Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4327
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4327, 538 aa
1>>>pF1KB4327 538 - 538 aa - 538 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5018+/-0.000725; mu= 18.0281+/- 0.044
mean_var=79.2535+/-16.120, 0's: 0 Z-trim(110.6): 50 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.144067
statistics sampled from 11650 (11701) to 11650 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.359), width: 16
Scan time: 3.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9593.1 SLC22A17 gene_id:51310|Hs108|chr14 ( 538) 3645 767.1 0
CCDS9594.2 SLC22A17 gene_id:51310|Hs108|chr14 ( 520) 2634 557.0 2e-158
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CCDS34331.1 SLC22A23 gene_id:63027|Hs108|chr6 ( 405) 751 165.5 1.1e-40
CCDS75389.1 SLC22A23 gene_id:63027|Hs108|chr6 ( 361) 417 96.1 7.6e-20
CCDS44632.1 SLC22A6 gene_id:9356|Hs108|chr11 ( 506) 379 88.3 2.4e-17
CCDS44631.1 SLC22A6 gene_id:9356|Hs108|chr11 ( 519) 379 88.3 2.4e-17
CCDS8041.1 SLC22A6 gene_id:9356|Hs108|chr11 ( 550) 379 88.3 2.5e-17
CCDS31591.1 SLC22A6 gene_id:9356|Hs108|chr11 ( 563) 379 88.3 2.6e-17
CCDS73927.1 SLC22A31 gene_id:146429|Hs108|chr16 ( 338) 371 86.5 5.5e-17
CCDS5277.1 SLC22A3 gene_id:6581|Hs108|chr6 ( 556) 368 86.0 1.2e-16
CCDS53644.1 SLC22A8 gene_id:9376|Hs108|chr11 ( 451) 362 84.7 2.5e-16
CCDS8042.1 SLC22A8 gene_id:9376|Hs108|chr11 ( 542) 362 84.8 2.9e-16
CCDS41661.1 SLC22A10 gene_id:387775|Hs108|chr11 ( 541) 340 80.2 6.9e-15
CCDS31592.1 SLC22A25 gene_id:387601|Hs108|chr11 ( 547) 339 80.0 8e-15
CCDS8043.1 SLC22A9 gene_id:114571|Hs108|chr11 ( 553) 336 79.4 1.2e-14
CCDS5084.1 SLC22A16 gene_id:85413|Hs108|chr6 ( 577) 331 78.3 2.7e-14
CCDS73308.1 SLC22A24 gene_id:283238|Hs108|chr11 ( 552) 320 76.0 1.3e-13
CCDS8075.1 SLC22A12 gene_id:116085|Hs108|chr11 ( 553) 315 75.0 2.6e-13
CCDS8074.1 SLC22A11 gene_id:55867|Hs108|chr11 ( 550) 310 74.0 5.3e-13
CCDS2676.1 SLC22A13 gene_id:9390|Hs108|chr3 ( 551) 305 72.9 1.1e-12
CCDS5275.1 SLC22A1 gene_id:6580|Hs108|chr6 ( 506) 304 72.7 1.2e-12
CCDS4893.2 SLC22A7 gene_id:10864|Hs108|chr6 ( 548) 304 72.7 1.2e-12
CCDS5274.1 SLC22A1 gene_id:6580|Hs108|chr6 ( 554) 304 72.7 1.3e-12
CCDS53643.1 SLC22A8 gene_id:9376|Hs108|chr11 ( 419) 302 72.2 1.3e-12
CCDS4892.1 SLC22A7 gene_id:10864|Hs108|chr6 ( 546) 299 71.7 2.6e-12
CCDS5276.1 SLC22A2 gene_id:6582|Hs108|chr6 ( 555) 295 70.8 4.6e-12
CCDS76425.1 SLC22A11 gene_id:55867|Hs108|chr11 ( 442) 284 68.5 1.9e-11
>>CCDS9593.1 SLC22A17 gene_id:51310|Hs108|chr14 (538 aa)
initn: 3645 init1: 3645 opt: 3645 Z-score: 4093.2 bits: 767.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3645; 100.0% identity (100.0% similar) in 538 aa overlap (1-538:1-538)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASDPIFTLAPPLHCHYGAFPPNASGWEQPPNASGVSVASAALAASAASRVATSTDPSCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 MASDPIFTLAPPLHCHYGAFPPNASGWEQPPNASGVSVASAALAASAASRVATSTDPSCS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GFAPPDFNHCLKDWDYNGLPVLTTNAIGQWDLVCDLGWQVILEQILFILGFASGYLFLGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 GFAPPDFNHCLKDWDYNGLPVLTTNAIGQWDLVCDLGWQVILEQILFILGFASGYLFLGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PADRFGRRGIVLLTLGLVGPCGVGGAAAGSSTGVMALRFLLGFLLAGVDLGVYLMRLELC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 PADRFGRRGIVLLTLGLVGPCGVGGAAAGSSTGVMALRFLLGFLLAGVDLGVYLMRLELC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 DPTQRLRVALAGELVGVGGHFLFLGLALVSKDWRFLQRMITAPCILFLFYGWPGLFLESA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 DPTQRLRVALAGELVGVGGHFLFLGLALVSKDWRFLQRMITAPCILFLFYGWPGLFLESA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RWLIVKRQIEEAQSVLRILAERNRPHGQMLGEEAQEALQDLENTCPLPATSSFSFASLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 RWLIVKRQIEEAQSVLRILAERNRPHGQMLGEEAQEALQDLENTCPLPATSSFSFASLLN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 YRNIWKNLLILGFTNFIAHAIRHCYQPVGGGGSPSDFYLCSLLASGTAALACVFLGVTVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 YRNIWKNLLILGFTNFIAHAIRHCYQPVGGGGSPSDFYLCSLLASGTAALACVFLGVTVD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 RFGRRGILLLSMTLTGIASLVLLGLWDCEHPIFPTVWAQQGNPNRDLNEAAITTFSVLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 RFGRRGILLLSMTLTGIASLVLLGLWDCEHPIFPTVWAQQGNPNRDLNEAAITTFSVLGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 FSSQAAAILSTLLAAEVIPTTVRGRGLGLIMALGALGGLSGPAQRLHMGHGAFLQHVVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 FSSQAAAILSTLLAAEVIPTTVRGRGLGLIMALGALGGLSGPAQRLHMGHGAFLQHVVLA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB4 ACALLCILSIMLLPETKRKLLPEVLRDGELCRRPSLLRQPPPTRCDHVPLLATPNPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 ACALLCILSIMLLPETKRKLLPEVLRDGELCRRPSLLRQPPPTRCDHVPLLATPNPAL
490 500 510 520 530
>>CCDS9594.2 SLC22A17 gene_id:51310|Hs108|chr14 (520 aa)
initn: 3478 init1: 2634 opt: 2634 Z-score: 2957.8 bits: 557.0 E(32554): 2e-158
Smith-Waterman score: 3443; 96.5% identity (96.5% similar) in 538 aa overlap (1-538:1-520)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASDPIFTLAPPLHCHYGAFPPNASGWEQPPNASGVSVASAALAASAASRVATSTDPSCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 MASDPIFTLAPPLHCHYGAFPPNASGWEQPPNASGVSVASAALAASAASRVATSTDPSCS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GFAPPDFNHCLKDWDYNGLPVLTTNAIGQWDLVCDLGWQVILEQILFILGFASGYLFLGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 GFAPPDFNHCLKDWDYNGLPVLTTNAIGQWDLVCDLGWQVILEQILFILGFASGYLFLGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PADRFGRRGIVLLTLGLVGPCGVGGAAAGSSTGVMALRFLLGFLLAGVDLGVYLMRLELC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 PADRFGRRGIVLLTLGLVGPCGVGGAAAGSSTGVMALRFLLGFLLAGVDLGVYLMRLELC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 DPTQRLRVALAGELVGVGGHFLFLGLALVSKDWRFLQRMITAPCILFLFYGWPGLFLESA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 DPTQRLRVALAGELVGVGGHFLFLGLALVSKDWRFLQRMITAPCILFLFYGWPGLFLESA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RWLIVKRQIEEAQSVLRILAERNRPHGQMLGEEAQEALQDLENTCPLPATSSFSFASLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 RWLIVKRQIEEAQSVLRILAERNRPHGQMLGEEAQEALQDLENTCPLPATSSFSFASLLN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 YRNIWKNLLILGFTNFIAHAIRHCYQPVGGGGSPSDFYLCSLLASGTAALACVFLGVTVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 YRNIWKNLLILGFTNFIAHAIRHCYQPVGGGGSPSDFYLCSLLASGTAALACVFLGVTVD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 RFGRRGILLLSMTLTGIASLVLLGLWDCEHPIFPTVWAQQGNPNRDLNEAAITTFSVLGL
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS95 RFGRRGILLLSMTLTGIASLVLLGLWDY------------------LNEAAITTFSVLGL
370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 FSSQAAAILSTLLAAEVIPTTVRGRGLGLIMALGALGGLSGPAQRLHMGHGAFLQHVVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 FSSQAAAILSTLLAAEVIPTTVRGRGLGLIMALGALGGLSGPAQRLHMGHGAFLQHVVLA
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530
pF1KB4 ACALLCILSIMLLPETKRKLLPEVLRDGELCRRPSLLRQPPPTRCDHVPLLATPNPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 ACALLCILSIMLLPETKRKLLPEVLRDGELCRRPSLLRQPPPTRCDHVPLLATPNPAL
470 480 490 500 510 520
>>CCDS47363.1 SLC22A23 gene_id:63027|Hs108|chr6 (686 aa)
initn: 945 init1: 402 opt: 936 Z-score: 1048.8 bits: 204.1 E(32554): 4.3e-52
Smith-Waterman score: 936; 32.9% identity (64.5% similar) in 529 aa overlap (23-533:148-654)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MASDPIFTLAPPLHCHYGAFPPNASGWEQPPNASGVSVASAALAASAASRVA
. ..: . :.. ... : . . : :
CCDS47 SFLLDQPNFWCRGAGKGTELAGVTTTGRGGDMGNWTSLPTTPFATAPWEAAGNRSNSSGA
120 130 140 150 160 170
60 70 80 90 100
pF1KB4 TSTD-PSCSGFAPPD----FNHC-LKDWDYNGLPVLTTNAIGQWDLVCDLGWQVILEQIL
. : : .::: ..: . :::. :. :....:::::: .:.: . ..
CCDS47 DGGDTPPLP--SPPDKGDNASNCDCRAWDYGIRAGLVQNVVSKWDLVCDNAWKVHIAKFS
180 190 200 210 220 230
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 FILGFASGYLFLGYPADRFGRRGIVLLTLGLVGPCGVGGAAAGSSTGVMALRFLLGFLLA
...:. :::. : :: ::: ..:... .. :. : . . : .:::. :: ::
CCDS47 LLVGLIFGYLITGCIADWVGRRPVLLFSIIFILIFGLTVALSVNVTMFSTLRFFEGFCLA
240 250 260 270 280 290
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 GVDLGVYLMRLELCDPTQRLRVALAGELVGVGGHFLFLGLALVSKDWRFLQRMITAPCIL
:. : .: .:.::: : .:. ..... .:...:.::. ::: . .::. :: .: : .:
CCDS47 GIILTLYALRIELCPPGKRFMITMVASFVAMAGQFLMPGLAALCRDWQVLQALIICPFLL
300 310 320 330 340 350
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 FLFYGWPGLFLESARWLIVKRQIEEAQSVLRILAERNR--PHGQMLGEEAQEALQDLENT
.:.: : ..: :: :::.. .:.: :. .. ....:: :.:.. : .. .::.
CCDS47 MLLY-W-SIFPESLRWLMATQQFESAKRLILHFTQKNRMNPEGDIKG-----VIPELEKE
360 370 380 390 400
290 300 310 320 330
pF1KB4 CPLPATSSFSFASLLNYRNIWKNLLILGFTNFIAHAIRHCYQPVGGGGS---P--SDFYL
.. ...... ::.:::...: ... ...:.::. : : .::
CCDS47 LSR-RPKKVCIVKVVGTRNLWKNIVVLCVNSLTGYGIHHCFARSMMGHEVKVPLLENFYA
410 420 430 440 450 460
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 CSLLASGTAALACVFLGVTVDRFGRRGILLLSMTLTGIASLVLLGLWD-----CEHPIFP
... : ..:. . :.: .:::: ::: : ::..:::. ::: . .::
CCDS47 DYYTTASIALVSCLAMCVVVRFLGRRGGLLLFMILTALASLLQLGLLNLIGKYSQHP---
470 480 490 500 510 520
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 TVWAQQGNPNRDLNEAAITTFSVLGLFSSQAAAILSTLLAAEVIPTTVRGRGLGLIMALG
..: . .. .:. ::..:.:.:.:.. ::... ::. ::..: ::::..: .
CCDS47 ----DSGMSDSVKDKFSIA-FSIVGMFASHAVGSLSVFFCAEITPTVIRCGGLGLVLASA
530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 ALGGLSGPAQRLHMGHGAFLQHVVLAACALLCILSIMLLPETKRKLLPEVLRDGELCRRP
..: :..: .:: .: ::.:...: :.:.::. :.::::.. . ::: . .:: :
CCDS47 GFGMLTAPIIELHNQKGYFLHHIIFACCTLICIICILLLPESRDQNLPENISNGEHYTRQ
580 590 600 610 620 630
520 530
pF1KB4 SLLRQPPPTRCDHVPLLATPNPAL
:: : . . ::: :
CCDS47 PLL----PHKKGEQPLLLTNAELKDYSGLHDAAAAGDTLPEGATANGMKAM
640 650 660 670 680
>>CCDS34331.1 SLC22A23 gene_id:63027|Hs108|chr6 (405 aa)
initn: 772 init1: 316 opt: 751 Z-score: 844.2 bits: 165.5 E(32554): 1.1e-40
Smith-Waterman score: 751; 34.9% identity (66.3% similar) in 392 aa overlap (157-533:5-373)
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RRGIVLLTLGLVGPCGVGGAAAGSSTGVMALRFLLGFLLAGVDLGVYLMRLELCDPTQRL
:::. :: :::. : .: .:.::: : .:.
CCDS34 MFSTLRFFEGFCLAGIILTLYALRIELCPPGKRF
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RVALAGELVGVGGHFLFLGLALVSKDWRFLQRMITAPCILFLFYGWPGLFLESARWLIVK
..... .:...:.::. ::: . .::. :: .: : .:.:.: : ..: :: :::..
CCDS34 MITMVASFVAMAGQFLMPGLAALCRDWQVLQALIICPFLLMLLY-W-SIFPESLRWLMAT
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RQIEEAQSVLRILAERNR--PHGQMLG---EEAQEALQDLENTCPLPATSSFSFASLLNY
.:.: :. .. ....:: :.:.. : : .: . ...: ......
CCDS34 QQFESAKRLILHFTQKNRMNPEGDIKGVIPELEKELSRRPKKVC---------IVKVVGT
100 110 120 130 140
310 320 330 340 350
pF1KB4 RNIWKNLLILGFTNFIAHAIRHCYQPVGGGGS---P--SDFYLCSLLASGTAALACVFLG
::.:::...: ... ...:.::. : : .:: ... : ..:. .
CCDS34 RNLWKNIVVLCVNSLTGYGIHHCFARSMMGHEVKVPLLENFYADYYTTASIALVSCLAMC
150 160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 VTVDRFGRRGILLLSMTLTGIASLVLLGLWD-----CEHPIFPTVWAQQGNPNRDLNEAA
:.: .:::: ::: : ::..:::. ::: . .:: ..: . .. .
CCDS34 VVVRFLGRRGGLLLFMILTALASLLQLGLLNLIGKYSQHP-------DSGMSDSVKDKFS
210 220 230 240 250
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 ITTFSVLGLFSSQAAAILSTLLAAEVIPTTVRGRGLGLIMALGALGGLSGPAQRLHMGHG
:. ::..:.:.:.:.. ::... ::. ::..: ::::..: ...: :..: .:: .:
CCDS34 IA-FSIVGMFASHAVGSLSVFFCAEITPTVIRCGGLGLVLASAGFGMLTAPIIELHNQKG
260 270 280 290 300 310
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 AFLQHVVLAACALLCILSIMLLPETKRKLLPEVLRDGELCRRPSLLRQPPPTRCDHVPLL
::.:...: :.:.::. :.::::.. . ::: . .:: : :: : . . :::
CCDS34 YFLHHIIFACCTLICIICILLLPESRDQNLPENISNGEHYTRQPLL----PHKKGEQPLL
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 ATPNPAL
:
CCDS34 LTNAELKDYSGLHDAAAAGDTLPEGATANGMKAM
380 390 400
>>CCDS75389.1 SLC22A23 gene_id:63027|Hs108|chr6 (361 aa)
initn: 430 init1: 402 opt: 417 Z-score: 469.7 bits: 96.1 E(32554): 7.6e-20
Smith-Waterman score: 417; 32.9% identity (64.4% similar) in 216 aa overlap (23-232:148-360)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MASDPIFTLAPPLHCHYGAFPPNASGWEQPPNASGVSVASAALAASAASRVA
. ..: . :.. ... : . . : :
CCDS75 SFLLDQPNFWCRGAGKGTELAGVTTTGRGGDMGNWTSLPTTPFATAPWEAAGNRSNSSGA
120 130 140 150 160 170
60 70 80 90 100
pF1KB4 TSTD-PSCSGFAPPD----FNHC-LKDWDYNGLPVLTTNAIGQWDLVCDLGWQVILEQIL
. : : .::: ..: . :::. :. :....:::::: .:.: . ..
CCDS75 DGGDTPPLP--SPPDKGDNASNCDCRAWDYGIRAGLVQNVVSKWDLVCDNAWKVHIAKFS
180 190 200 210 220 230
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 FILGFASGYLFLGYPADRFGRRGIVLLTLGLVGPCGVGGAAAGSSTGVMALRFLLGFLLA
...:. :::. : :: ::: ..:... .. :. : . . : .:::. :: ::
CCDS75 LLVGLIFGYLITGCIADWVGRRPVLLFSIIFILIFGLTVALSVNVTMFSTLRFFEGFCLA
240 250 260 270 280 290
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 GVDLGVYLMRLELCDPTQRLRVALAGELVGVGGHFLFLGLALVSKDWRFLQRMITAPCIL
:. : .: .:.::: : .:. ..... .:...:.::. ::: . .::. :: .: : .:
CCDS75 GIILTLYALRIELCPPGKRFMITMVASFVAMAGQFLMPGLAALCRDWQVLQALIICPFLL
300 310 320 330 340 350
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 FLFYGWPGLFLESARWLIVKRQIEEAQSVLRILAERNRPHGQMLGEEAQEALQDLENTCP
.:.: :
CCDS75 MLLY-WS
360
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>>CCDS8041.1 SLC22A6 gene_id:9356|Hs108|chr11 (550 aa)
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CCDS31 EVWLPRDRQGQPESCLRFTSPQWGLPFLNGTEANGTGATEP----CTDGWIYDN-STFPS
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CCDS31 TIVTEWDLVCSHRALRQLAQSLYMVGVLLGAMVFGYLADRLGRRKVLILNYLQTAVSGTC
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CCDS31 LLAGVAYAVPHWRHLQLLVSAPFFAFFIYSW--FFIESARWHSSSGRLDLTLRALQRVAR
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CCDS31 INGKREEGAKLSMEVLRASLQKELTMGKGQASAMELLRCPTLRHLFLCLSMLWFATSFAY
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CCDS31 YGLVMDLQ--GFGVS---IYLIQVIF-GAVDLPAKLVGFLVINSLGRRPAQMAALLLAGI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]