FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4336, 1093 aa
1>>>pF1KB4336 1093 - 1093 aa - 1093 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0484+/-0.00104; mu= -10.9173+/- 0.063
mean_var=452.1410+/-93.257, 0's: 0 Z-trim(117.2): 33 B-trim: 185 in 2/51
Lambda= 0.060317
statistics sampled from 17882 (17914) to 17882 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.811), E-opt: 0.2 (0.55), width: 16
Scan time: 6.830
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11327.1 MLLT6 gene_id:4302|Hs108|chr17 (1093) 7337 653.3 8.2e-187
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CCDS7135.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1027) 1540 148.9 5.6e-35
>>CCDS11327.1 MLLT6 gene_id:4302|Hs108|chr17 (1093 aa)
initn: 7337 init1: 7337 opt: 7337 Z-score: 3467.4 bits: 653.3 E(32554): 8.2e-187
Smith-Waterman score: 7337; 100.0% identity (100.0% similar) in 1093 aa overlap (1-1093:1-1093)
10 20 30 40 50 60
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CCDS11 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQVPTGPWFCRKCESQERA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTMEPIVLQYVPHDRFNKTC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQMAGLLCEEEVLEVDNVKYCGYCKYH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 FSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASPSTQQEKHPTHHERGQKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASPSTQQEKHPTHHERGQKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 SRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSSHHEASTQETSESSRESKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSSHHEASTQETSESSRESKG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KKSSSHSLSHKGKKLSSGKGVSSFTSASSSSSSSSSSSGGPFQPAVSSLQSSPDFSAFPK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 LEQPEEDKYSKPTAPAPSAPPSPSAPEPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTTSSSGRAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LEQPEEDKYSKPTAPAPSAPPSPSAPEPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTTSSSGRAR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 APSPGDYKSPHVTGSGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRSRHGPGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 APSPGDYKSPHVTGSGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRSRHGPGR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 PKGSRNKEGTGGPAAPSLPSAQLAGFTATAASPFSGGSLVSSGLGGLSSRTFGPSGSLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PKGSRNKEGTGGPAAPSLPSAQLAGFTATAASPFSGGSLVSSGLGGLSSRTFGPSGSLPS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LSLESPLLGAGIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLGPPGTSALPRLSRSPFTSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSLESPLLGAGIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLGPPGTSALPRLSRSPFTSTL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 PSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGTPMGAVNPLLSQAESSHTEPDLEDCSFRCRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGTPMGAVNPLLSQAESSHTEPDLEDCSFRCRG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 TSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAAPGTTNMEQLLEKQGDGEAGVNIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAAPGTTNMEQLLEKQGDGEAGVNIV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 EMLKALHALQKENQRLQEQILSLTAKKERLQILNVQLSVPFPALPAALPAANGPVPGPYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EMLKALHALQKENQRLQEQILSLTAKKERLQILNVQLSVPFPALPAALPAANGPVPGPYG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 LPPQAGSSDSLSTSKSPPGKSSLGLDNSLSTSSEDPHSGCPSRSSSSLSFHSTPPPLPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LPPQAGSSDSLSTSKSPPGKSSLGLDNSLSTSSEDPHSGCPSRSSSSLSFHSTPPPLPLL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 QQSPATLPLALPGAPAPLPPQPQNGLGRAPGAAGLGAMPMAEGLLGGLAGSGGLPLNGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QQSPATLPLALPGAPAPLPPQPQNGLGRAPGAAGLGAMPMAEGLLGGLAGSGGLPLNGLL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 GGLNGAAAPNPASLSQAGGAPTLQLPGCLNSLTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLLASPQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GGLNGAAAPNPASLSQAGGAPTLQLPGCLNSLTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLLASPQLT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 PEHQTVVYQMIQQIQQKRELQRLQMAGGSQLPMASLLAGSSTPLLSAGTPGLLPTASAPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PEHQTVVYQMIQQIQQKRELQRLQMAGGSQLPMASLLAGSSTPLLSAGTPGLLPTASAPP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 LLPAGALVAPSLGNNTSLMAAAAAAAAVAAAGGPPVLTAQTNPFLSLSGAEGSGGGPKGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLPAGALVAPSLGNNTSLMAAAAAAAAVAAAGGPPVLTAQTNPFLSLSGAEGSGGGPKGG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090
pF1KB4 TADKGASANQEKG
:::::::::::::
CCDS11 TADKGASANQEKG
1090
>>CCDS55708.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1068 aa)
initn: 1913 init1: 1337 opt: 2187 Z-score: 1045.5 bits: 205.2 E(32554): 6.5e-52
Smith-Waterman score: 2454; 44.0% identity (67.6% similar) in 1095 aa overlap (1-1009:18-1037)
10 20 30 40
pF1KB4 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQ
::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS55 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS55 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 EPIVLQYVPHDRFNKTCYICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQMAGLLCEE
:::::: :::::.:::::::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::.:::::::
CCDS55 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 EVLEVDNVKYCGYCKYHFSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASP
: .:::.:::::::::::.: :...:. : .: : :
CCDS55 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNR--------------------SYDQSLSDSS
190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 STQQEKHPTHHERGQKKSRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSS-
: .:.: :::. .::. :.:.. ::::::.:: :. :.: .. :..:. .:.:..:
CCDS55 SHSQDK---HHEK-EKKKYKEKDKHKQKHKKQPEPSPA-LVPSLTVTTEKTYTSTSNNSI
230 240 250 260 270
290 300 310
pF1KB4 -----------------------HHEASTQETSES-SRESKGKKSSSHSLSHKGKKLSSG
: .: ...::. . :.::::::.:: ...:.: ..:
CCDS55 SGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAHTSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGG
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 KGVSSFTSASSS--SSSSSSSSGGPFQPAVSSLQSSPDFSAFPKLEQPEEDKYSKPTAPA
.. .. .::.: ..: :.. :. . . ::.:: :: .: . ..:.::.
CCDS55 RNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSVKSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDL-RNDSYSH-----
340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 PSAPPSPSAPEPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTTSSSGRARA--PSPGDYKSPHVTG
. : .. . :.. :. ..:. .. . .:.. ... .. :::: . .
CCDS55 --SQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGLPSTSAVTSQPKSFENSPGDLGN----S
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 SGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRSRHGPGRPKGSRNKEGTG---
: .:: .:: . : .:: .::::.:..:.:.::::::::..:.:...
CCDS55 SLPTAG-YKR----AQTSGIEEET----VKEKKRKGNKQSKHGPGRPKGNKNQENVSHLS
450 460 470 480 490
500 510 520 530 540
pF1KB4 -GPAAPSLPSAQLAGFTATAA---SP--FSGGSLVS-----SGLGGLSSRTFGPSGSLPS
. :.:. :. :: .... :: . .::: : : .:. : . .:. :.
CCDS55 VSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGSEISMQYRHDGACPT
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590
pF1KB4 LSLESPLLGA---GIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLGPPGTSALPRLSR-SPF
.. : ::.: :::.:: .: . . . :::.::: : ... : ... ::
CCDS55 TTF-SELLNAIHNGIYNSNDVAVSFPNVVSGSGSSTPVSSSHLPQQSSGHLQQVGALSP-
560 570 580 590 600 610
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 TSTLPSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGT-PMGAVNPLLSQAESSHTEPDLEDCS
:.. :.. ...:::. .:.::..: .:..:. ... :..:.:...:. :: : :
CCDS55 -SAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYGNRSNSSMAALIAQSENNQTDQDLGDNS
620 630 640 650 660 670
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 --FRCRGTSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAAPGTTNMEQLLEKQ-GD
. ::.::. ::: ::.::: .:: : :...:. : ....:::::.: ..
CCDS55 RNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQ----P-GNSSLENLPPVAASIEQLLERQWSE
680 690 700 710 720
720 730 740 750 760
pF1KB4 G-----EAGV--NIVEMLKALHALQKENQRLQEQILSLTAKKERLQILNVQLSVPFPALP
: : :. .:. :::.:: :: ::.::.::: .:::::::::.::.:::::::..
CCDS55 GQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNLTAKKERLQLLNAQLSVPFPTIT
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 AALPAANGPVPGPYGLPPQ-AGSSDSLSTSKSPPGKSSLGLDNSLSTSSED-PHSGCPSR
: :. . . . . : : ..:::..:::: .:. :::: . ..: :: .
CCDS55 AN-PSPSHQI---HTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFLPDNSLPVLNQDLTSSGQSTS
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870
pF1KB4 SSSSLSFHSTPPPLPLLQQSPATLPLALPGAPAPLPPQPQNGL-------GRAPGAAGLG
:::.:: :::: :::: .. :. : ::. : : .. .
CCDS55 SSSALS---TPPPAG---QSPAQQGSGVSGV------QQVNGVTVGALASGMQPVTSTIP
850 860 870 880 890
880 890 900 910 920
pF1KB4 AMPMAEGLLGGLAGSGGLPLNGLLGGLNGAA-AP-----NPASLSQAGGAP--TLQLPGC
:. . :..:.: :. : .::..:.:::. .: ::. :... : : .:.
CCDS55 AVSAVGGIIGALPGNQ-LAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPLTHTTVPPNATHPMPAT
900 910 920 930 940
930 940 950 960 970
pF1KB4 L-NS------LTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLLASPQLTPE-HQTVVYQMIQQIQQKR--
: :: :..:::..: .: ::.:::: : ::::: ::. .::..:. .:..
CCDS55 LTNSASGLGLLSDQQRQILIHQ----QQFQQLLNSQQLTPEQHQAFLYQLMQHHHQQHHQ
950 960 970 980 990 1000
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KB4 -ELQRLQMAGGSQLPMASLLAGSSTPLLSAGTPGLLPTASAPPLLPAGALVAPSLGNNTS
:::.::. : .:.:. .::::...: : ..:
CCDS55 PELQQLQIPGPTQIPINNLLAGTQAPPLHTATTNPFLTIHGDNASQKVARLSDKTGPVAQ
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KB4 LMAAAAAAAAVAAAGGPPVLTAQTNPFLSLSGAEGSGGGPKGGTADKGASANQEKG
CCDS55 EKS
>>CCDS7135.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1027 aa)
initn: 1845 init1: 1337 opt: 1540 Z-score: 741.5 bits: 148.9 E(32554): 5.6e-35
Smith-Waterman score: 2300; 43.2% identity (65.8% similar) in 1062 aa overlap (1-964:18-1004)
10 20 30 40
pF1KB4 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQ
::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS71 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS71 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 EPIVLQYVPHDRFNKTCYICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQMAGLLCEE
:::::: :::::.:::::::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::.:::::::
CCDS71 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 EVLEVDNVKYCGYCKYHFSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASP
: .:::.:::::::::::.: :...:. : .: : :
CCDS71 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNR--------------------SYDQSLSDSS
190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 STQQEKHPTHHERGQKKSRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSS-
: .:.:: ::. .::. :.:.. ::::::.:: :. :.: .. :..:. .:.:..:
CCDS71 SHSQDKH---HEK-EKKKYKEKDKHKQKHKKQPEPSPA-LVPSLTVTTEKTYTSTSNNSI
230 240 250 260 270
290 300 310
pF1KB4 -----------------------HHEASTQETSES-SRESKGKKSSSHSLSHKGKKLSSG
: .: ...::. . :.::::::.:: ...:.: ..:
CCDS71 SGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAHTSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGG
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 KGVSSFTSASSS--SSSSSSSSGGPFQPAVSSLQSSPDFSAFPKLEQPEEDKYSKPTAPA
.. .. .::.: ..: :.. :. . . ::.:: :: .: . ..:.::.
CCDS71 RNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSVKSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDL-RNDSYSH-----
340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 PSAPPSPSAPEPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTTSSSGRARA--PSPGDYKSPHVTG
. : .. . :.. :. ..:. .. . .:.. ... .. :::: . .
CCDS71 --SQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGLPSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPT
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 SGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRSRHGPGRPKGSRNKEGTG---
.: .:: . : .:: .::::.:..:.:.::::::::..:.:...
CCDS71 AG-----YKR----AQTSGIEEET----VKEKKRKGNKQSKHGPGRPKGNKNQENVSHLS
450 460 470 480 490
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pF1KB4 -GPAAPSLPSAQLAGFTATAA---SP--FSGGSLVS-----SGLGGLSSRTFGPSGSLPS
. :.:. :. :: .... :: . .::: : : .:. : . .:. :.
CCDS71 VSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGSEISMQYRHDGACPT
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580
pF1KB4 LSLESPLLGA-------------------GIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLG
.. : ::.: :::.:: .: . . . :::.::: :
CCDS71 TTF-SELLNAIHNDRGDSSTLTKQELKFIGIYNSNDVAVSFPNVVSGSGSSTPVSSSHLP
560 570 580 590 600 610
590 600 610 620 630
pF1KB4 PPGTSALPRLSR-SPFTSTLPSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGT-PMGAVNPLL
... : ... :: :.. :.. ...:::. .:.::..: .:..:. ... :.
CCDS71 QQSSGHLQQVGALSP--SAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYGNRSNSSMAALI
620 630 640 650 660 670
640 650 660 670 680 690
pF1KB4 SQAESSHTEPDLEDCS--FRCRGTSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAA
.:.:...:. :: : : . ::.::. ::: ::.::: .:: : :...:.
CCDS71 AQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQ----P-GNSSLENLP
680 690 700 710 720
700 710 720 730 740
pF1KB4 PGTTNMEQLLEKQ-GDG-----EAGV--NIVEMLKALHALQKENQRLQEQILSLTAKKER
: ....:::::.: ..: : :. .:. :::.:: :: ::.::.::: .:::::::
CCDS71 PVAASIEQLLERQWSEGQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNLTAKKER
730 740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
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