FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4336, 1093 aa 1>>>pF1KB4336 1093 - 1093 aa - 1093 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0484+/-0.00104; mu= -10.9173+/- 0.063 mean_var=452.1410+/-93.257, 0's: 0 Z-trim(117.2): 33 B-trim: 185 in 2/51 Lambda= 0.060317 statistics sampled from 17882 (17914) to 17882 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.811), E-opt: 0.2 (0.55), width: 16 Scan time: 6.830 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11327.1 MLLT6 gene_id:4302|Hs108|chr17 (1093) 7337 653.3 8.2e-187 CCDS55708.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1068) 2187 205.2 6.5e-52 CCDS7135.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1027) 1540 148.9 5.6e-35 >>CCDS11327.1 MLLT6 gene_id:4302|Hs108|chr17 (1093 aa) initn: 7337 init1: 7337 opt: 7337 Z-score: 3467.4 bits: 653.3 E(32554): 8.2e-187 Smith-Waterman score: 7337; 100.0% identity (100.0% 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:.::::::.:: ...:.: ..: CCDS55 SGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAHTSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGG 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 pF1KB4 KGVSSFTSASSS--SSSSSSSSGGPFQPAVSSLQSSPDFSAFPKLEQPEEDKYSKPTAPA .. .. .::.: ..: :.. :. . . ::.:: :: .: . ..:.::. 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CCDS55 VSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGSEISMQYRHDGACPT 500 510 520 530 540 550 550 560 570 580 590 pF1KB4 LSLESPLLGA---GIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLGPPGTSALPRLSR-SPF .. : ::.: :::.:: .: . . . :::.::: : ... : ... :: CCDS55 TTF-SELLNAIHNGIYNSNDVAVSFPNVVSGSGSSTPVSSSHLPQQSSGHLQQVGALSP- 560 570 580 590 600 610 600 610 620 630 640 650 pF1KB4 TSTLPSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGT-PMGAVNPLLSQAESSHTEPDLEDCS :.. :.. ...:::. .:.::..: .:..:. ... :..:.:...:. :: : : CCDS55 -SAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYGNRSNSSMAALIAQSENNQTDQDLGDNS 620 630 640 650 660 670 660 670 680 690 700 710 pF1KB4 --FRCRGTSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAAPGTTNMEQLLEKQ-GD . ::.::. ::: ::.::: .:: : :...:. : ....:::::.: .. CCDS55 RNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQ----P-GNSSLENLPPVAASIEQLLERQWSE 680 690 700 710 720 720 730 740 750 760 pF1KB4 G-----EAGV--NIVEMLKALHALQKENQRLQEQILSLTAKKERLQILNVQLSVPFPALP : : :. .:. :::.:: :: ::.::.::: .:::::::::.::.:::::::.. CCDS55 GQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNLTAKKERLQLLNAQLSVPFPTIT 730 740 750 760 770 780 770 780 790 800 810 820 pF1KB4 AALPAANGPVPGPYGLPPQ-AGSSDSLSTSKSPPGKSSLGLDNSLSTSSED-PHSGCPSR : :. . . . . : : ..:::..:::: .:. :::: . ..: :: . CCDS55 AN-PSPSHQI---HTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFLPDNSLPVLNQDLTSSGQSTS 790 800 810 820 830 840 830 840 850 860 870 pF1KB4 SSSSLSFHSTPPPLPLLQQSPATLPLALPGAPAPLPPQPQNGL-------GRAPGAAGLG :::.:: :::: :::: .. :. : ::. : : .. . CCDS55 SSSALS---TPPPAG---QSPAQQGSGVSGV------QQVNGVTVGALASGMQPVTSTIP 850 860 870 880 890 880 890 900 910 920 pF1KB4 AMPMAEGLLGGLAGSGGLPLNGLLGGLNGAA-AP-----NPASLSQAGGAP--TLQLPGC :. . :..:.: :. : .::..:.:::. .: ::. :... : : .:. CCDS55 AVSAVGGIIGALPGNQ-LAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPLTHTTVPPNATHPMPAT 900 910 920 930 940 930 940 950 960 970 pF1KB4 L-NS------LTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLLASPQLTPE-HQTVVYQMIQQIQQKR-- : :: :..:::..: .: ::.:::: : ::::: ::. .::..:. .:.. CCDS55 LTNSASGLGLLSDQQRQILIHQ----QQFQQLLNSQQLTPEQHQAFLYQLMQHHHQQHHQ 950 960 970 980 990 1000 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KB4 -ELQRLQMAGGSQLPMASLLAGSSTPLLSAGTPGLLPTASAPPLLPAGALVAPSLGNNTS :::.::. : .:.:. .::::...: : ..: CCDS55 PELQQLQIPGPTQIPINNLLAGTQAPPLHTATTNPFLTIHGDNASQKVARLSDKTGPVAQ 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KB4 LMAAAAAAAAVAAAGGPPVLTAQTNPFLSLSGAEGSGGGPKGGTADKGASANQEKG CCDS55 EKS >>CCDS7135.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1027 aa) initn: 1845 init1: 1337 opt: 1540 Z-score: 741.5 bits: 148.9 E(32554): 5.6e-35 Smith-Waterman score: 2300; 43.2% identity (65.8% similar) in 1062 aa overlap (1-964:18-1004) 10 20 30 40 pF1KB4 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQ ::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::: CCDS71 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB4 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :: CCDS71 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB4 EPIVLQYVPHDRFNKTCYICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQMAGLLCEE :::::: :::::.:::::::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::.::::::: CCDS71 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB4 EVLEVDNVKYCGYCKYHFSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASP : .:::.:::::::::::.: :...:. : .: : : CCDS71 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNR--------------------SYDQSLSDSS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 STQQEKHPTHHERGQKKSRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSS- : .:.:: ::. .::. :.:.. ::::::.:: :. :.: .. :..:. .:.:..: CCDS71 SHSQDKH---HEK-EKKKYKEKDKHKQKHKKQPEPSPA-LVPSLTVTTEKTYTSTSNNSI 230 240 250 260 270 290 300 310 pF1KB4 -----------------------HHEASTQETSES-SRESKGKKSSSHSLSHKGKKLSSG : .: ...::. . :.::::::.:: ...:.: ..: CCDS71 SGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAHTSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGG 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 pF1KB4 KGVSSFTSASSS--SSSSSSSSGGPFQPAVSSLQSSPDFSAFPKLEQPEEDKYSKPTAPA .. .. .::.: ..: :.. :. . . ::.:: :: .: . ..:.::. CCDS71 RNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSVKSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDL-RNDSYSH----- 340 350 360 370 380 380 390 400 410 420 430 pF1KB4 PSAPPSPSAPEPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTTSSSGRARA--PSPGDYKSPHVTG . : .. . :.. :. ..:. .. . .:.. ... .. :::: . . CCDS71 --SQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGLPSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPT 390 400 410 420 430 440 440 450 460 470 480 490 pF1KB4 SGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRSRHGPGRPKGSRNKEGTG--- .: .:: . : .:: .::::.:..:.:.::::::::..:.:... CCDS71 AG-----YKR----AQTSGIEEET----VKEKKRKGNKQSKHGPGRPKGNKNQENVSHLS 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB4 -GPAAPSLPSAQLAGFTATAA---SP--FSGGSLVS-----SGLGGLSSRTFGPSGSLPS . :.:. :. :: .... :: . .::: : : .:. : . .:. :. 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