Result of FASTA (omim) for
pF1KB4336
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4336, 1093 aa
1>>>pF1KB4336 1093 - 1093 aa - 1093 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.2475+/-0.000401; mu= -24.3610+/- 0.025
mean_var=538.3033+/-109.628, 0's: 0 Z-trim(125.3): 93 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.055279
statistics sampled from 48686 (48782) to 48686 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.818), E-opt: 0.2 (0.572), width: 16
Scan time: 19.730
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005928 (OMIM: 600328) protein AF-17 [Homo sapie (1093) 7337 600.4 1.9e-170
XP_016880137 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF- ( 889) 5828 480.0 2.6e-134
XP_006721974 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF- (1067) 4954 410.3 3e-113
XP_016880138 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF- ( 657) 4408 366.7 2.5e-100
XP_016880139 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF- ( 652) 4171 347.8 1.2e-94
NP_001182555 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform (1068) 2187 189.7 8e-47
NP_004632 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform a [ (1027) 1540 138.1 2.6e-31
NP_001311226 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform ( 823) 979 93.3 6.4e-18
NP_001305978 (OMIM: 602410) peregrin isoform 3 [Ho (1119) 601 63.2 9.9e-09
XP_005265509 (OMIM: 602410) PREDICTED: peregrin is (1125) 601 63.2 9.9e-09
NP_001305979 (OMIM: 602410) peregrin isoform 4 [Ho (1213) 601 63.2 1.1e-08
NP_004625 (OMIM: 602410) peregrin isoform 2 [Homo (1214) 601 63.2 1.1e-08
XP_005265507 (OMIM: 602410) PREDICTED: peregrin is (1219) 601 63.2 1.1e-08
NP_001003694 (OMIM: 602410) peregrin isoform 1 [Ho (1220) 601 63.2 1.1e-08
XP_005265506 (OMIM: 602410) PREDICTED: peregrin is (1247) 601 63.2 1.1e-08
XP_011532403 (OMIM: 602410) PREDICTED: peregrin is (1248) 601 63.2 1.1e-08
XP_011532404 (OMIM: 602410) PREDICTED: peregrin is (1248) 601 63.2 1.1e-08
XP_011512794 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain ( 832) 579 61.4 2.6e-08
XP_016866231 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1088) 579 61.4 3.3e-08
XP_011512793 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1131) 579 61.4 3.4e-08
XP_011512792 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1144) 579 61.4 3.4e-08
XP_005249068 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1205) 579 61.5 3.5e-08
XP_011512791 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1205) 579 61.5 3.5e-08
NP_056510 (OMIM: 616856) bromodomain and PHD finge (1205) 579 61.5 3.5e-08
XP_005249067 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1205) 579 61.5 3.5e-08
XP_016884210 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain ( 941) 565 60.3 6.2e-08
XP_016884209 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain ( 955) 565 60.3 6.3e-08
XP_016884208 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain ( 958) 565 60.3 6.3e-08
XP_016884207 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain (1023) 565 60.3 6.7e-08
NP_001291738 (OMIM: 604589) bromodomain-containing (1058) 565 60.3 6.9e-08
XP_016884203 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain (1187) 565 60.3 7.6e-08
XP_016884204 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain (1189) 565 60.3 7.6e-08
XP_016884205 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain (1189) 565 60.3 7.6e-08
XP_016884206 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain (1189) 565 60.3 7.6e-08
NP_001291737 (OMIM: 604589) bromodomain-containing (1189) 565 60.3 7.6e-08
NP_001182559 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform ( 179) 493 54.2 8.2e-07
NP_001311225 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform ( 179) 493 54.2 8.2e-07
NP_001182557 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform ( 179) 493 54.2 8.2e-07
NP_001182556 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform ( 126) 478 52.9 1.4e-06
NP_056103 (OMIM: 610515) protein Jade-2 isoform 3 ( 790) 494 54.6 2.7e-06
NP_001276913 (OMIM: 610515) protein Jade-2 isoform ( 791) 494 54.6 2.7e-06
XP_016864771 (OMIM: 610515) PREDICTED: protein Jad ( 833) 494 54.6 2.8e-06
XP_005272002 (OMIM: 610515) PREDICTED: protein Jad ( 834) 494 54.6 2.9e-06
XP_005272003 (OMIM: 610515) PREDICTED: protein Jad ( 834) 494 54.6 2.9e-06
XP_005272005 (OMIM: 610515) PREDICTED: protein Jad ( 834) 494 54.6 2.9e-06
NP_001295072 (OMIM: 610515) protein Jade-2 isoform ( 834) 494 54.6 2.9e-06
XP_011541593 (OMIM: 610515) PREDICTED: protein Jad ( 834) 494 54.6 2.9e-06
NP_001276914 (OMIM: 610515) protein Jade-2 isoform ( 850) 494 54.6 2.9e-06
NP_079176 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform 2 ( 509) 459 51.7 1.3e-05
NP_001274370 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform ( 509) 459 51.7 1.3e-05
>>NP_005928 (OMIM: 600328) protein AF-17 [Homo sapiens] (1093 aa)
initn: 7337 init1: 7337 opt: 7337 Z-score: 3181.2 bits: 600.4 E(85289): 1.9e-170
Smith-Waterman score: 7337; 100.0% identity (100.0% similar) in 1093 aa overlap (1-1093:1-1093)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQVPTGPWFCRKCESQERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQVPTGPWFCRKCESQERA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTMEPIVLQYVPHDRFNKTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTMEPIVLQYVPHDRFNKTC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 YICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQMAGLLCEEEVLEVDNVKYCGYCKYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQMAGLLCEEEVLEVDNVKYCGYCKYH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 FSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASPSTQQEKHPTHHERGQKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASPSTQQEKHPTHHERGQKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 SRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSSHHEASTQETSESSRESKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSSHHEASTQETSESSRESKG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 KKSSSHSLSHKGKKLSSGKGVSSFTSASSSSSSSSSSSGGPFQPAVSSLQSSPDFSAFPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KKSSSHSLSHKGKKLSSGKGVSSFTSASSSSSSSSSSSGGPFQPAVSSLQSSPDFSAFPK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 LEQPEEDKYSKPTAPAPSAPPSPSAPEPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTTSSSGRAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LEQPEEDKYSKPTAPAPSAPPSPSAPEPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTTSSSGRAR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 APSPGDYKSPHVTGSGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRSRHGPGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 APSPGDYKSPHVTGSGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRSRHGPGR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 PKGSRNKEGTGGPAAPSLPSAQLAGFTATAASPFSGGSLVSSGLGGLSSRTFGPSGSLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PKGSRNKEGTGGPAAPSLPSAQLAGFTATAASPFSGGSLVSSGLGGLSSRTFGPSGSLPS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LSLESPLLGAGIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLGPPGTSALPRLSRSPFTSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LSLESPLLGAGIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLGPPGTSALPRLSRSPFTSTL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 PSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGTPMGAVNPLLSQAESSHTEPDLEDCSFRCRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGTPMGAVNPLLSQAESSHTEPDLEDCSFRCRG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 TSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAAPGTTNMEQLLEKQGDGEAGVNIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAAPGTTNMEQLLEKQGDGEAGVNIV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 EMLKALHALQKENQRLQEQILSLTAKKERLQILNVQLSVPFPALPAALPAANGPVPGPYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EMLKALHALQKENQRLQEQILSLTAKKERLQILNVQLSVPFPALPAALPAANGPVPGPYG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 LPPQAGSSDSLSTSKSPPGKSSLGLDNSLSTSSEDPHSGCPSRSSSSLSFHSTPPPLPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LPPQAGSSDSLSTSKSPPGKSSLGLDNSLSTSSEDPHSGCPSRSSSSLSFHSTPPPLPLL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 QQSPATLPLALPGAPAPLPPQPQNGLGRAPGAAGLGAMPMAEGLLGGLAGSGGLPLNGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QQSPATLPLALPGAPAPLPPQPQNGLGRAPGAAGLGAMPMAEGLLGGLAGSGGLPLNGLL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 GGLNGAAAPNPASLSQAGGAPTLQLPGCLNSLTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLLASPQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GGLNGAAAPNPASLSQAGGAPTLQLPGCLNSLTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLLASPQLT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 PEHQTVVYQMIQQIQQKRELQRLQMAGGSQLPMASLLAGSSTPLLSAGTPGLLPTASAPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PEHQTVVYQMIQQIQQKRELQRLQMAGGSQLPMASLLAGSSTPLLSAGTPGLLPTASAPP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 LLPAGALVAPSLGNNTSLMAAAAAAAAVAAAGGPPVLTAQTNPFLSLSGAEGSGGGPKGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LLPAGALVAPSLGNNTSLMAAAAAAAAVAAAGGPPVLTAQTNPFLSLSGAEGSGGGPKGG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090
pF1KB4 TADKGASANQEKG
:::::::::::::
NP_005 TADKGASANQEKG
1090
>>XP_016880137 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF-17 i (889 aa)
initn: 5828 init1: 5828 opt: 5828 Z-score: 2532.2 bits: 480.0 E(85289): 2.6e-134
Smith-Waterman score: 5828; 100.0% identity (100.0% similar) in 889 aa overlap (205-1093:1-889)
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 GYCKYHFSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASPSTQQEKHPTHH
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGGGGSGFISGRRSRSASPSTQQEKHPTHH
10 20 30
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 ERGQKKSRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSSHHEASTQETSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERGQKKSRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSSHHEASTQETSES
40 50 60 70 80 90
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 SRESKGKKSSSHSLSHKGKKLSSGKGVSSFTSASSSSSSSSSSSGGPFQPAVSSLQSSPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRESKGKKSSSHSLSHKGKKLSSGKGVSSFTSASSSSSSSSSSSGGPFQPAVSSLQSSPD
100 110 120 130 140 150
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 FSAFPKLEQPEEDKYSKPTAPAPSAPPSPSAPEPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSAFPKLEQPEEDKYSKPTAPAPSAPPSPSAPEPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTTS
160 170 180 190 200 210
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 SSGRARAPSPGDYKSPHVTGSGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSGRARAPSPGDYKSPHVTGSGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRS
220 230 240 250 260 270
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 RHGPGRPKGSRNKEGTGGPAAPSLPSAQLAGFTATAASPFSGGSLVSSGLGGLSSRTFGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RHGPGRPKGSRNKEGTGGPAAPSLPSAQLAGFTATAASPFSGGSLVSSGLGGLSSRTFGP
280 290 300 310 320 330
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 SGSLPSLSLESPLLGAGIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLGPPGTSALPRLSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SGSLPSLSLESPLLGAGIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLGPPGTSALPRLSRS
340 350 360 370 380 390
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 PFTSTLPSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGTPMGAVNPLLSQAESSHTEPDLEDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PFTSTLPSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGTPMGAVNPLLSQAESSHTEPDLEDC
400 410 420 430 440 450
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 SFRCRGTSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAAPGTTNMEQLLEKQGDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SFRCRGTSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAAPGTTNMEQLLEKQGDGE
460 470 480 490 500 510
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 AGVNIVEMLKALHALQKENQRLQEQILSLTAKKERLQILNVQLSVPFPALPAALPAANGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGVNIVEMLKALHALQKENQRLQEQILSLTAKKERLQILNVQLSVPFPALPAALPAANGP
520 530 540 550 560 570
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 VPGPYGLPPQAGSSDSLSTSKSPPGKSSLGLDNSLSTSSEDPHSGCPSRSSSSLSFHSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VPGPYGLPPQAGSSDSLSTSKSPPGKSSLGLDNSLSTSSEDPHSGCPSRSSSSLSFHSTP
580 590 600 610 620 630
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 PPLPLLQQSPATLPLALPGAPAPLPPQPQNGLGRAPGAAGLGAMPMAEGLLGGLAGSGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPLPLLQQSPATLPLALPGAPAPLPPQPQNGLGRAPGAAGLGAMPMAEGLLGGLAGSGGL
640 650 660 670 680 690
900 910 920 930 940 950
pF1KB4 PLNGLLGGLNGAAAPNPASLSQAGGAPTLQLPGCLNSLTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLNGLLGGLNGAAAPNPASLSQAGGAPTLQLPGCLNSLTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLL
700 710 720 730 740 750
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB4 ASPQLTPEHQTVVYQMIQQIQQKRELQRLQMAGGSQLPMASLLAGSSTPLLSAGTPGLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASPQLTPEHQTVVYQMIQQIQQKRELQRLQMAGGSQLPMASLLAGSSTPLLSAGTPGLLP
760 770 780 790 800 810
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB4 TASAPPLLPAGALVAPSLGNNTSLMAAAAAAAAVAAAGGPPVLTAQTNPFLSLSGAEGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TASAPPLLPAGALVAPSLGNNTSLMAAAAAAAAVAAAGGPPVLTAQTNPFLSLSGAEGSG
820 830 840 850 860 870
1080 1090
pF1KB4 GGPKGGTADKGASANQEKG
:::::::::::::::::::
XP_016 GGPKGGTADKGASANQEKG
880
>>XP_006721974 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF-17 i (1067 aa)
initn: 4930 init1: 4930 opt: 4954 Z-score: 2154.3 bits: 410.3 E(85289): 3e-113
Smith-Waterman score: 7118; 97.6% identity (97.6% similar) in 1093 aa overlap (1-1093:1-1067)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQVPTGPWFCRKCESQERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQVPTGPWFCRKCESQERA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTMEPIVLQYVPHDRFNKTC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASPSTQQEKHPTHHERGQKK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSSHHEASTQETSESSRESKG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_006 LLPAGALVAPSLGNNTSLMAAAAAAAAVAAAGGPPVLTAQTNPFLSLSGAEGSGGGPKGG
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XP_006 TADKGASANQEKG
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>>XP_016880138 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF-17 i (657 aa)
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Smith-Waterman score: 4408; 99.8% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)
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pF1KB4 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQVPTGPWFCRKCESQERA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
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pF1KB4 TSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAAPGTTNMEQLLEKQGDGEAGVNIV
>>XP_016880139 (OMIM: 600328) PREDICTED: protein AF-17 i (652 aa)
initn: 4171 init1: 4171 opt: 4171 Z-score: 1820.0 bits: 347.8 E(85289): 1.2e-94
Smith-Waterman score: 4171; 100.0% identity (100.0% similar) in 612 aa overlap (1-612:1-612)
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pF1KB4 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQVPTGPWFCRKCESQERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQVPTGPWFCRKCESQERA
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pF1KB4 ARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTMEPIVLQYVPHDRFNKTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTMEPIVLQYVPHDRFNKTC
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pF1KB4 YICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQMAGLLCEEEVLEVDNVKYCGYCKYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQMAGLLCEEEVLEVDNVKYCGYCKYH
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pF1KB4 FSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASPSTQQEKHPTHHERGQKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASPSTQQEKHPTHHERGQKK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 KKSSSHSLSHKGKKLSSGKGVSSFTSASSSSSSSSSSSGGPFQPAVSSLQSSPDFSAFPK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB4 APSPGDYKSPHVTGSGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRSRHGPGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APSPGDYKSPHVTGSGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRSRHGPGR
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pF1KB4 PKGSRNKEGTGGPAAPSLPSAQLAGFTATAASPFSGGSLVSSGLGGLSSRTFGPSGSLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKGSRNKEGTGGPAAPSLPSAQLAGFTATAASPFSGGSLVSSGLGGLSSRTFGPSGSLPS
490 500 510 520 530 540
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pF1KB4 LSLESPLLGAGIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLGPPGTSALPRLSRSPFTSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSLESPLLGAGIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLGPPGTSALPRLSRSPFTSTL
550 560 570 580 590 600
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pF1KB4 PSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGTPMGAVNPLLSQAESSHTEPDLEDCSFRCRG
::::::::::::
XP_016 PSSSASISTTQVGHPSPACDPRKNGRAFWLPPPSGHCPPCKNKQAGCGGSRL
610 620 630 640 650
>>NP_001182555 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform c [H (1068 aa)
initn: 1913 init1: 1337 opt: 2187 Z-score: 961.6 bits: 189.7 E(85289): 8e-47
Smith-Waterman score: 2454; 44.0% identity (67.6% similar) in 1095 aa overlap (1-1009:18-1037)
10 20 30 40
pF1KB4 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQACYGIVQ
::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_001 MVSSDRPVSLEDEVSHSMKEMIGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHGCSVAVHQACYGIVQ
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pF1KB4 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVLTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
NP_001 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
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pF1KB4 EPIVLQYVPHDRFNKTCYICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQMAGLLCEE
:::::: :::::.:::::::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::.:::::::
NP_001 EPIVLQSVPHDRYNKTCYICDEQGRESKAATGACMTCNKHGCRQAFHVTCAQFAGLLCEE
130 140 150 160 170 180
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pF1KB4 EVLEVDNVKYCGYCKYHFSKMKTSRHSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGFISGRRSRSASP
: .:::.:::::::::::.: :...:. : .: : :
NP_001 EGNGADNVQYCGYCKYHFSKLKKSKRGSNR--------------------SYDQSLSDSS
190 200 210 220
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pF1KB4 STQQEKHPTHHERGQKKSRKDKERLKQKHKKRPESPPSILTPPVVPTADKVSSSASSSS-
: .:.: :::. .::. :.:.. ::::::.:: :. :.: .. :..:. .:.:..:
NP_001 SHSQDK---HHEK-EKKKYKEKDKHKQKHKKQPEPSPA-LVPSLTVTTEKTYTSTSNNSI
230 240 250 260 270
290 300 310
pF1KB4 -----------------------HHEASTQETSES-SRESKGKKSSSHSLSHKGKKLSSG
: .: ...::. . :.::::::.:: ...:.: ..:
NP_001 SGSLKRLEDTTARFTNANFQEVSAHTSSGKDVSETRGSEGKGKKSSAHSSGQRGRKPGGG
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 KGVSSFTSASSS--SSSSSSSSGGPFQPAVSSLQSSPDFSAFPKLEQPEEDKYSKPTAPA
.. .. .::.: ..: :.. :. . . ::.:: :: .: . ..:.::.
NP_001 RNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSVKSSSGSSVQSPQDFLSFTDSDL-RNDSYSH-----
340 350 360 370 380
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pF1KB4 PSAPPSPSAPEPPKADLFEQKVVFSGFGPIMRFSTTTSSSGRARA--PSPGDYKSPHVTG
. : .. . :.. :. ..:. .. . .:.. ... .. :::: . .
NP_001 --SQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGLPSTSAVTSQPKSFENSPGDLGN----S
390 400 410 420 430 440
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pF1KB4 SGASAGTHKRMPALSATPVPADETPETGLKEKKHKASKRSRHGPGRPKGSRNKEGTG---
: .:: .:: . : .:: .::::.:..:.:.::::::::..:.:...
NP_001 SLPTAG-YKR----AQTSGIEEET----VKEKKRKGNKQSKHGPGRPKGNKNQENVSHLS
450 460 470 480 490
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pF1KB4 -GPAAPSLPSAQLAGFTATAA---SP--FSGGSLVS-----SGLGGLSSRTFGPSGSLPS
. :.:. :. :: .... :: . .::: : : .:. : . .:. :.
NP_001 VSSASPTSSVASAAGSITSSSLQKSPTLLRNGSLQSLSVGSSPVGSEISMQYRHDGACPT
500 510 520 530 540 550
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pF1KB4 LSLESPLLGA---GIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLGPPGTSALPRLSR-SPF
.. : ::.: :::.:: .: . . . :::.::: : ... : ... ::
NP_001 TTF-SELLNAIHNGIYNSNDVAVSFPNVVSGSGSSTPVSSSHLPQQSSGHLQQVGALSP-
560 570 580 590 600 610
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pF1KB4 TSTLPSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGT-PMGAVNPLLSQAESSHTEPDLEDCS
:.. :.. ...:::. .:.::..: .:..:. ... :..:.:...:. :: : :
NP_001 -SAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYGNRSNSSMAALIAQSENNQTDQDLGDNS
620 630 640 650 660 670
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pF1KB4 --FRCRGTSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAAPGTTNMEQLLEKQ-GD
. ::.::. ::: ::.::: .:: : :...:. : ....:::::.: ..
NP_001 RNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQ----P-GNSSLENLPPVAASIEQLLERQWSE
680 690 700 710 720
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pF1KB4 G-----EAGV--NIVEMLKALHALQKENQRLQEQILSLTAKKERLQILNVQLSVPFPALP
: : :. .:. :::.:: :: ::.::.::: .:::::::::.::.:::::::..
NP_001 GQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNLTAKKERLQLLNAQLSVPFPTIT
730 740 750 760 770 780
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pF1KB4 AALPAANGPVPGPYGLPPQ-AGSSDSLSTSKSPPGKSSLGLDNSLSTSSED-PHSGCPSR
: :. . . . . : : ..:::..:::: .:. :::: . ..: :: .
NP_001 AN-PSPSHQI---HTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFLPDNSLPVLNQDLTSSGQSTS
790 800 810 820 830 840
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pF1KB4 SSSSLSFHSTPPPLPLLQQSPATLPLALPGAPAPLPPQPQNGL-------GRAPGAAGLG
:::.:: :::: :::: .. :. : ::. : : .. .
NP_001 SSSALS---TPPPAG---QSPAQQGSGVSGV------QQVNGVTVGALASGMQPVTSTIP
850 860 870 880 890
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pF1KB4 AMPMAEGLLGGLAGSGGLPLNGLLGGLNGAA-AP-----NPASLSQAGGAP--TLQLPGC
:. . :..:.: :. : .::..:.:::. .: ::. :... : : .:.
NP_001 AVSAVGGIIGALPGNQ-LAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPLTHTTVPPNATHPMPAT
900 910 920 930 940
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pF1KB4 L-NS------LTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLLASPQLTPE-HQTVVYQMIQQIQQKR--
: :: :..:::..: .: ::.:::: : ::::: ::. .::..:. .:..
NP_001 LTNSASGLGLLSDQQRQILIHQ----QQFQQLLNSQQLTPEQHQAFLYQLMQHHHQQHHQ
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980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KB4 -ELQRLQMAGGSQLPMASLLAGSSTPLLSAGTPGLLPTASAPPLLPAGALVAPSLGNNTS
:::.::. : .:.:. .::::...: : ..:
NP_001 PELQQLQIPGPTQIPINNLLAGTQAPPLHTATTNPFLTIHGDNASQKVARLSDKTGPVAQ
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1040 1050 1060 1070 1080 1090
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NP_001 EKS
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10 20 30 40
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NP_004 VPTGPWFCRKCESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQFANVSTM
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:::::: :::::.:::::::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::.:::::::
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: .:::.:::::::::::.: :...:. : .: : :
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: .:.:: ::. .::. :.:.. ::::::.:: :. :.: .. :..:. .:.:..:
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: .: ...::. . :.::::::.:: ...:.: ..:
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.. .. .::.: ..: :.. :. . . ::.:: :: .: . ..:.::.
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. : .. . :.. :. ..:. .. . .:.. ... .. :::: . .
NP_004 --SQQSSATKDVHKGESGSQEGGVNSFSTLIGLPSTSAVTSQPKSFENSPGDLGNSSLPT
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.: .:: . : .:: .::::.:..:.:.::::::::..:.:...
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. :.:. :. :: .... :: . .::: : : .:. : . .:. :.
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pF1KB4 LSLESPLLGA-------------------GIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSSSLLG
.. : ::.: :::.:: .: . . . :::.::: :
NP_004 TTF-SELLNAIHNDRGDSSTLTKQELKFIGIYNSNDVAVSFPNVVSGSGSSTPVSSSHLP
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... : ... :: :.. :.. ...:::. .:.::..: .:..:. ... :.
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pF1KB4 SQAESSHTEPDLEDCS--FRCRGTSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQLDPAA
.:.:...:. :: : : . ::.::. ::: ::.::: .:: : :...:.
NP_004 AQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQ----P-GNSSLENLP
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: ....:::::.: ..: : :. .:. :::.:: :: ::.::.::: .:::::::
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::.::.:::::::.. : :. . . . . : : ..:::..:::: .:. :::
NP_004 LQLLNAQLSVPFPTITAN-PSPSHQI---HTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFLPDNS
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pF1KB4 LSTSSED-PHSGCPSRSSSSLSFHSTPPPLPLLQQSPATLPLALPGAPAPLPPQPQNGL-
: . ..: :: . :::.: ::::: :::: .. :. : ::.
NP_004 LPVLNQDLTSSGQSTSSSSAL---STPPP---AGQSPAQQGSGVSGV------QQVNGVT
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: : .. . :. . :..:.: :. : .::..:.:::. .: ::. :
NP_004 VGALASGMQPVTSTIPAVSAVGGIIGALPGNQ-LAINGIVGALNGVMQTPVTMSQNPTPL
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pF1KB4 SQAGGAP--TLQLPGCL-NS------LTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLLASPQLTPEHQT
... : : .:. : :: :..:::..: .: ::.:::: : :::: :.
NP_004 THTTVPPNATHPMPATLTNSASGLGLLSDQQRQILIHQ----QQFQQLLNSQQLTPVHRH
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 VVYQMIQQIQQKRELQRLQMAGGSQLPMASLLAGSSTPLLSAGTPGLLPTASAPPLLPAG
NP_004 PHFTQLPPTHFSPSMEIMQVRK
1010 1020
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NP_001 KGKKSSAHSSGQRGRKPGGGRNPGTTVSAASPFPQGSFSGTPGSVKSSSGSSVQSPQDFL
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.: . ..:.::. . : .. . :.. :. ..:. .. . .:.. .
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.. .. :::: . . .: .:: . : .:: .::::.:..:.:
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pF1KB4 -SGLGGLSSRTFGPSGSLPSLSLESPLLGA---GIYTSNKDPISHSGGMLRAVCSTPLSS
: .:. : . .:. :. .. : ::.: :::.:: .: . . . :::.::
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pF1KB4 SLLGPPGTSALPRLSR-SPFTSTLPSSSASISTTQVFSLAGSTFSLPSTHIFGT-PMGAV
: : ... : ... :: :.. :.. ...:::. .:.::..: .:..:. ...
NP_001 SHLPQQSSGHLQQVGALSP--SAVSSAAPAVATTQANTLSGSSLSQAPSHMYGNRSNSSM
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pF1KB4 NPLLSQAESSHTEPDLEDCS--FRCRGTSPQESLSSMSPISSLPALFDQTASAPCGGGQL
:..:.:...:. :: : : . ::.::. ::: ::.::: .:: : :...:
NP_001 AALIAQSENNQTDQDLGDNSRNLVGRGSSPRGSLSPRSPVSSLQIRYDQ----P-GNSSL
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pF1KB4 DPAAPGTTNMEQLLEKQ-GDG-----EAGV--NIVEMLKALHALQKENQRLQEQILSLTA
. : ....:::::.: ..: : :. .:. :::.:: :: ::.::.::: .:::
NP_001 ENLPPVAASIEQLLERQWSEGQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNLTA
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pF1KB4 KKERLQILNVQLSVPFPALPAALPAANGPVPGPYGLPPQ-AGSSDSLSTSKSPPGKSSLG
::::::.::.:::::::.. : :. : . . : : ..:::..:::: .:.
NP_001 KKERLQLLNAQLSVPFPTITAN-PS---PSHQIHTFSAQTAPTTDSLNSSKSPHIGNSFL
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pF1KB4 LDNSLSTSSED-PHSGCPSRSSSSLSFHSTPPPLPLLQQSPATLPLALPGAPAPLPPQPQ
:::: . ..: :: . :::.:: :::: :::: .. :. :
NP_001 PDNSLPVLNQDLTSSGQSTSSSSALS---TPPPAG---QSPAQQGSGVSGV------QQV
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pF1KB4 NGL-------GRAPGAAGLGAMPMAEGLLGGLAGSGGLPLNGLLGGLNGAA-AP-----N
::. : : .. . :. . :..:.: :. : .::..:.:::. .: :
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pF1KB4 PASLSQAGGAP--TLQLPGCL-NS------LTEQQRHLLQQQEQQLQQLQQLLASPQLTP
:. :... : : .:. : :: :..:::..: .: ::.:::: : ::::
NP_001 PTPLTHTTVPPNATHPMPATLTNSASGLGLLSDQQRQILIHQ----QQFQQLLNSQQLTP
690 700 710 720 730 740
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pF1KB4 E-HQTVVYQMIQQIQQKR---ELQRLQMAGGSQLPMASLLAGSSTPLLSAGTPGLLPTAS
: ::. .::..:. .:.. :::.::. : .:.:. .::::...: : ..:
NP_001 EQHQAFLYQLMQHHHQQHHQPELQQLQIPGPTQIPINNLLAGTQAPPLHTATTNPFLTIH
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1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB4 APPLLPAGALVAPSLGNNTSLMAAAAAAAAVAAAGGPPVLTAQTNPFLSLSGAEGSGGGP
NP_001 GDNASQKVARLSDKTGPVAQEKS
810 820
>>NP_001305978 (OMIM: 602410) peregrin isoform 3 [Homo s (1119 aa)
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pF1KB4 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQA
::.:.: . : ...:: :..::::
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pF1KB4 CYGIVQVPTGPWFCRKC-ESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQ
:::. .: : :.::.: .: :: : : :::.: ::.:.::.: ::::::::.::::
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pF1KB4 FANVLTMEPI-VLQYVPHDRFNKTCYICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQ
:::.. .::: ....: :.. :::::...: ::::. :.. .: ::::::::
NP_001 FANTVFLEPIDSIEHIPPARWKLTCYICKQRG------SGACIQCHKANCYTAFHVTCAQ
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.::: .... :. : :: ::. :. :
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pF1KB4 ISGRRSRSASPSTQQEKHPTHHERGQK------KSRKDKERLKQKH------KKRPESPP
:.:: . : : .: . ....:. :. : : :.:.:. .:: .:
NP_001 -SARRLPALSHSEGEEDEDEEEDEGKGWSSEKVKKAKAKSRIKMKKARKILAEKRAAAP-
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pF1KB4 SILTPPVVPTADKVSSSASSSSHHEASTQETSESSRESKGKKSSSHSLSHKGKKLSSGKG
... : .:
NP_001 -VVSVPCIPPHRLSKITNRLTIQRKSQFMQRLHSYWTLKRQSRNGVPLLRRLQTHLQSQR
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initn: 538 init1: 221 opt: 601 Z-score: 277.7 bits: 63.2 E(85289): 9.9e-09
Smith-Waterman score: 605; 37.6% identity (59.5% similar) in 279 aa overlap (8-269:276-517)
10 20 30
pF1KB4 MKEMVGGCCVCSDERGWAENPLVYCDGHACSVAVHQA
::.:.: . : ...:: :..::::
XP_005 EYLMDRLEKESYFESHNKGDPNALVDEDAVCCICNDGECQNSNVILFCD--MCNLAVHQE
250 260 270 280 290 300
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pF1KB4 CYGIVQVPTGPWFCRKC-ESQERAARVRCELCPHKDGALKRTDNGGWAHVVCALYIPEVQ
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XP_005 CYGVPYIPEGQWLCRRCLQSPSRA--VDCALCPNKGGAFKQTDDGRWAHVVCALWIPEVC
310 320 330 340 350 360
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pF1KB4 FANVLTMEPI-VLQYVPHDRFNKTCYICEEQGRESKAASGACMTCNRHGCRQAFHVTCAQ
:::.. .::: ....: :.. :::::...: ::::. :.. .: ::::::::
XP_005 FANTVFLEPIDSIEHIPPARWKLTCYICKQRG------SGACIQCHKANCYTAFHVTCAQ
370 380 390 400 410
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 MAGLLCEEEVLEVDNVKYCGYCKYHFSKMKTSR---HSSGGGGGGAGGGGGSMGGGGSGF
.::: .... :. : :: ::. :. :
XP_005 QAGLY-----MKMEPVRETGANGTSFSVRKTAYCDIHTPPG-------------------
420 430 440 450
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pF1KB4 ISGRRSRSASPSTQQEKHPTHHERGQK------KSRKDKERLKQKH------KKRPESPP
:.:: . : : .: . ....:. :. : : :.:.:. .:: .:
XP_005 -SARRLPALSHSEGEEDEDEEEDEGKGWSSEKVKKAKAKSRIKMKKARKILAEKRAAAP-
460 470 480 490 500
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pF1KB4 SILTPPVVPTADKVSSSASSSSHHEASTQETSESSRESKGKKSSSHSLSHKGKKLSSGKG
... : .:
XP_005 -VVSVPCIPPHRLSKITNRLTIQRKSQFMQRLHSYWTLKRQSRNGVPLLRRLQTHLQSQR
510 520 530 540 550 560
1093 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 21:33:06 2016 done: Thu Nov 3 21:33:09 2016
Total Scan time: 19.730 Total Display time: 0.290
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]