Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4347
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4347, 212 aa
1>>>pF1KB4347 212 - 212 aa - 212 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3531+/- 0.001; mu= 13.6125+/- 0.060
mean_var=79.8883+/-15.929, 0's: 0 Z-trim(105.5): 206 B-trim: 301 in 1/51
Lambda= 0.143494
statistics sampled from 8227 (8464) to 8227 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 1.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8 ( 212) 1392 297.6 3.7e-81
CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14 ( 216) 1191 256.0 1.3e-68
CCDS56537.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8 ( 188) 1132 243.8 5.3e-65
CCDS6827.1 RAB14 gene_id:51552|Hs108|chr9 ( 215) 825 180.3 8e-46
CCDS31050.1 RAB4A gene_id:5867|Hs108|chr1 ( 218) 713 157.1 7.7e-39
CCDS33030.1 RAB4B gene_id:53916|Hs108|chr19 ( 213) 694 153.1 1.2e-37
CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15 ( 207) 635 140.9 5.4e-34
CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19 ( 218) 615 136.8 9.9e-33
CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19 ( 207) 609 135.5 2.3e-32
CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15 ( 216) 604 134.5 4.8e-32
CCDS8338.1 RAB39A gene_id:54734|Hs108|chr11 ( 217) 603 134.3 5.5e-32
CCDS14766.1 RAB39B gene_id:116442|Hs108|chrX ( 213) 599 133.5 9.7e-32
CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2 ( 205) 597 133.1 1.2e-31
CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1 ( 203) 592 132.0 2.5e-31
CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2 ( 200) 588 131.2 4.5e-31
CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11 ( 201) 585 130.6 6.9e-31
CCDS7155.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10 ( 206) 576 128.7 2.6e-30
CCDS32722.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 223) 569 127.3 7.4e-30
CCDS82198.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 196) 568 127.0 7.7e-30
CCDS54161.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 228) 568 127.1 8.7e-30
CCDS11703.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 216) 566 126.7 1.1e-29
CCDS41413.1 RAB25 gene_id:57111|Hs108|chr1 ( 213) 561 125.6 2.3e-29
CCDS33850.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3 ( 212) 557 124.8 4e-29
CCDS34762.2 RAB19 gene_id:401409|Hs108|chr7 ( 217) 543 121.9 3e-28
CCDS8264.1 RAB30 gene_id:27314|Hs108|chr11 ( 203) 541 121.5 3.8e-28
CCDS10460.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16 ( 256) 541 121.5 4.6e-28
CCDS76691.1 RAB15 gene_id:376267|Hs108|chr14 ( 212) 531 119.4 1.7e-27
CCDS76806.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16 ( 190) 525 118.1 3.6e-27
CCDS58373.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15 ( 155) 519 116.8 7.3e-27
CCDS12372.1 RAB3A gene_id:5864|Hs108|chr19 ( 220) 515 116.1 1.7e-26
CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12 ( 201) 501 113.2 1.2e-25
CCDS11419.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17 ( 216) 498 112.6 1.9e-25
CCDS58551.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17 ( 249) 498 112.6 2.1e-25
CCDS42410.1 RAB12 gene_id:201475|Hs108|chr18 ( 244) 494 111.8 3.7e-25
CCDS8900.1 RAB5B gene_id:5869|Hs108|chr12 ( 215) 488 110.5 8e-25
CCDS3082.1 RAB6B gene_id:51560|Hs108|chr3 ( 208) 483 109.5 1.6e-24
CCDS12257.1 RAB3D gene_id:9545|Hs108|chr19 ( 219) 478 108.4 3.4e-24
CCDS560.1 RAB3B gene_id:5865|Hs108|chr1 ( 219) 476 108.0 4.6e-24
CCDS2520.1 RAB17 gene_id:64284|Hs108|chr2 ( 212) 472 107.2 7.9e-24
CCDS3976.1 RAB3C gene_id:115827|Hs108|chr5 ( 227) 472 107.2 8.3e-24
CCDS8223.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11 ( 208) 471 107.0 9e-24
CCDS2633.1 RAB5A gene_id:5868|Hs108|chr3 ( 215) 468 106.4 1.4e-23
CCDS9003.1 RAB21 gene_id:23011|Hs108|chr12 ( 225) 463 105.3 3e-23
CCDS8224.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11 ( 208) 461 104.9 3.8e-23
CCDS54162.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17 ( 186) 459 104.5 4.6e-23
CCDS3747.1 RAB33B gene_id:83452|Hs108|chr4 ( 229) 453 103.3 1.3e-22
CCDS33497.1 RAB22A gene_id:57403|Hs108|chr20 ( 194) 451 102.8 1.5e-22
CCDS44803.1 CRACR2A gene_id:84766|Hs108|chr12 ( 731) 441 101.2 1.7e-21
CCDS45826.1 RAB31 gene_id:11031|Hs108|chr18 ( 195) 423 97.0 8.4e-21
CCDS75442.1 RAB44 gene_id:401258|Hs108|chr6 (1021) 429 98.8 1.3e-20
>>CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8 (212 aa)
initn: 1392 init1: 1392 opt: 1392 Z-score: 1570.6 bits: 297.6 E(32554): 3.7e-81
Smith-Waterman score: 1392; 100.0% identity (100.0% similar) in 212 aa overlap (1-212:1-212)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGKQIKLQIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGKQIKLQIW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIMLIGNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 DTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIMLIGNK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 SDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGVFDINN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGVFDINN
130 140 150 160 170 180
190 200 210
pF1KB4 EANGIKIGPQHAATNATHAGNQGGQQAGGGCC
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 EANGIKIGPQHAATNATHAGNQGGQQAGGGCC
190 200 210
>>CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14 (216 aa)
initn: 1188 init1: 1165 opt: 1191 Z-score: 1345.6 bits: 256.0 E(32554): 1.3e-68
Smith-Waterman score: 1191; 83.8% identity (96.3% similar) in 216 aa overlap (1-212:1-216)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGKQIKLQIW
:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::
CCDS95 MTYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMVNIDGKQIKLQIW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIMLIGNK
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::.:::::::::::
CCDS95 DTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRETFNHLTSWLEDARQHSSSNMVIMLIGNK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 SDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGVFDINN
:::::::.::.:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.:::.:.::..:
CCDS95 SDLESRRDVKREEGEAFAREHGLIFMETSAKTACNVEEAFINTAKEIYRKIQQGLFDVHN
130 140 150 160 170 180
190 200 210
pF1KB4 EANGIKIGPQHAATNAT--HAGNQGGQQAGG--GCC
::::::::::.. .... :....... :. :::
CCDS95 EANGIKIGPQQSISTSVGPSASQRNSRDIGSNSGCC
190 200 210
>>CCDS56537.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8 (188 aa)
initn: 1132 init1: 1132 opt: 1132 Z-score: 1280.4 bits: 243.8 E(32554): 5.3e-65
Smith-Waterman score: 1170; 88.7% identity (88.7% similar) in 212 aa overlap (1-212:1-188)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGKQIKLQIW
::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS56 MAYAYLFKYIIIGDTGV------------------------EFGARMITIDGKQIKLQIW
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIMLIGNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIMLIGNK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 SDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGVFDINN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGVFDINN
100 110 120 130 140 150
190 200 210
pF1KB4 EANGIKIGPQHAATNATHAGNQGGQQAGGGCC
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EANGIKIGPQHAATNATHAGNQGGQQAGGGCC
160 170 180
>>CCDS6827.1 RAB14 gene_id:51552|Hs108|chr9 (215 aa)
initn: 806 init1: 787 opt: 825 Z-score: 936.1 bits: 180.3 E(32554): 8e-46
Smith-Waterman score: 825; 58.9% identity (84.2% similar) in 209 aa overlap (3-211:8-215)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGKQI
:.:.:::::::: :::::::: :::.:.:. :::::::.:.: ..:..:
CCDS68 MATAPYNYSYIFKYIIIGDMGVGKSCLLHQFTEKKFMADCPHTIGVEFGTRIIEVSGQKI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 KLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIM
::::::::::: ::..::::::::::::.:::::::.:.:::..:: :::. .: : ::.
CCDS68 KLQIWDTAGQERFRAVTRSYYRGAAGALMVYDITRRSTYNHLSSWLTDARNLTNPNTVII
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 LIGNKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGV
:::::.:::..:.: ::.. ::.:.::.:.:.::::. :::.::...::.::..::.:
CCDS68 LIGNKADLEAQRDVTYEEAKQFAEENGLLFLEASAKTGENVEDAFLEAAKKIYQNIQDGS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KB4 FDINNEANGIKIGPQHAATNATHAGNQGGQQAGGGCC
.:.: .:.. :. : .. ... :. : ::
CCDS68 LDLNAAESGVQHKPS-APQGGRLTSEPQPQREGCGC
190 200 210
>>CCDS31050.1 RAB4A gene_id:5867|Hs108|chr1 (218 aa)
initn: 713 init1: 713 opt: 713 Z-score: 810.7 bits: 157.1 E(32554): 7.7e-39
Smith-Waterman score: 713; 57.5% identity (82.8% similar) in 186 aa overlap (3-188:10-195)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGK
: .:::...::..:.:::::: :: .:.:. . :::::::...:.. ::
CCDS31 MSQTAMSETYDFLFKFLVIGNAGTGKSCLLHQFIEKKFKDDSNHTIGVEFGSKIINVGGK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 QIKLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMV
.::::::::::: :::.:::::::::::::::::: :.:.: ::.:: :::. ...:.:
CCDS31 YVKLQIWDTAGQERFRSVTRSYYRGAAGALLVYDITSRETYNALTNWLTDARMLASQNIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 IMLIGNKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQE
:.: :::.::.. ::: :. ::.:. :.:.:::: :. ::::::.. :..: .::.
CCDS31 IILCGNKKDLDADREVTFLEASRFAQENELMFLETSALTGENVEEAFVQCARKILNKIES
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KB4 GVFDINNEANGIKIGPQHAATNATHAGNQGGQQAGGGCC
: .: . ..::. :
CCDS31 GELDPERMGSGIQYGDAALRQLRSPRRAQAPNAQECGC
190 200 210
>>CCDS33030.1 RAB4B gene_id:53916|Hs108|chr19 (213 aa)
initn: 694 init1: 694 opt: 694 Z-score: 789.6 bits: 153.1 E(32554): 1.2e-37
Smith-Waterman score: 694; 55.9% identity (81.2% similar) in 186 aa overlap (3-188:5-190)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGKQIKLQ
: .:::...::..:.:::::: :: ...:. . :::::::.:.... :: .:::
CCDS33 MAETYDFLFKFLVIGSAGTGKSCLLHQFIENKFKQDSNHTIGVEFGSRVVNVGGKTVKLQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 IWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIMLIG
:::::::: :::.:::::::::::::::::: :.:.: :..:: ::: .. :.:..: :
CCDS33 IWDTAGQERFRSVTRSYYRGAAGALLVYDITSRETYNSLAAWLTDARTLASPNIVVILCG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 NKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGVFDI
::.::. .::: :. ::.:. :.:.:::: :. ::::::.. :. : .::. : .:
CCDS33 NKKDLDPEREVTFLEASRFAQENELMFLETSALTGENVEEAFLKCARTILNKIDSGELDP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KB4 NNEANGIKIGPQHAATNATHAGNQGGQQAGGGCC
. ..::. :
CCDS33 ERMGSGIQYGDASLRQLRQPRSAQAVAPQPCGC
190 200 210
>>CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15 (207 aa)
initn: 611 init1: 611 opt: 635 Z-score: 723.8 bits: 140.9 E(32554): 5.4e-34
Smith-Waterman score: 635; 47.7% identity (79.8% similar) in 193 aa overlap (3-195:5-194)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGKQIKLQ
: :::: ..:::.::::.:::..:.. :. . :::..: : : .:::.::::
CCDS10 MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCLLFRFSEDAFNTTFISTIGIDFKIRTIELDGKKIKLQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 IWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIMLIG
:::::::: ::.:: .::::: : .:::::: . .:... .:... ..:..:.. :..:
CCDS10 IWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIKNWIRNIEEHASSDVERMILG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 NKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGVFDI
:: :....:.:.::.:: .: ..:. :.:::::...::::::.. :..:. :... . :
CCDS10 NKCDMNDKRQVSKERGEKLAIDYGIKFLETSAKSSANVEEAFFTLARDIMTKLNRKMNDS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KB4 NNEANGIKIGPQHAATNATHAGNQGGQQAGGGCC
:. . : :: . . :
CCDS10 NSAGAG---GPVKITENRSKKTSFFRCSLL
190 200
>>CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19 (218 aa)
initn: 627 init1: 604 opt: 615 Z-score: 701.1 bits: 136.8 E(32554): 9.9e-33
Smith-Waterman score: 615; 48.3% identity (74.9% similar) in 211 aa overlap (3-212:8-215)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGKQI
: :::: ..:::.::::: :: .:: ..:. ::::::..: : .::: :
CCDS12 MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 KLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIM
: ::::::::: .:.:: .:::::.::::::::... :.... ::.. :.:..::.:::
CCDS12 KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 LIGNKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGV
:.::::::. : : .:..:::....: :.:::: ..:::::: : :::. ...
CCDS12 LVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNNLSFIETSALDSTNVEEAFKNILTEIYRIVSQK-
130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KB4 FDINNEANGIKIGPQHAATNATHAGNQGGQQAGG-GCC
.: ..: . .: . ... . . ::. . ::
CCDS12 -QIADRAAHDE-SPGNNVVDISVPPTTDGQKPNKLQCCQNL
180 190 200 210
>>CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19 (207 aa)
initn: 607 init1: 591 opt: 609 Z-score: 694.7 bits: 135.5 E(32554): 2.3e-32
Smith-Waterman score: 609; 46.1% identity (79.6% similar) in 191 aa overlap (3-191:5-195)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGKQIKLQ
: :::: ..:::.::::.:.:..:.. :. . :::..: : : .:::.::::
CCDS12 MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 IWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIMLIG
:::::::: ::.:: .::::: : .:::::: . .:... .:... ..:..... :..:
CCDS12 IWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKMILG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 NKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGVFDI
:: :....:.:.::.:: .: ..:. :::::::. :::.::.. :..: :... .
CCDS12 NKCDVNDKRQVSKERGEKLALDYGIKFMETSAKANINVENAFFTLARDIKAKMDKKLEGN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KB4 NNEAN--GIKIGPQHAATNATHAGNQGGQQAGGGCC
. ... :.:: :..
CCDS12 SPQGSNQGVKITPDQQKRSSFFRCVLL
190 200
>>CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15 (216 aa)
initn: 621 init1: 598 opt: 604 Z-score: 688.8 bits: 134.5 E(32554): 4.8e-32
Smith-Waterman score: 604; 55.0% identity (80.1% similar) in 171 aa overlap (3-173:8-178)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGKQI
: :::: ..:::.::::: :: .:: ..:. ::::::..: : .::: :
CCDS10 MGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 KLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSNSNMVIM
: ::::::::: .:.:: .:::::.::::::::... :.... ::.. :.:..::.:::
CCDS10 KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 LIGNKSDLESRREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTASNVEEAFINTAKEIYEKIQEGV
:.::::::. : : .:..:::...:: :.:::: ..::: :: . :::. ...
CCDS10 LVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNGLSFIETSALDSTNVEAAFQTILTEIYRIVSQKQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KB4 FDINNEANGIKIGPQHAATNATHAGNQGGQQAGGGCC
CCDS10 MSDRRENDMSPSNNVVPIHVPPTTENKPKVQCCQNI
190 200 210
212 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 20:39:49 2016 done: Fri Nov 4 20:39:49 2016
Total Scan time: 1.940 Total Display time: -0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]