Result of FASTA (ccds) for pF1KB4367
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4367, 1124 aa
  1>>>pF1KB4367 1124 - 1124 aa - 1124 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2145+/-0.00118; mu= -8.0253+/- 0.071
 mean_var=465.7472+/-96.890, 0's: 0 Z-trim(114.3): 754  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.059429
 statistics sampled from 14012 (14849) to 14012 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.456), width:  16
 Scan time:  6.030

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS7169.1 ZEB1 gene_id:6935|Hs108|chr10           (1124) 7521 660.4 6.5e-189
CCDS53505.1 ZEB1 gene_id:6935|Hs108|chr10          (1125) 7501 658.7 2.1e-188
CCDS44370.1 ZEB1 gene_id:6935|Hs108|chr10          (1108) 7360 646.6 9.2e-185
CCDS53507.1 ZEB1 gene_id:6935|Hs108|chr10          (1057) 6922 609.0 1.8e-173
CCDS53506.1 ZEB1 gene_id:6935|Hs108|chr10          (1104) 6813 599.7 1.2e-170
CCDS54403.1 ZEB2 gene_id:9839|Hs108|chr2           (1190) 1071 107.4   2e-22
CCDS2186.1 ZEB2 gene_id:9839|Hs108|chr2            (1214) 1071 107.4   2e-22


>>CCDS7169.1 ZEB1 gene_id:6935|Hs108|chr10                (1124 aa)
 initn: 7521 init1: 7521 opt: 7521  Z-score: 3505.1  bits: 660.4 E(32554): 6.5e-189
Smith-Waterman score: 7521; 100.0% identity (100.0% similar) in 1124 aa overlap (1-1124:1-1124)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MADGPRCKRRKQANPRRNNVTNYNTVVETNSDSDDEDKLHIVEEESVTDAADCEGVPEDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MADGPRCKRRKQANPRRNNVTNYNTVVETNSDSDDEDKLHIVEEESVTDAADCEGVPEDD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 LPTDQTVLPGRSSEREGNAKNCWEDDRKEGQEILGPEAQADEAGCTVKDDECESDAENEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 LPTDQTVLPGRSSEREGNAKNCWEDDRKEGQEILGPEAQADEAGCTVKDDECESDAENEQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 NHDPNVEEFLQQQDTAVIFPEAPEEDQRQGTPEASGHDENGTPDAFSQLLTCPYCDRGYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 NHDPNVEEFLQQQDTAVIFPEAPEEDQRQGTPEASGHDENGTPDAFSQLLTCPYCDRGYK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 RFTSLKEHIKYRHEKNEDNFSCSLCSYTFAYRTQLERHMTSHKSGRDQRHVTQSGCNRKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 RFTSLKEHIKYRHEKNEDNFSCSLCSYTFAYRTQLERHMTSHKSGRDQRHVTQSGCNRKF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 KCTECGKAFKYKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHISSKKCISLIPVNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 KCTECGKAFKYKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHISSKKCISLIPVNG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 RPRTGLKTSQCSSPSLSASPGSPTRPQIRQKIENKPLQEQLSVNQIKTEPVDYEFKPIVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 RPRTGLKTSQCSSPSLSASPGSPTRPQIRQKIENKPLQEQLSVNQIKTEPVDYEFKPIVV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 ASGINCSTPLQNGVFTGGGPLQATSSPQGMVQAVVLPTVGLVSPISINLSDIQNVLKVAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 ASGINCSTPLQNGVFTGGGPLQATSSPQGMVQAVVLPTVGLVSPISINLSDIQNVLKVAV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 DGNVIRQVLENNQANLASKEQETINASPIQQGGHSVISAISLPLVDQDGTTKIIINYSLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 DGNVIRQVLENNQANLASKEQETINASPIQQGGHSVISAISLPLVDQDGTTKIIINYSLE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 QPSQLQVVPQNLKKENPVATNSCKSEKLPEDLTVKSEKDKSFEGGVNDSTCLLCDDCPGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 QPSQLQVVPQNLKKENPVATNSCKSEKLPEDLTVKSEKDKSFEGGVNDSTCLLCDDCPGD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 INALPELKHYDLKQPTQPPPLPAAEAEKPESSVSSATGDGNLSPSQPPLKNLLSLLKAYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 INALPELKHYDLKQPTQPPPLPAAEAEKPESSVSSATGDGNLSPSQPPLKNLLSLLKAYY
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 ALNAQPSAEELSKIADSVNLPLDVVKKWFEKMQAGQISVQSSEPSSPEPGKVNIPAKNND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 ALNAQPSAEELSKIADSVNLPLDVVKKWFEKMQAGQISVQSSEPSSPEPGKVNIPAKNND
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 QPQSANANEPQDSTVNLQSPLKMTNSPVLPVGSTTNGSRSSTPSPSPLNLSSSRNTQGYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 QPQSANANEPQDSTVNLQSPLKMTNSPVLPVGSTTNGSRSSTPSPSPLNLSSSRNTQGYL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 YTAEGAQEEPQVEPLDLSLPKQQGELLERSTITSVYQNSVYSVQEEPLNLSCAKKEPQKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 YTAEGAQEEPQVEPLDLSLPKQQGELLERSTITSVYQNSVYSVQEEPLNLSCAKKEPQKD
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 SCVTDSEPVVNVIPPSANPINIAIPTVTAQLPTIVAIADQNSVPCLRALAANKQTILIPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 SCVTDSEPVVNVIPPSANPINIAIPTVTAQLPTIVAIADQNSVPCLRALAANKQTILIPQ
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 VAYTYSTTVSPAVQEPPLKVIQPNGNQDERQDTSSEGVSNVEDQNDSDSTPPKKKMRKTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 VAYTYSTTVSPAVQEPPLKVIQPNGNQDERQDTSSEGVSNVEDQNDSDSTPPKKKMRKTE
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB4 NGMYACDLCDKIFQKSSSLLRHKYEHTGKRPHECGICKKAFKHKHHLIEHMRLHSGEKPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 NGMYACDLCDKIFQKSSSLLRHKYEHTGKRPHECGICKKAFKHKHHLIEHMRLHSGEKPY
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB4 QCDKCGKRFSHSGSYSQHMNHRYSYCKREAEERDSTEQEEAGPEILSNEHVGARASPSQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 QCDKCGKRFSHSGSYSQHMNHRYSYCKREAEERDSTEQEEAGPEILSNEHVGARASPSQG
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB4 DSDERESLTREEDEDSEKEEEEEDKEMEELQEEKECEKPQGDEEEEEEEEEVEEEEVEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 DSDERESLTREEDEDSEKEEEEEDKEMEELQEEKECEKPQGDEEEEEEEEEVEEEEVEEA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120    
pF1KB4 ENEGEEAKTEGLMKDDRAESQASSLGQKVGESSEQVSEEKTNEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 ENEGEEAKTEGLMKDDRAESQASSLGQKVGESSEQVSEEKTNEA
             1090      1100      1110      1120    

>>CCDS53505.1 ZEB1 gene_id:6935|Hs108|chr10               (1125 aa)
 initn: 6925 init1: 6925 opt: 7501  Z-score: 3495.8  bits: 658.7 E(32554): 2.1e-188
Smith-Waterman score: 7501; 99.8% identity (99.8% similar) in 1125 aa overlap (1-1124:1-1125)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MADGPRCKRRKQANPRRNNVTNYNTVVETNSDSDDEDKLHIVEEESVTDAADCEGVPEDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MADGPRCKRRKQANPRRNNVTNYNTVVETNSDSDDEDKLHIVEEESVTDAADCEGVPEDD
               10        20        30        40        50        60

               70        80         90       100       110         
pF1KB4 LPTDQTVLPGRSSEREGNAKNCWEDDR-KEGQEILGPEAQADEAGCTVKDDECESDAENE
       ::::::::::::::::::::::::::  ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LPTDQTVLPGRSSEREGNAKNCWEDDTGKEGQEILGPEAQADEAGCTVKDDECESDAENE
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB4 QNHDPNVEEFLQQQDTAVIFPEAPEEDQRQGTPEASGHDENGTPDAFSQLLTCPYCDRGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QNHDPNVEEFLQQQDTAVIFPEAPEEDQRQGTPEASGHDENGTPDAFSQLLTCPYCDRGY
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB4 KRFTSLKEHIKYRHEKNEDNFSCSLCSYTFAYRTQLERHMTSHKSGRDQRHVTQSGCNRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KRFTSLKEHIKYRHEKNEDNFSCSLCSYTFAYRTQLERHMTSHKSGRDQRHVTQSGCNRK
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB4 FKCTECGKAFKYKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHISSKKCISLIPVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FKCTECGKAFKYKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHISSKKCISLIPVN
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB4 GRPRTGLKTSQCSSPSLSASPGSPTRPQIRQKIENKPLQEQLSVNQIKTEPVDYEFKPIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GRPRTGLKTSQCSSPSLSASPGSPTRPQIRQKIENKPLQEQLSVNQIKTEPVDYEFKPIV
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB4 VASGINCSTPLQNGVFTGGGPLQATSSPQGMVQAVVLPTVGLVSPISINLSDIQNVLKVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VASGINCSTPLQNGVFTGGGPLQATSSPQGMVQAVVLPTVGLVSPISINLSDIQNVLKVA
              370       380       390       400       410       420

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB4 VDGNVIRQVLENNQANLASKEQETINASPIQQGGHSVISAISLPLVDQDGTTKIIINYSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VDGNVIRQVLENNQANLASKEQETINASPIQQGGHSVISAISLPLVDQDGTTKIIINYSL
              430       440       450       460       470       480

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB4 EQPSQLQVVPQNLKKENPVATNSCKSEKLPEDLTVKSEKDKSFEGGVNDSTCLLCDDCPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EQPSQLQVVPQNLKKENPVATNSCKSEKLPEDLTVKSEKDKSFEGGVNDSTCLLCDDCPG
              490       500       510       520       530       540

     540       550       560       570       580       590         
pF1KB4 DINALPELKHYDLKQPTQPPPLPAAEAEKPESSVSSATGDGNLSPSQPPLKNLLSLLKAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DINALPELKHYDLKQPTQPPPLPAAEAEKPESSVSSATGDGNLSPSQPPLKNLLSLLKAY
              550       560       570       580       590       600

     600       610       620       630       640       650         
pF1KB4 YALNAQPSAEELSKIADSVNLPLDVVKKWFEKMQAGQISVQSSEPSSPEPGKVNIPAKNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YALNAQPSAEELSKIADSVNLPLDVVKKWFEKMQAGQISVQSSEPSSPEPGKVNIPAKNN
              610       620       630       640       650       660

     660       670       680       690       700       710         
pF1KB4 DQPQSANANEPQDSTVNLQSPLKMTNSPVLPVGSTTNGSRSSTPSPSPLNLSSSRNTQGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DQPQSANANEPQDSTVNLQSPLKMTNSPVLPVGSTTNGSRSSTPSPSPLNLSSSRNTQGY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LYTAEGAQEEPQVEPLDLSLPKQQGELLERSTITSVYQNSVYSVQEEPLNLSCAKKEPQK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DSCVTDSEPVVNVIPPSANPINIAIPTVTAQLPTIVAIADQNSVPCLRALAANKQTILIP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QVAYTYSTTVSPAVQEPPLKVIQPNGNQDERQDTSSEGVSNVEDQNDSDSTPPKKKMRKT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ENGMYACDLCDKIFQKSSSLLRHKYEHTGKRPHECGICKKAFKHKHHLIEHMRLHSGEKP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GDSDERESLTREEDEDSEKEEEEEDKEMEELQEEKECEKPQGDEEEEEEEEEVEEEEVEE
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AENEGEEAKTEGLMKDDRAESQASSLGQKVGESSEQVSEEKTNEA
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>>CCDS44370.1 ZEB1 gene_id:6935|Hs108|chr10               (1108 aa)
 initn: 6925 init1: 6925 opt: 7360  Z-score: 3430.5  bits: 646.6 E(32554): 9.2e-185
Smith-Waterman score: 7360; 99.8% identity (99.8% similar) in 1106 aa overlap (20-1124:3-1108)

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CCDS44                  MKVTNYNTVVETNSDSDDEDKLHIVEEESVTDAADCEGVPEDD
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       ::::::::::::::::::::::::::  ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LPTDQTVLPGRSSEREGNAKNCWEDDTGKEGQEILGPEAQADEAGCTVKDDECESDAENE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QNHDPNVEEFLQQQDTAVIFPEAPEEDQRQGTPEASGHDENGTPDAFSQLLTCPYCDRGY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GRPRTGLKTSQCSSPSLSASPGSPTRPQIRQKIENKPLQEQLSVNQIKTEPVDYEFKPIV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VASGINCSTPLQNGVFTGGGPLQATSSPQGMVQAVVLPTVGLVSPISINLSDIQNVLKVA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VDGNVIRQVLENNQANLASKEQETINASPIQQGGHSVISAISLPLVDQDGTTKIIINYSL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EQPSQLQVVPQNLKKENPVATNSCKSEKLPEDLTVKSEKDKSFEGGVNDSTCLLCDDCPG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DINALPELKHYDLKQPTQPPPLPAAEAEKPESSVSSATGDGNLSPSQPPLKNLLSLLKAY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LYTAEGAQEEPQVEPLDLSLPKQQGELLERSTITSVYQNSVYSVQEEPLNLSCAKKEPQK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QVAYTYSTTVSPAVQEPPLKVIQPNGNQDERQDTSSEGVSNVEDQNDSDSTPPKKKMRKT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ENGMYACDLCDKIFQKSSSLLRHKYEHTGKRPHECGICKKAFKHKHHLIEHMRLHSGEKP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YQCDKCGKRFSHSGSYSQHMNHRYSYCKREAEERDSTEQEEAGPEILSNEHVGARASPSQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GDSDERESLTREEDEDSEKEEEEEDKEMEELQEEKECEKPQGDEEEEEEEEEVEEEEVEE
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AENEGEEAKTEGLMKDDRAESQASSLGQKVGESSEQVSEEKTNEA
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>>CCDS53507.1 ZEB1 gene_id:6935|Hs108|chr10               (1057 aa)
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CCDS53                            MADGPRCKRRKQA-NPRRNNGKEGQEILGPEAQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ADEAGCTVKDDECESDAENEQNHDPNVEEFLQQQDTAVIFPEAPEEDQRQGTPEASGHDE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NGTPDAFSQLLTCPYCDRGYKRFTSLKEHIKYRHEKNEDNFSCSLCSYTFAYRTQLERHM
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TSHKSGRDQRHVTQSGCNRKFKCTECGKAFKYKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSH
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SGSYSSHISSKKCISLIPVNGRPRTGLKTSQCSSPSLSASPGSPTRPQIRQKIENKPLQE
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pF1KB4 QLSVNQIKTEPVDYEFKPIVVASGINCSTPLQNGVFTGGGPLQATSSPQGMVQAVVLPTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QLSVNQIKTEPVDYEFKPIVVASGINCSTPLQNGVFTGGGPLQATSSPQGMVQAVVLPTV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GLVSPISINLSDIQNVLKVAVDGNVIRQVLENNQANLASKEQETINASPIQQGGHSVISA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ISLPLVDQDGTTKIIINYSLEQPSQLQVVPQNLKKENPVATNSCKSEKLPEDLTVKSEKD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KSFEGGVNDSTCLLCDDCPGDINALPELKHYDLKQPTQPPPLPAAEAEKPESSVSSATGD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GNLSPSQPPLKNLLSLLKAYYALNAQPSAEELSKIADSVNLPLDVVKKWFEKMQAGQISV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QSSEPSSPEPGKVNIPAKNNDQPQSANANEPQDSTVNLQSPLKMTNSPVLPVGSTTNGSR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SSTPSPSPLNLSSSRNTQGYLYTAEGAQEEPQVEPLDLSLPKQQGELLERSTITSVYQNS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VYSVQEEPLNLSCAKKEPQKDSCVTDSEPVVNVIPPSANPINIAIPTVTAQLPTIVAIAD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QNSVPCLRALAANKQTILIPQVAYTYSTTVSPAVQEPPLKVIQPNGNQDERQDTSSEGVS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NVEDQNDSDSTPPKKKMRKTENGMYACDLCDKIFQKSSSLLRHKYEHTGKRPHECGICKK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AFKHKHHLIEHMRLHSGEKPYQCDKCGKRFSHSGSYSQHMNHRYSYCKREAEERDSTEQE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EAGPEILSNEHVGARASPSQGDSDERESLTREEDEDSEKEEEEEDKEMEELQEEKECEKP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QGDEEEEEEEEEVEEEEVEEAENEGEEAKTEGLMKDDRAESQASSLGQKVGESSEQVSEE
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    1120    
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       :::::
CCDS53 KTNEA
            

>>CCDS53506.1 ZEB1 gene_id:6935|Hs108|chr10               (1104 aa)
 initn: 6789 init1: 6789 opt: 6813  Z-score: 3177.1  bits: 599.7 E(32554): 1.2e-170
Smith-Waterman score: 7334; 98.1% identity (98.2% similar) in 1124 aa overlap (1-1124:1-1104)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MADGPRCKRRKQANPRRNNVTNYNTVVETNSDSDDEDKLHIVEEESVTDAADCEGVPEDD
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pF1KB4 LPTDQTVLPGRSSEREGNAKNCWEDDRKEGQEILGPEAQADEAGCTVKDDECESDAENEQ
       ::::::::::::::::::::::::::                    .:::::::::::::
CCDS53 LPTDQTVLPGRSSEREGNAKNCWEDD--------------------IKDDECESDAENEQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NHDPNVEEFLQQQDTAVIFPEAPEEDQRQGTPEASGHDENGTPDAFSQLLTCPYCDRGYK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RFTSLKEHIKYRHEKNEDNFSCSLCSYTFAYRTQLERHMTSHKSGRDQRHVTQSGCNRKF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KCTECGKAFKYKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHISSKKCISLIPVNG
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pF1KB4 RPRTGLKTSQCSSPSLSASPGSPTRPQIRQKIENKPLQEQLSVNQIKTEPVDYEFKPIVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RPRTGLKTSQCSSPSLSASPGSPTRPQIRQKIENKPLQEQLSVNQIKTEPVDYEFKPIVV
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pF1KB4 ASGINCSTPLQNGVFTGGGPLQATSSPQGMVQAVVLPTVGLVSPISINLSDIQNVLKVAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ASGINCSTPLQNGVFTGGGPLQATSSPQGMVQAVVLPTVGLVSPISINLSDIQNVLKVAV
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pF1KB4 DGNVIRQVLENNQANLASKEQETINASPIQQGGHSVISAISLPLVDQDGTTKIIINYSLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DGNVIRQVLENNQANLASKEQETINASPIQQGGHSVISAISLPLVDQDGTTKIIINYSLE
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pF1KB4 QPSQLQVVPQNLKKENPVATNSCKSEKLPEDLTVKSEKDKSFEGGVNDSTCLLCDDCPGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QPSQLQVVPQNLKKENPVATNSCKSEKLPEDLTVKSEKDKSFEGGVNDSTCLLCDDCPGD
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pF1KB4 INALPELKHYDLKQPTQPPPLPAAEAEKPESSVSSATGDGNLSPSQPPLKNLLSLLKAYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 INALPELKHYDLKQPTQPPPLPAAEAEKPESSVSSATGDGNLSPSQPPLKNLLSLLKAYY
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pF1KB4 ALNAQPSAEELSKIADSVNLPLDVVKKWFEKMQAGQISVQSSEPSSPEPGKVNIPAKNND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ALNAQPSAEELSKIADSVNLPLDVVKKWFEKMQAGQISVQSSEPSSPEPGKVNIPAKNND
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pF1KB4 QPQSANANEPQDSTVNLQSPLKMTNSPVLPVGSTTNGSRSSTPSPSPLNLSSSRNTQGYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QPQSANANEPQDSTVNLQSPLKMTNSPVLPVGSTTNGSRSSTPSPSPLNLSSSRNTQGYL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YTAEGAQEEPQVEPLDLSLPKQQGELLERSTITSVYQNSVYSVQEEPLNLSCAKKEPQKD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SCVTDSEPVVNVIPPSANPINIAIPTVTAQLPTIVAIADQNSVPCLRALAANKQTILIPQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VAYTYSTTVSPAVQEPPLKVIQPNGNQDERQDTSSEGVSNVEDQNDSDSTPPKKKMRKTE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NGMYACDLCDKIFQKSSSLLRHKYEHTGKRPHECGICKKAFKHKHHLIEHMRLHSGEKPY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QCDKCGKRFSHSGSYSQHMNHRYSYCKREAEERDSTEQEEAGPEILSNEHVGARASPSQG
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pF1KB4 DSDERESLTREEDEDSEKEEEEEDKEMEELQEEKECEKPQGDEEEEEEEEEVEEEEVEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DSDERESLTREEDEDSEKEEEEEDKEMEELQEEKECEKPQGDEEEEEEEEEVEEEEVEEA
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pF1KB4 ENEGEEAKTEGLMKDDRAESQASSLGQKVGESSEQVSEEKTNEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ENEGEEAKTEGLMKDDRAESQASSLGQKVGESSEQVSEEKTNEA
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>>CCDS54403.1 ZEB2 gene_id:9839|Hs108|chr2                (1190 aa)
 initn: 2009 init1: 781 opt: 1071  Z-score: 516.0  bits: 107.4 E(32554): 2e-22
Smith-Waterman score: 2812; 45.1% identity (70.0% similar) in 1151 aa overlap (35-1099:40-1171)

           10        20        30        40        50              
pF1KB4 PRCKRRKQANPRRNNVTNYNTVVETNSDSDDEDKLHIVEEESVTDAADCEGVP------E
                                     .::::::.:......  : :  :      :
CCDS54 PRCKRRKQANPRRKNVVNYDNVVDTGSETDEEDKLHIAEDDGIANPLDQETSPASVPNHE
      10        20        30        40        50        60         

       60        70           80        90       100       110     
pF1KB4 DDLPTDQTVLPGRSSE---REGNAKNCWEDDRKEGQEILGPEAQADEAGCTVKDDE--CE
       ..  ..:..:: .  :   :::.... :....     . ::   . .:.::   .:   .
CCDS54 SSPHVSQALLPREEEEDEIREGGVEHPWHNNEILQASVDGP---VKNANCTSDFEEYFAK
      70        80        90       100       110          120      

           120       130       140       150       160             
pF1KB4 SDAENEQNHDPNVEEFLQQQDTAVIFPEAPEEDQRQGTPEASGHDEN----GTPDAFSQL
          :....:  ..::.::..:::.:.:::::: .: :::::.:..::    ::::::.::
CCDS54 RKLEERDGHAVSIEEYLQRSDTAIIYPEAPEELSRLGTPEANGQEENDLPPGTPDAFAQL
        130       140       150       160       170       180      

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB4 LTCPYCDRGYKRFTSLKEHIKYRHEKNEDNFSCSLCSYTFAYRTQLERHMTSHKSGRDQR
       ::::::::::::.:::::::::::::::.:::: ::::::::::::::::..:: : ::.
CCDS54 LTCPYCDRGYKRLTSLKEHIKYRHEKNEENFSCPLCSYTFAYRTQLERHMVTHKPGTDQH
        190       200       210       220       230       240      

     230        240       250       260       270       280        
pF1KB4 HV-TQSGCNRKFKCTECGKAFKYKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHIS
       .. ::.. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QMLTQGAGNRKFKCTECGKAFKYKHHLKEHLRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHIS
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CCDS21 VGLPVVSHNGATKSIIDYTLEKVNEAKACLQSLTTDSRRQISNIKKEKLRTLIDLVTD-D
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CCDS21 SSEELQAEPLDLSLPKQMKEPKSIIATKNKTKASSISLDHNSVSSSSENSDEPLNLTFIK
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