Result of FASTA (omim) for
pF1KB4384
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4384, 870 aa
1>>>pF1KB4384 870 - 870 aa - 870 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4648+/-0.000352; mu= 6.8841+/- 0.022
mean_var=168.7727+/-34.624, 0's: 0 Z-trim(119.7): 183 B-trim: 273 in 1/57
Lambda= 0.098724
statistics sampled from 33884 (34072) to 33884 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.399), width: 16
Scan time: 13.930
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001421 (OMIM: 603349,611783) endothelial PAS do ( 870) 5916 855.2 0
XP_011531000 (OMIM: 603349,611783) PREDICTED: endo ( 883) 5867 848.2 0
NP_851397 (OMIM: 603348) hypoxia-inducible factor ( 735) 1854 276.6 3e-73
NP_001521 (OMIM: 603348) hypoxia-inducible factor ( 826) 1854 276.6 3.3e-73
NP_001230013 (OMIM: 603348) hypoxia-inducible fact ( 850) 1848 275.7 6.2e-73
XP_016882624 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 709) 1337 202.9 4.3e-51
XP_016882623 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 711) 1336 202.8 4.8e-51
XP_016882626 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 703) 1328 201.6 1e-50
XP_016882621 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 755) 1324 201.1 1.6e-50
XP_016882622 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 749) 1315 199.8 4e-50
NP_690007 (OMIM: 609976) hypoxia-inducible factor ( 667) 1294 196.8 2.9e-49
XP_016882627 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 663) 1293 196.6 3.1e-49
NP_690008 (OMIM: 609976) hypoxia-inducible factor ( 669) 1293 196.6 3.2e-49
XP_005259212 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 587) 1280 194.8 1e-48
XP_005259213 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 587) 1280 194.8 1e-48
XP_016882625 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 707) 1281 194.9 1.1e-48
XP_005259209 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 713) 1281 194.9 1.1e-48
XP_016882630 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 642) 907 141.7 1.1e-32
XP_016882628 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 642) 907 141.7 1.1e-32
XP_016882629 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 642) 907 141.7 1.1e-32
NP_690009 (OMIM: 609976) hypoxia-inducible factor ( 450) 863 135.3 6.2e-31
XP_016882631 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 474) 863 135.3 6.5e-31
XP_005259210 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 594) 864 135.5 7.1e-31
NP_071907 (OMIM: 609976) hypoxia-inducible factor ( 600) 864 135.5 7.1e-31
XP_011534374 (OMIM: 601665,603128) PREDICTED: sing ( 481) 835 131.3 1e-29
XP_005267157 (OMIM: 601665,603128) PREDICTED: sing ( 766) 835 131.4 1.5e-29
XP_016866686 (OMIM: 601665,603128) PREDICTED: sing ( 766) 835 131.4 1.5e-29
NP_005059 (OMIM: 601665,603128) single-minded homo ( 766) 835 131.4 1.5e-29
NP_033664 (OMIM: 600892) single-minded homolog 2 s ( 570) 818 129.0 6.4e-29
NP_005060 (OMIM: 600892) single-minded homolog 2 l ( 667) 818 129.0 7.3e-29
XP_016883931 (OMIM: 600892) PREDICTED: single-mind ( 327) 727 115.9 3.2e-25
XP_011527996 (OMIM: 600892) PREDICTED: single-mind ( 566) 596 97.3 2.1e-19
XP_016877075 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 831) 443 75.6 1.1e-12
XP_016877076 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 831) 443 75.6 1.1e-12
XP_016877077 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 831) 443 75.6 1.1e-12
XP_011535374 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 900) 443 75.6 1.1e-12
NP_071406 (OMIM: 609430) neuronal PAS domain-conta ( 901) 443 75.6 1.1e-12
NP_001159365 (OMIM: 609430) neuronal PAS domain-co ( 903) 443 75.7 1.1e-12
XP_011535372 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 918) 443 75.7 1.1e-12
NP_775182 (OMIM: 609430) neuronal PAS domain-conta ( 920) 443 75.7 1.1e-12
NP_001158221 (OMIM: 609430) neuronal PAS domain-co ( 933) 443 75.7 1.2e-12
XP_011535373 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 936) 443 75.7 1.2e-12
XP_016877074 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 939) 443 75.7 1.2e-12
XP_011535369 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 950) 443 75.7 1.2e-12
XP_016877073 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 956) 443 75.7 1.2e-12
XP_011535371 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 966) 443 75.7 1.2e-12
XP_005268049 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 967) 443 75.7 1.2e-12
XP_005268048 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 969) 443 75.7 1.2e-12
XP_016877072 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 983) 443 75.7 1.2e-12
XP_016877071 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 986) 443 75.7 1.2e-12
>>NP_001421 (OMIM: 603349,611783) endothelial PAS domain (870 aa)
initn: 5916 init1: 5916 opt: 5916 Z-score: 4561.6 bits: 855.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5916; 100.0% identity (100.0% similar) in 870 aa overlap (1-870:1-870)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTADKEKKRSSSERRKEKSRDAARCRRSKETEVFYELAHELPLPHSVSSHLDKASIMRLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTADKEKKRSSSERRKEKSRDAARCRRSKETEVFYELAHELPLPHSVSSHLDKASIMRLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ISFLRTHKLLSSVCSENESEAEADQQMDNLYLKALEGFIAVVTQDGDMIFLSENISKFMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISFLRTHKLLSSVCSENESEAEADQQMDNLYLKALEGFIAVVTQDGDMIFLSENISKFMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LTQVELTGHSIFDFTHPCDHEEIRENLSLKNGSGFGKKSKDMSTERDFFMRMKCTVTNRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTQVELTGHSIFDFTHPCDHEEIRENLSLKNGSGFGKKSKDMSTERDFFMRMKCTVTNRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RTVNLKSATWKVLHCTGQVKVYNNCPPHNSLCGYKEPLLSCLIIMCEPIQHPSHMDIPLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTVNLKSATWKVLHCTGQVKVYNNCPPHNSLCGYKEPLLSCLIIMCEPIQHPSHMDIPLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 SKTFLSRHSMDMKFTYCDDRITELIGYHPEELLGRSAYEFYHALDSENMTKSHQNLCTKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKTFLSRHSMDMKFTYCDDRITELIGYHPEELLGRSAYEFYHALDSENMTKSHQNLCTKG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 QVVSGQYRMLAKHGGYVWLETQGTVIYNPRNLQPQCIMCVNYVLSEIEKNDVVFSMDQTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVVSGQYRMLAKHGGYVWLETQGTVIYNPRNLQPQCIMCVNYVLSEIEKNDVVFSMDQTE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SLFKPHLMAMNSIFDSSGKGAVSEKSNFLFTKLKEEPEELAQLAPTPGDAIISLDFGNQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLFKPHLMAMNSIFDSSGKGAVSEKSNFLFTKLKEEPEELAQLAPTPGDAIISLDFGNQN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 FEESSAYGKAILPPSQPWATELRSHSTQSEAGSLPAFTVPQAAAPGSTTPSATSSSSSCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FEESSAYGKAILPPSQPWATELRSHSTQSEAGSLPAFTVPQAAAPGSTTPSATSSSSSCS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 TPNSPEDYYTSLDNDLKIEVIEKLFAMDTEAKDQCSTQTDFNELDLETLAPYIPMDGEDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPNSPEDYYTSLDNDLKIEVIEKLFAMDTEAKDQCSTQTDFNELDLETLAPYIPMDGEDF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 QLSPICPEERLLAENPQSTPQHCFSAMTNIFQPLAPVAPHSPFLLDKFQQQLESKKTEPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLSPICPEERLLAENPQSTPQHCFSAMTNIFQPLAPVAPHSPFLLDKFQQQLESKKTEPE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 HRPMSSIFFDAGSKASLPPCCGQASTPLSSMGGRSNTQWPPDPPLHFGPTKWAVGDQRTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HRPMSSIFFDAGSKASLPPCCGQASTPLSSMGGRSNTQWPPDPPLHFGPTKWAVGDQRTE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 FLGAAPLGPPVSPPHVSTFKTRSAKGFGARGPDVLSPAMVALSNKLKLKRQLEYEEQAFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLGAAPLGPPVSPPHVSTFKTRSAKGFGARGPDVLSPAMVALSNKLKLKRQLEYEEQAFQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 DLSGGDPPGGSTSHLMWKRMKNLRGGSCPLMPDKPLSANVPNDKFTQNPMRGLGHPLRHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLSGGDPPGGSTSHLMWKRMKNLRGGSCPLMPDKPLSANVPNDKFTQNPMRGLGHPLRHL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 PLPQPPSAISPGENSKSRFPPQCYATQYQDYSLSSAHKVSGMASRLLGPSFESYLLPELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLPQPPSAISPGENSKSRFPPQCYATQYQDYSLSSAHKVSGMASRLLGPSFESYLLPELT
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KB4 RYDCEVNVPVLGSSTLLQGGDLLRALDQAT
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RYDCEVNVPVLGSSTLLQGGDLLRALDQAT
850 860 870
>>XP_011531000 (OMIM: 603349,611783) PREDICTED: endothel (883 aa)
initn: 5867 init1: 5867 opt: 5867 Z-score: 4523.8 bits: 848.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5867; 100.0% identity (100.0% similar) in 862 aa overlap (9-870:22-883)
10 20 30 40
pF1KB4 MTADKEKKRSSSERRKEKSRDAARCRRSKETEVFYELAHELPLPHSV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLGLFVFKTGTQRRNRRLPYARSSSERRKEKSRDAARCRRSKETEVFYELAHELPLPHSV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 SSHLDKASIMRLAISFLRTHKLLSSVCSENESEAEADQQMDNLYLKALEGFIAVVTQDGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSHLDKASIMRLAISFLRTHKLLSSVCSENESEAEADQQMDNLYLKALEGFIAVVTQDGD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 MIFLSENISKFMGLTQVELTGHSIFDFTHPCDHEEIRENLSLKNGSGFGKKSKDMSTERD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MIFLSENISKFMGLTQVELTGHSIFDFTHPCDHEEIRENLSLKNGSGFGKKSKDMSTERD
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 FFMRMKCTVTNRGRTVNLKSATWKVLHCTGQVKVYNNCPPHNSLCGYKEPLLSCLIIMCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FFMRMKCTVTNRGRTVNLKSATWKVLHCTGQVKVYNNCPPHNSLCGYKEPLLSCLIIMCE
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 PIQHPSHMDIPLDSKTFLSRHSMDMKFTYCDDRITELIGYHPEELLGRSAYEFYHALDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PIQHPSHMDIPLDSKTFLSRHSMDMKFTYCDDRITELIGYHPEELLGRSAYEFYHALDSE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 NMTKSHQNLCTKGQVVSGQYRMLAKHGGYVWLETQGTVIYNPRNLQPQCIMCVNYVLSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NMTKSHQNLCTKGQVVSGQYRMLAKHGGYVWLETQGTVIYNPRNLQPQCIMCVNYVLSEI
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 EKNDVVFSMDQTESLFKPHLMAMNSIFDSSGKGAVSEKSNFLFTKLKEEPEELAQLAPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKNDVVFSMDQTESLFKPHLMAMNSIFDSSGKGAVSEKSNFLFTKLKEEPEELAQLAPTP
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 GDAIISLDFGNQNFEESSAYGKAILPPSQPWATELRSHSTQSEAGSLPAFTVPQAAAPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GDAIISLDFGNQNFEESSAYGKAILPPSQPWATELRSHSTQSEAGSLPAFTVPQAAAPGS
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 TTPSATSSSSSCSTPNSPEDYYTSLDNDLKIEVIEKLFAMDTEAKDQCSTQTDFNELDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTPSATSSSSSCSTPNSPEDYYTSLDNDLKIEVIEKLFAMDTEAKDQCSTQTDFNELDLE
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 TLAPYIPMDGEDFQLSPICPEERLLAENPQSTPQHCFSAMTNIFQPLAPVAPHSPFLLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLAPYIPMDGEDFQLSPICPEERLLAENPQSTPQHCFSAMTNIFQPLAPVAPHSPFLLDK
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 FQQQLESKKTEPEHRPMSSIFFDAGSKASLPPCCGQASTPLSSMGGRSNTQWPPDPPLHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FQQQLESKKTEPEHRPMSSIFFDAGSKASLPPCCGQASTPLSSMGGRSNTQWPPDPPLHF
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 GPTKWAVGDQRTEFLGAAPLGPPVSPPHVSTFKTRSAKGFGARGPDVLSPAMVALSNKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GPTKWAVGDQRTEFLGAAPLGPPVSPPHVSTFKTRSAKGFGARGPDVLSPAMVALSNKLK
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 LKRQLEYEEQAFQDLSGGDPPGGSTSHLMWKRMKNLRGGSCPLMPDKPLSANVPNDKFTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LKRQLEYEEQAFQDLSGGDPPGGSTSHLMWKRMKNLRGGSCPLMPDKPLSANVPNDKFTQ
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 NPMRGLGHPLRHLPLPQPPSAISPGENSKSRFPPQCYATQYQDYSLSSAHKVSGMASRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NPMRGLGHPLRHLPLPQPPSAISPGENSKSRFPPQCYATQYQDYSLSSAHKVSGMASRLL
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870
pF1KB4 GPSFESYLLPELTRYDCEVNVPVLGSSTLLQGGDLLRALDQAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GPSFESYLLPELTRYDCEVNVPVLGSSTLLQGGDLLRALDQAT
850 860 870 880
>>NP_851397 (OMIM: 603348) hypoxia-inducible factor 1-al (735 aa)
initn: 1411 init1: 811 opt: 1854 Z-score: 1436.0 bits: 276.6 E(85289): 3e-73
Smith-Waterman score: 2058; 48.7% identity (70.7% similar) in 764 aa overlap (6-720:9-730)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MTADKEKKRSSSERRKEKSRDAARCRRSKETEVFYELAHELPLPHSVSSHLDKASIM
.::. :::::::::::::: :::::.::::::::.:::::.:::::::::.:
NP_851 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 RLAISFLRTHKLLSSVCSENESEAEADQQMDNLYLKALEGFIAVVTQDGDMIFLSENISK
::.::.::..:::.. . :.. .: ::. .:::::.::. :.:.:::::..:.:..:
NP_851 RLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKA--QMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIYISDNVNK
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 FMGLTQVELTGHSIFDFTHPCDHEEIRENLSLKNGSGFGKKSKDMSTERDFFMRMKCTVT
.::::: ::::::.:::::::::::.:: :. .:: . ::.:...:.:.::.:::::.:
NP_851 YMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNG--LVKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 NRGRTVNLKSATWKVLHCTGQVKVY--NNCPPHNSLCGYKEPLLSCLIIMCEPIQHPSHM
.::::.:.::::::::::::...:: :. :. ::::.: ..::...:::: :::..
NP_851 SRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQ---CGYKKPPMTCLVLICEPIPHPSNI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 DIPLDSKTFLSRHSMDMKFTYCDDRITELIGYHPEELLGRSAYEFYHALDSENMTKSHQN
.:::::::::::::.::::.:::.:::::.::.:::::::: ::.::::::...::.:..
NP_851 EIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHLTKTHHD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 LCTKGQVVSGQYRMLAKHGGYVWLETQGTVIYNPRNLQPQCIMCVNYVLSEIEKNDVVFS
. :::::..::::::::.:::::.:::.::::: .: :::::.:::::.: : ..:..::
NP_851 MFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQHDLIFS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 MDQTESLFKP---HLMAMNSIFDSSGKGAVSEKSNFLFTKLKEEPEELAQLAPTPGDAII
..::: ..:: : :...: . . :: .. :: :::.::. :. :::. ::.::
NP_851 LQQTECVLKPVESSDMKMTQLFTK----VESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDTII
360 370 380 390 400
420 430 440
pF1KB4 SLDFG-------NQNFEESSAYGKAILP-PSQ----------PWATE-----LRSHS---
::::: .:..:: :. ..:: :.. : : ::: .
NP_851 SLDFGSNDTETDDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLPTAETPKPLRSSADPA
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KB4 -TQSEAGSL-P-------AFTVPQAAAPGSTTPSATSSSSSCSTPNSPEDYYTSLDNDL-
.: : .: : .::.:: . .:: :. .: :::: .: .:.:.
NP_851 LNQEVALKLEPNPESLELSFTMPQIQ-DQTPSPSDGSTRQSSPEPNSPSEYCFYVDSDMV
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500 510 520 530 540 550
pF1KB4 ---KIEVIEKLFAMDTEAKDQCSTQTDFNELDLETLAPYIPMDGEDFQL---SPICPEER
:.:..::::: :::::. ::: ..:::: :::::::: .:::: . . : :
NP_851 NEFKLELVEKLFAEDTEAKNPFSTQD--TDLDLEMLAPYIPMD-DDFQLRSFDQLSPLES
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600
pF1KB4 LLAENPQSTPQHCFSAM--TNIFQPLAPVAPHSPFLLDKFQQQLESKKTEPEHRPMSSIF
: ...:: ... :.: .: : : . :.. :: . : : .:
NP_851 SSASPESASPQSTVTVFQQTQIQEPTAN-ATTTTATTDEL-------KTVTKDR-MEDIK
590 600 610 620 630
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 FDAGSKASLPPCCGQASTPLSSMGGRSNTQWPPDPPLHFGPTKWAVGDQRTEFLGAAPLG
. .: . : . .: .: : .:: : . : : .. ..:: . : .
NP_851 ILIASPS--PTHIHKETTSATSSPYR-DTQSRTASPNRAG--KGVI--EQTE--KSHPRS
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: : .: : . :.: ..::.: . ::..:.. . ::
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.::. :::::::::::::: :::::.::::::::.:::::.:::::::::.:
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::.::.::..:::.. . :.. .: ::. .:::::.::. :.:.:::::..:.:..:
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.::::: ::::::.:::::::::::.:: :. .:: . ::.:...:.:.::.:::::.:
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pF1KB4 NRGRTVNLKSATWKVLHCTGQVKVY--NNCPPHNSLCGYKEPLLSCLIIMCEPIQHPSHM
.::::.:.::::::::::::...:: :. :. ::::.: ..::...:::: :::..
NP_001 SRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQ---CGYKKPPMTCLVLICEPIPHPSNI
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.:::::::::::::.::::.:::.:::::.::.:::::::: ::.::::::...::.:..
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..::: ..:: : :...: . . :: .. :: :::.::. :. :::. ::.::
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::::: .:..:: :. ..:: :.. : : ::: .
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.: : .: : .::.:: . .:: :. .: :::: .: .:.:.
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:.:..::::: :::::. ::: ..:::: :::::::: .:::: . . : :
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560 570 580 590 600
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: ...:: ... :.: .: : : . :.. :: . : : .:
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pF1KB4 FDAGSKASLPPCCGQASTPLSSMGGRSNTQWPPDPPLHFGPTKWAVGDQRTEFLGAAPLG
. .: . : . .: .: : .:: : . : : .. ..:: . : .
NP_001 ILIASPS--PTHIHKETTSATSSPYR-DTQSRTASPNRAG--KGVI--EQTE--KSHPRS
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pF1KB4 PPVSPPHVSTFKTRSAKGFGARGPDVLSPAMVALSNKLKLKRQLEYEEQAFQDLSGG---
: : .: : . :.: ..::.: . ::..:.. . :: .. :
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. : ..:. : :::.:. ... :: :.
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: . : : .: :::: :.. ::.:: ::
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::::.:. :: .:::: .:::::::
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pF1KB4 MTADKEKKRSSSERRKEKSRDAARCRRSKETEVFY
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pF1KB4 ELAHELPLPHSVSSHLDKASIMRLAISFLRTHKLLSSVCSENESEAEADQQMDNLYLKAL
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pF1KB4 EGFIAVVTQDGDMIFLSENISKFMGLTQVELTGHSIFDFTHPCDHEEIRENLSLKNGSGF
.::. :.:.:::::..:.:..:.::::: ::::::.:::::::::::.:: :. .:: .
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::.:...:.:.::.:::::.:.::::.:.::::::::::::...:: :. :. ::
NP_001 VKKGKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQ---CG
180 190 200 210 220 230
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::.: ..::...:::: :::...:::::::::::::.::::.:::.:::::.::.:::::
NP_001 YKKPPMTCLVLICEPIPHPSNIEIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELL
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pF1KB4 GRSAYEFYHALDSENMTKSHQNLCTKGQVVSGQYRMLAKHGGYVWLETQGTVIYNPRNLQ
::: ::.::::::...::.:... :::::..::::::::.:::::.:::.::::: .: :
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::::.:::::.: : ..:..::..::: ..:: : :...: . . :: .. ::
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:::.::. :. :::. ::.::::::: .:..:: :. ..:: :..
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440 450 460 470
pF1KB4 ----PWATE-----LRSHS----TQSEAGSL-P-------AFTVPQAAAPGSTTPSATSS
: : ::: . .: : .: : .::.:: . .:: :.
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480 490 500 510 520 530
pF1KB4 SSSCSTPNSPEDYYTSLDNDL----KIEVIEKLFAMDTEAKDQCSTQTDFNELDLETLAP
.: :::: .: .:.:. :.:..::::: :::::. ::: ..:::: :::
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540 550 560 570 580
pF1KB4 YIPMDGEDFQL---SPICPEERLLAENPQSTPQHCFSAM--TNIFQPLAPVAPHSPFLLD
::::: .:::: . . : : : ...:: ... :.: .: : : . :
NP_001 YIPMD-DDFQLRSFDQLSPLESSSASPESASPQSTVTVFQQTQIQEPTAN-ATTTTATTD
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590 600 610 620 630 640
pF1KB4 KFQQQLESKKTEPEHRPMSSIFFDAGSKASLPPCCGQASTPLSSMGGRSNTQWPPDPPLH
.. :: . : : .: . .: . : . .: .: : .:: : .
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650 660 670 680 690 700
pF1KB4 FGPTKWAVGDQRTEFLGAAPLGPPVSPPHVSTFKTRSAKGFGARGPDVLSPAMVALSNKL
: : .. ..:: . : .: : .: : . :.: ..::.:
NP_001 AG--KGVI--EQTE--KSHPRSPNVLSVALSQRTTVP--------EEELNPKILALQNAQ
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710 720 730 740 750 760
pF1KB4 KLKRQLEYEEQAFQDLSGG---DPPG--GSTSHLMWKRMKNLRGGSCPLMPDKPLSANVP
. ::..:.. . :: .. : . : ..:. : :::.:. ...
NP_001 R-KRKMEHDGSLFQAVGIGTLLQQPDDHAATTSLSWKRVKGCKSSE--------------
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pF1KB4 NDKFTQNPMRGLGHPLRHLPLPQPPSAISPGENSKSRFPPQCYATQYQDYSLSSAHKVSG
:: :. : . : :
NP_001 -----QNGME------------QKTIILIP----------------------------SD
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pF1KB4 MASRLLGPSFESYLLPELTRYDCEVNVPVLGSSTLLQGGDLLRALDQAT
.: :::: :.. ::.:: ::::::.:. :: .:::: .:::::::
NP_001 LACRLLGQSMDESGLPQLTSYDCEVNAPIQGSRNLLQGEELLRALDQVN
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pF1KB4 MTADKEKKRSSSERRKEKSRDAARCRRSKETEVFYELAHELPLPHSVSSHLDKASIMRLA
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pF1KB4 ISFLRTHKLLSSVCSENESEAEADQQMDNLYLKALEGFIAVVTQDGDMIFLSENISKFMG
::.:: :.: .. .: .. . . . .: ::::::::. :.: .::: .::::.:: .:
XP_016 ISYLRMHRLCAA--GEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLG
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pF1KB4 LTQVELTGHSIFDFTHPCDHEEIRENLSLKNGSGFGKKSKDMSTERDFFMRMKCTVTNRG
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XP_016 LSQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQT--LSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRG
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pF1KB4 RTVNLKSATWKVLHCTGQVKVYNNCPPHNSLCGY--KEPLLSCLIIMCEPIQHPSHMDIP
::.:::.::::::.:.:....:. : ..: : .:: :.::...:: : ::. .. :
XP_016 RTLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKP-PAQTSPAGSPDSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPP
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pF1KB4 LDSKTFLSRHSMDMKFTYCDDRITELIGYHPEELLGRSAYEFYHALDSENMTKSHQNLCT
: .::::::.:::::::::::.:. :: :..:.: ::::. :::::. ..:: ..: .
XP_016 LGRGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLS
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pF1KB4 KGQVVSGQYRMLAKHGGYVWLETQGTVIYNPRNLQPQCIMCVNYVLSEIEKNDVVFSMDQ
:::.:.::::.::. :::.: .::.::. . :. : . :.::....:..:.. ::.:..:
XP_016 KGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQ
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pF1KB4 TESLFKPHLMAMNSIFDSSGKGAVSEKSNFLFTKLKEEPEELAQLAPTPGDAIISLDFGN
::. . .. .:: :.:.. :.::: ::: .
XP_016 TEQHSRRPIQ----------RGAPSQKDT-----------------PNPGD---SLDTPG
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pF1KB4 QNFEESSAYGKAILPPSQPWATELRSHSTQSEAGSLPAFTVPQAAAPGSTTPSATSSSSS
. :. . ::: :. : . . . .: . : :... .. :. .
XP_016 PRIL---AF---LHPPSLSEAA-LAADPRRFCSPDLRRLLGP--ILDGASVAATPSTPLA
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pF1KB4 CSTPNSPEDYYTSLDNDLKI--EVIEKLFAMDTEAKDQCSTQTDFN-------ELDLETL
:.:: . ..: ..: . : ...:: : .:: ...::.. .: : :
XP_016 TRHPQSPLS--ADLPDELPVGTENVHRLF---TSGKDTEAVETDLDIAQMRKLKLRLLTT
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pF1KB4 APYIPMDGEDFQLSPICPEERLLAENPQSTPQHCFSAMTNIFQPLAPVAPHSPFLLDKFQ
. . :: . . . : ::. :. :: .:. .. ::: . : ::
XP_016 GTELRSDGAGTS-AKVHPSPRLILLPPSCPPQDA-DALD--LEMLAPYISMD----DDFQ
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pF1KB4 QQLESKKTEPEHRPMSSI------FFDAGSKASLPPCC--GQASTPLSSMGGRSNTQWPP
. . . :::.... : . : .: : .: : : .. : .
XP_016 LNASEQLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCSSPSRGDPSA
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pF1KB4 DPPLHFGPTKWAVG------DQRTEFLGAAPLGPPVSPPHVSTFKTRSAKGFGARGPDVL
. :. : : ... :. .:.::. : :: :
XP_016 SSPMA-GARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAP
610 620 630 640 650 660
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pF1KB4 SPAMVALSNKLKLKRQLEYEEQAFQDLSGGDPPGGSTSHLMWKRMKNLRGGSCPLMPDKP
XP_016 GSLQDPSTPLLNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQPRAGSAQAD
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>>XP_016882623 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-inducib (711 aa)
initn: 1351 init1: 577 opt: 1336 Z-score: 1037.5 bits: 202.8 E(85289): 4.8e-51
Smith-Waterman score: 1353; 37.9% identity (63.7% similar) in 700 aa overlap (1-675:1-642)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTADKEKKRSSSERRKEKSRDAARCRRSKETEVFYELAHELPLPHSVSSHLDKASIMRLA
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:
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XP_016 YEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESI
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340 350 360 370 380 390
pF1KB4 MCVNYVLSEIEKNDVVFSMDQTESLFKPHLMAMNSIFDSSGKGAVSEKSNFLFTKLKEEP
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870 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Thu Nov 3 14:53:21 2016 done: Thu Nov 3 14:53:23 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]