Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4450
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4450, 380 aa
1>>>pF1KB4450 380 - 380 aa - 380 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1234+/-0.000972; mu= 18.9279+/- 0.058
mean_var=118.5801+/-31.371, 0's: 0 Z-trim(107.3): 310 B-trim: 1223 in 2/49
Lambda= 0.117779
statistics sampled from 8957 (9475) to 8957 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16
Scan time: 2.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 2585 450.6 1.1e-126
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CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 652 122.2 8.1e-28
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 652 122.2 8.1e-28
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 585 110.7 2.1e-24
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 544 103.8 2.6e-22
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 544 103.8 2.6e-22
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 539 103.0 4.8e-22
CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX ( 384) 521 99.9 4e-21
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 518 99.4 5.8e-21
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 502 96.6 3.6e-20
CCDS5196.1 NMBR gene_id:4829|Hs108|chr6 ( 390) 487 94.1 2.2e-19
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 483 93.4 3.5e-19
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 476 92.3 8.1e-19
CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 ( 351) 474 91.9 9.6e-19
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 470 91.2 1.5e-18
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 468 90.9 2e-18
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 468 90.9 2.2e-18
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 463 89.9 3.1e-18
CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 ( 342) 460 89.5 4.9e-18
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 454 88.5 1.1e-17
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 451 87.9 1.4e-17
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 449 87.6 1.9e-17
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 448 87.5 2.2e-17
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 448 87.5 2.2e-17
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 448 87.5 2.2e-17
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CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 448 87.5 2.3e-17
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CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 448 87.5 2.3e-17
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CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 448 87.6 2.5e-17
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 446 87.1 2.5e-17
CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3 ( 342) 444 86.7 3.3e-17
CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11 ( 395) 444 86.8 3.5e-17
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 441 86.3 4.9e-17
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 436 85.4 8.2e-17
CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 ( 353) 436 85.4 8.5e-17
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 436 85.4 8.9e-17
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 431 84.6 1.6e-16
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 427 83.9 2.5e-16
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 ( 350) 426 83.7 2.7e-16
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 426 83.7 2.8e-16
CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14 ( 337) 422 83.0 4.3e-16
CCDS9491.1 GPR18 gene_id:2841|Hs108|chr13 ( 331) 420 82.7 5.4e-16
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 419 82.5 6.3e-16
CCDS14442.1 P2RY10 gene_id:27334|Hs108|chrX ( 339) 415 81.8 9.8e-16
CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX ( 399) 413 81.6 1.4e-15
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 411 81.2 1.7e-15
>>CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 (380 aa)
initn: 2585 init1: 2585 opt: 2585 Z-score: 2388.2 bits: 450.6 E(32554): 1.1e-126
Smith-Waterman score: 2585; 100.0% identity (100.0% similar) in 380 aa overlap (1-380:1-380)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MEEGGDFDNYYGADNQSECEYTDWKSSGALIPAIYMLVFLLGTTGNGLVLWTVFRSSREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 MEEGGDFDNYYGADNQSECEYTDWKSSGALIPAIYMLVFLLGTTGNGLVLWTVFRSSREK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 RRSADIFIASLAVADLTFVVTLPLWATYTYRDYDWPFGTFFCKLSSYLIFVNMYASVFCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 RRSADIFIASLAVADLTFVVTLPLWATYTYRDYDWPFGTFFCKLSSYLIFVNMYASVFCL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 TGLSFDRYLAIVRPVANARLRLRVSGAVATAVLWVLAALLAMPVMVLRTTGDLENTTKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 TGLSFDRYLAIVRPVANARLRLRVSGAVATAVLWVLAALLAMPVMVLRTTGDLENTTKVQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 CYMDYSMVATVSSEWAWEVGLGVSSTTVGFVVPFTIMLTCYFFIAQTIAGHFRKERIEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 CYMDYSMVATVSSEWAWEVGLGVSSTTVGFVVPFTIMLTCYFFIAQTIAGHFRKERIEGL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RKRRRLLSIIVVLVVTFALCWMPYHLVKTLYMLGSLLHWPCDFDLFLMNIFPYCTCISYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 RKRRRLLSIIVVLVVTFALCWMPYHLVKTLYMLGSLLHWPCDFDLFLMNIFPYCTCISYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 NSCLNPFLYAFFDPRFRQACTSMLCCGQSRCAGTSHSSSGEKSASYSSGHSQGPGPNMGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 NSCLNPFLYAFFDPRFRQACTSMLCCGQSRCAGTSHSSSGEKSASYSSGHSQGPGPNMGK
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KB4 GGEQMHEKSIPYSQETLVVD
::::::::::::::::::::
CCDS79 GGEQMHEKSIPYSQETLVVD
370 380
>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa)
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Smith-Waterman score: 652; 32.4% identity (66.4% similar) in 333 aa overlap (30-356:30-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MEEGGDFDNYYGADNQSECEYTDWKSSGALIPAIYMLVFLLGTTGNGLVLWTVFRSSREK
.::..: ..:..: ::.::. ... . :
CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 RRSADIFIASLAVADLTFVVTLPLWATYTYRDYDWPFGTFFCKLSSYLIFVNMYASVFCL
:..:. .::.::: :..::::::.:: .: ::::...::..: . :.::::: :
CCDS31 T-VASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 TGLSFDRYLAIVRPVANARLRLRVSGAVATAVLWVLAALLAMPVMVLRTTGDLENTTKVQ
: ::.:::::::.:. . : . . :. ..:.::.: ..:... :.. .:::. .
CCDS31 TCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 CYMDYSMVATVSSEWAWEVGLGVSSTTVGFVVPFTIMLTCYFFIAQTIAGHFRKERIEGL
: . : :.. . .:::.... .::. :: :.:: : .: ... .. .. .
CCDS31 CAFHYE-----SQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKP-
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB4 RKRRRLLSIIVVLVVTFALCWMPYHLVKTLYMLGSL-LHWPCDFDLFLMNIFPYCTCISY
. ...::...:. : . :.:... : .: .: . : . .. . .: ::.:
CCDS31 -RNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 VNSCLNPFLYAFFDPRFRQACTSMLCCGQSRCAGTSHSSSGEKSASYS-----SGHSQGP
:.::::..:.:. .:.. ..: . . :. :. .. :: :. .. :
CCDS31 FNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKP
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KB4 GPNMGKGGEQMHEKSIPYSQETLVVD
.:
CCDS31 APCFEVE
>>CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (388 aa)
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Smith-Waterman score: 652; 32.4% identity (66.4% similar) in 333 aa overlap (30-356:59-383)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MEEGGDFDNYYGADNQSECEYTDWKSSGALIPAIYMLVFLLGTTGNGLVLWTVFRSSRE
.::..: ..:..: ::.::. ... .
CCDS82 KMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKL
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60 70 80 90 100 110
pF1KB4 KRRSADIFIASLAVADLTFVVTLPLWATYTYRDYDWPFGTFFCKLSSYLIFVNMYASVFC
: :..:. .::.::: :..::::::.:: .: ::::...::..: . :.:::::
CCDS82 KT-VASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFL
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120 130 140 150 160 170
pF1KB4 LTGLSFDRYLAIVRPVANARLRLRVSGAVATAVLWVLAALLAMPVMVLRTTGDLENTTKV
:: ::.:::::::.:. . : . . :. ..:.::.: ..:... :.. .:::. .
CCDS82 LTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNIT
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 QCYMDYSMVATVSSEWAWEVGLGVSSTTVGFVVPFTIMLTCYFFIAQTIAGHFRKERIEG
: . : :.. . .:::.... .::. :: :.:: : .: ... .. .. .
CCDS82 VCAFHYE-----SQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKP
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 LRKRRRLLSIIVVLVVTFALCWMPYHLVKTLYMLGSL-LHWPCDFDLFLMNIFPYCTCIS
. ...::...:. : . :.:... : .: .: . : . .. . .: ::.
CCDS82 --RNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIA
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 YVNSCLNPFLYAFFDPRFRQACTSMLCCGQSRCAGTSHSSSGEKSASYS-----SGHSQG
: :.::::..:.:. .:.. ..: . . :. :. .. :: :. ..
CCDS82 YFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKK
330 340 350 360 370 380
360 370 380
pF1KB4 PGPNMGKGGEQMHEKSIPYSQETLVVD
:.:
CCDS82 PAPCFEVE
>>CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (394 aa)
initn: 616 init1: 375 opt: 652 Z-score: 612.9 bits: 122.2 E(32554): 8.1e-28
Smith-Waterman score: 652; 32.4% identity (66.4% similar) in 333 aa overlap (30-356:65-389)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MEEGGDFDNYYGADNQSECEYTDWKSSGALIPAIYMLVFLLGTTGNGLVLWTVFRSSRE
.::..: ..:..: ::.::. ... .
CCDS82 KMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKL
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 KRRSADIFIASLAVADLTFVVTLPLWATYTYRDYDWPFGTFFCKLSSYLIFVNMYASVFC
: :..:. .::.::: :..::::::.:: .: ::::...::..: . :.:::::
CCDS82 KT-VASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFL
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 LTGLSFDRYLAIVRPVANARLRLRVSGAVATAVLWVLAALLAMPVMVLRTTGDLENTTKV
:: ::.:::::::.:. . : . . :. ..:.::.: ..:... :.. .:::. .
CCDS82 LTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNIT
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 QCYMDYSMVATVSSEWAWEVGLGVSSTTVGFVVPFTIMLTCYFFIAQTIAGHFRKERIEG
: . : :.. . .:::.... .::. :: :.:: : .: ... .. .. .
CCDS82 VCAFHYE-----SQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKP
220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 LRKRRRLLSIIVVLVVTFALCWMPYHLVKTLYMLGSL-LHWPCDFDLFLMNIFPYCTCIS
. ...::...:. : . :.:... : .: .: . : . .. . .: ::.
CCDS82 --RNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIA
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 YVNSCLNPFLYAFFDPRFRQACTSMLCCGQSRCAGTSHSSSGEKSASYS-----SGHSQG
: :.::::..:.:. .:.. ..: . . :. :. .. :: :. ..
CCDS82 YFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKK
330 340 350 360 370 380
360 370 380
pF1KB4 PGPNMGKGGEQMHEKSIPYSQETLVVD
:.:
CCDS82 PAPCFEVE
390
>>CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX (363 aa)
initn: 469 init1: 252 opt: 585 Z-score: 551.7 bits: 110.7 E(32554): 2.1e-24
Smith-Waterman score: 585; 30.7% identity (62.7% similar) in 319 aa overlap (31-345:47-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MEEGGDFDNYYGADNQSECEYTDWKSSGALIPAIYMLVFLLGTTGNGLVLWTVFRSSREK
:: .:...:..: : .:. :.: ..
CCDS14 GLHFGLVNISGNNESTLNCSQKPSDKHLDAIPILYYIIFVIGFLVN-IVVVTLFCCQKGP
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 RRSADIFIASLAVADLTFVVTLPLWATYTYRDYDWPFGTFFCKLSSYLIFVNMYASVFCL
.. ..:.: .:::::: ...:::::::: ::: :: .::. . .. .::.::.: .
CCDS14 KKVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCKVFGSFLTLNMFASIFFI
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 TGLSFDRYLAIVRPVANARLRLRVSGAVATAVLWVLAALLAMPVMVLRTTGDLENTTKVQ
: .: ::: ... : . : : ... . ..: .: : ..:.. .: . .:
CCDS14 TCMSVDRYQSVIYPFLSQR-RNPWQASYIVPLVWCMACLSSLPTFYFRDVRTIEYLGVNA
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230
pF1KB4 CYMDYSMVATVSSEWA-WEVGLGVSSTTVGFVVPFTIMLTCYFFIAQTI--AGHFRKERI
: : . ..: : .:... .. .::..:. .. :::: : . . .. . :.::
CCDS14 CIMAFP-----PEKYAQWSAGIALMKNILGFIIPLIFIATCYFGIRKHLLKTNSYGKNRI
200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 EGLRKRRRLLSIIVVLVVTFALCWMPYHLVKTLYMLGSL-LHWPCDFDLFLMNIFPYCTC
: ..:.. ...:..: .::.:.:.. : :. . . :. . .:.
CCDS14 ----TRDQVLKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIAVIDLALPFAIL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 ISYVNSCLNPFLYAFFDPRFRQACTSMLCCGQSRCAGTSHSSSGEKSASYSSGHSQGPGP
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CCDS44 QRNR---LAKTKKPFKIIVTIIITFFLCWCPYH---TLNLL-ELHHTAMPGSVFSLGL-P
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CCDS44 LATALAIANSCMNPILYVFMGQDFKKFKVALFSRLVNALSEDTGHSSYPSHRSFTKMSSM
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CCDS44 NERTSMNERETGML
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CCDS61 KT-ATNIYIFNLALADALVTTTMPFQST-VYLMNSWPFGDVLCKIVISIDYYNMFTSIFT
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CCDS61 LTMMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPLKAKIINICIWLLSSSVGISAIVLGGTKVREDVDVI
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CCDS61 ECSLQFP---DDDYSW-WDLFMKICVFIFAFVIPVLIIIVCYTLMILRLKSVRLLSGSRE
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CCDS61 KDRNLRRITRLVLVVVAVFVVCWTPIHIFILVEALGSTSH-----STAALSSYYFCIALG
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CCDS14 IKIFCTVKSMRNVPNLFISSLALGDLLLLITCAPVDASRYLADR-WLFGRIGCKLIPFIQ
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CCDS14 LTSVGVSVFTLTALSADRYKAIVRPMDIQASHALMKICLKAAFIWIISMLLAIPEAVFSD
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CCDS14 QSAYNLPVEGNIHVKKQIESRKRLAKTVLVFVGLFAFCWLPNHVI---YLYRSYHYSEVD
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CCDS14 RSTTCMTSLKSTNPSVATFSLINGNICHERYV
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CCDS99 LATLENIFVL-SVFCLHKSSCTVAEIYLGNLAAADLILACGLPFWAITISNNFDWLFGET
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CCDS99 LCRVVNAIISMNLYSSICFLMLVSIDRYLALVKTMSMGRMRGVRWAKLYSLVIWGCTLLL
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CCDS99 TFCTMQIMQVLRNN-EMQKFKEIQTERRATVLVLVVLLLFIICWLPFQISTFLDTLHRLG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]