FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4456, 792 aa
1>>>pF1KB4456 792 - 792 aa - 792 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1592+/-0.00107; mu= -1.7069+/- 0.062
mean_var=375.3863+/-84.584, 0's: 0 Z-trim(112.2): 135 B-trim: 327 in 1/52
Lambda= 0.066197
statistics sampled from 12869 (12992) to 12869 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.73), E-opt: 0.2 (0.399), width: 16
Scan time: 4.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 4358 431.3 3e-120
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 4111 407.7 3.8e-113
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 819) 2700 273.0 1.4e-72
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 2534 257.1 7.6e-68
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 2534 257.1 7.8e-68
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 821) 2534 257.1 8.4e-68
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 2524 256.1 1.5e-67
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 2437 247.8 4.8e-65
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 2437 247.9 5.2e-65
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CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 2432 247.4 7.1e-65
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 2432 247.4 7.2e-65
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 2425 246.7 1.1e-64
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 2425 246.7 1.1e-64
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 2421 246.2 1.3e-64
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 2421 246.3 1.4e-64
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 822) 2421 246.3 1.5e-64
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 2364 240.9 6.4e-63
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 2134 218.8 2.4e-56
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 1983 204.3 4.7e-52
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 1457 154.2 7e-37
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 1289 138.2 4.7e-32
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 1268 136.2 1.9e-31
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 1061 116.4 1.8e-25
CCDS3344.1 FGFRL1 gene_id:53834|Hs108|chr4 ( 504) 625 74.6 4.6e-13
CCDS53525.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1072) 605 73.0 2.9e-12
CCDS7200.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1114) 605 73.0 3e-12
>>CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 (806 aa)
initn: 2860 init1: 2860 opt: 4358 Z-score: 2272.3 bits: 431.3 E(32554): 3e-120
Smith-Waterman score: 4358; 99.8% identity (99.8% similar) in 654 aa overlap (1-654:1-653)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGAPACALALCVAVAIVAGASSESLGTEQRVVGRAAEVPGPEPGQQEQLVFGSGDAVELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MGAPACALALCVAVAIVAGASSESLGTEQRVVGRAAEVPGPEPGQQEQLVFGSGDAVELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 CPPPGGGPMGPTVWVKDGTGLVPSERVLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSCRQRLTQRVLCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CPPPGGGPMGPTVWVKDGTGLVPSERVLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSCRQRLTQRVLCH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAEDTGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAEDTGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 NPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 YTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 DGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHSAWLVVLPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHSAWLVVLPAE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 EELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGSPTVHKISRFPLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGSPTVHKISRFPLK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 RQQVSLESNASMSSNTPLVRIARLSSGEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLGKPLG
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RQ-VSLESNASMSSNTPLVRIARLSSGEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLGKPLG
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 EGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNII
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 NLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLVSCAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLVSCAY
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 QVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNLVLWGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNGRLPVK
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 ALGDLHAGGLPVPRHPCGGALQAAEGGPPHGQARQLHTRPVHDHAGVLACRALPEAHLQA
CCDS33 WMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLKEGHRMDKPANC
660 670 680 690 700 710
>>CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 (808 aa)
initn: 3726 init1: 2135 opt: 4111 Z-score: 2144.8 bits: 407.7 E(32554): 3.8e-113
Smith-Waterman score: 4111; 94.7% identity (97.1% similar) in 657 aa overlap (1-654:1-655)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGAPACALALCVAVAIVAGASSESLGTEQRVVGRAAEVPGPEPGQQEQLVFGSGDAVELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MGAPACALALCVAVAIVAGASSESLGTEQRVVGRAAEVPGPEPGQQEQLVFGSGDAVELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 CPPPGGGPMGPTVWVKDGTGLVPSERVLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSCRQRLTQRVLCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CPPPGGGPMGPTVWVKDGTGLVPSERVLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSCRQRLTQRVLCH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAEDTGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAEDTGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 NPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 YTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB4 DGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHSAWLVVL-P-
::::::::::. ..... ... : : ::. .:.::: : : : :: .... :: : :
CCDS54 DGTPYVTVLKSWISESVEADVR-LRLANVSERDGGEYLCRATNFIGVAEKAFWLSVHGPR
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 -AEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGSPTVHKISRF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGSPTVHKISRF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 PLKRQQVSLESNASMSSNTPLVRIARLSSGEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLGK
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PLKRQ-VSLESNASMSSNTPLVRIARLSSGEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLGK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 PLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHK
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 NIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLVS
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 CAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNLVL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNGRL
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 WGPALGDLHAGGLPVPRHPCGGALQAAEGGPPHGQARQLHTRPVHDHAGVLACRALPEAH
CCDS54 PVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLKEGHRMDKP
660 670 680 690 700 710
>>CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 (819 aa)
initn: 2490 init1: 1180 opt: 2700 Z-score: 1416.4 bits: 273.0 E(32554): 1.4e-72
Smith-Waterman score: 2700; 64.6% identity (81.8% similar) in 659 aa overlap (10-654:8-660)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MGAPACALALCVAVAIVAGAS--SESLGTEQRVVGRAAEVPGP-EPGQQEQLVFGSGDAV
.:..:. .: : :.. . .. . : : . .: : : . :...
CCDS81 MVSWGRFICLVVVTMATLSLARPSFSLVEDTTLEPEEPPTKYQISQPEVYVAAPGESL
10 20 30 40 50
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pF1KB4 ELSCPPPGGGPMGPTVWVKDGTGLVPSER-VLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSCR-QRLTQ
:. : .. .. :.:::. : :..: ::.: . ::. .:. .::: :.: .: ..
CCDS81 EVRCLLKDAAVIS---WTKDGVHLGPNNRTVLIG-EYLQIKGATPRDSGLYACTASRTVD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 RVLCHFSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAED----TGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANT
.: : :::: ::::::: : ::: .. . ::::: :.:.:.: :::::::
CCDS81 SETWYFMVNVTDAISSGDDEDDTDGAEDFVSENSNNKRAPYWTNTEKMEKRLHAVPAANT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 VRFRCPAAGNPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVE
:.:::::.::: :.. :::::.::. :::::: :.:.:.:::.::::::::.::::::::
CCDS81 VKFRCPAGGNPMPTMRWLKNGKEFKQEHRIGGYKVRNQHWSLIMESVVPSDKGNYTCVVE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 NKFGSIRQTYTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHV
:..::: .:: :::.:::::::::::::::: ..:.:.:::: :::::::::::::.:::
CCDS81 NEYGSINHTYHLDVVERSPHRPILQAGLPANASTVVGGDVEFVCKVYSDAQPHIQWIKHV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 EVNGSKVGPDGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHS
: :::: :::: ::. :::.::.::::::.::: ..:::::::::::::::::::.: ::
CCDS81 EKNGSKYGPDGLPYLKVLKAAGVNTTDKEIEVLYIRNVTFEDAGEYTCLAGNSIGISFHS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB4 AWLVVLPAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGS--P
:::.:::: . : :. : : : .: ::. .:..: :::... :: : :
CCDS81 AWLTVLPAPGREKEIT-ASPDYLEIAIYCIGVFLIACMVVTVILCRMKNTTKKPDFSSQP
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 TVHKIS-RFPLKRQQVSLESNASMSSNTPLVRIA-RLSS-GEGPTLANVSELELPADPKW
.:::.. :.::.:: :: ::..::.::::::::. :::: .. : ::.::: ::: ::::
CCDS81 AVHKLTKRIPLRRQ-VSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSSTADTPMLAGVSEYELPEDPKW
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 ELSRARLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSE
:. : .::::::::::::::::::::.:::::. . :::::::::::::.:::::::::
CCDS81 EFPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTVAVKMLKDDATEKDLSDLVSE
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 MEMMKMIGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPP
:::::::::::::::::::::: :::::.::::.::::::.::::::::..::.: . :
CCDS81 MEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLRARRPPGMEYSYDINRVP
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 EEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNL
:::.::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::..:.
CCDS81 EEQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTENNVMKIADFGLARDINNI
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 DYYKKTTNLVLWGPALGDLHAGGLPVPRHPCGGALQAAEGGPPHGQARQLHTRPVHDHAG
::::::::
CCDS81 DYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMWEIFTLGGSPYPGIPVEELFK
660 670 680 690 700 710
>>CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 (707 aa)
initn: 2409 init1: 1180 opt: 2534 Z-score: 1331.5 bits: 257.1 E(32554): 7.6e-68
Smith-Waterman score: 2565; 72.5% identity (86.6% similar) in 538 aa overlap (127-654:37-573)
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 LNASHEDSGAYSCRQRLTQRVLCHFSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAED----TGVDTGAPY
:: ::::::: : ::: .. . :::
CCDS53 FICLVVVTMATLSLARPSFSLVEDTTLEPEDAISSGDDEDDTDGAEDFVSENSNNKRAPY
10 20 30 40 50 60
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 WTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAGNPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWS
:: :.:.:.: ::::::::.:::::.::: :.. :::::.::. :::::: :.:.:.::
CCDS53 WTNTEKMEKRLHAVPAANTVKFRCPAGGNPMPTMRWLKNGKEFKQEHRIGGYKVRNQHWS
70 80 90 100 110 120
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 LVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQTYTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVE
:.::::::::.:::::::::..::: .:: :::.:::::::::::::::: ..:.:.:::
CCDS53 LIMESVVPSDKGNYTCVVENEYGSINHTYHLDVVERSPHRPILQAGLPANASTVVGGDVE
130 140 150 160 170 180
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 FHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGPDGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFE
: :::::::::::::.:::: :::: :::: ::. :::.::.::::::.::: ..:::::
CCDS53 FVCKVYSDAQPHIQWIKHVEKNGSKYGPDGLPYLKVLKAAGVNTTDKEIEVLYIRNVTFE
190 200 210 220 230 240
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 DAGEYTCLAGNSIGFSHHSAWLVVLPAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAA
::::::::::::::.: :::::.:::: . : :. : : : .: ::. .:..
CCDS53 DAGEYTCLAGNSIGISFHSAWLTVLPAPGREKEIT-ASPDYLEIAIYCIGVFLIACMVVT
250 260 270 280 290 300
400 410 420 430 440
pF1KB4 VTLCRLRSPPKKGLGS--PTVHKIS-RFPLKRQ-QVSLESNASMSSNTPLVRIA-RLSS-
: :::... :: : :.:::.. :.::.:: :: ::..::.::::::::. ::::
CCDS53 VILCRMKNTTKKPDFSSQPAVHKLTKRIPLRRQVTVSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSST
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pF1KB4 GEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTV
.. : ::.::: ::: :::::. : .::::::::::::::::::::.:::::. . :::
CCDS53 ADTPMLAGVSEYELPEDPKWEFPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTV
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510 520 530 540 550 560
pF1KB4 AVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLRE
::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.::::.::::::
CCDS53 AVKMLKDDATEKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLRE
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pF1KB4 FLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLV
.::::::::..::.: . ::::.::::::::.::.::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YLRARRPPGMEYSYDINRVPEEQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLV
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::.:::::::::::::..:.::::::::
CCDS53 TENNVMKIADFGLARDINNIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMW
550 560 570 580 590 600
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:: :.:.:.: ::::::::.:::::.::: :.. :::::.::. :::::: :.:.:.::
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::::::::::::::.: :::::.:::: . : :. : : : .: ::. .:..
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pF1KB4 VTLCRLRSPPKKGLGS--PTVHKIS-RFPLKRQ-QVSLESNASMSSNTPLVRIA-RLSS-
: :::... :: : :.:::.. :.::.:: :: ::..::.::::::::. ::::
CCDS73 VILCRMKNTTKKPDFSSQPAVHKLTKRIPLRRQVTVSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSST
310 320 330 340 350 360
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pF1KB4 GEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTV
.. : ::.::: ::: :::::. : .::::::::::::::::::::.:::::. . :::
CCDS73 ADTPMLAGVSEYELPEDPKWEFPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTV
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::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.::::.::::::
CCDS73 AVKMLKDDATEKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLRE
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pF1KB4 FLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLV
.::::::::..::.: . ::::.::::::::.::.::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YLRARRPPGMEYSYDINRVPEEQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLV
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pF1KB4 TEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNLVLWGPALGDLHAGGLPVPRHPCGGALQAAEG
::.:::::::::::::..:.::::::::
CCDS73 TENNVMKIADFGLARDINNIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMW
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.:..:. .: : :.. . .. . : : . .: : : . :...
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:..::: .:: :::.:::::::::::::::: ..:.:.:::: :::::::::::::.:::
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CCDS31 EKNGSKYGPDGLPYLKVLKAAGVNTTDKEIEVLYIRNVTFEDAGEYTCLAGNSIGISFHS
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:::.:::: . : :. : : : .: ::. .:..: :::... :: : :
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CCDS31 EMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLRARRPPGMEYSYDINRV
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.::::::::
CCDS31 IDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMWEIFTLGGSPYPGIPVEELF
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CCDS44 TVKFRCPAGGNPMPTMRWLKNGKEFKQEHRIGGYKVRNQHWSLIMESVVPSDKGNYTCVV
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pF1KB4 ENKFGSIRQTYTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKH
::..::: .:: :::.:::::::::::::::: ..:.:.:::: :::::::::::::.::
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CCDS44 VEKNGSKYGPDGLPYLKVLKAAGVNTTDKEIEVLYIRNVTFEDAGEYTCLAGNSIGISFH
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CCDS44 SAWLTVLPAPGREKEIT-ASPDYLEIAIYCIGVFLIACMVVTVILCRMKNTTKKPDFSSQ
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pF1KB4 PTVHKIS-RFPLKRQQVSLESNASMSSNTPLVRIA-RLSS-GEGPTLANVSELELPADPK
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CCDS44 PAVHKLTKRIPLRRQ-VSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSSTADTPMLAGVSEYELPEDPK
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::. : .::::::::::::::::::::.:::::. . :::::::::::::.::::::::
CCDS44 WEFPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTVAVKMLKDDATEKDLSDLVS
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pF1KB4 EMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKP
::::::::::::::::::::::: :::::.::::.::::::.::::::::..::.: .
CCDS44 EMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLRARRPPGMEYSYDINRV
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pF1KB4 PEEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHN
::::.::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::..:
CCDS44 PEEQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTENNVMKIADFGLARDINN
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pF1KB4 LDYYKKTTNLVLWGPALGDLHAGGLPVPRHPCGGALQAAEGGPPHGQARQLHTRPVHDHA
.::::::::
CCDS44 IDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMWEIFTLGGSPYPGIPVEELF
540 550 560 570 580 590
>>CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 (731 aa)
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pF1KB4 LNASHEDSGAYSCRQRLTQRVLCHFSVRVTDA-PSSGDDEDGED------EAEDTGVDTG
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CCDS43 MWSWKCLLFWAVLVTATLCTARPSPTLPEQDALPSSEDDDDDDDSSSEEKETDNTKPNPV
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pF1KB4 APYWTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAGNPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQ
::::: ::.:.::: :::::.::.:.::..:.:.:.. :::::.::. .::::: :.:.
CCDS43 APYWTSPEKMEKKLHAVPAAKTVKFKCPSSGTPNPTLRWLKNGKEFKPDHRIGGYKVRYA
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pF1KB4 QWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQTYTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGS
::..:.::::::.:::::.:::..::: .:: :::.::::::::::::::::.:..:::
CCDS43 TWSIIMDSVVPSDKGNYTCIVENEYGSINHTYQLDVVERSPHRPILQAGLPANKTVALGS
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pF1KB4 DVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGPDGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNV
.::: :::::: :::::::::.::::::.:::. ::: .:::::.::::::.::: :.::
CCDS43 NVEFMCKVYSDPQPHIQWLKHIEVNGSKIGPDNLPYVQILKTAGVNTTDKEMEVLHLRNV
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pF1KB4 TFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHSAWLVVLPAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILV
.::::::::::::::::.:::::::.:: : :: : .. .: :. : .: ::. .
CCDS43 SFEDAGEYTCLAGNSIGLSHHSAWLTVLEALEER-PAVMTSPLYLEIIIYCTGAFLISCM
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pF1KB4 VAAVTLCRLRSPPKKG--LGSPTVHKISR-FPLKRQ-QVSLESNASMSSNTPLVRIARLS
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CCDS43 VGSVIVYKMKSGTKKSDFHSQMAVHKLAKSIPLRRQVTVSADSSASMNSGVLLVRPSRLS
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pF1KB4 SGEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVT
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CCDS43 SSGTPMLAGVSEYELPEDPRWELPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTK
360 370 380 390 400 410
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pF1KB4 VAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLR
:::::::.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::: :::::.::::.:::::
CCDS43 VAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLR
420 430 440 450 460 470
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pF1KB4 EFLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVL
:.:.:::::::.: .. . :::::. :::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS43 EYLQARRPPGLEYCYNPSHNPEEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVL
480 490 500 510 520 530
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pF1KB4 VTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNLVLWGPALGDLHAGGLPVPRHPCGGALQAAE
:::::::::::::::::.:..::::::::
CCDS43 VTEDNVMKIADFGLARDIHHIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLL
540 550 560 570 580 590
>>CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 (820 aa)
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pF1KB4 ALCVAVAIVAGASSESLGTEQRVVGRAAEVPGPEPGQQEQLVFGSGDAVELSCPPPGGGP
: : . :... :: ..: :
CCDS43 SWKCLLFWAVLVTATLCTARPSPTLPEQAQPWGAPVEVESFLVHPGDLLQLRCRLRDD--
10 20 30 40 50 60
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pF1KB4 MGPTVWVKDGTGLVPSERVLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSC-RQRLTQRVLCHFSVRVTD
. :..::. :. :.:. . ....: .. ::: :.: . . .::: :.:
CCDS43 VQSINWLRDGVQLAESNRTRITGEEVEVQDSVPADSGLYACVTSSPSGSDTTYFSVNVSD
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pF1KB4 A-PSSGDDEDGED------EAEDTGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAG
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CCDS43 ALPSSEDDDDDDDSSSEEKETDNTKPNPVAPYWTSPEKMEKKLHAVPAAKTVKFKCPSSG
130 140 150 160 170 180
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pF1KB4 NPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQT
.:.:.. :::::.::. .::::: :.:. ::..:.::::::.:::::.:::..::: .:
CCDS43 TPNPTLRWLKNGKEFKPDHRIGGYKVRYATWSIIMDSVVPSDKGNYTCIVENEYGSINHT
190 200 210 220 230 240
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