FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4456, 792 aa 1>>>pF1KB4456 792 - 792 aa - 792 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1592+/-0.00107; mu= -1.7069+/- 0.062 mean_var=375.3863+/-84.584, 0's: 0 Z-trim(112.2): 135 B-trim: 327 in 1/52 Lambda= 0.066197 statistics sampled from 12869 (12992) to 12869 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.73), E-opt: 0.2 (0.399), width: 16 Scan time: 4.310 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 4358 431.3 3e-120 CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 4111 407.7 3.8e-113 CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 819) 2700 273.0 1.4e-72 CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 2534 257.1 7.6e-68 CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 2534 257.1 7.8e-68 CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 821) 2534 257.1 8.4e-68 CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 2524 256.1 1.5e-67 CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 2437 247.8 4.8e-65 CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 2437 247.9 5.2e-65 CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 2437 247.9 5.3e-65 CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 2432 247.4 7.1e-65 CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 2432 247.4 7.2e-65 CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 2425 246.7 1.1e-64 CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 2425 246.7 1.1e-64 CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 2421 246.2 1.3e-64 CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 2421 246.3 1.4e-64 CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 822) 2421 246.3 1.5e-64 CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 2364 240.9 6.4e-63 CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 2134 218.8 2.4e-56 CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 1983 204.3 4.7e-52 CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 1457 154.2 7e-37 CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 1289 138.2 4.7e-32 CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 1268 136.2 1.9e-31 CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 1061 116.4 1.8e-25 CCDS3344.1 FGFRL1 gene_id:53834|Hs108|chr4 ( 504) 625 74.6 4.6e-13 CCDS53525.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1072) 605 73.0 2.9e-12 CCDS7200.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1114) 605 73.0 3e-12 >>CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 (806 aa) initn: 2860 init1: 2860 opt: 4358 Z-score: 2272.3 bits: 431.3 E(32554): 3e-120 Smith-Waterman score: 4358; 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CCDS81 EVRCLLKDAAVIS---WTKDGVHLGPNNRTVLIG-EYLQIKGATPRDSGLYACTASRTVD 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB4 RVLCHFSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAED----TGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANT .: : :::: ::::::: : ::: .. . ::::: :.:.:.: ::::::: CCDS81 SETWYFMVNVTDAISSGDDEDDTDGAEDFVSENSNNKRAPYWTNTEKMEKRLHAVPAANT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB4 VRFRCPAAGNPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVE :.:::::.::: :.. :::::.::. :::::: :.:.:.:::.::::::::.:::::::: CCDS81 VKFRCPAGGNPMPTMRWLKNGKEFKQEHRIGGYKVRNQHWSLIMESVVPSDKGNYTCVVE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB4 NKFGSIRQTYTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHV :..::: .:: :::.:::::::::::::::: ..:.:.:::: :::::::::::::.::: CCDS81 NEYGSINHTYHLDVVERSPHRPILQAGLPANASTVVGGDVEFVCKVYSDAQPHIQWIKHV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB4 EVNGSKVGPDGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHS : :::: :::: ::. :::.::.::::::.::: ..:::::::::::::::::::.: :: CCDS81 EKNGSKYGPDGLPYLKVLKAAGVNTTDKEIEVLYIRNVTFEDAGEYTCLAGNSIGISFHS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 AWLVVLPAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGS--P :::.:::: . : :. : : : .: ::. .:..: :::... :: : : CCDS81 AWLTVLPAPGREKEIT-ASPDYLEIAIYCIGVFLIACMVVTVILCRMKNTTKKPDFSSQP 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 TVHKIS-RFPLKRQQVSLESNASMSSNTPLVRIA-RLSS-GEGPTLANVSELELPADPKW .:::.. :.::.:: :: ::..::.::::::::. :::: .. : ::.::: ::: :::: CCDS81 AVHKLTKRIPLRRQ-VSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSSTADTPMLAGVSEYELPEDPKW 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 ELSRARLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSE :. : .::::::::::::::::::::.:::::. . :::::::::::::.::::::::: CCDS81 EFPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTVAVKMLKDDATEKDLSDLVSE 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KB4 MEMMKMIGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPP :::::::::::::::::::::: :::::.::::.::::::.::::::::..::.: . : CCDS81 MEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLRARRPPGMEYSYDINRVP 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KB4 EEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNL :::.::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::..:. CCDS81 EEQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTENNVMKIADFGLARDINNI 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KB4 DYYKKTTNLVLWGPALGDLHAGGLPVPRHPCGGALQAAEGGPPHGQARQLHTRPVHDHAG :::::::: CCDS81 DYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMWEIFTLGGSPYPGIPVEELFK 660 670 680 690 700 710 >>CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 (707 aa) initn: 2409 init1: 1180 opt: 2534 Z-score: 1331.5 bits: 257.1 E(32554): 7.6e-68 Smith-Waterman score: 2565; 72.5% identity (86.6% similar) in 538 aa overlap (127-654:37-573) 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 LNASHEDSGAYSCRQRLTQRVLCHFSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAED----TGVDTGAPY :: ::::::: : ::: .. . ::: CCDS53 FICLVVVTMATLSLARPSFSLVEDTTLEPEDAISSGDDEDDTDGAEDFVSENSNNKRAPY 10 20 30 40 50 60 160 170 180 190 200 210 pF1KB4 WTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAGNPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWS :: :.:.:.: ::::::::.:::::.::: :.. :::::.::. :::::: :.:.:.:: CCDS53 WTNTEKMEKRLHAVPAANTVKFRCPAGGNPMPTMRWLKNGKEFKQEHRIGGYKVRNQHWS 70 80 90 100 110 120 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 LVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQTYTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVE :.::::::::.:::::::::..::: .:: :::.:::::::::::::::: ..:.:.::: CCDS53 LIMESVVPSDKGNYTCVVENEYGSINHTYHLDVVERSPHRPILQAGLPANASTVVGGDVE 130 140 150 160 170 180 280 290 300 310 320 330 pF1KB4 FHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGPDGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFE : :::::::::::::.:::: :::: :::: ::. :::.::.::::::.::: ..::::: CCDS53 FVCKVYSDAQPHIQWIKHVEKNGSKYGPDGLPYLKVLKAAGVNTTDKEIEVLYIRNVTFE 190 200 210 220 230 240 340 350 360 370 380 390 pF1KB4 DAGEYTCLAGNSIGFSHHSAWLVVLPAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAA ::::::::::::::.: :::::.:::: . : :. : : : .: ::. .:.. CCDS53 DAGEYTCLAGNSIGISFHSAWLTVLPAPGREKEIT-ASPDYLEIAIYCIGVFLIACMVVT 250 260 270 280 290 300 400 410 420 430 440 pF1KB4 VTLCRLRSPPKKGLGS--PTVHKIS-RFPLKRQ-QVSLESNASMSSNTPLVRIA-RLSS- : :::... :: : :.:::.. :.::.:: :: ::..::.::::::::. :::: CCDS53 VILCRMKNTTKKPDFSSQPAVHKLTKRIPLRRQVTVSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSST 310 320 330 340 350 360 450 460 470 480 490 500 pF1KB4 GEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTV .. : ::.::: ::: :::::. : .::::::::::::::::::::.:::::. . ::: CCDS53 ADTPMLAGVSEYELPEDPKWEFPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTV 370 380 390 400 410 420 510 520 530 540 550 560 pF1KB4 AVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLRE ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.::::.:::::: CCDS53 AVKMLKDDATEKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLRE 430 440 450 460 470 480 570 580 590 600 610 620 pF1KB4 FLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLV .::::::::..::.: . ::::.::::::::.::.:::::::::::::::::::::::: CCDS53 YLRARRPPGMEYSYDINRVPEEQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLV 490 500 510 520 530 540 630 640 650 660 670 680 pF1KB4 TEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNLVLWGPALGDLHAGGLPVPRHPCGGALQAAEG ::.:::::::::::::..:.:::::::: CCDS53 TENNVMKIADFGLARDINNIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMW 550 560 570 580 590 600 >>CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 (732 aa) initn: 2409 init1: 1180 opt: 2534 Z-score: 1331.3 bits: 257.1 E(32554): 7.8e-68 Smith-Waterman score: 2565; 72.5% identity (86.6% similar) in 538 aa overlap (127-654:37-573) 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 LNASHEDSGAYSCRQRLTQRVLCHFSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAED----TGVDTGAPY :: ::::::: : ::: .. . ::: CCDS73 FICLVVVTMATLSLARPSFSLVEDTTLEPEDAISSGDDEDDTDGAEDFVSENSNNKRAPY 10 20 30 40 50 60 160 170 180 190 200 210 pF1KB4 WTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAGNPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWS :: :.:.:.: ::::::::.:::::.::: :.. :::::.::. :::::: :.:.:.:: CCDS73 WTNTEKMEKRLHAVPAANTVKFRCPAGGNPMPTMRWLKNGKEFKQEHRIGGYKVRNQHWS 70 80 90 100 110 120 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 LVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQTYTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVE :.::::::::.:::::::::..::: .:: :::.:::::::::::::::: ..:.:.::: CCDS73 LIMESVVPSDKGNYTCVVENEYGSINHTYHLDVVERSPHRPILQAGLPANASTVVGGDVE 130 140 150 160 170 180 280 290 300 310 320 330 pF1KB4 FHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGPDGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFE : :::::::::::::.:::: :::: :::: ::. :::.::.::::::.::: ..::::: CCDS73 FVCKVYSDAQPHIQWIKHVEKNGSKYGPDGLPYLKVLKAAGVNTTDKEIEVLYIRNVTFE 190 200 210 220 230 240 340 350 360 370 380 390 pF1KB4 DAGEYTCLAGNSIGFSHHSAWLVVLPAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAA ::::::::::::::.: :::::.:::: . : :. : : : .: ::. .:.. CCDS73 DAGEYTCLAGNSIGISFHSAWLTVLPAPGREKEIT-ASPDYLEIAIYCIGVFLIACMVVT 250 260 270 280 290 300 400 410 420 430 440 pF1KB4 VTLCRLRSPPKKGLGS--PTVHKIS-RFPLKRQ-QVSLESNASMSSNTPLVRIA-RLSS- : :::... :: : :.:::.. :.::.:: :: ::..::.::::::::. :::: CCDS73 VILCRMKNTTKKPDFSSQPAVHKLTKRIPLRRQVTVSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSST 310 320 330 340 350 360 450 460 470 480 490 500 pF1KB4 GEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTV .. : ::.::: ::: :::::. : .::::::::::::::::::::.:::::. . ::: CCDS73 ADTPMLAGVSEYELPEDPKWEFPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTV 370 380 390 400 410 420 510 520 530 540 550 560 pF1KB4 AVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLRE ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.::::.:::::: CCDS73 AVKMLKDDATEKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLRE 430 440 450 460 470 480 570 580 590 600 610 620 pF1KB4 FLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLV .::::::::..::.: . ::::.::::::::.::.:::::::::::::::::::::::: CCDS73 YLRARRPPGMEYSYDINRVPEEQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLV 490 500 510 520 530 540 630 640 650 660 670 680 pF1KB4 TEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNLVLWGPALGDLHAGGLPVPRHPCGGALQAAEG ::.:::::::::::::..:.:::::::: CCDS73 TENNVMKIADFGLARDINNIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMW 550 560 570 580 590 600 >>CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 (821 aa) initn: 2490 init1: 1180 opt: 2534 Z-score: 1330.7 bits: 257.1 E(32554): 8.4e-68 Smith-Waterman score: 2699; 64.5% identity (81.7% similar) in 660 aa overlap (10-654:8-662) 10 20 30 40 50 pF1KB4 MGAPACALALCVAVAIVAGAS--SESLGTEQRVVGRAAEVPGP-EPGQQEQLVFGSGDAV .:..:. .: : :.. . .. . : : . .: : : . :... CCDS31 MVSWGRFICLVVVTMATLSLARPSFSLVEDTTLEPEEPPTKYQISQPEVYVAAPGESL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB4 ELSCPPPGGGPMGPTVWVKDGTGLVPSER-VLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSCR-QRLTQ :. : .. .. :.:::. : :..: ::.: . ::. .:. .::: :.: .: .. CCDS31 EVRCLLKDAAVIS---WTKDGVHLGPNNRTVLIG-EYLQIKGATPRDSGLYACTASRTVD 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB4 RVLCHFSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAED----TGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANT .: : :::: ::::::: : ::: .. . ::::: :.:.:.: ::::::: CCDS31 SETWYFMVNVTDAISSGDDEDDTDGAEDFVSENSNNKRAPYWTNTEKMEKRLHAVPAANT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB4 VRFRCPAAGNPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVE :.:::::.::: :.. :::::.::. :::::: :.:.:.:::.::::::::.:::::::: CCDS31 VKFRCPAGGNPMPTMRWLKNGKEFKQEHRIGGYKVRNQHWSLIMESVVPSDKGNYTCVVE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB4 NKFGSIRQTYTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHV :..::: .:: :::.:::::::::::::::: ..:.:.:::: :::::::::::::.::: CCDS31 NEYGSINHTYHLDVVERSPHRPILQAGLPANASTVVGGDVEFVCKVYSDAQPHIQWIKHV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB4 EVNGSKVGPDGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHS : :::: :::: ::. :::.::.::::::.::: ..:::::::::::::::::::.: :: CCDS31 EKNGSKYGPDGLPYLKVLKAAGVNTTDKEIEVLYIRNVTFEDAGEYTCLAGNSIGISFHS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 AWLVVLPAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGS--P :::.:::: . : :. : : : .: ::. .:..: :::... :: : : CCDS31 AWLTVLPAPGREKEIT-ASPDYLEIAIYCIGVFLIACMVVTVILCRMKNTTKKPDFSSQP 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 TVHKIS-RFPLKRQ-QVSLESNASMSSNTPLVRIA-RLSS-GEGPTLANVSELELPADPK .:::.. :.::.:: :: ::..::.::::::::. :::: .. : ::.::: ::: ::: CCDS31 AVHKLTKRIPLRRQVTVSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSSTADTPMLAGVSEYELPEDPK 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 WELSRARLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVS ::. : .::::::::::::::::::::.:::::. . :::::::::::::.:::::::: CCDS31 WEFPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTVAVKMLKDDATEKDLSDLVS 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KB4 EMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKP ::::::::::::::::::::::: :::::.::::.::::::.::::::::..::.: . CCDS31 EMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLRARRPPGMEYSYDINRV 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KB4 PEEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHN ::::.::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::..: CCDS31 PEEQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTENNVMKIADFGLARDINN 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KB4 LDYYKKTTNLVLWGPALGDLHAGGLPVPRHPCGGALQAAEGGPPHGQARQLHTRPVHDHA .:::::::: CCDS31 IDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMWEIFTLGGSPYPGIPVEELF 660 670 680 690 700 710 >>CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 (704 aa) initn: 2399 init1: 1180 opt: 2524 Z-score: 1326.4 bits: 256.1 E(32554): 1.5e-67 Smith-Waterman score: 2524; 73.4% identity (87.9% similar) in 519 aa overlap (142-654:29-545) 120 130 140 150 160 170 pF1KB4 RLTQRVLCHFSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAEDTGVDT-GAPYWTRPERMDKKLLAVPAAN ::: .. :::::: :.:.:.: :::::: CCDS44 MVSWGRFICLVVVTMATLSLARPSFSLVEDTTLEPEGAPYWTNTEKMEKRLHAVPAAN 10 20 30 40 50 180 190 200 210 220 230 pF1KB4 TVRFRCPAAGNPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVV ::.:::::.::: :.. :::::.::. :::::: :.:.:.:::.::::::::.::::::: CCDS44 TVKFRCPAGGNPMPTMRWLKNGKEFKQEHRIGGYKVRNQHWSLIMESVVPSDKGNYTCVV 60 70 80 90 100 110 240 250 260 270 280 290 pF1KB4 ENKFGSIRQTYTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKH ::..::: .:: :::.:::::::::::::::: ..:.:.:::: :::::::::::::.:: CCDS44 ENEYGSINHTYHLDVVERSPHRPILQAGLPANASTVVGGDVEFVCKVYSDAQPHIQWIKH 120 130 140 150 160 170 300 310 320 330 340 350 pF1KB4 VEVNGSKVGPDGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHH :: :::: :::: ::. :::.::.::::::.::: ..:::::::::::::::::::.: : CCDS44 VEKNGSKYGPDGLPYLKVLKAAGVNTTDKEIEVLYIRNVTFEDAGEYTCLAGNSIGISFH 180 190 200 210 220 230 360 370 380 390 400 pF1KB4 SAWLVVLPAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGS-- ::::.:::: . : :. : : : .: ::. .:..: :::... :: : CCDS44 SAWLTVLPAPGREKEIT-ASPDYLEIAIYCIGVFLIACMVVTVILCRMKNTTKKPDFSSQ 240 250 260 270 280 290 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 PTVHKIS-RFPLKRQQVSLESNASMSSNTPLVRIA-RLSS-GEGPTLANVSELELPADPK :.:::.. :.::.:: :: ::..::.::::::::. :::: .. : ::.::: ::: ::: CCDS44 PAVHKLTKRIPLRRQ-VSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSSTADTPMLAGVSEYELPEDPK 300 310 320 330 340 350 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 WELSRARLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVS ::. : .::::::::::::::::::::.:::::. . :::::::::::::.:::::::: CCDS44 WEFPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTVAVKMLKDDATEKDLSDLVS 360 370 380 390 400 410 530 540 550 560 570 580 pF1KB4 EMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKP ::::::::::::::::::::::: :::::.::::.::::::.::::::::..::.: . CCDS44 EMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLRARRPPGMEYSYDINRV 420 430 440 450 460 470 590 600 610 620 630 640 pF1KB4 PEEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHN ::::.::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::..: CCDS44 PEEQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTENNVMKIADFGLARDINN 480 490 500 510 520 530 650 660 670 680 690 700 pF1KB4 LDYYKKTTNLVLWGPALGDLHAGGLPVPRHPCGGALQAAEGGPPHGQARQLHTRPVHDHA .:::::::: CCDS44 IDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMWEIFTLGGSPYPGIPVEELF 540 550 560 570 580 590 >>CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 (731 aa) initn: 2386 init1: 1198 opt: 2437 Z-score: 1281.3 bits: 247.8 E(32554): 4.8e-65 Smith-Waterman score: 2453; 68.3% identity (86.5% similar) in 539 aa overlap (127-654:31-568) 100 110 120 130 140 pF1KB4 LNASHEDSGAYSCRQRLTQRVLCHFSVRVTDA-PSSGDDEDGED------EAEDTGVDTG :: ::: ::.: .: :...: . CCDS43 MWSWKCLLFWAVLVTATLCTARPSPTLPEQDALPSSEDDDDDDDSSSEEKETDNTKPNPV 10 20 30 40 50 60 150 160 170 180 190 200 pF1KB4 APYWTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAGNPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQ ::::: ::.:.::: :::::.::.:.::..:.:.:.. :::::.::. .::::: :.:. CCDS43 APYWTSPEKMEKKLHAVPAAKTVKFKCPSSGTPNPTLRWLKNGKEFKPDHRIGGYKVRYA 70 80 90 100 110 120 210 220 230 240 250 260 pF1KB4 QWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQTYTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGS ::..:.::::::.:::::.:::..::: .:: :::.::::::::::::::::.:..::: CCDS43 TWSIIMDSVVPSDKGNYTCIVENEYGSINHTYQLDVVERSPHRPILQAGLPANKTVALGS 130 140 150 160 170 180 270 280 290 300 310 320 pF1KB4 DVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGPDGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNV .::: :::::: :::::::::.::::::.:::. ::: .:::::.::::::.::: :.:: CCDS43 NVEFMCKVYSDPQPHIQWLKHIEVNGSKIGPDNLPYVQILKTAGVNTTDKEMEVLHLRNV 190 200 210 220 230 240 330 340 350 360 370 380 pF1KB4 TFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHSAWLVVLPAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILV .::::::::::::::::.:::::::.:: : :: : .. .: :. : .: ::. . CCDS43 SFEDAGEYTCLAGNSIGLSHHSAWLTVLEALEER-PAVMTSPLYLEIIIYCTGAFLISCM 250 260 270 280 290 390 400 410 420 430 440 pF1KB4 VAAVTLCRLRSPPKKG--LGSPTVHKISR-FPLKRQ-QVSLESNASMSSNTPLVRIARLS :..: . ...: ::. .. .:::... .::.:: :: .:.:::.:.. ::: .::: CCDS43 VGSVIVYKMKSGTKKSDFHSQMAVHKLAKSIPLRRQVTVSADSSASMNSGVLLVRPSRLS 300 310 320 330 340 350 450 460 470 480 490 500 pF1KB4 SGEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVT :. : ::.::: ::: ::.::: : ::.::::::::::::::.:::::.:::. . . CCDS43 SSGTPMLAGVSEYELPEDPRWELPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTK 360 370 380 390 400 410 510 520 530 540 550 560 pF1KB4 VAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLR :::::::.:::.::::::.:::::::::::::::::::::::: :::::.::::.::::: CCDS43 VAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLR 420 430 440 450 460 470 570 580 590 600 610 620 pF1KB4 EFLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVL :.:.:::::::.: .. . :::::. :::::::::::::::::::.::::::::::::: CCDS43 EYLQARRPPGLEYCYNPSHNPEEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVL 480 490 500 510 520 530 630 640 650 660 670 680 pF1KB4 VTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNLVLWGPALGDLHAGGLPVPRHPCGGALQAAE :::::::::::::::::.:..:::::::: CCDS43 VTEDNVMKIADFGLARDIHHIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLL 540 550 560 570 580 590 >>CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 (820 aa) initn: 2347 init1: 1198 opt: 2437 Z-score: 1280.7 bits: 247.9 E(32554): 5.2e-65 Smith-Waterman score: 2562; 62.3% identity (81.8% similar) in 628 aa overlap (39-654:33-657) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 ALCVAVAIVAGASSESLGTEQRVVGRAAEVPGPEPGQQEQLVFGSGDAVELSCPPPGGGP : : . :... :: ..: : CCDS43 SWKCLLFWAVLVTATLCTARPSPTLPEQAQPWGAPVEVESFLVHPGDLLQLRCRLRDD-- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 MGPTVWVKDGTGLVPSERVLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSC-RQRLTQRVLCHFSVRVTD . :..::. :. :.:. . ....: .. ::: :.: . . .::: :.: CCDS43 VQSINWLRDGVQLAESNRTRITGEEVEVQDSVPADSGLYACVTSSPSGSDTTYFSVNVSD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 A-PSSGDDEDGED------EAEDTGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAG : ::: ::.: .: :...: . ::::: ::.:.::: :::::.::.:.::..: CCDS43 ALPSSEDDDDDDDSSSEEKETDNTKPNPVAPYWTSPEKMEKKLHAVPAAKTVKFKCPSSG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 NPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQT .:.:.. :::::.::. .::::: :.:. ::..:.::::::.:::::.:::..::: .: CCDS43 TPNPTLRWLKNGKEFKPDHRIGGYKVRYATWSIIMDSVVPSDKGNYTCIVENEYGSINHT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 YTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGP : :::.::::::::::::::::.:..:::.::: :::::: :::::::::.::::::.:: CCDS43 YQLDVVERSPHRPILQAGLPANKTVALGSNVEFMCKVYSDPQPHIQWLKHIEVNGSKIGP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 DGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHSAWLVVLPAE :. ::: .:::::.::::::.::: :.::.::::::::::::::::.:::::::.:: : CCDS43 DNLPYVQILKTAGVNTTDKEMEVLHLRNVSFEDAGEYTCLAGNSIGLSHHSAWLTVLEAL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB4 EELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKG--LGSPTVHKISR-F :: : .. .: :. : .: ::. .:..: . ...: ::. .. .:::... . CCDS43 EER-PAVMTSPLYLEIIIYCTGAFLISCMVGSVIVYKMKSGTKKSDFHSQMAVHKLAKSI 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB4 PLKRQ-QVSLESNASMSSNTPLVRIARLSSGEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLG ::.:: :: .:.:::.:.. ::: .::::. : ::.::: ::: ::.::: : ::.:: CCDS43 PLRRQVTVSADSSASMNSGVLLVRPSRLSSSGTPMLAGVSEYELPEDPRWELPRDRLVLG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB4 KPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKH ::::::::::::.:::::.:::. . . :::::::.:::.::::::.:::::::::::: CCDS43 KPLGEGCFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKH 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB4 KNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLV :::::::::::: :::::.::::.::::::.:.:::::::.: .. . :::::. :::: CCDS43 KNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLEYCYNPSHNPEEQLSSKDLV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB4 SCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNLV :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:..:::::::: CCDS43 SCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDIHHIDYYKKTTNGR 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB4 LWGPALGDLHAGGLPVPRHPCGGALQAAEGGPPHGQARQLHTRPVHDHAGVLACRALPEA CCDS43 LPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGVPVEELFKLLKEGHRMDK 660 670 680 690 700 710 >>CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 (853 aa) initn: 2347 init1: 1198 opt: 2437 Z-score: 1280.5 bits: 247.9 E(32554): 5.3e-65 Smith-Waterman score: 2562; 62.3% identity (81.8% similar) in 628 aa overlap (39-654:66-690) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 ALCVAVAIVAGASSESLGTEQRVVGRAAEVPGPEPGQQEQLVFGSGDAVELSCPPPGGGP : : . :... :: ..: : CCDS55 SWKCLLFWAVLVTATLCTARPSPTLPEQAQPWGAPVEVESFLVHPGDLLQLRCRLRDD-- 40 50 60 70 80 90 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 MGPTVWVKDGTGLVPSERVLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSC-RQRLTQRVLCHFSVRVTD . :..::. :. :.:. . ....: .. ::: :.: . . .::: :.: CCDS55 VQSINWLRDGVQLAESNRTRITGEEVEVQDSVPADSGLYACVTSSPSGSDTTYFSVNVSD 100 110 120 130 140 150 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 A-PSSGDDEDGED------EAEDTGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAG : ::: ::.: .: :...: . ::::: ::.:.::: :::::.::.:.::..: CCDS55 ALPSSEDDDDDDDSSSEEKETDNTKPNPVAPYWTSPEKMEKKLHAVPAAKTVKFKCPSSG 160 170 180 190 200 210 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 NPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQT .:.:.. :::::.::. .::::: :.:. ::..:.::::::.:::::.:::..::: .: CCDS55 TPNPTLRWLKNGKEFKPDHRIGGYKVRYATWSIIMDSVVPSDKGNYTCIVENEYGSINHT 220 230 240 250 260 270 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 YTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGP : :::.::::::::::::::::.:..:::.::: :::::: :::::::::.::::::.:: CCDS55 YQLDVVERSPHRPILQAGLPANKTVALGSNVEFMCKVYSDPQPHIQWLKHIEVNGSKIGP 280 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 DGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHSAWLVVLPAE :. ::: .:::::.::::::.::: :.::.::::::::::::::::.:::::::.:: : CCDS55 DNLPYVQILKTAGVNTTDKEMEVLHLRNVSFEDAGEYTCLAGNSIGLSHHSAWLTVLEAL 340 350 360 370 380 390 370 380 390 400 410 pF1KB4 EELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKG--LGSPTVHKISR-F :: : .. .: :. : .: ::. .:..: . ...: ::. .. .:::... . CCDS55 EER-PAVMTSPLYLEIIIYCTGAFLISCMVGSVIVYKMKSGTKKSDFHSQMAVHKLAKSI 400 410 420 430 440 450 420 430 440 450 460 470 pF1KB4 PLKRQ-QVSLESNASMSSNTPLVRIARLSSGEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLG ::.:: :: .:.:::.:.. ::: .::::. : ::.::: ::: ::.::: : ::.:: CCDS55 PLRRQVTVSADSSASMNSGVLLVRPSRLSSSGTPMLAGVSEYELPEDPRWELPRDRLVLG 460 470 480 490 500 510 480 490 500 510 520 530 pF1KB4 KPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKH ::::::::::::.:::::.:::. . . :::::::.:::.::::::.:::::::::::: CCDS55 KPLGEGCFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKH 520 530 540 550 560 570 540 550 560 570 580 590 pF1KB4 KNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLV :::::::::::: :::::.::::.::::::.:.:::::::.: .. . :::::. :::: CCDS55 KNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLEYCYNPSHNPEEQLSSKDLV 580 590 600 610 620 630 600 610 620 630 640 650 pF1KB4 SCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNLV :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:..:::::::: CCDS55 SCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDIHHIDYYKKTTNGR 640 650 660 670 680 690 660 670 680 690 700 710 pF1KB4 LWGPALGDLHAGGLPVPRHPCGGALQAAEGGPPHGQARQLHTRPVHDHAGVLACRALPEA CCDS55 LPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGVPVEELFKLLKEGHRMDK 700 710 720 730 740 750 792 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 00:35:16 2016 done: Sat Nov 5 00:35:16 2016 Total Scan time: 4.310 Total Display time: 0.220 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]