FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4477, 1149 aa 1>>>pF1KB4477 1149 - 1149 aa - 1149 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.1572+/-0.000562; mu= -32.9638+/- 0.035 mean_var=837.6173+/-180.140, 0's: 0 Z-trim(121.6): 1225 B-trim: 2236 in 1/60 Lambda= 0.044315 statistics sampled from 36785 (38484) to 36785 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.733), E-opt: 0.2 (0.451), width: 16 Scan time: 17.280 The best scores are: opt bits E(85289) NP_009297 (OMIM: 189980) tyrosine-protein kinase A (1149) 7665 506.7 3.2e-142 NP_005148 (OMIM: 189980) tyrosine-protein kinase A (1130) 7343 486.1 5e-136 NP_001161708 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1161) 3426 235.7 1.2e-60 XP_016856524 (OMIM: 164690) PREDICTED: Abelson tyr (1182) 3389 233.4 6.5e-60 XP_005245145 (OMIM: 164690) PREDICTED: Abelson tyr (1146) 3371 232.2 1.4e-59 NP_005149 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-protein (1167) 3371 232.2 1.4e-59 NP_009298 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-protein (1182) 3371 232.2 1.4e-59 NP_001161710 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1058) 3206 221.6 2e-56 NP_001161711 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1043) 3151 218.1 2.2e-55 NP_001129472 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1064) 3151 218.1 2.3e-55 NP_001161709 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1079) 3151 218.1 2.3e-55 NP_001129473 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote ( 542) 2950 205.0 1e-51 XP_016881449 (OMIM: 164880) PREDICTED: tyrosine-pr ( 543) 1264 97.2 2.8e-19 NP_005424 (OMIM: 164880) tyrosine-protein kinase Y ( 543) 1264 97.2 2.8e-19 XP_011527315 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 536) 1256 96.7 4e-19 NP_005408 (OMIM: 114500,190090,616937) proto-oncog ( 536) 1256 96.7 4e-19 NP_938033 (OMIM: 114500,190090,616937) proto-oncog ( 536) 1256 96.7 4e-19 XP_016866143 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 1249 96.3 5.5e-19 XP_016866141 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 1249 96.3 5.5e-19 NP_002028 (OMIM: 137025) tyrosine-protein kinase F ( 537) 1249 96.3 5.5e-19 XP_016866139 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 1249 96.3 5.5e-19 XP_016866140 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 1249 96.3 5.5e-19 XP_016866142 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 1249 96.3 5.5e-19 NP_005239 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinase F ( 529) 1243 95.9 7.1e-19 XP_006710515 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 529) 1243 95.9 7.1e-19 NP_001036194 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinas ( 529) 1243 95.9 7.1e-19 NP_001036212 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinas ( 529) 1243 95.9 7.1e-19 XP_011539312 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 529) 1243 95.9 7.1e-19 NP_694592 (OMIM: 137025) tyrosine-protein kinase F ( 534) 1239 95.6 8.5e-19 XP_005266947 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 534) 1239 95.6 8.5e-19 NP_001165601 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 525) 1238 95.6 8.8e-19 NP_002101 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinase H ( 526) 1233 95.3 1.1e-18 NP_001165602 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 504) 1231 95.1 1.2e-18 NP_005347 (OMIM: 153390,615758) tyrosine-protein k ( 509) 1231 95.1 1.2e-18 NP_001036236 (OMIM: 153390,615758) tyrosine-protei ( 509) 1231 95.1 1.2e-18 NP_001165604 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 505) 1226 94.8 1.4e-18 NP_001165600 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 505) 1226 94.8 1.4e-18 NP_001165603 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 506) 1226 94.8 1.4e-18 XP_005266937 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1212 93.9 2.7e-18 XP_005266939 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1212 93.9 2.7e-18 NP_002022 (OMIM: 606573) tyrosine-protein kinase F ( 505) 1212 93.9 2.7e-18 XP_011533955 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1212 93.9 2.7e-18 XP_011533956 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1212 93.9 2.7e-18 XP_016866134 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1212 93.9 2.7e-18 XP_005266938 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1212 93.9 2.7e-18 XP_011533957 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1212 93.9 2.7e-18 NP_002341 (OMIM: 165120) tyrosine-protein kinase L ( 512) 1187 92.3 8.2e-18 NP_001104567 (OMIM: 165120) tyrosine-protein kinas ( 491) 1183 92.0 9.5e-18 XP_016868905 (OMIM: 165120) PREDICTED: tyrosine-pr ( 491) 1183 92.0 9.5e-18 XP_011515831 (OMIM: 165120) PREDICTED: tyrosine-pr ( 682) 1180 92.0 1.4e-17 >>NP_009297 (OMIM: 189980) tyrosine-protein kinase ABL1 (1149 aa) initn: 7665 init1: 7665 opt: 7665 Z-score: 2674.3 bits: 506.7 E(85289): 3.2e-142 Smith-Waterman score: 7665; 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NP_001 EQDRMAMTLPRNCQRSKLQLERTVSTSSQPEENVDRANDMLPKKSEESAAPSRERPKAKL 780 790 800 810 820 830 800 810 820 830 840 850 pF1KB4 VTRGTVTPPPRLVKKNEEAADEVFKDIMESSPGSSPPNLTPKPLRRQVTVAPASGLPHKE . ::... : : . ... : : :: :: . ... : .. . . :. NP_001 LPRGATALPLR-TPSGDLAITE--KD----PPGVGVAGVAAAPKGKEKNGGARLGMAGVP 840 850 860 870 880 860 870 880 890 900 pF1KB4 EAGKGSALGTPAAAEPVTPTS---KAGSGAPGGTSKGPAE------ESRVRRHK----HS : :. . .:: : :: ::. :. .. ::. .:. . : :. NP_001 EDGEQPGWPSPAKAAPVLPTTHNHKVPVLISPTLKHTPADVQLIGTDSQGNKFKLLSEHQ 890 900 910 920 930 940 910 920 930 940 950 pF1KB4 SESPGRDKGKLSRLKP--APPPPPAA---SAGKAGGKPSQSPSQEAAGEAVLGAKTKATS : : :: . :.:: ::::::. . . . :.. :. .::... NP_001 VTSSG-DKDRPRRVKPKCAPPPPPVMRLLQHPSICSDPTEEPTALTAGQST--------- 950 960 970 980 990 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB4 LVDAVNSDAAKPSQPGEGLKKPVLPATPKPQSAKPSGTPISPAP-VPSTLPSASSALAGD :. :: :: .: :.: :.: .: :. : : :: ::. :: . 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NP_001 LVDTGHQLLDYCSGYVDCIPQTRNKFAFREAVSKLELSLQELQVSSAAAGV-PGTNPVLN 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1140 pF1KB4 KLLSSVKEISDIVQR .::: :.::::.::: NP_001 NLLSCVQEISDVVQR 1150 1160 >>XP_016856524 (OMIM: 164690) PREDICTED: Abelson tyrosin (1182 aa) initn: 3269 init1: 2813 opt: 3389 Z-score: 1196.6 bits: 233.4 E(85289): 6.5e-60 Smith-Waterman score: 3661; 53.8% identity (72.6% similar) in 1184 aa overlap (24-1149:52-1182) 10 20 30 40 50 pF1KB4 MGQQPGKVLGDQRRPSLPALHFIKGAGKKESSRHGGPHCNVFVEHEALQRPVA .: .::..... . . . .. .:::.:: . 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NP_005 CFTRDRKGGFFSSFMKKR--NAPTPPKRSSSFREMENQPHKKYELTGNFSSVASLQHADG 630 640 650 660 670 680 670 680 690 700 pF1KB4 LAFTPLDTADPAKSPKPSNGA-----------GVPNGALRESGG----SGFRSPHLWKKS ..::: . :: .:. : .:. .:: .:: .:.: ::. NP_005 FSFTPAQQEANLVPPKCYGGSFAQRNLCNDDGGGGGGSGTAGGGWSGITGFFTPRLIKKT 690 700 710 720 730 740 710 720 730 740 750 760 pF1KB4 STLTSSRLATGEEEGGGSSSKRFLRSCSASCVPHGAKDTEWRSVTLPRDLQSTGRQFDSS : . :. .. ..:: : :: :.: . : . . ..::::. : . :.. . NP_005 LGLRA-----GKPTASDDTSKPFPRSNSTSSMSSGLPEQDRMAMTLPRNCQRSKLQLERT 750 760 770 780 790 800 770 780 790 800 810 pF1KB4 TFGGHKSEKPA------LPRKR---AGENR----SDQVTRGTVTPPPRLVKKNEEAADEV . . . :. . ::.: :. .: . . ::... : : . ... : : NP_005 VSTSSQPEENVDRANDMLPKKSEESAAPSRERPKAKLLPRGATALPLR-TPSGDLAITE- 810 820 830 840 850 820 830 840 850 860 870 pF1KB4 FKDIMESSPGSSPPNLTPKPLRRQVTVAPASGLPHKEEAGKGSALGTPAAAEPVTPTS-- :: :: . ... : .. . . :. : :. . .:: : :: ::. 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