FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4505, 1172 aa 1>>>pF1KB4505 1172 - 1172 aa - 1172 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2505+/-0.00137; mu= 19.4679+/- 0.082 mean_var=192.2287+/-35.756, 0's: 0 Z-trim(107.7): 191 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.092505 statistics sampled from 9542 (9762) to 9542 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16 Scan time: 3.670 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34574.1 THBS2 gene_id:7058|Hs108|chr6 (1172) 8548 1155.3 0 CCDS32194.1 THBS1 gene_id:7057|Hs108|chr15 (1170) 5584 759.7 9.1e-219 CCDS12385.1 COMP gene_id:1311|Hs108|chr19 ( 757) 2464 343.0 1.6e-93 CCDS58034.1 THBS3 gene_id:7059|Hs108|chr1 ( 836) 2422 337.5 8.1e-92 CCDS72937.1 THBS3 gene_id:7059|Hs108|chr1 ( 947) 2422 337.6 8.7e-92 CCDS1099.1 THBS3 gene_id:7059|Hs108|chr1 ( 956) 2422 337.6 8.7e-92 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9.1e-219 Smith-Waterman score: 5618; 61.7% identity (83.0% similar) in 1176 aa overlap (1-1171:3-1169) 10 20 30 40 50 pF1KB4 MVWRL-VLLALWVWPSTQAGHQDKDTT-FDLFSISNINRKTIGAKQFRGPDPGVPAYR ..: : ::. . : ... .. :.. ::.: ... :: : . .::::. ::.: CCDS32 MGLAWGLGVLFLMHVCGTNRIPESGGDNSVFDIFELTGAARKGSGRRLVKGPDPSSPAFR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB4 FVRFDYIPPVNADDLSKITKIMRQKEGFFLTAQLKQDGKSRGTLLALEGPGLSQRQFEIV . . :::: : .. .. .: ..::.: :.:.: :.:::::::: : . : .: CCDS32 IEDANLIPPVPDDKFQDLVDAVRAEKGFLLLASLRQMKKTRGTLLALERKDHSGQVFSVV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB4 SNGPADTLDLTYWIDGTRHVVSLEDVGLADSQWKNVTVQVAGETYSLHVGCDLIDSFALD ::: : ::::. ..: .::::.:.. :: .:::..:. : . .:.. :. ... :: CCDS32 SNGKAGTLDLSLTVQGKQHVVSVEEALLATGQWKSITLFVQEDRAQLYIDCEKMENAELD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB4 EPF---YEHLQAEKSRMYVAKGSARESHFRGLLQNVHLVFENSVEDILSKKGCQQGQGAE :. . . : .:. .:::.. .. :.:.::::..:: .. :::: .:::... .. CCDS32 VPIQSVFTRDLASIARLRIAKGGVNDN-FQGVLQNVRFVFGTTPEDILRNKGCSSSTSVL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB4 INAISENTETLRLGPHVTTEYVGPSSERRPEVCERSCEELGNMVQELSGLHVLVNQLSEN .. .:. . .: . :.:.: ... .: ::.::..:: :: ::...:. :... CCDS32 LTL--DNNVVNGSSPAIRTNYIGHKTKDLQAICGISCDELSSMVLELRGLRTIVTTLQDS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB4 LKRVSNDNQFLWELIGGPPKTRNMSACWQDGRFFAENETWVVDSCTTCTCKKFKTICHQI ...:...:. : . . :: :...: . .:: :.::::: : :.. :::... CCDS32 IRKVTEENKELANELRRPP------LCYHNGVQYRNNEEWTVDSCTECHCQNSVTICKKV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB4 TCPPATCASPSFVEGECCPSCLHSVDGEEGWSPWAEWTQCSVTCGSGTQQRGRSCDVTSN .:: :.. . .::::: : : ....:::::.:::.::..::.: :::::::: .: CCDS32 SCPIMPCSNATVPDGECCPRCWPSDSADDGWSPWSEWTSCSTSCGNGIQQRGRSCDSLNN 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB4 TCLGPSIQTRACSLSKCDTRIRQDGGWSHWSPWSSCSVTCGVGNITRIRLCNSPVPQMGG : : :.:::.: ...:: :..::::::::::::::::::: : :::::::::: :::.: CCDS32 RCEGSSVQTRTCHIQECDKRFKQDGGWSHWSPWSSCSVTCGDGVITRIRLCNSPSPQMNG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB4 KNCKGSGRETKACQGAPCPIDGRWSPWSPWSACTVTCAGGIRERTRVCNSPEPQYGGKAC : :.: .::::::. :::.: :.:::::. :.:::.::...:.:.::.: ::.::: : CCDS32 KPCEGEARETKACKKDACPINGGWGPWSPWDICSVTCGGGVQKRSRLCNNPTPQFGGKDC 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB4 VGDVQERQMCNKRSCPVDGCLSNPCFPGAQCSSFPDGSWSCGSCPVGFLGNGTHCEDLDE :::: : :.:::..::.::::::::: :..:.:.:::::.::.:: :. ::: .: :.:: CCDS32 VGDVTENQICNKQDCPIDGCLSNPCFAGVKCTSYPDGSWKCGACPPGYSGNGIQCTDVDE 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB4 CALVPDICFSTSKVPRCVNTQPGFHCLPCPPRYRGNQPVGVGLEAAKTEKQVCEPENPCK : ::: ::. . :: ::.::..:::::::. :.:: : :.: : ..::::.:.::: CCDS32 CKEVPDACFNHNGEHRCENTDPGYNCLPCPPRFTGSQPFGQGVEHATANKQVCKPRNPCT 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB4 DKTHNCHKHAECIYLGHFSDPMYKCECQTGYAGDGLICGEDSDLDGWPNLNLVCATNATY : ::.:.:.:.: ::::.:::::.:::. ::::.:.:::::.::::::: ::::..:::: CCDS32 DGTHDCNKNAKCNYLGHYSDPMYRCECKPGYAGNGIICGEDTDLDGWPNENLVCVANATY 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KB4 HCIKDNCPHLPNSGQEDFDKDGIGDACDDDDDNDGVTDEKDNCQLLFNPRQADYDKDEVG :: :::::.::::::::.:::::::::::::::: . :..::: . .:: : :::.:.:: CCDS32 HCKKDNCPNLPNSGQEDYDKDGIGDACDDDDDNDKIPDDRDNCPFHYNPAQYDYDRDDVG 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KB4 DRCDNCPYVHNPAQIDTDNNGEGDACSVDIDGDDVFNERDNCPYVYNTDQRDTDGDGVGD :::::::: ::: : :::::::::::..::::: ..:::::: ::::.:::::: ::::: CCDS32 DRCDNCPYNHNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQRDTDMDGVGD 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KB4 HCDNCPLVHNPDQTDVDNDLVGDQCDNNEDIDDDGHQNNQDNCPYISNANQADHDRDGQG .:::::: ::::: : :.: .:: ::::.:::.:::::: :::::. ::::::::.::.: CCDS32 QCDNCPLEHNPDQLDSDSDRIGDTCDNNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNANQADHDKDGKG 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KB4 DACDPDDDNDGVPDDRDNCRLVFNPDQEDLDGDGRGDICKDDFDNDNIPDIDDVCPENNA :::: ::::::.:::.:::::: ::::.: ::::::: ::::::.:..:::::.:::: CCDS32 DACDHDDDNDGIPDDKDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDFDHDSVPDIDDICPENVD 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB4 ISETDFRNFQMVPLDPKGTTQIDPNWVIRHQGKELVQTANSDPGIAVGFDEFGSVDFSGT ::::::: :::.:::::::.: :::::.::::::::::.: :::.:::.:::..:::::: CCDS32 ISETDFRRFQMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDPGLAVGYDEFNAVDFSGT 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB4 FYVNTDRDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQTYWEDQPTRAYGYSGVSLKVVNSTTG :..::.::::::::::::::::::::::::::::.::. .:::: ::::.:.:::::::: CCDS32 FFINTERDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTRAQGYSGLSVKVVNSTTG 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB4 TGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRNIGWKDYTAYRWHLTHRPKTGYIRVLVHEGKQV ::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::.:.::::::.:::...:::.. CCDS32 PGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRHIGWKDFTAYRWRLSHRPKTGFIRVVMYEGKKI 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB4 MADSGPIYDQTYAGGRLGLFVFSQEMVYFSDLKYECRDI :::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::: CCDS32 MADSGPIYDKTYAGGRLGLFVFSQEMVFFSDLKYECRDP 1140 1150 1160 1170 >>CCDS12385.1 COMP gene_id:1311|Hs108|chr19 (757 aa) initn: 3056 init1: 2182 opt: 2464 Z-score: 1792.6 bits: 343.0 E(32554): 1.6e-93 Smith-Waterman score: 2632; 54.3% identity (71.3% similar) in 669 aa overlap (549-1171:87-743) 520 530 540 550 560 570 pF1KB4 RVCNSPEPQYGGKACVGDVQERQMCNKRSCPVDGCLSNPCFPGAQCSSFPDGSWSCGSCP :. : . ::::. : . .:. :: :: CCDS12 REITFLKNTVMECDACGMQQSVRTGLPSVRPLLHCAPGFCFPGVACIQTESGA-RCGPCP 60 70 80 90 100 110 580 590 600 610 620 630 pF1KB4 VGFLGNGTHCEDLDECALVPDICFSTSKVPRCVNTQPGFHCLPCPPRYRGNQPVGVGLEA .:: :::.:: :..:: : :: .: ::.::.:::.: ::: : : :::: CCDS12 AGFTGNGSHCTDVNECNAHP--CFP--RV-RCINTSPGFRCEACPPGYSGPTHQGVGLAF 120 130 140 150 160 170 640 650 pF1KB4 AKTEKQVCEPENPCKDKTHNC--------------------------------------- ::..:::: : :. ::: CCDS12 AKANKQVCTDINECETGQHNCVPNSVCINTRGSFQCGPCQPGFVGDQASGCQRRAQRFCP 180 190 200 210 220 230 660 670 680 690 700 710 pF1KB4 -------HKHAECIYLGHFSDPMYKCECQTGYAGDGLICGEDSDLDGWPNLNLVCATNAT :.::.:. : .: : .:.::.:..::.:.::::.:. .: : CCDS12 DGSPSECHEHADCVLE---RDGSRSCVCAVGWAGNGILCGRDTDLDGFPDEKLRCPE--- 240 250 260 270 280 720 730 740 750 760 770 pF1KB4 YHCIKDNCPHLPNSGQEDFDKDGIGDACDDDDDNDGVTDEKDNCQLLFNPRQADYDKDEV .: :::: .::::::: :.:::::::: : :.::: .::::: :. :: : . :.:. CCDS12 RQCRKDNCVTVPNSGQEDVDRDGIGDACDPDADGDGVPNEKDNCPLVRNPDQRNTDEDKW 290 300 310 320 330 340 780 790 800 810 820 830 pF1KB4 GDRCDNCPYVHNPAQIDTDNNGEGDACSVDIDGDDVFNERDNCPYVYNTDQRDTDGDGVG :: :::: .: : :::..:.::::. ::::: . :. :::: : :.::.:.::::.: CCDS12 GDACDNCRSQKNDDQKDTDQDGRGDACDDDIDGDRIRNQADNCPRVPNSDQKDSDGDGIG 350 360 370 380 390 400 840 850 860 870 880 890 pF1KB4 DHCDNCPLVHNPDQTDVDNDLVGDQCDNNEDIDDDGHQNNQDNCPYISNANQADHDRDGQ : ::::: ::::.:::.:.::: ::...: : ::::...:::: . :. : : :.::: CCDS12 DACDNCPQKSNPDQADVDHDFVGDACDSDQDQDGDGHQDSRDNCPTVPNSAQEDSDHDGQ 410 420 430 440 450 460 900 910 920 930 940 950 pF1KB4 GDACDPDDDNDGVPDDRDNCRLVFNPDQEDLDGDGRGDICKDDFDNDNIPDIDDVCPENN ::::: :::::::::.::::::: :: ::: : :: ::.:.:::: :.. : :::::: CCDS12 GDACDDDDDNDGVPDSRDNCRLVPNPGQEDADRDGVGDVCQDDFDADKVVDKIDVCPENA 470 480 490 500 510 520 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB4 AISETDFRNFQMVPLDPKGTTQIDPNWVIRHQGKELVQTANSDPGIAVGFDEFGSVDFSG .. :::: :: : :::.: .:::::::. .::.:.::: :::::.:::. :..::: : CCDS12 EVTLTDFRAFQTVVLDPEGDAQIDPNWVVLNQGREIVQTMNSDPGLAVGYTAFNGVDFEG 530 540 550 560 570 580 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB4 TFYVNTDRDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQTYWEDQPTRAYGYSGVSLKVVNSTT ::.::: :::::::.::::.:: ::::::::. ::::. .: :: . :..::.:.:.: CCDS12 TFHVNTVTDDDYAGFIFGYQDSSSFYVVMWKQMEQTYWQANPFRAVAEPGIQLKAVKSST 590 600 610 620 630 640 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB4 GTGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRNIGWKDYTAYRWHLTHRPKTGYIRVLVHEGKQ : ::.:::::::::.: .::: ::.::::.:::: .::: : :::..::::: .:: . CCDS12 GPGEQLRNALWHTGDTESQVRLLWKDPRNVGWKDKKSYRWFLQHRPQVGYIRVRFYEGPE 650 660 670 680 690 700 1140 1150 1160 1170 pF1KB4 VMADSGPIYDQTYAGGRLGLFVFSQEMVYFSDLKYECRDI ..:::. . : :. :::::.: :::: . ...:.:.: : CCDS12 LVADSNVVLDTTMRGGRLGVFCFSQENIIWANLRYRCNDTIPEDYETHQLRQA 710 720 730 740 750 >>CCDS58034.1 THBS3 gene_id:7059|Hs108|chr1 (836 aa) initn: 2137 init1: 1243 opt: 2422 Z-score: 1761.9 bits: 337.5 E(32554): 8.1e-92 Smith-Waterman score: 2562; 52.2% identity (69.9% similar) in 688 aa overlap (537-1171:143-818) 510 520 530 540 550 560 pF1KB4 TVTCAGGIRERTRVCNSPEPQYGGKACVGDVQERQMCN---KRSCPVDGCLSNPCFPGAQ ..: :.:. .:: : :::: :.. CCDS58 TQLTLFNQILVELRDDIRDQVKEMSLIRNTIMECQVCGFHEQRS----HCSPNPCFRGVD 120 130 140 150 160 570 580 590 600 610 620 pF1KB4 CSS-FPDGSWSCGSCPVGFLGNGTHCEDLDECALVPDICFSTSKVPRCVNTQPGFHCLPC : . .. :: :: :. :::::: :..::: . : :: :. :.::.::::: : CCDS58 CMEVYEYPGYRCGPCPPGLQGNGTHCSDINECAHA-DPCFPGSS---CINTMPGFHCEAC 170 180 190 200 210 220 630 640 pF1KB4 PPRYRGNQPVGVGLEAAKTEKQVCE----------------------------------- : :.:.: :::.. :.. ::::. CCDS58 PRGYKGTQVSGVGIDYARASKQVCNDIDECNDGNNGGCDPNSICTNTVGSFKCGPCRLGF 230 240 250 260 270 280 650 660 670 680 690 pF1KB4 ---------PENPCKDKTHN-CHKHAECIYLGHFSDPMYKCECQTGYAGDGLICGEDSDL : :.. .:. :: ::.:.. . .:.:..:.::.: .:: :.:. CCDS58 LGNQSQGCLPARTCHSPAHSPCHIHAHCLFE---RNGAVSCQCNVGWAGNGNVCGTDTDI 290 300 310 320 330 340 700 710 720 730 740 750 pF1KB4 DGWPNLNLVCATNATYHCIKDNCPHLPNSGQEDFDKDGIGDACDDDDDNDGVTDEKDNCQ ::.:. : : : . :: .::: ::::::: :.::.:: :::: :.::. . .:::. CCDS58 DGYPDQALPCMDN-NKHCKQDNCLLTPNSGQEDADNDGVGDQCDDDADGDGIKNVEDNCR 350 360 370 380 390 400 760 770 780 790 800 810 pF1KB4 LLFNPRQADYDKDEVGDRCDNCPYVHNPAQIDTDNNGEGDACSVDIDGDDVFNERDNCPY :. : : . : : :: ::::: : : : :::.:::::::. :.::: . : :::: CCDS58 LFPNKDQQNSDTDSFGDACDNCPNVPNNDQKDTDGNGEGDACDNDVDGDGIPNGLDNCPK 410 420 430 440 450 460 820 830 840 850 860 870 pF1KB4 VYNTDQRDTDGDGVGDHCDNCPLVHNPDQTDVDNDLVGDQCDNNEDIDDDGHQNNQDNCP : : : : : ::::: ::.:: . :: :::.:.::::: ::.::: : ::::...:::: CCDS58 VPNPLQTDRDEDGVGDACDSCPEMSNPTQTDADSDLVGDVCDTNEDSDGDGHQDTKDNCP 470 480 490 500 510 520 880 890 900 910 920 930 pF1KB4 YISNANQADHDRDGQGDACDPDDDNDGVPD----DRDNCRLVFNPDQEDLDGDGRGDICK . :..: : : :: :: :: ::::::.:: :::::: ::.:.: ::.: ::.:. CCDS58 QLPNSSQLDSDNDGLGDECDGDDDNDGIPDYVPPGPDNCRLVPNPNQKDSDGNGVGDVCE 530 540 550 560 570 580 940 950 960 970 980 990 pF1KB4 DDFDNDNIPDIDDVCPENNAISETDFRNFQMVPLDPKGTTQIDPNWVIRHQGKELVQTAN :::::: . : :::::. .. :::: .: : :::.: .:::::::. .:: :.::: : CCDS58 DDFDNDAVVDPLDVCPESAEVTLTDFRAYQTVVLDPEGDAQIDPNWVVLNQGMEIVQTMN 590 600 610 620 630 640 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB4 SDPGIAVGFDEFGSVDFSGTFYVNTDRDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQTYWEDQ ::::.:::. :..::: :::.::: :::::::.:.::.:.:::::::::. ::::. CCDS58 SDPGLAVGYTAFNGVDFEGTFHVNTVTDDDYAGFLFSYQDSGRFYVVMWKQTEQTYWQAT 650 660 670 680 690 700 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB4 PTRAYGYSGVSLKVVNSTTGTGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRNIGWKDYTAYRWH : :: . :..::.:.:..: ::::::::::::.:: ::: :: ::::.::.: :.:::. CCDS58 PFRAVAQPGLQLKAVTSVSGPGEHLRNALWHTGHTPDQVRLLWTDPRNVGWRDKTSYRWQ 710 720 730 740 750 760 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB4 LTHRPKTGYIRVLVHEGKQVMADSGPIYDQTYAGGRLGLFVFSQEMVYFSDLKYECRDI : :::..::::: ..:: :..:::: : : .. :::::.: :::: . .:.:.:.: : CCDS58 LLHRPQVGYIRVKLYEGPQLVADSGVIIDTSMRGGRLGVFCFSQENIIWSNLQYRCNDTV 770 780 790 800 810 820 CCDS58 PEDFEPFRRQLLQGRV 830 >>CCDS72937.1 THBS3 gene_id:7059|Hs108|chr1 (947 aa) initn: 2137 init1: 1243 opt: 2422 Z-score: 1761.3 bits: 337.6 E(32554): 8.7e-92 Smith-Waterman score: 2562; 52.2% identity (69.9% similar) in 688 aa overlap (537-1171:254-929) 510 520 530 540 550 560 pF1KB4 TVTCAGGIRERTRVCNSPEPQYGGKACVGDVQERQMCN---KRSCPVDGCLSNPCFPGAQ ..: :.:. .:: : :::: :.. CCDS72 TQLTLFNQILVELRDDIRDQVKEMSLIRNTIMECQVCGFHEQRS----HCSPNPCFRGVD 230 240 250 260 270 570 580 590 600 610 620 pF1KB4 CSS-FPDGSWSCGSCPVGFLGNGTHCEDLDECALVPDICFSTSKVPRCVNTQPGFHCLPC : . .. :: :: :. :::::: :..::: . : :: :. :.::.::::: : CCDS72 CMEVYEYPGYRCGPCPPGLQGNGTHCSDINECAHA-DPCFPGSS---CINTMPGFHCEAC 280 290 300 310 320 330 630 640 pF1KB4 PPRYRGNQPVGVGLEAAKTEKQVCE----------------------------------- : :.:.: :::.. :.. ::::. CCDS72 PRGYKGTQVSGVGIDYARASKQVCNDIDECNDGNNGGCDPNSICTNTVGSFKCGPCRLGF 340 350 360 370 380 390 650 660 670 680 690 pF1KB4 ---------PENPCKDKTHN-CHKHAECIYLGHFSDPMYKCECQTGYAGDGLICGEDSDL : :.. .:. :: ::.:.. . .:.:..:.::.: .:: :.:. CCDS72 LGNQSQGCLPARTCHSPAHSPCHIHAHCLFE---RNGAVSCQCNVGWAGNGNVCGTDTDI 400 410 420 430 440 450 700 710 720 730 740 750 pF1KB4 DGWPNLNLVCATNATYHCIKDNCPHLPNSGQEDFDKDGIGDACDDDDDNDGVTDEKDNCQ ::.:. : : : . :: .::: ::::::: :.::.:: :::: :.::. . .:::. CCDS72 DGYPDQALPCMDN-NKHCKQDNCLLTPNSGQEDADNDGVGDQCDDDADGDGIKNVEDNCR 460 470 480 490 500 510 760 770 780 790 800 810 pF1KB4 LLFNPRQADYDKDEVGDRCDNCPYVHNPAQIDTDNNGEGDACSVDIDGDDVFNERDNCPY :. : : . : : :: ::::: : : : :::.:::::::. :.::: . : :::: CCDS72 LFPNKDQQNSDTDSFGDACDNCPNVPNNDQKDTDGNGEGDACDNDVDGDGIPNGLDNCPK 520 530 540 550 560 570 820 830 840 850 860 870 pF1KB4 VYNTDQRDTDGDGVGDHCDNCPLVHNPDQTDVDNDLVGDQCDNNEDIDDDGHQNNQDNCP : : : : : ::::: ::.:: . :: :::.:.::::: ::.::: : ::::...:::: CCDS72 VPNPLQTDRDEDGVGDACDSCPEMSNPTQTDADSDLVGDVCDTNEDSDGDGHQDTKDNCP 580 590 600 610 620 630 880 890 900 910 920 930 pF1KB4 YISNANQADHDRDGQGDACDPDDDNDGVPD----DRDNCRLVFNPDQEDLDGDGRGDICK . :..: : : :: :: :: ::::::.:: :::::: ::.:.: ::.: ::.:. CCDS72 QLPNSSQLDSDNDGLGDECDGDDDNDGIPDYVPPGPDNCRLVPNPNQKDSDGNGVGDVCE 640 650 660 670 680 690 940 950 960 970 980 990 pF1KB4 DDFDNDNIPDIDDVCPENNAISETDFRNFQMVPLDPKGTTQIDPNWVIRHQGKELVQTAN :::::: . : :::::. .. :::: .: : :::.: .:::::::. .:: :.::: : CCDS72 DDFDNDAVVDPLDVCPESAEVTLTDFRAYQTVVLDPEGDAQIDPNWVVLNQGMEIVQTMN 700 710 720 730 740 750 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB4 SDPGIAVGFDEFGSVDFSGTFYVNTDRDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQTYWEDQ ::::.:::. :..::: :::.::: :::::::.:.::.:.:::::::::. ::::. CCDS72 SDPGLAVGYTAFNGVDFEGTFHVNTVTDDDYAGFLFSYQDSGRFYVVMWKQTEQTYWQAT 760 770 780 790 800 810 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB4 PTRAYGYSGVSLKVVNSTTGTGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRNIGWKDYTAYRWH : :: . :..::.:.:..: ::::::::::::.:: ::: :: ::::.::.: :.:::. CCDS72 PFRAVAQPGLQLKAVTSVSGPGEHLRNALWHTGHTPDQVRLLWTDPRNVGWRDKTSYRWQ 820 830 840 850 860 870 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB4 LTHRPKTGYIRVLVHEGKQVMADSGPIYDQTYAGGRLGLFVFSQEMVYFSDLKYECRDI : :::..::::: ..:: :..:::: : : .. :::::.: :::: . .:.:.:.: : CCDS72 LLHRPQVGYIRVKLYEGPQLVADSGVIIDTSMRGGRLGVFCFSQENIIWSNLQYRCNDTV 880 890 900 910 920 930 CCDS72 PEDFEPFRRQLLQGRV 940 >>CCDS1099.1 THBS3 gene_id:7059|Hs108|chr1 (956 aa) initn: 2137 init1: 1243 opt: 2422 Z-score: 1761.3 bits: 337.6 E(32554): 8.7e-92 Smith-Waterman score: 2562; 52.2% identity (69.9% similar) in 688 aa overlap (537-1171:263-938) 510 520 530 540 550 560 pF1KB4 TVTCAGGIRERTRVCNSPEPQYGGKACVGDVQERQMCN---KRSCPVDGCLSNPCFPGAQ ..: :.:. .:: : :::: :.. CCDS10 TQLTLFNQILVELRDDIRDQVKEMSLIRNTIMECQVCGFHEQRS----HCSPNPCFRGVD 240 250 260 270 280 570 580 590 600 610 620 pF1KB4 CSS-FPDGSWSCGSCPVGFLGNGTHCEDLDECALVPDICFSTSKVPRCVNTQPGFHCLPC : . .. :: :: :. :::::: :..::: . : :: :. :.::.::::: : CCDS10 CMEVYEYPGYRCGPCPPGLQGNGTHCSDINECAHA-DPCFPGSS---CINTMPGFHCEAC 290 300 310 320 330 340 630 640 pF1KB4 PPRYRGNQPVGVGLEAAKTEKQVCE----------------------------------- : :.:.: :::.. :.. ::::. CCDS10 PRGYKGTQVSGVGIDYARASKQVCNDIDECNDGNNGGCDPNSICTNTVGSFKCGPCRLGF 350 360 370 380 390 400 650 660 670 680 690 pF1KB4 ---------PENPCKDKTHN-CHKHAECIYLGHFSDPMYKCECQTGYAGDGLICGEDSDL : :.. .:. :: ::.:.. . .:.:..:.::.: .:: :.:. CCDS10 LGNQSQGCLPARTCHSPAHSPCHIHAHCLFE---RNGAVSCQCNVGWAGNGNVCGTDTDI 410 420 430 440 450 460 700 710 720 730 740 750 pF1KB4 DGWPNLNLVCATNATYHCIKDNCPHLPNSGQEDFDKDGIGDACDDDDDNDGVTDEKDNCQ ::.:. : : : . :: .::: ::::::: :.::.:: :::: :.::. . .:::. 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CCDS40 LTDFRAYQTVVLDPEGDAQIDPNWVVLNQGMEIVQTMNSDPGLAVGYTAFNGVDFEGTFH 730 740 750 760 770 780 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB4 VNTDRDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQTYWEDQPTRAYGYSGVSLKVVNSTTGTG :::. :::::::.::::.:: ::::::::. ::::. : :: . :..::.:.: :: : CCDS40 VNTQTDDDYAGFIFGYQDSSSFYVVMWKQTEQTYWQATPFRAVAEPGIQLKAVKSKTGPG 790 800 810 820 830 840 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB4 EHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRNIGWKDYTAYRWHLTHRPKTGYIRVLVHEGKQVMA :::::.:::::.: ::: ::.: ::.:::: ..::: : :::..::::: .::....: CCDS40 EHLRNSLWHTGDTSDQVRLLWKDSRNVGWKDKVSYRWFLQHRPQVGYIRVRFYEGSELVA 850 860 870 880 890 900 1140 1150 1160 1170 pF1KB4 DSGPIYDQTYAGGRLGLFVFSQEMVYFSDLKYECRDI ::: : :. :::::.: :::: . .:.:::.: : CCDS40 DSGVTIDTTMRGGRLGVFCFSQENIIWSNLKYRCNDTIPEDFQEFQTQNFDRFDN 910 920 930 940 950 960 >>CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8 (1584 aa) initn: 367 init1: 233 opt: 610 Z-score: 452.1 bits: 96.1 E(32554): 7.3e-19 Smith-Waterman score: 610; 33.6% identity (56.2% similar) in 336 aa overlap (266-593:299-620) 240 250 260 270 280 290 pF1KB4 AISENTETLRLGPHVTTEYVGPSSERRPEVCERSCEELGNMVQELSGLHVLVNQLSENLK :: :: . .: : ... :..:. CCDS64 LWGECTRDCGGGLQTRTRTCLPAPGVEGGGCEGVLEEGRQCNREACGPAGRTSSRSQSLR 270 280 290 300 310 320 300 310 320 330 340 350 pF1KB4 RVSNDNQFLWELIGGPPKTRNMSACWQDGRFFAENET-WVVDSCTTCTCKKFKT-ICHQI :.: . :: : . .. : : : ::. . : : : : . .: .: . CCDS64 --STDARRREEL-GDELQQFGFPAP-QTGDPAAEEWSPWSVCSSTCGEGWQTRTRFC--V 330 340 350 360 370 380 360 370 380 390 400 pF1KB4 TCPPAT-CASPSFVEGECCPSCLHSVDGEEGWSPWAEWTQCSVTCGSGTQQRGRSC---D . .: :..: . : : . : : .:. :. :. :: ::: : ..: :.: . CCDS64 SSSYSTQCSGPLREQRLCNNSAVCPVHG--AWDEWSPWSLCSSTCGRGFRDRTRTCRPPQ 390 400 410 420 430 440 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 VTSNTCLGPSIQTRACSLSKCDTRIRQDGGWSHWSPWSSCSVTCGVGNITRIRLCNSPVP .: : :: ::. :... : : ::.:..:: ::.::..:. : : : ::.: CCDS64 FGGNPCEGPEKQTKFCNIALCPGRAV-DGNWNEWSSWSACSASCSQGRQQRTRECNGP-- 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 QMGGKNCKGSGRETKACQGAPCPIDGRWSPWSPWSACTVTCAGGIRERTRVCNSPEPQYG ..:: .:.: ::. : ::.::.:. :. :..:.:::..: ..: :::..: .: CCDS64 SYGGAECQGHWVETRDCFLQQCPVDGKWQAWASWGSCSVTCGAGSQRRERVCSGPF--FG 500 510 520 530 540 550 530 540 550 560 570 580 pF1KB4 GKACVGDVQERQMCNKRSCPVDGCLSNPCFPGAQC-SSFPDGSWSCGSCPVGFLG-NGTH : :: : .: ..:. . :: . . :: . : : . :: . : . CCDS64 GAACQGPQDEYRQCGTQRCPEPHEICDEDNFGAVIWKETPAGEVAAVRCPRNATGLILRR 560 570 580 590 600 610 590 600 610 620 630 640 pF1KB4 CEDLDECALVPDICFSTSKVPRCVNTQPGFHCLPCPPRYRGNQPVGVGLEAAKTEKQVCE :: ::: CCDS64 CE-LDEEGIAYWEPPTYIRCVSIDYRNIQMMTREHLAKAQRGLPGEGVSEVIQTLVEISQ 620 630 640 650 660 670 >>CCDS4968.1 ADGRB3 gene_id:577|Hs108|chr6 (1522 aa) initn: 308 init1: 236 opt: 587 Z-score: 435.7 bits: 93.0 E(32554): 6e-18 Smith-Waterman score: 587; 39.9% identity (61.0% similar) in 218 aa overlap (380-593:290-497) 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 CHQITCPPATCASPSFVEGECCPSCLHSVDGEEGWSPWAEWTQCSVTCGSGTQQRGRSCD :: : :..:. ::::::.:.: : :.: CCDS49 HTIKSQRPRSVHEKRVPQEQADAAKFMAQTGESGVEEWSQWSTCSVTCGQGSQVRTRTCV 260 270 280 290 300 310 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 VTSNT-CLGPSIQTRACSLSK-CDTRIRQDGGWSHWSPWSSCSVTCGVGNITRIRLCNSP .: : :: ..:.:. . : .. : : .::::: :: ::: :. :: : : .: CCDS49 SPYGTHCSGPLRESRVCNNTALCPVH----GVWEEWSPWSLCSFTCGRGQRTRTRSC-TP 320 330 340 350 360 370 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 VPQMGGKNCKGSGRETKACQGAPCPIDGRWSPWSPWSACTVTCAGGIRERTRVCNSPEPQ ::.::. :.: . : :. : ::.::.:. :: :: :.:::..: ..:.: :.. CCDS49 -PQYGGRPCEGPETHHKPCNIALCPVDGQWQEWSSWSQCSVTCSNGTQQRSRQCTAAA-- 380 390 400 410 420 430 530 540 550 560 570 580 pF1KB4 YGGKACVGDVQERQMCNKRSCPVDGCLSNPCFPGAQCSSFPDGSWS--CGSCPVGFLGNG .::. : : : . : . : ..: : . ::. ::.: .: : . .: CCDS49 HGGSECRGPWAESRECYNPECTANGQW-NQWGHWSGCSKSCDGGWERRIRTCQ-GAVITG 440 450 460 470 480 590 600 610 620 630 640 pF1KB4 THCEDLDECALVPDICFSTSKVPRCVNTQPGFHCLPCPPRYRGNQPVGVGLEAAKTEKQV .:: : CCDS49 QQCEGTGEEVRRCNEQRCPAPYEICPEDYLMSMVWKRTPAGDLAFNQCPLNATGTTSRRC 490 500 510 520 530 540 1172 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 21:35:47 2016 done: Thu Nov 3 21:35:47 2016 Total Scan time: 3.670 Total Display time: 0.310 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]