Result of FASTA (ccds) for pF1KB4514
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4514, 1620 aa
  1>>>pF1KB4514 1620 - 1620 aa - 1620 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1133+/-0.00109; mu= 7.6797+/- 0.065
 mean_var=352.1804+/-81.869, 0's: 0 Z-trim(111.9): 361  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.068343
 statistics sampled from 12347 (12790) to 12347 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.393), width:  16
 Scan time:  5.830

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2             (1620) 11178 1118.2       0
CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15           ( 864) 2626 274.7 9.4e-73
CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15           ( 803) 2142 226.9 2.1e-58
CCDS45237.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15           ( 734) 1510 164.6 1.1e-39
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6            (2347) 1024 117.3 6.2e-25
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15         (1366)  939 108.6 1.5e-22
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15         (1367)  939 108.6 1.5e-22
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1           (1297)  910 105.7   1e-21
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19          (1370)  899 104.7 2.3e-21
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19          (1382)  899 104.7 2.3e-21
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9          ( 822)  793 93.9 2.3e-18
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9           ( 838)  793 93.9 2.3e-18
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1          ( 760)  792 93.8 2.4e-18
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1          ( 790)  792 93.8 2.4e-18
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1           ( 796)  792 93.8 2.4e-18
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15         ( 817)  781 92.7 5.2e-18
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15         ( 825)  781 92.7 5.2e-18
CCDS12574.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19            ( 885)  764 91.1 1.8e-17
CCDS62677.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19            ( 626)  758 90.3 2.1e-17
CCDS12575.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19            ( 894)  758 90.5 2.7e-17
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1             ( 937)  726 87.4 2.4e-16
CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            (1014)  722 87.0 3.4e-16
CCDS4886.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            ( 940)  715 86.3 5.2e-16
CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            (1030)  715 86.4 5.5e-16
CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            (1070)  715 86.4 5.6e-16
CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6           (1078)  715 86.4 5.6e-16
CCDS2094.1 MERTK gene_id:10461|Hs108|chr2          ( 999)  710 85.8 7.6e-16
CCDS81866.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15         ( 845)  692 84.0 2.3e-15
CCDS10080.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15         ( 890)  692 84.0 2.4e-15
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3          ( 984)  672 82.1   1e-14
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4           ( 694)  668 81.5 1.1e-14
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4           ( 806)  668 81.6 1.2e-14
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4          ( 808)  668 81.6 1.2e-14
CCDS78389.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9            ( 976)  662 81.1   2e-14
CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3          (1294)  664 81.5 2.1e-14
CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3          (1351)  664 81.5 2.1e-14
CCDS2807.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3           (1400)  664 81.5 2.2e-14
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5          ( 734)  656 80.4 2.5e-14
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5           ( 762)  656 80.4 2.6e-14
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5           ( 802)  656 80.4 2.6e-14
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 731)  655 80.3 2.7e-14
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 733)  655 80.3 2.7e-14
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 812)  655 80.3 2.9e-14
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 820)  655 80.3 2.9e-14
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 820)  655 80.3 2.9e-14
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8           ( 822)  655 80.3 2.9e-14
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 853)  655 80.3 2.9e-14
CCDS75825.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9            (1081)  651 80.1 4.5e-14
CCDS6519.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9             (1124)  651 80.1 4.6e-14
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1            ( 986)  642 79.1 7.8e-14


>>CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2                  (1620 aa)
 initn: 11178 init1: 11178 opt: 11178  Z-score: 5973.7  bits: 1118.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 11178; 99.8% identity (100.0% similar) in 1620 aa overlap (1-1620:1-1620)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MGAIGLLWLLPLLLSTAAVGSGMGTGQRAGSPAAGPPLQPREPLSYSRLQRKSLAVDFVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MGAIGLLWLLPLLLSTAAVGSGMGTGQRAGSPAAGPPLQPREPLSYSRLQRKSLAVDFVV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 PSLFRVYARDLLLPPSSSELKAGRPEARGSLALDCAPLLRLLGPAPGVSWTAGSPAPAEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PSLFRVYARDLLLPPSSSELKAGRPEARGSLALDCAPLLRLLGPAPGVSWTAGSPAPAEA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 RTLSRVLKGGSVRKLRRAKQLVLELGEEAILEGCVGPPGEAAVGLLQFNLSELFSWWIRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RTLSRVLKGGSVRKLRRAKQLVLELGEEAILEGCVGPPGEAAVGLLQFNLSELFSWWIRQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 GEGRLRIRLMPEKKASEVGREGRLSAAIRASQPRLLFQIFGTGHSSLESPTNMPSPSPDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GEGRLRIRLMPEKKASEVGREGRLSAAIRASQPRLLFQIFGTGHSSLESPTNMPSPSPDY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 FTWNLTWIMKDSFPFLSHRSRYGLECSFDFPCELEYSPPLHDLRNQSWSWRRIPSEEASQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FTWNLTWIMKDSFPFLSHRSRYGLECSFDFPCELEYSPPLHDLRNQSWSWRRIPSEEASQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 MDLLDGPGAERSKEMPRGSFLLLNTSADSKHTILSPWMRSSSEHCTLAVSVHRHLQPSGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MDLLDGPGAERSKEMPRGSFLLLNTSADSKHTILSPWMRSSSEHCTLAVSVHRHLQPSGR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 YIAQLLPHNEAAREILLMPTPGKHGWTVLQGRIGRPDNPFRVALEYISSGNRSLSAVDFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YIAQLLPHNEAAREILLMPTPGKHGWTVLQGRIGRPDNPFRVALEYISSGNRSLSAVDFF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 ALKNCSEGTSPGSKMALQSSFTCWNGTVLQLGQACDFHQDCAQGEDESQMCRKLPVGFYC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ALKNCSEGTSPGSKMALQSSFTCWNGTVLQLGQACDFHQDCAQGEDESQMCRKLPVGFYC
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 NFEDGFCGWTQGTLSPHTPQWQVRTLKDARFQDHQDHALLLSTTDVPASESATVTSATFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NFEDGFCGWTQGTLSPHTPQWQVRTLKDARFQDHQDHALLLSTTDVPASESATVTSATFP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 APIKSSPCELRMSWLIRGVLRGNVSLVLVENKTGKEQGRMVWHVAAYEGLSLWQWMVLPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 APIKSSPCELRMSWLIRGVLRGNVSLVLVENKTGKEQGRMVWHVAAYEGLSLWQWMVLPL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 LDVSDRFWLQMVAWWGQGSRAIVAFDNISISLDCYLTISGEDKILQNTAPKSRNLFERNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LDVSDRFWLQMVAWWGQGSRAIVAFDNISISLDCYLTISGEDKILQNTAPKSRNLFERNP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 NKELKPGENSPRQTPIFDPTVHWLFTTCGASGPHGPTQAQCNNAYQNSNLSVEVGSEGPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NKELKPGENSPRQTPIFDPTVHWLFTTCGASGPHGPTQAQCNNAYQNSNLSVEVGSEGPL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 KGIQIWKVPATDTYSISGYGAAGGKGGKNTMMRSHGVSVLGIFNLEKDDMLYILVGQQGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KGIQIWKVPATDTYSISGYGAAGGKGGKNTMMRSHGVSVLGIFNLEKDDMLYILVGQQGE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 DACPSTNQLIQKVCIGENNVIEEEIRVNRSVHEWAGGGGGGGGATYVFKMKDGVPVPLII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DACPSTNQLIQKVCIGENNVIEEEIRVNRSVHEWAGGGGGGGGATYVFKMKDGVPVPLII
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 AAGGGGRAYGAKTDTFHPERLENNSSVLGLNGNSGAAGGGGGWNDNTSLLWAGKSLQEGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AAGGGGRAYGAKTDTFHPERLENNSSVLGLNGNSGAAGGGGGWNDNTSLLWAGKSLQEGA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB4 TGGHSCPQAMKKWGWETRGGFGGGGGGCSSGGGGGGYIGGNAASNNDPEMDGEDGVSFIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TGGHSCPQAMKKWGWETRGGFGGGGGGCSSGGGGGGYIGGNAASNNDPEMDGEDGVSFIS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB4 PLGILYTPALKVMEGHGEVNIKHYLNCSHCEVDECHMDPESHKVICFCDHGTVLAEDGVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PLGILYTPALKVMEGHGEVNIKHYLNCSHCEVDECHMDPESHKVICFCDHGTVLAEDGVS
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB4 CIVSPTPEPHLPLSLILSVVTSALVAALVLAFSGIMIVYRRKHQELQAMQMELQSPEYKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CIVSPTPEPHLPLSLILSVVTSALVAALVLAFSGIMIVYRRKHQELQAMQMELQSPEYKL
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB4 SKLRTSTIMTDYNPNYCFAGKTSSISDLKEVPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SKLRTSTIMTDYNPNYCFAGKTSSISDLKEVPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPN
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DPSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GGDLKSFLRETRPRPSQPSSLAMLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GPGRVAKIGDFGMARDIYRASYYRKGGCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLW
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGRMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIIL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ERIEYCTQDPDVINTALPIEYGPLVEEEEKVPVRPKDPEGVPPLLVSQQAKREEERSPAA
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       ::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS33 PPPLPTTSSGKAAKKPTAAEISVRVPRGPAVEGGHVNMAFSQSNPPSELHKVHGSRNKPT
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       ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLWNPTYGSWFTEKPTKKNNPIAKKEPHDRGNLGLEGSCTVPPNVATGRLPGASLLLEPS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLTANMKEVPLFRLRHFPCGNVNYGYQQQGLPLEAATAPGAGHYEDTILKSKNSMNQPGP
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>>CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15                (864 aa)
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Smith-Waterman score: 3136; 55.5% identity (76.0% similar) in 859 aa overlap (608-1450:4-843)

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CCDS10                            MGCWGQLLVWFGAAGAILCSSPG---SQETFLR
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pF1KB4 ISGEDKILQNTAPKSRNLFERNPNKELKPGENSPRQTPIFDPTVHWLFTTCGASGPHGPT
        :     :  ..:. :.     : . :.:.  :: ..:  . .  :::.:::::: ::::
CCDS10 SSP----LPLASPSPRDPKVSAPPSILEPA--SPLNSPGTEGS--WLFSTCGASGRHGPT
                   40        50          60          70        80  

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pF1KB4 QAQCNNAYQNSNLSVEVGSEGPLKGIQIWKVPATDTYSISGYGAAGGKGGKNTMMRSHGV
       :.::..:: .... : ::. : :.:.:.:.::.   : ::.::::::::.:: . :.:::
CCDS10 QTQCDGAYAGTSVVVTVGAAGQLRGVQLWRVPGPGQYLISAYGAAGGKGAKNHLSRAHGV
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pF1KB4 SVLGIFNLEKDDMLYILVGQQGEDACPSTNQLIQKVCIGENNVIEEEIRVNRS-----VH
        : .::.:   . ::::::::::::::. .   : ::.::. ..::.  .. :      .
CCDS10 FVSAIFSLGLGESLYILVGQQGEDACPGGSPESQLVCLGESRAVEEHAAMDGSEGVPGSR
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pF1KB4 EWAGGGGGGGGATYVFKMKDGVPVPLIIAAGGGGRAYGAKTDTFH----PERLENNSSVL
       .:::::::::::::::... :   ::..:::::::::    :  .    ::.::: : . 
CCDS10 RWAGGGGGGGGATYVFRVRAGELEPLLVAAGGGGRAYLRPRDRGRTQASPEKLENRSEAP
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pF1KB4 GLNGNSGAAGGGGGWNDNTSLLWAGKSLQEGATGGHSCPQAMKKWGWETRGGFGGGGGGC
       : .: .:::::::::.. .    ::.:::::: ::..: .:    :: . ::::::::.:
CCDS10 GSGGRGGAAGGGGGWTSRAPSPQAGRSLQEGAEGGQGCSEAWATLGWAAAGGFGGGGGAC
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pF1KB4 SSGGGGGGYIGGNAASNNDPEMDGEDGVSFISPLGILYTPALKVMEGHGEVNIKHYLNCS
       ..::::::: ::.:. ...   ::::::::: : . :.   : : :.::::.:...::::
CCDS10 TAGGGGGGYRGGDASETDNLWADGEDGVSFIHPSSELFLQPLAVTENHGEVEIRRHLNCS
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pF1KB4 HCEVDECHMDPESHKVICFCDHGTVLAEDGVSCIVSPTPEPHLPLSLILSVVTSALVAAL
       :: . .:. . : . . :.: .:  :: :.:.:.     .:  :: :...::... .. :
CCDS10 HCPLRDCQWQAELQLAECLCPEGMELAVDNVTCM--DLHKPPGPLVLMVAVVATSTLSLL
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pF1KB4 VLAFSGIMIVYRRKH-QELQAMQMELQSPEYKLSKLRTSTIMTDYNPNYCFAGKTSSIS-
       ..   :..:. ..:. : ::  .:.: ::: .:::::::.: :  :: :: .:   . : 
CCDS10 MV--CGVLILVKQKKWQGLQ--EMRLPSPELELSKLRTSAIRTAPNPYYCQVGLGPAQSW
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pF1KB4 ----DLKEVPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPNDPSPLQVAVKTLPEVCSEQDEL
            . ::   :.::.:.:::::::::::: : :.:.: ::::::.:::::.:: ::::
CCDS10 PLPPGVTEVSPANVTLLRALGHGAFGEVYEGLVIGLPGDSSPLQVAIKTLPELCSPQDEL
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pF1KB4 DFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSQPSSLA
       :::::::::::: :::::::.:.::.. ::.::::::.:::.:::::..::. .::: :.
CCDS10 DFLMEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKSFLRHSRPHLGQPSPLV
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           1230      1240      1250      1260      1270      1280  
pF1KB4 MLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCPGPGRVAKIGDFGMARDIYRASY
       : :::..:.::: ::.:::::::::::::::::::.: ::.:::::::::::::::::::
CCDS10 MRDLLQLAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPSRVAKIGDFGMARDIYRASY
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           1290      1300      1310      1320      1330      1340  
pF1KB4 YRKGGCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFV
       ::.:  :.:::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::...:::::.::
CCDS10 YRRGDRALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEIFSLGYMPYPGRTNQEVLDFV
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           1350      1360      1370      1380      1390      1400  
pF1KB4 TSGGRMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIEYG
       ..:::::::..:::::::::::::::.:: ::.:: ::::..::::::::.:. ::.: :
CCDS10 VGGGRMDPPRGCPGPVYRIMTQCWQHEPELRPSFASILERLQYCTQDPDVLNSLLPMELG
        740       750       760       770       780       790      

           1410      1420       1430      1440      1450      1460 
pF1KB4 PLVEEEEKVPVRPKDPEGV-PPLLVSQQAKREEERSPAAPPPLPTTSSGKAAKKPTAAEV
       :  :::    .  .. : . ::    :. . :. .: .. :  :  :::           
CCDS10 PTPEEEGTSGLGNRSLECLRPPQ--PQELSPEKLKSWGGSPLGPWLSSGLKPLKSRGLQP
        800       810         820       830       840       850    

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pF1KB4 SVRVPRGPAVEGGHVNMAFSQSNPPSELHRVHGSRNKPTSLWNPTYGSWFTEKPTKKNNP
                                                                   
CCDS10 QNLWNPTYRS                                                  
          860                                                      

>>CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15                (803 aa)
 initn: 2448 init1: 1956 opt: 2142  Z-score: 1162.1  bits: 226.9 E(32554): 2.1e-58
Smith-Waterman score: 2748; 51.8% identity (70.8% similar) in 859 aa overlap (608-1450:4-782)

       580       590       600       610       620       630       
pF1KB4 GRMVWHVAAYEGLSLWQWMVLPLLDVSDRFWLQMVAWWGQGSRAIVAFDNISISLDCYLT
                                     : :...:.: ..  . .  .   : . .: 
CCDS10                            MGCWGQLLVWFGAAGAILCSSPG---SQETFLR
                                          10        20           30

       640       650       660       670       680       690       
pF1KB4 ISGEDKILQNTAPKSRNLFERNPNKELKPGENSPRQTPIFDPTVHWLFTTCGASGPHGPT
        :     :  ..:. :.     : . :.:.  :: ..:  . .  :::.:::::: ::::
CCDS10 SSP----LPLASPSPRDPKVSAPPSILEPA--SPLNSPGTEGS--WLFSTCGASGRHGPT
                   40        50          60          70        80  

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pF1KB4 QAQCNNAYQNSNLSVEVGSEGPLKGIQIWKVPATDTYSISGYGAAGGKGGKNTMMRSHGV
       :.::..:: .... : ::. : :.:.:.:.::.   : ::.::::::::.:: . :.:::
CCDS10 QTQCDGAYAGTSVVVTVGAAGQLRGVQLWRVPGPGQYLISAYGAAGGKGAKNHLSRAHGV
             90       100       110       120       130       140  

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pF1KB4 SVLGIFNLEKDDMLYILVGQQGEDACPSTNQLIQKVCIGENNVIEEEIRVNRS-----VH
        : .::.:   . ::::::::::::::. .   : ::.::. ..::.  .. :      .
CCDS10 FVSAIFSLGLGESLYILVGQQGEDACPGGSPESQLVCLGESRAVEEHAAMDGSEGVPGSR
            150       160       170       180       190       200  

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pF1KB4 EWAGGGGGGGGATYVFKMKDGVPVPLIIAAGGGGRAYGAKTDTFH----PERLENNSSVL
       .:::::::::::::::... :   ::..:::::::::    :  .    ::.::: : . 
CCDS10 RWAGGGGGGGGATYVFRVRAGELEPLLVAAGGGGRAYLRPRDRGRTQASPEKLENRSEAP
            210       220       230       240       250       260  

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pF1KB4 GLNGNSGAAGGGGGWNDNTSLLWAGKSLQEGATGGHSCPQAMKKWGWETRGGFGGGGGGC
       : .: .::::: .. .::   :::                                    
CCDS10 GSGGRGGAAGGDASETDN---LWA------------------------------------
            270       280                                          

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pF1KB4 SSGGGGGGYIGGNAASNNDPEMDGEDGVSFISPLGILYTPALKVMEGHGEVNIKHYLNCS
                             ::::::::: : . :.   : : :.::::.:...::::
CCDS10 ----------------------DGEDGVSFIHPSSELFLQPLAVTENHGEVEIRRHLNCS
                                 290       300       310       320 

      990      1000      1010      1020      1030      1040        
pF1KB4 HCEVDECHMDPESHKVICFCDHGTVLAEDGVSCIVSPTPEPHLPLSLILSVVTSALVAAL
       :: . .:. . : . . :.: .:  :: :.:.:.     .:  :: :...::... .. :
CCDS10 HCPLRDCQWQAELQLAECLCPEGMELAVDNVTCM--DLHKPPGPLVLMVAVVATSTLSLL
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       ..   :..:. ..:. : ::  .:.: ::: .:::::::.: :  :: :: .:   . : 
CCDS10 MV--CGVLILVKQKKWQGLQ--EMRLPSPELELSKLRTSAIRTAPNPYYCQVGLGPAQSW
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pF1KB4 ----DLKEVPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPNDPSPLQVAVKTLPEVCSEQDEL
            . ::   :.::.:.:::::::::::: : :.:.: ::::::.:::::.:: ::::
CCDS10 PLPPGVTEVSPANVTLLRALGHGAFGEVYEGLVIGLPGDSSPLQVAIKTLPELCSPQDEL
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pF1KB4 DFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSQPSSLA
       :::::::::::: :::::::.:.::.. ::.::::::.:::.:::::..::. .::: :.
CCDS10 DFLMEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKSFLRHSRPHLGQPSPLV
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pF1KB4 MLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCPGPGRVAKIGDFGMARDIYRASY
       : :::..:.::: ::.:::::::::::::::::::.: ::.:::::::::::::::::::
CCDS10 MRDLLQLAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPSRVAKIGDFGMARDIYRASY
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pF1KB4 YRKGGCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFV
       ::.:  :.:::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::...:::::.::
CCDS10 YRRGDRALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEIFSLGYMPYPGRTNQEVLDFV
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pF1KB4 TSGGRMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIEYG
       ..:::::::..:::::::::::::::.:: ::.:: ::::..::::::::.:. ::.: :
CCDS10 VGGGRMDPPRGCPGPVYRIMTQCWQHEPELRPSFASILERLQYCTQDPDVLNSLLPMELG
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pF1KB4 PLVEEEEKVPVRPKDPEGV-PPLLVSQQAKREEERSPAAPPPLPTTSSGKAAKKPTAAEV
       :  :::    .  .. : . ::    :. . :. .: .. :  :  :::           
CCDS10 PTPEEEGTSGLGNRSLECLRPPQ--PQELSPEKLKSWGGSPLGPWLSSGLKPLKSRGLQP
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CCDS10 QNLWNPTYRS                                                  
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>>CCDS45237.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15                (734 aa)
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CCDS45                            MGCWGQLLVWFGAAGAILCSSPG---SQETFLR
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        :     :  ..:. :.     : . :.:.  :: ..:  . .  :::.:::::: ::::
CCDS45 SSP----LPLASPSPRDPKVSAPPSILEPA--SPLNSPGTEGS--WLFSTCGASGRHGPT
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CCDS45 QTQCDGAYAGTSVVVTVGAAGQLRGVQLWRVPGPGQYLISAYGAAGGKGAKNHLSRAHGV
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CCDS45 FVSAIFSLGLGESLYILVGQQGEDACPGGSPESQLVCLGESRAVEEHAAMDGSEGVPGSR
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pF1KB4 EWAGGGGGGGGATYVFKMKDGVPVPLIIAAGGGGRAYGAKTDTFH----PERLENNSSVL
       .:::::::::::::::... :   ::..:::::::::    :  .    ::.::: : . 
CCDS45 RWAGGGGGGGGATYVFRVRAGELEPLLVAAGGGGRAYLRPRDRGRTQASPEKLENRSEAP
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pF1KB4 GLNGNSGAAGGGGGWNDNTSLLWAGKSLQEGATGGHSCPQAMKKWGWETRGGFGGGGGGC
       : .: .::::: .. .::   :::                                    
CCDS45 GSGGRGGAAGGDASETDN---LWA------------------------------------
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pF1KB4 SSGGGGGGYIGGNAASNNDPEMDGEDGVSFISPLGILYTPALKVMEGHGEVNIKHYLNCS
                             ::::::::: : . :.   : : :.::::.:...::::
CCDS45 ----------------------DGEDGVSFIHPSSELFLQPLAVTENHGEVEIRRHLNCS
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pF1KB4 HCEVDECHMDPESHKVICFCDHGTVLAEDGVSCIVSPTPEPHLPLSLILSVVTSALVAAL
       :: . .:. . : . . :.: .:  :: :.:.:.     .:  :: :...::... .. :
CCDS45 HCPLRDCQWQAELQLAECLCPEGMELAVDNVTCM--DLHKPPGPLVLMVAVVATSTLSLL
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pF1KB4 VLAFSGIMIVYRRKHQELQAMQMELQSPEYKLSKLRTSTIMTDYNPNYCFAGKTSSISDL
       ..   :..:                               .    :.  .:. :      
CCDS45 MVC--GVLI-------------------------------LGGAWPGPVLASATRC----
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pF1KB4 KEVPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPNDPSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEA
                      : .:              ::    : .::::.:: ::::::::::
CCDS45 ---------------HRGF--------------PSQCYSA-QTLPELCSPQDELDFLMEA
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pF1KB4 LIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSQPSSLAMLDLLH
       :::::: :::::::.:.::.. ::.::::::.:::.:::::..::. .::: :.: :::.
CCDS45 LIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKSFLRHSRPHLGQPSPLVMRDLLQ
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pF1KB4 VARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCPGPGRVAKIGDFGMARDIYRASYYRKGGC
       .:.::: ::.:::::::::::::::::::.: ::.:::::::::::::::::::::.:  
CCDS45 LAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPSRVAKIGDFGMARDIYRASYYRRGDR
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pF1KB4 AMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGRM
       :.:::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::...:::::.::..::::
CCDS45 ALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEIFSLGYMPYPGRTNQEVLDFVVGGGRM
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pF1KB4 DPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIEYGPLVEEE
       :::..:::::::::::::::.:: ::.:: ::::..::::::::.:. ::.: ::  :::
CCDS45 DPPRGCPGPVYRIMTQCWQHEPELRPSFASILERLQYCTQDPDVLNSLLPMELGPTPEEE
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pF1KB4 EKVPVRPKDPEGV-PPLLVSQQAKREEERSPAAPPPLPTTSSGKAAKKPTAAEVSVRVPR
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CCDS45 GTSGLGNRSLECLRPPQ--PQELSPEKLKSWGGSPLGPWLSSGLKPLKSRGLQPQNLWNP
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pF1KB4 GPAVEGGHVNMAFSQSNPPSELHRVHGSRNKPTSLWNPTYGSWFTEKPTKKNNPIAKKEP
                                                                   
CCDS45 TYRS                                                        
                                                                   

>>CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6                 (2347 aa)
 initn: 1031 init1: 547 opt: 1024  Z-score: 561.2  bits: 117.3 E(32554): 6.2e-25
Smith-Waterman score: 1051; 39.1% identity (67.4% similar) in 463 aa overlap (1027-1458:1858-2311)

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pF1KB4 MDPESHKVICFCDHGTVLAEDGVSCIVSPTPEPHLPLSLILSVVTSALVAALVLAFSGIM
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CCDS51 FRVVAANNLGFGEYSGISENIILVGDDFWIPETSFILTIIVGIF---LVVTIPLTF----
      1830      1840      1850      1860      1870         1880    

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pF1KB4 IVYRRKHQELQAMQ--MELQSPEYKLSKLRTSTIMTDYNPNYCFAGKT----SSISDLKE
       . .:: ... .: .    : . . .:..::  .  .    : :.: .:      : .:  
CCDS51 VWHRRLKNQKSAKEGVTVLINEDKELAELRGLAAGVGLA-NACYAIHTLPTQEEIENLPA
             1890      1900      1910       1920      1930         

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pF1KB4 VPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQ-VSGMPNDPSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEAL
        ::...::   :: :::::::::  :. .    . ..:::::: .  ..:....:: :: 
CCDS51 FPREKLTLRLLLGSGAFGEVYEGTAVDILGVGSGEIKVAVKTLKKGSTDQEKIEFLKEAH
    1940      1950      1960      1970      1980      1990         

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pF1KB4 IISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSQPSSLAMLDLLHV
       ..::::: ::.. .:: : . :..:.:::: :::: ..::..:        :...::. .
CCDS51 LMSKFNHPNILKQLGVCLLNEPQYIILELMEGGDLLTYLRKARMATFYGPLLTLVDLVDL
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pF1KB4 ARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCP---GPGRVAKIGDFGMARDIYRASYYRKG
         ::. :: :::. ::::::.::::::..     .: :..::::::.:::::. .:::: 
CCDS51 CVDISKGCVYLERMHFIHRDLAARNCLVSVKDYTSP-RIVKIGDFGLARDIYKNDYYRKR
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pF1KB4 GCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGG
       : ..:::.:: ::..:.::::...:.::::.:.:::..::..:::..:: .::..: .::
CCDS51 GEGLLPVRWMAPESLMDGIFTTQSDVWSFGILIWEILTLGHQPYPAHSNLDVLNYVQTGG
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pF1KB4 RMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIE----------YCTQDP----DV
       :..::.:::  .. .::::: ..:..::.:  : ....          : ..:      :
CCDS51 RLEPPRNCPDDLWNLMTQCWAQEPDQRPTFHRIQDQLQLFRNFFLNSIYKSRDEANNSGV
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       :: ..  : : ..  . .. .::   . :. ::.  .... .  . ::.: .      . 
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       : :  :  :.: :                                               
CCDS51 SCGLRKEEKEPHADKDFCQEKQVAYCPSGKPEGLNYACLTHSGYGDGSD           
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>>CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15              (1366 aa)
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       : :..::. : ::.:.:: :::: ..:. .:    .::.::. :. : .....:: :: .
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       ..: .:: :  ::. :.:.:::.:::::...      ..:::::::.::::...::::::
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        ..:::.:: ::.. .:.::. .:.:::::.:::: .:. .:: . ::..::.::  :: 
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CCDS73 LDKPDNCPDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFLEIISSIKE-EMEPGFREVSFYYSEENKLPE
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CCDS73 PEELDLEPENMESVP----------LDPSASSSSLPLPDRHSGHKAENGPGPGVLVLRAS
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CCDS73 FDERQPYAHMNGGRKNERALPLPQSSTC                                
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>>CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15              (1367 aa)
 initn: 735 init1: 735 opt: 939  Z-score: 518.5  bits: 108.6 E(32554): 1.5e-22
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CCDS10 HLIIALPVAVLLIVGGLVIMLYVFHRKRNNSRLGNGVLYASVNPEY-FSAADVYVPDEWE
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pF1KB4 VPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPNDPSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALI
       : :..::. : ::.:.:: :::: ..:. .:    .::.::. :. : .....:: :: .
CCDS10 VAREKITMSRELGQGSFGMVYEGVAKGVVKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIEFLNEASV
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CCDS10 MKEFNCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSYLRSLRPEMENNPVLAPPSLSKMI
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       ..: .:: :  ::. :.:.:::.:::::...      ..:::::::.::::...::::::
CCDS10 QMAGEIADGMAYLNANKFVHRDLAARNCMVA---EDFTVKIGDFGMTRDIYETDYYRKGG
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pF1KB4 CAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGR
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CCDS10 KGLLPVRWMSPESLKDGVFTTYSDVWSFGVVLWEIATLAEQPYQGLSNEQVLRFVMEGGL
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pF1KB4 MDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIEYGPLVEE
       .: : :::  ....: .:::..:. ::.:  :.  :.   ..:   ....       . :
CCDS10 LDKPDNCPDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFLEIISSIKE-EMEPGFREVSFYYSEENKLPE
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CCDS10 PEELDLEPENMESVP----------LDPSASSSSLPLPDRHSGHKAENGPGPGVLVLRAS
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pF1KB4 RGPAVEGGHVNMAFSQSNPPSELHRVHGSRNKPTSLWNPTYGSWFTEKPTKKNNPIAKKE
              .:.:                                                 
CCDS10 FDERQPYAHMNGGRKNERALPLPQSSTC                                
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>>CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1                (1297 aa)
 initn: 911 init1: 702 opt: 910  Z-score: 503.3  bits: 105.7 E(32554): 1e-21
Smith-Waterman score: 910; 40.7% identity (71.2% similar) in 354 aa overlap (1082-1429:946-1291)

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CCDS11 DAGGLHVLLTATPVGLTLLIVLAALGFFYGKKRNRTLYASVNPEY-FSASDMYVPDEWEV
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pF1KB4 PRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPNDPSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALII
       ::..:..:: ::.:.:: :::: . :.        ::.::. :. : .. ..:: :: ..
CCDS11 PREQISIIRELGQGSFGMVYEGLARGLEAGEESTPVALKTVNELASPRECIEFLKEASVM
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pF1KB4 SKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPR----PSQPSSLAMLDLL
       . :. ...:: .::  :. : ....:::. ::::: ::  ::.    :. :.  :. ...
CCDS11 KAFKCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSHLRSLRPEAENNPGLPQP-ALGEMI
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       ..: .:: :  ::  :.:.:::.:::::...      ..:::::::.::.:...::::::
CCDS11 QMAGEIADGMAYLAANKFVHRDLAARNCMVS---QDFTVKIGDFGMTRDVYETDYYRKGG
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pF1KB4 CAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGR
        ..:::.:: ::.. .::::...:.:::::.:::: .:. .:: . ::..::.:: .:: 
CCDS11 KGLLPVRWMAPESLKDGIFTTHSDVWSFGVVLWEIVTLAEQPYQGLSNEQVLKFVMDGGV
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pF1KB4 MDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIEYGPLVEE
       ..  ..::  . ..:..::: .:. ::.:. ::. :.   . :.     : . :.:  . 
CCDS11 LEELEGCPLQLQELMSRCWQPNPRLRPSFTHILDSIQEELR-PSF--RLLSFYYSPECRG
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pF1KB4 EE-KVPVRPKDPEGVP-PLLVSQQAKREEERSPAAPPPLPTTSSGKAAKKPTAAEVSVRV
        . ..:.   .:.. : :   : :                                    
CCDS11 ARGSLPTTDAEPDSSPTPRDCSPQNGGPGH                              
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>>CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19               (1370 aa)
 initn: 738 init1: 705 opt: 899  Z-score: 497.2  bits: 104.7 E(32554): 2.3e-21
Smith-Waterman score: 901; 39.0% identity (67.2% similar) in 418 aa overlap (1034-1434:940-1327)

          1010      1020      1030      1040      1050         1060
pF1KB4 VICFCDHGTVLAEDGVSCIVSPTPEPHLPLSLILSVVTSALVAALVLAFS---GIMIVYR
                                     : : ... . :.  .:. ::   : . .. 
CCDS42 SVRIRATSLAGNGSWTEPTYFYVTDYLDVPSNIAKIIIGPLI--FVFLFSVVIGSIYLFL
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pF1KB4 RKHQELQAMQMELQSPEYKLSKLRTSTIMTDYNPNYCFAGK----TSSISDLKEVPRKNI
       ::.:           :.  :. : .:.     ::.:  :.     .  . :  :: :..:
CCDS42 RKRQ-----------PDGPLGPLYASS-----NPEYLSASDVFPCSVYVPDEWEVSREKI
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pF1KB4 TLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPNDPSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALIISKFNH
       ::.: ::.:.:: ::::..  . .  .  .:::::. :  : .....:: :: ... :. 
CCDS42 TLLRELGQGSFGMVYEGNARDIIKGEAETRVAVKTVNESASLRERIEFLNEASVMKGFTC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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