Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4567
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4567, 760 aa
1>>>pF1KB4567 760 - 760 aa - 760 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5336+/-0.00103; mu= 6.3246+/- 0.062
mean_var=193.7905+/-40.759, 0's: 0 Z-trim(110.3): 56 B-trim: 9 in 1/49
Lambda= 0.092131
statistics sampled from 11449 (11500) to 11449 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.709), E-opt: 0.2 (0.353), width: 16
Scan time: 4.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44877.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12 ( 760) 4998 677.4 2.2e-194
CCDS8802.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12 ( 759) 4965 673.0 4.6e-193
CCDS55826.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12 ( 600) 3959 539.3 6.9e-153
CCDS58230.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12 ( 457) 3036 416.5 4.8e-116
CCDS42768.1 XIRP2 gene_id:129446|Hs108|chr2 ( 938) 748 112.6 3e-24
CCDS56143.1 XIRP2 gene_id:129446|Hs108|chr2 ( 971) 737 111.1 8.4e-24
CCDS56145.1 XIRP2 gene_id:129446|Hs108|chr2 ( 716) 728 109.9 1.5e-23
CCDS11641.1 LIMD2 gene_id:80774|Hs108|chr17 ( 127) 465 74.4 1.3e-13
>>CCDS44877.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12 (760 aa)
initn: 4998 init1: 4998 opt: 4998 Z-score: 3603.2 bits: 677.4 E(32554): 2.2e-194
Smith-Waterman score: 4998; 100.0% identity (100.0% similar) in 760 aa overlap (1-760:1-760)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MESSPFNRRQWTSLSLRVTAKELSLVNKNKSSAIVEIFSKYQKAAEETNMEKKRSNTENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MESSPFNRRQWTSLSLRVTAKELSLVNKNKSSAIVEIFSKYQKAAEETNMEKKRSNTENL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SQHFRKGTLTVLKKKWENPGLGAESHTDSLRNSSTEIRHRADHPPAEVTSHAASGAKADQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SQHFRKGTLTVLKKKWENPGLGAESHTDSLRNSSTEIRHRADHPPAEVTSHAASGAKADQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EEQIHPRSRLRSPPEALVQGRYPHIKDGEDLKDHSTESKKMENCLGESRHEVEKSEISEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EEQIHPRSRLRSPPEALVQGRYPHIKDGEDLKDHSTESKKMENCLGESRHEVEKSEISEN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 TDASGKIEKYNVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASGRKISENSYSLDDLEIGPGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TDASGKIEKYNVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASGRKISENSYSLDDLEIGPGQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LSSSTFDSEKNESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYTNELKASGGEIKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LSSSTFDSEKNESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYTNELKASGGEIKI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 HKMEQKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSLAVRSTPAEDDSPGDSQVKSEVQQPVHPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HKMEQKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSLAVRSTPAEDDSPGDSQVKSEVQQPVHPK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 CNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWASKNENEEILERPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWASKNENEEILERPA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKEDKPAETKKLRIAWPPPTELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKEDKPAETKKLRIAWPPPTELG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 SSGSALEEGIKMSKPKWPPEDEISKPEVPEDVDLDLKKLRRSSSLKERSRPFTVAASFQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSGSALEEGIKMSKPKWPPEDEISKPEVPEDVDLDLKKLRRSSSLKERSRPFTVAASFQS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 TSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKASKKNGNVGKTTWQNKESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKASKKNGNVGKTTWQNKESK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 GETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQEPKSLNWSSFVDNTFAEEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQEPKSLNWSSFVDNTFAEEF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KB4 TTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE
730 740 750 760
>>CCDS8802.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12 (759 aa)
initn: 2784 init1: 2784 opt: 4965 Z-score: 3579.5 bits: 673.0 E(32554): 4.6e-193
Smith-Waterman score: 4965; 99.7% identity (99.7% similar) in 760 aa overlap (1-760:1-759)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MESSPFNRRQWTSLSLRVTAKELSLVNKNKSSAIVEIFSKYQKAAEETNMEKKRSNTENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MESSPFNRRQWTSLSLRVTAKELSLVNKNKSSAIVEIFSKYQKAAEETNMEKKRSNTENL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SQHFRKGTLTVLKKKWENPGLGAESHTDSLRNSSTEIRHRADHPPAEVTSHAASGAKADQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SQHFRKGTLTVLKKKWENPGLGAESHTDSLRNSSTEIRHRADHPPAEVTSHAASGAKADQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EEQIHPRSRLRSPPEALVQGRYPHIKDGEDLKDHSTESKKMENCLGESRHEVEKSEISEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 EEQIHPRSRLRSPPEALVQGRYPHIKDGEDLKDHSTESKKMENCLGESRHEVEKSEISEN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 TDASGKIEKYNVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASGRKISENSYSLDDLEIGPGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TDASGKIEKYNVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASGRKISENSYSLDDLEIGPGQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LSSSTFDSEKNESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYTNELKASGGEIKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LSSSTFDSEKNESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYTNELKASGGEIKI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 HKMEQKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSLAVRSTPAEDDSPGDSQVKSEVQQPVHPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS88 HKMEQKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSLAVRSTPAEDDSR-DSQVKSEVQQPVHPK
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSY
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 CNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWASKNENEEILERPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 CNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWASKNENEEILERPA
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKEDKPAETKKLRIAWPPPTELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 QLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKEDKPAETKKLRIAWPPPTELG
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 SSGSALEEGIKMSKPKWPPEDEISKPEVPEDVDLDLKKLRRSSSLKERSRPFTVAASFQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SSGSALEEGIKMSKPKWPPEDEISKPEVPEDVDLDLKKLRRSSSLKERSRPFTVAASFQS
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 TSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKASKKNGNVGKTTWQNKESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKASKKNGNVGKTTWQNKESK
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 GETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQEPKSLNWSSFVDNTFAEEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQEPKSLNWSSFVDNTFAEEF
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760
pF1KB4 TTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE
720 730 740 750
>>CCDS55826.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12 (600 aa)
initn: 3959 init1: 3959 opt: 3959 Z-score: 2858.3 bits: 539.3 E(32554): 6.9e-153
Smith-Waterman score: 3959; 100.0% identity (100.0% similar) in 600 aa overlap (161-760:1-600)
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 RSPPEALVQGRYPHIKDGEDLKDHSTESKKMENCLGESRHEVEKSEISENTDASGKIEKY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MENCLGESRHEVEKSEISENTDASGKIEKY
10 20 30
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 NVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASGRKISENSYSLDDLEIGPGQLSSSTFDSEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASGRKISENSYSLDDLEIGPGQLSSSTFDSEK
40 50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 NESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYTNELKASGGEIKIHKMEQKENVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYTNELKASGGEIKIHKMEQKENVP
100 110 120 130 140 150
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 PGPEVCITHQEGEKISANENSLAVRSTPAEDDSPGDSQVKSEVQQPVHPKPLSPDSRASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PGPEVCITHQEGEKISANENSLAVRSTPAEDDSPGDSQVKSEVQQPVHPKPLSPDSRASS
160 170 180 190 200 210
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 LSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSYCNNKLSLGTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSYCNNKLSLGTY
220 230 240 250 260 270
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 ASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWASKNENEEILERPAQLANARETPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWASKNENEEILERPAQLANARETPH
280 290 300 310 320 330
500 510 520 530 540 550
pF1KB4 SPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKEDKPAETKKLRIAWPPPTELGSSGSALEEGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKEDKPAETKKLRIAWPPPTELGSSGSALEEGI
340 350 360 370 380 390
560 570 580 590 600 610
pF1KB4 KMSKPKWPPEDEISKPEVPEDVDLDLKKLRRSSSLKERSRPFTVAASFQSTSVKSPKTVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KMSKPKWPPEDEISKPEVPEDVDLDLKKLRRSSSLKERSRPFTVAASFQSTSVKSPKTVS
400 410 420 430 440 450
620 630 640 650 660 670
pF1KB4 PPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKASKKNGNVGKTTWQNKESKGETGKRSKEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKASKKNGNVGKTTWQNKESKGETGKRSKEG
460 470 480 490 500 510
680 690 700 710 720 730
pF1KB4 HSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQEPKSLNWSSFVDNTFAEEFTTQNQKSQDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQEPKSLNWSSFVDNTFAEEFTTQNQKSQDV
520 530 540 550 560 570
740 750 760
pF1KB4 ELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE
580 590 600
>>CCDS58230.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12 (457 aa)
initn: 2784 init1: 2784 opt: 3036 Z-score: 2196.9 bits: 416.5 E(32554): 4.8e-116
Smith-Waterman score: 3036; 99.6% identity (99.6% similar) in 458 aa overlap (303-760:1-457)
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 KYQAAVSKQSSSTNYTNELKASGGEIKIHKMEQKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MEQKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSL
10 20 30
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 AVRSTPAEDDSPGDSQVKSEVQQPVHPKPLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCV
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AVRSTPAEDDSR-DSQVKSEVQQPVHPKPLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCV
40 50 60 70 80
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 ECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSYCNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSYCNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGN
90 100 110 120 130 140
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 YDEGFGHRPHKDLWASKNENEEILERPAQLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YDEGFGHRPHKDLWASKNENEEILERPAQLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAK
150 160 170 180 190 200
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 ASSQQEKEDKPAETKKLRIAWPPPTELGSSGSALEEGIKMSKPKWPPEDEISKPEVPEDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ASSQQEKEDKPAETKKLRIAWPPPTELGSSGSALEEGIKMSKPKWPPEDEISKPEVPEDV
210 220 230 240 250 260
580 590 600 610 620 630
pF1KB4 DLDLKKLRRSSSLKERSRPFTVAASFQSTSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DLDLKKLRRSSSLKERSRPFTVAASFQSTSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVA
270 280 290 300 310 320
640 650 660 670 680 690
pF1KB4 ERKQVENAKASKKNGNVGKTTWQNKESKGETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ERKQVENAKASKKNGNVGKTTWQNKESKGETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDN
330 340 350 360 370 380
700 710 720 730 740 750
pF1KB4 SFLKQQSPQEPKSLNWSSFVDNTFAEEFTTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SFLKQQSPQEPKSLNWSSFVDNTFAEEFTTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRY
390 400 410 420 430 440
760
pF1KB4 YDEDEDEE
::::::::
CCDS58 YDEDEDEE
450
>>CCDS42768.1 XIRP2 gene_id:129446|Hs108|chr2 (938 aa)
initn: 767 init1: 487 opt: 748 Z-score: 548.9 bits: 112.6 E(32554): 3e-24
Smith-Waterman score: 763; 28.3% identity (56.4% similar) in 674 aa overlap (41-693:64-677)
20 30 40 50 60
pF1KB4 WTSLSLRVTAKELSLVNKNKSSAIVEIFSKYQKAAEETNMEKKRSNTENLSQHFRK-GTL
:. . : . . ..... . :.. :. :
CCDS42 TIFQPQESKLLAPEGEVVSAPQSLDPTSLPYSTGEEMWSSKPEEKDSVDKSNNTREYGRP
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 TVLKKKWENPGLGAESHTDSLRNSSTEIRHRADHPPAEVTSHAASGAKADQEEQIHPRSR
:::. .:... . . . . :.: . : . .. : :.: . :.
CCDS42 EVLKED----SLSSRRRIERFSIALDELRSVFEAPKSG-NKPAEYGGKEVEIERSLCSPA
100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LRSPPEALVQGRYPHIKDGEDLKDHSTESKKMENCLGESRHEVEKSEISENTDASGKIEK
..: : . .. .::. : : . : :: :.:: . .. . : :: :
CCDS42 FKSHPGSQLEDS---VKDS-DKKGKETSFDKMSPESGHSR--IFEATAGPNKPESGFAED
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 YNVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASG--RKISENSYSLDDLEIGPGQLSS--ST
. . .. . : . .. : :. . : :..: : . ... :: :.. .
CCDS42 SAARGEGVSDLHEV-VSLKERMARYQAAVSRGDCRSFSANMMEESEMCAVPGGLAKVKKQ
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 FDSEKNESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYT-NELKASGGEIKIHKME
:..: . :: .. . .. . ... : ... :. . :: ... :: ..: :..:..
CCDS42 FEDEITSSRNTFAQYQYQHQNRSEQEAIHSSQVGTSRSSQEMARNEQEGS----KVQKID
270 280 290 300 310
310 320 330 340 350
pF1KB4 QKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSL-------AVRSTPAEDDSPGDSQ--VKSEVQQ
. : :. ..: : . .:. : .: .:: ... : : .: . ..
CCDS42 VH-----GTEM-VSHLEKHTEEVNQASQFHQYVQETVIDTPEDEEIPKVSTKLLKEQFEK
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 PVHPKPLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQQVFHISC
.. : : :.. .. : : .::. .: :. ::::::::: :.:..: :: ::
CCDS42 SAQEKILYSDKEMTT-----PAKQIKKLLLQDKEICILCQKTVYPMECLVADKQNFHKSC
380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 FRCSYCNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWASKNENEEI
::: .::.:::::.::::::.:::::::.:::::::::::::::. ::: : ::... .
CCDS42 FRCHHCNSKLSLGNYASLHGQIYCKPHFKQLFKSKGNYDEGFGHKQHKDRWNCKNQSRSV
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 L----ERPAQLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKE-DKPAETKKLR
:.: . : :. :: .. ..: : :... : .: ::.
CCDS42 DFIPNEEPNMCKNIAENTLVPGDRNE----------HLDAGNSEGQRNDLRKLGERGKLK
490 500 510 520 530
540 550 560 570 580
pF1KB4 IAWPPPTELGSSGSALEEGIKMSKPKWPPE-DEISKPEVPEDVDLDLKKLRRSSSLKERS
. ::: :. .. .:: .:::::::::: . .:: . :. . .... ..
CCDS42 VIWPPSKEIPKKTLPFEEELKMSKPKWPPEMTTLLSPEFKSESLLEDVRTPENKGQRQDH
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 RPFTVAASFQSTSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKASKKNGNV
:: . .::: : :.:. .: . : :. :. : ::.:
CCDS42 FPF-LQPYLQSTHVC-----------------QKEDVIG--IKEMKMPEGRKDEKKEG--
600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 GKTTWQNKESKGETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQEPKSLNWS
. . :.. :..: : .... .:.:.. ..:........
CCDS42 -RKNVQDRPSEAEDTKSNRKSAMDLNDNNNVIVQSAEKEKNEKTNQTNGAEVLQVTNTDD
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 SFVDNTFAEEFTTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE
CCDS42 EMMPENHKENLNKNNNNNYVAVSYLNNCRQKTSILEFLDLLPLSSEANDTANEYEIEKLE
700 710 720 730 740 750
>>CCDS56143.1 XIRP2 gene_id:129446|Hs108|chr2 (971 aa)
initn: 767 init1: 487 opt: 737 Z-score: 540.8 bits: 111.1 E(32554): 8.4e-24
Smith-Waterman score: 748; 29.1% identity (56.7% similar) in 616 aa overlap (103-693:152-710)
80 90 100 110 120
pF1KB4 KKKWENPGLGAESHTDSLRNSSTEIRHRADHPPAEVTSHAASGAKADQE---EQIHPRSR
:: ... . . .. : .: ... :.:
CCDS56 EAPKSGNKPAEYGGKEVEIERSLCSPAFKSHPGSQLEDSVKDSDKKGKETSFDKMSPESG
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LRSPPEALVQGRYPHIKDGEDLKDHSTESKKMENCLGESRHEV----EKSEISENTDASG
::. . .: :. : .: .: : : . .: : . :...
CCDS56 HSRIFEAVFSTDQAQILR---LHLHPKLTKTPKNSLKSSTYISTAGPNKPESGFAEDSAA
190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 KIEKYNVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASGRKISENSYSLDDLEIGPGQLSS--
. : . :... . :. :. . :.. :: :. . :. .. :: :..
CCDS56 RGEGVS-DLHEVVSLKERMARYQAAVSRGDCRSFSANMMEES-----EMCAVPGGLAKVK
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 STFDSEKNESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYT-NELKASGGEIKIHK
. :..: . :: .. . .. . ... : ... :. . :: ... :: ..: :..:
CCDS56 KQFEDEITSSRNTFAQYQYQHQNRSEQEAIHSSQVGTSRSSQEMARNEQEGS----KVQK
300 310 320 330 340
310 320 330 340 350
pF1KB4 MEQKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSL-------AVRSTPAEDDSPGDSQ--VKSEV
.. . : :. ..: : . .:. : .: .:: ... : : .: .
CCDS56 IDVH-----GTEM-VSHLEKHTEEVNQASQFHQYVQETVIDTPEDEEIPKVSTKLLKEQF
350 360 370 380 390 400
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 QQPVHPKPLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQQVFHI
.. .. : : :.. .. : : .::. .: :. ::::::::: :.:..: ::
CCDS56 EKSAQEKILYSDKEMTT-----PAKQIKKLLLQDKEICILCQKTVYPMECLVADKQNFHK
410 420 430 440 450
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 SCFRCSYCNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWASKNENE
::::: .::.:::::.::::::.:::::::.:::::::::::::::. ::: : ::...
CCDS56 SCFRCHHCNSKLSLGNYASLHGQIYCKPHFKQLFKSKGNYDEGFGHKQHKDRWNCKNQSR
460 470 480 490 500 510
480 490 500 510 520
pF1KB4 EIL----ERPAQLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKE-DKPAETKK
. :.: . : :. :: .. ..: : :... : .: :
CCDS56 SVDFIPNEEPNMCKNIAENTLVPGDRNE----------HLDAGNSEGQRNDLRKLGERGK
520 530 540 550 560
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 LRIAWPPPTELGSSGSALEEGIKMSKPKWPPE-DEISKPEVPEDVDLDLKKLRRSSSLKE
:.. ::: :. .. .:: .:::::::::: . .:: . :. . .... ..
CCDS56 LKVIWPPSKEIPKKTLPFEEELKMSKPKWPPEMTTLLSPEFKSESLLEDVRTPENKGQRQ
570 580 590 600 610 620
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 RSRPFTVAASFQSTSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKASKKNG
:: . .::: : :.:. .: . : :. :. : ::.:
CCDS56 DHFPF-LQPYLQSTHVC-----------------QKEDVIG--IKEMKMPEGRKDEKKEG
630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 NVGKTTWQNKESKGETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQEPKSLN
. . :.. :..: : .... .:.:.. ..:........
CCDS56 ---RKNVQDRPSEAEDTKSNRKSAMDLNDNNNVIVQSAEKEKNEKTNQTNGAEVLQVTNT
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 WSSFVDNTFAEEFTTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE
CCDS56 DDEMMPENHKENLNKNNNNNYVAVSYLNNCRQKTSILEFLDLLPLSSEANDTANEYEIEK
730 740 750 760 770 780
>>CCDS56145.1 XIRP2 gene_id:129446|Hs108|chr2 (716 aa)
initn: 714 init1: 487 opt: 728 Z-score: 536.2 bits: 109.9 E(32554): 1.5e-23
Smith-Waterman score: 738; 31.5% identity (59.1% similar) in 501 aa overlap (213-693:3-455)
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 ASGKIEKYNVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASG--RKISENSYSLDDLEIGPGQ
: :. . : :..: : . ... ::
CCDS56 MARYQAAVSRGDCRSFSANMMEESEMCAVPGG
10 20 30
250 260 270 280 290
pF1KB4 LSS--STFDSEKNESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYT-NELKASGGE
:.. . :..: . :: .. . .. . ... : ... :. . :: ... :: ..:
CCDS56 LAKVKKQFEDEITSSRNTFAQYQYQHQNRSEQEAIHSSQVGTSRSSQEMARNEQEGS---
40 50 60 70 80
300 310 320 330 340
pF1KB4 IKIHKMEQKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSL-------AVRSTPAEDDSPGDSQ--
:..:.. . : :. ..: : . .:. : .: .:: ... : :
CCDS56 -KVQKIDVH-----GTEM-VSHLEKHTEEVNQASQFHQYVQETVIDTPEDEEIPKVSTKL
90 100 110 120 130 140
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 VKSEVQQPVHPKPLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQ
.: . .. .. : : :.. .. : : .::. .: :. ::::::::: :.:..
CCDS56 LKEQFEKSAQEKILYSDKEMTT-----PAKQIKKLLLQDKEICILCQKTVYPMECLVADK
150 160 170 180 190
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 QVFHISCFRCSYCNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWAS
: :: ::::: .::.:::::.::::::.:::::::.:::::::::::::::. ::: :
CCDS56 QNFHKSCFRCHHCNSKLSLGNYASLHGQIYCKPHFKQLFKSKGNYDEGFGHKQHKDRWNC
200 210 220 230 240 250
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 KNENEEIL----ERPAQLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKE-DKP
::... . :.: . : :. :: .. ..: : :... :
CCDS56 KNQSRSVDFIPNEEPNMCKNIAENTLVPGDRNE----------HLDAGNSEGQRNDLRKL
260 270 280 290 300
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 AETKKLRIAWPPPTELGSSGSALEEGIKMSKPKWPPE-DEISKPEVPEDVDLDLKKLRRS
.: ::.. ::: :. .. .:: .:::::::::: . .:: . :. . ..
CCDS56 GERGKLKVIWPPSKEIPKKTLPFEEELKMSKPKWPPEMTTLLSPEFKSESLLEDVRTPEN
310 320 330 340 350 360
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 SSLKERSRPFTVAASFQSTSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKA
.. .. :: . .::: : :.:. .: . : :. :. :
CCDS56 KGQRQDHFPF-LQPYLQSTHVC-----------------QKEDVIG--IKEMKMPEGRKD
370 380 390 400
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 SKKNGNVGKTTWQNKESKGETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQE
::.: . . :.. :..: : .... .:.:.. ..:........
CCDS56 EKKEG---RKNVQDRPSEAEDTKSNRKSAMDLNDNNNVIVQSAEKEKNEKTNQTNGAEVL
410 420 430 440 450 460
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 PKSLNWSSFVDNTFAEEFTTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE
CCDS56 QVTNTDDEMMPENHKENLNKNNNNNYVAVSYLNNCRQKTSILEFLDLLPLSSEANDTANE
470 480 490 500 510 520
>>CCDS11641.1 LIMD2 gene_id:80774|Hs108|chr17 (127 aa)
initn: 471 init1: 451 opt: 465 Z-score: 357.9 bits: 74.4 E(32554): 1.3e-13
Smith-Waterman score: 465; 58.9% identity (86.9% similar) in 107 aa overlap (363-469:13-118)
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 AVRSTPAEDDSPGDSQVKSEVQQPVHPKPLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCV
: :..... : . :... ..: ..:::.
CCDS11 MFQAAGAAQATPSHDAKGGGSSTVQRSKSFS-LRAQVKETCA
10 20 30 40
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 ECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSYCNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGN
:::::::::::.:.. .:: ::: :..:..:::::.::.:::..::::::.::::::::
CCDS11 ACQKTVYPMERLVADKLIFHNSCFCCKHCHTKLSLGSYAALHGEFYCKPHFQQLFKSKGN
50 60 70 80 90 100
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 YDEGFGHRPHKDLWASKNENEEILERPAQLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAK
::::::.. ::.::: :
CCDS11 YDEGFGRKQHKELWAHKEVDPGTKTA
110 120
760 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 02:35:57 2016 done: Sat Nov 5 02:35:58 2016
Total Scan time: 4.500 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]