Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4573
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4573, 648 aa
1>>>pF1KB4573 648 - 648 aa - 648 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2526+/-0.00133; mu= 6.3216+/- 0.078
mean_var=298.1548+/-66.322, 0's: 0 Z-trim(107.8): 718 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.074277
statistics sampled from 8987 (9807) to 8987 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.301), width: 16
Scan time: 3.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2612.1 RAF1 gene_id:5894|Hs108|chr3 ( 648) 4370 483.1 5e-136
CCDS35232.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX ( 606) 2457 278.1 2.5e-74
CCDS75970.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX ( 609) 2449 277.2 4.5e-74
CCDS5863.1 BRAF gene_id:673|Hs108|chr7 ( 766) 1797 207.5 5.6e-53
CCDS59164.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX ( 186) 645 83.3 3.4e-16
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 535 72.1 2.3e-12
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 527 71.2 4.2e-12
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 523 70.8 5.6e-12
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 519 70.3 7.5e-12
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 517 70.1 8.4e-12
CCDS61250.1 KSR2 gene_id:283455|Hs108|chr12 ( 921) 511 69.8 1.9e-11
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 502 68.5 2.5e-11
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 512) 502 68.5 2.6e-11
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 497 68.3 5.6e-11
CCDS305.1 FGR gene_id:2268|Hs108|chr1 ( 529) 489 67.1 6.9e-11
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 486 66.8 8.4e-11
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 (1005) 490 67.6 9.5e-11
>>CCDS2612.1 RAF1 gene_id:5894|Hs108|chr3 (648 aa)
initn: 4370 init1: 4370 opt: 4370 Z-score: 2555.6 bits: 483.1 E(32554): 5e-136
Smith-Waterman score: 4370; 100.0% identity (100.0% similar) in 648 aa overlap (1-648:1-648)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MEHIQGAWKTISNGFGFKDAVFDGSSCISPTIVQQFGYQRRASDDGKLTDPSKTSNTIRV
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CCDS26 MEHIQGAWKTISNGFGFKDAVFDGSSCISPTIVQQFGYQRRASDDGKLTDPSKTSNTIRV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 FLPNKQRTVVNVRNGMSLHDCLMKALKVRGLQPECCAVFRLLHEHKGKKARLDWNTDAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 FLPNKQRTVVNVRNGMSLHDCLMKALKVRGLQPECCAVFRLLHEHKGKKARLDWNTDAAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LIGEELQVDFLDHVPLTTHNFARKTFLKLAFCDICQKFLLNGFRCQTCGYKFHEHCSTKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 LIGEELQVDFLDHVPLTTHNFARKTFLKLAFCDICQKFLLNGFRCQTCGYKFHEHCSTKV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PTMCVDWSNIRQLLLFPNSTIGDSGVPALPSLTMRRMRESVSRMPVSSQHRYSTPHAFTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 PTMCVDWSNIRQLLLFPNSTIGDSGVPALPSLTMRRMRESVSRMPVSSQHRYSTPHAFTF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 NTSSPSSEGSLSQRQRSTSTPNVHMVSTTLPVDSRMIEDAIRSHSESASPSALSSSPNNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 NTSSPSSEGSLSQRQRSTSTPNVHMVSTTLPVDSRMIEDAIRSHSESASPSALSSSPNNL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SPTGWSQPKTPVPAQRERAPVSGTQEKNKIRPRGQRDSSYYWEIEASEVMLSTRIGSGSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 SPTGWSQPKTPVPAQRERAPVSGTQEKNKIRPRGQRDSSYYWEIEASEVMLSTRIGSGSF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 GTVYKGKWHGDVAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKTRHVNILLFMGYMTKDNLAIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 GTVYKGKWHGDVAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKTRHVNILLFMGYMTKDNLAIV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 TQWCEGSSLYKHLHVQETKFQMFQLIDIARQTAQGMDYLHAKNIIHRDMKSNNIFLHEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 TQWCEGSSLYKHLHVQETKFQMFQLIDIARQTAQGMDYLHAKNIIHRDMKSNNIFLHEGL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 TVKIGDFGLATVKSRWSGSQQVEQPTGSVLWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 TVKIGDFGLATVKSRWSGSQQVEQPTGSVLWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LMTGELPYSHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 LMTGELPYSHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB4 QILSSIELLQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 QILSSIELLQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF
610 620 630 640
>>CCDS35232.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX (606 aa)
initn: 2208 init1: 1617 opt: 2457 Z-score: 1448.0 bits: 278.1 E(32554): 2.5e-74
Smith-Waterman score: 2457; 62.1% identity (81.1% similar) in 607 aa overlap (50-646:13-606)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 AVFDGSSCISPTIVQQFGYQRRASDDGKLTDPSKTSNTIRVFLPNKQRTVVNVRNGMSLH
.::.. .:..:.:::::::::.::.:::..
CCDS35 MEPPRGPPANGAEPSRAVGTVKVYLPNKQRTVVTVRDGMSVY
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 DCLMKALKVRGLQPECCAVFRLLHEHKGKKARLDWNTDAASLIGEELQVDFLDHVPLTTH
: : ::::::::. .::.:.::. ::.:. :.: : : :::: :. :. :::: :
CCDS35 DSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLI---KGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTMH
50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 NFARKTFLKLAFCDICQKFLLNGFRCQTCGYKFHEHCSTKVPTMCVDWSNIRQLLLFPNS
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CCDS35 NFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMSTNRQQFYHSVQ
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 TI-GDSGVPALPSLTMRRMRESVSRMPVSSQHRYSTPHAFTFNTSSPSSEGSLSQRQRST
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CCDS35 DLSGGSRQHEAPS--NRPLNELLTPQGPSPRTQHCDPEHFPF----PAPANAPLQRIRST
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 STPNVHMVSTTLPVDSRMIE--------DAIRSHSESASPSALSSSPNNLSPTGWSQPKT
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CCDS35 STPNVHMVSTTAPMDSNLIQLTGQSFSTDAAGSRGGSDGTPRGSPSPASVS-SGRKSPHS
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360
pF1KB4 PVPA-QRERAPVSGTQEKNKIRPRGQRDSSYYWEIEASEVMLSTRIGSGSFGTVYKGKWH
:: :::: : ...:.:.. : :::.::::. :::.: :::.::::::..:.::
CCDS35 KSPAEQRERK--SLADDKKKVKNLGYRDSGYYWEVPPSEVQLLKRIGTGSFGTVFRGRWH
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 GDVAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKTRHVNILLFMGYMTKDNLAIVTQWCEGSSL
::::::.::: .:: :: :::.::. :::::::::::::::.::. ..::.:::::::::
CCDS35 GDVAVKVLKVSQPTAEQAQAFKNEMQVLRKTRHVNILLFMGFMTRPGFAIITQWCEGSSL
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 YKHLHVQETKFQMFQLIDIARQTAQGMDYLHAKNIIHRDMKSNNIFLHEGLTVKIGDFGL
:.:::: .:.:.: ::::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS35 YHHLHVADTRFDMVQLIDVARQTAQGMDYLHAKNIIHRDLKSNNIFLHEGLTVKIGDFGL
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 ATVKSRWSGSQQVEQPTGSVLWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMTGELPYS
::::.::::.: .:::.::::::: ::::::: ::.:::::::.::.:::::::: ::::
CCDS35 ATVKTRWSGAQPLEQPSGSVLWMAAEVIRMQDPNPYSFQSDVYAYGVVLYELMTGSLPYS
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFPQILSSIELL
::. :::::::::::: ::::::. .::::::.::..::.: .::::::::::..::::
CCDS35 HIGCRDQIIFMVGRGYLSPDLSKISSNCPKAMRRLLSDCLKFQREERPLFPQILATIELL
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640
pF1KB4 QHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF
:.:::::.::::::::::. ..... :: :... .:
CCDS35 QRSLPKIERSASEPSLHRT-QADELPACLLSAARLVP
580 590 600
>>CCDS75970.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX (609 aa)
initn: 2222 init1: 1617 opt: 2449 Z-score: 1443.3 bits: 277.2 E(32554): 4.5e-74
Smith-Waterman score: 2449; 61.7% identity (80.9% similar) in 608 aa overlap (50-646:13-609)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 AVFDGSSCISPTIVQQFGYQRRASDDGKLTDPSKTSNTIRVFLPNKQRTVVNVRNGMSLH
.::.. .:..:.:::::::::.::.:::..
CCDS75 MEPPRGPPANGAEPSRAVGTVKVYLPNKQRTVVTVRDGMSVY
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 DCLMKALKVRGLQPECCAVFRLLHEHKGKKARLDWNTDAASLIGEELQVDFLDHVPLTTH
: : ::::::::. .::.:.::. ::.:. :.: : : :::: :. :. :::: :
CCDS75 DSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLI---KGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTMH
50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 NFARKTFLKLAFCDICQKFLLNGFRCQTCGYKFHEHCSTKVPTMCVDWSNIRQLLLFPNS
::.::::..:::::.: :::..::::::::::::.:::.::::.::: :. ::
CCDS75 NFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMSTNRQQPSRFYH
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 TIGD--SGVPALPSLTMRRMRESVSRMPVSSQHRYSTPHAFTFNTSSPSSEGSLSQRQRS
.. : .: . . : . : .. . : . .. :. : : :. .. :: ::
CCDS75 SVQDLSGGSRQHEAPSNRPLNELLTPQGPSPRTQHCDPEHFPF----PAPANAPLQRIRS
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300
pF1KB4 TSTPNVHMVSTTLPVDSRMIE--------DAIRSHSESASPSALSSSPNNLSPTGWSQPK
:::::::::::: :.:: .:. :: :.. : . : :: ..: .: ..:.
CCDS75 TSTPNVHMVSTTAPMDSNLIQLTGQSFSTDAAGSRGGSDGTPRGSPSPASVS-SGRKSPH
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TPVPA-QRERAPVSGTQEKNKIRPRGQRDSSYYWEIEASEVMLSTRIGSGSFGTVYKGKW
. :: :::: : ...:.:.. : :::.::::. :::.: :::.::::::..:.:
CCDS75 SKSPAEQRERK--SLADDKKKVKNLGYRDSGYYWEVPPSEVQLLKRIGTGSFGTVFRGRW
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 HGDVAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKTRHVNILLFMGYMTKDNLAIVTQWCEGSS
:::::::.::: .:: :: :::.::. :::::::::::::::.::. ..::.::::::::
CCDS75 HGDVAVKVLKVSQPTAEQAQAFKNEMQVLRKTRHVNILLFMGFMTRPGFAIITQWCEGSS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 LYKHLHVQETKFQMFQLIDIARQTAQGMDYLHAKNIIHRDMKSNNIFLHEGLTVKIGDFG
::.:::: .:.:.: ::::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS75 LYHHLHVADTRFDMVQLIDVARQTAQGMDYLHAKNIIHRDLKSNNIFLHEGLTVKIGDFG
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 LATVKSRWSGSQQVEQPTGSVLWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMTGELPY
:::::.::::.: .:::.::::::: ::::::: ::.:::::::.::.:::::::: :::
CCDS75 LATVKTRWSGAQPLEQPSGSVLWMAAEVIRMQDPNPYSFQSDVYAYGVVLYELMTGSLPY
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 SHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFPQILSSIEL
:::. :::::::::::: ::::::. .::::::.::..::.: .::::::::::..:::
CCDS75 SHIGCRDQIIFMVGRGYLSPDLSKISSNCPKAMRRLLSDCLKFQREERPLFPQILATIEL
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640
pF1KB4 LQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF
::.:::::.::::::::::. ..... :: :... .:
CCDS75 LQRSLPKIERSASEPSLHRT-QADELPACLLSAARLVP
580 590 600
>>CCDS5863.1 BRAF gene_id:673|Hs108|chr7 (766 aa)
initn: 2298 init1: 1666 opt: 1797 Z-score: 1064.7 bits: 207.5 E(32554): 5.6e-53
Smith-Waterman score: 2368; 56.5% identity (78.1% similar) in 672 aa overlap (5-647:97-755)
10 20
pF1KB4 MEHIQGAWKTISNGFGFK-------DAVFDGSSC
: ....:: :. :.: ..::
CCDS58 KFGGEHNPPSIYLEAYEEYTSKLDALQQREQQLLESLGNGTDFSVSSSASMDTVTSSSSS
70 80 90 100 110 120
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 ISPTIVQQFGYQRRASDDGKLTDPSKTSNTIRVFLPNKQRTVVNVRNGMSLHDCLMKALK
.. .... . .: .. . : . .:::::::::::: .: :....: : :::
CCDS58 SLSVLPSSLSVFQNPTDVARSNPKSPQKPIVRVFLPNKQRTVVPARCGVTVRDSLKKALM
130 140 150 160 170 180
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 VRGLQPECCAVFRLLHEHKGKKARLDWNTDAASLIGEELQVDFLDHVPLTTHNFARKTFL
.::: ::::::.:. . :.: . :.:: . : ::::.:. :..::::::::.::::.
CCDS58 MRGLIPECCAVYRI---QDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTTHNFVRKTFF
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 KLAFCDICQKFLLNGFRCQTCGYKFHEHCSTKVPTMCVDWSNIRQLLLFPNSTIGDSGVP
:::::.:.:.:..::::::::::::..:::.:: :::..... ::: .. . .:
CCDS58 TLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLD--LLFVSKFFEHHPIP
250 260 270 280 290 300
210 220 230 240 250
pF1KB4 ---------ALPSLTMRRMRESVSRMP---VSSQHRYSTPHAFTFNTSSPSSEGSLSQRQ
:: : . : : : .: . : : : .. . .....::.
CCDS58 QEEASLAETALTSGSSPSAPASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQPFRPADEDHRNQFGQRD
310 320 330 340 350 360
260 270 280 290 300
pF1KB4 RSTSTPNVHMVSTTLPVDSRMIEDAIRSHS---ESASPSALSSSPNNLSPTGWSQ----P
::.:.:::: ..: ::. :.: ::... ...: ..::..: : . ..
CCDS58 RSSSAPNVH-INTIEPVN---IDDLIRDQGFRGDGGSTTGLSATPPASLPGSLTNVKALQ
370 380 390 400 410
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 KTPVPAQRERAPVSGTQEKNKIRPRGQRDSSYYWEIEASEVMLSTRIGSGSFGTVYKGKW
:.: : :::: :.....:... :.:::: ::: ... .. :::::::::::::::
CCDS58 KSPGP-QRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKW
420 430 440 450 460 470
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 HGDVAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKTRHVNILLFMGYMTKDNLAIVTQWCEGSS
:::::::.:.:. :::.:.:::.:::.:::::::::::::::: :: .::::::::::::
CCDS58 HGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSS
480 490 500 510 520 530
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 LYKHLHVQETKFQMFQLIDIARQTAQGMDYLHAKNIIHRDMKSNNIFLHEGLTVKIGDFG
::.:::. ::::.:..::::::::::::::::::.:::::.::::::::: :::::::::
CCDS58 LYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFG
540 550 560 570 580 590
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 LATVKSRWSGSQQVEQPTGSVLWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMTGELPY
:::::::::::.: :: .::.::::::::::::.::.:::::::..::::::::::.:::
CCDS58 LATVKSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPY
600 610 620 630 640 650
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 SHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFPQILSSIEL
:.::::::::::::::: ::::::. .:::::::::.:.:.:: ..:::::::::.::::
CCDS58 SNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIEL
660 670 680 690 700 710
610 620 630 640
pF1KB4 LQHSLPKINRSASEPSLHRAA-HTEDIN--ACTLTTSPRLPVF
: .:::::.::::::::.::. .:::.. ::. ::. :.
CCDS58 LARSLPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYACA---SPKTPIQAGGYGAFPVH
720 730 740 750 760
>>CCDS59164.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX (186 aa)
initn: 423 init1: 423 opt: 645 Z-score: 404.3 bits: 83.3 E(32554): 3.4e-16
Smith-Waterman score: 645; 63.6% identity (85.3% similar) in 143 aa overlap (50-192:13-152)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 AVFDGSSCISPTIVQQFGYQRRASDDGKLTDPSKTSNTIRVFLPNKQRTVVNVRNGMSLH
.::.. .:..:.:::::::::.::.:::..
CCDS59 MEPPRGPPANGAEPSRAVGTVKVYLPNKQRTVVTVRDGMSVY
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 DCLMKALKVRGLQPECCAVFRLLHEHKGKKARLDWNTDAASLIGEELQVDFLDHVPLTTH
: : ::::::::. .::.:.::. ::.:. :.: : : :::: :. :. :::: :
CCDS59 DSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLI---KGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTMH
50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 NFARKTFLKLAFCDICQKFLLNGFRCQTCGYKFHEHCSTKVPTMCVDWSNIRQLLLFPNS
::.::::..:::::.: :::..::::::::::::.:::.::::.::: :. ::
CCDS59 NFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMSTNRQQFYHSVQ
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 TIGDSGVPALPSLTMRRMRESVSRMPVSSQHRYSTPHAFTFNTSSPSSEGSLSQRQRSTS
CCDS59 DLSGGSRQHEAPSNRPLNELLTPQGPR
160 170 180
>>CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 (537 aa)
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320 330 340 350 360 370
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::: ..: :.:.:.:: :. : :.:.
CCDS50 RAAGLCCRLVVPCHKGMPRLTDLSVKTKDVWEIPRESLQLIKRLGNGQFGEVWMGTWNGN
240 250 260 270 280 290
380 390 400 410 420
pF1KB4 --VAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKTRHVNILLFMGYMTKDNLAIVTQWCEGSSL
::.: :: .:: .: .:. ...: .: ... ... .... . :::.. . .::
CCDS50 TKVAIKTLKPGTMSPE---SFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSL
300 310 320 330 340 350
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pF1KB4 YKHLHVQETK-FQMFQLIDIARQTAQGMDYLHAKNIIHRDMKSNNIFLHEGLTVKIGDFG
:. : . ... .:.:.: :.: :: :.. : ::::..: ::.. .:: ::.:::
CCDS50 LDFLKDGEGRALKLPNLVDMAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFG
360 370 380 390 400 410
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pF1KB4 LATV--KSRWSGSQQVEQPTGSVLWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMT-GE
:: . ..... : .. : . : :::. . . :...:::.:.::.: ::.: :.
CCDS50 LARLIEDNEYTARQGAKFP---IKWTAPEAALY---GRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGR
420 430 440 450 460
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LPYSHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFPQILSS
.:: .:::. .. .: ::: : ..:: ....:. : :: :::: : . :
CCDS50 VPYPGMNNRE-VLEQVERGYRMP----CPQDCPISLHELMIHCWKKDPEERPTFEYLQSF
470 480 490 500 510
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pF1KB4 IELLQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF
.:
CCDS50 LEDYFTATEPQYQPGENL
520 530
>>CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 (543 aa)
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300 310 320 330 340 350
pF1KB4 LSPTGWSQPKTPVPAQRERAPVSGTQEKNKIRPRGQRDSSYYWEIEASEVMLSTRIGSGS
..:. : .. ::: . : ...:.:
CCDS11 AQFDTLQKLVKHYTEHADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGC
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360 370 380 390 400 410
pF1KB4 FGTVYKGKWHGDVAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKTRHVNILLFMGYMTKDNLAI
:: :. : :.: . : : :.. : . .:: .:. ...: :: ... ... .... . :
CCDS11 FGEVWMGTWNGTTKVAI-KTLKPGTMMPEAFLQEAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSEEPIYI
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 VTQWCEGSSLYKHLHVQETKF-QMFQLIDIARQTAQGMDYLHAKNIIHRDMKSNNIFLHE
::.. .:: :. . :. .. ::.:.: : :.:: :.. : ::::... ::.. :
CCDS11 VTEFMSKGSLLDFLKEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGE
350 360 370 380 390 400
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 GLTVKIGDFGLATV--KSRWSGSQQVEQPTGSVLWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGI
.:. ::.::::: . ..... : .. : . : :::. . . :...:::.:.::
CCDS11 NLVCKIADFGLARLIEDNEYTARQGAKFP---IKWTAPEAALY---GRFTIKSDVWSFGI
410 420 430 440 450 460
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 VLYELMT-GELPYSHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEE
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CCDS11 LQTELVTKGRVPYPGMVNRE-VLEQVERGYRMP----CPQGCPESLHELMNLCWKKDPDE
470 480 490 500 510
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pF1KB4 RPLFPQILSSIELLQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF
:: : : : .:
CCDS11 RPTFEYIQSFLEDYFTATEPQYQPGENL
520 530 540
>>CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 (536 aa)
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310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SPTGWSQPKTPVPAQRERAPVSGTQEKNKIRPRGQRDSSYYWEIEASEVMLSTRIGSGSF
.:. : .. ::: . : ...:.: :
CCDS13 QFNSLQQLVAYYSKHADGLCHRLTTVCPTSKPQTQGLAKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCF
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410
pF1KB4 GTVYKGKWHGD--VAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKTRHVNILLFMGYMTKDNLA
: :. : :.: ::.: :: .:: :: .:. :..: :: ... ... .... .
CCDS13 GEVWMGTWNGTTRVAIKTLKPGTMSPE---AFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIY
290 300 310 320 330
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pF1KB4 IVTQWCEGSSLYKHLHVQETKF-QMFQLIDIARQTAQGMDYLHAKNIIHRDMKSNNIFLH
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CCDS13 IVTEYMSKGSLLDFLKGETGKYLRLPQLVDMAAQIASGMAYVERMNYVHRDLRAANILVG
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 EGLTVKIGDFGLATV--KSRWSGSQQVEQPTGSVLWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYG
:.:. :..::::: . ..... : .. : . : :::. . . :...:::.:.:
CCDS13 ENLVCKVADFGLARLIEDNEYTARQGAKFP---IKWTAPEAALY---GRFTIKSDVWSFG
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 IVLYELMT-GELPYSHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKE
:.: :: : :..:: . ::. .. .: ::: : .::.... :. .: .: :
CCDS13 ILLTELTTKGRVPYPGMVNRE-VLDQVERGYRMP----CPPECPESLHDLMCQCWRKEPE
460 470 480 490 500
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pF1KB4 ERPLFPQILSSIELLQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF
::: : . . .:
CCDS13 ERPTFEYLQAFLEDYFTSTEPQYQPGENL
510 520 530
>>CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 (534 aa)
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::. . : ..:.: :. :. : :.:.
CCDS50 YSEKADGLCFNLTVIASSCTPQTSGLAKDAWEVARRSLCLEKKLGQGCFAEVWLGTWNGN
240 250 260 270 280 290
380 390 400 410 420
pF1KB4 --VAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKTRHVNILLFMGYMTKDNLAIVTQWCEGSSL
::.: :: .:: .: .:. ...: .: ... ... .... . :::.. . .::
CCDS50 TKVAIKTLKPGTMSPE---SFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSL
300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 YKHLHVQETK-FQMFQLIDIARQTAQGMDYLHAKNIIHRDMKSNNIFLHEGLTVKIGDFG
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CCDS50 LDFLKDGEGRALKLPNLVDMAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANILVGNGLICKIADFG
350 360 370 380 390 400
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 LATV--KSRWSGSQQVEQPTGSVLWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMT-GE
:: . ..... : .. : . : :::. . . :...:::.:.::.: ::.: :.
CCDS50 LARLIEDNEYTARQGAKFP---IKWTAPEAALY---GRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGR
410 420 430 440 450 460
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LPYSHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFPQILSS
.:: .:::. .. .: ::: : ..:: ....:. : :: :::: : . :
CCDS50 VPYPGMNNRE-VLEQVERGYRMP----CPQDCPISLHELMIHCWKKDPEERPTFEYLQSF
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pF1KB4 IELLQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF
.:
CCDS50 LEDYFTATEPQYQPGENL
520 530
>>CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 (505 aa)
initn: 426 init1: 169 opt: 517 Z-score: 325.4 bits: 70.1 E(32554): 8.4e-12
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pF1KB4 NLSPTGWSQPKTPVPAQRERAPVSGTQEKNKIRPRGQRDSSY----YWEIEASEVMLSTR
::. . : :: :::. . ..: :
CCDS51 RRIFSTLNEFVSHYTKTSDGLCVKLGKPCLKIQVPAPFDLSYKTVDQWEIDRNSIQLLKR
180 190 200 210 220 230
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 IGSGSFGTVYKGKWHGD--VAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKTRHVNILLFMGYM
.:::.:: :..: :.. :::: :: . :..: .: :. .... :: ... ...
CCDS51 LGSGQFGEVWEGLWNNTTPVAVKTLKPGSMDPNDF--LR-EAQIMKNLRHPKLIQLYAVC
240 250 260 270 280 290
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pF1KB4 T-KDNLAIVTQWCEGSSLYKHLHVQE-TKFQMFQLIDIARQTAQGMDYLHAKNIIHRDMK
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CCDS51 TLEDPIYIITELMRHGSLQEYLQNDTGSKIHLTQQVDMAAQVASGMAYLESRNYIHRDLA
300 310 320 330 340 350
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pF1KB4 SNNIFLHEGLTVKIGDFGLATV-----KSRWSGSQQVEQPTGSVLWMAPEVIRMQDNNPF
. :... : :..::::: : .. . . .... : : : :::.:: .: :
CCDS51 ARNVLVGEHNIYKVADFGLARVFKVDNEDIYESRHEIKLP---VKWTAPEAIR---SNKF
360 370 380 390 400 410
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pF1KB4 SFQSDVYSYGIVLYELMT-GELPYSHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRL
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CCDS51 SIKSDVWSFGILLYEIITYGKMPYSGMTGA-QVIQMLAQNYRLPQPS----NCPQQFYNI
420 430 440 450 460
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pF1KB4 VADCVKKVKEERPLFPQILSSIELLQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPR
. .: . .::: : . ..:
CCDS51 MLECWNAEPKERPTFETLRWKLEDYFETDSSYSDANNFIR
470 480 490 500
648 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 15:10:25 2016 done: Thu Nov 3 15:10:25 2016
Total Scan time: 3.760 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]