FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4594, 706 aa
1>>>pF1KB4594 706 - 706 aa - 706 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2825+/-0.000525; mu= -7.8919+/- 0.033
mean_var=425.3051+/-88.750, 0's: 0 Z-trim(119.6): 1843 B-trim: 1815 in 1/54
Lambda= 0.062190
statistics sampled from 31759 (33907) to 31759 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.719), E-opt: 0.2 (0.398), width: 16
Scan time: 13.080
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005247751 (OMIM: 109565) PREDICTED: B-cell lymp ( 706) 4888 453.7 1.1e-126
NP_001697 (OMIM: 109565) B-cell lymphoma 6 protein ( 706) 4888 453.7 1.1e-126
NP_001124317 (OMIM: 109565) B-cell lymphoma 6 prot ( 706) 4888 453.7 1.1e-126
XP_011511364 (OMIM: 109565) PREDICTED: B-cell lymp ( 650) 3857 361.2 7.4e-99
NP_001128210 (OMIM: 109565) B-cell lymphoma 6 prot ( 650) 3857 361.2 7.4e-99
NP_862827 (OMIM: 608992) B-cell CLL/lymphoma 6 mem ( 480) 1022 106.7 2.2e-22
XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 518) 618 70.5 1.9e-11
NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 531) 618 70.5 1.9e-11
XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 536) 618 70.5 1.9e-11
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 618 70.5 2.1e-11
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 618 70.6 2.2e-11
XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 640) 618 70.6 2.2e-11
XP_016873758 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 592) 617 70.4 2.2e-11
XP_006718372 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 592) 617 70.4 2.2e-11
XP_005253186 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 592) 617 70.4 2.2e-11
XP_011518659 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 592) 617 70.4 2.2e-11
XP_005253185 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 606) 617 70.5 2.3e-11
NP_037381 (OMIM: 605015) zinc finger protein 214 [ ( 606) 617 70.5 2.3e-11
XP_006718371 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 606) 617 70.5 2.3e-11
XP_011518657 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 617) 617 70.5 2.3e-11
XP_005272399 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 542) 613 70.0 2.7e-11
XP_005272398 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 613 70.1 3.1e-11
NP_008889 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 [H ( 682) 613 70.1 3.1e-11
XP_011515600 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 613 70.1 3.1e-11
NP_001025147 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 ( 682) 613 70.1 3.1e-11
NP_001284554 (OMIM: 613910) zinc finger protein 48 ( 458) 598 68.6 6.1e-11
NP_001284553 (OMIM: 613910) zinc finger protein 48 ( 492) 598 68.7 6.4e-11
NP_653285 (OMIM: 613910) zinc finger protein 480 i ( 535) 598 68.7 6.8e-11
XP_011524767 (OMIM: 613910) PREDICTED: zinc finger ( 535) 598 68.7 6.8e-11
XP_016882717 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 600 69.0 6.8e-11
XP_016882718 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 600 69.0 6.8e-11
XP_016882719 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 600 69.0 6.8e-11
XP_016882706 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 600 69.0 7.1e-11
XP_016882712 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 600 69.0 7.1e-11
XP_016882708 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 600 69.0 7.1e-11
XP_016882716 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 600 69.0 7.1e-11
XP_016882709 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 600 69.0 7.1e-11
XP_016882707 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 600 69.0 7.1e-11
XP_016882714 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 600 69.0 7.1e-11
NP_003416 (OMIM: 194554) zinc finger protein 45 [H ( 682) 600 69.0 7.1e-11
XP_016882711 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 600 69.0 7.1e-11
XP_011525571 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 600 69.0 7.1e-11
XP_011525575 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 600 69.0 7.1e-11
XP_011525573 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 600 69.0 7.1e-11
XP_016882715 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 600 69.0 7.1e-11
XP_016882713 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 600 69.0 7.1e-11
XP_016882710 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 600 69.0 7.1e-11
XP_011525569 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 600 69.0 7.1e-11
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 604 69.5 7.5e-11
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 604 69.5 7.5e-11
>>XP_005247751 (OMIM: 109565) PREDICTED: B-cell lymphoma (706 aa)
initn: 4888 init1: 4888 opt: 4888 Z-score: 2395.3 bits: 453.7 E(85289): 1.1e-126
Smith-Waterman score: 4888; 100.0% identity (100.0% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-706)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACSGLFYSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACSGLFYSI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 FTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 CRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPGCESRAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPGCESRAF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 APSLYSGLSTPPASYSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPCDSARPVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 APSLYSGLSTPPASYSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPCDSARPVPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EYSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EYSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 KEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNACILQASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNACILQASG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAELGRLSPRAYTAPPACQPPMEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAELGRLSPRAYTAPPACQPPMEP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ENLDLQSPTKLSASGEDSTIPQASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ENLDLQSPTKLSASGEDSTIPQASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 PYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB4 EKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
670 680 690 700
>>NP_001697 (OMIM: 109565) B-cell lymphoma 6 protein iso (706 aa)
initn: 4888 init1: 4888 opt: 4888 Z-score: 2395.3 bits: 453.7 E(85289): 1.1e-126
Smith-Waterman score: 4888; 100.0% identity (100.0% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-706)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACSGLFYSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACSGLFYSI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 FTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 CRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPGCESRAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPGCESRAF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 APSLYSGLSTPPASYSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPCDSARPVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APSLYSGLSTPPASYSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPCDSARPVPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EYSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EYSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 KEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNACILQASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNACILQASG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAELGRLSPRAYTAPPACQPPMEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAELGRLSPRAYTAPPACQPPMEP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ENLDLQSPTKLSASGEDSTIPQASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ENLDLQSPTKLSASGEDSTIPQASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 PYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB4 EKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
670 680 690 700
>>NP_001124317 (OMIM: 109565) B-cell lymphoma 6 protein (706 aa)
initn: 4888 init1: 4888 opt: 4888 Z-score: 2395.3 bits: 453.7 E(85289): 1.1e-126
Smith-Waterman score: 4888; 100.0% identity (100.0% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-706)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACSGLFYSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACSGLFYSI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 FTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 CRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPGCESRAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPGCESRAF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 APSLYSGLSTPPASYSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPCDSARPVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APSLYSGLSTPPASYSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPCDSARPVPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EYSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EYSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 KEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNACILQASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNACILQASG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAELGRLSPRAYTAPPACQPPMEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAELGRLSPRAYTAPPACQPPMEP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ENLDLQSPTKLSASGEDSTIPQASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ENLDLQSPTKLSASGEDSTIPQASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 PYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB4 EKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
670 680 690 700
>>XP_011511364 (OMIM: 109565) PREDICTED: B-cell lymphoma (650 aa)
initn: 4015 init1: 3857 opt: 3857 Z-score: 1895.8 bits: 361.2 E(85289): 7.4e-99
Smith-Waterman score: 4361; 92.1% identity (92.1% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-650)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACSGLFYSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACSGLFYSI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 FTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 CRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPGCESRAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPGCESRAF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 APSLYSGLSTPPASYSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPCDSARPVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APSLYSGLSTPPASYSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPCDSARPVPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EYSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EYSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 KEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNACILQASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNACILQASG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAELGRLSPRAYTAPPACQPPMEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAELGRLSPRAYTAPPACQPPMEP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ENLDLQSPTKLSASGEDSTIPQASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ENLDLQSPTKLSASGEDSTIPQASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQT
:::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSC---------------------------
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550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEK
:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 -----------------------------GEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEK
520 530 540
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pF1KB4 PYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHC
550 560 570 580 590 600
670 680 690 700
pF1KB4 EKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
610 620 630 640 650
>>NP_001128210 (OMIM: 109565) B-cell lymphoma 6 protein (650 aa)
initn: 4015 init1: 3857 opt: 3857 Z-score: 1895.8 bits: 361.2 E(85289): 7.4e-99
Smith-Waterman score: 4361; 92.1% identity (92.1% similar) in 706 aa overlap (1-706:1-650)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACSGLFYSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACSGLFYSI
10 20 30 40 50 60
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pF1KB4 FTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQMEHVVDT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 CRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPGCESRAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPGCESRAF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 APSLYSGLSTPPASYSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPCDSARPVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APSLYSGLSTPPASYSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPCDSARPVPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EYSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EYSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 KEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNACILQASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNACILQASG
310 320 330 340 350 360
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pF1KB4 SPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAELGRLSPRAYTAPPACQPPMEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAELGRLSPRAYTAPPACQPPMEP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ENLDLQSPTKLSASGEDSTIPQASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ENLDLQSPTKLSASGEDSTIPQASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQT
:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSC---------------------------
490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEK
:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -----------------------------GEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEK
520 530 540
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 PYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHC
550 560 570 580 590 600
670 680 690 700
pF1KB4 EKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
610 620 630 640 650
>>NP_862827 (OMIM: 608992) B-cell CLL/lymphoma 6 member (480 aa)
initn: 2422 init1: 978 opt: 1022 Z-score: 522.8 bits: 106.7 E(85289): 2.2e-22
Smith-Waterman score: 1238; 39.9% identity (53.4% similar) in 685 aa overlap (10-693:16-476)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVLMACS
.::::.:::: :::.:: : :::::...:. . .::::.::.:::
NP_862 MGSPAAPEGALGYVREFTRHSSDVLGNLNELRLRGILTDVTLLVGGQPLRAHKAVLIACS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 GLFYSIFTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREGNIMAVMATAMYLQM
:.::::: . ...:..: . .:: :::::::::: : .. ::.:.: ::::
NP_862 GFFYSIFRGRAGVGVDVLSLPGGPEARGFAPLLDFMYTSRLRLSPATAPAVLAAATYLQM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 EHVVDTCRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLMPQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPG
::::..:..::.:: :. ::
NP_862 EHVVQACHRFIQAS----------------------------YE---------PL-----
130
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 CESRAFAPSLYSGLSTPPASYSMYSHLPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPCDS
:.: :
NP_862 ------------GISLRP------------------------------------------
140
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 ARPVPGEYSRPTLEVSPNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPAAPSARNAPYF
::. : :. :.:
NP_862 ------------LEAEP-------------------------------PTPPTA------
150
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 PCDKASKEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSSKNAC
:: : ::..:. .:. :::: : :
NP_862 -----------------------PP-----------PGSPRRSEGHPDPPTESRS----C
160 170
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 ILQASGSPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAELGRLSPRAYTAPPAC
: .::. . :::::::::::.::::: .:. : .: . .: : :
NP_862 ----SQGPPSPASPDPKACNWKKYKYIVLNS---QASQAGSLVGERSSGQP----CPQAR
180 190 200 210 220
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 QPPMEPENLDLQSPTKLSASGEDSTIP-QASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPP
: .. . .: .. :.:.:.. :: :::. . : . . .. . .: .
NP_862 LPS--GDEASSSSSSSSSSSSEEGPIPGPQSRLSPT---AATVQFKCGAPASTPYLLTSQ
230 240 250 260 270 280
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 KCTSCGSQSPQHAEMCLHTAGPTFPEEMGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSEEASL
. :: : . : : .: : ::. : :..:. . ..:
NP_862 AQDTSGSPSER--------ARP-LP---G---SEF---------FSCQNCEAVAGCSSGL
290 300 310
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 KRHTLQTHSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHT
. ::::::. :..:::::::::::.:::::::::.:.::::.::::::::::.
NP_862 DS-LVPGDEDKPYKCQLCRSSFRYKGNLASHRTVHTGEKPYHCSICGARFNRPANLKTHS
320 330 340 350 360 370
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 RIHSGEKPYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHT
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::
NP_862 RIHSGEKPYKCETCGSRFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCPTCGTRFRHLQTLKSHVRIHT
380 390 400 410 420 430
660 670 680 690 700
pF1KB4 GEKPYHCEKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
:::::::. :.::::::::::::::::::: :::::.:..
NP_862 GEKPYHCDPCGLHFRHKSQLRLHLRQKHGAATNTKVHYHILGGP
440 450 460 470 480
>>XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger pro (518 aa)
initn: 2617 init1: 575 opt: 618 Z-score: 326.5 bits: 70.5 E(85289): 1.9e-11
Smith-Waterman score: 646; 42.3% identity (66.2% similar) in 222 aa overlap (472-682:152-373)
450 460 470 480 490
pF1KB4 QASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGSQSPQHAEMC----LHTAGPTF
: :: ::. : ... .::. .
XP_016 VNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPY
130 140 150 160 170 180
500 510 520 530 540 550
pF1KB4 P-EEMGETQSEYSDSSCEN----GA--FFCNECDCRFSEEASLKRHTLQTHSDKPYKCDR
:: :.: ...: . .. : . :.:: :.. ..: : ..:::::..
XP_016 KCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEE
190 200 210 220 230 240
560 570 580 590 600 610
pF1KB4 CQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEKPYKCETCGAR
: .:. ..::..:: .:::::::.:. :: ::. :.: :: ::.:::::::: ::
XP_016 CGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKA
250 260 270 280 290 300
620 630 640 650 660 670
pF1KB4 FVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHCEKCNLHFRHK
: . .:: .: .:::::::: :. :: :.: .:: .: ::::::::.:..:. : ..
XP_016 FNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQS
310 320 330 340 350 360
680 690 700
pF1KB4 SQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
:.: : . . :
XP_016 SKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLT
370 380 390 400 410 420
>--
initn: 1254 init1: 501 opt: 519 Z-score: 278.5 bits: 61.6 E(85289): 9e-09
Smith-Waterman score: 519; 52.2% identity (70.9% similar) in 134 aa overlap (543-676:374-507)
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 CENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQTHSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEK
.:::.:..: .: ..::. :: :: ::
XP_016 TGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEK
350 360 370 380 390 400
580 590 600 610 620 630
pF1KB4 PYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEKPYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPC
::.:. :: :. :..: : ::.:::::::: :: : : ..: : :::::::: :
XP_016 PYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTC
410 420 430 440 450 460
640 650 660 670 680 690
pF1KB4 EICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHCEKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYR
: :: : . ..: .: :::::::::.::.:. :. .: : :
XP_016 EECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
470 480 490 500 510
700
pF1KB4 VSATDLPPELPKAC
>>NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 iso (531 aa)
initn: 2617 init1: 575 opt: 618 Z-score: 326.4 bits: 70.5 E(85289): 1.9e-11
Smith-Waterman score: 646; 42.3% identity (66.2% similar) in 222 aa overlap (472-682:165-386)
450 460 470 480 490
pF1KB4 QASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGSQSPQHAEMC----LHTAGPTF
: :: ::. : ... .::. .
NP_001 VNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPY
140 150 160 170 180 190
500 510 520 530 540 550
pF1KB4 P-EEMGETQSEYSDSSCEN----GA--FFCNECDCRFSEEASLKRHTLQTHSDKPYKCDR
:: :.: ...: . .. : . :.:: :.. ..: : ..:::::..
NP_001 KCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEE
200 210 220 230 240 250
560 570 580 590 600 610
pF1KB4 CQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEKPYKCETCGAR
: .:. ..::..:: .:::::::.:. :: ::. :.: :: ::.:::::::: ::
NP_001 CGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKA
260 270 280 290 300 310
620 630 640 650 660 670
pF1KB4 FVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHCEKCNLHFRHK
: . .:: .: .:::::::: :. :: :.: .:: .: ::::::::.:..:. : ..
NP_001 FNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQS
320 330 340 350 360 370
680 690 700
pF1KB4 SQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPPELPKAC
:.: : . . :
NP_001 SKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLT
380 390 400 410 420 430
>--
initn: 1254 init1: 501 opt: 519 Z-score: 278.4 bits: 61.6 E(85289): 9.1e-09
Smith-Waterman score: 519; 52.2% identity (70.9% similar) in 134 aa overlap (543-676:387-520)
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 CENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQTHSDKPYKCDRCQASFRYKGNLASHKTVHTGEK
.:::.:..: .: ..::. :: :: ::
NP_001 TGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEK
360 370 380 390 400 410
580 590 600 610 620 630
pF1KB4 PYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEKPYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPC
::.:. :: :. :..: : ::.:::::::: :: : : ..: : :::::::: :
NP_001 PYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTC
420 430 440 450 460 470
640 650 660 670 680 690
pF1KB4 EICGTRFRHLQTLKSHLRIHTGEKPYHCEKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYR
: :: : . ..: .: :::::::::.::.:. :. .: : :
NP_001 EECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
480 490 500 510 520 530
700
pF1KB4 VSATDLPPELPKAC
>>XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger pro (536 aa)
initn: 2617 init1: 575 opt: 618 Z-score: 326.3 bits: 70.5 E(85289): 1.9e-11
Smith-Waterman score: 646; 42.3% identity (66.2% similar) in 222 aa overlap (472-682:170-391)
450 460 470 480 490
pF1KB4 QASRLNNIVNRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGSQSPQHAEMC----LHTAGPTF
: :: ::. : ... .::. .
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]