FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4626, 770 aa
1>>>pF1KB4626 770 - 770 aa - 770 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8554+/-0.00103; mu= 4.7723+/- 0.062
mean_var=222.5681+/-43.384, 0's: 0 Z-trim(112.0): 77 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.085969
statistics sampled from 12749 (12824) to 12749 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.733), E-opt: 0.2 (0.394), width: 16
Scan time: 4.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42290.1 GIT1 gene_id:28964|Hs108|chr17 ( 770) 5118 648.2 1.4e-185
CCDS11250.1 GIT1 gene_id:28964|Hs108|chr17 ( 761) 3309 423.9 4.8e-118
CCDS44968.1 GIT2 gene_id:9815|Hs108|chr12 ( 729) 2538 328.2 2.9e-89
CCDS9138.1 GIT2 gene_id:9815|Hs108|chr12 ( 759) 2528 327.0 7e-89
CCDS9139.1 GIT2 gene_id:9815|Hs108|chr12 ( 471) 2434 315.2 1.6e-85
CCDS44969.1 GIT2 gene_id:9815|Hs108|chr12 ( 631) 2373 307.7 3.7e-83
CCDS55884.1 GIT2 gene_id:9815|Hs108|chr12 ( 681) 2238 291.0 4.3e-78
CCDS81737.1 GIT2 gene_id:9815|Hs108|chr12 ( 421) 2218 288.3 1.7e-77
CCDS81736.1 GIT2 gene_id:9815|Hs108|chr12 ( 708) 2217 288.4 2.7e-77
>>CCDS42290.1 GIT1 gene_id:28964|Hs108|chr17 (770 aa)
initn: 5118 init1: 5118 opt: 5118 Z-score: 3445.2 bits: 648.2 E(32554): 1.4e-185
Smith-Waterman score: 5118; 100.0% identity (100.0% similar) in 770 aa overlap (1-770:1-770)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HKNGHYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRRE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 NDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KRRQQGKSLSSPTDNLELSLRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGATRSNRARSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KRRQQGKSLSSPTDNLELSLRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGATRSNRARSM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 DSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHKLQAENLQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHKLQAENLQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPPGDELTTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPPGDELTTRL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 SGADSDYENTQSGDPLLGLEGKRFLELGKEEDFHPELESLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SGADSDYENTQSGDPLLGLEGKRFLELGKEEDFHPELESLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 VTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFPKRPALEPVRSSLRLLNASAYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFPKRPALEPVRSSLRLLNASAYR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KB4 LQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTREKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTREKKQ
730 740 750 760 770
>>CCDS11250.1 GIT1 gene_id:28964|Hs108|chr17 (761 aa)
initn: 3307 init1: 3307 opt: 3309 Z-score: 2232.7 bits: 423.9 E(32554): 4.8e-118
Smith-Waterman score: 5026; 98.8% identity (98.8% similar) in 770 aa overlap (1-770:1-761)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 HKNGHYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRRE
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HKNGHYIIPQMAD---------SLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRRE
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 NDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSEA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KRRQQGKSLSSPTDNLELSLRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGATRSNRARSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KRRQQGKSLSSPTDNLELSLRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGATRSNRARSM
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 DSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHKLQAENLQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHKLQAENLQL
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPPGDELTTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPPGDELTTRL
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 SGADSDYENTQSGDPLLGLEGKRFLELGKEEDFHPELESLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SGADSDYENTQSGDPLLGLEGKRFLELGKEEDFHPELESLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQ
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 VTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFPKRPALEPVRSSLRLLNASAYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFPKRPALEPVRSSLRLLNASAYR
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770
pF1KB4 LQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTREKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTREKKQ
720 730 740 750 760
>>CCDS44968.1 GIT2 gene_id:9815|Hs108|chr12 (729 aa)
initn: 3011 init1: 1468 opt: 2538 Z-score: 1716.2 bits: 328.2 E(32554): 2.9e-89
Smith-Waterman score: 3106; 64.0% identity (79.1% similar) in 788 aa overlap (1-767:1-726)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
::.. .:::::::.:::.:::..::...:::::::::::::::: :.::.:. :::::
CCDS44 MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFLCDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
::::.:: .:::::::::::::::...:::::::::::::: :.::::::::::::::.:
CCDS44 LQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::::
CCDS44 PCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
::::::.:::::::. : .:.::.:::::.::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS44 LQAELLAVYGADPGTQDSSGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB4 HKNG-HYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRR
:::: :.::::::: .::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
CCDS44 HKNGQHFIIPQMAD--------SSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRR
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 ENDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSE
:.:::::::::::.:::: ..:::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::::.
CCDS44 ETDAVWLATQNHSALVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 AKRRQQGKSLSSPTDNLELSLRS-------QSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGAT
:::::::.:::. ::.:: :.. .:. .:: :::::::::::: : : :.
CCDS44 AKRRQQGSSLSGSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLE----TTAS
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 RSNRARSMDSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHK
..:: .:.:: ::::: ::.::..:.:.::..::::.:::::::..:::::: .:....
CCDS44 KTNRQKSLDS-DLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLQT
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KB4 LQAENLQLRQPPGP----VPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPF
::.:: .::. : : .. ..:. . :. : . .:::: ::. ::.
CCDS44 LQSENSNLRKQATTNVYQVQTGSEYTDTSNHSSLKRRPSA--RGSRPMSMYETGSGQKPY
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 GGPPGD-----ELTTRLQPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLL
: :. : ::::: ::
CCDS44 L-PMGEASRPEESRMRLQPF---------------PA-----------------------
530 540
590 600 610 620 630
pF1KB4 SCSQEGSRHTSKLSRHGSGADSDYENTQSGDPLLGL----EGKRFLELGKEEDFHPELES
:.:.: ...: .:::.:: . :. .:.. . . . :.
CCDS44 --------HASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDGMGSSRKGRQRSMVWPGDGLVPDTAE
550 560 570 580 590
640 650 660 670 680 690
pF1KB4 LDGDLDPGLPSTEDVILKTEQVTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFP
.: :::::::: ::::.::::::::::::: ::::..::::.::.::::::.:::
CCDS44 PHVAPSPTLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALFP
600 610 620 630 640 650
700 710 720 730 740 750
pF1KB4 KRPALEPVRSSLRLLNASAYRLQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQ
:.: . ::.:::::..:::::::::.::.: .::.:.: ::.:::::::::::::::::
CCDS44 KKPKSDMVRTSLRLLTSSAYRLQSECKKTLPGDPGSPTDVQLVTQQVIQCAYDIAKAAKQ
660 670 680 690 700 710
760 770
pF1KB4 LVTITTREKKQ
::::::.:
CCDS44 LVTITTKENNN
720
>>CCDS9138.1 GIT2 gene_id:9815|Hs108|chr12 (759 aa)
initn: 3006 init1: 1468 opt: 2528 Z-score: 1709.2 bits: 327.0 E(32554): 7e-89
Smith-Waterman score: 3194; 65.1% identity (81.5% similar) in 789 aa overlap (1-767:1-756)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
::.. .:::::::.:::.:::..::...:::::::::::::::: :.::.:. :::::
CCDS91 MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFLCDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
::::.:: .:::::::::::::::...:::::::::::::: :.::::::::::::::.:
CCDS91 LQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::::
CCDS91 PCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
::::::.:::::::. : .:.::.:::::.::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS91 LQAELLAVYGADPGTQDSSGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB4 HKNG-HYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRR
:::: :.::::::: .::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
CCDS91 HKNGQHFIIPQMAD--------SSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRR
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 ENDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSE
:.:::::::::::.:::: ..:::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::::.
CCDS91 ETDAVWLATQNHSALVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 AKRRQQGKSLSSPTDNLELSLRS-------QSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGAT
:::::::.:::. ::.:: :.. .:. .:: :::::::::::: : : :.
CCDS91 AKRRQQGSSLSGSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLE----TTAS
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 RSNRARSMDSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHK
..:: .:.:: ::::: ::.::..:.:.::..::::.:::::::..:::::: .:....
CCDS91 KTNRQKSLDS-DLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLQT
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KB4 LQAENLQLRQPPGP----VPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPF
::.:: .::. : : .. ..:. . :. : . .:::: ::. ::.
CCDS91 LQSENSNLRKQATTNVYQVQTGSEYTDTSNHSSLKRRPSA--RGSRPMSMYETGSGQKPY
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 GGPPGD-----ELTTRLQPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLL
: :. : ::::: :: . : .:.:..: ::. :
CCDS91 L-PMGEASRPEESRMRLQPF---------------PAHIGRSALVTSSSSLPSFPST--L
530 540 550 560
590 600 610 620 630
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::.: . ::.:::::..:::::::::.::.: .::.:.: ::.::::::::::::::::
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CCDS91 QLVTITTKENNN
750
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CCDS91 KDAN
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CCDS55 ITTKENNN
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