FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4641, 969 aa 1>>>pF1KB4641 969 - 969 aa - 969 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6254+/-0.000997; mu= 15.3259+/- 0.060 mean_var=96.1721+/-19.576, 0's: 0 Z-trim(106.8): 88 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.130783 statistics sampled from 9081 (9169) to 9081 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16 Scan time: 4.630 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS44084.1 USP48 gene_id:84196|Hs108|chr1 ( 485) 3319 637.1 2.5e-182 CCDS81277.1 USP48 gene_id:84196|Hs108|chr1 ( 983) 3319 637.2 4.6e-182 CCDS30623.1 USP48 gene_id:84196|Hs108|chr1 (1035) 3319 637.3 4.8e-182 CCDS41619.1 USP47 gene_id:55031|Hs108|chr11 (1287) 456 97.1 2.4e-19 CCDS60725.1 USP47 gene_id:55031|Hs108|chr11 (1355) 456 97.1 2.5e-19 CCDS81554.1 USP47 gene_id:55031|Hs108|chr11 (1375) 456 97.1 2.5e-19 CCDS46547.1 USP40 gene_id:55230|Hs108|chr2 (1247) 409 88.2 1.1e-16 CCDS59456.1 USP17L12 gene_id:100287205|Hs108|chr4 ( 530) 381 82.8 2e-15 CCDS59462.1 USP17L21 gene_id:100287478|Hs108|chr4 ( 530) 381 82.8 2e-15 CCDS59458.1 USP17L17 gene_id:100287327|Hs108|chr4 ( 530) 378 82.2 3e-15 CCDS59463.1 USP17L22 gene_id:100287513|Hs108|chr4 ( 530) 377 82.0 3.4e-15 CCDS59457.1 USP17L13 gene_id:100287238|Hs108|chr4 ( 530) 376 81.8 3.9e-15 CCDS59466.1 USP17L26 gene_id:728379|Hs108|chr4 ( 530) 374 81.5 5e-15 CCDS59465.1 USP17L25 gene_id:728373|Hs108|chr4 ( 530) 374 81.5 5e-15 CCDS59468.1 USP17L27 gene_id:728393|Hs108|chr4 ( 530) 374 81.5 5e-15 CCDS59460.1 USP17L19 gene_id:100287404|Hs108|chr4 ( 530) 374 81.5 5e-15 CCDS59461.1 USP17L20 gene_id:100287441|Hs108|chr4 ( 530) 374 81.5 5e-15 CCDS59464.1 USP17L24 gene_id:728369|Hs108|chr4 ( 530) 374 81.5 5e-15 CCDS59471.1 USP17L30 gene_id:728419|Hs108|chr4 ( 530) 374 81.5 5e-15 CCDS59455.1 USP17L11 gene_id:100287178|Hs108|chr4 ( 530) 374 81.5 5e-15 CCDS59470.1 USP17L29 gene_id:728405|Hs108|chr4 ( 530) 374 81.5 5e-15 CCDS59469.1 USP17L28 gene_id:728400|Hs108|chr4 ( 530) 374 81.5 5e-15 CCDS59459.1 USP17L18 gene_id:100287364|Hs108|chr4 ( 530) 372 81.1 6.5e-15 CCDS59467.1 USP17L5 gene_id:728386|Hs108|chr4 ( 530) 371 80.9 7.4e-15 CCDS43713.1 USP17L2 gene_id:377630|Hs108|chr8 ( 530) 371 80.9 7.4e-15 CCDS78300.1 USP17L8 gene_id:392188|Hs108|chr8 ( 530) 368 80.3 1.1e-14 CCDS59454.1 USP17L10 gene_id:100287144|Hs108|chr4 ( 530) 363 79.4 2.1e-14 CCDS13752.1 USP18 gene_id:11274|Hs108|chr22 ( 372) 359 78.6 2.6e-14 CCDS77901.1 USP17L15 gene_id:100288520|Hs108|chr4 ( 559) 361 79.0 2.9e-14 CCDS78299.1 USP17L4 gene_id:645402|Hs108|chr8 ( 530) 355 77.9 6e-14 CCDS78305.1 USP17L7 gene_id:392197|Hs108|chr8 ( 530) 354 77.7 6.9e-14 CCDS32755.1 USP36 gene_id:57602|Hs108|chr17 (1123) 356 78.2 1e-13 CCDS78301.1 USP17L3 gene_id:645836|Hs108|chr8 ( 530) 348 76.6 1.5e-13 CCDS78298.1 USP17L1 gene_id:401447|Hs108|chr8 ( 530) 334 73.9 9.4e-13 CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 362) 330 73.1 1.1e-12 CCDS44154.2 USP24 gene_id:23358|Hs108|chr1 (2620) 343 75.9 1.2e-12 CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 396) 330 73.1 1.2e-12 CCDS55403.1 USP9X gene_id:8239|Hs108|chrX (2554) 342 75.7 1.3e-12 CCDS43930.1 USP9X gene_id:8239|Hs108|chrX (2570) 342 75.7 1.3e-12 CCDS14781.1 USP9Y gene_id:8287|Hs108|chrY (2555) 340 75.4 1.7e-12 CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 605) 330 73.2 1.8e-12 CCDS47535.1 USP42 gene_id:84132|Hs108|chr7 (1316) 334 74.1 2.1e-12 CCDS47054.1 USP46 gene_id:64854|Hs108|chr4 ( 359) 321 71.4 3.7e-12 CCDS47053.1 USP46 gene_id:64854|Hs108|chr4 ( 366) 321 71.4 3.7e-12 CCDS42686.1 USP34 gene_id:9736|Hs108|chr2 (3546) 331 73.7 7.2e-12 CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1012) 322 71.8 7.9e-12 CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1118) 322 71.8 8.6e-12 CCDS31952.1 USP12 gene_id:219333|Hs108|chr13 ( 370) 311 69.5 1.4e-11 >>CCDS44084.1 USP48 gene_id:84196|Hs108|chr1 (485 aa) initn: 3319 init1: 3319 opt: 3319 Z-score: 3386.9 bits: 637.1 E(32554): 2.5e-182 Smith-Waterman score: 3319; 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93.4% identity (93.4% similar) in 1001 aa overlap (1-935:1-1001) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MAPRLQLEKAAWRWAETVRPEEVSQEHIETAYRIWLEPCIRGVCRRNCKGNPNCLVGIGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 MAPRLQLEKAAWRWAETVRPEEVSQEHIETAYRIWLEPCIRGVCRRNCKGNPNCLVGIGE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 HIWLGEIDENSFHNIDDPNCERRKKNSFVGLTNLGATCYVNTFLQVWFLNLELRQALYLC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 HIWLGEIDENSFHNIDDPNCERRKKNSFVGLTNLGATCYVNTFLQVWFLNLELRQALYLC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 PSTCSDYMLGDGIQEEKDYEPQTICEHLQYLFALLQNSNRRYIDPSGFVKALGLDTGQQQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 PSTCSDYMLGDGIQEEKDYEPQTICEHLQYLFALLQNSNRRYIDPSGFVKALGLDTGQQQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 DAQEFSKLFMSLLEDTLSKQKNPDVRNIVQQQFCGEYAYVTVCNQCGRESKLLSKFYELE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 DAQEFSKLFMSLLEDTLSKQKNPDVRNIVQQQFCGEYAYVTVCNQCGRESKLLSKFYELE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 LNIQGHKQLTDCISEFLKEEKLEGDNRYFCENCQSKQNATRKIRLLSLPCTLNLQLMRFV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 LNIQGHKQLTDCISEFLKEEKLEGDNRYFCENCQSKQNATRKIRLLSLPCTLNLQLMRFV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 FDRQTGHKKKLNTYIGFSEILDMEPYVEHKGGSYVYELSAVLIHRGVSAYSGHYIAHVKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 FDRQTGHKKKLNTYIGFSEILDMEPYVEHKGGSYVYELSAVLIHRGVSAYSGHYIAHVKD 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 PQSGEWYKFNDEDIEKMEGKKLQLGIEEDLAEPSKSQTRKPKCGKGTHCSRNAYMLVYRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 PQSGEWYKFNDEDIEKMEGKKLQLGIEEDLAEPSKSQTRKPKCGKGTHCSRNAYMLVYRL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 QTQEKPNTTVQVPAFLQELVDRDNSKFEEWCIEMAEMRKQSVDKGKAKHEEVKELYQRLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 QTQEKPNTTVQVPAFLQELVDRDNSKFEEWCIEMAEMRKQSVDKGKAKHEEVKELYQRLP 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 AGA--------------------------------------------------------- ::: CCDS30 AGAEPYEFVSLEWLQKWLDESTPTKPIDNHACLCSHDKLHPDKISIMKRISEYAADIFYS 490 500 510 520 530 540 490 500 510 520 530 pF1KB4 ---------VKALCKECVVERCRILRLKNQLNEDYKTVNNLLKAAVKGSDGFWVGKSSLR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 RYGGGPRLTVKALCKECVVERCRILRLKNQLNEDYKTVNNLLKAAVKGSDGFWVGKSSLR 550 560 570 580 590 600 540 550 560 570 580 590 pF1KB4 SWRQLALEQLDEQDGDAEQSNGKMNGSTLNKDESKEERKEEEELNFNEDILCPHGELCIS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 SWRQLALEQLDEQDGDAEQSNGKMNGSTLNKDESKEERKEEEELNFNEDILCPHGELCIS 610 620 630 640 650 660 600 610 620 630 640 650 pF1KB4 ENERRLVSKEAWSKLQQYFPKAPEFPSYKECCSQCKILEREGEENEALHKMIANEQKTSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 ENERRLVSKEAWSKLQQYFPKAPEFPSYKECCSQCKILEREGEENEALHKMIANEQKTSL 670 680 690 700 710 720 660 670 680 690 700 710 pF1KB4 PNLFQDKNRPCLSNWPEDTDVLYIVSQFFVEEWRKFVRKPTRCSPVSSVGNSALLCPHGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 PNLFQDKNRPCLSNWPEDTDVLYIVSQFFVEEWRKFVRKPTRCSPVSSVGNSALLCPHGG 730 740 750 760 770 780 720 730 740 750 760 770 pF1KB4 LMFTFASMTKEDSKLIALIWPSEWQMIQKLFVVDHVIKITRIEVGDVNPSETQYISEPKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 LMFTFASMTKEDSKLIALIWPSEWQMIQKLFVVDHVIKITRIEVGDVNPSETQYISEPKL 790 800 810 820 830 840 780 790 800 810 820 830 pF1KB4 CPECREGLLCQQQRDLREYTQATIYVHKVVDNKKVMKDSAPELNVSSSETEEDKEEAKPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 CPECREGLLCQQQRDLREYTQATIYVHKVVDNKKVMKDSAPELNVSSSETEEDKEEAKPD 850 860 870 880 890 900 840 850 860 870 880 890 pF1KB4 GEKDPDFNQSNGGTKRQKISHQNYIAYQKQVIRRSMRHRKVRGEKALLVSANQTLKELKI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 GEKDPDFNQSNGGTKRQKISHQNYIAYQKQVIRRSMRHRKVRGEKALLVSANQTLKELKI 910 920 930 940 950 960 900 910 920 930 940 950 pF1KB4 QIMHAFSVAPFDQNLSIDGKILSDDCATLGTLGVIPESVILLKADEPIADYAAMDDVMQV ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 QIMHAFSVAPFDQNLSIDGKILSDDCATLGTLGVIPESVILLKADEPIADYAAMDDVMQV 970 980 990 1000 1010 1020 960 pF1KB4 CMPEEGFKGTGLLGH CCDS30 CMPEEGFKGTGLLGH 1030 >>CCDS41619.1 USP47 gene_id:55031|Hs108|chr11 (1287 aa) initn: 492 init1: 190 opt: 456 Z-score: 460.9 bits: 97.1 E(32554): 2.4e-19 Smith-Waterman score: 524; 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CCDS41 FRNALY-------KWEF-----EESEEDPVTSIPYQLQRLFVLLQTSKKRAIETTDVTRS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB4 LGLDTG---QQQDAQEFSKLFMSLLEDTLSKQKNPDVRNIVQQQFCGEYAYVTVCNQCGR .: :.. ::.:.::. ..... ::. : :. . ..... . :. . : .:: CCDS41 FGWDSSEAWQQHDVQELCRVMFDALEQ---KWKQTEQADLINELYQGKLKDYVRCLECGY 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 ESKLLSKFYELELNIQ--GHKQLTDCISE----FLKEEKLEGDNRYFCENCQSKQNATRK :. .. . .. : :. : .: . : :.. : :.: :.:::: :..: .: . CCDS41 EGWRIDTYLDIPLVIRPYGSSQAFASVEEALHAFIQPEILDGPNQYFCERCKKKCDARKG 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KB4 IRLLSLPCTLNLQLMRFVFDRQTGHKKKLNTYIGFSEILDMEPYV--------------- .:.: .: :.::: :: :: : :. ::: . : : ::: .. CCDS41 LRFLHFPYLLTLQLKRFDFDYTTMHRIKLNDRMTFPEELDMSTFIDVEDEKSPQTESCTD 290 300 310 320 330 340 330 340 pF1KB4 ---EHKGG---------------------------------------SYVYELSAVLIHR :..:. : .::: .:..: CCDS41 SGAENEGSCHSDQMSNDFSNDDGVDEGICLETNSGTEKISKSGLEKNSLIYELFSVMVHS 350 360 370 380 390 400 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 GVSAYSGHYIAHVKDPQSGEWYKFNDEDIEKMEGKKLQLGIEEDLAEP-SKSQTRKPKCG : :: .::: : .:. .. .::.:::. . .. .::. . . :. . . CCDS41 G-SAAGGHYYACIKSFSDEQWYSFNDQHVSRIT--------QEDIKKTHGGSSGSRGYYS 410 420 430 440 450 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 KGTHCSRNAYMLVYRLQTQEKPNTTVQV---PAFLQELVDRDNSKFEEWCIEMAEMRKQS .. : :::::.:::. . ..: : ...::... .: : :.. CCDS41 SAFASSTNAYMLIYRLKDPARNAKFLEVDEYPEHIKNLVQKERE------LEEQEKRQRE 460 470 480 490 500 510 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 VDKGKAKHEEVKELYQRLPAGAVKALCKECVVERCRILRLKNQLNEDYKTVNNLLKAAVK .... : CCDS41 IERNTCKIKLFCLHPTKQVMMENKLEVHKDKTLKEAVEMAYKMMDLEEVIPLDCCRLVKY 520 530 540 550 560 570 >>CCDS60725.1 USP47 gene_id:55031|Hs108|chr11 (1355 aa) initn: 492 init1: 190 opt: 456 Z-score: 460.5 bits: 97.1 E(32554): 2.5e-19 Smith-Waterman score: 524; 27.6% identity (54.7% similar) in 457 aa overlap (83-468:162-588) 60 70 80 90 100 110 pF1KB4 NCLVGIGEHIWLGEIDENSFHNIDDPNCERRKKNSFVGLTNLGATCYVNTFLQVWFLNLE ......:::.: . :::.:..::. :.. : CCDS60 RFIGPLPREGSGGSTSDYVSQSYSYSSILNKSETGYVGLVNQAMTCYLNSLLQTLFMTPE 140 150 160 170 180 190 120 130 140 150 160 170 pF1KB4 LRQALYLCPSTCSDYMLGDGIQEEKDYEPQT-ICEHLQYLFALLQNSNRRYIDPSGFVKA .:.::: . . ::.. .: : : .:: ::.:::.:..: :. . ... CCDS60 FRNALY-------KWEF-----EESEEDPVTSIPYQLQRLFVLLQTSKKRAIETTDVTRS 200 210 220 230 180 190 200 210 220 pF1KB4 LGLDTG---QQQDAQEFSKLFMSLLEDTLSKQKNPDVRNIVQQQFCGEYAYVTVCNQCGR .: :.. ::.:.::. ..... ::. : :. . ..... . :. . : .:: CCDS60 FGWDSSEAWQQHDVQELCRVMFDALEQ---KWKQTEQADLINELYQGKLKDYVRCLECGY 240 250 260 270 280 290 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 ESKLLSKFYELELNIQ--GHKQLTDCISE----FLKEEKLEGDNRYFCENCQSKQNATRK :. .. . .. : :. : .: . : :.. : :.: :.:::: :..: .: . CCDS60 EGWRIDTYLDIPLVIRPYGSSQAFASVEEALHAFIQPEILDGPNQYFCERCKKKCDARKG 300 310 320 330 340 350 290 300 310 320 pF1KB4 IRLLSLPCTLNLQLMRFVFDRQTGHKKKLNTYIGFSEILDMEPYV--------------- .:.: .: :.::: :: :: : :. ::: . : : ::: .. CCDS60 LRFLHFPYLLTLQLKRFDFDYTTMHRIKLNDRMTFPEELDMSTFIDVEDEKSPQTESCTD 360 370 380 390 400 410 330 340 pF1KB4 ---EHKGG---------------------------------------SYVYELSAVLIHR :..:. : .::: .:..: CCDS60 SGAENEGSCHSDQMSNDFSNDDGVDEGICLETNSGTEKISKSGLEKNSLIYELFSVMVHS 420 430 440 450 460 470 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 GVSAYSGHYIAHVKDPQSGEWYKFNDEDIEKMEGKKLQLGIEEDLAEP-SKSQTRKPKCG : :: .::: : .:. .. .::.:::. . .. .::. . . :. . . CCDS60 G-SAAGGHYYACIKSFSDEQWYSFNDQHVSRIT--------QEDIKKTHGGSSGSRGYYS 480 490 500 510 520 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 KGTHCSRNAYMLVYRLQTQEKPNTTVQV---PAFLQELVDRDNSKFEEWCIEMAEMRKQS .. : :::::.:::. . ..: : ...::... .: : :.. CCDS60 SAFASSTNAYMLIYRLKDPARNAKFLEVDEYPEHIKNLVQKERE------LEEQEKRQRE 530 540 550 560 570 580 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 VDKGKAKHEEVKELYQRLPAGAVKALCKECVVERCRILRLKNQLNEDYKTVNNLLKAAVK .... : CCDS60 IERNTCKIKLFCLHPTKQVMMENKLEVHKDKTLKEAVEMAYKMMDLEEVIPLDCCRLVKY 590 600 610 620 630 640 >>CCDS81554.1 USP47 gene_id:55031|Hs108|chr11 (1375 aa) initn: 492 init1: 190 opt: 456 Z-score: 460.4 bits: 97.1 E(32554): 2.5e-19 Smith-Waterman score: 524; 27.6% identity (54.7% similar) in 457 aa overlap (83-468:182-608) 60 70 80 90 100 110 pF1KB4 NCLVGIGEHIWLGEIDENSFHNIDDPNCERRKKNSFVGLTNLGATCYVNTFLQVWFLNLE ......:::.: . :::.:..::. :.. : CCDS81 RFIGPLPREGSGGSTSDYVSQSYSYSSILNKSETGYVGLVNQAMTCYLNSLLQTLFMTPE 160 170 180 190 200 210 120 130 140 150 160 170 pF1KB4 LRQALYLCPSTCSDYMLGDGIQEEKDYEPQT-ICEHLQYLFALLQNSNRRYIDPSGFVKA .:.::: . . ::.. .: : : .:: ::.:::.:..: :. . ... CCDS81 FRNALY-------KWEF-----EESEEDPVTSIPYQLQRLFVLLQTSKKRAIETTDVTRS 220 230 240 250 180 190 200 210 220 pF1KB4 LGLDTG---QQQDAQEFSKLFMSLLEDTLSKQKNPDVRNIVQQQFCGEYAYVTVCNQCGR .: :.. ::.:.::. ..... ::. : :. . ..... . :. . : .:: CCDS81 FGWDSSEAWQQHDVQELCRVMFDALEQ---KWKQTEQADLINELYQGKLKDYVRCLECGY 260 270 280 290 300 310 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 ESKLLSKFYELELNIQ--GHKQLTDCISE----FLKEEKLEGDNRYFCENCQSKQNATRK :. .. . .. : :. : .: . : :.. : :.: :.:::: :..: .: . CCDS81 EGWRIDTYLDIPLVIRPYGSSQAFASVEEALHAFIQPEILDGPNQYFCERCKKKCDARKG 320 330 340 350 360 370 290 300 310 320 pF1KB4 IRLLSLPCTLNLQLMRFVFDRQTGHKKKLNTYIGFSEILDMEPYV--------------- .:.: .: :.::: :: :: : :. ::: . : : ::: .. CCDS81 LRFLHFPYLLTLQLKRFDFDYTTMHRIKLNDRMTFPEELDMSTFIDVEDEKSPQTESCTD 380 390 400 410 420 430 330 340 pF1KB4 ---EHKGG---------------------------------------SYVYELSAVLIHR :..:. : .::: .:..: CCDS81 SGAENEGSCHSDQMSNDFSNDDGVDEGICLETNSGTEKISKSGLEKNSLIYELFSVMVHS 440 450 460 470 480 490 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 GVSAYSGHYIAHVKDPQSGEWYKFNDEDIEKMEGKKLQLGIEEDLAEP-SKSQTRKPKCG : :: .::: : .:. .. .::.:::. . .. .::. . . :. . . CCDS81 G-SAAGGHYYACIKSFSDEQWYSFNDQHVSRIT--------QEDIKKTHGGSSGSRGYYS 500 510 520 530 540 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 KGTHCSRNAYMLVYRLQTQEKPNTTVQV---PAFLQELVDRDNSKFEEWCIEMAEMRKQS .. : :::::.:::. . ..: : ...::... .: : :.. CCDS81 SAFASSTNAYMLIYRLKDPARNAKFLEVDEYPEHIKNLVQKERE------LEEQEKRQRE 550 560 570 580 590 600 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 VDKGKAKHEEVKELYQRLPAGAVKALCKECVVERCRILRLKNQLNEDYKTVNNLLKAAVK .... : CCDS81 IERNTCKIKLFCLHPTKQVMMENKLEVHKDKTLKEAVEMAYKMMDLEEVIPLDCCRLVKY 610 620 630 640 650 660 >>CCDS46547.1 USP40 gene_id:55230|Hs108|chr2 (1247 aa) initn: 239 init1: 131 opt: 409 Z-score: 413.2 bits: 88.2 E(32554): 1.1e-16 Smith-Waterman score: 409; 27.4% identity (62.3% similar) in 321 aa overlap (83-393:47-356) 60 70 80 90 100 110 pF1KB4 NCLVGIGEHIWLGEIDENSFHNIDDPNCERRKKNSFVGLTNLGATCYVNTFLQVWFLNLE :. ... :. : :.:::.:..::. .. : CCDS46 LFEEEYSTVSNNQYGKGKKLKTKALEPPAPREFTNLSGIRNQGGTCYLNSLLQTLHFTPE 20 30 40 50 60 70 120 130 140 150 160 170 pF1KB4 LRQALY-LCPSTCSDYMLGDGIQEEKDYEPQTICEHLQYLFALLQNSNRRYIDPSGFVKA .:.::. : : . .. : ... : . . : .:: ::: : ... . . .. . CCDS46 FREALFSLGPEELG--LFED--KDKPDAKVRIIPLQLQRLFAQLLLLDQEAASTADLTDS 80 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 pF1KB4 LGLDTGQ---QQDAQEFSKLFMSLLEDTLSKQKNPDVRNIVQQQFCGEYAYVTVCNQCGR .: ... :.:.::......: :: .: .. : .. . . : . ::..: CCDS46 FGWTSNEEMRQHDVQELNRILFSALETSLVGTSGHD---LIYRLYHGTIVNQIVCKECKN 140 150 160 170 180 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 ESKLLSKFYELELNIQGHKQLTDCI-SEFLKEEKLEGDNRYFCENCQSKQNATRKIRLLS :. : .: . ... . : : . . ...:: .. :: : : .:. .:... .: . CCDS46 VSERQEDFLDLTVAVKNVSGLEDALWNMYVEEEVFDCDNLYHCGTCDRLVKAAKSAKLRK 190 200 210 220 230 240 290 300 310 320 330 340 pF1KB4 LPCTLNLQLMRFVFDRQTGHKKKLNTYIGFSEILDMEPYVEHK---GGSYVYELSAVLIH :: :...:.:: :: .. : .. : ....:. :.. :.:.: .:.:: CCDS46 LPPFLTVSLLRFNFDFVKCERYKETSCYTFPLRINLKPFCEQSELDDLEYIYDLFSVIIH 250 260 270 280 290 300 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 RGVSAYSGHYIAHVKD-PQSGEWYKFNDEDIEK-MEGKKLQLGIEEDLAEPSKSQTRKPK .: . :.::: ...:: . :.: .:..: . .. : :: ::.. .: CCDS46 KG-GCYGGHYHVYIKDVDHLGNW-QFQEEKSKPDVNLKDLQ--SEEEIDHPLMILKAILL 310 320 330 340 350 360 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 CGKGTHCSRNAYMLVYRLQTQEKPNTTVQVPAFLQELVDRDNSKFEEWCIEMAEMRKQSV CCDS46 EENNLIPVDQLGQKLLKKIGISWNKKYRKQHGPLRKFLQLHSQIFLLSSDESTVRLLKNS 370 380 390 400 410 420 >>CCDS59456.1 USP17L12 gene_id:100287205|Hs108|chr4 (530 aa) initn: 196 init1: 98 opt: 381 Z-score: 390.4 bits: 82.8 E(32554): 2e-15 Smith-Waterman score: 428; 27.8% identity (55.6% similar) in 392 aa overlap (78-450:69-437) 50 60 70 80 90 100 pF1KB4 CKGNPNCLVGIGEHIWLGEIDENSFHNIDDPNCERRKKNSFVGLTNLGATCYVNTFLQVW : .:: .:: :.: :::::. :: CCDS59 EKSPLSCETRVDLCDDLAPVARQLAPREKLPLSNRRPAAVGAGLQNMGNTCYVNASLQC- 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 pF1KB4 FLNLELRQALYLCPSTCSDYMLG-DGIQEEKDYEPQTICEHLQYLFALLQNSNRRYIDPS : : ..:::. . : . .. .: .. :.: .. :.:: CCDS59 ---------LTYTPPL-ANYMLSREHSQTCHRHKGCMLCTMQAHITRALHNPGH-VIQPS 100 110 120 130 140 170 180 190 200 210 220 pF1KB4 GFVKALGLDTGQQQDAQEFSKLFMSLLEDT-LSKQKNPDVRN----IVQQQFCGEYAYVT . : :. :.:.::.:: . .. .. . : .:. : .. ...: : : . CCDS59 QALAA-GFHRGKQEDAHEFLMFTVDAMKKACLPGHKQVDHHSKDTTLIHQIFGGYWRSQI 150 160 170 180 190 200 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 VCNQCGRESKLLSKFYELELNIQGHKQLTDCISEFLKEEKLEGDNRYFCENCQSKQNATR : .: : .. . .. :.::. ... . . ...: :.:.:.: : : : .. :.. CCDS59 KCLHCHGISDTFDPYLDIALDIQAAQSVQQALEQLVKPEELNGENAYHCGVCLQRAPASK 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 pF1KB4 KIRLLSLPCTLNLQLMRFVFDRQTGHKKKLNTYIGFSEILDMEPYVEHKG-GSYVYELSA . ::. .: : : : :. ::.: : . . : :::.::. . . : :: : : CCDS59 MLTLLTSAKVLILVLKR--FSDVTGNKIAKN--VQYPECLDMQPYMSQPNTGPLVYVLYA 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 pF1KB4 VLIHRGVSAYSGHYIAHVKDPQSGEWYKFNDEDIEKM-------EGKKLQLGIEEDLAE- ::.: : : ..:::...:: : :.:::..: .. . . . :... : CCDS59 VLVHAGWSCHNGHYFSYVK-AQEGQWYKMDDAEVTASSITSVLSQQAYVLFYIQKSEWER 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 pF1KB4 --PSKSQTRKPKCGKGTHCSRNAYMLVYRLQTQEKPNTTVQVPAFLQELVDR--DNSKFE : :. :.:. . .: : . . ...: .:.: . ..::.: ..: .. 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CCDS59 HSESVSRGREPRALGAEDTDRRATQGELK---RDHP--CLQAPELDEHLVERATQESTLD 390 400 410 420 430 450 460 470 480 490 500 pF1KB4 EWCIEMAEMRKQSVDKGKAKHEEVKELYQRLPAGAVKALCKECVVERCRILRLKNQLNED .: CCDS59 HWKFLQEQNKTKPEFNVRKVEGTLPPDVLVIHQSKYKCGMKNHHPEQQSSLLNLSSSTPT 440 450 460 470 480 490 >>CCDS59458.1 USP17L17 gene_id:100287327|Hs108|chr4 (530 aa) initn: 197 init1: 99 opt: 378 Z-score: 387.3 bits: 82.2 E(32554): 3e-15 Smith-Waterman score: 424; 27.6% identity (55.4% similar) in 392 aa overlap (78-450:69-437) 50 60 70 80 90 100 pF1KB4 CKGNPNCLVGIGEHIWLGEIDENSFHNIDDPNCERRKKNSFVGLTNLGATCYVNTFLQVW : :: .:: :.: :::::. :: CCDS59 EKSPLSCETRVDLCDDLAPVARQLAPREKLPLSSRRPAAVGAGLQNMGNTCYVNASLQC- 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 pF1KB4 FLNLELRQALYLCPSTCSDYMLG-DGIQEEKDYEPQTICEHLQYLFALLQNSNRRYIDPS : : ..:::. . : . .. .: .. :.: .. :.:: CCDS59 ---------LTYTPPL-ANYMLSREHSQTCHRHKGCMLCTMQAHITRALHNPGH-VIQPS 100 110 120 130 140 170 180 190 200 210 220 pF1KB4 GFVKALGLDTGQQQDAQEFSKLFMSLLEDT-LSKQKNPDVRN----IVQQQFCGEYAYVT . : :. :.:.::.:: . .. .. . : .:. : .. ...: : : . CCDS59 QALAA-GFHRGKQEDAHEFLMFTVDAMKKACLPGHKQVDHHSKDTTLIHQIFGGYWRSQI 150 160 170 180 190 200 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 VCNQCGRESKLLSKFYELELNIQGHKQLTDCISEFLKEEKLEGDNRYFCENCQSKQNATR : .: : .. . .. :.::. ... . . ...: :.:.:.: : : : .. :.. CCDS59 KCLHCHGISDTFDPYLDIALDIQAAQSVQQALEQLVKPEELNGENAYHCGVCLQRAPASK 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 pF1KB4 KIRLLSLPCTLNLQLMRFVFDRQTGHKKKLNTYIGFSEILDMEPYVEHKG-GSYVYELSA . : . .: : : : :. ::.: : . . : :::.::. ... : :: : : CCDS59 TLTLHTSAKVLILVLKR--FSDVTGNKIAKN--VQYPECLDMQPYMSQQNTGPLVYVLYA 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 pF1KB4 VLIHRGVSAYSGHYIAHVKDPQSGEWYKFNDEDIEKM-------EGKKLQLGIEEDLAE- ::.: : : ..:::...:: : :.:::..: .. . . . :... : CCDS59 VLVHAGWSCHNGHYFSYVK-AQEGQWYKMDDAEVTAASITSVLSQQAYVLFYIQKSEWER 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 pF1KB4 --PSKSQTRKPKCGKGTHCSRNAYMLVYRLQTQEKPNTTVQVPAFLQELVDR--DNSKFE : :. :.:. . .: : . . ...: .:.: . ..::.: ..: .. CCDS59 HSESVSRGREPRALGAEDTDRRATQGELK---RDHP--CLQAPELDEHLVERATQESTLD 390 400 410 420 430 450 460 470 480 490 500 pF1KB4 EWCIEMAEMRKQSVDKGKAKHEEVKELYQRLPAGAVKALCKECVVERCRILRLKNQLNED .: CCDS59 HWKFLQEQNKTKPEFNVRKVEGTLPPDVLVIHQSKYKCGMKNHHPEQQSSLLNLSSSTPT 440 450 460 470 480 490 969 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 15:17:22 2016 done: Thu Nov 3 15:17:23 2016 Total Scan time: 4.630 Total Display time: 0.210 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]