Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4659
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4659, 480 aa
1>>>pF1KB4659 480 - 480 aa - 480 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7926+/-0.000763; mu= 13.2499+/- 0.047
mean_var=119.0736+/-23.831, 0's: 0 Z-trim(113.0): 7 B-trim: 3 in 1/50
Lambda= 0.117535
statistics sampled from 13675 (13681) to 13675 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.748), E-opt: 0.2 (0.42), width: 16
Scan time: 3.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS321.1 SESN2 gene_id:83667|Hs108|chr1 ( 480) 3260 563.3 2e-160
CCDS56445.1 SESN1 gene_id:27244|Hs108|chr6 ( 492) 1768 310.3 2.9e-84
CCDS5070.1 SESN1 gene_id:27244|Hs108|chr6 ( 551) 1768 310.4 3.2e-84
CCDS56444.1 SESN1 gene_id:27244|Hs108|chr6 ( 426) 1700 298.8 7.7e-81
CCDS60938.1 SESN3 gene_id:143686|Hs108|chr11 ( 353) 949 171.4 1.4e-42
CCDS8303.1 SESN3 gene_id:143686|Hs108|chr11 ( 492) 949 171.5 1.9e-42
>>CCDS321.1 SESN2 gene_id:83667|Hs108|chr1 (480 aa)
initn: 3260 init1: 3260 opt: 3260 Z-score: 2993.7 bits: 563.3 E(32554): 2e-160
Smith-Waterman score: 3260; 100.0% identity (100.0% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-480)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MIVADSECRAELKDYLRFAPGGVGDSGPGEEQRESRARRGPRGPSAFIPVEEVLREGAES
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CCDS32 MIVADSECRAELKDYLRFAPGGVGDSGPGEEQRESRARRGPRGPSAFIPVEEVLREGAES
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LEQHLGLEALMSSGRVDNLAVVMGLHPDYFTSFWRLHYLLLHTDGPLASSWRHYIAIMAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LEQHLGLEALMSSGRVDNLAVVMGLHPDYFTSFWRLHYLLLHTDGPLASSWRHYIAIMAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 ARHQCSYLVGSHMAEFLQTGGDPEWLLGLHRAPEKLRKLSEINKLLAHRPWLITKEHIQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ARHQCSYLVGSHMAEFLQTGGDPEWLLGLHRAPEKLRKLSEINKLLAHRPWLITKEHIQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LLKTGEHTWSLAELIQALVLLTHCHSLSSFVFGCGILPEGDADGSPAPQAPTPPSEQSSP
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CCDS32 LLKTGEHTWSLAELIQALVLLTHCHSLSSFVFGCGILPEGDADGSPAPQAPTPPSEQSSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 PSRDPLNNSGGFESARDVEALMERMQQLQESLLRDEGTSQEEMESRFELEKSESLLVTPS
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CCDS32 PSRDPLNNSGGFESARDVEALMERMQQLQESLLRDEGTSQEEMESRFELEKSESLLVTPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 ADILEPSPHPDMLCFVEDPTFGYEDFTRRGAQAPPTFRAQDYTWEDHGYSLIQRLYPEGG
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CCDS32 ADILEPSPHPDMLCFVEDPTFGYEDFTRRGAQAPPTFRAQDYTWEDHGYSLIQRLYPEGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 QLLDEKFQAAYSLTYNTIAMHSGVDTSVLRRAIWNYIHCVFGIRYDDYDYGEVNQLLERN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QLLDEKFQAAYSLTYNTIAMHSGVDTSVLRRAIWNYIHCVFGIRYDDYDYGEVNQLLERN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 LKVYIKTVACYPEKTTRRMYNLFWRHFRHSEKVHVNLLLLEARMQAALLYALRAITRYMT
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CCDS32 LKVYIKTVACYPEKTTRRMYNLFWRHFRHSEKVHVNLLLLEARMQAALLYALRAITRYMT
430 440 450 460 470 480
>>CCDS56445.1 SESN1 gene_id:27244|Hs108|chr6 (492 aa)
initn: 1723 init1: 835 opt: 1768 Z-score: 1626.3 bits: 310.3 E(32554): 2.9e-84
Smith-Waterman score: 1792; 58.9% identity (80.2% similar) in 475 aa overlap (22-480:22-492)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MIVADSECRAELKDYLRFAPGGVGDSGPGEEQRESRARRGPR----GPSAFIPVEEVLRE
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CCDS56 MRLAAAANEAYTAPLAVSGLLGCKQCGGGRDQDEELGIRIPRPLGQGPSRFIPEKEILQV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 GAESLEQH-LGLEALMSSGRVDNLAVVMGLHPDYFTSFWRLHYLLLHTDGPLASSWRHYI
:.:. ..: : ... . ::.::...:: .::.:. :: . .. ::. :::: .::::
CCDS56 GSEDAQMHALFADSFAALGRLDNITLVMVFHPQYLESFLKTQHYLLQMDGPLPLHYRHYI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 AIMAAARHQCSYLVGSHMAEFLQTGGDPEWLLGLHRAPEKLRKLSEINKLLAHRPWLITK
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CCDS56 GIMAAARHQCSYLVNLHVNDFLHVGGDPKWLNGLENAPQKLQNLGELNKVLAHRPWLITK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 EHIQALLKTGEHTWSLAELIQALVLLTHCHSLSSFVFGCGILPEGDADGSPAPQAPTPPS
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CCDS56 EHIEGLLKAEEHSWSLAELVHAVVLLTHYHSLASFTFGCGISPEIHCDGGHTFRPPSVSN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KB4 E-----QSSPPSRD--PLNNSGGF---ESARDVEALMERMQQLQESLLRDEG-TSQEEME
.. : : :.:.. . .: .::::::.:.:::: ::: .:::::
CCDS56 YCICDITNGNHSVDEMPVNSAENVSVSDSFFEVEALMEKMRQLQEC--RDEEEASQEEMA
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 SRFELEKSESLLVTPSADILEPSPHPDMLCFVEDPTFGYEDFTRRGAQAPPTFRAQDYTW
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CCDS56 SRFEIEKRESMFVF-SSDDEEVTPARAVSRHFEDTSYGYKDFSRHGMHVP-TFRVQDYCW
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 EDHGYSLIQRLYPEGGQLLDEKFQAAYSLTYNTIAMHSGVDTSVLRRAIWNYIHCVFGIR
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CCDS56 EDHGYSLVNRLYPDVGQLIDEKFHIAYNLTYNTMAMHKDVDTSMLRRAIWNYIHCMFGIR
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 YDDYDYGEVNQLLERNLKVYIKTVACYPEKTTRRMYNLFWRHFRHSEKVHVNLLLLEARM
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CCDS56 YDDYDYGEINQLLDRSFKVYIKTVVCTPEKVTKRMYDSFWRQFKHSEKVHVNLLLIEARM
420 430 440 450 460 470
470 480
pF1KB4 QAALLYALRAITRYMT
:: :::::::::::::
CCDS56 QAELLYALRAITRYMT
480 490
>>CCDS5070.1 SESN1 gene_id:27244|Hs108|chr6 (551 aa)
initn: 1799 init1: 835 opt: 1768 Z-score: 1625.5 bits: 310.4 E(32554): 3.2e-84
Smith-Waterman score: 1769; 60.0% identity (81.2% similar) in 458 aa overlap (39-480:98-551)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 RAELKDYLRFAPGGVGDSGPGEEQRESRARRGPR----GPSAFIPVEEVLREGAESLEQH
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CCDS50 HLLMLSKRCPFKDVREKSEFILKSIQELGIRIPRPLGQGPSRFIPEKEILQVGSEDAQMH
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 -LGLEALMSSGRVDNLAVVMGLHPDYFTSFWRLHYLLLHTDGPLASSWRHYIAIMAAARH
: ... . ::.::...:: .::.:. :: . .. ::. :::: .::::.:::::::
CCDS50 ALFADSFAALGRLDNITLVMVFHPQYLESFLKTQHYLLQMDGPLPLHYRHYIGIMAAARH
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 QCSYLVGSHMAEFLQTGGDPEWLLGLHRAPEKLRKLSEINKLLAHRPWLITKEHIQALLK
::::::. :. .::..::::.:: ::. ::.::..:.:.::.:::::::::::::..:::
CCDS50 QCSYLVNLHVNDFLHVGGDPKWLNGLENAPQKLQNLGELNKVLAHRPWLITKEHIEGLLK
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230
pF1KB4 TGEHTWSLAELIQALVLLTHCHSLSSFVFGCGILPEGDADGSPAPQAPTPPSE-----QS
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CCDS50 AEEHSWSLAELVHAVVLLTHYHSLASFTFGCGISPEIHCDGGHTFRPPSVSNYCICDITN
250 260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 SPPSRD--PLNNSGGF---ESARDVEALMERMQQLQESLLRDEG-TSQEEMESRFELEKS
. : : :.:.. . .: .::::::.:.:::: ::: .::::: ::::.::
CCDS50 GNHSVDEMPVNSAENVSVSDSFFEVEALMEKMRQLQEC--RDEEEASQEEMASRFEIEKR
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 ESLLVTPSADILEPSPHPDMLCFVEDPTFGYEDFTRRGAQAPPTFRAQDYTWEDHGYSLI
::..: :.: : .: . :: ..::.::.:.: ..: :::.::: ::::::::.
CCDS50 ESMFVF-SSDDEEVTPARAVSRHFEDTSYGYKDFSRHGMHVP-TFRVQDYCWEDHGYSLV
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 QRLYPEGGQLLDEKFQAAYSLTYNTIAMHSGVDTSVLRRAIWNYIHCVFGIRYDDYDYGE
.::::. :::.::::. ::.:::::.:::. ::::.:::::::::::.::::::::::::
CCDS50 NRLYPDVGQLIDEKFHIAYNLTYNTMAMHKDVDTSMLRRAIWNYIHCMFGIRYDDYDYGE
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 VNQLLERNLKVYIKTVACYPEKTTRRMYNLFWRHFRHSEKVHVNLLLLEARMQAALLYAL
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CCDS50 INQLLDRSFKVYIKTVVCTPEKVTKRMYDSFWRQFKHSEKVHVNLLLIEARMQAELLYAL
490 500 510 520 530 540
480
pF1KB4 RAITRYMT
::::::::
CCDS50 RAITRYMT
550
>>CCDS56444.1 SESN1 gene_id:27244|Hs108|chr6 (426 aa)
initn: 1656 init1: 835 opt: 1700 Z-score: 1564.8 bits: 298.8 E(32554): 7.7e-81
Smith-Waterman score: 1700; 61.3% identity (82.5% similar) in 424 aa overlap (68-480:7-426)
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 RRGPRGPSAFIPVEEVLREGAESLEQHLGLEALMSSGRVDNLAVVMGLHPDYFTSFWRLH
... . ::.::...:: .::.:. :: . .
CCDS56 MHALFADSFAALGRLDNITLVMVFHPQYLESFLKTQ
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 YLLLHTDGPLASSWRHYIAIMAAARHQCSYLVGSHMAEFLQTGGDPEWLLGLHRAPEKLR
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CCDS56 HYLLQMDGPLPLHYRHYIGIMAAARHQCSYLVNLHVNDFLHVGGDPKWLNGLENAPQKLQ
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 KLSEINKLLAHRPWLITKEHIQALLKTGEHTWSLAELIQALVLLTHCHSLSSFVFGCGIL
.:.:.::.:::::::::::::..:::. ::.::::::..:.::::: :::.::.:::::
CCDS56 NLGELNKVLAHRPWLITKEHIEGLLKAEEHSWSLAELVHAVVLLTHYHSLASFTFGCGIS
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260
pF1KB4 PEGDADGSPAPQAPTPPSE-----QSSPPSRD--PLNNSGGF---ESARDVEALMERMQQ
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CCDS56 PEIHCDGGHTFRPPSVSNYCICDITNGNHSVDEMPVNSAENVSVSDSFFEVEALMEKMRQ
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 LQESLLRDEG-TSQEEMESRFELEKSESLLVTPSADILEPSPHPDMLCFVEDPTFGYEDF
::: ::: .::::: ::::.:: ::..: :.: : .: . :: ..::.::
CCDS56 LQEC--RDEEEASQEEMASRFEIEKRESMFVF-SSDDEEVTPARAVSRHFEDTSYGYKDF
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 TRRGAQAPPTFRAQDYTWEDHGYSLIQRLYPEGGQLLDEKFQAAYSLTYNTIAMHSGVDT
.:.: ..: :::.::: ::::::::..::::. :::.::::. ::.:::::.:::. :::
CCDS56 SRHGMHVP-TFRVQDYCWEDHGYSLVNRLYPDVGQLIDEKFHIAYNLTYNTMAMHKDVDT
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 SVLRRAIWNYIHCVFGIRYDDYDYGEVNQLLERNLKVYIKTVACYPEKTTRRMYNLFWRH
:.:::::::::::.::::::::::::.::::.:..:::::::.: :::.:.:::. :::.
CCDS56 SMLRRAIWNYIHCMFGIRYDDYDYGEINQLLDRSFKVYIKTVVCTPEKVTKRMYDSFWRQ
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480
pF1KB4 FRHSEKVHVNLLLLEARMQAALLYALRAITRYMT
:.:::::::::::.:::::: :::::::::::::
CCDS56 FKHSEKVHVNLLLIEARMQAELLYALRAITRYMT
400 410 420
>>CCDS60938.1 SESN3 gene_id:143686|Hs108|chr11 (353 aa)
initn: 1296 init1: 880 opt: 949 Z-score: 877.8 bits: 171.4 E(32554): 1.4e-42
Smith-Waterman score: 1174; 58.9% identity (78.8% similar) in 321 aa overlap (178-480:35-353)
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 GLHRAPEKLRKLSEINKLLAHRPWLITKEHIQALLKTGEHTWSLAELIQALVLLTHCHSL
:. :.::::..::: ::..:.:::.: :.:
CCDS60 TQYLESFLRSQFYMLRMDGPLPLPYRHYIAIMKLVKTGENNWSLPELVHAVVLLAHYHAL
10 20 30 40 50 60
210 220 230 240 250
pF1KB4 SSFVFGCGILPEGDADGSPAPQAPTPPSEQSSPPSRD------PLNNS--GGFESARDVE
.::::: :: :: : . : . . . . . : :..: : .: ..:
CCDS60 ASFVFGSGINPERDPEISNGFRLISVNNFCVCDLANDNNIENASLSGSNFGIVDSLSELE
70 80 90 100 110 120
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 ALMERMQQLQESLLRDEGTSQEEMESRFELEKSESLLVTPSADILEPSPHPD----MLC-
::::::..::: .:: .::::: .::: ::.:::.:. :.: .. :: : :.
CCDS60 ALMERMKRLQEER-EDEEASQEEMSTRFEKEKKESLFVV-SGDTFHSFPHSDFEDDMIIT
130 140 150 160 170 180
320 330 340 350 360
pF1KB4 -----FVEDPTFGYEDFTRRGAQAPPTFRAQDYTWEDHGYSLIQRLYPEGGQLLDEKFQA
..::: ::::::.::: . :::::::::::.::.::..::: . :.::::::.
CCDS60 SDVSRYIEDPGFGYEDFARRGEEHLPTFRAQDYTWENHGFSLVNRLYSDIGHLLDEKFRM
190 200 210 220 230 240
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 AYSLTYNTIAMHSGVDTSVLRRAIWNYIHCVFGIRYDDYDYGEVNQLLERNLKVYIKTVA
.:.:::::.: : :::..::::..::.::.:::::::::::::::::::.::::::::.
CCDS60 VYNLTYNTMATHEDVDTTMLRRALFNYVHCMFGIRYDDYDYGEVNQLLERSLKVYIKTVT
250 260 270 280 290 300
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 CYPEKTTRRMYNLFWRHFRHSEKVHVNLLLLEARMQAALLYALRAITRYMT
::::.::.:::. .::.:.:::::::::::.:::::: ::::::::::..:
CCDS60 CYPERTTKRMYDSYWRQFKHSEKVHVNLLLMEARMQAELLYALRAITRHLT
310 320 330 340 350
>>CCDS8303.1 SESN3 gene_id:143686|Hs108|chr11 (492 aa)
initn: 1730 init1: 880 opt: 949 Z-score: 875.7 bits: 171.5 E(32554): 1.9e-42
Smith-Waterman score: 1714; 58.6% identity (79.6% similar) in 457 aa overlap (42-480:38-492)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 LKDYLRFAPGGVGDSGPGEEQRESRARRGPRGPSAFIPVEEVLREGAESLEQHLGLEALM
:::::::: .::.. .. . . .. .:
CCDS83 PSAAANYLLCTNCRKVLRKDKRIRVSQPLTRGPSAFIPEKEVVQANTVDERTNFLVEEYS
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 SSGRVDNLAVVMGLHPDYFTSFWRLHYLLLHTDGPLASSWRHYIAIMAAARHQCSYLVGS
.:::.::.. ::.:: .:. :: : .. .:. :::: .:::::::::::::::::..
CCDS83 TSGRLDNITQVMSLHTQYLESFLRSQFYMLRMDGPLPLPYRHYIAIMAAARHQCSYLINM
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 HMAEFLQTGGDPEWLLGLHRAPEKLRKLSEINKLLAHRPWLITKEHIQALLKTGEHTWSL
:. :::.::: ::: ::. .:..:..:.::::::::::::::::::: :.::::..:::
CCDS83 HVDEFLKTGGIAEWLNGLEYVPQRLKNLNEINKLLAHRPWLITKEHIQKLVKTGENNWSL
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240
pF1KB4 AELIQALVLLTHCHSLSSFVFGCGILPEGDADGSPAPQAPTPPSEQSSPPSRD------P
::..:.:::.: :.:.::::: :: :: : . : . . . . . :
CCDS83 PELVHAVVLLAHYHALASFVFGSGINPERDPEISNGFRLISVNNFCVCDLANDNNIENAS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LNNS--GGFESARDVEALMERMQQLQESLLRDEGTSQEEMESRFELEKSESLLVTPSADI
:..: : .: ..:::::::..::: .:: .::::: .::: ::.:::.:. :.:
CCDS83 LSGSNFGIVDSLSELEALMERMKRLQEER-EDEEASQEEMSTRFEKEKKESLFVV-SGDT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB4 LEPSPHPD----MLC------FVEDPTFGYEDFTRRGAQAPPTFRAQDYTWEDHGYSLIQ
.. :: : :. ..::: ::::::.::: . :::::::::::.::.::..
CCDS83 FHSFPHSDFEDDMIITSDVSRYIEDPGFGYEDFARRGEEHLPTFRAQDYTWENHGFSLVN
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 RLYPEGGQLLDEKFQAAYSLTYNTIAMHSGVDTSVLRRAIWNYIHCVFGIRYDDYDYGEV
::: . :.::::::. .:.:::::.: : :::..::::..::.::.:::::::::::::
CCDS83 RLYSDIGHLLDEKFRMVYNLTYNTMATHEDVDTTMLRRALFNYVHCMFGIRYDDYDYGEV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 NQLLERNLKVYIKTVACYPEKTTRRMYNLFWRHFRHSEKVHVNLLLLEARMQAALLYALR
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CCDS83 NQLLERSLKVYIKTVTCYPERTTKRMYDSYWRQFKHSEKVHVNLLLMEARMQAELLYALR
430 440 450 460 470 480
480
pF1KB4 AITRYMT
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CCDS83 AITRHLT
490
480 residues in 1 query sequences
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