Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4698
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4698, 883 aa
1>>>pF1KB4698 883 - 883 aa - 883 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2326+/-0.00134; mu= 20.9189+/- 0.080
mean_var=64.6258+/-12.860, 0's: 0 Z-trim(99.4): 53 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.159541
statistics sampled from 5657 (5705) to 5657 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.52), E-opt: 0.2 (0.175), width: 16
Scan time: 3.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3797.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 883) 5791 1342.8 0
CCDS43274.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 883) 5732 1329.3 0
CCDS43275.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 836) 5480 1271.2 0
CCDS41706.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 884) 4492 1043.9 0
CCDS8333.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 902) 4353 1011.9 0
CCDS14605.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX ( 894) 4346 1010.2 0
CCDS14604.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX ( 894) 4288 996.9 0
CCDS47318.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 906) 4158 967.0 0
CCDS4322.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 906) 4127 959.8 0
CCDS58988.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 916) 4114 956.9 0
CCDS58987.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 916) 4083 949.7 0
CCDS58989.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 837) 3974 924.6 0
CCDS58986.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 826) 3563 830.0 0
CCDS5049.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 869) 2021 475.1 2.4e-133
CCDS55045.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 892) 2021 475.1 2.4e-133
CCDS5048.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 908) 2021 475.1 2.5e-133
CCDS416.1 GRIK3 gene_id:2899|Hs108|chr1 ( 919) 1956 460.2 8e-129
CCDS33530.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 905) 1945 457.6 4.6e-128
CCDS82656.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 934) 1945 457.6 4.7e-128
CCDS41707.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 433) 1724 406.6 5.1e-113
CCDS8433.1 GRIK4 gene_id:2900|Hs108|chr11 ( 956) 1647 389.0 2.1e-107
CCDS12595.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 980) 1620 382.8 1.6e-105
CCDS77305.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 981) 1616 381.9 3e-105
CCDS42913.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 918) 1601 378.4 3.2e-104
CCDS82658.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 920) 1601 378.4 3.2e-104
CCDS82659.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 949) 1601 378.5 3.2e-104
CCDS45407.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1281) 660 161.9 6.6e-39
CCDS10539.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1464) 660 162.0 7.4e-39
CCDS31236.1 GRID1 gene_id:2894|Hs108|chr10 (1009) 651 159.8 2.3e-38
CCDS8662.1 GRIN2B gene_id:2904|Hs108|chr12 (1484) 648 159.2 5.1e-38
CCDS12719.1 GRIN2D gene_id:2906|Hs108|chr19 (1336) 634 156.0 4.3e-37
CCDS62330.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 ( 873) 619 152.4 3.3e-36
CCDS32724.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 (1233) 619 152.5 4.4e-36
CCDS68758.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 ( 912) 599 147.8 8.4e-35
CCDS3637.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 (1007) 599 147.8 9.1e-35
CCDS43910.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 885) 548 136.1 2.8e-31
CCDS7032.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 901) 548 136.1 2.8e-31
CCDS7031.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 938) 548 136.1 2.9e-31
CCDS55355.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 906) 543 134.9 6.3e-31
CCDS55354.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 943) 543 134.9 6.5e-31
CCDS6758.1 GRIN3A gene_id:116443|Hs108|chr9 (1115) 321 83.9 1.8e-15
CCDS32861.1 GRIN3B gene_id:116444|Hs108|chr19 (1043) 312 81.8 7.2e-15
>>CCDS3797.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 (883 aa)
initn: 5791 init1: 5791 opt: 5791 Z-score: 7197.0 bits: 1342.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5791; 99.9% identity (100.0% similar) in 883 aa overlap (1-883:1-883)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 HIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 HIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 THPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 THPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 GNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 GFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 YDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 YDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVTT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 WNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 WNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 PLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 PLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 SLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDL
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 SKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 YAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 YAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGVL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 DKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880
pF1KB4 AEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 AEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
850 860 870 880
>>CCDS43274.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 (883 aa)
initn: 5732 init1: 5732 opt: 5732 Z-score: 7123.6 bits: 1329.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5732; 98.9% identity (99.5% similar) in 883 aa overlap (1-883:1-883)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 HIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 THPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 THPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 GNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 GFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 YDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVTT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 WNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 PLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 SLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDL
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 SKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 YAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::::::::.:::.:
CCDS43 YAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRNAVNLAVLKLNEQGLL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 DKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSR
:::::::::::::::. . ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880
pF1KB4 AEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
850 860 870 880
>>CCDS43275.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 (836 aa)
initn: 5480 init1: 5480 opt: 5480 Z-score: 6810.5 bits: 1271.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5480; 99.9% identity (100.0% similar) in 836 aa overlap (48-883:1-836)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 LIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTPHIDNLEVANSFAVTNAF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MVQFSTSEFRLTPHIDNLEVANSFAVTNAF
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 CSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 SLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQ
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 DLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANV
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 SGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQ
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 RIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIME
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 LKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLE
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 GNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAI
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB4 APLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 APLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGV
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KB4 SVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWFSLGAFMRQGCDISPRSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS43 SVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSL
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KB4 SGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTK
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KB4 EFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRK
640 650 660 670 680 690
740 750 760 770 780 790
pF1KB4 PCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAK
700 710 720 730 740 750
800 810 820 830 840 850
pF1KB4 DSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINP
760 770 780 790 800 810
860 870 880
pF1KB4 SSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
820 830
>>CCDS41706.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 (884 aa)
initn: 3983 init1: 3380 opt: 4492 Z-score: 5581.1 bits: 1043.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4492; 73.6% identity (92.2% similar) in 890 aa overlap (1-883:1-884)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSE-----
:. : . ::: .::: .:. .:.:::::: :..::::.:::... .::
CCDS41 MRIISRQIVLLFSGFWGLAMGAFPSSVQIGGLFIRNTDQEYTAFRLAIFLHNTSPNASEA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 -FRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITP
: :.::.::.:.:::::::::::::.::::.::::.:::.::.:.::::..::.:.:::
CCDS41 PFNLVPHVDNIETANSFAVTNAFCSQYSRGVFAIFGLYDKRSVHTLTSFCSALHISLITP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 SFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQ
::::.: ::.:.::.:.::::::...:.:. :..:::.::: : :::....:... :.
CCDS41 SFPTEGESQFVLQLRPSLRGALLSLLDHYEWNCFVFLYDTDRGYSILQAIMEKAGQNGWH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 VTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYH
:.:: : :.: : ::.:...:. ..:.. ..::: .....:..:....::::::::
CCDS41 VSAICVENFN----DVSYRQLLEELDRRQEKKFVIDCEIERLQNILEQIVSVGKHVKGYH
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 YIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIK
:::::::: : .: .. :::::.:::.::.. .: :...::. :...::::..: :
CCDS41 YIIANLGFKDISLERFIHGGANVTGFQLVDFNTPMVIKLMDRWKKLDQREYPGSETPP-K
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 YTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVE
::::::::.: ::.:.::.::.:.:.:::::::::::::::.:::::...::.::::...
CCDS41 YTSALTYDGVLVMAETFRSLRRQKIDISRRGNAGDCLANPAAPWGQGIDMERTLKQVRIQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 GLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPS-GNDTSGLEN
::.::..::. :.:.:::....:::..::::.:::...::.:. . ..:. ::::...::
CCDS41 GLTGNVQFDHYGRRVNYTMDVFELKSTGPRKVGYWNDMDKLVL-IQDVPTLGNDTAAIEN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGA
.:::::::.::::::.::::::.:::..:::::::::.::::: :.:::..:: ::::::
CCDS41 RTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 RDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKP
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 GVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.: :.. ::::
CCDS41 GVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEPEDGKEGPSDQPPNEFG
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 IFNSLWFSLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSP
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSP
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 IESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVAR
:::::::.::::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::.:::::::::
CCDS41 IESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVAR
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 VRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLK
:::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::. :::::::
CCDS41 VRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRNAVNLAVLK
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 LSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALI
:.:::.::::::::::::::::. . ::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALI
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880
pF1KB4 EFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
:::::::::::::::::.::..::.::::.::.:::.::::::: ::.::
CCDS41 EFCYKSRAEAKRMKVAKSAQTFNPTSSQNTQNLATYREGYNVYGTESIKI
840 850 860 870 880
>>CCDS8333.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 (902 aa)
initn: 3843 init1: 3240 opt: 4353 Z-score: 5408.1 bits: 1011.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4353; 74.3% identity (92.3% similar) in 855 aa overlap (1-848:1-849)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSE-----
:. : . ::: .::: .:. .:.:::::: :..::::.:::... .::
CCDS83 MRIISRQIVLLFSGFWGLAMGAFPSSVQIGGLFIRNTDQEYTAFRLAIFLHNTSPNASEA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 -FRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITP
: :.::.::.:.:::::::::::::.::::.::::.:::.::.:.::::..::.:.:::
CCDS83 PFNLVPHVDNIETANSFAVTNAFCSQYSRGVFAIFGLYDKRSVHTLTSFCSALHISLITP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 SFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQ
::::.: ::.:.::.:.::::::...:.:. :..:::.::: : :::....:... :.
CCDS83 SFPTEGESQFVLQLRPSLRGALLSLLDHYEWNCFVFLYDTDRGYSILQAIMEKAGQNGWH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 VTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYH
:.:: : :.: : ::.:...:. ..:.. ..::: .....:..:....::::::::
CCDS83 VSAICVENFN----DVSYRQLLEELDRRQEKKFVIDCEIERLQNILEQIVSVGKHVKGYH
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 YIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIK
:::::::: : .: .. :::::.:::.::.. .: :...::. :...::::..: :
CCDS83 YIIANLGFKDISLERFIHGGANVTGFQLVDFNTPMVIKLMDRWKKLDQREYPGSETPP-K
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 YTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVE
::::::::.: ::.:.::.::.:.:.:::::::::::::::.:::::...::.::::...
CCDS83 YTSALTYDGVLVMAETFRSLRRQKIDISRRGNAGDCLANPAAPWGQGIDMERTLKQVRIQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 GLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPS-GNDTSGLEN
::.::..::. :.:.:::....:::..::::.:::...::.:. . ..:. ::::...::
CCDS83 GLTGNVQFDHYGRRVNYTMDVFELKSTGPRKVGYWNDMDKLVL-IQDVPTLGNDTAAIEN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGA
.:::::::.::::::.::::::.:::..:::::::::.::::: :.:::..:: ::::::
CCDS83 RTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 RDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKP
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 GVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.: :.. ::::
CCDS83 GVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEPEDGKEGPSDQPPNEFG
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 IFNSLWFSLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSP
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSP
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 IESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVAR
:::::::.::::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::.:::::::::
CCDS83 IESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVAR
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 VRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLK
:::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS83 VRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLK
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 LSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALI
::: :::::::::::::::::: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LSEAGVLDKLKNKWWYDKGECGPKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALI
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880
pF1KB4 EFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
::::::::::::::.
CCDS83 EFCYKSRAEAKRMKLTFSEAIRNKARLSITGSVGENGRVLTPDCPKAVHTGTAIRQSSGL
840 850 860 870 880 890
>>CCDS14605.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX (894 aa)
initn: 3472 init1: 1781 opt: 4346 Z-score: 5399.5 bits: 1010.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4346; 71.7% identity (90.2% similar) in 890 aa overlap (2-883:9-894)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFST
:.... .: : : : :.:.::::: :.. ::.:::: .. ..:
CCDS14 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB4 SE------FRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTL
.. :.:. :.:.:. .:::.:::::::::::::::::::::. :.::.:::::.:
CCDS14 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 HVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDS
:.::.:::::::. ::::::: ::::.:::. .:.:.::.::::..::.: :::....
CCDS14 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 AAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIG
:....::::: .:::: : . .: ...... ..:.: ..::: ...: :..::. .:
CCDS14 AVQNNWQVTARSVGNI---KDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILG
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 KHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPG
:: .::::..::::::: : ... ::::..:::::. .. .:..::.:: :.:.:.:
CCDS14 KHSRGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 AHTTTIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERA
:... .:::::::.::. :..:::: ::.::...::::.::::::::::::.::..::::
CCDS14 AKNAPLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 LKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGND
::.:::.:..:::.:: :.: ::::...:.:..: :: :::.: ...: ... .::
CCDS14 LKMVQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFV-PFSDQQISND
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 TSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVG
... ::.:.::::::::::::.:::::.::::::::::::::: ::::: .::::.:::
CCDS14 SASSENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVG
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 DGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
:::::::: .::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEF-EDGRETQSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :. :. :. ::
CCDS14 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSP
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 -ESTNEFGIFNSLWFSLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFL
. :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PDPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFL
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 TVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVR
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..:::.::.:::::::..
CCDS14 TVERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTK
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 TTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRT
:::.:::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::
CCDS14 TTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALRT
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 PVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS14 PVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 LAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
:::.:::::::::::::.::::..::.::..:. . :.::.:::.::::::: :::::
CCDS14 LAMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
840 850 860 870 880 890
>>CCDS14604.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX (894 aa)
initn: 3414 init1: 1723 opt: 4288 Z-score: 5327.3 bits: 996.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4288; 70.8% identity (89.8% similar) in 890 aa overlap (2-883:9-894)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFST
:.... .: : : : :.:.::::: :.. ::.:::: .. ..:
CCDS14 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB4 SE------FRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTL
.. :.:. :.:.:. .:::.:::::::::::::::::::::. :.::.:::::.:
CCDS14 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 HVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDS
:.::.:::::::. ::::::: ::::.:::. .:.:.::.::::..::.: :::....
CCDS14 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 AAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIG
:....::::: .:::: : . .: ...... ..:.: ..::: ...: :..::. .:
CCDS14 AVQNNWQVTARSVGNI---KDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILG
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 KHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPG
:: .::::..::::::: : ... ::::..:::::. .. .:..::.:: :.:.:.:
CCDS14 KHSRGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 AHTTTIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERA
:... .:::::::.::. :..:::: ::.::...::::.::::::::::::.::..::::
CCDS14 AKNAPLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 LKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGND
::.:::.:..:::.:: :.: ::::...:.:..: :: :::.: ...: ... .::
CCDS14 LKMVQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFV-PFSDQQISND
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 TSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVG
... ::.:.::::::::::::.:::::.::::::::::::::: ::::: .::::.:::
CCDS14 SASSENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVG
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 DGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
:::::::: .::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEF-EDGRETQSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :. :. :. ::
CCDS14 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSP
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 -ESTNEFGIFNSLWFSLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFL
. :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PDPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFL
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 TVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVR
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..:::.::.:::::::..
CCDS14 TVERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTK
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 TTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRT
:::.:::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::.
CCDS14 TTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALRN
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 PVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
::::::::.:::.::::::::::::::::. . ::.::::::::::::::::::::::
CCDS14 AVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 LAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
:::.:::::::::::::.::::..::.::..:. . :.::.:::.::::::: :::::
CCDS14 LAMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
840 850 860 870 880 890
>>CCDS47318.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 (906 aa)
initn: 3576 init1: 3492 opt: 4158 Z-score: 5165.5 bits: 967.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4158; 71.7% identity (90.4% similar) in 845 aa overlap (4-847:1-840)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVS-SNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLT
..:: ... . : . :.. :.:::::::: .::..::: .. :.. .:
CCDS47 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPP-KLL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 PHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTD
:.:: .....:: .: ::::::.:::::::::....:: .:::::.::: :::::::.:
CCDS47 PQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 GTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAIN
.. ::.:.::.:. ::.:.:..:.:.::.:.::.:::::.:: :::.::::.:::::.:
CCDS47 TSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 VGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIAN
. . . .: :: :::::: :::: :..::: ...: :. :.: . :. :::::.::
CCDS47 ILTTT----EEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILAN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 LGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSAL
::: : :: :.. .::::.:::.:.: :.. .:....:.. . ... . ::::::
CCDS47 LGFMDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSAL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 TYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGN
:::.:.::.:::..::.:::.:::::::::::::::::::::..:.:::.::. :::.::
CCDS47 TYDGVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 IKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVT
..:...:.: :::....:.: .: ::::::.: ::.: . :. .:.:.:...:.: .::
CCDS47 VQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 TILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTK
::::.::::.::: ...:::.:::::::.:::::::: :..:.: ::.:::::::: :::
CCDS47 TILEDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 IWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFL
:::::::::::.::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AWNGMVGELVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 DPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::. .:...::::::::::
CCDS47 DPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLW
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 FSLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAED
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAED
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 LSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKG
:.::::::::::..:::::::::::::::.::::::.::::::::::: ::. :::::::
CCDS47 LAKQTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKG
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 KYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: ::::::::::::::
CCDS47 KYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQGV
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 LDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKS
:::::.::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS47 LDKLKSKWWYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKS
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880
pF1KB4 RAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
:.:.::::
CCDS47 RSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPC
840 850 860 870 880 890
>>CCDS4322.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 (906 aa)
initn: 3545 init1: 3461 opt: 4127 Z-score: 5126.9 bits: 959.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4127; 71.1% identity (90.2% similar) in 845 aa overlap (4-847:1-840)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVS-SNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLT
..:: ... . : . :.. :.:::::::: .::..::: .. :.. .:
CCDS43 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPP-KLL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 PHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTD
:.:: .....:: .: ::::::.:::::::::....:: .:::::.::: :::::::.:
CCDS43 PQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 GTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAIN
.. ::.:.::.:. ::.:.:..:.:.::.:.::.:::::.:: :::.::::.:::::.:
CCDS43 TSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 VGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIAN
. . . .: :: :::::: :::: :..::: ...: :. :.: . :. :::::.::
CCDS43 ILTTT----EEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILAN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 LGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSAL
::: : :: :.. .::::.:::.:.: :.. .:....:.. . ... . ::::::
CCDS43 LGFMDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSAL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 TYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGN
:::.:.::.:::..::.:::.:::::::::::::::::::::..:.:::.::. :::.::
CCDS43 TYDGVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 IKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVT
..:...:.: :::....:.: .: ::::::.: ::.: . :. .:.:.:...:.: .::
CCDS43 VQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 TILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTK
::::.::::.::: ...:::.:::::::.:::::::: :..:.: ::.:::::::: :::
CCDS43 TILEDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 IWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFL
:::::::::::.::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AWNGMVGELVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 DPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::. .:...::::::::::
CCDS43 DPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLW
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 FSLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAED
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAED
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 LSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKG
:.::::::::::..:::::::::::::::.::::::.::::::::::: ::. :::::::
CCDS43 LAKQTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKG
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 KYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::.:::.
CCDS43 KYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRNPVNLAVLKLNEQGL
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 LDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKS
::::::::::::::::. . ::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS43 LDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKS
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880
pF1KB4 RAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
:.:.::::
CCDS43 RSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPC
840 850 860 870 880 890
>>CCDS58988.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 (916 aa)
initn: 3551 init1: 3492 opt: 4114 Z-score: 5110.7 bits: 956.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4114; 72.9% identity (91.1% similar) in 820 aa overlap (28-847:36-850)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFR
.. :::: .::..::: .. :. : .
CCDS58 HLFQPLQLAGGLEWPWSNLLCFLTPVKLHPEVWGLFPNQQSQEHAAFRFALSQL-TEPPK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 LTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFP
: :.:: .....:: .: ::::::.:::::::::....:: .:::::.::: :::::::
CCDS58 LLPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 TDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTA
.: .. ::.:.::.:. ::.:.:..:.:.::.:.::.:::::.:: :::.::::.:::::
CCDS58 VDTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 INVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYII
.:. . . .: :: :::::: :::: :..::: ...: :. :.: . :. :::::.
CCDS58 VNILTTT----EEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYIL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 ANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTS
::::: : :: :.. .::::.:::.:.: :.. .:....:.. . ... . ::::
CCDS58 ANLGFMDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 ALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLS
:::::.:.::.:::..::.:::.:::::::::::::::::::::..:.:::.::. :::.
CCDS58 ALTYDGVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLT
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 GNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVV
::..:...:.: :::....:.: .: ::::::.: ::.: . :. .:.:.:...:.: .
CCDS58 GNVQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 VTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDAD
::::::.::::.::: ...:::.:::::::.:::::::: :..:.: ::.:::::::: :
CCDS58 VTTILEDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPD
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 TKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFS
:: :::::::::::.::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TKAWNGMVGELVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 FLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::. .:...::::::::
CCDS58 FLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNS
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 LWFSLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESA
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESA
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 EDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKS
:::.::::::::::..:::::::::::::::.::::::.::::::::::: ::. :::::
CCDS58 EDLAKQTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKS
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 KGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: ::::::::::::
CCDS58 KGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQ
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 GVLDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCY
:::::::.::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS58 GVLDKLKSKWWYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCY
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880
pF1KB4 KSRAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
:::.:.::::
CCDS58 KSRSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSI
850 860 870 880 890 900
883 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 15:23:28 2016 done: Thu Nov 3 15:23:29 2016
Total Scan time: 3.270 Total Display time: 0.300
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]