Result of FASTA (omim) for
pF1KB4714
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4714, 874 aa
1>>>pF1KB4714 874 - 874 aa - 874 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9420+/-0.000524; mu= 17.3459+/- 0.033
mean_var=78.2355+/-15.409, 0's: 0 Z-trim(107.3): 53 B-trim: 152 in 1/54
Lambda= 0.145001
statistics sampled from 15383 (15416) to 15383 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.528), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16
Scan time: 10.340
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_057212 (OMIM: 615525) coatomer subunit gamma-1 ( 874) 5650 1192.7 0
NP_036265 (OMIM: 604355) coatomer subunit gamma-2 ( 871) 4694 992.7 0
NP_001276962 (OMIM: 604355) coatomer subunit gamma ( 726) 3900 826.6 0
XP_011510851 (OMIM: 615525) PREDICTED: coatomer su ( 536) 3297 700.4 5.7e-201
NP_006585 (OMIM: 607245,614066) AP-4 complex subun ( 739) 246 62.2 1e-08
NP_001240781 (OMIM: 607245,614066) AP-4 complex su ( 739) 246 62.2 1e-08
XP_016855577 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 700) 237 60.3 3.6e-08
NP_001240782 (OMIM: 607245,614066) AP-4 complex su ( 640) 192 50.9 2.3e-05
NP_001295241 (OMIM: 607245,614066) AP-4 complex su ( 571) 158 43.8 0.0029
XP_016855579 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 571) 158 43.8 0.0029
XP_011538825 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 664) 158 43.8 0.0032
XP_011538826 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 664) 158 43.8 0.0032
>>NP_057212 (OMIM: 615525) coatomer subunit gamma-1 [Hom (874 aa)
initn: 5650 init1: 5650 opt: 5650 Z-score: 6386.0 bits: 1192.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5650; 100.0% identity (100.0% similar) in 874 aa overlap (1-874:1-874)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MLKKFDKKDEESGGGSNPFQHLEKSAVLQEARVFNETPINPRKCAHILTKILYLINQGEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MLKKFDKKDEESGGGSNPFQHLEKSAVLQEARVFNETPINPRKCAHILTKILYLINQGEH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LGTTEATEAFFAMTKLFQSNDPTLRRMCYLTIKEMSCIAEDVIIVTSSLTKDMTGKEDNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LGTTEATEAFFAMTKLFQSNDPTLRRMCYLTIKEMSCIAEDVIIVTSSLTKDMTGKEDNY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RGPAVRALCQITDSTMLQAIERYMKQAIVDKVPSVSSSALVSSLHLLKCSFDVVKRWVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 RGPAVRALCQITDSTMLQAIERYMKQAIVDKVPSVSSSALVSSLHLLKCSFDVVKRWVNE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 AQEAASSDNIMVQYHALGLLYHVRKNDRLAVNKMISKVTRHGLKSPFAYCMMIRVASKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 AQEAASSDNIMVQYHALGLLYHVRKNDRLAVNKMISKVTRHGLKSPFAYCMMIRVASKQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EEEDGSRDSPLFDFIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNLPGCSAKELAPAVSVLQLFCSSPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 EEEDGSRDSPLFDFIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNLPGCSAKELAPAVSVLQLFCSSPK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 AALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLVTDSNRSIATLAITTLLKTGSESSIDRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 AALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLVTDSNRSIATLAITTLLKTGSESSIDRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 MKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLREEGGFEYKRAIVDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLREEGGFEYKRAIVDC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 IISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTTNPSKYIRFIYNRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 IISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTTNPSKYIRFIYNRV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 VLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 VLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 ALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPMAEQRTESTPITAVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPMAEQRTESTPITAVK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 QPEKVAATRQEIFQEQLAAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTNHMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 QPEKVAATRQEIFQEQLAAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTNHMV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 FQFDCTNTLNDQTLENVTVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 FQFDCTNTLNDQTLENVTVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 ACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKLNFEAAWDEVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKLNFEAAWDEVG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 DEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 DEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDI
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KB4 LVRSRLLLLDTVTMQVTARSLEELPVDIILASVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LVRSRLLLLDTVTMQVTARSLEELPVDIILASVG
850 860 870
>>NP_036265 (OMIM: 604355) coatomer subunit gamma-2 isof (871 aa)
initn: 4540 init1: 3299 opt: 4694 Z-score: 5305.2 bits: 992.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4694; 80.8% identity (93.5% similar) in 874 aa overlap (1-874:1-871)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MLKKFDKKDEESGGGSNPFQHLEKSAVLQEARVFNETPINPRKCAHILTKILYLINQGEH
:.:::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::.: :::::::::.:::::
NP_036 MIKKFDKKDEESGSGSNPFQHLEKSAVLQEARIFNETPINPRRCLHILTKILYLLNQGEH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LGTTEATEAFFAMTKLFQSNDPTLRRMCYLTIKEMSCIAEDVIIVTSSLTKDMTGKEDNY
.:::::::::::::.:::::: :::::::::::::. :.::::::::::::::::::: :
NP_036 FGTTEATEAFFAMTRLFQSNDQTLRRMCYLTIKEMATISEDVIIVTSSLTKDMTGKEDVY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RGPAVRALCQITDSTMLQAIERYMKQAIVDKVPSVSSSALVSSLHLLKCSFDVVKRWVNE
::::.::::.:::.:::::::::::::::::: ::::::::::::..: :.::::::.::
NP_036 RGPAIRALCRITDGTMLQAIERYMKQAIVDKVSSVSSSALVSSLHMMKISYDVVKRWINE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 AQEAASSDNIMVQYHALGLLYHVRKNDRLAVNKMISKVTRHGLKSPFAYCMMIRVASKQL
::::::::::::::::::.:::.::::::::.::..: :. :::: :::::.::.::. :
NP_036 AQEAASSDNIMVQYHALGVLYHLRKNDRLAVSKMLNKFTKSGLKSQFAYCMLIRIASRLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EEEDGSRDSPLFDFIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNLPGCSAKELAPAVSVLQLFCSSPK
.: . ...::::::::::::::::::.:::::::..::.:.:.:::::::::::::::::
NP_036 KETEDGHESPLFDFIESCLRNKHEMVIYEAASAIIHLPNCTARELAPAVSVLQLFCSSPK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 AALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLVTDSNRSIATLAITTLLKTGSESSIDRL
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:::
NP_036 PALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLITDSNRSIATLAITTLLKTGSESSVDRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 MKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLREEGGFEYKRAIVDC
:::::::.::::::::::::::::::::::::::.:.:.:: .:::..::::::::::::
NP_036 MKQISSFVSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHSVMMTFLSNMLRDDGGFEYKRAIVDC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 IISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTTNPSKYIRFIYNRV
::::.::: ::::.::.:::::::::: :::::.::::::.:::.: ::::::::.:::
NP_036 IISIVEENPESKEAGLAHLCEFIEDCEHTVLATKILHLLGKEGPRTPVPSKYIRFIFNRV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 VLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQK
:::.: :::.::::::::::::: .::::::::.::.:: :.:::::::::::::.:.:
NP_036 VLENEAVRAAAVSALAKFGAQNESLLPSILVLLQRCMMDTDDEVRDRATFYLNVLQQRQM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 ALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPMAEQRTESTPITAVK
:::: ::.::::::.::.:.::.::::::::::::.::.::: ::. ::..: : ..:.:
NP_036 ALNATYIFNGLTVSVPGMEKALHQYTLEPSEKPFDMKSIPLAMAPVFEQKAEIT-LVATK
550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 QPEKVAATRQEIFQEQLAAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTNHMV
:::.: .::.::::::::.::: ..::::::: ::: :::.:::: .:: :: ::::.:
NP_036 -PEKLAPSRQDIFQEQLAAIPEFLNIGPLFKSS-EPVQLTEAETEYFVRCIKHMFTNHIV
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 FQFDCTNTLNDQTLENVTVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAV
:::::::::::: ::.:::::::...:::: .:: :::::::: ::::: :: .:::::
NP_036 FQFDCTNTLNDQLLEKVTVQMEPSDSYEVLSCIPAPSLPYNQPGICYTLVRLPDDDPTAV
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 ACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKLNFEAAWDEVG
: .::: :::::.::::.:: :..::.::::::::::::.::::::.: :: :::.:::
NP_036 AGSFSCTMKFTVRDCDPNTGVPDEDGYDDEYVLEDLEVTVSDHIQKVLKPNFAAAWEEVG
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 DEFEKEETFTLSTIKTLEEAVGNIVKFLGMHPCERSDKVPDNKNTHTLLLAGVFRGGHDI
: :::::::.::. :::::::.::. ::::.:::::::::.:::.:.: :::.::::.:.
NP_036 DTFEKEETFALSSTKTLEEAVNNIITFLGMQPCERSDKVPENKNSHSLYLAGIFRGGYDL
780 790 800 810 820 830
850 860 870
pF1KB4 LVRSRLLLLDTVTMQVTARSLEELPVDIILASVG
:::::: : : ::::::.:: :. :::.::::::
NP_036 LVRSRLALADGVTMQVTVRSKERTPVDVILASVG
840 850 860 870
>>NP_001276962 (OMIM: 604355) coatomer subunit gamma-2 i (726 aa)
initn: 3737 init1: 3290 opt: 3900 Z-score: 4408.7 bits: 826.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3900; 81.9% identity (94.2% similar) in 719 aa overlap (1-719:1-716)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MLKKFDKKDEESGGGSNPFQHLEKSAVLQEARVFNETPINPRKCAHILTKILYLINQGEH
:.:::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::.: :::::::::.:::::
NP_001 MIKKFDKKDEESGSGSNPFQHLEKSAVLQEARIFNETPINPRRCLHILTKILYLLNQGEH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LGTTEATEAFFAMTKLFQSNDPTLRRMCYLTIKEMSCIAEDVIIVTSSLTKDMTGKEDNY
.:::::::::::::.:::::: :::::::::::::. :.::::::::::::::::::: :
NP_001 FGTTEATEAFFAMTRLFQSNDQTLRRMCYLTIKEMATISEDVIIVTSSLTKDMTGKEDVY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RGPAVRALCQITDSTMLQAIERYMKQAIVDKVPSVSSSALVSSLHLLKCSFDVVKRWVNE
::::.::::.:::.:::::::::::::::::: ::::::::::::..: :.::::::.::
NP_001 RGPAIRALCRITDGTMLQAIERYMKQAIVDKVSSVSSSALVSSLHMMKISYDVVKRWINE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 AQEAASSDNIMVQYHALGLLYHVRKNDRLAVNKMISKVTRHGLKSPFAYCMMIRVASKQL
::::::::::::::::::.:::.::::::::.::..: :. :::: :::::.::.::. :
NP_001 AQEAASSDNIMVQYHALGVLYHLRKNDRLAVSKMLNKFTKSGLKSQFAYCMLIRIASRLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EEEDGSRDSPLFDFIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNLPGCSAKELAPAVSVLQLFCSSPK
.: . ...::::::::::::::::::.:::::::..::.:.:.:::::::::::::::::
NP_001 KETEDGHESPLFDFIESCLRNKHEMVIYEAASAIIHLPNCTARELAPAVSVLQLFCSSPK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 AALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLVTDSNRSIATLAITTLLKTGSESSIDRL
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:::
NP_001 PALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLITDSNRSIATLAITTLLKTGSESSVDRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 MKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLREEGGFEYKRAIVDC
:::::::.::::::::::::::::::::::::::.:.:.:: .:::..::::::::::::
NP_001 MKQISSFVSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHSVMMTFLSNMLRDDGGFEYKRAIVDC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 IISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTTNPSKYIRFIYNRV
::::.::: ::::.::.:::::::::: :::::.::::::.:::.: ::::::::.:::
NP_001 IISIVEENPESKEAGLAHLCEFIEDCEHTVLATKILHLLGKEGPRTPVPSKYIRFIFNRV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 VLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDDDNEVRDRATFYLNVLEQKQK
:::.: :::.::::::::::::: .::::::::.::.:: :.:::::::::::::.:.:
NP_001 VLENEAVRAAAVSALAKFGAQNESLLPSILVLLQRCMMDTDDEVRDRATFYLNVLQQRQM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 ALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSVPLATAPMAEQRTESTPITAVK
:::: ::.::::::.::.:.::.::::::::::::.::.::: ::. ::..: : ..:.:
NP_001 ALNATYIFNGLTVSVPGMEKALHQYTLEPSEKPFDMKSIPLAMAPVFEQKAEIT-LVATK
550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 QPEKVAATRQEIFQEQLAAVPEFRGLGPLFKSSPEPVALTESETEYVIRCTKHTFTNHMV
:::.: .::.::::::::.::: ..::::::: ::: :::.:::: .:: :: ::::.:
NP_001 -PEKLAPSRQDIFQEQLAAIPEFLNIGPLFKSS-EPVQLTEAETEYFVRCIKHMFTNHIV
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 FQFDCTNTLNDQTLENVTVQMEPTEAYEVLCYVPARSLPYNQPGTCYTLVALPKEDPTAV
:::::::::::: ::.:::::::...:::: .:: :::::::: ::::: :: .::::
NP_001 FQFDCTNTLNDQLLEKVTVQMEPSDSYEVLSCIPAPSLPYNQPGICYTLVRLPDDDPTAG
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 ACTFSCMMKFTVKDCDPTTGETDDEGYEDEYVLEDLEVTVADHIQKVMKLNFEAAWDEVG
NP_001 TNPQKGGDT
720
>>XP_011510851 (OMIM: 615525) PREDICTED: coatomer subuni (536 aa)
initn: 3297 init1: 3297 opt: 3297 Z-score: 3729.0 bits: 700.4 E(85289): 5.7e-201
Smith-Waterman score: 3297; 100.0% identity (100.0% similar) in 515 aa overlap (1-515:1-515)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MLKKFDKKDEESGGGSNPFQHLEKSAVLQEARVFNETPINPRKCAHILTKILYLINQGEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLKKFDKKDEESGGGSNPFQHLEKSAVLQEARVFNETPINPRKCAHILTKILYLINQGEH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LGTTEATEAFFAMTKLFQSNDPTLRRMCYLTIKEMSCIAEDVIIVTSSLTKDMTGKEDNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGTTEATEAFFAMTKLFQSNDPTLRRMCYLTIKEMSCIAEDVIIVTSSLTKDMTGKEDNY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RGPAVRALCQITDSTMLQAIERYMKQAIVDKVPSVSSSALVSSLHLLKCSFDVVKRWVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RGPAVRALCQITDSTMLQAIERYMKQAIVDKVPSVSSSALVSSLHLLKCSFDVVKRWVNE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 AQEAASSDNIMVQYHALGLLYHVRKNDRLAVNKMISKVTRHGLKSPFAYCMMIRVASKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AQEAASSDNIMVQYHALGLLYHVRKNDRLAVNKMISKVTRHGLKSPFAYCMMIRVASKQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EEEDGSRDSPLFDFIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNLPGCSAKELAPAVSVLQLFCSSPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EEEDGSRDSPLFDFIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNLPGCSAKELAPAVSVLQLFCSSPK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLVTDSNRSIATLAITTLLKTGSESSIDRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLREEGGFEYKRAIVDC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATRILHLLGQEGPKTTNPSKYIRFIYNRV
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLEHEEVRAGAVSALAKFGAQNEEMLPSILVLLKRELSVHECGLSSLPPPSAWGHH
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... ... ..:: . . .:. :.:
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. ....:..: :. ::. : :.. ...: :. . .: ::: ..
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. .: . : : .. :.. ...:: : ::. . : . . ..: ..
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:: ::: ...: :... ::. :.. .. : : .. :. . . :
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.. ......... .. ...: .: ... ::... . : . . ... :. ::.: .
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..:. . ... . :. .:. . :: .. .. .. ::: .: . :
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::. :: .:
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pF1KB4 SNPFQHLEKSAVLQEARVFNETPINPRKCAHILTKILYLINQGEHLGTTEATEAFFAMTK
... ... ..:: . . .:. :.:
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. ....:..: :. ::. : :.. ...: :. . .: ::: ..
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. .: . : : .. :.. ...:: : ::. . : . . ..: ..
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:: ::: ...: :... ::. :.. .. : : .. :. . . :
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::: . : ..:. . .. . :. .. . .. . : . .: .
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.. ......... .. ...: .: ... ::... . : . . ... :. ::.: .
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..:. . ... . :. .:. . :: .. .. .. ::: .: . :
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pF1KB4 -PSKYIRFIYNRVVLEHEEVRAGAVSALAK-FGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDD-DNEVR
: :. : :. ..:: . : .. : . :: :. .. : ::
NP_001 APYVLEDFVENVKSETFPAVKMELLTALLRLFLSRPAECQDMLGRLLYYCIEEEKDMAVR
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::. :: .:
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:. ... ..: :: . . :: :.:..: : . ....:..: :. ::.
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pF1KB4 VSSSALV--SSLHLLKCSFDVVKRWVNEAQEAASSDNIMVQYHALGLLYHVRKNDR-LAV
: :.. ...: :. . .: ::: ... .: . : : .. :.. ...
XP_016 VRRVAVLGCAKMHNLHGDSEVDGALVNELYSLLRDQDPIVVVNCLRSLEEILKQEGGVVI
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:: : ::. . : . . ..: .. :: ::: ...: :.
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.. ::. :.. .. : : .. :. . . : ::: . : ..:. . ..
XP_016 SSSPGVVMGATKLFLILAKMFPHVQTDVLVRVKGPLLAACSSESRELCFVALCHVRQILH
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. :. .. . .. . : . .: . .. ......... .. ...: .:
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... ::... . : . . ... :. ::.: . ..:. . ... . :.
XP_016 QAAIFAIGGIARTYTDQCVQILTELLG-LRQE---HITTVVVQTFRDLVWLCPQCTEA--
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.:. . :: .. .. .. ::: .: . : : :. : :.
XP_016 --VCQALPGCEENIQDSEGKQALIWLLGVHGERIPNAPYVLEDFVENVKSETFPAVKMEL
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..:: . : .. : . :: :. .. : ::::. :: .:
XP_016 LTALLRLFLSRPAECQDMLGRLLYYCIEEEKDMAVRDRGLFYYRLLLVGIDEVKRILCSP
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XP_016 KSDPTLGLLEDPAERPVNSWASDFNTLVPVYGKAHWATISKCQGAERCDPELPKTSSFAA
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::. : :.. ...: :. . .: ::: ... .: . : : ..
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:.. ...:: : ::. . : . . ..: .. :: :::
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pF1KB4 -FIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNL----PGCSAKELAPAVSVLQLFCSSPKAALRYAAV
...: :... ::. :.. .. : : .. :. . . : ::: . : ..:.
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. .. . :. .. . .. . : . .: . .. ......... ..
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...: .: ... ::... . : . . ... :. ::.: . ..:. . ...
NP_001 TDVSADFAQAAIFAIGGIARTYTDQCVQILTELLG-LRQE---HITTVVVQTFRDLVWLC
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pF1KB4 SESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATR----ILHLLGQEGPKTTN-PSKYIRFIYNRVVLE
. :. .:. . :: .. .. .. ::: .: . : : :. :
NP_001 PQCTEA----VCQALPGCEENIQDSEGKQALIWLLGVHGERIPNAPYVLEDFVENVKSET
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pF1KB4 HEEVRAGAVSALAK-FGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDD-DNEVRDRATFYLNVLEQKQKA
:. ..:: . : .. : . :: :. .. : ::::. :: .:
NP_001 FPAVKMELLTALLRLFLSRPAECQDMLGRLLYYCIEEEKDMAVRDRGLFYYRLLLVGIDE
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pF1KB4 DVVKRWVNEAQEAASSDNIMVQYHALGLLYHVRKNDRLAVNKMISKVTRHGLKSPFAYCM
:. . ::: ..:..: : . . ..
NP_001 MPYLGSEDVVKELKKALCNPHI-QADRLRYRNVIQRVIRMSKLDQWGQAE
10 20 30 40
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pF1KB4 MIRVASK-QLEEEDGSRDSPLFDFIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNL----PGCSAKELA
.. . : . :. : ......: :... ::. :.. .. : : .. :.
NP_001 VLNFLLRYQPRSEEELFD--ILNLLDSFLKSSSPGVVMGATKLFLILAKMFPHVQTDVLV
50 60 70 80 90 100
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pF1KB4 PAVSVLQLFCSSPKAALRYAAVRTLNKVAMKHPSAVTACNLDLENLVTDSNRSIATLAIT
. . : ::: . : ..:. . .. . :. .. . .. . : .
NP_001 RVKGPLLAACSSESRELCFVALCHVRQILHSLPGHFSSHYKKFFCSYSEPHY-IKLQKVE
110 120 130 140 150 160
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pF1KB4 TLLKTGSESSIDRLMKQISSFMSEISDEFKVVVVQAISALCQKYPRKHAVLMNFLFTMLR
.: . .. ......... .. ...: .: ... ::... . : . . ... :. ::
NP_001 VLCELVNDENVQQVLEELRGYCTDVSADFAQAAIFAIGGIARTYTDQCVQILTELLG-LR
170 180 190 200 210 220
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pF1KB4 EEGGFEYKRAIVDCIISIIEENSESKETGLSHLCEFIEDCEFTVLATR----ILHLLGQE
.: . ..:. . ... . :. .:. . :: .. .. .. ::: .
NP_001 QE---HITTVVVQTFRDLVWLCPQCTEA----VCQALPGCEENIQDSEGKQALIWLLGVH
230 240 250 260 270
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pF1KB4 GPKTTN-PSKYIRFIYNRVVLEHEEVRAGAVSALAK-FGAQNEEMLPSILVLLKRCVMDD
: . : : :. : :. ..:: . : .. : . :: :. ..
NP_001 GERIPNAPYVLEDFVENVKSETFPAVKMELLTALLRLFLSRPAECQDMLGRLLYYCIEEE
280 290 300 310 320 330
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pF1KB4 -DNEVRDRATFYLNVLEQKQKALNAGYILNGLTVSIPGLERALQQYTLEPSEKPFDLKSV
: ::::. :: .:
NP_001 KDMAVRDRGLFYYRLLLVGIDEVKRILCSPKSDPTLGLLEDPAERPVNSWASDFNTLVPV
340 350 360 370 380 390
>>XP_016855579 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 com (571 aa)
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pF1KB4 DVVKRWVNEAQEAASSDNIMVQYHALGLLYHVRKNDRLAVNKMISKVTRHGLKSPFAYCM
:. . ::: ..:..: : . . ..
XP_016 MPYLGSEDVVKELKKALCNPHI-QADRLRYRNVIQRVIRMSKLDQWGQAE
10 20 30 40
240 250 260 270 280
pF1KB4 MIRVASK-QLEEEDGSRDSPLFDFIESCLRNKHEMVVYEAASAIVNL----PGCSAKELA
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