Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4757
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4757, 544 aa
1>>>pF1KB4757 544 - 544 aa - 544 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4747+/-0.00198; mu= 9.8752+/- 0.116
mean_var=275.6030+/-56.805, 0's: 0 Z-trim(104.1): 942 B-trim: 82 in 1/50
Lambda= 0.077256
statistics sampled from 6721 (7744) to 6721 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.543), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 2.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 3900 449.4 5e-126
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1979 235.4 1.5e-61
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1979 235.4 1.6e-61
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1979 235.4 1.6e-61
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1979 235.4 1.6e-61
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1927 229.7 9e-60
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1907 227.5 4.4e-59
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1893 225.9 1.3e-58
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1892 225.9 1.5e-58
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1892 225.9 1.5e-58
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1888 225.4 2e-58
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1888 225.4 2e-58
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1884 224.8 2.5e-58
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1876 223.9 4.3e-58
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1858 221.9 1.7e-57
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1858 221.9 1.8e-57
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1858 222.0 2e-57
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1859 222.3 2.2e-57
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1859 222.4 2.2e-57
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1853 221.2 2.3e-57
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1855 221.9 3.2e-57
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1855 222.0 3.2e-57
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1843 220.3 5.8e-57
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1839 219.8 7.6e-57
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1837 219.5 8.1e-57
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1837 219.6 9.4e-57
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1837 219.6 9.4e-57
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1832 219.1 1.5e-56
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1829 218.8 1.9e-56
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1829 218.8 1.9e-56
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1829 218.8 1.9e-56
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1825 218.2 2.2e-56
CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19 ( 588) 1824 218.1 2.3e-56
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 1817 217.2 3.5e-56
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1816 217.1 3.9e-56
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1817 217.3 4.1e-56
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1817 217.4 4.3e-56
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 1816 217.5 5.7e-56
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1813 217.0 6.1e-56
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1813 217.0 6.6e-56
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1813 217.0 6.6e-56
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1813 217.1 6.6e-56
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 1813 217.1 6.7e-56
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1812 216.9 6.8e-56
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1804 216.0 1.3e-55
CCDS46164.1 ZNF880 gene_id:400713|Hs108|chr19 ( 577) 1798 215.2 1.7e-55
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 1798 215.2 1.8e-55
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1790 214.5 4.1e-55
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1785 214.1 6.7e-55
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1780 213.2 7.3e-55
>>CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 (544 aa)
initn: 3900 init1: 3900 opt: 3900 Z-score: 2376.1 bits: 449.4 E(32554): 5e-126
Smith-Waterman score: 3900; 100.0% identity (100.0% similar) in 544 aa overlap (1-544:1-544)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MLNMQGAEERDIRRETCPGWVNKNKPALEQDVCKIDSSGIVVKRFQEDEYQDSTFEEKYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MLNMQGAEERDIRRETCPGWVNKNKPALEQDVCKIDSSGIVVKRFQEDEYQDSTFEEKYA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 CEGMKENSPREIAESCLFQEGGFGRITFIHKEAPPEIISQGYNFEKSLLLTSSLVTRLRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CEGMKENSPREIAESCLFQEGGFGRITFIHKEAPPEIISQGYNFEKSLLLTSSLVTRLRV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 STEESLHQWETSNIQTNDISDQSKCPTLCTQKKSWKCNECGKTFTQSSSLTQHQRTHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 STEESLHQWETSNIQTNDISDQSKCPTLCTQKKSWKCNECGKTFTQSSSLTQHQRTHTGE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RPYTCEECGKAFSRSSFLVQHQRIHTGVKPYGCEQCGKTFRCRSFLTQHQRIHTGEKPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 RPYTCEECGKAFSRSSFLVQHQRIHTGVKPYGCEQCGKTFRCRSFLTQHQRIHTGEKPYK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 CNECGNSFRNHSHLTEHQRIHTGEKPYKCNRCGKAFNQNTHLIHHQRIHTGEKPYICSEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CNECGNSFRNHSHLTEHQRIHTGEKPYKCNRCGKAFNQNTHLIHHQRIHTGEKPYICSEC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 GSSFRKHSNLTQHQRIHTGEKPHKCDECGKTFQTKANLSQHQRIHSGEKPYKCKECGKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 GSSFRKHSNLTQHQRIHTGEKPHKCDECGKTFQTKANLSQHQRIHSGEKPYKCKECGKAF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 CQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCKECGKAFTQSTPLTKHQRIHTGERPYKCSECGKAFIQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCKECGKAFTQSTPLTKHQRIHTGERPYKCSECGKAFIQSI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 CLIRHQRSHTGEKPYKCNECGKGFNQNTCLTQHMRIHTGEKPYKCKECGKAFAHSSSLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CLIRHQRSHTGEKPYKCNECGKGFNQNTCLTQHMRIHTGEKPYKCKECGKAFAHSSSLTE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 HHRTHTGEKLYKCSECEKTFRKYAHLSEHYRIHTGEKPYECIECGKFFRHSSVLFRHQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 HHRTHTGEKLYKCSECEKTFRKYAHLSEHYRIHTGEKPYECIECGKFFRHSSVLFRHQKL
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 HSGD
::::
CCDS27 HSGD
>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 7382 init1: 1950 opt: 1979 Z-score: 1218.4 bits: 235.4 E(32554): 1.5e-61
Smith-Waterman score: 1979; 59.5% identity (79.7% similar) in 454 aa overlap (91-543:168-616)
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 CEGMKENSPREIAESCLFQEGGFGRITFIHKEAPPEIISQGYNFEKSLLLTSSLVTRLRV
:: : . : : .: :.:. . :.
CCDS74 MTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHS----SALIEHHRT
140 150 160 170 180 190
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 STEESLHQWETSNIQTNDISDQSKCPTLCTQKKSWKCNECGKTFTQSSSLTQHQRTHTGE
: : .. . . : .: . : .: .::..::.::.: . : :::::::::
CCDS74 HTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGE
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230
pF1KB4 RPYTCEECGKAFS-RSSFLVQHQRIHTGVKPYGCEQCGKTFRCRSFLTQHQRIHTGEKPY
.:: : ::::.:: :::: ::.: ::: ::: : .:::.:: :::: :::::::::
CCDS74 KPYECSECGKSFSFRSSF-SQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPY
260 270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 KCNECGNSFRNHSHLTEHQRIHTGEKPYKCNRCGKAFNQNTHLIHHQRIHTGEKPYICSE
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CCDS74 QCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGE
320 330 340 350 360 370
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 CGSSFRKHSNLTQHQRIHTGEKPHKCDECGKTFQTKANLSQHQRIHSGEKPYKCKECGKA
::..: . . ::.:.::::::::. :.::::::. ...::::.: :.:::::.:..::::
CCDS74 CGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKA
380 390 400 410 420 430
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 FCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCKECGKAFTQSTPLTKHQRIHTGERPYKCSECGKAFIQS
: :: : .:::::::::::.:..:::::..:. :::::::::::.::.:..::.:: :
CCDS74 FRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQL
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 ICLIRHQRSHTGEKPYKCNECGKGFNQNTCLTQHMRIHTGEKPYKCKECGKAFAHSSSLT
::.::: :::::::.::.::..:.:.. : .:.:::: :::: :.::::.:.:::::.
CCDS74 APLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLS
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 EHHRTHTGEKLYKCSECEKTFRKYAHLSEHYRIHTGEKPYECIECGKFFRHSSVLFRHQK
.:.::::::: :.: .: :.::. .::..: ::::::::: : .::: : ::: : .::.
CCDS74 QHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQR
560 570 580 590 600 610
540
pF1KB4 LHSGD
:.:
CCDS74 THTG
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
initn: 7382 init1: 1950 opt: 1979 Z-score: 1218.1 bits: 235.4 E(32554): 1.6e-61
Smith-Waterman score: 1979; 59.5% identity (79.7% similar) in 454 aa overlap (91-543:210-658)
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 CEGMKENSPREIAESCLFQEGGFGRITFIHKEAPPEIISQGYNFEKSLLLTSSLVTRLRV
:: : . : : .: :.:. . :.
CCDS74 MTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHS----SALIEHHRT
180 190 200 210 220 230
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 STEESLHQWETSNIQTNDISDQSKCPTLCTQKKSWKCNECGKTFTQSSSLTQHQRTHTGE
: : .. . . : .: . : .: .::..::.::.: . : :::::::::
CCDS74 HTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGE
240 250 260 270 280 290
190 200 210 220 230
pF1KB4 RPYTCEECGKAFS-RSSFLVQHQRIHTGVKPYGCEQCGKTFRCRSFLTQHQRIHTGEKPY
.:: : ::::.:: :::: ::.: ::: ::: : .:::.:: :::: :::::::::
CCDS74 KPYECSECGKSFSFRSSF-SQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPY
300 310 320 330 340 350
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 KCNECGNSFRNHSHLTEHQRIHTGEKPYKCNRCGKAFNQNTHLIHHQRIHTGEKPYICSE
.:.:::..: . : ::.:::::::::::.:..:::::.: : ::.::: ::::::: :.:
CCDS74 QCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGE
360 370 380 390 400 410
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 CGSSFRKHSNLTQHQRIHTGEKPHKCDECGKTFQTKANLSQHQRIHSGEKPYKCKECGKA
::..: . . ::.:.::::::::. :.::::::. ...::::.: :.:::::.:..::::
CCDS74 CGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKA
420 430 440 450 460 470
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 FCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCKECGKAFTQSTPLTKHQRIHTGERPYKCSECGKAFIQS
: :: : .:::::::::::.:..:::::..:. :::::::::::.::.:..::.:: :
CCDS74 FRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQL
480 490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 ICLIRHQRSHTGEKPYKCNECGKGFNQNTCLTQHMRIHTGEKPYKCKECGKAFAHSSSLT
::.::: :::::::.::.::..:.:.. : .:.:::: :::: :.::::.:.:::::.
CCDS74 APLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLS
540 550 560 570 580 590
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 EHHRTHTGEKLYKCSECEKTFRKYAHLSEHYRIHTGEKPYECIECGKFFRHSSVLFRHQK
.:.::::::: :.: .: :.::. .::..: ::::::::: : .::: : ::: : .::.
CCDS74 QHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQR
600 610 620 630 640 650
540
pF1KB4 LHSGD
:.:
CCDS74 THTG
>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (670 aa)
initn: 7382 init1: 1950 opt: 1979 Z-score: 1218.0 bits: 235.4 E(32554): 1.6e-61
Smith-Waterman score: 1979; 59.5% identity (79.7% similar) in 454 aa overlap (91-543:222-670)
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 CEGMKENSPREIAESCLFQEGGFGRITFIHKEAPPEIISQGYNFEKSLLLTSSLVTRLRV
:: : . : : .: :.:. . :.
CCDS12 MTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHS----SALIEHHRT
200 210 220 230 240
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 STEESLHQWETSNIQTNDISDQSKCPTLCTQKKSWKCNECGKTFTQSSSLTQHQRTHTGE
: : .. . . : .: . : .: .::..::.::.: . : :::::::::
CCDS12 HTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGE
250 260 270 280 290 300
190 200 210 220 230
pF1KB4 RPYTCEECGKAFS-RSSFLVQHQRIHTGVKPYGCEQCGKTFRCRSFLTQHQRIHTGEKPY
.:: : ::::.:: :::: ::.: ::: ::: : .:::.:: :::: :::::::::
CCDS12 KPYECSECGKSFSFRSSF-SQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPY
310 320 330 340 350 360
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 KCNECGNSFRNHSHLTEHQRIHTGEKPYKCNRCGKAFNQNTHLIHHQRIHTGEKPYICSE
.:.:::..: . : ::.:::::::::::.:..:::::.: : ::.::: ::::::: :.:
CCDS12 QCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGE
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540
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CCDS12 THTG
670
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CCDS54 THTG
680
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CCDS12 FSHGSQVYM
680
>--
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:: ::::: :::.: :::::: : :::..:..::: :: :.:..::::: . .::..: :
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CCDS11 EKCYKCNECGKAFAHSSTLIQHQTTHTGEKSYICNICGKAFSQSANLTQHHRTHTGEKPY
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CCDS11 KCSVCGKAFSQSVHLTQHQRIHNGEKPFKCNICGKAYRQGANLTQHQRIHTGEKPYKCNE
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CCDS11 FTQSTNLIQHQRVHTGAKHRN
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CCDS33 TGEKPYKCNECGKAFRARSSLAIHQATHSGEKPYKCNECGKVFTQNSHLTNHWRIHTGEK
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CCDS33 KAFSVYSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRGIHTGEKPYKCNECGKVFR
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pF1KB4 SGD
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CCDS54 TGEKPYECGKPFSICSSLTTHQTIHTGGKPYKCNVWKVLKSEFKPCKPSQNS
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CCDS54 AEGNYKGVLLTQEGNLT-HGRDEHDKRDARNKLIKNQLGLSLQSHLPELQLFQYEGKIYE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]