Result of FASTA (omim) for pF1KB4774
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4774, 730 aa
  1>>>pF1KB4774 730 - 730 aa - 730 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5708+/-0.00041; mu= 13.5359+/- 0.025
 mean_var=137.3227+/-28.540, 0's: 0 Z-trim(115.6): 329  B-trim: 398 in 2/55
 Lambda= 0.109447
 statistics sampled from 25617 (26103) to 25617 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.306), width:  16
 Scan time: 10.510

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001190 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic ( 730) 5150 825.8       0
XP_006716449 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 813) 4959 795.6       0
XP_016869227 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 717) 4956 795.1       0
NP_006120 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic ( 986) 4956 795.3       0
XP_011542919 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 622) 4155 668.6 2.1e-191
NP_036597 (OMIM: 606743) tolloid-like protein 2 pr (1015) 3636 586.8 1.4e-166
XP_016864059 (OMIM: 606742,613087) PREDICTED: toll ( 964) 3603 581.6  5e-165
NP_036596 (OMIM: 606742,613087) tolloid-like prote (1013) 3603 581.6 5.2e-165
XP_011530516 (OMIM: 606742,613087) PREDICTED: toll ( 837) 3413 551.5 4.8e-156
NP_001191689 (OMIM: 606742,613087) tolloid-like pr ( 392) 1523 252.8 1.9e-66
NP_113621 (OMIM: 606227,609549,611040) membrane fr ( 579)  542 98.1 1.1e-19
XP_011518010 (OMIM: 261100,602997) PREDICTED: cubi (2867)  507 93.2 1.6e-17
NP_001072 (OMIM: 261100,602997) cubilin precursor  (3623)  507 93.3 1.9e-17
XP_011518013 (OMIM: 261100,602997) PREDICTED: cubi (2237)  465 86.5 1.3e-15
XP_011518012 (OMIM: 261100,602997) PREDICTED: cubi (2277)  465 86.5 1.3e-15
XP_011518011 (OMIM: 261100,602997) PREDICTED: cubi (2285)  465 86.5 1.3e-15
NP_001002036 (OMIM: 608860) astacin-like metalloen ( 431)  452 83.7 1.7e-15
XP_011509508 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 432)  452 83.7 1.7e-15
XP_011509507 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 436)  452 83.7 1.7e-15
NP_001295100 (OMIM: 600389) meprin A subunit beta  ( 700)  434 81.1 1.7e-14
NP_005916 (OMIM: 600389) meprin A subunit beta iso ( 701)  434 81.1 1.7e-14
XP_016862359 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 668)  407 76.8 3.1e-13
XP_016862361 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 615)  401 75.8 5.7e-13
NP_001725 (OMIM: 120580,613783) complement C1s sub ( 688)  400 75.7 6.9e-13
XP_005253817 (OMIM: 120580,613783) PREDICTED: comp ( 688)  400 75.7 6.9e-13
NP_958850 (OMIM: 120580,613783) complement C1s sub ( 688)  400 75.7 6.9e-13
XP_011509509 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 418)  389 73.8 1.6e-12
XP_011509510 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 252)  376 71.5 4.6e-12
XP_011512931 (OMIM: 600388) PREDICTED: meprin A su ( 705)  375 71.8 1.1e-11
NP_005579 (OMIM: 600388) meprin A subunit alpha pr ( 746)  375 71.8 1.1e-11
XP_011512930 (OMIM: 600388) PREDICTED: meprin A su ( 774)  375 71.8 1.2e-11
XP_011518058 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 628)  358 69.1 6.4e-11
XP_011518057 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 656)  358 69.1 6.6e-11
XP_006717589 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 663)  358 69.1 6.6e-11
XP_006717588 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 888)  358 69.2 8.2e-11
XP_006717587 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 889)  358 69.2 8.2e-11
XP_016872354 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 899)  358 69.2 8.3e-11
XP_006717585 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 907)  358 69.2 8.3e-11
XP_006717584 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 924)  358 69.2 8.4e-11
NP_001019800 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform c ( 609)  353 68.3 1.1e-10
NP_001019799 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform b ( 644)  353 68.3 1.1e-10
NP_001316997 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform f ( 906)  353 68.4 1.4e-10
NP_001231902 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform e ( 916)  353 68.4 1.4e-10
NP_001231901 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform d ( 917)  353 68.4 1.4e-10
NP_003864 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform a pr ( 923)  353 68.4 1.5e-10
NP_957716 (OMIM: 602070) neuropilin-2 isoform 6 pr ( 555)  348 67.4 1.7e-10
XP_016860677 (OMIM: 602070) PREDICTED: neuropilin- ( 848)  348 67.6 2.4e-10
XP_016860676 (OMIM: 602070) PREDICTED: neuropilin- ( 853)  348 67.6 2.4e-10
XP_016860675 (OMIM: 602070) PREDICTED: neuropilin- ( 901)  348 67.6 2.5e-10
NP_957719 (OMIM: 602070) neuropilin-2 isoform 5 pr ( 901)  348 67.6 2.5e-10


>>NP_001190 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic pro  (730 aa)
 initn: 5150 init1: 5150 opt: 5150  Z-score: 4405.5  bits: 825.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5150; 99.9% identity (100.0% similar) in 730 aa overlap (1-730:1-730)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDIALDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDIALDE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 EDLRALQVQQAVDLRRHTARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRR
       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDLRAFQVQQAVDLRRHTARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 RPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVREN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVREN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 IQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 QRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 ILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 NWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 EIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 AVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 SITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 LHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKF
              670       680       690       700       710       720

              730
pF1KB4 RVQKRNRTPQ
       ::::::::::
NP_001 RVQKRNRTPQ
              730

>>XP_006716449 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone mor  (813 aa)
 initn: 4948 init1: 4948 opt: 4959  Z-score: 4241.9  bits: 795.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4966; 96.3% identity (97.3% similar) in 738 aa overlap (1-729:1-737)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDIALDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDIALDE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 EDLRALQVQQAVDLRRHTARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRR
       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EDLRAFQVQQAVDLRRHTARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 RPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVREN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVREN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 IQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 QRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 ILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 NWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSK
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pF1KB4 LHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFS-----EKRPALQP----P
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::     ...:  ::    :
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pF1KB4 RGRPHQLKFRVQKRNRTPQ                                         
        : : .: : :..    :                                          
XP_006 PG-PGDLPFFVNHSALHPGSWRGQGTDTHIYQAWSYCSAPMPWSTLCPPHPQPCTETHTP
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>>XP_016869227 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone mor  (717 aa)
 initn: 4948 init1: 4948 opt: 4956  Z-score: 4240.0  bits: 795.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4956; 98.6% identity (98.9% similar) in 718 aa overlap (1-715:1-717)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB4 SITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSK
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pF1KB4 LHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFS--EKRPAL-QPPRGRPHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  :    : .::: ::  
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       720       730
pF1KB4 LKFRVQKRNRTPQ

>>NP_006120 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic pro  (986 aa)
 initn: 5503 init1: 4956 opt: 4956  Z-score: 4238.2  bits: 795.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4956; 99.7% identity (100.0% similar) in 704 aa overlap (1-704:1-704)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDIALDE
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       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EDLRAFQVQQAVDLRRHTARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRR
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pF1KB4 AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKI
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NP_006 ILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSS
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NP_006 NWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNG
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pF1KB4 SITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSK
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pF1KB4 LHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:                
NP_006 LHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSDKDECSKDNGGCQQDCVN
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pF1KB4 RVQKRNRTPQ                                                  
                                                                   
NP_006 TFGSYECQCRSGFVLHDNKHDCKEAGCDHKVTSTSGTITSPNWPDKYPSKKECTWAISST
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>--
 initn: 882 init1: 343 opt: 356  Z-score: 312.8  bits: 68.9 E(85289): 1.1e-10
Smith-Waterman score: 623; 38.9% identity (69.7% similar) in 234 aa overlap (318-544:743-973)

       290       300       310       320       330       340       
pF1KB4 PKYEVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMH
                                     :  .: . . ...:...::..:. : .. .
NP_006 GCQQDCVNTFGSYECQCRSGFVLHDNKHDCKEAGCDHKVTSTSGTITSPNWPDKYPSKKE
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pF1KB4 CVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVS
       :.: :: :::... :.:  .:.  .  : ::..:: ::   :::. ::::::: :::...
NP_006 CTWAISSTPGHRVKLTFMEMDIESQPECAYDHLEVFDGRDAKAPVLGRFCGSKKPEPVLA
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pF1KB4 YARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTG
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       :::.: .:::: .. ::::::::::::::.:::::.::..::::::::::::::.:::::
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pF1KB4 LRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNY
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pF1KB4 SKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKFRVQKRNRTPQ                     
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NP_036 SKRGFRAHFFSDKDECAKDNGGCQHECVNTFGSYLCRCRNGYWLHENGHDCKEAGCAHKI
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NP_036 GCQHECVNTFGSYLCRCRNGYWLHENGHDCKEAGCAHKISSVEGTLASPNWPDKYPSRRE
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pF1KB4 CVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVS
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pF1KB4 TDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKD------YGHIQ--SPNYPDDYRPSK
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NP_036 SGSSMFLRFYSDASVQRKGFQAVHSTECGGRLKAEVQTKELYSHAQFGDNNYPSEAR---
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pF1KB4 VCIWRIQVSEGFHVGLTFQSFEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIK
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NP_036 -CDWVIVAEDGYGVELTFRTFEVEEEADCGYDYMEAYDGYDSSAPRLGRFCGSGPLEEIY
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       :... : ..: .: .::: :: . .                                   
NP_036 SAGDSLMIRFRTDDTINKKGFHARYTSTKFQDALHMKK                      
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                                     ..: ::::::.:::  .:.....:: .   
XP_016                        MRGGQSQSVFWGDIALDDEDLNIFQIDRTIDLTQNPF
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        :::::: ::.:: ::::.::::::::::::.:.::::::::::::::.::.::.:::::
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       :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: ::.:.:
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       :::::::::::::::: ::.:::: :::::::::::::::::.:::::.:. . ::..: 
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       :::::::::::::::::::.:::::::::.:.::.::: .:::: .. ::.::.::::::
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       ::.::::..:::.: ::::::.:::::.:::.:: :::::.:::: ..:::::.:.::::
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       ::::::::: :::::::::...:. :.:::::::::::: : :.:.: :::..:::::::
XP_016 SSNWVGKGFAAVYEAICGGEIRKNEGQIQSPNYPDDYRPMKECVWKITVSESYHVGLTFQ
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pF1KB4 SFEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKA
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pF1KB4 GFAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKL
       :::.::::: :::..:.:::::::::::::::.:.:.:::::.::.: :::::::.::::
XP_016 GFAANFFKEEDECAKPDRGGCEQRCLNTLGSYQCACEPGYELGPDRRSCEAACGGLLTKL
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pF1KB4 NGSITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTAD
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XP_016 NGTITTPGWPKEYPPNKNCVWQVVAPTQYRISVKFEFFELEGNEVCKYDYVEIWSGLSSE
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       :::::::::.: :::::::.::::.:::::::::::::::::::.:    .   :  :. 
XP_016 SKLHGKFCGAEVPEVITSQFNNMRIEFKSDNTVSKKGFKAHFFSDKDECSKDNGGCQHEC
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>--
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pF1KB4 CVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVS
       :.:.::.:::..: : :. ... . . : ::..:: ::  .:.:. ::.::.:.:.:.:.
XP_016 CTWEISATPGHRIKLAFSEFEIEQHQECAYDHLEVFDGETEKSPILGRLCGNKIPDPLVA
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pF1KB4 TDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKD------YGHIQSPNYPDDYRPSKV-
       : ....:.: :...   ::: :.. . ::: .: .      :.: :   . :.  :..: 
XP_016 TGNKMFVRFVSDASVQRKGFQATHSTECGGRLKAESKPRDLYSHAQ---FGDNNYPGQVD
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pF1KB4 CIWRIQVSEGFHVGLTFQSFEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKS
       : : .   .: .. :.::.::.:.. .:.:::.:. :: . ... .::.::   :..: :
XP_016 CEWLLVSERGSRLELSFQTFEVEEEADCGYDYVELFDGLDSTAVGLGRFCGSGPPEEIYS
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pF1KB4 TSSRLWLKFVSDGSINKAGFAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYEL
        .. . ..: .: .::: :: . .                                    
XP_016 IGDSVLIHFHTDDTINKKGFHIRYKSIRYPDTTHTKK                       
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Smith-Waterman score: 3749; 71.5% identity (88.1% similar) in 712 aa overlap (27-717:34-744)

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pF1KB4 ALDEEDLRALQVQQAVDLRR-------HTA----------RKSSIKAAVPG----NTSTP
       :::.:::  .:.....:: .       ::.          .....   .      . .  
NP_036 ALDDEDLNIFQIDRTIDLTQNPFGNLGHTTGGLGDHAMSKKRGALYQLIDRIRRIGFGLE
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pF1KB4 SCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRRAATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAM
       . ....:.      :.   ..:  :::::: ::.:: ::::.::::::::::::.:.:::
NP_036 QNNTVKGKVPLQFSGQ-NEKNRVPRAATSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQRAMFKQAM
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       :::::::::::.::.::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
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       :::.:::::::::::: ::.:.::::::::::::::::: ::.:::: ::::::::::::
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pF1KB4 TFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSS
       :::::.:::::.:. . ::..: :::::::::::::::::::.:::::::::.:.::.::
NP_036 TFSRGMFLDTILPSRDDNGIRPAIGQRTRLSKGDIAQARKLYRCPACGETLQESNGNLSS
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pF1KB4 PEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGR
       : .:::: .. ::.::.::::::::.::::..:::.: ::::::.:::::.:::.:: ::
NP_036 PGFPNGYPSYTHCIWRVSVTPGEKIVLNFTTMDLYKSSLCWYDYIEVRDGYWRKSPLLGR
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pF1KB4 FCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDY
       :::.:::: ..:::::.:.::::::::::::: :::::::::...:. :.::::::::::
NP_036 FCGDKLPEVLTSTDSRMWIEFRSSSNWVGKGFAAVYEAICGGEIRKNEGQIQSPNYPDDY
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pF1KB4 RPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSFEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKP
       :: : :.:.: :::..:::::::::::::::.::::::::::: ::.: ::::.:::.::
NP_036 RPMKECVWKITVSESYHVGLTFQSFEIERHDNCAYDYLEVRDGTSENSPLIGRFCGYDKP
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pF1KB4 DDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGFAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCD
       .::.:::. ::.::::::..::::::.::::: :::..:.:::::::::::::::.:.:.
NP_036 EDIRSTSNTLWMKFVSDGTVNKAGFAANFFKEEDECAKPDRGGCEQRCLNTLGSYQCACE
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pF1KB4 PGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNGSITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDF
       :::::.::.: :::::::.::::::.::.:::::::::::::.::.:::::::::..:.:
NP_036 PGYELGPDRRSCEAACGGLLTKLNGTITTPGWPKEYPPNKNCVWQVVAPTQYRISVKFEF
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pF1KB4 FETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSKLHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKG
       :: :::.:::::.::. :::...:::::::::.: :::::::.::::.::::::::::::
NP_036 FELEGNEVCKYDYVEIWSGLSSESKLHGKFCGAEVPEVITSQFNNMRIEFKSDNTVSKKG
            670       680       690       700       710       720  

         700       710       720       730                         
pF1KB4 FKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKFRVQKRNRTPQ                         
       :::::::.:    .   :  :.                                      
NP_036 FKAHFFSDKDECSKDNGGCQHECVNTMGSYMCQCRNGFVLHDNKHDCKEAECEQKIHSPS
            730       740       750       760       770       780  

>--
 initn: 911 init1: 359 opt: 364  Z-score: 319.5  bits: 70.2 E(85289): 4.7e-11
Smith-Waterman score: 578; 35.0% identity (70.5% similar) in 234 aa overlap (318-544:770-1000)

       290       300       310       320       330       340       
pF1KB4 PKYEVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMH
                                     :   : . ... .: ..::..:. : .. .
NP_036 GCQHECVNTMGSYMCQCRNGFVLHDNKHDCKEAECEQKIHSPSGLITSPNWPDKYPSRKE
     740       750       760       770       780       790         

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pF1KB4 CVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVS
       :.:.::.:::..: : :. ... . . : ::..:: ::  .:.:. ::.::.:.:.:.:.
NP_036 CTWEISATPGHRIKLAFSEFEIEQHQECAYDHLEVFDGETEKSPILGRLCGNKIPDPLVA
     800       810       820       830       840       850         

       410       420       430       440             450       460 
pF1KB4 TDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKD------YGHIQSPNYPDDYRPSKV-
       : ....:.: :...   ::: :.. . ::: .: .      :.: :   . :.  :..: 
NP_036 TGNKMFVRFVSDASVQRKGFQATHSTECGGRLKAESKPRDLYSHAQ---FGDNNYPGQVD
     860       870       880       890       900          910      

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pF1KB4 CIWRIQVSEGFHVGLTFQSFEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKS
       : : .   .: .. :.::.::.:.. .:.:::.:. :: . ... .::.::   :..: :
NP_036 CEWLLVSERGSRLELSFQTFEVEEEADCGYDYVELFDGLDSTAVGLGRFCGSGPPEEIYS
        920       930       940       950       960       970      

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pF1KB4 TSSRLWLKFVSDGSINKAGFAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYEL
        .. . ..: .: .::: :: . .                                    
NP_036 IGDSVLIHFHTDDTINKKGFHIRYKSIRYPDTTHTKK                       
        980       990      1000      1010                          

>>XP_011530516 (OMIM: 606742,613087) PREDICTED: tolloid-  (837 aa)
 initn: 3932 init1: 3397 opt: 3413  Z-score: 2922.4  bits: 551.5 E(85289): 4.8e-156
Smith-Waterman score: 3413; 79.0% identity (94.0% similar) in 568 aa overlap (150-717:1-568)

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB4 RAATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFT
                                     .:.::::::::::::::.::.::.::::::
XP_011                               MFKQAMRHWEKHTCVTFIERSDEESYIVFT
                                             10        20        30

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB4 YRPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVRE
       ::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: ::.:.::
XP_011 YRPCGCCSYVGRRGNGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVIGFWHEHTRPDRDNHVTIIRE
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pF1KB4 NIQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPI
       ::::::::::::::: ::.:::: :::::::::::::::::.:::::.:. . ::..: :
XP_011 NIQPGQEYNFLKMEPGEVNSLGERYDFDSIMHYARNTFSRGMFLDTILPSRDDNGIRPAI
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pF1KB4 GQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEK
       ::::::::::::::::::.:::::::::.:.::.::: .:::: .. ::.::.:::::::
XP_011 GQRTRLSKGDIAQARKLYRCPACGETLQESNGNLSSPGFPNGYPSYTHCIWRVSVTPGEK
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pF1KB4 IILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSS
       :.::::..:::.: ::::::.:::::.:::.:: :::::.:::: ..:::::.:.:::::
XP_011 IVLNFTTMDLYKSSLCWYDYIEVRDGYWRKSPLLGRFCGDKLPEVLTSTDSRMWIEFRSS
              220       230       240       250       260       270

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB4 SNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQS
       :::::::: :::::::::...:. :.:::::::::::: : :.:.: :::..::::::::
XP_011 SNWVGKGFAAVYEAICGGEIRKNEGQIQSPNYPDDYRPMKECVWKITVSESYHVGLTFQS
              280       290       300       310       320       330

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB4 FEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAG
       :::::::.::::::::::: ::.: ::::.:::.::.::.:::. ::.::::::..::::
XP_011 FEIERHDNCAYDYLEVRDGTSENSPLIGRFCGYDKPEDIRSTSNTLWMKFVSDGTVNKAG
              340       350       360       370       380       390

     540       550       560       570       580       590         
pF1KB4 FAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLN
       ::.::::: :::..:.:::::::::::::::.:.:.:::::.::.: :::::::.:::::
XP_011 FAANFFKEEDECAKPDRGGCEQRCLNTLGSYQCACEPGYELGPDRRSCEAACGGLLTKLN
              400       410       420       430       440       450

     600       610       620       630       640       650         
pF1KB4 GSITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADS
       :.::.:::::::::::::.::.:::::::::..:.::: :::.:::::.::. :::...:
XP_011 GTITTPGWPKEYPPNKNCVWQVVAPTQYRISVKFEFFELEGNEVCKYDYVEIWSGLSSES
              460       470       480       490       500       510

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pF1KB4 KLHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLK
       ::::::::.: :::::::.::::.:::::::::::::::::::.:    .   :  :.  
XP_011 KLHGKFCGAEVPEVITSQFNNMRIEFKSDNTVSKKGFKAHFFSDKDECSKDNGGCQHECV
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pF1KB4 FRVQKRNRTPQ                                                 
                                                                   
XP_011 NTMGSYMCQCRNGFVLHDNKHDCKEAECEQKIHSPSGLITSPNWPDKYPSRKECTWEISA
              580       590       600       610       620       630

>--
 initn: 911 init1: 359 opt: 364  Z-score: 320.6  bits: 70.1 E(85289): 4.1e-11
Smith-Waterman score: 578; 35.0% identity (70.5% similar) in 234 aa overlap (318-544:594-824)

       290       300       310       320       330       340       
pF1KB4 PKYEVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMH
                                     :   : . ... .: ..::..:. : .. .
XP_011 GCQHECVNTMGSYMCQCRNGFVLHDNKHDCKEAECEQKIHSPSGLITSPNWPDKYPSRKE
           570       580       590       600       610       620   

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pF1KB4 CVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVS
       :.:.::.:::..: : :. ... . . : ::..:: ::  .:.:. ::.::.:.:.:.:.
XP_011 CTWEISATPGHRIKLAFSEFEIEQHQECAYDHLEVFDGETEKSPILGRLCGNKIPDPLVA
           630       640       650       660       670       680   

       410       420       430       440             450       460 
pF1KB4 TDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKD------YGHIQSPNYPDDYRPSKV-
       : ....:.: :...   ::: :.. . ::: .: .      :.: :   . :.  :..: 
XP_011 TGNKMFVRFVSDASVQRKGFQATHSTECGGRLKAESKPRDLYSHAQ---FGDNNYPGQVD
           690       700       710       720          730       740

              470       480       490       500       510       520
pF1KB4 CIWRIQVSEGFHVGLTFQSFEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKS
       : : .   .: .. :.::.::.:.. .:.:::.:. :: . ... .::.::   :..: :
XP_011 CEWLLVSERGSRLELSFQTFEVEEEADCGYDYVELFDGLDSTAVGLGRFCGSGPPEEIYS
              750       760       770       780       790       800

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pF1KB4 TSSRLWLKFVSDGSINKAGFAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYEL
        .. . ..: .: .::: :: . .                                    
XP_011 IGDSVLIHFHTDDTINKKGFHIRYKSIRYPDTTHTKK                       
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>>NP_001191689 (OMIM: 606742,613087) tolloid-like protei  (392 aa)
 initn: 1717 init1: 1517 opt: 1523  Z-score: 1313.9  bits: 252.8 E(85289): 1.9e-66
Smith-Waterman score: 1669; 65.7% identity (83.3% similar) in 359 aa overlap (27-364:34-391)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB4     MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDI
                                     :::.:  ::: .: ..::::::::.: :::
NP_001 GTLSPRMLVWLVASGIVFYGELWVCAGLDYDYTFDGNEEDKTETIDYKDPCKAAVFWGDI
            10        20        30        40        50        60   

         60        70                         80        90         
pF1KB4 ALDEEDLRALQVQQAVDLRR-------HTA----------RKSSIKAAVPG----NTSTP
       :::.:::  .:.....:: .       ::.          .....   .      . .  
NP_001 ALDDEDLNIFQIDRTIDLTQNPFGNLGHTTGGLGDHAMSKKRGALYQLIDRIRRIGFGLE
            70        80        90       100       110       120   

         100       110       120       130       140       150     
pF1KB4 SCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRRAATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAM
       . ....:.      :.   ..:  :::::: ::.:: ::::.::::::::::::.:.:::
NP_001 QNNTVKGKVPLQFSGQ-NEKNRVPRAATSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQRAMFKQAM
           130        140       150       160       170       180  

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB4 RHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTYRPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVVHEL
       :::::::::::.::.::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_001 RHWEKHTCVTFIERSDEESYIVFTYRPCGCCSYVGRRGNGPQAISIGKNCDKFGIVVHEL
            190       200       210       220       230       240  

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB4 GHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVRENIQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARN
       :::.:::::::::::: ::.:.::::::::::::::::: ::.:::: ::::::::::::
NP_001 GHVIGFWHEHTRPDRDNHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEPGEVNSLGERYDFDSIMHYARN
            250       260       270       280       290       300  

         280       290       300       310       320       330     
pF1KB4 TFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSS
       :::::.:::::.:. . ::..: :::::::::::::::::::.:::::::::.:.::.::
NP_001 TFSRGMFLDTILPSRDDNGIRPAIGQRTRLSKGDIAQARKLYRCPACGETLQESNGNLSS
            310       320       330       340       350       360  

         340       350       360       370       380       390     
pF1KB4 PEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGR
       : .:::: .. ::.::.:::::::.....                               
NP_001 PGFPNGYPSYTHCIWRVSVTPGEKVVFSLC                              
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730 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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