FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4774, 730 aa
1>>>pF1KB4774 730 - 730 aa - 730 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5708+/-0.00041; mu= 13.5359+/- 0.025
mean_var=137.3227+/-28.540, 0's: 0 Z-trim(115.6): 329 B-trim: 398 in 2/55
Lambda= 0.109447
statistics sampled from 25617 (26103) to 25617 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 10.510
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001190 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic ( 730) 5150 825.8 0
XP_006716449 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 813) 4959 795.6 0
XP_016869227 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 717) 4956 795.1 0
NP_006120 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic ( 986) 4956 795.3 0
XP_011542919 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 622) 4155 668.6 2.1e-191
NP_036597 (OMIM: 606743) tolloid-like protein 2 pr (1015) 3636 586.8 1.4e-166
XP_016864059 (OMIM: 606742,613087) PREDICTED: toll ( 964) 3603 581.6 5e-165
NP_036596 (OMIM: 606742,613087) tolloid-like prote (1013) 3603 581.6 5.2e-165
XP_011530516 (OMIM: 606742,613087) PREDICTED: toll ( 837) 3413 551.5 4.8e-156
NP_001191689 (OMIM: 606742,613087) tolloid-like pr ( 392) 1523 252.8 1.9e-66
NP_113621 (OMIM: 606227,609549,611040) membrane fr ( 579) 542 98.1 1.1e-19
XP_011518010 (OMIM: 261100,602997) PREDICTED: cubi (2867) 507 93.2 1.6e-17
NP_001072 (OMIM: 261100,602997) cubilin precursor (3623) 507 93.3 1.9e-17
XP_011518013 (OMIM: 261100,602997) PREDICTED: cubi (2237) 465 86.5 1.3e-15
XP_011518012 (OMIM: 261100,602997) PREDICTED: cubi (2277) 465 86.5 1.3e-15
XP_011518011 (OMIM: 261100,602997) PREDICTED: cubi (2285) 465 86.5 1.3e-15
NP_001002036 (OMIM: 608860) astacin-like metalloen ( 431) 452 83.7 1.7e-15
XP_011509508 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 432) 452 83.7 1.7e-15
XP_011509507 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 436) 452 83.7 1.7e-15
NP_001295100 (OMIM: 600389) meprin A subunit beta ( 700) 434 81.1 1.7e-14
NP_005916 (OMIM: 600389) meprin A subunit beta iso ( 701) 434 81.1 1.7e-14
XP_016862359 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 668) 407 76.8 3.1e-13
XP_016862361 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 615) 401 75.8 5.7e-13
NP_001725 (OMIM: 120580,613783) complement C1s sub ( 688) 400 75.7 6.9e-13
XP_005253817 (OMIM: 120580,613783) PREDICTED: comp ( 688) 400 75.7 6.9e-13
NP_958850 (OMIM: 120580,613783) complement C1s sub ( 688) 400 75.7 6.9e-13
XP_011509509 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 418) 389 73.8 1.6e-12
XP_011509510 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 252) 376 71.5 4.6e-12
XP_011512931 (OMIM: 600388) PREDICTED: meprin A su ( 705) 375 71.8 1.1e-11
NP_005579 (OMIM: 600388) meprin A subunit alpha pr ( 746) 375 71.8 1.1e-11
XP_011512930 (OMIM: 600388) PREDICTED: meprin A su ( 774) 375 71.8 1.2e-11
XP_011518058 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 628) 358 69.1 6.4e-11
XP_011518057 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 656) 358 69.1 6.6e-11
XP_006717589 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 663) 358 69.1 6.6e-11
XP_006717588 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 888) 358 69.2 8.2e-11
XP_006717587 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 889) 358 69.2 8.2e-11
XP_016872354 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 899) 358 69.2 8.3e-11
XP_006717585 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 907) 358 69.2 8.3e-11
XP_006717584 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 924) 358 69.2 8.4e-11
NP_001019800 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform c ( 609) 353 68.3 1.1e-10
NP_001019799 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform b ( 644) 353 68.3 1.1e-10
NP_001316997 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform f ( 906) 353 68.4 1.4e-10
NP_001231902 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform e ( 916) 353 68.4 1.4e-10
NP_001231901 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform d ( 917) 353 68.4 1.4e-10
NP_003864 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform a pr ( 923) 353 68.4 1.5e-10
NP_957716 (OMIM: 602070) neuropilin-2 isoform 6 pr ( 555) 348 67.4 1.7e-10
XP_016860677 (OMIM: 602070) PREDICTED: neuropilin- ( 848) 348 67.6 2.4e-10
XP_016860676 (OMIM: 602070) PREDICTED: neuropilin- ( 853) 348 67.6 2.4e-10
XP_016860675 (OMIM: 602070) PREDICTED: neuropilin- ( 901) 348 67.6 2.5e-10
NP_957719 (OMIM: 602070) neuropilin-2 isoform 5 pr ( 901) 348 67.6 2.5e-10
>>NP_001190 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic pro (730 aa)
initn: 5150 init1: 5150 opt: 5150 Z-score: 4405.5 bits: 825.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5150; 99.9% identity (100.0% similar) in 730 aa overlap (1-730:1-730)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDIALDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDIALDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 EDLRALQVQQAVDLRRHTARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRR
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDLRAFQVQQAVDLRRHTARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVREN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVREN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 IQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 QRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 ILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 NWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 EIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 AVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 SITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 LHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKF
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB4 RVQKRNRTPQ
::::::::::
NP_001 RVQKRNRTPQ
730
>>XP_006716449 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone mor (813 aa)
initn: 4948 init1: 4948 opt: 4959 Z-score: 4241.9 bits: 795.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4966; 96.3% identity (97.3% similar) in 738 aa overlap (1-729:1-737)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDIALDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDIALDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 EDLRALQVQQAVDLRRHTARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRR
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EDLRAFQVQQAVDLRRHTARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVREN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVREN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 IQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 QRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 ILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 NWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 NWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSF
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490 500 510 520 530 540
pF1KB4 EIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGF
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550 560 570 580 590 600
pF1KB4 AVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 SITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB4 LHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFS-----EKRPALQP----P
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ...: :: :
XP_006 LHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSGGLNGDQQPLAQPLSADP
670 680 690 700 710 720
720 730
pF1KB4 RGRPHQLKFRVQKRNRTPQ
: : .: : :.. :
XP_006 PG-PGDLPFFVNHSALHPGSWRGQGTDTHIYQAWSYCSAPMPWSTLCPPHPQPCTETHTP
730 740 750 760 770
>>XP_016869227 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone mor (717 aa)
initn: 4948 init1: 4948 opt: 4956 Z-score: 4240.0 bits: 795.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4956; 98.6% identity (98.9% similar) in 718 aa overlap (1-715:1-717)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDIALDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDIALDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 EDLRALQVQQAVDLRRHTARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRR
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EDLRAFQVQQAVDLRRHTARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVREN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVREN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 IQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 QRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 ILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 NWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 EIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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: .: . . ...:...::..:. : .. .
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:.: :: :::... :.: .:. . : ::..:: :: :::. ::::::: :::...
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: ::....: :... ::: : . . :::.:. : :.: : . :. :. :
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: : : . ::. : :.::.::.:.. .:.:::.:. ::.. .. .::::: :... :
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... . .:: :: .:.: :: . .
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XP_011 AVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEG-CYDLQVGKPL
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XP_011 LWDRHCFRLSTHGPEMLGTALRG
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: :::::::.::. .....: : ..:. .:. .. :.:. . . : . :
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:: : :::.::: ::.:: ::::.::::::::::::.:
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.::::::::::::::.:::::.:.:::.:: :::::::::::::::::::::::::::::
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.:::::::::::::::::::.::.:.:::::::::::::::: :: :::::::::::::
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:::::::::.:::::.:. . :::.: ::::.:::.:::::::::::::::::::::.::
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:::.: .:::: .. ::::::::::::::.:::::.::..::::::::::::::.:::::
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: :::::.:.:::.:::::::::::::::: .::::::.::: ::::..:: :.::::::
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:::::::: :.::: ::::::::::::.::::::::::::::::::: .: :.:::..::
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::::.:.::.:.:::.::::::::::::::.:::::::::: :..::::.::.:::::::
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:.:::::::: ::. ::.:::::.:::::.::::::::::: ::::.::.:::.::::::
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::. :: :::::::::::::::::. :.::::.::::: ::::::: :::::::::::::
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pF1KB4 SKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKFRVQKRNRTPQ
::.::.:::::.: . : :.
NP_036 SKRGFRAHFFSDKDECAKDNGGCQHECVNTFGSYLCRCRNGYWLHENGHDCKEAGCAHKI
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pF1KB4 PKYEVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMH
: .:.. ... :...::..:. : .. .
NP_036 GCQHECVNTFGSYLCRCRNGYWLHENGHDCKEAGCAHKISSVEGTLASPNWPDKYPSRRE
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pF1KB4 CVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVS
:.: :: : :... :.:. ... . . : ::..:. :: ::. ::::::: :.: :.
NP_036 CTWNISSTAGHRVKLTFNEFEIEQHQECAYDHLEMYDGPDSLAPILGRFCGSKKPDPTVA
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pF1KB4 TDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKD------YGHIQ--SPNYPDDYRPSK
. : ....: :... ::: ::. . ::: .: . :.: : . :::.. :
NP_036 SGSSMFLRFYSDASVQRKGFQAVHSTECGGRLKAEVQTKELYSHAQFGDNNYPSEAR---
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pF1KB4 VCIWRIQVSEGFHVGLTFQSFEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIK
: : : . .:. : :::..::.:.. .:.:::.:. ::.. :. .::.:: ..:
NP_036 -CDWVIVAEDGYGVELTFRTFEVEEEADCGYDYMEAYDGYDSSAPRLGRFCGSGPLEEIY
920 930 940 950 960 970
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pF1KB4 STSSRLWLKFVSDGSINKAGFAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYE
:... : ..: .: .::: :: . .
NP_036 SAGDSLMIRFRTDDTINKKGFHARYTSTKFQDALHMKK
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pF1KB4 GRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDIALDEEDLRALQVQQAVDLRR---
..: ::::::.::: .:.....:: .
XP_016 MRGGQSQSVFWGDIALDDEDLNIFQIDRTIDLTQNPF
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pF1KB4 ----HTA----------RKSSIKAAVPG----NTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRS
::. ..... . . . . ....:. :. . ..:
XP_016 GNLGHTTGGLGDHAMSKKRGALYQLIDRIRRIGFGLEQNNTVKGKVPLQFSGQNE-KNRV
40 50 60 70 80 90
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pF1KB4 RRAATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVF
:::::: ::.:: ::::.::::::::::::.:.::::::::::::::.::.::.:::::
XP_016 PRAATSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQRAMFKQAMRHWEKHTCVTFIERSDEESYIVF
100 110 120 130 140 150
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pF1KB4 TYRPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVR
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: ::.:.:
XP_016 TYRPCGCCSYVGRRGNGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVIGFWHEHTRPDRDNHVTIIR
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pF1KB4 ENIQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPP
:::::::::::::::: ::.:::: :::::::::::::::::.:::::.:. . ::..:
XP_016 ENIQPGQEYNFLKMEPGEVNSLGERYDFDSIMHYARNTFSRGMFLDTILPSRDDNGIRPA
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pF1KB4 IGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGE
:::::::::::::::::::.:::::::::.:.::.::: .:::: .. ::.::.::::::
XP_016 IGQRTRLSKGDIAQARKLYRCPACGETLQESNGNLSSPGFPNGYPSYTHCIWRVSVTPGE
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pF1KB4 KIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRS
::.::::..:::.: ::::::.:::::.:::.:: :::::.:::: ..:::::.:.::::
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::::::::: :::::::::...:. :.:::::::::::: : :.:.: :::..:::::::
XP_016 SSNWVGKGFAAVYEAICGGEIRKNEGQIQSPNYPDDYRPMKECVWKITVSESYHVGLTFQ
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::.::.:::::::::::::.::.:::::::::..:.::: :::.:::::.::. :::...
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:::::::::.: :::::::.::::.:::::::::::::::::::.: . : :.
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pF1KB4 KFRVQKRNRTPQ
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>--
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290 300 310 320 330 340
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: : . ... .: ..::..:. : .. .
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:.:.::.:::..: : :. ... . . : ::..:: :: .:.:. ::.::.:.:.:.:.
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: ....:.: :... ::: :.. . ::: .: . :.: : . :. :..:
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: : . .: .. :.::.::.:.. .:.:::.:. :: . ... .::.:: :..: :
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.. . ..: .: .::: :: . .
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. ....:. :. ..: :::::: ::.:: ::::.::::::::::::.:.:::
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:::::::::::.::.::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
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:::.:::::::::::: ::.:.::::::::::::::::: ::.:::: ::::::::::::
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: .:::: .. ::.::.::::::::.::::..:::.: ::::::.:::::.:::.:: ::
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:::.:::: ..:::::.:.::::::::::::: :::::::::...:. :.::::::::::
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:: : :.:.: :::..:::::::::::::::.::::::::::: ::.: ::::.:::.::
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pF1KB4 DDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGFAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCD
.::.:::. ::.::::::..::::::.::::: :::..:.:::::::::::::::.:.:.
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:::::.::.: :::::::.::::::.::.:::::::::::::.::.:::::::::..:.:
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:: :::.:::::.::. :::...:::::::::.: :::::::.::::.::::::::::::
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pF1KB4 FKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKFRVQKRNRTPQ
:::::::.: . : :.
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: : . ... .: ..::..:. : .. .
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:.:.::.:::..: : :. ... . . : ::..:: :: .:.:. ::.::.:.:.:.:.
NP_036 CTWEISATPGHRIKLAFSEFEIEQHQECAYDHLEVFDGETEKSPILGRLCGNKIPDPLVA
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pF1KB4 TDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKD------YGHIQSPNYPDDYRPSKV-
: ....:.: :... ::: :.. . ::: .: . :.: : . :. :..:
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pF1KB4 CIWRIQVSEGFHVGLTFQSFEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKS
: : . .: .. :.::.::.:.. .:.:::.:. :: . ... .::.:: :..: :
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pF1KB4 TSSRLWLKFVSDGSINKAGFAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYEL
.. . ..: .: .::: :: . .
NP_036 IGDSVLIHFHTDDTINKKGFHIRYKSIRYPDTTHTKK
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>>XP_011530516 (OMIM: 606742,613087) PREDICTED: tolloid- (837 aa)
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::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: ::.:.::
XP_011 YRPCGCCSYVGRRGNGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVIGFWHEHTRPDRDNHVTIIRE
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pF1KB4 NIQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPI
::::::::::::::: ::.:::: :::::::::::::::::.:::::.:. . ::..: :
XP_011 NIQPGQEYNFLKMEPGEVNSLGERYDFDSIMHYARNTFSRGMFLDTILPSRDDNGIRPAI
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::::::::::::::::::.:::::::::.:.::.::: .:::: .. ::.::.:::::::
XP_011 GQRTRLSKGDIAQARKLYRCPACGETLQESNGNLSSPGFPNGYPSYTHCIWRVSVTPGEK
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pF1KB4 IILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSS
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XP_011 IVLNFTTMDLYKSSLCWYDYIEVRDGYWRKSPLLGRFCGDKLPEVLTSTDSRMWIEFRSS
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pF1KB4 SNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQS
:::::::: :::::::::...:. :.:::::::::::: : :.:.: :::..::::::::
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pF1KB4 FEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAG
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pF1KB4 FAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLN
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pF1KB4 GSITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADS
:.::.:::::::::::::.::.:::::::::..:.::: :::.:::::.::. :::...:
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pF1KB4 KLHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLK
::::::::.: :::::::.::::.:::::::::::::::::::.: . : :.
XP_011 KLHGKFCGAEVPEVITSQFNNMRIEFKSDNTVSKKGFKAHFFSDKDECSKDNGGCQHECV
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pF1KB4 FRVQKRNRTPQ
XP_011 NTMGSYMCQCRNGFVLHDNKHDCKEAECEQKIHSPSGLITSPNWPDKYPSRKECTWEISA
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initn: 911 init1: 359 opt: 364 Z-score: 320.6 bits: 70.1 E(85289): 4.1e-11
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pF1KB4 PKYEVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMH
: : . ... .: ..::..:. : .. .
XP_011 GCQHECVNTMGSYMCQCRNGFVLHDNKHDCKEAECEQKIHSPSGLITSPNWPDKYPSRKE
570 580 590 600 610 620
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pF1KB4 CVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVS
:.:.::.:::..: : :. ... . . : ::..:: :: .:.:. ::.::.:.:.:.:.
XP_011 CTWEISATPGHRIKLAFSEFEIEQHQECAYDHLEVFDGETEKSPILGRLCGNKIPDPLVA
630 640 650 660 670 680
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pF1KB4 TDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKD------YGHIQSPNYPDDYRPSKV-
: ....:.: :... ::: :.. . ::: .: . :.: : . :. :..:
XP_011 TGNKMFVRFVSDASVQRKGFQATHSTECGGRLKAESKPRDLYSHAQ---FGDNNYPGQVD
690 700 710 720 730 740
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pF1KB4 CIWRIQVSEGFHVGLTFQSFEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKS
: : . .: .. :.::.::.:.. .:.:::.:. :: . ... .::.:: :..: :
XP_011 CEWLLVSERGSRLELSFQTFEVEEEADCGYDYVELFDGLDSTAVGLGRFCGSGPPEEIYS
750 760 770 780 790 800
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 TSSRLWLKFVSDGSINKAGFAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYEL
.. . ..: .: .::: :: . .
XP_011 IGDSVLIHFHTDDTINKKGFHIRYKSIRYPDTTHTKK
810 820 830
>>NP_001191689 (OMIM: 606742,613087) tolloid-like protei (392 aa)
initn: 1717 init1: 1517 opt: 1523 Z-score: 1313.9 bits: 252.8 E(85289): 1.9e-66
Smith-Waterman score: 1669; 65.7% identity (83.3% similar) in 359 aa overlap (27-364:34-391)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDI
:::.: ::: .: ..::::::::.: :::
NP_001 GTLSPRMLVWLVASGIVFYGELWVCAGLDYDYTFDGNEEDKTETIDYKDPCKAAVFWGDI
10 20 30 40 50 60
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pF1KB4 ALDEEDLRALQVQQAVDLRR-------HTA----------RKSSIKAAVPG----NTSTP
:::.::: .:.....:: . ::. ..... . . .
NP_001 ALDDEDLNIFQIDRTIDLTQNPFGNLGHTTGGLGDHAMSKKRGALYQLIDRIRRIGFGLE
70 80 90 100 110 120
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pF1KB4 SCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRRAATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]