Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4783
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4783, 652 aa
1>>>pF1KB4783 652 - 652 aa - 652 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1818+/-0.000933; mu= 8.4606+/- 0.057
mean_var=201.5611+/-41.214, 0's: 0 Z-trim(112.9): 69 B-trim: 121 in 1/51
Lambda= 0.090338
statistics sampled from 13542 (13611) to 13542 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.418), width: 16
Scan time: 3.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 4482 597.0 3.1e-170
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 4454 593.3 3.9e-169
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 2676 361.5 1.9e-99
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 2639 356.7 5.5e-98
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 1253 176.2 1.8e-43
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 1233 173.6 1.2e-42
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 1233 173.6 1.2e-42
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 1148 162.4 1.8e-39
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 1145 162.0 2.4e-39
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 989 141.7 3.1e-33
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 989 141.7 3.2e-33
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 971 139.3 1.4e-32
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 966 138.7 2.5e-32
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 965 138.6 2.8e-32
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 965 138.6 2.9e-32
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 965 138.6 2.9e-32
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 932 134.2 5.2e-31
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 825 120.3 8.1e-27
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 748 110.1 6.8e-24
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 731 108.1 4.4e-23
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 731 108.1 4.5e-23
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 731 108.1 4.7e-23
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 691 102.7 1.2e-21
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 688 102.3 1.4e-21
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 667 99.5 9.4e-21
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 666 99.4 1e-20
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 661 99.0 2.7e-20
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 644 96.7 1e-19
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 646 97.1 1.1e-19
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 646 97.1 1.1e-19
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 631 95.1 4.3e-19
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 622 93.9 8e-19
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 593 90.1 1.3e-17
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 566 86.4 9e-17
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 565 86.3 9.8e-17
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 552 84.8 5.2e-16
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 541 83.2 9.4e-16
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 538 82.7 1e-15
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 513 79.5 1.2e-14
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 505 78.4 1.9e-14
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 485 75.9 1.5e-13
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 480 75.1 1.9e-13
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 482 75.5 1.9e-13
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 447 70.9 4.3e-12
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 447 70.9 4.4e-12
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 446 70.8 4.7e-12
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 422 67.7 5.1e-11
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 415 66.8 9.7e-11
>>CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 (731 aa)
initn: 4482 init1: 4482 opt: 4482 Z-score: 3169.8 bits: 597.0 E(32554): 3.1e-170
Smith-Waterman score: 4482; 100.0% identity (100.0% similar) in 652 aa overlap (1-652:80-731)
10 20 30
pF1KB4 MRGGGFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PPSVVTRPEPQALPSPAIRAPLPDLYPFGTMRGGGFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKK
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 FGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKP
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 VFAFHHANFPQYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VFAFHHANFPQYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPA
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 IVHINHQPYLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IVHINHQPYLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIR
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 DLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPD
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 RQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQL
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 MEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKA
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 PILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQ
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 ARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGGGGGKGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGGGGGKGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRR
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 LRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANGSGYGSPNSAFGAQAGQYTYGQGTYGAAAYGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANGSGYGSPNSAFGAQAGQYTYGQGTYGAAAYGT
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KB4 SSYTAQEYGAGTYGASSTTSTGRSSQSSSQQFSGIGRSGQQPQPLMSQQFAQPPGATNMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SSYTAQEYGAGTYGASSTTSTGRSSQSSSQQFSGIGRSGQQPQPLMSQQFAQPPGATNMI
650 660 670 680 690 700
640 650
pF1KB4 GYMGQTAYQYPPPPPPPPPSRK
::::::::::::::::::::::
CCDS46 GYMGQTAYQYPPPPPPPPPSRK
710 720 730
>>CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 (729 aa)
initn: 3482 init1: 3348 opt: 4454 Z-score: 3150.1 bits: 593.3 E(32554): 3.9e-169
Smith-Waterman score: 4454; 99.7% identity (99.7% similar) in 652 aa overlap (1-652:80-729)
10 20 30
pF1KB4 MRGGGFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PPSVVTRPEPQALPSPAIRAPLPDLYPFGTMRGGGFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKK
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 FGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKP
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 VFAFHHANFPQYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VFAFHHANFPQYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPA
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 IVHINHQPYLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IVHINHQPYLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIR
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 DLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPD
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 RQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQL
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 MEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKA
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 PILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQ
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 ARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGGGGGKGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRR
::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGGGGG--GRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRR
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 LRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANGSGYGSPNSAFGAQAGQYTYGQGTYGAAAYGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANGSGYGSPNSAFGAQAGQYTYGQGTYGAAAYGT
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KB4 SSYTAQEYGAGTYGASSTTSTGRSSQSSSQQFSGIGRSGQQPQPLMSQQFAQPPGATNMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SSYTAQEYGAGTYGASSTTSTGRSSQSSSQQFSGIGRSGQQPQPLMSQQFAQPPGATNMI
650 660 670 680 690 700
640 650
pF1KB4 GYMGQTAYQYPPPPPPPPPSRK
::::::::::::::::::::::
CCDS33 GYMGQTAYQYPPPPPPPPPSRK
710 720
>>CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 (614 aa)
initn: 2426 init1: 2305 opt: 2676 Z-score: 1898.7 bits: 361.5 E(32554): 1.9e-99
Smith-Waterman score: 2721; 68.1% identity (81.1% similar) in 646 aa overlap (4-638:3-612)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MRGGGFGDRDRDRDRGGFGA-RGGGG----LPPKKFGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNF
: .:::: :::: ::: : ::. : ::::::::.: ::::.:.:::::::::
CCDS11 MSGYSSDRDRGRDRG-FGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 YVEHPEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKPVFAFHHANFPQYVMDVLMDQHFTEP
: :::..:: : ::. ::.::::::: . :::::. :..:::: ::::. :.::::
CCDS11 YQEHPDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHN-CPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 TPIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPAIVHINHQPYLERGDGPICLVLAPTR
: :: ::.:.:::: ::::.:::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS11 TAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 ELAQQVQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKT
:::::::::: .: . ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS11 ELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 NLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDY
:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS11 NLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 TQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDL
.::.: :::::::::::::::: . :::.:::.::::::.:::::::.:::::::::.:
CCDS11 IHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDEL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 TRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYD
::.::::::::: ::::::: :::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYD
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 YPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDH
::::::::.::::::::::. :::::::::.:.::. .::.::.::::::::::.:::.
CCDS11 YPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVED
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 RGGGGGGGKGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAG
::.: . :.:: : .:. :: : : :: ..::: . ::
CCDS11 RGSGRSRGRGG---------------MKDDRRDRYSAG-KRGGF---NTFRDRENYDR--
480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 YANGSGYGSP-NSAFGAQAGQYTYGQGTYGAAAYGTSSYTAQEYGAG---TYGASSTTST
::.: . :::.. .:.:.:: : ..:. .. .:: .. ... :.:
CCDS11 -----GYSSLLKRDFGAKT-----QNGVYSAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGT
520 530 540 550 560
600 610 620 630 640
pF1KB4 GRSSQSSSQQFSGIGRSGQQPQPLMSQQ-FAQPP-GATNMIGYMGQTAYQYPPPPPPPPP
... .:.::. : . . . :.:: .: : .:. :::: :.:
CCDS11 YQNGYDSTQQY---GSNVPNMHNGMNQQAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ
570 580 590 600 610
650
pF1KB4 SRK
>>CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 (614 aa)
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10 20 30 40 50
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:..: : . : : ::. .: : ::::::::.: ::::.:.::::::::::
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10 20 30 40 50 60
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CCDS82 EHPDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHN-CPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTA
70 80 90 100 110
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:: ::.:.:::: ::::.:::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS82 IQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTREL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
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:::::::: .: . ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS82 AQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNL
180 190 200 210 220 230
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CCDS82 RRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIH
240 250 260 270 280 290
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::.: :::::::::::::::: . :::.:::.::::::.:::::::.:::::::::.:::
CCDS82 INIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTR
300 310 320 330 340 350
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.::::::::: ::::::: :::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYP
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::::::.::::::::::. :::::::::.:.::. .::.::.::::::::::.:::. ::
CCDS82 NSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRG
420 430 440 450 460 470
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.: . :.:: : .:. :: : : :: ..::: . ::
CCDS82 SGRSRGRGG---------------MKDDRRDRYSAG-KRGGF---NTFRDRENYDR----
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::.: . :::.. .:.:.:: : ..:. .. .:: .. ... :.: .
CCDS82 ---GYSSLLKRDFGAKT-----QNGVYSAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQ
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.. .:.::. : . . . :.:: .: : .:. :::: :.:
CCDS82 NGYDSTQQY---GSNVPNMHNGMNQQAYAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ
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pF1KB4 K
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10 20 30
pF1KB4 MRGGGFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGERL
.....: . . :. : ::. .: .
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... : : :::::: :: :.. ::: .. .::.: .. : :. . :.: .: : .
CCDS32 DHSEIDY---PPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHKLNLRVSGA-APPRPGSSFAHFG
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: . .: . ...:.:::::::: :.:::::::.:::.:::::: :.. : ..:: :
CCDS32 FDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQK
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pF1KB4 YLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEI
:: ::::: ... ::::: ::.. .:: :.:. .:::. : . :..:.::
CCDS32 ELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKRFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGAEI
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. ::::::: ... :::.: .:::.::::::.::::: :.:.:....:::::::..::
CCDS32 VVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFDEADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSA
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:. :....::.:.: : .. :.. ::... :::.. . : . : . . :. .
CCDS32 TFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIG-EANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFTSS
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.....:: : ..:. ....: .::: .: ::. :...:.. :.:.:::
CCDS32 --GSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATD
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CCDS32 VAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRN
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. . . .. . ..... :: . .:.. : : .: : : . .. :..
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: :.:..:. ::. .. :.:. :..: :... . :.: .:. ..
CCDS32 AAGASGWTS----AGSLNSVPTNSAQQGHNSPDSPVTSAAKGIPGFGNTGNISGAPVTYP
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: :..:
CCDS32 SAGAQGVNNTASGNNSREGTGGSNGKRERYTENRGSSRHSHGETGNRHSDSPRHGDGGRH
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>>CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031 aa)
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CCDS34 EEEEVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLE
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pF1KB4 KE-ITVRGGDVCPKPVFAFHHANFPQYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGI
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CCDS34 MEGITVKGKG-CPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQTQAIPAIMSGRDLIGI
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pF1KB4 AQTGSGKTLAYLLPAIVHINHQPYLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLK
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CCDS34 AKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFSKTLGLR
420 430 440 450 460 470
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 STCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFL--ESGK-TNLRRCTYLVLDEADRML
.:.:::. . :: .:.::.:: . ::::.::.: .::. ::::: ::.::::::::.
CCDS34 VVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEADRMF
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pF1KB4 DMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINVGNLELSANHNIL
:::::::. .:::..::::::.:.:::.:. .. ::. .: ...::. . . ..
CCDS34 DMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVVCS-DVE
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CCDS34 QQV-IVIEEEK--KFLKLLELLGHYQESGSVIIFVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMSLHG
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pF1KB4 DKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTA
.: .:: ..:.:..: .:.::.::.:::::. . .:.::. :: :::::: :::.
CCDS34 GIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAGRTG
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:. ::: ::::.: . . : ..::.:: .. :. : : .: : . . ::
CCDS34 RAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDFKDQQKAEGK----II
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. .:. .. .. . :: .. : . . .. . . .: .. : :
CCDS34 KKSSGFSGKGFKF-DETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKR
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pF1KB4 AQAGQYTYGQGTYGAAAYGTSSYTAQEYGAGTYGASSTTSTGRSSQSSSQQFSGIGRSGQ
CCDS34 VKDMAAPGTSSVPAPTAGNAEKLEIAKRLALRINAQKNLGIESQDVMQQATNAILRGGTI
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>>CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032 aa)
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pF1KB4 GFGARGGGGLPPKKFGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVDELRRK
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CCDS75 EEEEVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLE
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pF1KB4 KE-ITVRGGDVCPKPVFAFHHANFPQYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGI
: :::.: ::::. .. . .. . ... : . . .::::: :..: .::::..::
CCDS75 MEGITVKGKG-CPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQTQAIPAIMSGRDLIGI
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pF1KB4 AQTGSGKTLAYLLPAIVHINHQPYLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLK
:.::::::.:.::: . :: : ::.:.::: ....:::::: :. . ..: :.
CCDS75 AKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFSKTLGLR
420 430 440 450 460 470
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pF1KB4 STCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFL--ESGK-TNLRRCTYLVLDEADRML
.:.:::. . :: .:.::.:: . ::::.::.: .::. ::::: ::.::::::::.
CCDS75 VVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEADRMF
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CCDS75 DMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVVCS-DVE
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pF1KB4 QIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKT-IIFVETKRRCDDLTRRMRRDGWPAMCIHG
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CCDS75 QQV-IVIEEEK--KFLKLLELLGHYQESGSVIIFVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMSLHG
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pF1KB4 DKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTA
.: .:: ..:.:..: .:.::.::.:::::. . .:.::. :: :::::: :::.
CCDS75 GIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAGRTG
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pF1KB4 RSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQL-VDHRGGGGGGGKGGRSRY
:. ::: ::::.: . . : ..::.:: .. :. : : .: : . . ::
CCDS75 RAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDFKDQQKAEGK----II
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pF1KB4 RTTSSANNPNLMYQDECDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANGSGYGSPNSAFG
. .:. .. .. . :: .. : . . .. . . .: .. : :
CCDS75 KKSSGFSGKGFKF-DETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKR
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pF1KB4 AQAGQYTYGQGTYGAAAYGTSSYTAQEYGAGTYGASSTTSTGRSSQSSSQQFSGIGRSGQ
CCDS75 VKDMAAPGTSSVPAPTAGNAEKLEIAKRLALRINAQKNLGIESQVDVMQQATNAILRGGT
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>>CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX (631 aa)
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pF1KB4 DRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYE
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CCDS35 GRNLGRNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKW--ADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQ
140 150 160 170 180 190
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VDELRRKK-EIT---VRGGD--VCPKPVFAFHHANFPQY--VMDVLMDQHFTEPTPIQCQ
: . :... .:: ...:. . :::. :. : : :: .. .. ...::::: :
CCDS35 VINWRKENFNITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDA-FQQYPDLLKSIIRVGIVKPTPIQSQ
200 210 220 230 240 250
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pF1KB4 GFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPAIVHINHQPYL-ERGDGPICLVLAPTRELAQQ
..:. :.: :.. .::::.::::.::.:...:.. :: :. .:: :::.:::::: .
CCDS35 AWPIILQGIDLIVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALH
260 270 280 290 300 310
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRC
:. . :. . ::: ::::: .. ::.:. .::.: ::::::: :. ....:::
CCDS35 VEAECSKYSY-KGLKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNSVNLRSI
320 330 340 350 360 370
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 TYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINV
::::.::::.:::: ::::::::. ..::::::.: ::::: ::::: ..:.: . :
CCDS35 TYLVIDEADKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYV
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pF1KB4 GNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRRMR
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CCDS35 GNLNLVAVNTVKQNIIVTTEKEK-RALTQEFVENMSPND-KVIMFVSQKHIADDLSSDFN
440 450 460 470 480
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pF1KB4 RDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSS
.: : .::.. : ... ....:.::. :::.::..:::::..:: : :::.: .
CCDS35 IQGISAESLHGNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNI
490 500 510 520 530 540
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pF1KB4 EDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGG
. ::::.: .:. . ::. :..: . :.: ::::.:..:::.. :. ....
CCDS35 DVYVHRVGYIGRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQ
550 560 570 580 590 600
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....
CCDS49 SMAERFKAHQQKREMERKMERPQGRPKKFH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]