FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4815, 1474 aa
1>>>pF1KB4815 1474 - 1474 aa - 1474 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1070+/-0.00128; mu= 18.6435+/- 0.077
mean_var=69.3564+/-13.995, 0's: 0 Z-trim(100.4): 28 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.154004
statistics sampled from 6078 (6092) to 6078 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.525), E-opt: 0.2 (0.187), width: 16
Scan time: 5.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44827.1 A2M gene_id:2|Hs108|chr12 (1474) 9657 2155.9 0
CCDS8600.1 PZP gene_id:5858|Hs108|chr12 (1482) 5205 1166.7 0
CCDS8596.2 A2ML1 gene_id:144568|Hs108|chr12 (1454) 2928 660.8 8.4e-189
CCDS73439.1 A2ML1 gene_id:144568|Hs108|chr12 ( 963) 2058 467.5 8.8e-131
CCDS55039.1 CD109 gene_id:135228|Hs108|chr6 (1368) 970 225.8 7.1e-58
CCDS55038.1 CD109 gene_id:135228|Hs108|chr6 (1428) 970 225.8 7.4e-58
CCDS4982.1 CD109 gene_id:135228|Hs108|chr6 (1445) 970 225.8 7.5e-58
CCDS42519.1 CPAMD8 gene_id:27151|Hs108|chr19 (1932) 971 226.0 8.5e-58
CCDS6826.1 C5 gene_id:727|Hs108|chr9 (1676) 554 133.4 5.8e-30
CCDS32883.1 C3 gene_id:718|Hs108|chr19 (1663) 540 130.2 4.9e-29
CCDS47405.1 C4B gene_id:721|Hs108|chr6 (1744) 540 130.3 5.2e-29
CCDS59005.1 C4A gene_id:720|Hs108|chr6 (1698) 536 129.4 9.3e-29
CCDS47404.1 C4A gene_id:720|Hs108|chr6 (1744) 536 129.4 9.6e-29
>>CCDS44827.1 A2M gene_id:2|Hs108|chr12 (1474 aa)
initn: 9657 init1: 9657 opt: 9657 Z-score: 11582.9 bits: 2155.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9657; 99.9% identity (100.0% similar) in 1474 aa overlap (1-1474:1-1474)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGKNKLLHPSLVLLLLVLLPTDASVSGKPQYMVLVPSLLHTETTEKGCVLLSYLNETVTV
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CCDS44 MGKNKLLHPSLVLLLLVLLPTDASVSGKPQYMVLVPSLLHTETTEKGCVLLSYLNETVTV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SASLESVRGNRSLFTDLEAENDVLHCVAFAVPKSSSNEEVMFLTVQVKGPTQEFKKRTTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MVKNEDSLVFVQTDKSIYKPGQTVKFRVVSMDENFHPLNELIPLVYIQDPKGNRIAQWQS
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FQLEGGLKQFSFPLSSEPFQGSYKVVVQKKSGGRTEHPFTVEEFVLPKFEVQVTVPKIIT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ILEEEMNVSVCGLYTYGKPVPGHVTVSICRKYSDASDCHGEDSQAFCEKFSGQLNSHGCF
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YQQVKTKVFQLKRKEYEMKLHTEAQIQEEGTVVELTGRQSSEITRTITKLSFVKVDSHFR
310 320 330 340 350 360
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pF1KB4 QGIPFFGQVRLVDGKGVPIPNKVIFIRGNEANYYSNATTDEHGLVQFSINTTNVMGTSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QGIPFFGQVRLVDGKGVPIPNKVIFIRGNEANYYSNATTDEHGLVQFSINTTNVMGTSLT
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430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VRVNYKDRSPCYGYQWVSEEHEEAHHTAYLVFSPSKSFVHLEPMSHELPCGHTQTVQAHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VRVNYKDRSPCYGYQWVSEEHEEAHHTAYLVFSPSKSFVHLEPMSHELPCGHTQTVQAHY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 ILNGGTLLGLKKLSFYYLIMAKGGIVRTGTHGLLVKQEDMKGHFSISIPVKSDIAPVARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ILNGGTLLGLKKLSFYYLIMAKGGIVRTGTHGLLVKQEDMKGHFSISIPVKSDIAPVARL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LIYAVLPTGDVIGDSAKYDVENCLANKVDLSFSPSQSLPASHAHLRVTAAPQSVCALRAV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 DQSVLLMKPDAELSASSVYNLLPEKDLTGFPGPLNDQDDEDCINRHNVYINGITYTPVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS44 DQSVLLMKPDAELSASSVYNLLPEKDLTGFPGPLNDQDNEDCINRHNVYINGITYTPVSS
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pF1KB4 TNEKDMYSFLEDMGLKAFTNSKIRKPKMCPQLQQYEMHGPEGLRVGFYESDVMGRGHARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TNEKDMYSFLEDMGLKAFTNSKIRKPKMCPQLQQYEMHGPEGLRVGFYESDVMGRGHARL
670 680 690 700 710 720
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pF1KB4 VHVEEPHTETVRKYFPETWIWDLVVVNSAGVAEVGVTVPDTITEWKAGAFCLSEDAGLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VHVEEPHTETVRKYFPETWIWDLVVVNSAGVAEVGVTVPDTITEWKAGAFCLSEDAGLGI
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pF1KB4 SSTASLRAFQPFFVELTMPYSVIRGEAFTLKATVLNYLPKCIRVSVQLEASPAFLAVPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSTASLRAFQPFFVELTMPYSVIRGEAFTLKATVLNYLPKCIRVSVQLEASPAFLAVPVE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 KEQVPHCICANGRQTVSWAVTPKSLGNVNFTVSAEALESQELCGTEVPSVPEHGRKDTVI
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KEQAPHCICANGRQTVSWAVTPKSLGNVNFTVSAEALESQELCGTEVPSVPEHGRKDTVI
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910 920 930 940 950 960
pF1KB4 KPLLVEPEGLEKETTFNSLLCPSGGEVSEELSLKLPPNVVEESARASVSVLGDILGSAMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KPLLVEPEGLEKETTFNSLLCPSGGEVSEELSLKLPPNVVEESARASVSVLGDILGSAMQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 NTQNLLQMPYGCGEQNMVLFAPNIYVLDYLNETQQLTPEIKSKAIGYLNTGYQRQLNYKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NTQNLLQMPYGCGEQNMVLFAPNIYVLDYLNETQQLTPEIKSKAIGYLNTGYQRQLNYKH
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 YDGSYSTFGERYGRNQGNTWLTAFVLKTFAQARAYIFIDEAHITQALIWLSQRQKDNGCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YDGSYSTFGERYGRNQGNTWLTAFVLKTFAQARAYIFIDEAHITQALIWLSQRQKDNGCF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RSSGSLLNNAIKGGVEDEVTLSAYITIALLEIPLTVTHPVVRNALFCLESAWKTAQEGDH
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pF1KB4 GSHVYTKALLAYAFALAGNQDKRKEVLKSLNEEAVKKDNSVHWERPQKPKAPVGHFYEPQ
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1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB4 APSAEVEMTSYVLLAYLTAQPAPTSEDLTSATNIVKWITKQQNAQGGFSSTQDTVVALHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 APSAEVEMTSYVLLAYLTAQPAPTSEDLTSATNIVKWITKQQNAQGGFSSTQDTVVALHA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB4 LSKYGAATFTRTGKAAQVTIQSSGTFSSKFQVDNNNRLLLQQVSLPELPGEYSMKVTGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LSKYGAATFTRTGKAAQVTIQSSGTFSSKFQVDNNNRLLLQQVSLPELPGEYSMKVTGEG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB4 CVYLQTSLKYNILPEKEEFPFALGVQTLPQTCDEPKAHTSFQISLSVSYTGSRSASNMAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CVYLQTSLKYNILPEKEEFPFALGVQTLPQTCDEPKAHTSFQISLSVSYTGSRSASNMAI
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB4 VDVKMVSGFIPLKPTVKMLERSNHVSRTEVSSNHVLIYLDKVSNQTLSLFFTVLQDVPVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VDVKMVSGFIPLKPTVKMLERSNHVSRTEVSSNHVLIYLDKVSNQTLSLFFTVLQDVPVR
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470
pF1KB4 DLKPAIVKVYDYYETDEFAIAEYNAPCSKDLGNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DLKPAIVKVYDYYETDEFAIAEYNAPCSKDLGNA
1450 1460 1470
>>CCDS8600.1 PZP gene_id:5858|Hs108|chr12 (1482 aa)
initn: 5688 init1: 4044 opt: 5205 Z-score: 6237.1 bits: 1166.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6991; 72.5% identity (88.2% similar) in 1481 aa overlap (1-1470:1-1476)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGKNKLLHPSLVLLLLVLLPTDASVSGKPQYMVLVPSLLHTETTEKGCVLLSYLNETVTV
: :..::: :::::..: .:.. : .::::::::::::::. .:::::::.:::::::
CCDS86 MRKDRLLHLCLVLLLILLSASDSN-STEPQYMVLVPSLLHTEAPKKGCVLLSHLNETVTV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SASLESVRGNRSLFTDLEAENDVLHCVAFAVPKSSSNEEVMFLTVQVKGPTQEFKKRTTV
:::::: : :::::::: ::.:..:::.:..:. :.. :: ::..:.:::::.:.::.::
CCDS86 SASLESGRENRSLFTDLVAEKDLFHCVSFTLPRISASSEVAFLSIQIKGPTQDFRKRNTV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 MVKNEDSLVFVQTDKSIYKPGQTVKFRVVSMDENFHPLNELIPLVYIQDPKGNRIAQWQS
.: : .::::::::: .:::::::.:::::.::::.: ::::::.:...:. ::::::::
CCDS86 LVLNTQSLVFVQTDKPMYKPGQTVRFRVVSVDENFRPRNELIPLIYLENPRRNRIAQWQS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 FQLEGGLKQFSFPLSSEPFQGSYKVVVQKKSGGRTEHPFTVEEFVLPKFEVQVTVPKIIT
..::.:..:.::::::::.::::.:::: .:::: .:::::::::::::::.: :::::.
CCDS86 LKLEAGINQLSFPLSSEPIQGSYRVVVQTESGGRIQHPFTVEEFVLPKFEVKVQVPKIIS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ILEEEMNVSVCGLYTYGKPVPGHVTVSICRKYSDASDCHGEDSQAFCEKFSGQLNSHGCF
:..:..:..::: ::::::::: .:::.::: : . .: :.: ::.:: ::::.::.
CCDS86 IMDEKVNITVCGEYTYGKPVPGLATVSLCRKLSRVLNC---DKQEVCEEFSQQLNSNGCI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 YQQVKTKVFQLKRKEYEMKLHTEAQIQEEGTVVELTGRQSSEITRTITKLSFVKVDSHFR
:::.::..:. .::::..::.:.:::: .:.:. . :::: ..::.:::::::::
CCDS86 TQQVHTKMLQITNTGFEMKLRVEARIREEGTDLEVTANRISEITNIVSKLKFVKVDSHFR
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 QGIPFFGQVRLVDGKGVPIPNKVIFIRGNEANYYSNATTDEHGLVQFSINTTNVMGTSLT
::::::.:: ::::::::::::..:: :.:::::::::.:.::.:::::::.. ..:
CCDS86 QGIPFFAQVLLVDGKGVPIPNKLFFISVNDANYYSNATTNEQGLAQFSINTTSISVNKLF
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VRVNYKDRSPCYGYQWVSEEHEEAHHTAYLVFSPSKSFVHLEPMSHELPCGHTQTVQAHY
::: . :. :.::.:.:. :.::: ::: : :..::::.. ::::::.:. :::
CCDS86 VRVFTVHPNLCFHYSWVAEDHQGAQHTANRVFSLSGSYIHLEPVAGTLPCGHTETITAHY
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pF1KB4 ILNGGTLLGLKKLSFYYLIMAKGGIVRTGTHGLLVKQEDMKGHFSISIPVKSDIAPVARL
:: .. :..:::.::::::: :::.::: : :.. :::: :..:.::.::.::.::.
CCDS86 TLNRQAMGELSELSFHYLIMAKGVIVRSGTHTLPVESGDMKGSFALSFPVESDVAPIARM
480 490 500 510 520 530
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pF1KB4 LIYAVLPTGDVIGDSAKYDVENCLANKVDLSFSPSQSLPASHAHLRVTAAPQSVCALRAV
.:.:.:: :.:.::: :...::::::::::::::.:: :::::::.:.:::::.::::::
CCDS86 FIFAILPDGEVVGDSEKFEIENCLANKVDLSFSPAQSPPASHAHLQVAAAPQSLCALRAV
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pF1KB4 DQSVLLMKPDAELSASSVYNLLPEKDLTGFPGPLNDQDDEDCINRHNVYI-NGITYTPVS
:::::::::.::::.::::::: ::::.:: ...:..:. . .: :: :.:.:
CCDS86 DQSVLLMKPEAELSVSSVYNLLTVKDLTNFPDNVDQQEEEQGHCPRPFFIHNGAIYVPLS
600 610 620 630 640 650
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pF1KB4 STNEKDMYSFLEDMGLKAFTNSKIRKPKMC---PQLQQYEM-HGPEGLRVGFYESDVMGR
: :: :.::::. ::::.:::::::::: : :... . .: : .: : . .
CCDS86 S-NEADIYSFLKGMGLKVFTNSKIRKPKSCSVIPSVSAGAVGQGYYGAGLGVVERPYVPQ
660 670 680 690 700 710
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pF1KB4 -GHARLVHVEE-----PHTETVRKYFPETWIWDLVVVNSAGVAEVGVTVPDTITEWKAGA
: .. ... : ::::.::::::::.::.:::.::::::::::::::::::::
CCDS86 LGTYNVIPLNNEQSSGPVPETVRSYFPETWIWELVAVNSSGVAEVGVTVPDTITEWKAGA
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 FCLSEDAGLGISSTASLRAFQPFFVELTMPYSVIRGEAFTLKATVLNYLPKCIRVSVQLE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.
CCDS86 FCLSEDAGLGISSTASLRAFQPFFVELTMPYSVIRGEVFTLKATVLNYLPKCIRVSVQLK
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 ASPAFLAVPVEKEQVPHCICANGRQTVSWAVTPKSLGNVNFTVSAEALESQELCGTEVPS
::::::: : . .:::.: :::.::.::::.::::::.:::::..: ::::.::
CCDS86 ASPAFLASQNTKGEESYCICGNERQTLSWTVTPKTLGNVNFSVSAEAMQSLELCGNEVVE
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KB4 VPEHGRKDTVIKPLLVEPEGLEKETTFNSLLCPSGGEVSEELSLKLPPNVVEESARASVS
::: ::::::: :::: ::.:.: ::.:. : ::..:::.:::::: :::.:::::: :
CCDS86 VPEIKRKDTVIKTLLVEAEGIEQEKTFSSMTCASGANVSEQLSLKLPSNVVKESARASFS
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980 990 1000
pF1KB4 VLGDILGSAMQNTQNLLQMPYGCGEQNMVLFAPNIYVLDYLNETQQLTPEIKSKAIGYLN
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::.::::::::: :::.::.:::
CCDS86 VLGDILGSAMQNIQNLLQMPYGCGEQNMVLFAPNIYVLNYLNETQQLTQEIKAKAVGYLI
960 970 980 990 1000 1010
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB4 TGYQRQLNYKHYDGSYSTFGERYGRNQGNTWLTAFVLKTFAQARAYIFIDEAHITQALIW
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.: :
CCDS86 TGYQRQLNYKHQDGSYSTFGERYGRNQGNTWLTAFVLKTFAQARSYIFIDEAHITQSLTW
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB4 LSQRQKDNGCFRSSGSLLNNAIKGGVEDEVTLSAYITIALLEIPLTVTHPVVRNALFCLE
::: :::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::: ::.:.:::::::::
CCDS86 LSQMQKDNGCFRSSGSLLNNAIKGGVEDEATLSAYVTIALLEIPLPVTNPIVRNALFCLE
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB4 SAWKTAQEGDHGSHVYTKALLAYAFALAGNQDKRKEVLKSLNEEAVKKDNSVHWERPQKP
:::..:.:: :::::::::::::::.: :.:.. .:.:.::..::::.:: :::::::.:
CCDS86 SAWNVAKEGTHGSHVYTKALLAYAFSLLGKQNQNREILNSLDKEAVKEDNLVHWERPQRP
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB4 KAPVGHFYEPQAPSAEVEMTSYVLLAYLTAQPAPTSEDLTSATNIVKWITKQQNAQGGFS
::::::.:. :::::::::::::::::::::::::: :::::::::::: ::::::::::
CCDS86 KAPVGHLYQTQAPSAEVEMTSYVLLAYLTAQPAPTSGDLTSATNIVKWIMKQQNAQGGFS
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KB4 STQDTVVALHALSKYGAATFTRTGKAAQVTIQSSGTFSSKFQVDNNNRLLLQQVSLPELP
:::::::::::::.::::::::: :.::::.:.: :::..::::::: :::::.::::::
CCDS86 STQDTVVALHALSRYGAATFTRTEKTAQVTVQDSQTFSTNFQVDNNNLLLLQQISLPELP
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KB4 GEYSMKVTGEGCVYLQTSLKYNILPEKEEFPFALGVQTLPQTCDEPKAHTSFQISLSVSY
::: . :::: :::::::.:::::::::. :::: :::.::::: ::::::::::..::
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CCDS73 NIQSVNRLVFQQDTLPNVPGMYTLEASGQGCVYVQTVLRYNILPPTNMKTFSLSVEIGKA
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CCDS73 GTDTLNIYLDELIKNTQTYTFTISQSVLVTNLKPATIKVYDYYLPDEQATIQYSDPCE
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pF1KB4 LGNA
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CCDS55 VKAELLKTASNLTVSVLEAEGVFEKGSFKTLTLPSDPKSNLIQQWLSQQSDLGVISKTFQ
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CCDS55 LSSHPILGDWSIQVQVNDQTYYQS-FQVSEYVLPKFEVTLQTPLYCSMNSKHLNGTITAK
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CCDS55 YTYGKPVKGDVTLTFL-----PLSFWGK-KKNITKTFKINGSANFSFNDEEMKNVMDSSN
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CCDS55 GLSEY-LDLSSPGPVEILTTVTESVTGISRNVSTNVFFKQHDYIIEFFDYTTVLKPSLNF
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CCDS55 TATVKVTRADGNQLTLEERRNNVVITVTQRNYTEYWSGSNSGNQKMEAVQ-KINYTVPQS
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CCDS55 GTFKIEFPILEDSSELQLKAYFLGSKSSMAVHS--LFKSPSKTYIQLKTRDENIKVGSP-
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