Result of FASTA (omim) for
pF1KB4815
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4815, 1474 aa
1>>>pF1KB4815 1474 - 1474 aa - 1474 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8993+/-0.000536; mu= 20.2321+/- 0.033
mean_var=71.5700+/-14.681, 0's: 0 Z-trim(106.8): 56 B-trim: 247 in 2/48
Lambda= 0.151603
statistics sampled from 14877 (14927) to 14877 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.51), E-opt: 0.2 (0.175), width: 16
Scan time: 13.970
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000005 (OMIM: 103950,104300,614036) alpha-2-mac (1474) 9663 2124.0 0
XP_006719119 (OMIM: 103950,104300,614036) PREDICTE (1512) 9624 2115.5 0
NP_002855 (OMIM: 176420) pregnancy zone protein pr (1482) 5205 1149.0 0
XP_016875253 (OMIM: 176420) PREDICTED: pregnancy z (1488) 5198 1147.5 0
XP_011519107 (OMIM: 176420) PREDICTED: pregnancy z (1499) 5146 1136.1 0
XP_011519106 (OMIM: 176420) PREDICTED: pregnancy z (1500) 5134 1133.5 0
XP_016875252 (OMIM: 176420) PREDICTED: pregnancy z (1500) 5134 1133.5 0
XP_016875255 (OMIM: 176420) PREDICTED: pregnancy z (1268) 3092 686.8 2.8e-196
XP_016875254 (OMIM: 176420) PREDICTED: pregnancy z (1417) 3021 671.3 1.5e-191
XP_011519109 (OMIM: 176420) PREDICTED: pregnancy z ( 831) 2971 660.3 1.8e-188
XP_016875256 (OMIM: 176420) PREDICTED: pregnancy z ( 939) 2971 660.3 2e-188
XP_016874359 (OMIM: 610627) PREDICTED: alpha-2-mac (1454) 2928 651.0 2e-185
NP_653271 (OMIM: 610627) alpha-2-macroglobulin-lik (1454) 2926 650.5 2.7e-185
XP_011519108 (OMIM: 176420) PREDICTED: pregnancy z (1045) 2864 636.9 2.4e-181
NP_001269353 (OMIM: 610627) alpha-2-macroglobulin- ( 963) 2056 460.2 3.6e-128
XP_011518868 (OMIM: 610627) PREDICTED: alpha-2-mac (1467) 1882 422.2 1.5e-116
XP_011518869 (OMIM: 610627) PREDICTED: alpha-2-mac (1467) 1882 422.2 1.5e-116
XP_016874357 (OMIM: 610627) PREDICTED: alpha-2-mac (1466) 1868 419.1 1.3e-115
XP_016874358 (OMIM: 610627) PREDICTED: alpha-2-mac (1466) 1868 419.1 1.3e-115
XP_011526227 (OMIM: 608841) PREDICTED: C3 and PZP- (1189) 971 222.9 1.2e-56
XP_016865772 (OMIM: 608859) PREDICTED: CD109 antig (1205) 970 222.7 1.4e-56
NP_001153060 (OMIM: 608859) CD109 antigen isoform (1368) 970 222.7 1.6e-56
NP_001153059 (OMIM: 608859) CD109 antigen isoform (1428) 970 222.7 1.6e-56
XP_011533775 (OMIM: 608859) PREDICTED: CD109 antig (1432) 970 222.7 1.6e-56
NP_598000 (OMIM: 608859) CD109 antigen isoform 1 p (1445) 970 222.7 1.6e-56
XP_005248716 (OMIM: 608859) PREDICTED: CD109 antig (1445) 970 222.7 1.6e-56
XP_011526224 (OMIM: 608841) PREDICTED: C3 and PZP- (1815) 971 223.0 1.7e-56
XP_011526225 (OMIM: 608841) PREDICTED: C3 and PZP- (1815) 971 223.0 1.7e-56
XP_011526223 (OMIM: 608841) PREDICTED: C3 and PZP- (1815) 971 223.0 1.7e-56
XP_011526226 (OMIM: 608841) PREDICTED: C3 and PZP- (1815) 971 223.0 1.7e-56
XP_016882083 (OMIM: 608841) PREDICTED: C3 and PZP- (1817) 971 223.0 1.7e-56
XP_011526222 (OMIM: 608841) PREDICTED: C3 and PZP- (1858) 971 223.0 1.8e-56
XP_011526221 (OMIM: 608841) PREDICTED: C3 and PZP- (1862) 971 223.0 1.8e-56
XP_011526220 (OMIM: 608841) PREDICTED: C3 and PZP- (1887) 971 223.0 1.8e-56
XP_011526219 (OMIM: 608841) PREDICTED: C3 and PZP- (1920) 971 223.0 1.8e-56
NP_056507 (OMIM: 608841) C3 and PZP-like alpha-2-m (1932) 971 223.0 1.8e-56
XP_016870592 (OMIM: 120900,609536,615749) PREDICTE (1560) 554 131.7 4.3e-29
NP_001726 (OMIM: 120900,609536,615749) complement (1676) 554 131.7 4.6e-29
XP_011517282 (OMIM: 120900,609536,615749) PREDICTE (1681) 554 131.7 4.6e-29
XP_016870591 (OMIM: 120900,609536,615749) PREDICTE (1681) 554 131.7 4.6e-29
NP_001304092 (OMIM: 120900,609536,615749) compleme (1682) 554 131.7 4.6e-29
NP_000055 (OMIM: 120700,611378,612925,613779) comp (1663) 540 128.7 3.8e-28
NP_001002029 (OMIM: 120820,614379) complement C4-B (1744) 540 128.7 4e-28
NP_001239133 (OMIM: 120810,614374,614380) compleme (1698) 536 127.8 7.1e-28
NP_009224 (OMIM: 120810,614374,614380) complement (1744) 536 127.8 7.3e-28
XP_016885778 (OMIM: 120810,614374,614380) PREDICTE (1744) 536 127.8 7.3e-28
XP_016870593 (OMIM: 120900,609536,615749) PREDICTE (1171) 448 108.5 3.2e-22
NP_001304093 (OMIM: 120900,609536,615749) compleme ( 902) 251 65.4 2.4e-09
>>NP_000005 (OMIM: 103950,104300,614036) alpha-2-macrogl (1474 aa)
initn: 9663 init1: 9663 opt: 9663 Z-score: 11410.9 bits: 2124.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9663; 99.9% identity (100.0% similar) in 1474 aa overlap (1-1474:1-1474)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGKNKLLHPSLVLLLLVLLPTDASVSGKPQYMVLVPSLLHTETTEKGCVLLSYLNETVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MGKNKLLHPSLVLLLLVLLPTDASVSGKPQYMVLVPSLLHTETTEKGCVLLSYLNETVTV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SASLESVRGNRSLFTDLEAENDVLHCVAFAVPKSSSNEEVMFLTVQVKGPTQEFKKRTTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SASLESVRGNRSLFTDLEAENDVLHCVAFAVPKSSSNEEVMFLTVQVKGPTQEFKKRTTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 MVKNEDSLVFVQTDKSIYKPGQTVKFRVVSMDENFHPLNELIPLVYIQDPKGNRIAQWQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MVKNEDSLVFVQTDKSIYKPGQTVKFRVVSMDENFHPLNELIPLVYIQDPKGNRIAQWQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 FQLEGGLKQFSFPLSSEPFQGSYKVVVQKKSGGRTEHPFTVEEFVLPKFEVQVTVPKIIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FQLEGGLKQFSFPLSSEPFQGSYKVVVQKKSGGRTEHPFTVEEFVLPKFEVQVTVPKIIT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ILEEEMNVSVCGLYTYGKPVPGHVTVSICRKYSDASDCHGEDSQAFCEKFSGQLNSHGCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ILEEEMNVSVCGLYTYGKPVPGHVTVSICRKYSDASDCHGEDSQAFCEKFSGQLNSHGCF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 YQQVKTKVFQLKRKEYEMKLHTEAQIQEEGTVVELTGRQSSEITRTITKLSFVKVDSHFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YQQVKTKVFQLKRKEYEMKLHTEAQIQEEGTVVELTGRQSSEITRTITKLSFVKVDSHFR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 QGIPFFGQVRLVDGKGVPIPNKVIFIRGNEANYYSNATTDEHGLVQFSINTTNVMGTSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QGIPFFGQVRLVDGKGVPIPNKVIFIRGNEANYYSNATTDEHGLVQFSINTTNVMGTSLT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VRVNYKDRSPCYGYQWVSEEHEEAHHTAYLVFSPSKSFVHLEPMSHELPCGHTQTVQAHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VRVNYKDRSPCYGYQWVSEEHEEAHHTAYLVFSPSKSFVHLEPMSHELPCGHTQTVQAHY
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490 500 510 520 530 540
pF1KB4 ILNGGTLLGLKKLSFYYLIMAKGGIVRTGTHGLLVKQEDMKGHFSISIPVKSDIAPVARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ILNGGTLLGLKKLSFYYLIMAKGGIVRTGTHGLLVKQEDMKGHFSISIPVKSDIAPVARL
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pF1KB4 LIYAVLPTGDVIGDSAKYDVENCLANKVDLSFSPSQSLPASHAHLRVTAAPQSVCALRAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LIYAVLPTGDVIGDSAKYDVENCLANKVDLSFSPSQSLPASHAHLRVTAAPQSVCALRAV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 DQSVLLMKPDAELSASSVYNLLPEKDLTGFPGPLNDQDDEDCINRHNVYINGITYTPVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DQSVLLMKPDAELSASSVYNLLPEKDLTGFPGPLNDQDDEDCINRHNVYINGITYTPVSS
610 620 630 640 650 660
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pF1KB4 TNEKDMYSFLEDMGLKAFTNSKIRKPKMCPQLQQYEMHGPEGLRVGFYESDVMGRGHARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TNEKDMYSFLEDMGLKAFTNSKIRKPKMCPQLQQYEMHGPEGLRVGFYESDVMGRGHARL
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730 740 750 760 770 780
pF1KB4 VHVEEPHTETVRKYFPETWIWDLVVVNSAGVAEVGVTVPDTITEWKAGAFCLSEDAGLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VHVEEPHTETVRKYFPETWIWDLVVVNSAGVAEVGVTVPDTITEWKAGAFCLSEDAGLGI
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pF1KB4 SSTASLRAFQPFFVELTMPYSVIRGEAFTLKATVLNYLPKCIRVSVQLEASPAFLAVPVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SSTASLRAFQPFFVELTMPYSVIRGEAFTLKATVLNYLPKCIRVSVQLEASPAFLAVPVE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 KEQVPHCICANGRQTVSWAVTPKSLGNVNFTVSAEALESQELCGTEVPSVPEHGRKDTVI
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KEQAPHCICANGRQTVSWAVTPKSLGNVNFTVSAEALESQELCGTEVPSVPEHGRKDTVI
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pF1KB4 KPLLVEPEGLEKETTFNSLLCPSGGEVSEELSLKLPPNVVEESARASVSVLGDILGSAMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KPLLVEPEGLEKETTFNSLLCPSGGEVSEELSLKLPPNVVEESARASVSVLGDILGSAMQ
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pF1KB4 NTQNLLQMPYGCGEQNMVLFAPNIYVLDYLNETQQLTPEIKSKAIGYLNTGYQRQLNYKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NTQNLLQMPYGCGEQNMVLFAPNIYVLDYLNETQQLTPEIKSKAIGYLNTGYQRQLNYKH
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 YDGSYSTFGERYGRNQGNTWLTAFVLKTFAQARAYIFIDEAHITQALIWLSQRQKDNGCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YDGSYSTFGERYGRNQGNTWLTAFVLKTFAQARAYIFIDEAHITQALIWLSQRQKDNGCF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KB4 RSSGSLLNNAIKGGVEDEVTLSAYITIALLEIPLTVTHPVVRNALFCLESAWKTAQEGDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RSSGSLLNNAIKGGVEDEVTLSAYITIALLEIPLTVTHPVVRNALFCLESAWKTAQEGDH
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pF1KB4 GSHVYTKALLAYAFALAGNQDKRKEVLKSLNEEAVKKDNSVHWERPQKPKAPVGHFYEPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GSHVYTKALLAYAFALAGNQDKRKEVLKSLNEEAVKKDNSVHWERPQKPKAPVGHFYEPQ
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pF1KB4 APSAEVEMTSYVLLAYLTAQPAPTSEDLTSATNIVKWITKQQNAQGGFSSTQDTVVALHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 APSAEVEMTSYVLLAYLTAQPAPTSEDLTSATNIVKWITKQQNAQGGFSSTQDTVVALHA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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pF1KB4 LSKYGAATFTRTGKAAQVTIQSSGTFSSKFQVDNNNRLLLQQVSLPELPGEYSMKVTGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LSKYGAATFTRTGKAAQVTIQSSGTFSSKFQVDNNNRLLLQQVSLPELPGEYSMKVTGEG
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1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB4 CVYLQTSLKYNILPEKEEFPFALGVQTLPQTCDEPKAHTSFQISLSVSYTGSRSASNMAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CVYLQTSLKYNILPEKEEFPFALGVQTLPQTCDEPKAHTSFQISLSVSYTGSRSASNMAI
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1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB4 VDVKMVSGFIPLKPTVKMLERSNHVSRTEVSSNHVLIYLDKVSNQTLSLFFTVLQDVPVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VDVKMVSGFIPLKPTVKMLERSNHVSRTEVSSNHVLIYLDKVSNQTLSLFFTVLQDVPVR
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470
pF1KB4 DLKPAIVKVYDYYETDEFAIAEYNAPCSKDLGNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DLKPAIVKVYDYYETDEFAIAEYNAPCSKDLGNA
1450 1460 1470
>>XP_006719119 (OMIM: 103950,104300,614036) PREDICTED: a (1512 aa)
initn: 9624 init1: 9624 opt: 9624 Z-score: 11364.6 bits: 2115.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9624; 99.9% identity (100.0% similar) in 1469 aa overlap (1-1469:1-1469)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGKNKLLHPSLVLLLLVLLPTDASVSGKPQYMVLVPSLLHTETTEKGCVLLSYLNETVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MGKNKLLHPSLVLLLLVLLPTDASVSGKPQYMVLVPSLLHTETTEKGCVLLSYLNETVTV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SASLESVRGNRSLFTDLEAENDVLHCVAFAVPKSSSNEEVMFLTVQVKGPTQEFKKRTTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SASLESVRGNRSLFTDLEAENDVLHCVAFAVPKSSSNEEVMFLTVQVKGPTQEFKKRTTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 MVKNEDSLVFVQTDKSIYKPGQTVKFRVVSMDENFHPLNELIPLVYIQDPKGNRIAQWQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MVKNEDSLVFVQTDKSIYKPGQTVKFRVVSMDENFHPLNELIPLVYIQDPKGNRIAQWQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 FQLEGGLKQFSFPLSSEPFQGSYKVVVQKKSGGRTEHPFTVEEFVLPKFEVQVTVPKIIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FQLEGGLKQFSFPLSSEPFQGSYKVVVQKKSGGRTEHPFTVEEFVLPKFEVQVTVPKIIT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ILEEEMNVSVCGLYTYGKPVPGHVTVSICRKYSDASDCHGEDSQAFCEKFSGQLNSHGCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ILEEEMNVSVCGLYTYGKPVPGHVTVSICRKYSDASDCHGEDSQAFCEKFSGQLNSHGCF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 YQQVKTKVFQLKRKEYEMKLHTEAQIQEEGTVVELTGRQSSEITRTITKLSFVKVDSHFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YQQVKTKVFQLKRKEYEMKLHTEAQIQEEGTVVELTGRQSSEITRTITKLSFVKVDSHFR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 QGIPFFGQVRLVDGKGVPIPNKVIFIRGNEANYYSNATTDEHGLVQFSINTTNVMGTSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QGIPFFGQVRLVDGKGVPIPNKVIFIRGNEANYYSNATTDEHGLVQFSINTTNVMGTSLT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VRVNYKDRSPCYGYQWVSEEHEEAHHTAYLVFSPSKSFVHLEPMSHELPCGHTQTVQAHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VRVNYKDRSPCYGYQWVSEEHEEAHHTAYLVFSPSKSFVHLEPMSHELPCGHTQTVQAHY
430 440 450 460 470 480
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pF1KB4 ILNGGTLLGLKKLSFYYLIMAKGGIVRTGTHGLLVKQEDMKGHFSISIPVKSDIAPVARL
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NP_002 TGNRPASNMVIVDVKMVSGFIPLKPTVKMLERSSSVSRTEVSNNHVLIYVEQVTNQTLSF
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>>XP_011519106 (OMIM: 176420) PREDICTED: pregnancy zone (1500 aa)
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pF1KB4 MGKNKLLHPSLVLLLLVLLPTDASVSGKPQYMVLVPSLLHTETTEKGCVLLSYLNETVTV
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pF1KB4 FQLEGGLKQFSFPLSSEPFQGSYKVVVQKKSGGRTEHPFTVEEFVLPKFEVQVTVPKIIT
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XP_011 LKLEAGINQLSFPLSSEPIQGSYRVVVQTESGGRIQHPFTVEEFVLPKFEVKVQVPKIIS
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pF1KB4 FQLEGGLKQFSFPLSSEPFQGSYKVVVQKKSGGRTEHPFTVEEFVLPKFEVQVTVPKIIT
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XP_011 LKLEAGINQLSFPLSSEPIQGSYRVVVQTESGGRIQHPFTVEEFVLPKFEVKVQVPKIIS
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XP_011 VRVFTVHPNLCFHYSWVAEDHQGAQHTANRVFSLSGSYIHLEPVAGTLPCGHTETITAHY
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pF1KB4 ILNGGTLLGLKKLSFYYLIMAKGGIVRTGTHGLLVKQEDMKGHFSISIPVKSDIAPVARL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]