Result of FASTA (ccds) for pF1KB4823
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4823, 741 aa
  1>>>pF1KB4823 741 - 741 aa - 741 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8119+/-0.00089; mu= 10.6933+/- 0.054
 mean_var=164.8016+/-32.920, 0's: 0 Z-trim(112.4): 24  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.099906
 statistics sampled from 13111 (13134) to 13111 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.403), width:  16
 Scan time:  4.360

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33589.1 ADARB1 gene_id:104|Hs108|chr21         ( 741) 4938 724.0 2.1e-208
CCDS42970.1 ADARB1 gene_id:104|Hs108|chr21         ( 714) 4745 696.1 4.8e-200
CCDS33590.1 ADARB1 gene_id:104|Hs108|chr21         ( 701) 3082 456.4 6.7e-128
CCDS7058.1 ADARB2 gene_id:105|Hs108|chr10          ( 739)  940 147.7 6.1e-35
CCDS30879.1 ADAR gene_id:103|Hs108|chr1            ( 931)  550 91.6 6.1e-18
CCDS1071.1 ADAR gene_id:103|Hs108|chr1             (1226)  550 91.7 7.6e-18


>>CCDS33589.1 ADARB1 gene_id:104|Hs108|chr21              (741 aa)
 initn: 4938 init1: 4938 opt: 4938  Z-score: 3855.1  bits: 724.0 E(32554): 2.1e-208
Smith-Waterman score: 4938; 100.0% identity (100.0% similar) in 741 aa overlap (1-741:1-741)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 GHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAPLFVMSVEVNGQVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAPLFVMSVEVNGQVF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 EGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 ETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMIL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 NELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 LDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 TDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 QKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 GSLQPRPPGLLSDPSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GSLQPRPPGLLSDPSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 TWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAM
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 YQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 LGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFI
              670       680       690       700       710       720

              730       740 
pF1KB4 KAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP
       :::::::::::::::::::::
CCDS33 KAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP
              730       740 

>>CCDS42970.1 ADARB1 gene_id:104|Hs108|chr21              (714 aa)
 initn: 4745 init1: 4745 opt: 4745  Z-score: 3705.0  bits: 696.1 E(32554): 4.8e-200
Smith-Waterman score: 4745; 100.0% identity (100.0% similar) in 712 aa overlap (1-712:1-712)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 GHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAPLFVMSVEVNGQVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAPLFVMSVEVNGQVF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 EGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 ETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMIL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 NELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 LDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 TDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 QKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 GSLQPRPPGLLSDPSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GSLQPRPPGLLSDPSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 TWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAM
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 YQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 LGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
CCDS42 LGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKVH      
              670       680       690       700       710          

              730       740 
pF1KB4 KAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP

>>CCDS33590.1 ADARB1 gene_id:104|Hs108|chr21              (701 aa)
 initn: 4640 init1: 3082 opt: 3082  Z-score: 2409.7  bits: 456.4 E(32554): 6.7e-128
Smith-Waterman score: 4564; 94.6% identity (94.6% similar) in 741 aa overlap (1-741:1-701)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 GHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAPLFVMSVEVNGQVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAPLFVMSVEVNGQVF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 EGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 ETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMIL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 NELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 LDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 TDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDD
              370       380       390       400       410       420

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pF1KB4 QKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNH
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::               
CCDS33 QKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILE---------------
              430       440       450       460                    

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pF1KB4 GSLQPRPPGLLSDPSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQ
                                :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 -------------------------EPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQ
                                  470       480       490       500

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pF1KB4 TWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAM
              510       520       530       540       550       560

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pF1KB4 YQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDE
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pF1KB4 LGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFI
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              730       740 
pF1KB4 KAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP
       :::::::::::::::::::::
CCDS33 KAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP
              690       700 

>>CCDS7058.1 ADARB2 gene_id:105|Hs108|chr10               (739 aa)
 initn: 2400 init1: 766 opt: 940  Z-score: 740.8  bits: 147.7 E(32554): 6.1e-35
Smith-Waterman score: 2358; 51.3% identity (75.5% similar) in 743 aa overlap (2-740:55-738)

                                            10        20        30 
pF1KB4                              MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGS
                                     . ::....:.::..::::::. :.. .   
CCDS70 RRRRRSKRKDKVSILSTFLAPFKHLSPGITNTEDDDTLSTSSAEVKENRNVGNLAAR---
           30        40        50        60        70        80    

              40        50        60         70        80        90
pF1KB4 TPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSNGH-SKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIK
        : :. :.. . ::. :  ::::::::..::  : .:  . :    : :::::.::.:..
CCDS70 -PPPS-GDR-ARGGAPGAKRKRPLEEGNGGHLCKLQLVWK-KLSWSVAPKNALVQLHELR
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pF1KB4 PGLQYTLLSQTGPVHAPLFVMSVEVNGQVFEGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASE
       :::::  .:::::::::.:...::::: .:::.::::::::..::: ::::::::::: .
CCDS70 PGLQYRTVSQTGPVHAPVFAVAVEVNGLTFEGTGPTKKKAKMRAAELALRSFVQFPNACQ
       140       150       160       170       180       190       

              160       170       180       190       200          
pF1KB4 AHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGFETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSS--GDLSL
       ::::::   . .:::::::::::::::. :: :   .: .  :  :: .. :.  :   :
CCDS70 AHLAMGGGPGPGTDFTSDQADFPDTLFQEFE-PPAPRPGLAGGRPGDAALLSAAYGRRRL
       200       210       220        230       240       250      

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pF1KB4 SASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMILNELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVV
           .  .:. :  :. :    :. .:::..::.:: ::.:  :.: .: .:.::::.: 
CCDS70 LCRAL--DLVGPT-PATP--AAPGERNPVVLLNRLRAGLRYVCLAEPAERRARSFVMAVS
        260          270         280       290       300       310 

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pF1KB4 VDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLHLDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVS
       :::. ::::::.::::...:::.::  .:..   : :.. :  ... .  .:: .::..:
CCDS70 VDGRTFEGSGRSKKLARGQAAQAALQELFDI---QMPGHAP--GRARRTPMPQEFADSIS
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pF1KB4 RLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTGTDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGL
       .::  :: ..: ...  :::.:.:::.::: : :...:.:...:.:::::.::..::.::
CCDS70 QLVTQKFREVTTDLTPMHARHKALAGIVMTKGLDARQAQVVALSSGTKCISGEHLSDQGL
        370       380       390       400       410       420      

      390       400       410        420       430       440       
pF1KB4 ALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNK-DDQKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYIS
       ..::::::...::..:.::::::::.:... .:..:::: . ..::.::.::. ::::.:
CCDS70 VVNDCHAEVVARRAFLHFLYTQLELHLSKRREDSERSIFVRLKEGGYRLRENILFHLYVS
        430       440       450       460       470       480      

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pF1KB4 TSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNHGSLQPRPPGLLSDPSTSTFQGAGTTEP
       ::::::::. ::.:                            . .:  .:          
CCDS70 TSPCGDARLHSPYE----------------------------ITTDLHSS----------
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pF1KB4 ADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQTWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVG
         .:  :: ::.:::::::::::.:::. ...::::::: ::.:.::::.::::::::.:
CCDS70 --KHLVRKFRGHLRTKIESGEGTVPVRGPSAVQTWDGVLLGEQLITMSCTDKIARWNVLG
        510       520       530       540       550       560      

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pF1KB4 IQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAMYQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNA
       .::.::: ::::.:..::..:::.:  ::.:.: .:. .. .::  :  :.:::::.:.:
CCDS70 LQGALLSHFVEPVYLQSIVVGSLHHTGHLARVMSHRMEGVGQLPASYRHNRPLLSGVSDA
        570       580       590       600       610       620      

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pF1KB4 EARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDELGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHL
       :::::::.: ::.::.::.. .:.::::::.   :  ::::::.:  :: :..:.. .. 
CCDS70 EARQPGKSPPFSMNWVVGSADLEIINATTGRRSCGGPSRLCKHVLSARWARLYGRLSTRT
        630       640       650       660       670       680      

       690       700       710       720       730       740 
pF1KB4 LRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFIKAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP
         :    :..: :.::.:. ::..: .:: :: :::::.::.:: ::.:: :: 
CCDS70 -PSPGDTPSMYCEAKLGAHTYQSVKQQLFKAFQKAGLGTWVRKPPEQQQFLLTL
         690       700       710       720       730         

>>CCDS30879.1 ADAR gene_id:103|Hs108|chr1                 (931 aa)
 initn: 775 init1: 372 opt: 550  Z-score: 435.6  bits: 91.6 E(32554): 6.1e-18
Smith-Waterman score: 917; 31.8% identity (58.0% similar) in 707 aa overlap (79-741:320-930)

       50        60        70        80         90       100       
pF1KB4 PGRKRPLEEGSNGHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQ-LNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAP
                                     : ..:.. ....  . .. :::. ::.: :
CCDS30 SHYSTEKESEKTAESQTPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHEP
     290       300       310       320       330       340         

       110       120        130       140       150       160      
pF1KB4 LFVMSVEVNGQVFEG-SGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFT
        : . : :..:.: . :.:.:: ::  :::.:....      .::      : :. .:  
CCDS30 KFQYCVAVGAQTFPSVSAPSKKVAKQMAAEEAMKAL-----HGEA------TNSMASD--
     350       360       370       380                  390        

        170       180       190       200         210       220    
pF1KB4 SDQADFPDTLFNGFETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLS--LSASPVPASLAQPPLPV
        .:   :. ...  :. :. :      :   ..  . :.:   :...:: . :       
CCDS30 -NQ---PEGMIS--ESLDNLE------SMMPNKVRKIGELVRYLNTNPVGGLLE------
            400         410             420       430              

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pF1KB4 LPPFPPPSGKNPVMILNELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEG-SGRNKKL
          .    :              .. ....::  :  .::... : :..: .  ...:: 
CCDS30 ---YARSHGFAA-----------EFKLVDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQ
         440                  450       460       470       480    

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pF1KB4 AKARAAQSALAAIFN-------------------------LHLDQTPSRQP--IPSEGLQ
       .: .::..:: ....                         : :...:  ::  .:  :  
CCDS30 GKQEAADAALRVLIGENEKAERMGFTEVTPVTGASLRRTMLLLSRSPEAQPKTLPLTGST
          490       500       510       520       530       540    

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pF1KB4 LHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTGTDVKDAKVI-SVSTGT
       .:      : .. :    :. ::..:.     ::.::...:    : .:  :. :..::.
CCDS30 FH------DQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLGRKILAAIIMKK--DSEDMGVVVSLGTGN
                550       560       570       580         590      

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pF1KB4 KCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDDQKRSIFQKSERGGFR
       .:..:. .: .: ..:::::::::::...::::..:  :  :..  : :::. . .:: .
CCDS30 RCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSELMKY--NSQTAKDSIFEPA-KGGEK
        600       610       620       630         640        650   

           440       450       460       470       480       490   
pF1KB4 L--KENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNHGSLQPRPPGLLSD
       :  :..:.:::::::.::::. .:.                   :.  ...         
CCDS30 LQIKKTVSFHLYISTAPCGDGALFDKS-----------------CSDRAME---------
           660       670       680                                 

           500       510       520       530       540       550   
pF1KB4 PSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQTWDGVLQGERLLT
        :: . .      :. ..:..   :.::::.:.:::::::.:.  . ::::.  :::: :
CCDS30 -STESRH-----YPVFENPKQ---GKLRTKVENGEGTIPVESSDIVPTWDGIRLGERLRT
        690            700          710       720       730        

           560       570       580       590       600             
pF1KB4 MSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAMYQRI----SNIED
       ::::::: ::::.:.::.::. :..:::..:. :: :.   ::.::.  :.    : .::
CCDS30 MSCSDKILRWNVLGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLGYLFSQGHLTRAICCRVTRDGSAFED
      740       750       760       770       780       790        

      610       620        630       640        650       660      
pF1KB4 -LPPLYTLNKPLLSGISNAEA-RQPGKAPNFSVNWTVGDSA-IEVINATTGKDELGRA--
        :   . .:.: .. .:  .. :: ::. . :::: ..:.  .:....: :  .  :   
CCDS30 GLRHPFIVNHPKVGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNWCLADGYDLEILDGTRGTVDGPRNEL
      800       810       820       830       840       850        

          670       680       690       700       710       720    
pF1KB4 SRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFIKAGL
       ::. :. ..     .  :. :   :  . . . : :.: ::..:..::  .  ..   : 
CCDS30 SRVSKKNIFL----LFKKLCSFRYRRDLLRLS-YGEAKKAARDYETAKNYFKKGLKDMGY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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