FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4823, 741 aa 1>>>pF1KB4823 741 - 741 aa - 741 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8119+/-0.00089; mu= 10.6933+/- 0.054 mean_var=164.8016+/-32.920, 0's: 0 Z-trim(112.4): 24 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.099906 statistics sampled from 13111 (13134) to 13111 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.403), width: 16 Scan time: 4.360 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS33589.1 ADARB1 gene_id:104|Hs108|chr21 ( 741) 4938 724.0 2.1e-208 CCDS42970.1 ADARB1 gene_id:104|Hs108|chr21 ( 714) 4745 696.1 4.8e-200 CCDS33590.1 ADARB1 gene_id:104|Hs108|chr21 ( 701) 3082 456.4 6.7e-128 CCDS7058.1 ADARB2 gene_id:105|Hs108|chr10 ( 739) 940 147.7 6.1e-35 CCDS30879.1 ADAR gene_id:103|Hs108|chr1 ( 931) 550 91.6 6.1e-18 CCDS1071.1 ADAR gene_id:103|Hs108|chr1 (1226) 550 91.7 7.6e-18 >>CCDS33589.1 ADARB1 gene_id:104|Hs108|chr21 (741 aa) initn: 4938 init1: 4938 opt: 4938 Z-score: 3855.1 bits: 724.0 E(32554): 2.1e-208 Smith-Waterman score: 4938; 100.0% identity (100.0% similar) in 741 aa overlap (1-741:1-741) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 GHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAPLFVMSVEVNGQVF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 GHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAPLFVMSVEVNGQVF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 EGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 EGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 ETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 ETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMIL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 NELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 NELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLH 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 LDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 LDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 TDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 TDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDD 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 QKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 QKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNH 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB4 GSLQPRPPGLLSDPSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 GSLQPRPPGLLSDPSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQ 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB4 TWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 TWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAM 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB4 YQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 YQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDE 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB4 LGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 LGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFI 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KB4 KAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP ::::::::::::::::::::: CCDS33 KAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP 730 740 >>CCDS42970.1 ADARB1 gene_id:104|Hs108|chr21 (714 aa) initn: 4745 init1: 4745 opt: 4745 Z-score: 3705.0 bits: 696.1 E(32554): 4.8e-200 Smith-Waterman score: 4745; 100.0% identity (100.0% similar) in 712 aa overlap (1-712:1-712) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 GHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAPLFVMSVEVNGQVF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 GHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAPLFVMSVEVNGQVF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 EGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 EGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 ETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 ETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMIL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 NELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 NELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLH 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 LDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 LDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 TDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 TDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDD 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 QKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 QKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNH 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB4 GSLQPRPPGLLSDPSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 GSLQPRPPGLLSDPSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQ 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB4 TWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 TWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAM 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB4 YQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 YQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDE 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB4 LGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 LGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKVH 670 680 690 700 710 730 740 pF1KB4 KAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP >>CCDS33590.1 ADARB1 gene_id:104|Hs108|chr21 (701 aa) initn: 4640 init1: 3082 opt: 3082 Z-score: 2409.7 bits: 456.4 E(32554): 6.7e-128 Smith-Waterman score: 4564; 94.6% identity (94.6% similar) in 741 aa overlap (1-741:1-701) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 GHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAPLFVMSVEVNGQVF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 GHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAPLFVMSVEVNGQVF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 EGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 EGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 ETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 ETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMIL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 NELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 NELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLH 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 LDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 LDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 TDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 TDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDD 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 QKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNH ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 QKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILE--------------- 430 440 450 460 490 500 510 520 530 540 pF1KB4 GSLQPRPPGLLSDPSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQ ::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 -------------------------EPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQ 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 pF1KB4 TWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 TWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAM 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 660 pF1KB4 YQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 YQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDE 570 580 590 600 610 620 670 680 690 700 710 720 pF1KB4 LGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 LGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFI 630 640 650 660 670 680 730 740 pF1KB4 KAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP ::::::::::::::::::::: CCDS33 KAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP 690 700 >>CCDS7058.1 ADARB2 gene_id:105|Hs108|chr10 (739 aa) initn: 2400 init1: 766 opt: 940 Z-score: 740.8 bits: 147.7 E(32554): 6.1e-35 Smith-Waterman score: 2358; 51.3% identity (75.5% similar) in 743 aa overlap (2-740:55-738) 10 20 30 pF1KB4 MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGS . ::....:.::..::::::. :.. . CCDS70 RRRRRSKRKDKVSILSTFLAPFKHLSPGITNTEDDDTLSTSSAEVKENRNVGNLAAR--- 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 pF1KB4 TPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSNGH-SKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIK : :. :.. . ::. : ::::::::..:: : .: . : : :::::.::.:.. CCDS70 -PPPS-GDR-ARGGAPGAKRKRPLEEGNGGHLCKLQLVWK-KLSWSVAPKNALVQLHELR 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 PGLQYTLLSQTGPVHAPLFVMSVEVNGQVFEGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASE ::::: .:::::::::.:...::::: .:::.::::::::..::: ::::::::::: . CCDS70 PGLQYRTVSQTGPVHAPVFAVAVEVNGLTFEGTGPTKKKAKMRAAELALRSFVQFPNACQ 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 pF1KB4 AHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGFETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSS--GDLSL :::::: . .:::::::::::::::. :: : .: . : :: .. :. : : CCDS70 AHLAMGGGPGPGTDFTSDQADFPDTLFQEFE-PPAPRPGLAGGRPGDAALLSAAYGRRRL 200 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 pF1KB4 SASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMILNELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVV . .:. : :. : :. .:::..::.:: ::.: :.: .: .:.::::.: CCDS70 LCRAL--DLVGPT-PATP--AAPGERNPVVLLNRLRAGLRYVCLAEPAERRARSFVMAVS 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 pF1KB4 VDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLHLDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVS :::. ::::::.::::...:::.:: .:.. : :.. : ... . .:: .::..: CCDS70 VDGRTFEGSGRSKKLARGQAAQAALQELFDI---QMPGHAP--GRARRTPMPQEFADSIS 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 pF1KB4 RLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTGTDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGL .:: :: ..: ... :::.:.:::.::: : :...:.:...:.:::::.::..::.:: CCDS70 QLVTQKFREVTTDLTPMHARHKALAGIVMTKGLDARQAQVVALSSGTKCISGEHLSDQGL 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KB4 ALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNK-DDQKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYIS ..::::::...::..:.::::::::.:... .:..:::: . ..::.::.::. ::::.: CCDS70 VVNDCHAEVVARRAFLHFLYTQLELHLSKRREDSERSIFVRLKEGGYRLRENILFHLYVS 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KB4 TSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNHGSLQPRPPGLLSDPSTSTFQGAGTTEP ::::::::. ::.: . .: .: CCDS70 TSPCGDARLHSPYE----------------------------ITTDLHSS---------- 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KB4 ADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQTWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVG .: :: ::.:::::::::::.:::. ...::::::: ::.:.::::.::::::::.: CCDS70 --KHLVRKFRGHLRTKIESGEGTVPVRGPSAVQTWDGVLLGEQLITMSCTDKIARWNVLG 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KB4 IQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAMYQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNA .::.::: ::::.:..::..:::.: ::.:.: .:. .. .:: : :.:::::.:.: CCDS70 LQGALLSHFVEPVYLQSIVVGSLHHTGHLARVMSHRMEGVGQLPASYRHNRPLLSGVSDA 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 pF1KB4 EARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDELGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHL :::::::.: ::.::.::.. .:.::::::. : ::::::.: :: :..:.. .. CCDS70 EARQPGKSPPFSMNWVVGSADLEIINATTGRRSCGGPSRLCKHVLSARWARLYGRLSTRT 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KB4 LRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFIKAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP : :..: :.::.:. ::..: .:: :: :::::.::.:: ::.:: :: CCDS70 -PSPGDTPSMYCEAKLGAHTYQSVKQQLFKAFQKAGLGTWVRKPPEQQQFLLTL 690 700 710 720 730 >>CCDS30879.1 ADAR gene_id:103|Hs108|chr1 (931 aa) initn: 775 init1: 372 opt: 550 Z-score: 435.6 bits: 91.6 E(32554): 6.1e-18 Smith-Waterman score: 917; 31.8% identity (58.0% similar) in 707 aa overlap (79-741:320-930) 50 60 70 80 90 100 pF1KB4 PGRKRPLEEGSNGHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQ-LNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAP : ..:.. .... . .. :::. ::.: : CCDS30 SHYSTEKESEKTAESQTPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHEP 290 300 310 320 330 340 110 120 130 140 150 160 pF1KB4 LFVMSVEVNGQVFEG-SGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFT : . : :..:.: . :.:.:: :: :::.:.... .:: : :. .: CCDS30 KFQYCVAVGAQTFPSVSAPSKKVAKQMAAEEAMKAL-----HGEA------TNSMASD-- 350 360 370 380 390 170 180 190 200 210 220 pF1KB4 SDQADFPDTLFNGFETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLS--LSASPVPASLAQPPLPV .: :. ... :. :. : : .. . :.: :...:: . : CCDS30 -NQ---PEGMIS--ESLDNLE------SMMPNKVRKIGELVRYLNTNPVGGLLE------ 400 410 420 430 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 LPPFPPPSGKNPVMILNELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEG-SGRNKKL . : .. ....:: : .::... : :..: . ...:: CCDS30 ---YARSHGFAA-----------EFKLVDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQ 440 450 460 470 480 290 300 310 pF1KB4 AKARAAQSALAAIFN-------------------------LHLDQTPSRQP--IPSEGLQ .: .::..:: .... : :...: :: .: : CCDS30 GKQEAADAALRVLIGENEKAERMGFTEVTPVTGASLRRTMLLLSRSPEAQPKTLPLTGST 490 500 510 520 530 540 320 330 340 350 360 370 pF1KB4 LHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTGTDVKDAKVI-SVSTGT .: : .. : :. ::..:. ::.::...: : .: :. :..::. CCDS30 FH------DQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLGRKILAAIIMKK--DSEDMGVVVSLGTGN 550 560 570 580 590 380 390 400 410 420 430 pF1KB4 KCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDDQKRSIFQKSERGGFR .:..:. .: .: ..:::::::::::...::::..: : :.. : :::. . .:: . CCDS30 RCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSELMKY--NSQTAKDSIFEPA-KGGEK 600 610 620 630 640 650 440 450 460 470 480 490 pF1KB4 L--KENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNHGSLQPRPPGLLSD : :..:.:::::::.::::. .:. :. ... CCDS30 LQIKKTVSFHLYISTAPCGDGALFDKS-----------------CSDRAME--------- 660 670 680 500 510 520 530 540 550 pF1KB4 PSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQTWDGVLQGERLLT :: . . :. ..:.. :.::::.:.:::::::.:. . ::::. :::: : CCDS30 -STESRH-----YPVFENPKQ---GKLRTKVENGEGTIPVESSDIVPTWDGIRLGERLRT 690 700 710 720 730 560 570 580 590 600 pF1KB4 MSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAMYQRI----SNIED ::::::: ::::.:.::.::. :..:::..:. :: :. ::.::. :. : .:: CCDS30 MSCSDKILRWNVLGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLGYLFSQGHLTRAICCRVTRDGSAFED 740 750 760 770 780 790 610 620 630 640 650 660 pF1KB4 -LPPLYTLNKPLLSGISNAEA-RQPGKAPNFSVNWTVGDSA-IEVINATTGKDELGRA-- : . .:.: .. .: .. :: ::. . :::: ..:. .:....: : . : CCDS30 GLRHPFIVNHPKVGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNWCLADGYDLEILDGTRGTVDGPRNEL 800 810 820 830 840 850 670 680 690 700 710 720 pF1KB4 SRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFIKAGL ::. :. .. . :. : : . . . : :.: ::..:..:: . .. : CCDS30 SRVSKKNIFL----LFKKLCSFRYRRDLLRLS-YGEAKKAARDYETAKNYFKKGLKDMGY 860 870 880 890 900 910 730 740 pF1KB4 GAWVEKPTEQDQFSLTP : :. :: :. .: : : CCDS30 GNWISKPQEEKNFYLCPV 920 930 >>CCDS1071.1 ADAR gene_id:103|Hs108|chr1 (1226 aa) initn: 740 init1: 372 opt: 550 Z-score: 433.9 bits: 91.7 E(32554): 7.6e-18 Smith-Waterman score: 917; 31.8% identity (58.0% similar) in 707 aa overlap (79-741:615-1225) 50 60 70 80 90 100 pF1KB4 PGRKRPLEEGSNGHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQ-LNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAP : ..:.. .... . .. :::. ::.: : CCDS10 SHYSTEKESEKTAESQTPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHEP 590 600 610 620 630 640 110 120 130 140 150 160 pF1KB4 LFVMSVEVNGQVFEG-SGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFT : . : :..:.: . :.:.:: :: :::.:.... .:: : :. .: CCDS10 KFQYCVAVGAQTFPSVSAPSKKVAKQMAAEEAMKAL-----HGEA------TNSMASD-- 650 660 670 680 690 170 180 190 200 210 220 pF1KB4 SDQADFPDTLFNGFETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLS--LSASPVPASLAQPPLPV .: :. ... :. :. : : .. . :.: :...:: . : CCDS10 -NQ---PEGMIS--ESLDNLE------SMMPNKVRKIGELVRYLNTNPVGGLLE------ 700 710 720 730 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 LPPFPPPSGKNPVMILNELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEG-SGRNKKL . : .. ....:: : .::... : :..: . ...:: CCDS10 ---YARSHGFAA-----------EFKLVDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQ 740 750 760 770 290 300 310 pF1KB4 AKARAAQSALAAIFN-------------------------LHLDQTPSRQP--IPSEGLQ .: .::..:: .... : :...: :: .: : CCDS10 GKQEAADAALRVLIGENEKAERMGFTEVTPVTGASLRRTMLLLSRSPEAQPKTLPLTGST 780 790 800 810 820 830 320 330 340 350 360 370 pF1KB4 LHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTGTDVKDAKVI-SVSTGT .: : .. : :. ::..:. ::.::...: : .: :. :..::. CCDS10 FH------DQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLGRKILAAIIMKK--DSEDMGVVVSLGTGN 840 850 860 870 880 890 380 390 400 410 420 430 pF1KB4 KCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDDQKRSIFQKSERGGFR .:..:. .: .: ..:::::::::::...::::..: : :.. : :::. . .:: . CCDS10 RCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSELMKY--NSQTAKDSIFEPA-KGGEK 900 910 920 930 940 440 450 460 470 480 490 pF1KB4 L--KENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNHGSLQPRPPGLLSD : :..:.:::::::.::::. .:. :. ... CCDS10 LQIKKTVSFHLYISTAPCGDGALFDKS-----------------CSDRAME--------- 950 960 970 980 500 510 520 530 540 550 pF1KB4 PSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQTWDGVLQGERLLT :: . . :. ..:.. :.::::.:.:::::::.:. . ::::. :::: : CCDS10 -STESRH-----YPVFENPKQ---GKLRTKVENGEGTIPVESSDIVPTWDGIRLGERLRT 990 1000 1010 1020 1030 560 570 580 590 600 pF1KB4 MSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAMYQRI----SNIED ::::::: ::::.:.::.::. :..:::..:. :: :. ::.::. :. : .:: CCDS10 MSCSDKILRWNVLGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLGYLFSQGHLTRAICCRVTRDGSAFED 1040 1050 1060 1070 1080 1090 610 620 630 640 650 660 pF1KB4 -LPPLYTLNKPLLSGISNAEA-RQPGKAPNFSVNWTVGDSA-IEVINATTGKDELGRA-- : . .:.: .. .: .. :: ::. . :::: ..:. .:....: : . : CCDS10 GLRHPFIVNHPKVGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNWCLADGYDLEILDGTRGTVDGPRNEL 1100 1110 1120 1130 1140 1150 670 680 690 700 710 720 pF1KB4 SRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFIKAGL ::. :. .. . :. : : . . . : :.: ::..:..:: . .. : CCDS10 SRVSKKNIFL----LFKKLCSFRYRRDLLRLS-YGEAKKAARDYETAKNYFKKGLKDMGY 1160 1170 1180 1190 1200 730 740 pF1KB4 GAWVEKPTEQDQFSLTP : :. :: :. .: : : CCDS10 GNWISKPQEEKNFYLCPV 1210 1220 741 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 21:03:51 2016 done: Mon Nov 7 21:03:51 2016 Total Scan time: 4.360 Total Display time: 0.160 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]