FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4865, 923 aa 1>>>pF1KB4865 923 - 923 aa - 923 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7846+/-0.000929; mu= 18.0933+/- 0.056 mean_var=66.1850+/-13.451, 0's: 0 Z-trim(105.0): 134 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.157650 statistics sampled from 8073 (8211) to 8073 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16 Scan time: 3.690 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7177.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 923) 6380 1460.5 0 CCDS81448.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 906) 5639 1292.0 0 CCDS31180.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 644) 4428 1016.5 0 CCDS31179.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 609) 4065 933.9 0 CCDS46496.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 926) 2434 563.0 9.1e-160 CCDS2364.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 931) 2424 560.7 4.4e-159 CCDS46498.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 901) 2195 508.7 2.1e-143 CCDS2365.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 906) 2195 508.7 2.1e-143 CCDS46497.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 909) 2195 508.7 2.1e-143 CCDS46499.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 555) 1998 463.8 4.1e-130 CCDS5700.1 PCOLCE gene_id:5118|Hs108|chr7 ( 449) 546 133.5 8.7e-31 CCDS10347.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 ( 387) 541 132.4 1.7e-30 CCDS64195.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5 ( 470) 539 131.9 2.7e-30 CCDS4062.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5 ( 480) 539 131.9 2.8e-30 CCDS81918.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 ( 343) 528 129.4 1.2e-29 CCDS3811.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (1013) 475 117.5 1.3e-25 CCDS588.2 CDCP2 gene_id:200008|Hs108|chr1 ( 449) 397 99.6 1.4e-20 CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10 (3623) 407 102.2 1.9e-20 CCDS45345.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 ( 335) 381 95.9 1.3e-19 CCDS44026.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX ( 216) 356 90.2 4.5e-18 CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015) 358 90.9 1.4e-17 CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 730) 353 89.7 2.2e-17 CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 986) 353 89.7 2.9e-17 CCDS73251.1 OVCH2 gene_id:341277|Hs108|chr11 ( 565) 348 88.5 3.9e-17 CCDS35457.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX (2351) 356 90.5 4e-17 CCDS1281.1 F5 gene_id:2153|Hs108|chr1 (2224) 354 90.0 5.2e-17 CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1 ( 855) 334 85.4 5.1e-16 CCDS58460.1 NETO2 gene_id:81831|Hs108|chr16 ( 518) 327 83.7 9.8e-16 CCDS46878.1 DCBLD2 gene_id:131566|Hs108|chr3 ( 775) 327 83.8 1.4e-15 CCDS5476.1 AEBP1 gene_id:165|Hs108|chr7 (1158) 328 84.1 1.7e-15 CCDS42444.1 NETO1 gene_id:81832|Hs108|chr18 ( 156) 305 78.6 1e-14 CCDS12000.1 NETO1 gene_id:81832|Hs108|chr18 ( 533) 308 79.4 2e-14 CCDS10727.1 NETO2 gene_id:81831|Hs108|chr16 ( 525) 305 78.7 3.2e-14 CCDS34522.1 DCBLD1 gene_id:285761|Hs108|chr6 ( 539) 286 74.4 6.5e-13 CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10 ( 756) 281 73.3 1.9e-12 CCDS75419.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 767) 280 73.1 2.3e-12 CCDS47417.1 MDGA1 gene_id:266727|Hs108|chr6 ( 955) 281 73.3 2.4e-12 CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 876) 280 73.1 2.6e-12 CCDS56411.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 894) 280 73.1 2.7e-12 CCDS34385.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 913) 280 73.1 2.7e-12 CCDS47396.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 919) 280 73.1 2.7e-12 CCDS5889.1 CNTNAP2 gene_id:26047|Hs108|chr7 (1331) 281 73.4 3.3e-12 CCDS7010.1 MAMDC4 gene_id:158056|Hs108|chr9 (1137) 280 73.1 3.3e-12 CCDS41948.1 MDGA2 gene_id:161357|Hs108|chr14 ( 727) 277 72.4 3.5e-12 CCDS45098.3 MDGA2 gene_id:161357|Hs108|chr14 ( 956) 277 72.4 4.5e-12 CCDS3127.1 PCOLCE2 gene_id:26577|Hs108|chr3 ( 415) 270 70.7 6.4e-12 CCDS2193.1 TNFAIP6 gene_id:7130|Hs108|chr2 ( 277) 260 68.4 2.1e-11 CCDS12604.2 MEGF8 gene_id:1954|Hs108|chr19 (2778) 264 69.6 9.3e-11 CCDS62693.1 MEGF8 gene_id:1954|Hs108|chr19 (2845) 264 69.6 9.5e-11 >>CCDS7177.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 (923 aa) initn: 6380 init1: 6380 opt: 6380 Z-score: 7832.2 bits: 1460.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6380; 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CCDS46 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB4 A-PKMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFPDVGPHIGRYCGQKTPGRIR : ::: ::::.: :::: : : :.:: :.::::.: ::: ::.::: :::...: CCDS46 AKPKM-EIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB4 SSSGILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSDQITASSQY ::.::::..:.:: :.::.:::: : .... :.:.: ::::::.: ..::.::: : CCDS46 SSTGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB4 STN-WSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKETKKKYYVK : . :. ..:::. .:::::. :: .:..:::: .: ..::..::::::.::.. :::: CCDS46 SDGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVK 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB4 TYKIDVSSNGEDWITIKEGNKPVLFQGNTNPTDVVVAVFPKPLITRFVRIKPATWETGIS .::..::.:::::.. ..:.. .::.:.. :.::. . ::.::::::.: ::..::. 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CCDS23 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB4 A-PKMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFPDVGPHIGRYCGQKTPGRIR : ::: ::::.: :::: : : :.:: :.::::.: ::: ::.::: :::...: CCDS23 AKPKM-EIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB4 SSSGILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSDQITASSQY ::.::::..:.:: :.::.:::: : .... :.:.: ::::::.: ..::.::: : CCDS23 SSTGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB4 STN-WSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKETKKKYYVK : . :. ..:::. .:::::. :: .:..:::: .: ..::..::::::.::.. :::: CCDS23 SDGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVK 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB4 TYKIDVSSNGEDWITIKEGNKPVLFQGNTNPTDVVVAVFPKPLITRFVRIKPATWETGIS .::..::.:::::.. ..:.. .::.:.. :.::. . ::.::::::.: ::..::. CCDS23 SYKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB4 MRFEVYGCKITDYPCSGMLGMVSGLISDSQITSSNQGDRNWMPENIRLVTSRSGWALPPA .:.:..::..:: :::.::::.::::.::::..:. . : : :::.::::: .: CCDS23 LRLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGW-FPRI 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 PHSYINE-WLQIDLGEEKIVRGIIIQGGKHR------ENKVFMRKFKIGYSNNGSDWKMI :.. .: :::.::: : :.:.::::.. : ..:.::::..:: ::.::..: CCDS23 PQAQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYI 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KB4 MDDSKRKAKSFEGNNNYDTPELRTFPALSTRFIRIYPERATHGGLGLRMELLGCEVE--A .: .. : :::: .::::..: : . ....:.:::: . .:.:.:.:.:::. CCDS23 QDPRTQQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPIPAQYVRVYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSK 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KB4 PTA---GPTTPNGNLVDECDDDQANCHSGTGDDFQLTGGTTVLATEKPTVIDSTIQSEFP ::. :::. . . . .. . : . .:. :. .: .: CCDS23 PTVETLGPTVKSEETTTPYPTEEEATECGENCSFED---------------DKDLQ--LP 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KB4 TYGFNCEFGWGSHKTFCHWEHDNHVQLKWSVLTSKTGPIQDHT--GDGNFIYSQADENQK . ::::.: . . : : .: :.. .. .:...: .:.: : ::. :.: ... CCDS23 S-GFNCNFDFLEEP--CGWMYD-HAKWLRTTWASSSSP-NDRTFPDDRNFLRLQSDSQRE 650 660 670 680 690 710 720 730 740 750 760 pF1KB4 GKVARLVSPVVYSQNSAHCMTFWYHMSGSHVGTLRVKLRYQKPEEYDQLVWMAIGHQGDH :. :::.:: :. : :: : :. .:.. .:.: .: . : ..:.:. :: . CCDS23 GQYARLISPPVHLPRSPVCMEFQYQATGGRGVALQV-VREASQE--SKLLWVIREDQGGE 700 710 720 730 740 750 770 780 790 800 810 820 pF1KB4 WKEGRVLLHKSLKLYQVIFEGEIGKGNLGGIAVDDISINNHISQEDCAKPAD-LDKKNPE ::.::..: . ::..::: :::: : ::.::: :.. . :.: .: . . .: . 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CCDS46 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB4 A-PKMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFPDVGPHIGRYCGQKTPGRIR : ::: ::::.: :::: : : :.:: :.::::.: ::: ::.::: :::...: CCDS46 AKPKM-EIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB4 SSSGILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSDQITASSQY ::.::::..:.:: :.::.:::: : .... :.:.: ::::::.: ..::.::: : CCDS46 SSTGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB4 STN-WSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKETKKKYYVK : . :. ..:::. .:::::. :: .:..:::: .: ..::..::::::.::.. :::: CCDS46 SDGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVK 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB4 TYKIDVSSNGEDWITIKEGNKPVLFQGNTNPTDVVVAVFPKPLITRFVRIKPATWETGIS .::..::.:::::.. ..:.. .::.:.. :.::. . ::.::::::.: ::..::. 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CCDS23 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB4 APDPYQRIMINFNPHFDLEDRDCKYDYVEVFDGENENGHFRGKFCGKIAPPPVVSSGPFL ::.: :.:..::::::..: .:::::..:. ::..:.. . :: ::.:::: ..::: .: CCDS23 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB4 FIKFVSDYETHGAGFSIRYEIFKRGPE-CSQNYTTPSGVIKSPGFPEKYPNSLECTYIVF .:::.::: .:::::.:::::: : : ::.:.:.:.:.:.:::::::::..:.::. .. 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