Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4875
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4875, 1042 aa
1>>>pF1KB4875 1042 - 1042 aa - 1042 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1379+/-0.000776; mu= 10.4353+/- 0.047
mean_var=165.6423+/-33.110, 0's: 0 Z-trim(113.7): 23 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.099653
statistics sampled from 14271 (14294) to 14271 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.439), width: 16
Scan time: 5.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8108.1 SIPA1 gene_id:6494|Hs108|chr11 (1042) 6961 1013.2 0
CCDS61491.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1782) 1593 241.6 1.1e-62
CCDS61490.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1783) 1593 241.6 1.1e-62
CCDS9807.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1804) 1593 241.6 1.1e-62
CCDS41474.1 SIPA1L2 gene_id:57568|Hs108|chr1 (1722) 1561 237.0 2.6e-61
CCDS33007.1 SIPA1L3 gene_id:23094|Hs108|chr19 (1781) 1524 231.7 1.1e-59
CCDS69663.1 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 ( 991) 688 111.3 1e-23
CCDS6869.2 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 (1013) 688 111.3 1e-23
CCDS82035.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 711) 664 107.8 8.5e-23
CCDS45574.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 715) 664 107.8 8.6e-23
CCDS45573.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 730) 664 107.8 8.7e-23
CCDS218.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 663) 636 103.8 1.3e-21
CCDS53276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 681) 636 103.8 1.3e-21
CCDS53277.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 727) 636 103.8 1.4e-21
CCDS81276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 748) 636 103.8 1.5e-21
>>CCDS8108.1 SIPA1 gene_id:6494|Hs108|chr11 (1042 aa)
initn: 6961 init1: 6961 opt: 6961 Z-score: 5413.0 bits: 1013.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6961; 100.0% identity (100.0% similar) in 1042 aa overlap (1-1042:1-1042)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MPMWAGGVGSPRRGMAPASTDDLFARKLRQPARPPLTPHTFEPRPVRGPLLRSGSDAGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MPMWAGGVGSPRRGMAPASTDDLFARKLRQPARPPLTPHTFEPRPVRGPLLRSGSDAGEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 RPPTPASPRARAHSHEEASRPAATSTRLFTDPLALLGLPAEEPEPAFPPVLEPRWFAHYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RPPTPASPRARAHSHEEASRPAATSTRLFTDPLALLGLPAEEPEPAFPPVLEPRWFAHYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VQSLLFDWAPRSQGMGSHSEASSGTLASAEDQAASSDLLHGAPGFVCELGGEGELGLGGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VQSLLFDWAPRSQGMGSHSEASSGTLASAEDQAASSDLLHGAPGFVCELGGEGELGLGGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 ASPPVPPALPNAAVSILEEPQNRTSAYSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFFGMDESLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ASPPVPPALPNAAVSILEEPQNRTSAYSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFFGMDESLGP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 VAVSLRREEKEGSGGGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTISEDALPPGPPRGLSPRKLLEHVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VAVSLRREEKEGSGGGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTISEDALPPGPPRGLSPRKLLEHVA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 PQLSPSCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYNNQEAGPAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PQLSPSCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYNNQEAGPAF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 MQFLTLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPNNQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MQFLTLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPNNQQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 QLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHTPCTPHTTYRVAVSRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHTPCTPHTTYRVAVSRT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QDTPAFGPALPAGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QDTPAFGPALPAGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQDLA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 TNEVTTTSLDSASRFGLPSLGGRRRAAPRGPGAELQAAGSLVWGVRAAPGARVAAGAQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TNEVTTTSLDSASRFGLPSLGGRRRAAPRGPGAELQAAGSLVWGVRAAPGARVAAGAQAS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GPEGIEVPCLLGISAEALVLVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEQQLDLYHGRGEAITLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GPEGIEVPCLLGISAEALVLVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEQQLDLYHGRGEAITLR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 FDGSPGQAVGEVVARLQLVSRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFVTHVERFTFAETA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FDGSPGQAVGEVVARLQLVSRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFVTHVERFTFAETA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 GLRPGARLLRVCGQTLPSLRPEAAAQLLRSAPKVCVTVLPPDESGRPRRSFSELYTLSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GLRPGARLLRVCGQTLPSLRPEAAAQLLRSAPKVCVTVLPPDESGRPRRSFSELYTLSLQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 EPSRRGAPDPVQDEVQGVTLLPTTKQLLHLCLQDGGSPPGPGDLAEERTEFLHSQNSLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EPSRRGAPDPVQDEVQGVTLLPTTKQLLHLCLQDGGSPPGPGDLAEERTEFLHSQNSLSP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 RSSLSDEAPVLPNTTPDLLLATTAKPSVPSADSETPLTQDRPGSPSGSEDKGNPAPELRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RSSLSDEAPVLPNTTPDLLLATTAKPSVPSADSETPLTQDRPGSPSGSEDKGNPAPELRA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 SFLPRTLSLRNSISRIMSEAGSGTLEDEWQAISEIASTCNTILESLSREGQPIPESGDPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SFLPRTLSLRNSISRIMSEAGSGTLEDEWQAISEIASTCNTILESLSREGQPIPESGDPK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 GTPKSDAEPEPGNLSEKVSHLESMLRKLQEDLQKEKADRAALEEEVRSLRHNNRRLQAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GTPKSDAEPEPGNLSEKVSHLESMLRKLQEDLQKEKADRAALEEEVRSLRHNNRRLQAES
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040
pF1KB4 ESAATRLLLASKQLGSPTADLA
::::::::::::::::::::::
CCDS81 ESAATRLLLASKQLGSPTADLA
1030 1040
>>CCDS61491.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1782 aa)
initn: 2043 init1: 1046 opt: 1593 Z-score: 1238.7 bits: 241.6 E(32554): 1.1e-62
Smith-Waterman score: 2174; 42.3% identity (64.8% similar) in 962 aa overlap (98-961:313-1237)
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 PRARAHSHEEASRPAATSTRLFTDPLALLGLPAEEPEPAFPPVLEPRWFAHYDVQSLLFD
: .. : . : :. ::::::::.:::
CCDS61 KRRSKSETGDSSIFRKLRNAKGEELGKSSDLEDNRSEDSVRPWTCPKCFAHYDVQSILFD
290 300 310 320 330 340
130 140 150
pF1KB4 WAP-----------RSQGMG--------------SHSEASSGTLASAEDQAA--------
:. : ::: . :. ..:.:: .
CCDS61 LNEAIMNRHNVIKRRNTTTGASAAAVASLVSGPLSHSASFSSPMGSTEDLNSKGSLSMDQ
350 360 370 380 390 400
160 170 180 190
pF1KB4 ----SSDLLHGAPGFVCELGGEGEL----------GLGGPASPPVPPALP----NAAVSI
:..:. . : : :.::::: ...: : .: ::.:..
CCDS61 GDDKSNELVMSCPYFRNEIGGEGERKISLSKSNSGSFSGCESASFESTLSSHCTNAGVAV
410 420 430 440 450 460
200 210 220 230 240
pF1KB4 LEEPQ-------NRTSAYSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFFGMDESLGPVAVSLRREE
:: :. .:.. : .::.:::: ::::.:: ::: :.:: ::.:::::::.:::.
CCDS61 LEVPKENLVLHLDRVKRYIVEHVDLGAYYYRKFFYQKEHWNYFGADENLGPVAVSIRREK
470 480 490 500 510 520
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 K-EGSGGGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTISEDALPP----GPPRGLSPRKLLEHVAPQLS
: . .:. ..::.: ::..: ::::.. :::.: . ::: ...::::.:.:.
CCDS61 PDEMKENGSPYNYRIIFRTSELMTLRGSVLEDAIPSTAKHSTARGLPLKEVLEHVVPELN
530 540 550 560 570 580
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 PSCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYNNQEAGPAFMQFL
.::::. .::: . :. :::: :..:.::::.::.:::..:::::::. ::::: .::
CCDS61 VQCLRLAFNTPKVTEQLMKLDEQGLNYQQKVGIMYCKAGQSTEEEMYNNESAGPAFEEFL
590 600 610 620 630 640
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 TLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPNNQQQLLR
:::. :::::::.:::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::.:::::
CCDS61 QLLGERVRLKGFEKYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYKDYEIMFHVSTMLPYTPNNKQQLLR
650 660 670 680 690 700
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 KRHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHTPCTPHTTYRVAVSRTQDTP
:::::::::::::::::..:: : .:::::::::..::.:.::. . : :::.:..:.:
CCDS61 KRHIGNDIVTIVFQEPGAQPFSPKNIRSHFQHVFVIVRVHNPCSDSVCYSVAVTRSRDVP
710 720 730 740 750 760
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 AFGPALPAGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQDLATNEV
.::: .: : : . :: :::::..:.:.:: ....:.::::::::.::.::: ..:
CCDS61 SFGPPIPKGV-TFPKSNVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATRTRQEYLKDLAEKNV
770 780 790 800 810 820
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 TTTSLDSASRFGLPSLGGRRRAAPRG-PGAELQAAGSLVWGVRAAPGARVAAGAQASGPE
:.: .: ...: . ::..... . :::::.. :..::.::: ..
CCDS61 TNTPIDPSGKFPFISLASKKKEKSKPYPGAELSSMGAIVWAVRAEDYNKA----------
830 840 850 860 870
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GIEVPCLLGISAEALVLVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEQQLDLYHGRGEAITLRFDG
.:. :::::: : .::. . :::::.::::..:: .. .: ... ::: ... :
CCDS61 -MELDCLLGISNEFIVLIEQETKSVVFNCSCRDVIGWTSTDTSLKIFYERGECVSV---G
880 890 900 910 920
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 S--PGQAVGEVVARLQLVSRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFVTHVERFTFAETAG
: . . :.: :::.::.:::. :..: :.: :.:::.:. ::.:. :: . .: ::
CCDS61 SFINIEEIKEIVKRLQFVSKGCESVEMTLRRNGLGQLGFHVNYEGIVADVEPYGYAWQAG
930 940 950 960 970 980
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 LRPGARLLRVCGQTLPSLRPEAAAQLLRSAPKVCVTVLPPDESGRPRRSFSELYTLSLQE
:: :.::...: .. .: : .:::.. : :...:: .. :::: :: : . ..:
CCDS61 LRQGSRLVEICKVAVATLSHEQMIDLLRTSVTVKVVIIPPHDDCTPRRSCSETYRMPVME
990 1000 1010 1020 1030 1040
790 800 810 820
pF1KB4 -------------P-------SRRGAPDPVQDEVQGVTLLPTTKQLLHLCLQDGGSPPGP
: .: .. : . .: . . : :..: . :: :: :
CCDS61 YKMNEGVSYEFKFPFRNNNKWQRNASKGPHSPQVPSQVQSPMTSRL-NAGKGDGKMPP-P
1050 1060 1070 1080 1090 1100
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 GDLAEERTEFLHSQNSLSPRSSLSDEAPVLPNTTPDLLLATTAKPSVPSADSETPLTQDR
::. . ::: :: :. .: . .:.. :. : :. ..
CCDS61 -----ERAANI-------PRSISSDGRPLERRLSPGSDIYVTVS-SMALARSQC---RNS
1110 1120 1130 1140
890 900 910 920 930
pF1KB4 PGSPSGSEDKGNPAPELRASFLPRTL--SLRN--SISRIMSEA---GSGTLEDEWQ----
:.. :.: : :. . : . .:. . : :. ::.: ... ::: ::
CCDS61 PSNLSSSSDTGSVGGTYRQKSMPEGFGVSRRSPASIDRQNTQSDIGGSGKSTPSWQRSED
1150 1160 1170 1180 1190 1200
940 950 960 970 980
pF1KB4 -AISEIASTCNTILESLSREGQPIPESGDPKGTPKSDAEPEPGNLSEKVSHLESMLRKLQ
... ::. : ..:. . :: :.:
CCDS61 SIADQMEPTCH--LPAVSKVLPAFRES--PSGRLMRQDPVVHLSPNKQGHSDSHYSSHSS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB4 EDLQKEKADRAALEEEVRSLRHNNRRLQAESESAATRLLLASKQLGSPTADLA
CCDS61 SNTLSSNASSAHSDEKWYDGDRTESELNSYNYLQGTSADSGIDTTSYGPSHGSTASLGAA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
>>CCDS61490.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1783 aa)
initn: 2043 init1: 1046 opt: 1593 Z-score: 1238.7 bits: 241.6 E(32554): 1.1e-62
Smith-Waterman score: 2174; 42.3% identity (64.8% similar) in 962 aa overlap (98-961:313-1237)
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 PRARAHSHEEASRPAATSTRLFTDPLALLGLPAEEPEPAFPPVLEPRWFAHYDVQSLLFD
: .. : . : :. ::::::::.:::
CCDS61 KRRSKSETGDSSIFRKLRNAKGEELGKSSDLEDNRSEDSVRPWTCPKCFAHYDVQSILFD
290 300 310 320 330 340
130 140 150
pF1KB4 WAP-----------RSQGMG--------------SHSEASSGTLASAEDQAA--------
:. : ::: . :. ..:.:: .
CCDS61 LNEAIMNRHNVIKRRNTTTGASAAAVASLVSGPLSHSASFSSPMGSTEDLNSKGSLSMDQ
350 360 370 380 390 400
160 170 180 190
pF1KB4 ----SSDLLHGAPGFVCELGGEGEL----------GLGGPASPPVPPALP----NAAVSI
:..:. . : : :.::::: ...: : .: ::.:..
CCDS61 GDDKSNELVMSCPYFRNEIGGEGERKISLSKSNSGSFSGCESASFESTLSSHCTNAGVAV
410 420 430 440 450 460
200 210 220 230 240
pF1KB4 LEEPQ-------NRTSAYSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFFGMDESLGPVAVSLRREE
:: :. .:.. : .::.:::: ::::.:: ::: :.:: ::.:::::::.:::.
CCDS61 LEVPKENLVLHLDRVKRYIVEHVDLGAYYYRKFFYQKEHWNYFGADENLGPVAVSIRREK
470 480 490 500 510 520
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 K-EGSGGGTLHSYRVIVRTTQLRTLRGTISEDALPP----GPPRGLSPRKLLEHVAPQLS
: . .:. ..::.: ::..: ::::.. :::.: . ::: ...::::.:.:.
CCDS61 PDEMKENGSPYNYRIIFRTSELMTLRGSVLEDAIPSTAKHSTARGLPLKEVLEHVVPELN
530 540 550 560 570 580
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 PSCLRLGSASPKVPRTLLTLDEQVLSFQRKVGILYCRAGQGSEEEMYNNQEAGPAFMQFL
.::::. .::: . :. :::: :..:.::::.::.:::..:::::::. ::::: .::
CCDS61 VQCLRLAFNTPKVTEQLMKLDEQGLNYQQKVGIMYCKAGQSTEEEMYNNESAGPAFEEFL
590 600 610 620 630 640
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 TLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPNNQQQLLR
:::. :::::::.:::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::.:::::
CCDS61 QLLGERVRLKGFEKYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYKDYEIMFHVSTMLPYTPNNKQQLLR
650 660 670 680 690 700
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 KRHIGNDIVTIVFQEPGSKPFCPTTIRSHFQHVFLVVRAHTPCTPHTTYRVAVSRTQDTP
:::::::::::::::::..:: : .:::::::::..::.:.::. . : :::.:..:.:
CCDS61 KRHIGNDIVTIVFQEPGAQPFSPKNIRSHFQHVFVIVRVHNPCSDSVCYSVAVTRSRDVP
710 720 730 740 750 760
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 AFGPALPAGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQDLATNEV
.::: .: : : . :: :::::..:.:.:: ....:.::::::::.::.::: ..:
CCDS61 SFGPPIPKGV-TFPKSNVFRDFLLAKVINAENAAHKSEKFRAMATRTRQEYLKDLAEKNV
770 780 790 800 810 820
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 TTTSLDSASRFGLPSLGGRRRAAPRG-PGAELQAAGSLVWGVRAAPGARVAAGAQASGPE
:.: .: ...: . ::..... . :::::.. :..::.::: ..
CCDS61 TNTPIDPSGKFPFISLASKKKEKSKPYPGAELSSMGAIVWAVRAEDYNKA----------
830 840 850 860 870
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GIEVPCLLGISAEALVLVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEQQLDLYHGRGEAITLRFDG
.:. :::::: : .::. . :::::.::::..:: .. .: ... ::: ... :
CCDS61 -MELDCLLGISNEFIVLIEQETKSVVFNCSCRDVIGWTSTDTSLKIFYERGECVSV---G
880 890 900 910 920
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pF1KB4 S--PGQAVGEVVARLQLVSRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFVTHVERFTFAETAG
: . . :.: :::.::.:::. :..: :.: :.:::.:. ::.:. :: . .: ::
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:: :.::...: .. .: : .:::.. : :...:: .. :::: :: : . ..:
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::. . ::: :: :. .: . .:.. :. : :. ..
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:.. :.: : :. . : . .:. . : :. ::.: ... ::: ::
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... ::. : ..:. . :: :.:
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: . .:. ..::.: ::..: ::::.. :::.: . ::: ...::::.:.:.
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:: :::::..:.:.:: ....:.::::::::.::.::: : :::...:.. .:.. .::
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.... . :: :.: . :...: : : .. : .. :::::: : ..
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: .:: :: .: .. : .:.: ..:: .. :: : . .
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pF1KB4 LRASFLPRTLSLRNSISRIMSE------AGSGTLEDEWQAISEIAS-TCNTILESLSREG
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CCDS41 MEASRHPET-KWHGPPSKVLGSYKERALQKDGSCKDSPNKLSHIGDKSCSSHSSSNTLSS
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pF1KB4 QPIPESGDPKGTPKSDAEPEPGNLSEKVSHLESMLRKLQEDLQKEKADRAALEEEVRSLR
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CCDS41 NTSSNSDDKHFGSGDLMDPELLGLTYIKGASTDSGIDTAPCMPATILGPVHLAGSRSLIH
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pF1KB4 RARAHSHEEASRPAATSTRLFTDPLALLGLPAEEPEPAFPPVLEPRW-----FAHYDVQS
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CCDS33 ARGLGGGDTVDSSIFRKLRSSKPEGEAGRSPGEADEGRSPPEASRPWVCQKSFAHFDVQS
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pF1KB4 LLFDW----APR---SQGMGSHSEASSGTLASA----------------------ED---
.::: : : :: .. . ::... ::: ::
CCDS33 MLFDLNEAAANRVSVSQRRNTTTGASAASAASAMASLTASRAHSLGGLDPAFTSTEDLNC
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pF1KB4 ---------QAASSDLLHGAPGFVCELGGEGE-------LGLGGPASPP---VPPALP--
. :.::: . : : :.::: : ..:.:.: . :::
CCDS33 KENLEQDLGDDNSNDLLLSCPHFRNEIGGECERNVSFSRASVGSPSSGEGHLAEPALSAY
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pF1KB4 --NAAVSILEEP------QNRTSAYSLEHADLGAGYYRKYFYGKEHQNFFGMDESLGPVA
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CCDS33 RTNASISVLEVPKEQQRTQSRPRQYSIEHVDLGARYYQDYFVGKEHANYFGVDEKLGPVA
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CCDS33 VSIKREKLEDHKEHGPQYQYRIIFRTRELITLRGSILEDATPTATKHGTGRGLPLKDALE
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CCDS33 YVIPELNIHCLRLALNTPKVTEQLLKLDEQGLCRKHKVGILYCKAGQSSEEEMYNNEEAG
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pF1KB4 PAFMQFLTLLGDVVRLKGFESYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYQDHEIMFHVSTMLPYTPN
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CCDS33 PAFEEFLSLIGEKVCLKGFTKYAAQLDVKTDSTGTHSLYTMYQDYEIMFHVSTLLPYTPN
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CCDS33 NRQQLLRKRHIGNDIVTIIFQEPGALPFTPKNIRSHFQHVFIIVRVHNPCTDNVCYSMAV
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pF1KB4 SRTQDTPAFGPALPAGGGPFAANADFRAFLLAKALNGEQAAGHARQFHAMATRTRQQYLQ
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CCDS33 TRSKDAPPFGPPIPSGT-TFRKSDVFRDFLLAKVINAENAAHKSDKFHTMATRTRQEYLK
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CCDS33 DLAENCVSNTPIDSTGKFNLISLTSKKKEKTKARAGAEQHSAGAIAW--------RVVAQ
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pF1KB4 AQASGPEGIEVPCLLGISAEALVLVAPRDGRVVFNCACRDVLAWTFSEQQLDLYHGRGEA
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CCDS33 DYA---QGVEIDCILGISNEFVVLLDLRTKEVVFNCYCGDVIGWTPDSSTLKIFYGRGDH
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pF1KB4 ITLRFDGSPGQAVGEVVARLQLVSRGCETRELALPRDGQGRLGFEVDAEGFVTHVERFTF
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CCDS33 IFLQATEGSVEDIREIVQRLKVMTSGWETVDMTLRRNGLGQLGFHVKYDGTVAEVEDYGF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]