FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4875, 1042 aa 1>>>pF1KB4875 1042 - 1042 aa - 1042 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6514+/-0.000325; mu= 7.3766+/- 0.020 mean_var=184.7961+/-37.806, 0's: 0 Z-trim(121.3): 71 B-trim: 432 in 1/59 Lambda= 0.094347 statistics sampled from 37681 (37752) to 37681 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.741), E-opt: 0.2 (0.443), width: 16 Scan time: 15.680 The best scores are: opt bits E(85289) XP_011543516 (OMIM: 602180) PREDICTED: signal-indu (1042) 6961 960.4 0 NP_694985 (OMIM: 602180) signal-induced proliferat (1042) 6961 960.4 0 XP_005274246 (OMIM: 602180) PREDICTED: signal-indu (1042) 6961 960.4 0 NP_006738 (OMIM: 602180) signal-induced proliferat (1042) 6961 960.4 0 XP_016857387 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1704) 1561 225.5 2e-57 XP_016857386 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1704) 1561 225.5 2e-57 XP_011542545 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1722) 1561 225.5 2e-57 XP_005273269 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1722) 1561 225.5 2e-57 XP_005273270 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1722) 1561 225.5 2e-57 NP_065859 (OMIM: 611609) signal-induced proliferat (1722) 1561 225.5 2e-57 XP_005273268 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1722) 1561 225.5 2e-57 XP_016857385 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1722) 1561 225.5 2e-57 XP_016882007 (OMIM: 616655,616851) PREDICTED: sign (1780) 1524 220.5 6.9e-56 XP_016882006 (OMIM: 616655,616851) PREDICTED: sign (1781) 1524 220.5 6.9e-56 XP_011524959 (OMIM: 616655,616851) PREDICTED: sign (1781) 1524 220.5 6.9e-56 NP_055888 (OMIM: 616655,616851) signal-induced pro (1781) 1524 220.5 6.9e-56 XP_005258728 (OMIM: 616655,616851) PREDICTED: sign (1781) 1524 220.5 6.9e-56 XP_016857466 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 617) 636 99.3 7e-20 XP_016857480 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 625) 636 99.3 7.1e-20 XP_016857465 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 625) 636 99.3 7.1e-20 XP_016857463 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 651) 636 99.3 7.3e-20 XP_016857464 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 655) 636 99.3 7.4e-20 XP_016857478 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 655) 636 99.3 7.4e-20 XP_016857461 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 655) 636 99.3 7.4e-20 XP_016857479 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 655) 636 99.3 7.4e-20 XP_016857477 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 663) 636 99.3 7.4e-20 XP_016857475 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 663) 636 99.3 7.4e-20 NP_002876 (OMIM: 600278) rap1 GTPase-activating pr ( 663) 636 99.3 7.4e-20 XP_016857462 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 663) 636 99.3 7.4e-20 XP_016857476 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 663) 636 99.3 7.4e-20 XP_016857474 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 681) 636 99.3 7.6e-20 XP_016857459 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 681) 636 99.3 7.6e-20 NP_001139129 (OMIM: 600278) rap1 GTPase-activating ( 681) 636 99.3 7.6e-20 XP_016857473 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 681) 636 99.3 7.6e-20 XP_005246012 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 681) 636 99.3 7.6e-20 XP_016857471 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 689) 636 99.3 7.7e-20 XP_016857470 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 689) 636 99.3 7.7e-20 XP_016857458 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 689) 636 99.3 7.7e-20 XP_016857457 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 689) 636 99.3 7.7e-20 XP_016857472 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 689) 636 99.3 7.7e-20 XP_016857456 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 710) 636 99.3 7.9e-20 XP_016857469 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 719) 636 99.3 8e-20 NP_001139130 (OMIM: 600278) rap1 GTPase-activating ( 727) 636 99.3 8e-20 XP_006710868 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 740) 636 99.3 8.1e-20 XP_016857455 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 740) 636 99.3 8.1e-20 XP_016857468 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 740) 636 99.3 8.1e-20 XP_006710867 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 748) 636 99.4 8.2e-20 NP_001317312 (OMIM: 600278) rap1 GTPase-activating ( 748) 636 99.4 8.2e-20 XP_016857454 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 748) 636 99.4 8.2e-20 XP_016857460 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 804) 636 99.4 8.7e-20 >>XP_011543516 (OMIM: 602180) PREDICTED: signal-induced (1042 aa) initn: 6961 init1: 6961 opt: 6961 Z-score: 5127.4 bits: 960.4 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6961; 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