Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4900
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4900, 542 aa
1>>>pF1KB4900 542 - 542 aa - 542 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9895+/-0.00122; mu= 19.9419+/- 0.073
mean_var=58.6043+/-11.752, 0's: 0 Z-trim(99.5): 35 B-trim: 0 in 0/47
Lambda= 0.167537
statistics sampled from 5732 (5754) to 5732 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.509), E-opt: 0.2 (0.177), width: 16
Scan time: 2.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3919.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 542) 3412 833.8 0
CCDS78004.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 496) 2763 676.9 1.5e-194
CCDS54844.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 497) 2707 663.4 1.8e-190
CCDS6452.1 SLC1A1 gene_id:6505|Hs108|chr9 ( 524) 1702 420.5 2.5e-117
CCDS55756.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 ( 565) 1664 411.3 1.5e-114
CCDS31459.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 ( 574) 1664 411.3 1.6e-114
CCDS78003.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 430) 1605 397.0 2.4e-110
CCDS12321.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 ( 564) 1513 374.8 1.5e-103
CCDS72796.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 472) 1226 305.4 9.8e-83
CCDS574.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 560) 1220 304.0 3.1e-82
CCDS1879.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 ( 532) 1041 260.7 3.1e-69
CCDS12692.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 541) 1021 255.9 9.1e-68
CCDS46125.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 339) 1015 254.3 1.7e-67
CCDS46126.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 313) 987 247.5 1.7e-65
CCDS62578.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 ( 312) 860 216.8 3e-56
CCDS72797.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 619) 743 188.7 1.7e-47
CCDS54362.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 ( 234) 627 160.4 2.1e-39
CCDS72798.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 158) 467 121.7 6.6e-28
>>CCDS3919.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (542 aa)
initn: 3412 init1: 3412 opt: 3412 Z-score: 4453.4 bits: 833.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3412; 100.0% identity (100.0% similar) in 542 aa overlap (1-542:1-542)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTKSNGEEPKMGGRMERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MTKSNGEEPKMGGRMERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GTILGFTLRPYRMSYREVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 GTILGFTLRPYRMSYREVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 MRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGTKENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGTKENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 NLVEACFKQFKTNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVPVPGSVNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 NLVEACFKQFKTNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVPVPGSVNG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 VNALGLVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 VNALGLVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 IVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 GTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 GTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 LNFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LNFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 TTNVLGDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 TTNVLGDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSET
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 KM
::
CCDS39 KM
>>CCDS78004.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (496 aa)
initn: 2763 init1: 2763 opt: 2763 Z-score: 3606.3 bits: 676.9 E(32554): 1.5e-194
Smith-Waterman score: 3017; 91.5% identity (91.5% similar) in 542 aa overlap (1-542:1-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTKSNGEEPKMGGRMERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MTKSNGEEPKMGGRMERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GTILGFTLRPYRMSYREVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMG
: :::::::::::::
CCDS78 G----------------------------------------------MAALDSKASGKMG
70
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 MRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGTKENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGTKENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPP
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 NLVEACFKQFKTNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVPVPGSVNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NLVEACFKQFKTNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVPVPGSVNG
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 VNALGLVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VNALGLVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGK
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITAL
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 GTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFE
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 LNFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LNFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRT
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 TTNVLGDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TTNVLGDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSET
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 KM
::
CCDS78 KM
>>CCDS54844.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (497 aa)
initn: 3120 init1: 2707 opt: 2707 Z-score: 3533.1 bits: 663.4 E(32554): 1.8e-190
Smith-Waterman score: 3033; 91.5% identity (91.5% similar) in 542 aa overlap (1-542:1-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTKSNGEEPKMGGRMERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MTKSNGEEPKMGGRMERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GTILGFTLRPYRMSYREVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GTILGFTLRPYRMSYREVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 MRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGTKENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGTKENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 NLVEACFKQFKTNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVPVPGSVNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NLVEACFKQFKTNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVPVPGSVNG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 VNALGLVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VNALGLVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 GTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 LNFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRT
::::::::: :::::
CCDS54 LNFGQIITIR---------------------------------------------DRLRT
430
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 TTNVLGDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TTNVLGDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSET
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 KM
::
CCDS54 KM
>>CCDS6452.1 SLC1A1 gene_id:6505|Hs108|chr9 (524 aa)
initn: 1656 init1: 916 opt: 1702 Z-score: 2219.9 bits: 420.5 E(32554): 2.5e-117
Smith-Waterman score: 1702; 55.2% identity (82.2% similar) in 493 aa overlap (45-534:14-501)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 MERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLL-TVTAVIVGTILGFTLRPYR-
...: .::: ::.::..: : .: .
CCDS64 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSN
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 MSYREVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTI
.: : ::.::::.:::::....:::::::..::.:::::..:::.:.::::::. ::.
CCDS64 LSTLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTL
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 IAVVIGIIIVIIIHPGKGTKEN-MHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEACFKQFK
:::..::..:. :.:: : . . : :. .:...::.::::::::: :::.:::.:.:
CCDS64 IAVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYK
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 TNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVPVPGSVNGVNALGLVVFSM
:. :. : : . . ... .. : . . .. :.: : .:.:.:::.:: .
CCDS64 TKREE--VKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNK-TKEYKIVGMYSDGINVLGLIVFCL
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 CFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEMEDMGVIG
::.:::.: :.:: : .::..:..: :..: .:: : :.::::::::::.:.:: ..
CCDS64 VFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIFR
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 GQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSSSATLPI
.:..: .::..:: ::....:::.::.:.::::. : :. :::.::: ::::::::.
CCDS64 -KLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPV
290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 TFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQIITISI
::.: :::: ::::.:::::::::::::::::::::.::.::::.:...:..::::::::
CCDS64 TFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISI
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 TATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVLGDSLGA
:::.:::::::.::::::::::::..::::..:.::::::::.:::.:: .:::::..:.
CCDS64 TATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGT
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540
pF1KB4 GIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM
::::.::..::.. :: .... ... : .:..:.:
CCDS64 GIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTI-LDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISF
460 470 480 490 500 510
CCDS64 TQTSQF
520
>>CCDS55756.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 (565 aa)
initn: 1514 init1: 1149 opt: 1664 Z-score: 2169.8 bits: 411.3 E(32554): 1.5e-114
Smith-Waterman score: 1664; 54.4% identity (80.4% similar) in 500 aa overlap (45-538:32-525)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 MERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGTILGFTLRPYRMS
: .: .. ::: .::.:.. : ::
CCDS55 PKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPI
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 YREVKYF-SFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTII
. .: .. .:::..:::::.::.::::::::.::...::.::::..: ::.::::.::::
CCDS55 HPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTII
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 AVVIGIIIVIIIHPGKGTKENMHREGKIV-RVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEACFKQFKT
:.:.:.:.:. ::::. ... :: .:.. :::::::::.:: :::.:::.:..:
CCDS55 AAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQT
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240
pF1KB4 NYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEE--LVPVPGSV--NGVNALGLVV
.: : . . . ..:: :: ::.:.. :: .: : .:.:.:::.
CCDS55 VTKKVLVAPPPDEEANATSAV---VSLLNETVTEVPEETKMVIKKGLEFKDGMNVLGLIG
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 FSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEMEDMG
: . ::...:.: .:.. . .::. ::: .:.:: .::::.:.:: :: :::. ..:.
CCDS55 FFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAIKDLE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSSSAT
:.. ::.:: ::::.::.::. : :::.::.::::::. :..:..:: ::::::.::..:
CCDS55 VVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGT
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 LPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQIIT
::.::.::::: :.:::::::::::::::::::::::::.:::::::.:. :. :::.:
CCDS55 LPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVT
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVLGDS
.:.::: ::.:::.::.::::::...::.:::::.::.:..::::.:::.::..::.:::
CCDS55 VSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDS
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 LGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM
.::::: :::. :: . : . . : :. :: : : : .: .... .:
CCDS55 FGAGIVYHLSKSELDTIDSQ--HRVHEDIEMTKT-QSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNS
480 490 500 510 520 530
CCDS55 VIVDECKVTLAANGKSADCSVEEEPWKREK
540 550 560
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20 30 40 50 60 70
pF1KB4 MERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGTILGFTLRPYRMS
: .: .. ::: .::.:.. : ::
CCDS31 PKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPI
20 30 40 50 60 70
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pF1KB4 YREVKYF-SFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTII
. .: .. .:::..:::::.::.::::::::.::...::.::::..: ::.::::.::::
CCDS31 HPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTII
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 AVVIGIIIVIIIHPGKGTKENMHREGKIV-RVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEACFKQFKT
:.:.:.:.:. ::::. ... :: .:.. :::::::::.:: :::.:::.:..:
CCDS31 AAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQT
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240
pF1KB4 NYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEE--LVPVPGSV--NGVNALGLVV
.: : . . . ..:: :: ::.:.. :: .: : .:.:.:::.
CCDS31 VTKKVLVAPPPDEEANATSAV---VSLLNETVTEVPEETKMVIKKGLEFKDGMNVLGLIG
200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 FSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEMEDMG
: . ::...:.: .:.. . .::. ::: .:.:: .::::.:.:: :: :::. ..:.
CCDS31 FFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAIKDLE
250 260 270 280 290 300
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pF1KB4 VIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSSSAT
:.. ::.:: ::::.::.::. : :::.::.::::::. :..:..:: ::::::.::..:
CCDS31 VVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 LPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQIIT
::.::.::::: :.:::::::::::::::::::::::::.:::::::.:. :. :::.:
CCDS31 LPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVLGDS
.:.::: ::.:::.::.::::::...::.:::::.::.:..::::.:::.::..::.:::
CCDS31 VSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 LGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM
.::::: :::. :: . : . . : :. :: : : : .: .... .:
CCDS31 FGAGIVYHLSKSELDTIDSQ--HRVHEDIEMTKT-QSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNS
490 500 510 520 530 540
CCDS31 VIVDECKVTLAANGKSADCSVEEEPWKREK
550 560 570
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MTKSNGEEPKMGGRMERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GTILGFTLRPYRMSYREVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMG
70 80 90 100 110 120
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pF1KB4 MRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGTKENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGTKENMHREGKIVRVTAADAFLDLIR-----
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190 200 210 220 230 240
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CCDS78 ------------------------------------------------------------
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:::::::::::::
CCDS78 -----------------------------------------------YAPVGILFLIAGK
180
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pF1KB4 IVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITAL
190 200 210 220 230 240
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pF1KB4 GTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFE
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pF1KB4 LNFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LNFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRT
310 320 330 340 350 360
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pF1KB4 TTNVLGDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TTNVLGDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSET
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KM
::
CCDS78 KM
430
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10 20 30 40 50
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. .:.. : ..:.:.....:.: .. ..:..: : : .: ::::.:
CCDS12 MSSHGNSLFLRESGQRLGRVGWLQRLQESLQQRALRTRLRLQTMTLEHVLRFLRRNAFIL
10 20 30 40 50 60
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pF1KB4 LTVTAVIVGTILGFTLRPYRMSYREVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALD
:::.::..:. :.:.::::...::..::::::::::::::::::::::.::::::::.::
CCDS12 LTVSAVVIGVSLAFALRPYQLTYRQIKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIVSSLVTGMASLD
70 80 90 100 110 120
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pF1KB4 SKASGKMGMRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGTKENMHREGKIVRVTAADAFLD
.::.:.:::::.::::.:::::: :::..: :::::::.::..::::.: . .::::.:
CCDS12 NKATGRMGMRAAVYYMVTTIIAVFIGILMVTIIHPGKGSKEGLHREGRIETIPTADAFMD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KB4 LIRNMFPPNLVEACFKQFKTNYEKRSFKVPI--QANETLVGA-------------VINNV
::::::::::::::::::::.: : . : . :: ..::
CCDS12 LIRNMFPPNLVEACFKQFKTQYSTRVVTRTMVRTENGSEPGASMPPPFSVENGTSFLENV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 SEAMETLTRIT--EELVPVPGSVNGVNALGLVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLN
..:. :: .. :: ::::::.::.:::::::::. ::.:::.::..:..::.::::::
CCDS12 TRALGTLQEMLSFEETVPVPGSANGINALGLVVFSVAFGLVIGGMKHKGRVLRDFFDSLN
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 EAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPL
:::::::..:.:::::::::::::::.:::::.:.::::.:::.::::::..:: :::::
CCDS12 EAIMRLVGIIIWYAPVGILFLIAGKILEMEDMAVLGGQLGMYTLTVIVGLFLHAGIVLPL
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 LYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGA
.:::::..::. ::::.:::::::.:::::::::::::.::::. :::.:.:::::::::
CCDS12 IYFLVTHRNPFPFIGGMLQALITAMGTSSSSATLPITFRCLEEGLGVDRRITRFVLPVGA
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400 410 420 430 440 450
pF1KB4 TINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVL
:.:::::::::::::::::::::.:::.::: ::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS12 TVNMDGTALYEALAAIFIAQVNNYELNLGQITTISITATAASVGAAGIPQAGLVTMVIVL
430 440 450 460 470 480
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pF1KB4 TSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVLGDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIE
:::::::.::::::::::::::::: :::::::.::...::::..::. ...:.
CCDS12 TSVGLPTEDITLIIAVDWFLDRLRTMTNVLGDSIGAAVIEHLSQRELELQEAEL-----T
490 500 510 520 530
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pF1KB4 ENEMKKPYQ-LIAQDNETEKPIDSETKM
. :::. :.::.
CCDS12 LPSLGKPYKSLMAQEKGASRGRGGNESAM
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pF1KB4 RFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGTILGFTLRPYRMSYR
::....:.: .:::: .::: :: :.: .
CCDS72 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQ
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80 90 100 110 120 130
pF1KB4 EVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTIIAVV
:..::.::::::::::.:..:::..:
CCDS72 EISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVS----------------------------------
50 60 70
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 IGIIIVIIIHPGKGTKENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEACFKQFKTNYEK
::::: ::::: :::..:.
CCDS72 --------------------------------------RNMFPANLVEATFKQYRTKTTP
80 90
200 210 220 230 240
pF1KB4 --RSFKV-PIQANETLV---GAVINNVSEAMETLTRITE--ELV--PVPGSVNGVNALGL
.: :: : .: . :. .: :.... .: :.: ::. .:.:.::.
CCDS72 VVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGI
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pF1KB4 VVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEMED
: :: .:...: : ..: : : . :::..:..::: .:: : ::.:::::::.::.:
CCDS72 VFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDD
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310 320 330 340 350 360
pF1KB4 MGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSSS
..: .:..:.:::. ::..:....::::::..:.::: ::: :.::::. ::.:::::
CCDS72 PRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSS
220 230 240 250 260 270
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pF1KB4 ATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQI
:::::::::: ::: .:.:..::::::::::::::::::::.::::::::::.::.::::
CCDS72 ATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQI
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pF1KB4 ITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:: ::::
CCDS72 ITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLG
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pF1KB4 DSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM
:.:.:::. :. :... ::. :. :. . .: .:. .: : :
CCDS72 DALAAGIMAHICRKDFA-RDT--GT----ETCFPSPETAALRDQASEPPGDRGSPAEWLC
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CCDS72 EECSRGLRAHPGPHLPPPRPRSSGAG
450 460 470
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20 30 40 50 60 70
pF1KB4 RFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGTILGFTLRPYRMSYR
::....:.: .:::: .::: :: :.: .
CCDS57 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQ
10 20 30 40
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pF1KB4 EVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTIIAVV
:..::.::::::::::.:..:::..:::..:.:.::.:.:...:. .:.::. ::..::.
CCDS57 EISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVI
50 60 70 80 90 100
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pF1KB4 IGIIIVIIIHPGKGT-KENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEACFKQFKTNYE
.::..: :::::... ::. .. :: . ...:::.::::::::: ::::: :::..:.
CCDS57 VGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGKPI-MSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTT
110 120 130 140 150 160
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pF1KB4 K--RSFKV-PIQANETLV---GAVINNVSEAMETLTRITE--ELV--PVPGSVNGVNALG
.: :: : .: . :. .: :.... .: :.: ::. .:.:.::
CCDS57 PVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLG
170 180 190 200 210 220
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pF1KB4 LVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEME
.: :: .:...: : ..: : : . :::..:..::: .:: : ::.:::::::.::.
CCDS57 IVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMD
230 240 250 260 270 280
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pF1KB4 DMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSS
: ..: .:..:.:::. ::..:....::::::..:.::: ::: :.::::. ::.::::
CCDS57 DPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSS
290 300 310 320 330 340
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pF1KB4 SATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQ
::::::::::: ::: .:.:..::::::::::::::::::::.::::::::::.::.:::
CCDS57 SATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQ
350 360 370 380 390 400
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pF1KB4 IITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:: :::
CCDS57 IITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVL
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 GDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQL----IAQDNETEKPIDSETK
::.:.:::. :. :... ::. :. . : : : .: ::.: : . ..
CCDS57 GDALAAGIMAHICRKDFA-RDT--GTEKLLPCETK-PVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASE
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 M
.
CCDS57 LTLGPTCPHHVPVQVEQDEELPAASLNHCTIQISELETNV
530 540 550 560
542 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 06:05:58 2016 done: Sat Nov 5 06:05:59 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]