Result of FASTA (omim) for
pF1KB4908
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4908, 644 aa
1>>>pF1KB4908 644 - 644 aa - 644 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6384+/-0.000629; mu= 10.0525+/- 0.039
mean_var=320.0620+/-65.698, 0's: 0 Z-trim(116.5): 2067 B-trim: 99 in 1/50
Lambda= 0.071690
statistics sampled from 25309 (27679) to 25309 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.675), E-opt: 0.2 (0.325), width: 16
Scan time: 10.590
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003417 (OMIM: 194548) zinc finger protein 74 is ( 644) 4621 492.9 1.5e-138
NP_001243453 (OMIM: 194548) zinc finger protein 74 ( 644) 4621 492.9 1.5e-138
NP_001243454 (OMIM: 194548) zinc finger protein 74 ( 573) 4149 444.0 6.9e-124
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 1667 187.4 1.4e-46
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 1618 182.3 4.4e-45
NP_115799 (OMIM: 615580) zinc finger protein 528 [ ( 628) 1610 181.5 8.1e-45
XP_016882851 (OMIM: 615580) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1601 180.5 1.5e-44
XP_016882853 (OMIM: 615580) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1601 180.5 1.5e-44
XP_016882852 (OMIM: 615580) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1601 180.5 1.5e-44
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1553 175.6 4.8e-43
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1553 175.6 4.8e-43
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1553 175.6 4.8e-43
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1553 175.6 5e-43
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1553 175.6 5e-43
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1553 175.6 5e-43
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1553 175.6 5e-43
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1553 175.6 5e-43
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1553 175.6 5e-43
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1553 175.6 5.1e-43
XP_016881639 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 688) 1536 173.9 1.7e-42
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1524 172.7 4.4e-42
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1524 172.7 4.4e-42
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1524 172.7 4.4e-42
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1524 172.7 4.5e-42
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 1524 172.7 4.5e-42
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1524 172.7 4.5e-42
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1524 172.7 4.5e-42
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1524 172.7 4.5e-42
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1524 172.7 4.5e-42
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1524 172.7 4.5e-42
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1524 172.7 4.5e-42
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1524 172.7 4.5e-42
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1524 172.7 4.5e-42
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1524 172.7 4.5e-42
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1524 172.7 4.5e-42
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1524 172.7 4.5e-42
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 1524 172.8 4.5e-42
XP_016882568 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 1517 171.8 5.9e-42
XP_011525495 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 1517 171.8 5.9e-42
XP_016882567 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 1517 171.8 5.9e-42
XP_016882569 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 489) 1510 171.0 9.2e-42
NP_067039 (OMIM: 194545) endothelial zinc finger p ( 489) 1510 171.0 9.2e-42
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1506 170.7 1.4e-41
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1506 170.7 1.4e-41
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1506 170.7 1.4e-41
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1506 170.7 1.4e-41
NP_001166303 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 568) 1498 169.8 2.4e-41
NP_443092 (OMIM: 612429) zinc finger protein 300 i ( 604) 1498 169.9 2.4e-41
XP_011536004 (OMIM: 612429) PREDICTED: zinc finger ( 609) 1498 169.9 2.5e-41
NP_001166302 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 620) 1498 169.9 2.5e-41
>>NP_003417 (OMIM: 194548) zinc finger protein 74 isofor (644 aa)
initn: 4621 init1: 4621 opt: 4621 Z-score: 2608.5 bits: 492.9 E(85289): 1.5e-138
Smith-Waterman score: 4621; 100.0% identity (100.0% similar) in 644 aa overlap (1-644:1-644)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MEIPAPEPEKTALSSQDPALSLKENLEDISGWGLPEARSKESVSFKDVAVDFTQEEWGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MEIPAPEPEKTALSSQDPALSLKENLEDISGWGLPEARSKESVSFKDVAVDFTQEEWGQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DSPQRALYRDVMLENYQNLLALGPPLHKPDVISHLERGEEPWSMQREVPRGPCPEWELKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DSPQRALYRDVMLENYQNLLALGPPLHKPDVISHLERGEEPWSMQREVPRGPCPEWELKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VPSQQQGICKEEPAQEPIMERPLGGAQAWGRQAGALQRSQAAPWAPAPAMVWDVPVEEFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VPSQQQGICKEEPAQEPIMERPLGGAQAWGRQAGALQRSQAAPWAPAPAMVWDVPVEEFP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LRCPLFAQQRVPEGGPLLDTRKNVQATEGRTKAPARLCAGENASTPSEPEKFPQVRRQRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LRCPLFAQQRVPEGGPLLDTRKNVQATEGRTKAPARLCAGENASTPSEPEKFPQVRRQRG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 AGAGEGEFVCGECGKAFRQSSSLTLHRRWHSREKAYKCDECGKAFTWSTNLLEHRRIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AGAGEGEFVCGECGKAFRQSSSLTLHRRWHSREKAYKCDECGKAFTWSTNLLEHRRIHTG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 EKPFFCGECGKAFSCHSSLNVHQRIHTGERPYKCSACEKAFSCSSLLSMHLRVHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EKPFFCGECGKAFSCHSSLNVHQRIHTGERPYKCSACEKAFSCSSLLSMHLRVHTGEKPY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 RCGECGKAFNQRTHLTRHHRIHTGEKPYQCGSCGKAFTCHSSLTVHEKIHSGDKPFKCSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RCGECGKAFNQRTHLTRHHRIHTGEKPYQCGSCGKAFTCHSSLTVHEKIHSGDKPFKCSD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 CEKAFNSRSRLTLHQRTHTGEKPFKCADCGKGFSCHAYLLVHRRIHSGEKPFKCNECGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CEKAFNSRSRLTLHQRTHTGEKPFKCADCGKGFSCHAYLLVHRRIHSGEKPFKCNECGKA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 FSSHAYLIVHRRIHTGEKPFDCSQCWKAFSCHSSLIVHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 FSSHAYLIVHRRIHTGEKPFDCSQCWKAFSCHSSLIVHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HCLIKHQKIHSGEKSFKCEKCGEMFNWSSHLTEHQRLHSEGKPLAIQFNKHLLSTYYVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 HCLIKHQKIHSGEKSFKCEKCGEMFNWSSHLTEHQRLHSEGKPLAIQFNKHLLSTYYVPG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB4 SLLGAGDAGLRDVDPIDALDVAKLLCVVPPRAGRNFSLGSKPRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SLLGAGDAGLRDVDPIDALDVAKLLCVVPPRAGRNFSLGSKPRN
610 620 630 640
>>NP_001243453 (OMIM: 194548) zinc finger protein 74 iso (644 aa)
initn: 4621 init1: 4621 opt: 4621 Z-score: 2608.5 bits: 492.9 E(85289): 1.5e-138
Smith-Waterman score: 4621; 100.0% identity (100.0% similar) in 644 aa overlap (1-644:1-644)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MEIPAPEPEKTALSSQDPALSLKENLEDISGWGLPEARSKESVSFKDVAVDFTQEEWGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEIPAPEPEKTALSSQDPALSLKENLEDISGWGLPEARSKESVSFKDVAVDFTQEEWGQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DSPQRALYRDVMLENYQNLLALGPPLHKPDVISHLERGEEPWSMQREVPRGPCPEWELKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSPQRALYRDVMLENYQNLLALGPPLHKPDVISHLERGEEPWSMQREVPRGPCPEWELKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VPSQQQGICKEEPAQEPIMERPLGGAQAWGRQAGALQRSQAAPWAPAPAMVWDVPVEEFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPSQQQGICKEEPAQEPIMERPLGGAQAWGRQAGALQRSQAAPWAPAPAMVWDVPVEEFP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LRCPLFAQQRVPEGGPLLDTRKNVQATEGRTKAPARLCAGENASTPSEPEKFPQVRRQRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRCPLFAQQRVPEGGPLLDTRKNVQATEGRTKAPARLCAGENASTPSEPEKFPQVRRQRG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 AGAGEGEFVCGECGKAFRQSSSLTLHRRWHSREKAYKCDECGKAFTWSTNLLEHRRIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGAGEGEFVCGECGKAFRQSSSLTLHRRWHSREKAYKCDECGKAFTWSTNLLEHRRIHTG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 EKPFFCGECGKAFSCHSSLNVHQRIHTGERPYKCSACEKAFSCSSLLSMHLRVHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKPFFCGECGKAFSCHSSLNVHQRIHTGERPYKCSACEKAFSCSSLLSMHLRVHTGEKPY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 RCGECGKAFNQRTHLTRHHRIHTGEKPYQCGSCGKAFTCHSSLTVHEKIHSGDKPFKCSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RCGECGKAFNQRTHLTRHHRIHTGEKPYQCGSCGKAFTCHSSLTVHEKIHSGDKPFKCSD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 CEKAFNSRSRLTLHQRTHTGEKPFKCADCGKGFSCHAYLLVHRRIHSGEKPFKCNECGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CEKAFNSRSRLTLHQRTHTGEKPFKCADCGKGFSCHAYLLVHRRIHSGEKPFKCNECGKA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 FSSHAYLIVHRRIHTGEKPFDCSQCWKAFSCHSSLIVHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSSHAYLIVHRRIHTGEKPFDCSQCWKAFSCHSSLIVHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HCLIKHQKIHSGEKSFKCEKCGEMFNWSSHLTEHQRLHSEGKPLAIQFNKHLLSTYYVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HCLIKHQKIHSGEKSFKCEKCGEMFNWSSHLTEHQRLHSEGKPLAIQFNKHLLSTYYVPG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB4 SLLGAGDAGLRDVDPIDALDVAKLLCVVPPRAGRNFSLGSKPRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLLGAGDAGLRDVDPIDALDVAKLLCVVPPRAGRNFSLGSKPRN
610 620 630 640
>>NP_001243454 (OMIM: 194548) zinc finger protein 74 iso (573 aa)
initn: 4149 init1: 4149 opt: 4149 Z-score: 2345.2 bits: 444.0 E(85289): 6.9e-124
Smith-Waterman score: 4149; 100.0% identity (100.0% similar) in 573 aa overlap (72-644:1-573)
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 SVSFKDVAVDFTQEEWGQLDSPQRALYRDVMLENYQNLLALGPPLHKPDVISHLERGEEP
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLENYQNLLALGPPLHKPDVISHLERGEEP
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 WSMQREVPRGPCPEWELKAVPSQQQGICKEEPAQEPIMERPLGGAQAWGRQAGALQRSQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WSMQREVPRGPCPEWELKAVPSQQQGICKEEPAQEPIMERPLGGAQAWGRQAGALQRSQA
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 APWAPAPAMVWDVPVEEFPLRCPLFAQQRVPEGGPLLDTRKNVQATEGRTKAPARLCAGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APWAPAPAMVWDVPVEEFPLRCPLFAQQRVPEGGPLLDTRKNVQATEGRTKAPARLCAGE
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 NASTPSEPEKFPQVRRQRGAGAGEGEFVCGECGKAFRQSSSLTLHRRWHSREKAYKCDEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NASTPSEPEKFPQVRRQRGAGAGEGEFVCGECGKAFRQSSSLTLHRRWHSREKAYKCDEC
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 GKAFTWSTNLLEHRRIHTGEKPFFCGECGKAFSCHSSLNVHQRIHTGERPYKCSACEKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKAFTWSTNLLEHRRIHTGEKPFFCGECGKAFSCHSSLNVHQRIHTGERPYKCSACEKAF
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 SCSSLLSMHLRVHTGEKPYRCGECGKAFNQRTHLTRHHRIHTGEKPYQCGSCGKAFTCHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCSSLLSMHLRVHTGEKPYRCGECGKAFNQRTHLTRHHRIHTGEKPYQCGSCGKAFTCHS
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 SLTVHEKIHSGDKPFKCSDCEKAFNSRSRLTLHQRTHTGEKPFKCADCGKGFSCHAYLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLTVHEKIHSGDKPFKCSDCEKAFNSRSRLTLHQRTHTGEKPFKCADCGKGFSCHAYLLV
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 HRRIHSGEKPFKCNECGKAFSSHAYLIVHRRIHTGEKPFDCSQCWKAFSCHSSLIVHQRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HRRIHSGEKPFKCNECGKAFSSHAYLIVHRRIHTGEKPFDCSQCWKAFSCHSSLIVHQRI
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 HTGEKPYKCSECGRAFSQNHCLIKHQKIHSGEKSFKCEKCGEMFNWSSHLTEHQRLHSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HTGEKPYKCSECGRAFSQNHCLIKHQKIHSGEKSFKCEKCGEMFNWSSHLTEHQRLHSEG
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 KPLAIQFNKHLLSTYYVPGSLLGAGDAGLRDVDPIDALDVAKLLCVVPPRAGRNFSLGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KPLAIQFNKHLLSTYYVPGSLLGAGDAGLRDVDPIDALDVAKLLCVVPPRAGRNFSLGSK
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 PRN
:::
NP_001 PRN
>>NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [Homo (620 aa)
initn: 1465 init1: 1465 opt: 1667 Z-score: 957.5 bits: 187.4 E(85289): 1.4e-46
Smith-Waterman score: 1679; 45.2% identity (68.3% similar) in 586 aa overlap (43-611:4-566)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 LSSQDPALSLKENLEDISGWGLPEARSKESVSFKDVAVDFTQEEWGQLDSPQRALYRDVM
..:.:::..:. ::: ::. :: :::.::
NP_112 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVM
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KB4 LENYQNLLALGPPLHKPDVISHLERGEEPWSMQR-EVPRGP---CPEWELKAVPSQQQGI
::::.::. :: . :::.:.:::.:..: .:.: :. .: : .. : .:.:
NP_112 LENYSNLVFLGIVVSKPDLIAHLEQGKKPLTMKRHEMVANPSVICSHFAQDLWP--EQNI
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pF1KB4 CKEEPAQEPIMERPLGGAQAWGRQAGALQ---RSQAAPWAPAPAMVWDVPVEEFPLRCPL
.. :. :..: : : :: : ... . . .. ... :
NP_112 --KDSFQKVILRR------YEKRGHGNLQLIKRCESVDECKVHTGGYN-GLNQ----CST
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.. .:: ..: ::::::. ::.:. :.: :. :: ::::.: ::: :..: .:. :
NP_112 HKKIHTGEKPYICEECGKAFKYSSALNTHKRIHTGEKPYKCDKCDKAFIASSTLSKHEII
200 210 220 230 240 250
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:::.::. : ::::::. :.:. :..:::::.:::: : :::. :: :. : ..::::
NP_112 HTGKKPYKCEECGKAFNQSSTLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTKHKKIHTGE
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::: : ::::::. :: :.:::::::::.:..::::: :.:. :: :: : : .:
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:::: . . : :. ::::.::. : .: :::. ::: :..:::::::::: :::.::
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pF1KB4 SQNHCLIKHQKIHSGEKSFKCEKCGEMFNWSSHLTEHQRLHSEGKPLAIQ-FNKHL-LST
.:. : ::.:::.::: .:::.::. :: :: : .:...:.. :: . .: . :::
NP_112 NQSSSLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLIKHKKIHTREKPYKCEECGKAFHLST
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. . ..: .:. :
NP_112 HLTTHKILHTGEKPYRCRECGKAFNHSATLSSHKKIHSGEKPYECDKCGKAFISPSSLSR
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..:.:::..:. .:: ::. :: :::.::
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pF1KB4 LENYQNLLALGPPLHKPDVISHLERGEEPWSMQR-EV----PRGPC--------PEWELK
::::.::. :: . :::.:. ::.:.: :::.: :. : : :: ..:
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: .. : :..: : . : . : . :: .. .. : : . : ..
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pF1KB4 FKCADCGKGFSCHAYLLVHRRIHSGEKPFKCNECGKAFSSHAYLIVHRRIHTGEKPFDCS
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pF1KB4 QCWKAFSCHSSLIVHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNHCLIKHQKIHSGEKSFKCEKCGE
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NP_115 LYRDVMLENYRNLVSLGICLPDLSVTSMLEQKRDPWTLQSEEKIANDPDGRECIKGVNTE
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... . ...: . :: . . . . :: :: . .. :: . :
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... . :.::::.: ::.:..::: :. :: ::: :::: :. ..:: .:.::
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pF1KB4 GKAFSSHAYLIVHRRIHTGEKPFDCSQCWKAFSCHSSLIVHQRIHTGEKPYKCSECGRAF
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NP_115 GTAFREFSDLTAHFLIHSGEKPYECKECGKVFRYKSSLTSHHRIHTGEKPYKCNRCGKVF
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pF1KB4 SQNHCLIKHQKIHSGEKSFKCEKCGEMFNWSSHLTEHQRLHSEGKPLAIQFNKHLLSTYY
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pF1KB4 EKAFNSRSRLTLHQRTHTGEKPFKCADCGKGFSCHAYLLVHRRIHSGEKPFKCNECGKAF
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: :.: : ... . : : .. . :: .. ...
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:: :.: :.: ::::::::.:::: :.:.:. . : : ..::::::: :..:::
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pF1KB4 AGLRDVDPIDALDVAKLLCVVPPRAGRNFSLGSKPRN
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>--
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pF1KB4 KPFFCGECGKAFSCHSSLNVHQRIHTGERPYKCSACEKAFSCSSLLSMHLRVHTGEKPYR
:.:: : ::: : :. :: .:: .: ..
XP_016 KPYKCNQCGKVFNQASYLTRHQIIHTGERPYRCSKCGKAFRGCSGLTAHLAIHTEKKSHE
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pF1KB4 CGECGKAFNQRTHLTRHHRIHTGEKPYQCGSCGKAFTCHSSLTVHEKIHSGDKPFKCSDC
: :::: :.:.. :: ::::: :::::.: :.:.:. .:.:. :...::
XP_016 CKECGKIFTQKSSLTNHHRIHIGEKPYKCTLCSKVFSHNSDLAQHQRVHS
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pF1KB4 EKAFNSRSRLTLHQRTHTGEKPFKCADCGKGFSCHAYLLVHRRIHSGEKPFKCNECGKAF
>>XP_016882853 (OMIM: 615580) PREDICTED: zinc finger pro (618 aa)
initn: 2799 init1: 1477 opt: 1601 Z-score: 920.6 bits: 180.5 E(85289): 1.5e-44
Smith-Waterman score: 1601; 43.6% identity (69.0% similar) in 546 aa overlap (47-583:2-538)
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pF1KB4 DPALSLKENLEDISGWGLPEARSKESVSFKDVAVDFTQEEWGQLDSPQRALYRDVMLENY
:::..:.:::: :: ::.::::::::::
XP_016 MDVAIEFSQEEWKCLDPAQRTLYRDVMLENY
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pF1KB4 QNLLALGPPLHKPDVISHLERGEEPWSMQRE--VPRGPCPEWELKAVPSQQQGICKEEPA
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pF1KB4 GPLLDTRKNV-------QATEGRTKAPARLCAGENASTPSEPEKFPQVRRQRGAGAGEGE
: :.: : ... . : : .. . :: .. ...
XP_016 HLLNKYRNNFDHAPLLPQEQKAHIREKAYKCNEHGQVFRASASLTNQVIHN-----ADNP
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pF1KB4 EKAFNSRSRLTLHQRTHTGEKPFKCADCGKGFSCHAYLLVHRRIHSGEKPFKCNECGKAF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]