Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4917
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4917, 323 aa
1>>>pF1KB4917 323 - 323 aa - 323 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1124+/-0.000848; mu= 17.6850+/- 0.051
mean_var=73.6804+/-14.688, 0's: 0 Z-trim(107.6): 74 B-trim: 481 in 1/50
Lambda= 0.149416
statistics sampled from 9568 (9655) to 9568 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.297), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7715.1 SLC25A22 gene_id:79751|Hs108|chr11 ( 323) 2094 460.5 8.3e-130
CCDS13744.1 SLC25A18 gene_id:83733|Hs108|chr22 ( 315) 1347 299.4 2.4e-81
CCDS9959.1 SLC25A47 gene_id:283600|Hs108|chr14 ( 308) 415 98.5 7.1e-21
CCDS5645.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 ( 675) 390 93.4 5.4e-19
CCDS55130.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 ( 676) 390 93.4 5.4e-19
CCDS33327.1 SLC25A12 gene_id:8604|Hs108|chr2 ( 678) 389 93.2 6.3e-19
CCDS103.1 SLC25A33 gene_id:84275|Hs108|chr1 ( 321) 269 67.1 2.2e-11
CCDS72943.1 SLC25A44 gene_id:9673|Hs108|chr1 ( 322) 260 65.1 8.4e-11
>>CCDS7715.1 SLC25A22 gene_id:79751|Hs108|chr11 (323 aa)
initn: 2094 init1: 2094 opt: 2094 Z-score: 2444.0 bits: 460.5 E(32554): 8.3e-130
Smith-Waterman score: 2094; 100.0% identity (100.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MADKQISLPAKLINGGIAGLIGVTCVFPIDLAKTRLQNQQNGQRVYTSMSDCLIKTVRSE
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CCDS77 MADKQISLPAKLINGGIAGLIGVTCVFPIDLAKTRLQNQQNGQRVYTSMSDCLIKTVRSE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GYFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFRHQLSKDGQKLTLLKEMLAGCGAGTCQVIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GYFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFRHQLSKDGQKLTLLKEMLAGCGAGTCQVIV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 TTPMEMLKIQLQDAGRIAAQRKILAAQGQLSAQGGAQPSVEAPAAPRPTATQLTRDLLRS
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CCDS77 TTPMEMLKIQLQDAGRIAAQRKILAAQGQLSAQGGAQPSVEAPAAPRPTATQLTRDLLRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RGIAGLYKGLGATLLRDVPFSVVYFPLFANLNQLGRPASEEKSPFYVSFLAGCVAGSAAA
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CCDS77 RGIAGLYKGLGATLLRDVPFSVVYFPLFANLNQLGRPASEEKSPFYVSFLAGCVAGSAAA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 VAVNPCDVVKTRLQSLQRGVNEDTYSGILDCARKILRHEGPSAFLKGAYCRALVIAPLFG
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CCDS77 VAVNPCDVVKTRLQSLQRGVNEDTYSGILDCARKILRHEGPSAFLKGAYCRALVIAPLFG
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB4 IAQVVYFLGIAESLLGLLQDPQA
:::::::::::::::::::::::
CCDS77 IAQVVYFLGIAESLLGLLQDPQA
310 320
>>CCDS13744.1 SLC25A18 gene_id:83733|Hs108|chr22 (315 aa)
initn: 1159 init1: 674 opt: 1347 Z-score: 1573.9 bits: 299.4 E(32554): 2.4e-81
Smith-Waterman score: 1347; 65.6% identity (84.9% similar) in 317 aa overlap (1-315:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MADKQISLPAKLINGGIAGLIGVTCVFPIDLAKTRLQNQQNGQRVYTSMSDCLIKTVRSE
:. ...:. :::::::.:::.::::::::::::::::::. :. .: .: :::.::.:.:
CCDS13 MTHQDLSITAKLINGGVAGLVGVTCVFPIDLAKTRLQNQH-GKAMYKGMIDCLMKTARAE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GYFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFRHQLSKDGQKLTLLKEMLAGCGAGTCQVIV
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CCDS13 GFFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFRRLLMEDGMQRNLKMEMLAGCGAGMCQVVV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB4 TTPMEMLKIQLQDAGRIAAQRKILAAQGQLSAQGGAQPSVEAPAAP--RPTATQLTRDLL
: ::::::::::::::.:... ::. :: . .. . . :. ::.:: .. .::
CCDS13 TCPMEMLKIQLQDAGRLAVHH-----QGSASAPSTSRSYTTGSASTHRRPSATLIAWELL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 RSRGIAGLYKGLGATLLRDVPFSVVYFPLFANLNQLGRPASEEKSPFYVSFLAGCVAGSA
:..:.::::.:::::::::.:::..:::::::::.:: :. : ::..::::::
CCDS13 RTQGLAGLYRGLGATLLRDIPFSIIYFPLFANLNNLGFNELAGKASFAHSFVSGCVAGSI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 AAVAVNPCDVVKTRLQSLQRGVNEDTYSGILDCARKILRHEGPSAFLKGAYCRALVIAPL
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CCDS13 AAVAVTPLDVLKTRIQTLKKGLGEDMYSGITDCARKLWIQEGPSAFMKGAGCRALVIAPL
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KB4 FGIAQVVYFLGIAESLLGLLQDPQA
::::: :::.::.: .:
CCDS13 FGIAQGVYFIGIGERILKCFD
300 310
>>CCDS9959.1 SLC25A47 gene_id:283600|Hs108|chr14 (308 aa)
initn: 250 init1: 156 opt: 415 Z-score: 488.2 bits: 98.5 E(32554): 7.1e-21
Smith-Waterman score: 415; 30.2% identity (58.9% similar) in 321 aa overlap (12-315:3-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MADKQISLPAKLINGGIAGLIGVTCVFPIDLAKTRLQNQQNGQRVYTSMSDCLIKTVRSE
.. :.:.:. ::. .:.: .:.:.:.. . ::.. :. : . :
CCDS99 MDFVAGAIGGVCGVAVGYPLDTVKVRIQTEPK----YTGIWHCVRDTYHRE
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB4 GYFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFRHQLS-----KDGQ---KLTLLKEMLAGCG
.:.::: .. . :. ....... .:: :. . :. : : :.::.
CCDS99 RVWGFYRGLSLPVCTVSLVSSVSFGT---YRHCLAHICRLRYGNPDAKPTKADITLSGCA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB4 AGTCQVIVTTPMEMLKIQLQDAGRIAAQRKILAAQGQLSAQGGAQPSVEAPAA-PRPT--
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CCDS99 SGLVRVFLTSPTEVAKVRLQTQTQAQKQQRRLSASGPLAVP----PMCPVPPACPEPKYR
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 -ATQLTRDLLRSRGIAGLYKGLGATLLRDVPFSVVYFPLFANLNQLGRPASEEKSPFYVS
. . : .:. ::::: .: .::: ..:: .: : . ::.. .
CCDS99 GPLHCLATVAREEGLCGLYKGSSALVLRDGHSFATYFLSYAVLCEWLSPAGHSRPDVPGV
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 FLAGCVAGSAAAVAVNPCDVVKTRLQSLQRGVNEDTYSGILDCARKILRHEGPSAFLKGA
..:: :: : ....: ::.:.:::. : .. : :.: : .:.::: ...::
CCDS99 LVAGGCAGVLAWAVATPMDVIKSRLQA--DGQGQRRYRGLLHCMVTSVREEGPRVLFKGL
230 240 250 260 270
290 300 310 320
pF1KB4 Y---CRALVIAPLFGIAQVVY--FLGIAESLLGLLQDPQA
:::. :. .. :.: : .:..::
CCDS99 VLNCCRAF---PVNMVVFVAYEAVLRLARGLLT
280 290 300
>>CCDS5645.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 (675 aa)
initn: 726 init1: 270 opt: 390 Z-score: 454.4 bits: 93.4 E(32554): 5.4e-19
Smith-Waterman score: 707; 43.3% identity (67.0% similar) in 300 aa overlap (15-308:335-602)
10 20 30 40
pF1KB4 MADKQISLPAKLINGGIAGLIGVTCVFPIDLAKTRLQNQQN---
:..:: .:.: :.::::.:::.:::..
CCDS56 LAEAQRQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQRSTGS
310 320 330 340 350 360
50 60 70 80 90
pF1KB4 --GQRVYTSMSDCLIKTVRSEGYFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFRHQ-LSKDG
:. .: . ::. :..: ::.::.::: .: :.:::::::..::: : . . :::
CCDS56 FVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFMHKDG
370 380 390 400 410 420
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 QKLTLLKEMLAGCGAGTCQVIVTTPMEMLKIQLQDAGRIAAQRKILAAQGQLSAQGGAQP
. . : :.::: :: ::: :.:.:..::.:: ::.:..
CCDS56 S-VPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITT-------------------
430 440 450 460
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 SVEAPAAPRPTATQLTRDLLRSRGIAGLYKGLGATLLRDVPFSVVYFPLFANLNQLGRPA
.:: .: ...::: :. :.::: : .:::.:::..::: .:...
CCDS56 ------GPRVSALSVVRDL----GFFGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASFANE
470 480 490 500 510
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 SEEKSPFYVSFLAGCVAGSAAAVAVNPCDVVKTRLQSLQRGVNEDTYSGILDCARKILRH
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CCDS56 DGQVSPGSL-LLAGAIAGMPAASLVTPADVIKTRLQVAARA-GQTTYSGVIDCFRKILRE
520 530 540 550 560 570
280 290 300 310 320
pF1KB4 EGPSAFLKGAYCRALVIAPLFGIAQVVYFLGIAESLLGLLQDPQA
:::.:. ::: :.. .: ::.. ..: :
CCDS56 EGPKALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAP
580 590 600 610 620 630
>>CCDS55130.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 (676 aa)
initn: 726 init1: 270 opt: 390 Z-score: 454.4 bits: 93.4 E(32554): 5.4e-19
Smith-Waterman score: 707; 43.3% identity (67.0% similar) in 300 aa overlap (15-308:336-603)
10 20 30 40
pF1KB4 MADKQISLPAKLINGGIAGLIGVTCVFPIDLAKTRLQNQQN---
:..:: .:.: :.::::.:::.:::..
CCDS55 AEAQRQQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQRSTGS
310 320 330 340 350 360
50 60 70 80 90
pF1KB4 --GQRVYTSMSDCLIKTVRSEGYFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFRHQ-LSKDG
:. .: . ::. :..: ::.::.::: .: :.:::::::..::: : . . :::
CCDS55 FVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFMHKDG
370 380 390 400 410 420
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 QKLTLLKEMLAGCGAGTCQVIVTTPMEMLKIQLQDAGRIAAQRKILAAQGQLSAQGGAQP
. . : :.::: :: ::: :.:.:..::.:: ::.:..
CCDS55 S-VPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITT-------------------
430 440 450 460
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 SVEAPAAPRPTATQLTRDLLRSRGIAGLYKGLGATLLRDVPFSVVYFPLFANLNQLGRPA
.:: .: ...::: :. :.::: : .:::.:::..::: .:...
CCDS55 ------GPRVSALSVVRDL----GFFGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKASFANE
470 480 490 500 510
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 SEEKSPFYVSFLAGCVAGSAAAVAVNPCDVVKTRLQSLQRGVNEDTYSGILDCARKILRH
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CCDS55 DGQVSPGSL-LLAGAIAGMPAASLVTPADVIKTRLQVAARA-GQTTYSGVIDCFRKILRE
520 530 540 550 560 570
280 290 300 310 320
pF1KB4 EGPSAFLKGAYCRALVIAPLFGIAQVVYFLGIAESLLGLLQDPQA
:::.:. ::: :.. .: ::.. ..: :
CCDS55 EGPKALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAP
580 590 600 610 620 630
>>CCDS33327.1 SLC25A12 gene_id:8604|Hs108|chr2 (678 aa)
initn: 644 init1: 274 opt: 389 Z-score: 453.2 bits: 93.2 E(32554): 6.3e-19
Smith-Waterman score: 714; 43.4% identity (66.6% similar) in 311 aa overlap (5-308:322-600)
10 20 30
pF1KB4 MADKQISLPA-KLINGGIAGLIGVTCVFPIDLAK
::. : .. :..:: .:.: :.::::.:
CCDS33 IAPLAEGALPYNLAELQRQQSPGLGRPIWLQIAESAYRFTLGSVAGAVGATAVYPIDLVK
300 310 320 330 340 350
40 50 60 70 80
pF1KB4 TRLQNQQN-----GQRVYTSMSDCLIKTVRSEGYFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAAND
::.:::.. :. .: . ::. :..: ::.::.::: .: :.:::::::..::
CCDS33 TRMQNQRGSGSVVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLIPQLIGVAPEKAIKLTVND
360 370 380 390 400 410
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 FFRHQLSKDGQKLTLLKEMLAGCGAGTCQVIVTTPMEMLKIQLQDAGRIAAQRKILAAQG
: : .... .. : :.::: :: ::: :.:.:..::.:: ::.:..
CCDS33 FVRDKFTRRDGSVPLPAEVLAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEITT---------
420 430 440 450 460
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 QLSAQGGAQPSVEAPAAPRPTATQLTRDLLRSRGIAGLYKGLGATLLRDVPFSVVYFPLF
.:: .: .. ::: :: ::::: : .:::.:::..:::..
CCDS33 ----------------GPRVSALNVLRDL----GIFGLYKGAKACFLRDIPFSAIYFPVY
470 480 490 500
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 ANLNQLGRPASEEKSPFYVSFLA-GCVAGSAAAVAVNPCDVVKTRLQSLQRGVNEDTYSG
:. . : :.:. ...:: : .:: :: :.: ::.::::: :. .. ::::
CCDS33 AHCKLLL--ADENGHVGGLNLLAAGAMAGVPAASLVTPADVIKTRLQVAARA-GQTTYSG
510 520 530 540 550
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 ILDCARKILRHEGPSAFLKGAYCRALVIAPLFGIAQVVYFLGIAESLLGLLQDPQA
..:: :::::.:::::: ::. :.. .: ::.. :.: :
CCDS33 VIDCFRKILREEGPSAFWKGTAARVFRSSPQFGVTLVTYELLQRWFYIDFGGLKPAGSEP
560 570 580 590 600 610
CCDS33 TPKSRIADLPPANPDHIGGYRLATATFAGIENKFGLYLPKFKSPSVAVVQPKAAVAATQ
620 630 640 650 660 670
>>CCDS103.1 SLC25A33 gene_id:84275|Hs108|chr1 (321 aa)
initn: 242 init1: 81 opt: 269 Z-score: 317.9 bits: 67.1 E(32554): 2.2e-11
Smith-Waterman score: 269; 30.5% identity (60.3% similar) in 239 aa overlap (94-323:1-220)
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFRHQLSKDGQKL--TLLKEMLAGCGAGTCQVIVT
.. ::. :::. . .::: :: .: :
CCDS10 MATGGQQKENTLLHLFAGGCG-GTVGAIFT
10 20
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 TPMEMLKIQLQDAGRIAAQRKILAAQGQLSAQGGAQPSVEAPAAPRPTATQLTRDLLRSR
:.:..: .:: ..:.: : . : .:.. .:: .. :.. : :. ...:...
CCDS10 CPLEVIKTRLQ-SSRLAL-RTVYYPQVHLGTISGA--GMVRPTSVTPGLFQVLKSILEKE
30 40 50 60 70 80
190 200 210 220 230
pF1KB4 GIAGLYKGLGATLLRDVPFSVVYFPLFANLNQLGRPASEEKSPFYV---SFLAGCVAGSA
: .:..::: .:. .: .::: ... :.:. . ..: ... ::::
CCDS10 GPKSLFRGLGPNLVGVAPSRAVYFACYSK-------AKEQFNGIFVPNSNIVHIFSAGSA
90 100 110 120 130
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 AAVA---VNPCDVVKTRLQSLQRGVNEDTYSGILDCARKILRHEGPSAFLKGAYCRALVI
: .. .:: .::::.: :.. : . . :.::: . . :: .: .: .
CCDS10 AFITNSLMNPIWMVKTRMQ-LEQKVRGSKQMNTLQCARYVYQTEGIRGFYRG------LT
140 150 160 170 180 190
300 310 320
pF1KB4 APLFGIAQVVYFLGIAESLLGLLQD-PQA
: ::.... ..: ::: :.. : :
CCDS10 ASYAGISETIICFAIYESLKKYLKEAPLASSANGTEKNSTSFFGLMAAAALSKGCASCIA
200 210 220 230 240 250
>>CCDS72943.1 SLC25A44 gene_id:9673|Hs108|chr1 (322 aa)
initn: 183 init1: 76 opt: 260 Z-score: 307.4 bits: 65.1 E(32554): 8.4e-11
Smith-Waterman score: 327; 27.4% identity (59.1% similar) in 318 aa overlap (16-322:24-315)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MADKQISLPAKLINGGIAGLIGV-TCVFPIDLAKTRLQNQQNGQRVYTSMSD
:.: . . . :.:. : .:::: :. :. .: . :
CCDS72 MEDKRNIQIIEWEHLDKKKFYVFGVAMTMMIRVSVYPFTLIRTRLQVQK-GKSLYHGTFD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 CLIKTVRSEGYFGMYRGAAVN-LTLVTPEKAIKLAANDFFRHQLSKDGQKLTLLKEMLAG
.:: .:..: :.::: :: .::.. . . .. .. : .. : .. . .: ..::
CCDS72 AFIKILRADGITGLYRGFLVNTFTLISGQCYV--TTYELTR-KFVADYSQSNTVKSLVAG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 CGAGTCQVIVTTPMEMLKIQLQDAGRIAAQRKILAAQGQLSAQGGAQPSVEAPAAPRPTA
.:. .:.:..... .:. ::: .:.....:. : .. .: :
CCDS72 GSASLVAQSITVPIDVVSQHLM------MQRKG-EKMGRFQVRGN--PEGQGVVAFGQTK
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB4 TQLTRDLLRSRGIAGLYKGLGATLLRDVPFSVVYFPLFANLNQLGRPASEEKSPF-----
.. :..:.. :. :.:.: :.:: .: :.:..:.. . : :. .
CCDS72 -DIIRQILQADGLRGFYRGYVASLLTYIPNSAVWWPFYHFYAAIVFPWIPEQLSYLCPKE
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 --YVSFLA--GCVAGSAAAVAVNPCDVVKTRLQSLQRGVNEDTYSGILDCARKILRHEGP
.. : : : .:...:.. .:: ::..::.: .: : .:. :... .:::
CCDS72 CPHIVFQAVSGPLAAATASILTNPMDVIRTRVQV--EGKN-----SIILTFRQLMAEEGP
230 240 250 260 270
290 300 310 320
pF1KB4 SAFLKGAYCRALVIAPLFGIAQVVYFLGIAESLLGLLQDPQA
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CCDS72 WGLMKGLSARIISATP----STIVIVVGY-ESLKKLSLRPELVDSRHW
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