Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4944
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4944, 512 aa
1>>>pF1KB4944 512 - 512 aa - 512 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9057+/-0.00102; mu= 14.2030+/- 0.061
mean_var=65.0014+/-13.129, 0's: 0 Z-trim(103.6): 28 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.159079
statistics sampled from 7474 (7500) to 7474 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 3.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34859.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 512) 3445 799.9 0
CCDS59094.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 502) 2989 695.2 4.4e-200
CCDS34037.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 521) 2855 664.5 8.2e-191
CCDS7328.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 524) 2834 659.6 2.3e-189
CCDS44437.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 525) 2828 658.3 6.1e-189
CCDS47114.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 511) 2780 647.3 1.2e-185
CCDS44436.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 515) 2756 641.7 5.6e-184
CCDS59093.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 521) 2628 612.4 4e-175
CCDS47113.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 469) 1895 444.1 1.6e-124
CCDS8160.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 ( 330) 683 165.9 6.1e-41
CCDS31618.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 ( 341) 683 166.0 6.3e-41
CCDS9150.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12 ( 323) 678 164.8 1.3e-40
CCDS58279.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12 ( 337) 678 164.8 1.4e-40
CCDS6079.1 PPP2CB gene_id:5516|Hs108|chr8 ( 309) 675 164.1 2e-40
CCDS33169.1 PPP1CB gene_id:5500|Hs108|chr2 ( 327) 673 163.7 3e-40
CCDS10669.1 PPP4C gene_id:5531|Hs108|chr16 ( 307) 671 163.2 3.8e-40
CCDS4173.1 PPP2CA gene_id:5515|Hs108|chr5 ( 309) 661 160.9 1.9e-39
CCDS6861.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 305) 653 159.1 6.7e-39
CCDS48018.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 342) 653 159.1 7.5e-39
CCDS8161.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 ( 286) 633 154.5 1.5e-37
CCDS12684.1 PPP5C gene_id:5536|Hs108|chr19 ( 499) 629 153.6 4.8e-37
CCDS48019.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 283) 480 119.3 5.6e-27
CCDS34013.1 PPEF2 gene_id:5470|Hs108|chr4 ( 753) 322 83.2 1.2e-15
CCDS43920.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX ( 591) 296 77.2 5.7e-14
CCDS14188.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX ( 653) 296 77.2 6.3e-14
>>CCDS34859.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 (512 aa)
initn: 3445 init1: 3445 opt: 3445 Z-score: 4271.1 bits: 799.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3445; 100.0% identity (100.0% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFENGKPKVDVLKNHLVKEGRLEEEVALKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFENGKPKVDVLKNHLVKEGRLEEEVALKI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 INDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYVDRGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 INDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYVDRGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYSEQVYDACMETFDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYSEQVYDACMETFDC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYGNEKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYGNEKT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQATGFPSLIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQATGFPSLIT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 LVNVLNICSDDELISDDEAEGSTTVRKEIIRNKIRAIGKMARVFSILRQESESVLTLKGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVNVLNICSDDELISDDEAEGSTTVRKEIIRNKIRAIGKMARVFSILRQESESVLTLKGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 TPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFEEARGLDRINERMPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFEEARGLDRINERMPPR
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KB4 KDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS
490 500 510
>>CCDS59094.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 (502 aa)
initn: 2978 init1: 2978 opt: 2989 Z-score: 3705.6 bits: 695.2 E(32554): 4.4e-200
Smith-Waterman score: 3360; 98.0% identity (98.0% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-502)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFENGKPKVDVLKNHLVKEGRLEEEVALKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFENGKPKVDVLKNHLVKEGRLEEEVALKI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 INDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYVDRGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 INDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYVDRGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYSEQVYDACMETFDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYSEQVYDACMETFDC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYGNEKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYGNEKT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQATGFPSLIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQATGFPSLIT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 LVNVLNICSDDELISDDEAEGSTTVRKEIIRNKIRAIGKMARVFSILRQESESVLTLKGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LVNVLNICSDDELISDDEAEGSTTVRKEIIRNKIRAIGKMARVFSILRQESESVLTLKGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 TPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFEEARGLDRINERMPPR
::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TPTGTLPLGVLSGGKQTIETA----------IRGFSLQHKIRSFEEARGLDRINERMPPR
430 440 450 460 470
490 500 510
pF1KB4 KDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS
480 490 500
>>CCDS34037.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 (521 aa)
initn: 2709 init1: 2172 opt: 2855 Z-score: 3539.2 bits: 664.5 E(32554): 8.2e-191
Smith-Waterman score: 2855; 80.9% identity (94.9% similar) in 508 aa overlap (8-512:11-518)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFEN-GKPKVDVLKNHLVKEGRLEEEV
:::::::.:::::::..::: ::::.: :::.::.:: ::.::::::: :
CCDS34 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 ALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYV
::.::..::.::::::.....:::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS34 ALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 DRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYSEQVYDACME
::::::::::::::.::: .:::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::::.
CCDS34 DRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 TFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYG
.:::::::::.::::::::::.::::..:::::::::: ::::.::.::.::::: ::.:
CCDS34 AFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 NEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQATGFP
:::: ::.::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.::::
CCDS34 NEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 VTEMLVNVLNICSDDELISDDEA-EGSTTV-RKEIIRNKIRAIGKMARVFSILRQESESV
::::::::::::::::: :.... .:.:.. :::.::::::::::::::::.::.:::::
CCDS34 VTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 LTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFEEARGLDRIN
:::::::::: :: :::::::::...:::::.:: :::.::: :::: :::::.::::::
CCDS34 LTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSATVEAIEADEAIKGFSPQHKITSFEEAKGLDRIN
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KB4 ERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS
::::::.:.. . . ..:...: . .. .:.. . :
CCDS34 ERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
490 500 510 520
>>CCDS7328.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 (524 aa)
initn: 2810 init1: 2174 opt: 2834 Z-score: 3513.1 bits: 659.6 E(32554): 2.3e-189
Smith-Waterman score: 2834; 83.0% identity (95.3% similar) in 494 aa overlap (12-502:24-516)
10 20 30 40
pF1KB4 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFE-NGKPKVDVLKNHLV
:::.::::::::.::: .:::. .: :.:::::::::
CCDS73 MAAPEPARAAPPPPPPPPPPPGADRVVKAVPFPPTHRLTSEEVFDLDGIPRVDVLKNHLV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 KEGRLEEEVALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNT
::::..::.::.:::.::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS73 KEGRVDEEIALRIINEGAAILRREKTMIEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYS
::::::::::::::::::::::: ::: .:.:::::::::::::::.::::::::.::::
CCDS73 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 EQVYDACMETFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLL
:.::.::::.:: :::::::::::::::::.:::: .:::::.:::: :::::::.::::
CCDS73 ERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 WSDPSEDYGNEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY
:::::::.::::. ::..:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 WSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 RKSQATGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 WSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELISD--DEAEGSTTVRKEIIRNKIRAIGKMARVFS
::::::::::::::::::.:::::::... :. .::...::::::::::::::::::::
CCDS73 WSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDGSAAARKEIIRNKIRAIGKMARVFS
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 ILRQESESVLTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFE
.::.::::::::::::::: :: :::.::.::...:::::.::..:::::: :.: :::
CCDS73 VLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSATVEAIEAEKAIRGFSPPHRICSFE
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510
pF1KB4 EARGLDRINERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS
::.::::::::::::::... : ..:...::. :
CCDS73 EAKGLDRINERMPPRKDAVQQDG-FNSLNTAHATENHGTGNHTAQ
490 500 510 520
>>CCDS44437.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 (525 aa)
initn: 2810 init1: 2174 opt: 2828 Z-score: 3505.6 bits: 658.3 E(32554): 6.1e-189
Smith-Waterman score: 2828; 82.8% identity (94.9% similar) in 495 aa overlap (12-502:24-517)
10 20 30 40
pF1KB4 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFE-NGKPKVDVLKNHLV
:::.::::::::.::: .:::. .: :.:::::::::
CCDS44 MAAPEPARAAPPPPPPPPPPPGADRVVKAVPFPPTHRLTSEEVFDLDGIPRVDVLKNHLV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 KEGRLEEEVALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNT
::::..::.::.:::.::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS44 KEGRVDEEIALRIINEGAAILRREKTMIEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYS
::::::::::::::::::::::: ::: .:.:::::::::::::::.::::::::.::::
CCDS44 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 EQVYDACMETFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLL
:.::.::::.:: :::::::::::::::::.:::: .:::::.:::: :::::::.::::
CCDS44 ERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 WSDPSEDYGNEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY
:::::::.::::. ::..:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 RKSQATGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 WSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELISDDEAE---GSTTVRKEIIRNKIRAIGKMARVF
::::::::::::::::::.:::::::... : . ::...:::::::::::::::::::
CCDS44 WSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDVGSAAARKEIIRNKIRAIGKMARVF
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 SILRQESESVLTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSF
:.::.::::::::::::::: :: :::.::.::...:::::.::..:::::: :.: ::
CCDS44 SVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSATVEAIEAEKAIRGFSPPHRICSF
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510
pF1KB4 EEARGLDRINERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS
:::.::::::::::::::... : ..:...::. :
CCDS44 EEAKGLDRINERMPPRKDAVQQDG-FNSLNTAHATENHGTGNHTAQ
490 500 510 520
>>CCDS47114.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 (511 aa)
initn: 2655 init1: 2172 opt: 2780 Z-score: 3446.3 bits: 647.3 E(32554): 1.2e-185
Smith-Waterman score: 2780; 79.3% identity (93.1% similar) in 508 aa overlap (8-512:11-508)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFEN-GKPKVDVLKNHLVKEGRLEEEV
:::::::.:::::::..::: ::::.: :::.::.:: ::.::::::: :
CCDS47 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 ALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYV
::.::..::.::::::.....:::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS47 ALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 DRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYSEQVYDACME
::::::::::::::.::: .:::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::::.
CCDS47 DRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 TFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYG
.:::::::::.::::::::::.::::..:::::::::: ::::.::.::.::::: ::.:
CCDS47 AFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 NEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQATGFP
:::: ::.::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.::::
CCDS47 NEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 VTEMLVNVLNICSDDELISDDEA-EGSTTV-RKEIIRNKIRAIGKMARVFSILRQESESV
::::::::::::::::: :.... .:.:.. :::.::::::::::::::::.::.:::::
CCDS47 VTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 LTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFEEARGLDRIN
:::::::::: :: :::::::::...: :.::: :::: :::::.::::::
CCDS47 LTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSA----------IKGFSPQHKITSFEEAKGLDRIN
430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KB4 ERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS
::::::.:.. . . ..:...: . .. .:.. . :
CCDS47 ERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
480 490 500 510
>>CCDS44436.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 (515 aa)
initn: 2766 init1: 2154 opt: 2756 Z-score: 3416.5 bits: 641.7 E(32554): 5.6e-184
Smith-Waterman score: 2756; 81.4% identity (92.9% similar) in 495 aa overlap (12-502:24-507)
10 20 30 40
pF1KB4 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFE-NGKPKVDVLKNHLV
:::.::::::::.::: .:::. .: :.:::::::::
CCDS44 MAAPEPARAAPPPPPPPPPPPGADRVVKAVPFPPTHRLTSEEVFDLDGIPRVDVLKNHLV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 KEGRLEEEVALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNT
::::..::.::.:::.::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS44 KEGRVDEEIALRIINEGAAILRREKTMIEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYS
::::::::::::::::::::::: ::: .:.:::::::::::::::.::::::::.::::
CCDS44 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 EQVYDACMETFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLL
:.::.::::.:: :::::::::::::::::.:::: .:::::.:::: :::::::.::::
CCDS44 ERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 WSDPSEDYGNEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY
:::::::.::::. ::..:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 RKSQATGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 WSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELISDDEAE---GSTTVRKEIIRNKIRAIGKMARVF
::::::::::::::::::.:::::::... : . ::...:::::::::::::::::::
CCDS44 WSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDVGSAAARKEIIRNKIRAIGKMARVF
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 SILRQESESVLTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSF
:.::.::::::::::::::: :: :::.::.::...: ::::: :.: ::
CCDS44 SVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSA----------IRGFSPPHRICSF
430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KB4 EEARGLDRINERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS
:::.::::::::::::::... : ..:...::. :
CCDS44 EEAKGLDRINERMPPRKDAVQQDG-FNSLNTAHATENHGTGNHTAQ
480 490 500 510
>>CCDS59093.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 (521 aa)
initn: 2612 init1: 2612 opt: 2628 Z-score: 3257.6 bits: 612.4 E(32554): 4e-175
Smith-Waterman score: 3417; 98.3% identity (98.3% similar) in 521 aa overlap (1-512:1-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFENGKPKVDVLKNHLVKEGRLEEEVALKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFENGKPKVDVLKNHLVKEGRLEEEVALKI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 INDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYVDRGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 INDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYVDRGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYSEQVYDACMETFDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYSEQVYDACMETFDC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYGNEKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYGNEKT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQATGFPSLIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQATGFPSLIT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB4 LVNVLNICSDDELISDDEAE---------GSTTVRKEIIRNKIRAIGKMARVFSILRQES
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LVNVLNICSDDELISDDEAEDHYIPSYQKGSTTVRKEIIRNKIRAIGKMARVFSILRQES
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 ESVLTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFEEARGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ESVLTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFEEARGLD
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KB4 RINERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RINERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS
490 500 510 520
>>CCDS47113.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 (469 aa)
initn: 2231 init1: 1748 opt: 1895 Z-score: 2349.2 bits: 444.1 E(32554): 1.6e-124
Smith-Waterman score: 2377; 71.1% identity (84.8% similar) in 508 aa overlap (8-512:11-466)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFEN-GKPKVDVLKNHLVKEGRLEEEV
:::::::.:::::::..::: ::::.: :::.::.:: ::.::::::: :
CCDS47 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 ALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYV
::.::..::.::::::.....:::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS47 ALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 DRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYSEQVYDACME
::::::::::::::.::: .:::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::::.
CCDS47 DRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 TFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYG
.:::::::::.::::::::::.::::..:::::::::: ::::.::.::.::::: ::.:
CCDS47 AFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 NEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQATGFP
:::: ::.::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.::::
CCDS47 NEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
::::::::::::::::::
CCDS47 SLITIFSAPNYLDVYNNK------------------------------------------
310
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 VTEMLVNVLNICSDDELISDDEA-EGSTTV-RKEIIRNKIRAIGKMARVFSILRQESESV
::::::::::::::::: :.... .:.:.. :::.::::::::::::::::.::.:::::
CCDS47 VTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESV
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 LTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFEEARGLDRIN
:::::::::: :: :::::::::...: :.::: :::: :::::.::::::
CCDS47 LTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSA----------IKGFSPQHKITSFEEAKGLDRIN
380 390 400 410 420
480 490 500 510
pF1KB4 ERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS
::::::.:.. . . ..:...: . .. .:.. . :
CCDS47 ERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
430 440 450 460
>>CCDS8160.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 (330 aa)
initn: 741 init1: 614 opt: 683 Z-score: 848.5 bits: 165.9 E(32554): 6.1e-41
Smith-Waterman score: 744; 40.2% identity (73.7% similar) in 259 aa overlap (67-325:45-290)
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 PKVDVLKNHLVKEGRLEEEVALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMK
:. .. ..:..::. .:::::::..::..
CCDS81 RLLEVQGSRPGKNVQLTENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYYDLLR
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 LFEVGGSPSNTRYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYF
::: :: : .. ::::::::::: :.: . : . ::..:...::::::::: .. .
CCDS81 LFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIY
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 TFKQECRIKYSEQVYDACMETFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTE
: .::. .:. ... . . :.:::.::.......: :::.::.. :...::.. : :.
CCDS81 GFYDECKRRYNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTD
140 150 160 170 180 190
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 PPAFGPVCDLLWSDPSEDYGNEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRA
: : .::::::::..: .. . .: :: :. .. .: .::....: : ::
CCDS81 VPDQGLLCDLLWSDPDKD------VQGWGEND-RGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRA
200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 HEAQDAGYRMYRKSQATGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHP
:.. . ::... : : :.:.:::::: ..: .:... ....:
CCDS81 HQVVEDGYEFFAKRQ------LVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPADK
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 YWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELISDDEAEGSTTVRKEIIRNKIRA
CCDS81 NKGKYGQFSGLNPGGRPITPPRNSAKAKK
310 320 330
512 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 15:37:22 2016 done: Thu Nov 3 15:37:23 2016
Total Scan time: 3.000 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]