FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4944, 512 aa 1>>>pF1KB4944 512 - 512 aa - 512 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8192+/-0.000436; mu= 14.9137+/- 0.027 mean_var=68.3273+/-13.989, 0's: 0 Z-trim(110.4): 50 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.155159 statistics sampled from 18711 (18761) to 18711 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16 Scan time: 9.350 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005596 (OMIM: 114107) serine/threonine-protein ( 512) 3445 780.7 0 NP_001230904 (OMIM: 114107) serine/threonine-prote ( 502) 2989 678.6 1.1e-194 XP_016869099 (OMIM: 114107) PREDICTED: serine/thre ( 439) 2978 676.1 5.5e-194 NP_000935 (OMIM: 114105) serine/threonine-protein ( 521) 2855 648.6 1.3e-185 NP_066955 (OMIM: 114106) serine/threonine-protein ( 524) 2834 643.9 3.3e-184 NP_001135825 (OMIM: 114106) serine/threonine-prote ( 525) 2828 642.6 8.3e-184 XP_016863854 (OMIM: 114105) PREDICTED: serine/thre ( 509) 2806 637.7 2.5e-182 NP_001124163 (OMIM: 114105) serine/threonine-prote ( 511) 2780 631.8 1.4e-180 NP_001135826 (OMIM: 114106) serine/threonine-prote ( 515) 2756 626.5 5.8e-179 XP_005270001 (OMIM: 114106) PREDICTED: serine/thre ( 514) 2744 623.8 3.7e-178 NP_001230903 (OMIM: 114107) serine/threonine-prote ( 521) 2628 597.8 2.5e-170 XP_016869100 (OMIM: 114107) PREDICTED: serine/thre ( 418) 2612 594.2 2.4e-169 XP_016871868 (OMIM: 114106) PREDICTED: serine/thre ( 426) 2410 549.0 1e-155 NP_001276898 (OMIM: 114106) serine/threonine-prote ( 410) 2266 516.8 4.9e-146 NP_001276897 (OMIM: 114106) serine/threonine-prote ( 514) 1931 441.8 2.3e-123 NP_001124164 (OMIM: 114105) serine/threonine-prote ( 469) 1895 433.7 5.6e-121 NP_002699 (OMIM: 176875) serine/threonine-protein ( 330) 683 162.4 1.9e-39 NP_001008709 (OMIM: 176875) serine/threonine-prote ( 341) 683 162.4 2e-39 NP_002701 (OMIM: 176914) serine/threonine-protein ( 323) 678 161.3 4e-39 XP_011536807 (OMIM: 176914) PREDICTED: serine/thre ( 330) 678 161.3 4.1e-39 NP_001231903 (OMIM: 176914) serine/threonine-prote ( 337) 678 161.3 4.2e-39 XP_011536806 (OMIM: 176914) PREDICTED: serine/thre ( 362) 678 161.3 4.5e-39 NP_001009552 (OMIM: 176916) serine/threonine-prote ( 309) 675 160.6 6.2e-39 NP_002700 (OMIM: 600590) serine/threonine-protein ( 327) 673 160.1 8.9e-39 NP_996759 (OMIM: 600590) serine/threonine-protein ( 327) 673 160.1 8.9e-39 NP_001290432 (OMIM: 602035) serine/threonine-prote ( 307) 671 159.7 1.1e-38 NP_002711 (OMIM: 602035) serine/threonine-protein ( 307) 671 159.7 1.1e-38 NP_002706 (OMIM: 176915) serine/threonine-protein ( 309) 661 157.4 5.4e-38 XP_011517149 (OMIM: 612725) PREDICTED: serine/thre ( 293) 654 155.9 1.5e-37 NP_002712 (OMIM: 612725) serine/threonine-protein ( 305) 653 155.7 1.9e-37 NP_001116827 (OMIM: 612725) serine/threonine-prote ( 342) 653 155.7 2.1e-37 NP_996756 (OMIM: 176875) serine/threonine-protein ( 286) 633 151.2 3.9e-36 NP_006238 (OMIM: 600658) serine/threonine-protein ( 499) 629 150.3 1.2e-35 XP_016882424 (OMIM: 600658) PREDICTED: serine/thre ( 551) 629 150.4 1.3e-35 NP_001191213 (OMIM: 600658) serine/threonine-prote ( 477) 602 144.3 7.6e-34 NP_001290435 (OMIM: 602035) serine/threonine-prote ( 228) 482 117.3 4.8e-26 NP_001290436 (OMIM: 602035) serine/threonine-prote ( 228) 482 117.3 4.8e-26 XP_016878893 (OMIM: 602035) PREDICTED: serine/thre ( 228) 482 117.3 4.8e-26 XP_016878892 (OMIM: 602035) PREDICTED: serine/thre ( 228) 482 117.3 4.8e-26 NP_001116841 (OMIM: 612725) serine/threonine-prote ( 283) 480 116.9 7.9e-26 NP_001290433 (OMIM: 602035) serine/threonine-prote ( 273) 395 97.9 4.1e-20 XP_006721124 (OMIM: 602035) PREDICTED: serine/thre ( 273) 395 97.9 4.1e-20 XP_011530341 (OMIM: 602256) PREDICTED: serine/thre ( 753) 322 81.7 8.5e-15 NP_006230 (OMIM: 602256) serine/threonine-protein ( 753) 322 81.7 8.5e-15 NP_689410 (OMIM: 300109) serine/threonine-protein ( 625) 313 79.6 2.9e-14 XP_016885101 (OMIM: 300109) PREDICTED: serine/thre ( 563) 296 75.8 3.7e-13 NP_689412 (OMIM: 300109) serine/threonine-protein ( 591) 296 75.8 3.8e-13 XP_005274610 (OMIM: 300109) PREDICTED: serine/thre ( 653) 296 75.8 4.2e-13 NP_006231 (OMIM: 300109) serine/threonine-protein ( 653) 296 75.8 4.2e-13 >>NP_005596 (OMIM: 114107) serine/threonine-protein phos (512 aa) initn: 3445 init1: 3445 opt: 3445 Z-score: 4167.5 bits: 780.7 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 3445; 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83.0% identity (95.3% similar) in 494 aa overlap (12-502:24-516) 10 20 30 40 pF1KB4 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFE-NGKPKVDVLKNHLV :::.::::::::.::: .:::. .: :.::::::::: NP_066 MAAPEPARAAPPPPPPPPPPPGADRVVKAVPFPPTHRLTSEEVFDLDGIPRVDVLKNHLV 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB4 KEGRLEEEVALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNT ::::..::.::.:::.::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::.:: NP_066 KEGRVDEEIALRIINEGAAILRREKTMIEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB4 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYS ::::::::::::::::::::::: ::: .:.:::::::::::::::.::::::::.:::: NP_066 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB4 EQVYDACMETFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLL :.::.::::.:: :::::::::::::::::.:::: .:::::.:::: :::::::.:::: NP_066 ERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLL 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 WSDPSEDYGNEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY :::::::.::::. ::..:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: NP_066 WSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KB4 RKSQATGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_066 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 WSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELISD--DEAEGSTTVRKEIIRNKIRAIGKMARVFS ::::::::::::::::::.:::::::... :. .::...:::::::::::::::::::: NP_066 WSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDGSAAARKEIIRNKIRAIGKMARVFS 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 ILRQESESVLTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFE .::.::::::::::::::: :: :::.::.::...:::::.::..:::::: :.: ::: NP_066 VLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSATVEAIEAEKAIRGFSPPHRICSFE 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 pF1KB4 EARGLDRINERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS ::.::::::::::::::... : ..:...::. : NP_066 EAKGLDRINERMPPRKDAVQQDG-FNSLNTAHATENHGTGNHTAQ 490 500 510 520 >>NP_001135825 (OMIM: 114106) serine/threonine-protein p (525 aa) initn: 2810 init1: 2174 opt: 2828 Z-score: 3420.9 bits: 642.6 E(85289): 8.3e-184 Smith-Waterman score: 2828; 82.8% identity (94.9% similar) in 495 aa overlap (12-502:24-517) 10 20 30 40 pF1KB4 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFE-NGKPKVDVLKNHLV :::.::::::::.::: .:::. .: :.::::::::: NP_001 MAAPEPARAAPPPPPPPPPPPGADRVVKAVPFPPTHRLTSEEVFDLDGIPRVDVLKNHLV 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB4 KEGRLEEEVALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNT ::::..::.::.:::.::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::.:: NP_001 KEGRVDEEIALRIINEGAAILRREKTMIEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB4 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYS ::::::::::::::::::::::: ::: .:.:::::::::::::::.::::::::.:::: NP_001 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB4 EQVYDACMETFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLL :.::.::::.:: :::::::::::::::::.:::: .:::::.:::: :::::::.:::: NP_001 ERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLL 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 WSDPSEDYGNEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY :::::::.::::. ::..:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 WSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KB4 RKSQATGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 WSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELISDDEAE---GSTTVRKEIIRNKIRAIGKMARVF ::::::::::::::::::.:::::::... : . ::...::::::::::::::::::: NP_001 WSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDVGSAAARKEIIRNKIRAIGKMARVF 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 SILRQESESVLTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSF :.::.::::::::::::::: :: :::.::.::...:::::.::..:::::: :.: :: NP_001 SVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSATVEAIEAEKAIRGFSPPHRICSF 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 pF1KB4 EEARGLDRINERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS :::.::::::::::::::... : ..:...::. : NP_001 EEAKGLDRINERMPPRKDAVQQDG-FNSLNTAHATENHGTGNHTAQ 490 500 510 520 >>XP_016863854 (OMIM: 114105) PREDICTED: serine/threonin (509 aa) initn: 2709 init1: 2172 opt: 2806 Z-score: 3394.5 bits: 637.7 E(85289): 2.5e-182 Smith-Waterman score: 2806; 80.3% identity (94.4% similar) in 502 aa overlap (14-512:5-506) 10 20 30 40 50 pF1KB4 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFEN-GKPKVDVLKNHLVKEGRLEEEVALK . ::::::..::: ::::.: :::.::.:: ::.::::::: :::. XP_016 MLASICTAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESVALR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB4 IINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYVDRG ::..::.::::::.....:::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::: XP_016 IITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYVDRG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB4 YFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYSEQVYDACMETFD :::::::::::.::: .:::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::::..:: XP_016 YFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMDAFD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB4 CLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYGNEK :::::::.::::::::::.::::..:::::::::: ::::.::.::.::::: ::.:::: XP_016 CLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFGNEK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB4 TLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQATGFPSLI : ::.::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.::::::: XP_016 TQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB4 TIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 TIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB4 MLVNVLNICSDDELISDDEA-EGSTTV-RKEIIRNKIRAIGKMARVFSILRQESESVLTL :::::::::::::: :.... .:.:.. :::.::::::::::::::::.::.:::::::: XP_016 MLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESVLTL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB4 KGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFEEARGLDRINERM ::::::: :: :::::::::...:::::.:: :::.::: :::: :::::.::::::::: XP_016 KGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSATVEAIEADEAIKGFSPQHKITSFEEAKGLDRINERM 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KB4 PPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS :::.:.. . . ..:...: . .. .:.. . : XP_016 PPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ 480 490 500 >>NP_001124163 (OMIM: 114105) serine/threonine-protein p (511 aa) initn: 2655 init1: 2172 opt: 2780 Z-score: 3363.0 bits: 631.8 E(85289): 1.4e-180 Smith-Waterman score: 2780; 79.3% identity (93.1% similar) in 508 aa overlap (8-512:11-508) 10 20 30 40 50 pF1KB4 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFEN-GKPKVDVLKNHLVKEGRLEEEV :::::::.:::::::..::: ::::.: :::.::.:: ::.::::::: : NP_001 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB4 ALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYV ::.::..::.::::::.....:::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::: NP_001 ALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB4 DRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYSEQVYDACME ::::::::::::::.::: .:::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::::. NP_001 DRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB4 TFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYG .:::::::::.::::::::::.::::..:::::::::: ::::.::.::.::::: ::.: NP_001 AFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFG 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB4 NEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQATGFP :::: ::.::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.:::: NP_001 NEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFP 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB4 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KB4 VTEMLVNVLNICSDDELISDDEA-EGSTTV-RKEIIRNKIRAIGKMARVFSILRQESESV ::::::::::::::::: :.... .:.:.. :::.::::::::::::::::.::.::::: NP_001 VTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESV 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KB4 LTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFEEARGLDRIN :::::::::: :: :::::::::...: :.::: :::: :::::.:::::: NP_001 LTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSA----------IKGFSPQHKITSFEEAKGLDRIN 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KB4 ERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS ::::::.:.. . . ..:...: . .. .:.. . : NP_001 ERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ 480 490 500 510 >>NP_001135826 (OMIM: 114106) serine/threonine-protein p (515 aa) initn: 2766 init1: 2154 opt: 2756 Z-score: 3333.9 bits: 626.5 E(85289): 5.8e-179 Smith-Waterman score: 2756; 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