Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4964
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4964, 1464 aa
1>>>pF1KB4964 1464 - 1464 aa - 1464 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8689+/-0.00125; mu= 15.6381+/- 0.075
mean_var=106.2765+/-22.009, 0's: 0 Z-trim(103.6): 53 B-trim: 2 in 1/47
Lambda= 0.124410
statistics sampled from 7450 (7493) to 7450 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 4.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10539.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1464) 9837 1777.8 0
CCDS45407.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1281) 8455 1529.7 0
CCDS8662.1 GRIN2B gene_id:2904|Hs108|chr12 (1484) 4694 854.7 0
CCDS32724.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 (1233) 3444 630.3 1.1e-179
CCDS62330.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 ( 873) 3327 609.2 1.7e-173
CCDS12719.1 GRIN2D gene_id:2906|Hs108|chr19 (1336) 2694 495.7 3.8e-139
CCDS6758.1 GRIN3A gene_id:116443|Hs108|chr9 (1115) 914 176.2 4.9e-43
CCDS43910.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 885) 826 160.3 2.3e-38
CCDS7032.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 901) 826 160.3 2.3e-38
CCDS55355.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 906) 826 160.3 2.3e-38
CCDS7031.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 938) 826 160.4 2.4e-38
CCDS55354.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 943) 826 160.4 2.4e-38
CCDS32861.1 GRIN3B gene_id:116444|Hs108|chr19 (1043) 821 159.5 4.9e-38
CCDS416.1 GRIK3 gene_id:2899|Hs108|chr1 ( 919) 671 132.5 5.6e-30
CCDS5049.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 869) 662 130.9 1.6e-29
CCDS55045.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 892) 662 130.9 1.7e-29
CCDS5048.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 908) 662 130.9 1.7e-29
CCDS43275.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 836) 661 130.7 1.8e-29
CCDS3797.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 883) 661 130.7 1.9e-29
CCDS43274.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 883) 656 129.8 3.5e-29
CCDS42913.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 918) 652 129.1 5.9e-29
CCDS8333.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 902) 649 128.6 8.5e-29
CCDS33530.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 905) 649 128.6 8.5e-29
CCDS82658.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 920) 649 128.6 8.6e-29
CCDS82656.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 934) 649 128.6 8.7e-29
CCDS82659.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 949) 649 128.6 8.9e-29
CCDS41706.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 884) 647 128.2 1.1e-28
CCDS12595.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 980) 641 127.2 2.5e-28
CCDS77305.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 981) 641 127.2 2.5e-28
CCDS8433.1 GRIK4 gene_id:2900|Hs108|chr11 ( 956) 637 126.4 4e-28
CCDS47318.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 906) 628 124.8 1.2e-27
CCDS58988.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 916) 628 124.8 1.2e-27
CCDS58989.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 837) 624 124.1 1.8e-27
CCDS4322.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 906) 624 124.1 1.9e-27
CCDS58987.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 916) 624 124.1 1.9e-27
CCDS58986.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 826) 609 121.4 1.1e-26
CCDS31236.1 GRID1 gene_id:2894|Hs108|chr10 (1009) 564 113.3 3.7e-24
CCDS14604.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX ( 894) 559 112.4 6.1e-24
CCDS14605.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX ( 894) 559 112.4 6.1e-24
CCDS68758.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 ( 912) 520 105.4 8e-22
CCDS3637.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 (1007) 520 105.4 8.7e-22
>>CCDS10539.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1464 aa)
initn: 9837 init1: 9837 opt: 9837 Z-score: 9539.8 bits: 1777.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9837; 99.9% identity (100.0% similar) in 1464 aa overlap (1-1464:1-1464)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGRVGYWTLLVLPALLVWRGPAPSAAAEKGPPALNIAVMLGHSHDVTERELRTLWGPEQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGRVGYWTLLVLPALLVWRGPAPSAAAEKGPPALNIAVMLGHSHDVTERELRTLWGPEQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 AGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLMSGARIHGLVFGDDTDQEAVAQMLDFISSHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLMSGARIHGLVFGDDTDQEAVAQMLDFISSHT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FVPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLKIMQDYDWHVFSLVTTIFPGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FVPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLKIMQDYDWHVFSLVTTIFPGY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 REFISFVKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 REFISFVKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 SEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKEFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGIGILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKEFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGIGILT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TAASSMLEKFSYIPEAKASCYGQMERPEVPMHTLHPFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TAASSMLEKFSYIPEAKASCYGQMERPEVPMHTLHPFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 LVVIVLNKDREWEKVGKWENHTLSLRHAVWPRYKSFSDCEPDDNHLSIVTLEEAPFVIVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LVVIVLNKDREWEKVGKWENHTLSLRHAVWPRYKSFSDCEPDDNHLSIVTLEEAPFVIVE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 DIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 TNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 NGTVSPSAFLEPFSASVWVMMFVMLLIVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NGTVSPSAFLEPFSASVWVMMFVMLLIVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 IGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEFVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEFVD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 QVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 KTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 QFVGDGEMEELETLWLTGICHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QFVGDGEMEELETLWLTGICHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 FYWKLRFCFTGVCSDRPGLLFSISRGIYSCIHGVHIEEKKKSPDFNLTGSQSNMLKLLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FYWKLRFCFTGVCSDRPGLLFSISRGIYSCIHGVHIEEKKKSPDFNLTGSQSNMLKLLRS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 AKNISSMSNMNSSRMDSPKRAADFIQRGSLIMDMVSDKGNLMYSDNRSFQGKESIFGDNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AKNISSMSNMNSSRMDSPKRAADFIQRGSLIMDMVSDKGNLMYSDNRSFQGKESIFGDNM
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 NELQTFVANRQKDNLNNYVFQGQHPLTLNESNPNTVEVAVSTESKANSRPRQLWKKSVDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NELQTFVANRQKDNLNNYVFQGQHPLTLNESNPNTVEVAVSTESKANSRPRQLWKKSVDS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 IRQDSLSQNPVSQRDEATAENRTHSLKSPRYLPEEMAHSDFSETSNRATCHREPDNSKNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS10 IRQDSLSQNPVSQRDEATAENRTHSLKSPRYLPEEMAHSDISETSNRATCHREPDNSKNH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 KTKDNFKRSVASKYPKDCSEVERTYLKTKSSSPRDKIYTIDGEKEPGFHLDPPQFVENVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KTKDNFKRSVASKYPKDCSEVERTYLKTKSSSPRDKIYTIDGEKEPGFHLDPPQFVENVT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 LPENVDFPDPYQDPSENFRKGDSTLPMNRNPLHNEEGLSNNDQYKLYSKHFTLKDKGSPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPENVDFPDPYQDPSENFRKGDSTLPMNRNPLHNEEGLSNNDQYKLYSKHFTLKDKGSPH
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB4 SETSERYRQNSTHCRSCLSNMPTYSGHFTMRSPFKCDACLRMGNLYDIDEDQMLQETGNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SETSERYRQNSTHCRSCLSNMPTYSGHFTMRSPFKCDACLRMGNLYDIDEDQMLQETGNP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB4 ATGEQVYQQDWAQNNALQLQKNKLRISRQHSYDNIVDKPRELDLSRPSRSISLKDRERLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ATGEQVYQQDWAQNNALQLQKNKLRISRQHSYDNIVDKPRELDLSRPSRSISLKDRERLL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB4 EGNFYGSLFSVPSSKLSGKKSSLFPQGLEDSKRSKSLLPDHTSDNPFLHSHRDDQRLVIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EGNFYGSLFSVPSSKLSGKKSSLFPQGLEDSKRSKSLLPDHTSDNPFLHSHRDDQRLVIG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB4 RCPSDPYKHSLPSQAVNDSYLRSSLRSTASYCSRDSRGHNDVYISEHVMPYAANKNNMYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RCPSDPYKHSLPSQAVNDSYLRSSLRSTASYCSRDSRGHNDVYISEHVMPYAANKNNMYS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460
pF1KB4 TPRVLNSCSNRRVYKKMPSIESDV
::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TPRVLNSCSNRRVYKKMPSIESDV
1450 1460
>>CCDS45407.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1281 aa)
initn: 8455 init1: 8455 opt: 8455 Z-score: 8200.1 bits: 1529.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8455; 99.9% identity (100.0% similar) in 1258 aa overlap (1-1258:1-1258)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGRVGYWTLLVLPALLVWRGPAPSAAAEKGPPALNIAVMLGHSHDVTERELRTLWGPEQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MGRVGYWTLLVLPALLVWRGPAPSAAAEKGPPALNIAVMLGHSHDVTERELRTLWGPEQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 AGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLMSGARIHGLVFGDDTDQEAVAQMLDFISSHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLMSGARIHGLVFGDDTDQEAVAQMLDFISSHT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FVPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLKIMQDYDWHVFSLVTTIFPGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FVPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLKIMQDYDWHVFSLVTTIFPGY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 REFISFVKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 REFISFVKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 SEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKEFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGIGILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKEFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGIGILT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TAASSMLEKFSYIPEAKASCYGQMERPEVPMHTLHPFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TAASSMLEKFSYIPEAKASCYGQMERPEVPMHTLHPFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 LVVIVLNKDREWEKVGKWENHTLSLRHAVWPRYKSFSDCEPDDNHLSIVTLEEAPFVIVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LVVIVLNKDREWEKVGKWENHTLSLRHAVWPRYKSFSDCEPDDNHLSIVTLEEAPFVIVE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 DIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 TNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 NGTVSPSAFLEPFSASVWVMMFVMLLIVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NGTVSPSAFLEPFSASVWVMMFVMLLIVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 IGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEFVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEFVD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 QVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 KTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 QFVGDGEMEELETLWLTGICHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QFVGDGEMEELETLWLTGICHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHL
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850 860 870 880 890 900
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CCDS32 AIDLALLQFLGDGETQKLETVWLSGICQNEKNEVMSSKLDIDNMAGVFYMLLVAMGLALL
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CCDS32 VFAWEHLVYWKLRHSVPN--SSQLDFLLAFSRGIYSCFSGVQSLASPPRQASPDLTASSA
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CCDS62 MGGALGPALLLTSLFGAWAGLGPG----QGEQGMTVAVVFSSSGP-PQAQFRARLTPQS
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CCDS62 FLDLPLEIQPLTVGVNTTNPSSLLTQICGLLGAAHVHGIVFEDNVDTEAVAQILDFISSQ
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. :. :....: : :.: . .:.::. . :.:: :... . :.. :::..::
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....:: . ::.: :.::.:. :.:. : :: ::::: ..: ::. .::::..
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CCDS62 AIDLALLQFLGDGETQKLETVWLSGICQNEKNEVMSSKLDIDNMAGVFYMLLVAMGLALL
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CCDS62 VFAWEHLVYWKLRHSVPN--SSQLDFLLAFSRVGAHPSPHRPKF
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CCDS12 MYSCCSAEAAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVPRERASVDRWRRTKGAGPP
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. . . .: :.:.. ... .:...:.. ... :: . .:. ..: .. .
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CCDS67 HWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILV-RTRDTAAPIGAFM
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CCDS67 WPLHWTMWLGIFVALHI-TAVFLTLYEWKSPFGLT---PKGRN-RSKVFSFSSALNICYA
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CCDS67 LLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGIHDPKL
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pF1KB4 IYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEM
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CCDS67 IMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKP--FAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSHGFM
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pF1KB4 EELETLWLTGI-CHNEKNEVMSS-QLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHLFYWKLR
. :. : . : ... : . :. : ...:.: .: ...::..: : ::. : :
CCDS67 DMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVY---R
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pF1KB4 FCFTGVCSDRPGLLFSI--SRGIYSCIHGVHIEEKKKSPDFNLTGSQSNMLKLLRSAKNI
. . . ... : . . :. .. :. ::::.. . . ..::. .. :
CCDS67 LLLPRI-KNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWNT
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pF1KB4 SSMSNMNSSRMDSPKRAADFIQRGSLIMDMVSDKGNLMYSDNRSFQGKESIFGDNMNELQ
:..:. : .
CCDS67 SNLSHDNRRKYIFSDEEGQNQLGIRIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGKADSLNVSRNSVM
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CCDS43 MSTMRLLTLALLFSCSVARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVN-QANKR
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pF1KB4 AAGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVC-DLMSGARIHGLVFGDDTDQEAVAQM-LDFIS
.. ...:.... .. . .. :: ::.:. :: : .. . ... .
CCDS43 HGSWKIQLNATSVT-HKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYTA
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. .:.::. : :..::. .:.. ..:..: ...:. :.: :.. ::.
CCDS43 GFYRIPVLGLTTRMS-IYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIILLVSDD
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CCDS43 HEG-RAAQKRLETLLEERES--KAEKVLQFDPGTKNVTALLMEAKELEARVIILSASEDD
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:. . : :..:: . :.: .:::. . :.:..... . . :.. :
CCDS43 AATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNAL---RYAPDGILGLQLIN-GKNESAHISD
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pF1KB4 GIGILTTAASSMLEKFSYIPEAKASCYGQMERPEVPMHTLHPFMVNVTWDGKD--LSFTE
..:... :. .::: . : . .: :. . .. . .: . :: . :.:
CCDS43 AVGVVAQAVHELLEKEN-ITDPPRGCVGNTNIWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNE
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.: . .. : ..:. .:: ... :.. . :. .:: .. . . ...:.::
CCDS43 DGDRKFANYSIMNL-QNRKLVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRLKIV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]