Result of FASTA (omim) for
pF1KB4964
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4964, 1464 aa
1>>>pF1KB4964 1464 - 1464 aa - 1464 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6085+/-0.00053; mu= 17.2845+/- 0.033
mean_var=118.3336+/-24.093, 0's: 0 Z-trim(110.4): 121 B-trim: 18 in 1/51
Lambda= 0.117902
statistics sampled from 18619 (18740) to 18619 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16
Scan time: 12.460
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001127879 (OMIM: 138253,245570) glutamate recep (1464) 9837 1686.2 0
NP_000824 (OMIM: 138253,245570) glutamate receptor (1464) 9837 1686.2 0
XP_016878661 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1516) 9837 1686.2 0
XP_011520760 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1307) 8787 1507.5 0
NP_001127880 (OMIM: 138253,245570) glutamate recep (1281) 8455 1451.0 0
XP_011520763 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1281) 8455 1451.0 0
XP_016878662 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1333) 8455 1451.1 0
XP_011518930 (OMIM: 138252,613970,616139) PREDICTE (1484) 4694 811.4 0
XP_011518931 (OMIM: 138252,613970,616139) PREDICTE (1484) 4694 811.4 0
XP_016874708 (OMIM: 138252,613970,616139) PREDICTE (1484) 4694 811.4 0
NP_000825 (OMIM: 138252,613970,616139) glutamate r (1484) 4694 811.4 0
XP_006721909 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1307) 3447 599.2 6.8e-170
NP_000826 (OMIM: 138254) glutamate receptor ionotr (1233) 3444 598.7 9.3e-170
XP_006721908 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1308) 3444 598.7 9.7e-170
XP_011522990 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1316) 3360 584.4 2e-165
NP_001265482 (OMIM: 138254) glutamate receptor ion ( 873) 3327 578.7 7e-164
NP_000827 (OMIM: 602717,617162) glutamate receptor (1336) 2694 471.1 2.5e-131
XP_011525174 (OMIM: 602717,617162) PREDICTED: glut (1336) 2694 471.1 2.5e-131
XP_011522988 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1336) 2358 414.0 4e-114
XP_011522994 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r ( 879) 2355 413.3 4.1e-114
XP_011522991 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1262) 2355 413.4 5.5e-114
XP_011522989 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1329) 2355 413.5 5.7e-114
XP_016880033 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1337) 2355 413.5 5.7e-114
XP_005253408 (OMIM: 138252,613970,616139) PREDICTE ( 746) 1282 230.8 3.2e-59
NP_597702 (OMIM: 606650) glutamate receptor ionotr (1115) 914 168.3 3e-40
XP_011516513 (OMIM: 606650) PREDICTED: glutamate r ( 925) 836 155.0 2.6e-36
NP_000823 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ( 885) 826 153.3 8.1e-36
XP_011516885 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 892) 826 153.3 8.2e-36
NP_067544 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ( 901) 826 153.3 8.2e-36
NP_001172020 (OMIM: 138249,614254) glutamate recep ( 906) 826 153.3 8.3e-36
XP_005266129 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 922) 826 153.3 8.4e-36
XP_005266128 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 922) 826 153.3 8.4e-36
NP_015566 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ( 938) 826 153.3 8.5e-36
NP_001172019 (OMIM: 138249,614254) glutamate recep ( 943) 826 153.3 8.5e-36
XP_005266130 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 959) 826 153.3 8.6e-36
NP_619635 (OMIM: 606651) glutamate receptor ionotr (1043) 821 152.5 1.7e-35
NP_000822 (OMIM: 138243) glutamate receptor ionotr ( 919) 671 126.9 7.2e-28
XP_005267003 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 859) 662 125.4 2e-27
NP_786944 (OMIM: 138244,611092) glutamate receptor ( 869) 662 125.4 2e-27
XP_011534080 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 869) 662 125.4 2e-27
NP_001159719 (OMIM: 138244,611092) glutamate recep ( 892) 662 125.4 2e-27
XP_011534079 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 892) 662 125.4 2e-27
NP_068775 (OMIM: 138244,611092) glutamate receptor ( 908) 662 125.4 2.1e-27
XP_005267002 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 908) 662 125.4 2.1e-27
XP_016863605 (OMIM: 138247) PREDICTED: glutamate r ( 836) 661 125.2 2.2e-27
XP_016863606 (OMIM: 138247) PREDICTED: glutamate r ( 836) 661 125.2 2.2e-27
NP_001077089 (OMIM: 138247) glutamate receptor 2 i ( 836) 660 125.0 2.5e-27
NP_000817 (OMIM: 138247) glutamate receptor 2 isof ( 883) 660 125.0 2.6e-27
XP_016863603 (OMIM: 138247) PREDICTED: glutamate r ( 836) 656 124.3 3.9e-27
XP_016863602 (OMIM: 138247) PREDICTED: glutamate r ( 836) 656 124.3 3.9e-27
>>NP_001127879 (OMIM: 138253,245570) glutamate receptor (1464 aa)
initn: 9837 init1: 9837 opt: 9837 Z-score: 9044.6 bits: 1686.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9837; 99.9% identity (100.0% similar) in 1464 aa overlap (1-1464:1-1464)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGRVGYWTLLVLPALLVWRGPAPSAAAEKGPPALNIAVMLGHSHDVTERELRTLWGPEQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGRVGYWTLLVLPALLVWRGPAPSAAAEKGPPALNIAVMLGHSHDVTERELRTLWGPEQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 AGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLMSGARIHGLVFGDDTDQEAVAQMLDFISSHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLMSGARIHGLVFGDDTDQEAVAQMLDFISSHT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FVPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLKIMQDYDWHVFSLVTTIFPGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLKIMQDYDWHVFSLVTTIFPGY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 REFISFVKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REFISFVKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 SEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKEFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGIGILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKEFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGIGILT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TAASSMLEKFSYIPEAKASCYGQMERPEVPMHTLHPFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAASSMLEKFSYIPEAKASCYGQMERPEVPMHTLHPFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 LVVIVLNKDREWEKVGKWENHTLSLRHAVWPRYKSFSDCEPDDNHLSIVTLEEAPFVIVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVVIVLNKDREWEKVGKWENHTLSLRHAVWPRYKSFSDCEPDDNHLSIVTLEEAPFVIVE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 DIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 TNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 NGTVSPSAFLEPFSASVWVMMFVMLLIVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NGTVSPSAFLEPFSASVWVMMFVMLLIVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 IGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEFVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEFVD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 QVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 KTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 QFVGDGEMEELETLWLTGICHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFVGDGEMEELETLWLTGICHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 FYWKLRFCFTGVCSDRPGLLFSISRGIYSCIHGVHIEEKKKSPDFNLTGSQSNMLKLLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FYWKLRFCFTGVCSDRPGLLFSISRGIYSCIHGVHIEEKKKSPDFNLTGSQSNMLKLLRS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 AKNISSMSNMNSSRMDSPKRAADFIQRGSLIMDMVSDKGNLMYSDNRSFQGKESIFGDNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKNISSMSNMNSSRMDSPKRAADFIQRGSLIMDMVSDKGNLMYSDNRSFQGKESIFGDNM
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 NELQTFVANRQKDNLNNYVFQGQHPLTLNESNPNTVEVAVSTESKANSRPRQLWKKSVDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NELQTFVANRQKDNLNNYVFQGQHPLTLNESNPNTVEVAVSTESKANSRPRQLWKKSVDS
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pF1KB4 IRQDSLSQNPVSQRDEATAENRTHSLKSPRYLPEEMAHSDFSETSNRATCHREPDNSKNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
NP_001 IRQDSLSQNPVSQRDEATAENRTHSLKSPRYLPEEMAHSDISETSNRATCHREPDNSKNH
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pF1KB4 KTKDNFKRSVASKYPKDCSEVERTYLKTKSSSPRDKIYTIDGEKEPGFHLDPPQFVENVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTKDNFKRSVASKYPKDCSEVERTYLKTKSSSPRDKIYTIDGEKEPGFHLDPPQFVENVT
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1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 LPENVDFPDPYQDPSENFRKGDSTLPMNRNPLHNEEGLSNNDQYKLYSKHFTLKDKGSPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPENVDFPDPYQDPSENFRKGDSTLPMNRNPLHNEEGLSNNDQYKLYSKHFTLKDKGSPH
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pF1KB4 SETSERYRQNSTHCRSCLSNMPTYSGHFTMRSPFKCDACLRMGNLYDIDEDQMLQETGNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SETSERYRQNSTHCRSCLSNMPTYSGHFTMRSPFKCDACLRMGNLYDIDEDQMLQETGNP
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pF1KB4 ATGEQVYQQDWAQNNALQLQKNKLRISRQHSYDNIVDKPRELDLSRPSRSISLKDRERLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATGEQVYQQDWAQNNALQLQKNKLRISRQHSYDNIVDKPRELDLSRPSRSISLKDRERLL
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pF1KB4 EGNFYGSLFSVPSSKLSGKKSSLFPQGLEDSKRSKSLLPDHTSDNPFLHSHRDDQRLVIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGNFYGSLFSVPSSKLSGKKSSLFPQGLEDSKRSKSLLPDHTSDNPFLHSHRDDQRLVIG
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pF1KB4 RCPSDPYKHSLPSQAVNDSYLRSSLRSTASYCSRDSRGHNDVYISEHVMPYAANKNNMYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RCPSDPYKHSLPSQAVNDSYLRSSLRSTASYCSRDSRGHNDVYISEHVMPYAANKNNMYS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460
pF1KB4 TPRVLNSCSNRRVYKKMPSIESDV
::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPRVLNSCSNRRVYKKMPSIESDV
1450 1460
>>NP_000824 (OMIM: 138253,245570) glutamate receptor ion (1464 aa)
initn: 9837 init1: 9837 opt: 9837 Z-score: 9044.6 bits: 1686.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9837; 99.9% identity (100.0% similar) in 1464 aa overlap (1-1464:1-1464)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGRVGYWTLLVLPALLVWRGPAPSAAAEKGPPALNIAVMLGHSHDVTERELRTLWGPEQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MGRVGYWTLLVLPALLVWRGPAPSAAAEKGPPALNIAVMLGHSHDVTERELRTLWGPEQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 AGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLMSGARIHGLVFGDDTDQEAVAQMLDFISSHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLMSGARIHGLVFGDDTDQEAVAQMLDFISSHT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FVPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLKIMQDYDWHVFSLVTTIFPGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FVPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLKIMQDYDWHVFSLVTTIFPGY
130 140 150 160 170 180
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pF1KB4 REFISFVKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 REFISFVKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLIL
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pF1KB4 SEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKEFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGIGILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKEFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGIGILT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TAASSMLEKFSYIPEAKASCYGQMERPEVPMHTLHPFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TAASSMLEKFSYIPEAKASCYGQMERPEVPMHTLHPFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPR
310 320 330 340 350 360
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pF1KB4 LVVIVLNKDREWEKVGKWENHTLSLRHAVWPRYKSFSDCEPDDNHLSIVTLEEAPFVIVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LVVIVLNKDREWEKVGKWENHTLSLRHAVWPRYKSFSDCEPDDNHLSIVTLEEAPFVIVE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 DIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 TNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRS
490 500 510 520 530 540
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pF1KB4 NGTVSPSAFLEPFSASVWVMMFVMLLIVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NGTVSPSAFLEPFSASVWVMMFVMLLIVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEFVD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_000 TPRVLNSCSNRRVYKKMPSIESDV
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Smith-Waterman score: 9837; 99.9% identity (100.0% similar) in 1464 aa overlap (1-1464:53-1516)
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40 50 60 70 80 90
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPALNIAVMLGHSHDVTERELRTLWGPEQAAGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IQQQATVMLKIMQDYDWHVFSLVTTIFPGYREFISFVKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSF
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pF1KB4 EDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLILSEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLILSEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MHTLHPFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPRLVVIVLNKDREWEKVGKWENHTLSLRHAVW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRYKSFSDCEPDDNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFTIGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIM
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pF1KB4 VSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEFVDQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEFVDQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGST
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTI
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pF1KB4 GSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICHNEKNEVMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICHNEKNEVMSS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHLFYWKLRFCFTGVCSDRPGLLFSISRGIYSC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB4 IMDMVSDKGNLMYSDNRSFQGKESIFGDNMNELQTFVANRQKDNLNNYVFQGQHPLTLNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IMDMVSDKGNLMYSDNRSFQGKESIFGDNMNELQTFVANRQKDNLNNYVFQGQHPLTLNE
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pF1KB4 SNPNTVEVAVSTESKANSRPRQLWKKSVDSIRQDSLSQNPVSQRDEATAENRTHSLKSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SNPNTVEVAVSTESKANSRPRQLWKKSVDSIRQDSLSQNPVSQRDEATAENRTHSLKSPR
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::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YLPEEMAHSDISETSNRATCHREPDNSKNHKTKDNFKRSVASKYPKDCSEVERTYLKTKS
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pF1KB4 SSPRDKIYTIDGEKEPGFHLDPPQFVENVTLPENVDFPDPYQDPSENFRKGDSTLPMNRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSPRDKIYTIDGEKEPGFHLDPPQFVENVTLPENVDFPDPYQDPSENFRKGDSTLPMNRN
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pF1KB4 PLHNEEGLSNNDQYKLYSKHFTLKDKGSPHSETSERYRQNSTHCRSCLSNMPTYSGHFTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLHNEEGLSNNDQYKLYSKHFTLKDKGSPHSETSERYRQNSTHCRSCLSNMPTYSGHFTM
1230 1240 1250 1260 1270 1280
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pF1KB4 RSPFKCDACLRMGNLYDIDEDQMLQETGNPATGEQVYQQDWAQNNALQLQKNKLRISRQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RSPFKCDACLRMGNLYDIDEDQMLQETGNPATGEQVYQQDWAQNNALQLQKNKLRISRQH
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pF1KB4 SYDNIVDKPRELDLSRPSRSISLKDRERLLEGNFYGSLFSVPSSKLSGKKSSLFPQGLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SYDNIVDKPRELDLSRPSRSISLKDRERLLEGNFYGSLFSVPSSKLSGKKSSLFPQGLED
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pF1KB4 SKRSKSLLPDHTSDNPFLHSHRDDQRLVIGRCPSDPYKHSLPSQAVNDSYLRSSLRSTAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SKRSKSLLPDHTSDNPFLHSHRDDQRLVIGRCPSDPYKHSLPSQAVNDSYLRSSLRSTAS
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1420 1430 1440 1450 1460
pF1KB4 YCSRDSRGHNDVYISEHVMPYAANKNNMYSTPRVLNSCSNRRVYKKMPSIESDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YCSRDSRGHNDVYISEHVMPYAANKNNMYSTPRVLNSCSNRRVYKKMPSIESDV
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130 140 150 160 170 180
pF1KB4 HGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLKIMQDYDWHVFSLVTTIFPGYREFISFV
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLKIMQDYDWHVFSLVTTIFPGYREFISFV
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pF1KB4 KTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLILSEARSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLILSEARSLG
40 50 60 70 80 90
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pF1KB4 LTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKEFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGIGILTTAASSML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKEFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGIGILTTAASSML
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 EKFSYIPEAKASCYGQMERPEVPMHTLHPFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPRLVVIVLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKFSYIPEAKASCYGQMERPEVPMHTLHPFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPRLVVIVLN
160 170 180 190 200 210
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pF1KB4 KDREWEKVGKWENHTLSLRHAVWPRYKSFSDCEPDDNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KDREWEKVGKWENHTLSLRHAVWPRYKSFSDCEPDDNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTE
220 230 240 250 260 270
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pF1KB4 TCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGK
280 290 300 310 320 330
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pF1KB4 KVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRSNGTVSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRSNGTVSPS
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pF1KB4 AFLEPFSASVWVMMFVMLLIVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFTIGKAIWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AFLEPFSASVWVMMFVMLLIVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFTIGKAIWL
400 410 420 430 440 450
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pF1KB4 LWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEFVDQVTGLSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEFVDQVTGLSD
460 470 480 490 500 510
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pF1KB4 KKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDA
520 530 540 550 560 570
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pF1KB4 FIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGE
580 590 600 610 620 630
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pF1KB4 MEELETLWLTGICHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHLFYWKLRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MEELETLWLTGICHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHLFYWKLRF
640 650 660 670 680 690
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pF1KB4 CFTGVCSDRPGLLFSISRGIYSCIHGVHIEEKKKSPDFNLTGSQSNMLKLLRSAKNISSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CFTGVCSDRPGLLFSISRGIYSCIHGVHIEEKKKSPDFNLTGSQSNMLKLLRSAKNISSM
700 710 720 730 740 750
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pF1KB4 SNMNSSRMDSPKRAADFIQRGSLIMDMVSDKGNLMYSDNRSFQGKESIFGDNMNELQTFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SNMNSSRMDSPKRAADFIQRGSLIMDMVSDKGNLMYSDNRSFQGKESIFGDNMNELQTFV
760 770 780 790 800 810
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pF1KB4 ANRQKDNLNNYVFQGQHPLTLNESNPNTVEVAVSTESKANSRPRQLWKKSVDSIRQDSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ANRQKDNLNNYVFQGQHPLTLNESNPNTVEVAVSTESKANSRPRQLWKKSVDSIRQDSLS
820 830 840 850 860 870
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pF1KB4 QNPVSQRDEATAENRTHSLKSPRYLPEEMAHSDFSETSNRATCHREPDNSKNHKTKDNFK
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QNPVSQRDEATAENRTHSLKSPRYLPEEMAHSDISETSNRATCHREPDNSKNHKTKDNFK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSVASKYPKDCSEVERTYLKTKSSSPRDKIYTIDGEKEPGFHLDPPQFVENVTLPENVDF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PDPYQDPSENFRKGDSTLPMNRNPLHNEEGLSNNDQYKLYSKHFTLKDKGSPHSETSERY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::
XP_011 CSNRRVYKKMPSIESDV
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Smith-Waterman score: 8455; 99.9% identity (100.0% similar) in 1258 aa overlap (1-1258:1-1258)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 AGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLMSGARIHGLVFGDDTDQEAVAQMLDFISSHT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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Smith-Waterman score: 8455; 99.9% identity (100.0% similar) in 1258 aa overlap (1-1258:1-1258)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGRVGYWTLLVLPALLVWRGPAPSAAAEKGPPALNIAVMLGHSHDVTERELRTLWGPEQA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLMSGARIHGLVFGDDTDQEAVAQMLDFISSHT
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FVPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLKIMQDYDWHVFSLVTTIFPGY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 REFISFVKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFEDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLIL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKEFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGIGILT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TAASSMLEKFSYIPEAKASCYGQMERPEVPMHTLHPFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LVVIVLNKDREWEKVGKWENHTLSLRHAVWPRYKSFSDCEPDDNHLSIVTLEEAPFVIVE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NGTVSPSAFLEPFSASVWVMMFVMLLIVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEFVD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALL
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pF1KB4 QFVGDGEMEELETLWLTGICHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QFVGDGEMEELETLWLTGICHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHL
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pF1KB4 FYWKLRFCFTGVCSDRPGLLFSISRGIYSCIHGVHIEEKKKSPDFNLTGSQSNMLKLLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FYWKLRFCFTGVCSDRPGLLFSISRGIYSCIHGVHIEEKKKSPDFNLTGSQSNMLKLLRS
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pF1KB4 AKNISSMSNMNSSRMDSPKRAADFIQRGSLIMDMVSDKGNLMYSDNRSFQGKESIFGDNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AKNISSMSNMNSSRMDSPKRAADFIQRGSLIMDMVSDKGNLMYSDNRSFQGKESIFGDNM
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pF1KB4 NELQTFVANRQKDNLNNYVFQGQHPLTLNESNPNTVEVAVSTESKANSRPRQLWKKSVDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NELQTFVANRQKDNLNNYVFQGQHPLTLNESNPNTVEVAVSTESKANSRPRQLWKKSVDS
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KB4 IRQDSLSQNPVSQRDEATAENRTHSLKSPRYLPEEMAHSDFSETSNRATCHREPDNSKNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
XP_011 IRQDSLSQNPVSQRDEATAENRTHSLKSPRYLPEEMAHSDISETSNRATCHREPDNSKNH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 KTKDNFKRSVASKYPKDCSEVERTYLKTKSSSPRDKIYTIDGEKEPGFHLDPPQFVENVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KTKDNFKRSVASKYPKDCSEVERTYLKTKSSSPRDKIYTIDGEKEPGFHLDPPQFVENVT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KB4 LPENVDFPDPYQDPSENFRKGDSTLPMNRNPLHNEEGLSNNDQYKLYSKHFTLKDKGSPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPENVDFPDPYQDPSENFRKGDSTLPMNRNPLHNEEGLSNNDQYKLYSKHFTLKDKGSPH
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB4 SETSERYRQNSTHCRSCLSNMPTYSGHFTMRSPFKCDACLRMGNLYDIDEDQMLQETGNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SETSERYRQNSTHCRSCLSNMPTYSGHFTMRSPFKCDACLRMGNLYDIDEDQMLQETGMT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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pF1KB4 ATGEQVYQQDWAQNNALQLQKNKLRISRQHSYDNIVDKPRELDLSRPSRSISLKDRERLL
XP_011 NAWLLGDAPRTLTNTRCHPRR
1270 1280
>>XP_016878662 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glutamat (1333 aa)
initn: 8455 init1: 8455 opt: 8455 Z-score: 7774.7 bits: 1451.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8455; 99.9% identity (100.0% similar) in 1258 aa overlap (1-1258:53-1310)
10 20 30
pF1KB4 MGRVGYWTLLVLPALLVWRGPAPSAAAEKG
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AKLVIPFFWSPCSPRPCLSLFTLQGPSVATMGRVGYWTLLVLPALLVWRGPAPSAAAEKG
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pF1KB4 PPALNIAVMLGHSHDVTERELRTLWGPEQAAGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPALNIAVMLGHSHDVTERELRTLWGPEQAAGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLM
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 SGARIHGLVFGDDTDQEAVAQMLDFISSHTFVPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SGARIHGLVFGDDTDQEAVAQMLDFISSHTFVPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGAS
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 IQQQATVMLKIMQDYDWHVFSLVTTIFPGYREFISFVKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IQQQATVMLKIMQDYDWHVFSLVTTIFPGYREFISFVKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSF
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 EDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLILSEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EDAKTQVQLKKIHSSVILLYCSKDEAVLILSEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPK
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 EFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGIGILTTAASSMLEKFSYIPEAKASCYGQMERPEVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EFPSGLISVSYDDWDYSLEARVRDGIGILTTAASSMLEKFSYIPEAKASCYGQMERPEVP
330 340 350 360 370 380
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pF1KB4 MHTLHPFMVNVTWDGKDLSFTEEGYQVHPRLVVIVLNKDREWEKVGKWENHTLSLRHAVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]