Result of FASTA (ccds) for pF1KB4967
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4967, 2414 aa
  1>>>pF1KB4967 2414 - 2414 aa - 2414 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.1982+/-0.00124; mu= -21.9027+/- 0.075
 mean_var=746.7023+/-154.709, 0's: 0 Z-trim(115.9): 74  B-trim: 0 in 0/56
 Lambda= 0.046935
 statistics sampled from 16461 (16516) to 16461 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.767), E-opt: 0.2 (0.507), width:  16
 Scan time:  9.390

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14010.1 EP300 gene_id:2033|Hs108|chr22         (2414) 16836 1157.2       0
CCDS45399.1 CREBBP gene_id:1387|Hs108|chr16        (2404) 7025 492.9 7.9e-138
CCDS10509.1 CREBBP gene_id:1387|Hs108|chr16        (2442) 6812 478.5 1.7e-133


>>CCDS14010.1 EP300 gene_id:2033|Hs108|chr22              (2414 aa)
 initn: 16836 init1: 16836 opt: 16836  Z-score: 6178.3  bits: 1157.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 16836; 100.0% identity (100.0% similar) in 2414 aa overlap (1-2414:1-2414)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAENVVEPGPPSAKRPKLSSPALSASASDGTDFGSLFDLEHDLPDELINSTELGLTNGGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAENVVEPGPPSAKRPKLSSPALSASASDGTDFGSLFDLEHDLPDELINSTELGLTNGGD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 INQLQTSLGMVQDAASKHKQLSELLRSGSSPNLNMGVGGPGQVMASQAQQSSPGLGLINS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 INQLQTSLGMVQDAASKHKQLSELLRSGSSPNLNMGVGGPGQVMASQAQQSSPGLGLINS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 MVKSPMTQAGLTSPNMGMGTSGPNQGPTQSTGMMNSPVNQPAMGMNTGMNAGMNPGMLAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MVKSPMTQAGLTSPNMGMGTSGPNQGPTQSTGMMNSPVNQPAMGMNTGMNAGMNPGMLAA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 GNGQGIMPNQVMNGSIGAGRGRQNMQYPNPGMGSAGNLLTEPLQQGSPQMGGQTGLRGPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GNGQGIMPNQVMNGSIGAGRGRQNMQYPNPGMGSAGNLLTEPLQQGSPQMGGQTGLRGPQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 PLKMGMMNNPNPYGSPYTQNPGQQIGASGLGLQIQTKTVLSNNLSPFAMDKKAVPGGGMP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PLKMGMMNNPNPYGSPYTQNPGQQIGASGLGLQIQTKTVLSNNLSPFAMDKKAVPGGGMP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 NMGQQPAPQVQQPGLVTPVAQGMGSGAHTADPEKRKLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NMGQQPAPQVQQPGLVTPVAQGMGSGAHTADPEKRKLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 VRQCNLPHCRTMKNVLNHMTHCQSGKSCQVAHCASSRQIISHWKNCTRHDCPVCLPLKNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VRQCNLPHCRTMKNVLNHMTHCQSGKSCQVAHCASSRQIISHWKNCTRHDCPVCLPLKNA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 GDKRNQQPILTGAPVGLGNPSSLGVGQQSAPNLSTVSQIDPSSIERAYAALGLPYQVNQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GDKRNQQPILTGAPVGLGNPSSLGVGQQSAPNLSTVSQIDPSSIERAYAALGLPYQVNQM
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 PTQPQVQAKNQQNQQPGQSPQGMRPMSNMSASPMGVNGGVGVQTPSLLSDSMLHSAINSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PTQPQVQAKNQQNQQPGQSPQGMRPMSNMSASPMGVNGGVGVQTPSLLSDSMLHSAINSQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 NPMMSENASVPSLGPMPTAAQPSTTGIRKQWHEDITQDLRNHLVHKLVQAIFPTPDPAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NPMMSENASVPSLGPMPTAAQPSTTGIRKQWHEDITQDLRNHLVHKLVQAIFPTPDPAAL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 KDRRMENLVAYARKVEGDMYESANNRAEYYHLLAEKIYKIQKELEEKRRTRLQKQNMLPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KDRRMENLVAYARKVEGDMYESANNRAEYYHLLAEKIYKIQKELEEKRRTRLQKQNMLPN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 AAGMVPVSMNPGPNMGQPQPGMTSNGPLPDPSMIRGSVPNQMMPRITPQSGLNQFGQMSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAGMVPVSMNPGPNMGQPQPGMTSNGPLPDPSMIRGSVPNQMMPRITPQSGLNQFGQMSM
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 AQPPIVPRQTPPLQHHGQLAQPGALNPPMGYGPRMQQPSNQGQFLPQTQFPSQGMNVTNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AQPPIVPRQTPPLQHHGQLAQPGALNPPMGYGPRMQQPSNQGQFLPQTQFPSQGMNVTNI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 PLAPSSGQAPVSQAQMSSSSCPVNSPIMPPGSQGSHIHCPQLPQPALHQNSPSPVPSRTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PLAPSSGQAPVSQAQMSSSSCPVNSPIMPPGSQGSHIHCPQLPQPALHQNSPSPVPSRTP
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 TPHHTPPSIGAQQPPATTIPAPVPTPPAMPPGPQSQALHPPPRQTPTPPTTQLPQQVQPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TPHHTPPSIGAQQPPATTIPAPVPTPPAMPPGPQSQALHPPPRQTPTPPTTQLPQQVQPS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB4 LPAAPSADQPQQQPRSQQSTAASVPTPTAPLLPPQPATPLSQPAVSIEGQVSNPPSTSST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LPAAPSADQPQQQPRSQQSTAASVPTPTAPLLPPQPATPLSQPAVSIEGQVSNPPSTSST
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB4 EVNSQAIAEKQPSQEVKMEAKMEVDQPEPADTQPEDISESKVEDCKMESTETEERSTELK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EVNSQAIAEKQPSQEVKMEAKMEVDQPEPADTQPEDISESKVEDCKMESTETEERSTELK
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB4 TEIKEEEDQPSTSATQSSPAPGQSKKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TEIKEEEDQPSTSATQSSPAPGQSKKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVD
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB4 PQLLGIPDYFDIVKSPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDIWLMFNNAWLYNRKTSRVYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PQLLGIPDYFDIVKSPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDIWLMFNNAWLYNRKTSRVYK
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB4 YCSKLSEVFEQEIDPVMQSLGYCCGRKLEFSPQTLCCYGKQLCTIPRDATYYSYQNRYHF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YCSKLSEVFEQEIDPVMQSLGYCCGRKLEFSPQTLCCYGKQLCTIPRDATYYSYQNRYHF
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB4 CEKCFNEIQGESVSLGDDPSQPQTTINKEQFSKRKNDTLDPELFVECTECGRKMHQICVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CEKCFNEIQGESVSLGDDPSQPQTTINKEQFSKRKNDTLDPELFVECTECGRKMHQICVL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB4 HHEIIWPAGFVCDGCLKKSARTRKENKFSAKRLPSTRLGTFLENRVNDFLRRQNHPESGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HHEIIWPAGFVCDGCLKKSARTRKENKFSAKRLPSTRLGTFLENRVNDFLRRQNHPESGE
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB4 VTVRVVHASDKTVEVKPGMKARFVDSGEMAESFPYRTKALFAFEEIDGVDLCFFGMHVQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VTVRVVHASDKTVEVKPGMKARFVDSGEMAESFPYRTKALFAFEEIDGVDLCFFGMHVQE
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB4 YGSDCPPPNQRRVYISYLDSVHFFRPKCLRTAVYHEILIGYLEYVKKLGYTTGHIWACPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YGSDCPPPNQRRVYISYLDSVHFFRPKCLRTAVYHEILIGYLEYVKKLGYTTGHIWACPP
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB4 SEGDDYIFHCHPPDQKIPKPKRLQEWYKKMLDKAVSERIVHDYKDIFKQATEDRLTSAKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SEGDDYIFHCHPPDQKIPKPKRLQEWYKKMLDKAVSERIVHDYKDIFKQATEDRLTSAKE
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB4 LPYFEGDFWPNVLEESIKELEQEEEERKREENTSNESTDVTKGDSKNAKKKNNKKTSKNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LPYFEGDFWPNVLEESIKELEQEEEERKREENTSNESTDVTKGDSKNAKKKNNKKTSKNK
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KB4 SSLSRGNKKKPGMPNVSNDLSQKLYATMEKHKEVFFVIRLIAGPAANSLPPIVDPDPLIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SSLSRGNKKKPGMPNVSNDLSQKLYATMEKHKEVFFVIRLIAGPAANSLPPIVDPDPLIP
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KB4 CDLMDGRDAFLTLARDKHLEFSSLRRAQWSTMCMLVELHTQSQDRFVYTCNECKHHVETR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CDLMDGRDAFLTLARDKHLEFSSLRRAQWSTMCMLVELHTQSQDRFVYTCNECKHHVETR
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KB4 WHCTVCEDYDLCITCYNTKNHDHKMEKLGLGLDDESNNQQAAATQSPGDSRRLSIQRCIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 WHCTVCEDYDLCITCYNTKNHDHKMEKLGLGLDDESNNQQAAATQSPGDSRRLSIQRCIQ
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KB4 SLVHACQCRNANCSLPSCQKMKRVVQHTKGCKRKTNGGCPICKQLIALCCYHAKHCQENK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLVHACQCRNANCSLPSCQKMKRVVQHTKGCKRKTNGGCPICKQLIALCCYHAKHCQENK
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KB4 CPVPFCLNIKQKLRQQQLQHRLQQAQMLRRRMASMQRTGVVGQQQGLPSPTPATPTTPTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CPVPFCLNIKQKLRQQQLQHRLQQAQMLRRRMASMQRTGVVGQQQGLPSPTPATPTTPTG
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KB4 QQPTTPQTPQPTSQPQPTPPNSMPPYLPRTQAAGPVSQGKAAGQVTPPTPPQTAQPPLPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QQPTTPQTPQPTSQPQPTPPNSMPPYLPRTQAAGPVSQGKAAGQVTPPTPPQTAQPPLPG
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS14 DLNSNLSQSTLDIH
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CCDS45 KACQA---------------------------------------ILGSPASGIQNTIGSV
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CCDS45 GTGQQNATSLSNPNPIDPSSMQRAYAALGLPY-MNQPQTQLQPQVPGQQPAQP-QTHQQM
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CCDS45 QMNSMGSV-PGMAISPSRMPQPPNMMGAHTNNMMAQAPAQSQFLPQNQFPSSS-GAMSVG
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CCDS45 FVDCKECGRKMHQICVLHYDIIWPSGFVCDNCLKKTGRPRKENKFSAKRLQTTRLGNHLE
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CCDS45 DRVNKFLRRQNHPEAGEVFVRVVASSDKTVEVKPGMKSRFVDSGEMSESFPYRTKALFAF
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CCDS10 GTGQQNATSLSNPNPIDPSSMQRAYAALGLPY-MNQPQTQLQPQVPGQQPAQP-QTHQQM
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CCDS10 QMNSMGSV-PGMAISPSRMPQPPNMMGAHTNNMMAQAPAQSQFLPQNQFPSSS-GAMSVG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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