FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4967, 2414 aa
1>>>pF1KB4967 2414 - 2414 aa - 2414 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.1982+/-0.00124; mu= -21.9027+/- 0.075
mean_var=746.7023+/-154.709, 0's: 0 Z-trim(115.9): 74 B-trim: 0 in 0/56
Lambda= 0.046935
statistics sampled from 16461 (16516) to 16461 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.767), E-opt: 0.2 (0.507), width: 16
Scan time: 9.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14010.1 EP300 gene_id:2033|Hs108|chr22 (2414) 16836 1157.2 0
CCDS45399.1 CREBBP gene_id:1387|Hs108|chr16 (2404) 7025 492.9 7.9e-138
CCDS10509.1 CREBBP gene_id:1387|Hs108|chr16 (2442) 6812 478.5 1.7e-133
>>CCDS14010.1 EP300 gene_id:2033|Hs108|chr22 (2414 aa)
initn: 16836 init1: 16836 opt: 16836 Z-score: 6178.3 bits: 1157.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 16836; 100.0% identity (100.0% similar) in 2414 aa overlap (1-2414:1-2414)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAENVVEPGPPSAKRPKLSSPALSASASDGTDFGSLFDLEHDLPDELINSTELGLTNGGD
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CCDS14 MAENVVEPGPPSAKRPKLSSPALSASASDGTDFGSLFDLEHDLPDELINSTELGLTNGGD
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pF1KB4 INQLQTSLGMVQDAASKHKQLSELLRSGSSPNLNMGVGGPGQVMASQAQQSSPGLGLINS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 INQLQTSLGMVQDAASKHKQLSELLRSGSSPNLNMGVGGPGQVMASQAQQSSPGLGLINS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MVKSPMTQAGLTSPNMGMGTSGPNQGPTQSTGMMNSPVNQPAMGMNTGMNAGMNPGMLAA
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190 200 210 220 230 240
pF1KB4 GNGQGIMPNQVMNGSIGAGRGRQNMQYPNPGMGSAGNLLTEPLQQGSPQMGGQTGLRGPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GNGQGIMPNQVMNGSIGAGRGRQNMQYPNPGMGSAGNLLTEPLQQGSPQMGGQTGLRGPQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PLKMGMMNNPNPYGSPYTQNPGQQIGASGLGLQIQTKTVLSNNLSPFAMDKKAVPGGGMP
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NMGQQPAPQVQQPGLVTPVAQGMGSGAHTADPEKRKLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VRQCNLPHCRTMKNVLNHMTHCQSGKSCQVAHCASSRQIISHWKNCTRHDCPVCLPLKNA
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430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GDKRNQQPILTGAPVGLGNPSSLGVGQQSAPNLSTVSQIDPSSIERAYAALGLPYQVNQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GDKRNQQPILTGAPVGLGNPSSLGVGQQSAPNLSTVSQIDPSSIERAYAALGLPYQVNQM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PTQPQVQAKNQQNQQPGQSPQGMRPMSNMSASPMGVNGGVGVQTPSLLSDSMLHSAINSQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NPMMSENASVPSLGPMPTAAQPSTTGIRKQWHEDITQDLRNHLVHKLVQAIFPTPDPAAL
550 560 570 580 590 600
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pF1KB4 KDRRMENLVAYARKVEGDMYESANNRAEYYHLLAEKIYKIQKELEEKRRTRLQKQNMLPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KDRRMENLVAYARKVEGDMYESANNRAEYYHLLAEKIYKIQKELEEKRRTRLQKQNMLPN
610 620 630 640 650 660
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pF1KB4 AAGMVPVSMNPGPNMGQPQPGMTSNGPLPDPSMIRGSVPNQMMPRITPQSGLNQFGQMSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAGMVPVSMNPGPNMGQPQPGMTSNGPLPDPSMIRGSVPNQMMPRITPQSGLNQFGQMSM
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pF1KB4 AQPPIVPRQTPPLQHHGQLAQPGALNPPMGYGPRMQQPSNQGQFLPQTQFPSQGMNVTNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AQPPIVPRQTPPLQHHGQLAQPGALNPPMGYGPRMQQPSNQGQFLPQTQFPSQGMNVTNI
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pF1KB4 PLAPSSGQAPVSQAQMSSSSCPVNSPIMPPGSQGSHIHCPQLPQPALHQNSPSPVPSRTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PLAPSSGQAPVSQAQMSSSSCPVNSPIMPPGSQGSHIHCPQLPQPALHQNSPSPVPSRTP
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pF1KB4 TPHHTPPSIGAQQPPATTIPAPVPTPPAMPPGPQSQALHPPPRQTPTPPTTQLPQQVQPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TPHHTPPSIGAQQPPATTIPAPVPTPPAMPPGPQSQALHPPPRQTPTPPTTQLPQQVQPS
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pF1KB4 LPAAPSADQPQQQPRSQQSTAASVPTPTAPLLPPQPATPLSQPAVSIEGQVSNPPSTSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LPAAPSADQPQQQPRSQQSTAASVPTPTAPLLPPQPATPLSQPAVSIEGQVSNPPSTSST
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pF1KB4 EVNSQAIAEKQPSQEVKMEAKMEVDQPEPADTQPEDISESKVEDCKMESTETEERSTELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EVNSQAIAEKQPSQEVKMEAKMEVDQPEPADTQPEDISESKVEDCKMESTETEERSTELK
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pF1KB4 TEIKEEEDQPSTSATQSSPAPGQSKKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVD
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CCDS14 TEIKEEEDQPSTSATQSSPAPGQSKKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVD
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pF1KB4 PQLLGIPDYFDIVKSPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDIWLMFNNAWLYNRKTSRVYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PQLLGIPDYFDIVKSPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDIWLMFNNAWLYNRKTSRVYK
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1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 YCSKLSEVFEQEIDPVMQSLGYCCGRKLEFSPQTLCCYGKQLCTIPRDATYYSYQNRYHF
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CCDS14 YCSKLSEVFEQEIDPVMQSLGYCCGRKLEFSPQTLCCYGKQLCTIPRDATYYSYQNRYHF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB4 CEKCFNEIQGESVSLGDDPSQPQTTINKEQFSKRKNDTLDPELFVECTECGRKMHQICVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CEKCFNEIQGESVSLGDDPSQPQTTINKEQFSKRKNDTLDPELFVECTECGRKMHQICVL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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pF1KB4 HHEIIWPAGFVCDGCLKKSARTRKENKFSAKRLPSTRLGTFLENRVNDFLRRQNHPESGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HHEIIWPAGFVCDGCLKKSARTRKENKFSAKRLPSTRLGTFLENRVNDFLRRQNHPESGE
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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pF1KB4 VTVRVVHASDKTVEVKPGMKARFVDSGEMAESFPYRTKALFAFEEIDGVDLCFFGMHVQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VTVRVVHASDKTVEVKPGMKARFVDSGEMAESFPYRTKALFAFEEIDGVDLCFFGMHVQE
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pF1KB4 YGSDCPPPNQRRVYISYLDSVHFFRPKCLRTAVYHEILIGYLEYVKKLGYTTGHIWACPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YGSDCPPPNQRRVYISYLDSVHFFRPKCLRTAVYHEILIGYLEYVKKLGYTTGHIWACPP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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pF1KB4 SEGDDYIFHCHPPDQKIPKPKRLQEWYKKMLDKAVSERIVHDYKDIFKQATEDRLTSAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SEGDDYIFHCHPPDQKIPKPKRLQEWYKKMLDKAVSERIVHDYKDIFKQATEDRLTSAKE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB4 LPYFEGDFWPNVLEESIKELEQEEEERKREENTSNESTDVTKGDSKNAKKKNNKKTSKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LPYFEGDFWPNVLEESIKELEQEEEERKREENTSNESTDVTKGDSKNAKKKNNKKTSKNK
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pF1KB4 SSLSRGNKKKPGMPNVSNDLSQKLYATMEKHKEVFFVIRLIAGPAANSLPPIVDPDPLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SSLSRGNKKKPGMPNVSNDLSQKLYATMEKHKEVFFVIRLIAGPAANSLPPIVDPDPLIP
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pF1KB4 CDLMDGRDAFLTLARDKHLEFSSLRRAQWSTMCMLVELHTQSQDRFVYTCNECKHHVETR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CDLMDGRDAFLTLARDKHLEFSSLRRAQWSTMCMLVELHTQSQDRFVYTCNECKHHVETR
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pF1KB4 WHCTVCEDYDLCITCYNTKNHDHKMEKLGLGLDDESNNQQAAATQSPGDSRRLSIQRCIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 WHCTVCEDYDLCITCYNTKNHDHKMEKLGLGLDDESNNQQAAATQSPGDSRRLSIQRCIQ
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1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB4 SLVHACQCRNANCSLPSCQKMKRVVQHTKGCKRKTNGGCPICKQLIALCCYHAKHCQENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLVHACQCRNANCSLPSCQKMKRVVQHTKGCKRKTNGGCPICKQLIALCCYHAKHCQENK
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB4 CPVPFCLNIKQKLRQQQLQHRLQQAQMLRRRMASMQRTGVVGQQQGLPSPTPATPTTPTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CPVPFCLNIKQKLRQQQLQHRLQQAQMLRRRMASMQRTGVVGQQQGLPSPTPATPTTPTG
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1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KB4 QQPTTPQTPQPTSQPQPTPPNSMPPYLPRTQAAGPVSQGKAAGQVTPPTPPQTAQPPLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QQPTTPQTPQPTSQPQPTPPNSMPPYLPRTQAAGPVSQGKAAGQVTPPTPPQTAQPPLPG
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1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB4 PPPAAVEMAMQIQRAAETQRQMAHVQIFQRPIQHQMPPMTPMAPMGMNPPPMTRGPSGHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PPPAAVEMAMQIQRAAETQRQMAHVQIFQRPIQHQMPPMTPMAPMGMNPPPMTRGPSGHL
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KB4 EPGMGPTGMQQQPPWSQGGLPQPQQLQSGMPRPAMMSVAQHGQPLNMAPQPGLGQVGISP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EPGMGPTGMQQQPPWSQGGLPQPQQLQSGMPRPAMMSVAQHGQPLNMAPQPGLGQVGISP
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KB4 LKPGTVSQQALQNLLRTLRSPSSPLQQQQVLSILHANPQLLAAFIKQRAAKYANSNPQPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LKPGTVSQQALQNLLRTLRSPSSPLQQQQVLSILHANPQLLAAFIKQRAAKYANSNPQPI
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KB4 PGQPGMPQGQPGLQPPTMPGQQGVHSNPAMQNMNPMQAGVQRAGLPQQQPQQQLQPPMGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PGQPGMPQGQPGLQPPTMPGQQGVHSNPAMQNMNPMQAGVQRAGLPQQQPQQQLQPPMGG
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2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KB4 MSPQAQQMNMNHNTMPSQFRDILRRQQMMQQQQQQGAGPGIGPGMANHNQFQQPQGVGYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSPQAQQMNMNHNTMPSQFRDILRRQQMMQQQQQQGAGPGIGPGMANHNQFQQPQGVGYP
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2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KB4 PQQQQRMQHHMQQMQQGNMGQIGQLPQALGAEAGASLQAYQQRLLQQQMGSPVQPNPMSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PQQQQRMQHHMQQMQQGNMGQIGQLPQALGAEAGASLQAYQQRLLQQQMGSPVQPNPMSP
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KB4 QQHMLPNQAQSPHLQGQQIPNSLSNQVRSPQPVPSPRPQSQPPHSSPSPRMQPQPSPHHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QQHMLPNQAQSPHLQGQQIPNSLSNQVRSPQPVPSPRPQSQPPHSSPSPRMQPQPSPHHV
2290 2300 2310 2320 2330 2340
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pF1KB4 SPQTSSPHPGLVAAQANPMEQGHFASPDQNSMLSQLASNPGMANLHGASATDLGLSTDNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SPQTSSPHPGLVAAQANPMEQGHFASPDQNSMLSQLASNPGMANLHGASATDLGLSTDNS
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410
pF1KB4 DLNSNLSQSTLDIH
::::::::::::::
CCDS14 DLNSNLSQSTLDIH
2410
>>CCDS45399.1 CREBBP gene_id:1387|Hs108|chr16 (2404 aa)
initn: 7259 init1: 3547 opt: 7025 Z-score: 2588.0 bits: 492.9 E(32554): 7.9e-138
Smith-Waterman score: 9385; 59.4% identity (76.9% similar) in 2517 aa overlap (1-2400:1-2393)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAENVVEPGPPSAKRPKLSSPALSASASDGTDFGSLFDLEHDLPDELI-NSTELGLTNGG
::::... :::. :: :::::..:: .:.::::::::::.::::::: :. :::: :.:
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10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 DINQLQTSLGMVQDAASKHKQLSELLRSGSSPNLNMGVGG-----P-GQVMASQAQ--QS
. .: ::::::::::::::.::. ..: :.:. : : ...::: .
CCDS45 N---------LVPDAASKHKQLSELLRGGSGSSINPGIGNVSASSPVQQGLGGQAQGQPN
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB4 SPGLGLINSMVKSPMTQAGLTSPNM---GMGTSGPNQGPTQS--------TGMMNSPVNQ
: ... ...: :::..:. ..:.. . .::::. . .:. .:. .:
CCDS45 SANMASLSAMGKSPLSQGDSSAPSLPKQAASTSGPTPAASQALNPQAQKQVGLATSSPAT
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200
pF1KB4 PAMGMNTGMNAGMN---PGMLAAGNGQGIMPN------QVMNGSIGA-GRGR-QNMQYPN
: . :::..: ::.: ...:.... . ::::::.:: :::: .: ::.
CCDS45 SQTGPGICMNANFNQTHPGLLNSNSGHSLINQASQGQAQVMNGSLGAAGRGRGAGMPYPT
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 PGM-GSAGNLLTEPLQQGSPQMGGQTGLRGPQP---LKMGMMNNPNPYGSPYTQNPGQQI
:.: :.....:.: : : :::: :..:: : :::. .: .:.:.:..: :: .
CCDS45 PAMQGASSSVLAETLTQVSPQMTGHAGLNTAQAGGMAKMGITGNTSPFGQPFSQAGGQPM
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 GASGLGLQIQTKTVLSNNLSPFAMDKKAVPGGGMPNMGQQPAPQVQQPGLVTPVAQGMGS
::.:.. :. .: . :.: : : : . ..:::.: .: ..:. :....
CCDS45 GATGVNPQLASKQSMVNSLPTFPTDIKNTSVTNVPNMSQ-----MQTSVGIVPT-QAIAT
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 GAHTADPEKRKLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGEVRQCNLPHCRTMKNVLNHMTHCQSG
: :::::::::::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::.:
CCDS45 GP-TADPEKRKLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGEVRACSLPHCRTMKNVLNHMTHCQAG
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 KSCQVAHCASSRQIISHWKNCTRHDCPVCLPLKNAGDKRNQQPILTGAPV-GLGNP-SSL
:.::. . :.:. :. : .:.
CCDS45 KACQA---------------------------------------ILGSPASGIQNTIGSV
410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 GVGQQSAPNLSTVSQIDPSSIERAYAALGLPYQVNQMPTQPQVQAKNQQNQQPGQSPQGM
:.:::.: .::. . :::::..:::::::::: .:: :: : :. .:: :: :. : :
CCDS45 GTGQQNATSLSNPNPIDPSSMQRAYAALGLPY-MNQPQTQLQPQVPGQQPAQP-QTHQQM
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550
pF1KB4 RPMSNMSASPMGV-NGGVGV--QTPSLLSDSMLHSAINSQNPMM---SENASVPSLGPMP
: .. .. .::.. ::. . : :.:.:.: : ..... ::.: :..... .:. .:
CCDS45 RTLNPLGNNPMNIPAGGITTDQQPPNLISESALPTSLGATNPLMNDGSNSGNIGTLSTIP
490 500 510 520 530 540
560 570 580 590 600 610
pF1KB4 TAAQPSTTGIRKQWHEDITQDLRNHLVHKLVQAIFPTPDPAALKDRRMENLVAYARKVEG
::: ::.::.:: ::: .:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS45 TAAPPSSTGVRKGWHEHVTQDLRSHLVHKLVQAIFPTPDPAALKDRRMENLVAYAKKVEG
550 560 570 580 590 600
620 630 640 650 660 670
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]