FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4969, 2224 aa 1>>>pF1KB4969 2224 - 2224 aa - 2224 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6312+/-0.000625; mu= 3.3729+/- 0.038 mean_var=230.6538+/-48.942, 0's: 0 Z-trim(111.5): 255 B-trim: 294 in 2/52 Lambda= 0.084449 statistics sampled from 19831 (20099) to 19831 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16 Scan time: 17.070 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000121 (OMIM: 188055,227400,600880,601367,61230 (2224) 15037 1847.7 0 XP_016856149 (OMIM: 188055,227400,600880,601367,61 (2087) 14106 1734.3 0 NP_000123 (OMIM: 134500,300841,306700) coagulation (2351) 1809 236.1 3.7e-60 NP_001265571 (OMIM: 606018) EGF-like repeat and di ( 470) 924 127.9 2.9e-28 NP_005702 (OMIM: 606018) EGF-like repeat and disco ( 480) 924 127.9 2.9e-28 NP_000087 (OMIM: 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NP_000 NRSWYLTENIQRFLPNPAGVQLEDPEFQASNIMHSINGYVFDSLQ-LSVCLHEVAYWYIL 610 620 630 640 650 620 630 640 650 660 670 pF1KB4 SVGTQNEILTIHFTGHSFIYGKRHEDTLTLFPMRGESVTVTMDNVGTWMLTSMNSSPRSK :.:.:...:.. :.:..: . .::::::::. ::.: ..:.: : :.: ::. :.. NP_000 SIGAQTDFLSVFFSGYTFKHKMVYEDTLTLFPFSGETVFMSMENPGLWILGCHNSDFRNR 660 670 680 690 700 710 680 690 700 710 720 730 pF1KB4 KLRLKFRDVKC---IPDDDEDSYEIFEPPESTVMATRKMHDRLEPEDEESDADYDYQNRL . .. .: : ::::: . :. . .. .. .::.. :: NP_000 GMTALLKVSSCDKNTGDYYEDSYEDI----SAYLLSK--NNAIEPRSFS-------QNSR 720 730 740 750 760 740 750 760 770 780 pF1KB4 AAALGIRSFRNSSLNQEEEEFNLTALALENGTEFVS--SNTDIIVGSNYS-SPSNISKFT . ..: ... ... : . .: .. .. :..:... : .: ..: NP_000 HPSTRQKQFNATTIPENDIEKTDPWFAHRTPMPKIQNVSSSDLLMLLRQSPTPHGLS--- 770 780 790 800 810 820 790 800 810 820 830 840 pF1KB4 VNNLAEPQKAPSHQQATTAGSPLRHLIGKNSVLNSSTAEHSSPYSEDPIEDPLQPDVTGI :.. :.: . : . .: : .:. :. : : : . . . :. .:. NP_000 ---LSDLQEA---KYETFSDDPSPGAIDSNNSLSEMT--HFRPQLHHSGDMVFTPE-SGL 830 840 850 860 870 850 860 870 880 890 900 pF1KB4 RL-LSLGAGEFKSQEHAKHKGPKVERDQAAKHRFSWMKLLAHKVGRHLSQDTGSPSGMRP .: :. : . : :. :: ...... .: . .: ... : :: : NP_000 QLRLNEKLGTTAATE-LKKLDFKV--SSTSNNLISTIPSDNLAAGTDNTSSLGPPS-MPV 880 890 900 910 920 930 910 920 930 940 950 960 pF1KB4 WEDLPSQDTGSPSRMRPWKDPPSDLLLLKQSNSSKILVGRWHLASEKGSYEIIQDTDEDT : . : .. : . . : : ...:.::.: . ..:.. . ...:. NP_000 HYDSQLDTTLFGKKSSPLTESGGPLSLSEENNDSKLLESGLMNSQESSWGKNVSSTESGR 940 950 960 970 980 990 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB4 ------AVNNWLISPQNASRAWGESTPLANKPGKQSGHPKFPRVRHKSLQVRQDGGKSRL : . :.. .:: . : .:: ...:. . .. :: .... . NP_000 LFKGKRAHGPALLTKDNALFKVSISLLKTNKTSNNSATNRKTHIDGPSLLIENS---PSV 1000 1010 1020 1030 1040 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB4 KKSQFLIKTRKKKKEKHTHHAPLSPRTFHPLRSEAYNTFSERRL--KHSLVLHKSNETSL .. . :. :: : : .. :: : .:.. :. ......: . NP_000 WQNILESDTEFKKVTPLIHDRMLMDKNATALR---LNHMSNKTTSSKNMEMVQQKKEGPI 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KB4 PTDLNQTLPSMDFGWIASLPD--------HNQNSSNDTGQASCPPGLYQTVPPEEHY--Q : : .. :.:.: . ::. :..:: : .::. : : .. ::. : NP_000 PPDAQN--PDMSFFKMLFLPESARWIQRTHGKNSLN-SGQGPSPKQLV-SLGPEKSVEGQ 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KB4 TFPIQDPDQMHSTSDPSHRSSSPELSEMLEYDRSHKSFPTDISQMSPSSEHEVWQTVISP .: ... ... . .. ... :.::. . :.. : :..... .. :. . . NP_000 NF-LSEKNKV--VVGKGEFTKDVGLKEMV-FPSSRNLFLTNLDNLHENNTHNQEKKI--- 1170 1180 1190 1200 1210 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KB4 DLSQVTLSPELSQTNLSPDLSHTTLSPELIQRNL-----------SPALGQMPISPDLSH .. . : : :. ::. . . ...:: : . :. :. NP_000 -QEEIEKKETLIQENVVLPQIHTVTGTKNFMKNLFLLSTRQNVEGSYDGAYAPVLQDFRS 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1240 1250 1260 pF1KB4 TTLSPDLS--HTT-------------LSLDLSQ--------TNLSPELSQTNLSP----- . : . . ::. :. . .: : .::. :: :. NP_000 LNDSTNRTKKHTAHFSKKGEEENLEGLGNQTKQIVEKYACTTRISPNTSQQNFVTQRSKR 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KB4 ALGQ--MPLSPDLSHTTLSLDFSQTNLSPELSHMTLSPELSQTNLSP----ALGQMPISP :: : .:: . . .: ..:. : ...:.: : :.: . . :. : :.: NP_000 ALKQFRLPLEETELEKRIIVDDTSTQWSKNMKHLTPST-LTQIDYNEKEKGAITQSPLSD 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KB4 DL--SHTTLS-----LDFSQTNLSPELSQTNLSPALGQMPLSPDPSHTTLSLDLSQTNLS : ::. . : ..... : . :. .: : : :. . . : . . : NP_000 CLTRSHSIPQANRSPLPIAKVSSFPSIRPIYLTRVLFQDNSSHLPAASYRKKDSGVQESS 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1380 1390 1400 1410 pF1KB4 PELS---QTNLSPDLSEMPLFADLSQIPL--TPDLDQMTLS---------PDL----GET :. ..::: . . . .: .. : ...: . ::: :.. NP_000 HFLQGAKKNNLSLAILTLEMTGDQREVGSLGTSATNSVTYKKVENTVLPKPDLPKTSGKV 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KB4 DLSP--NFGQMSLSPDLSQVTLSP---DISDTTLLPDL------SQISPPPDLDQIFYPS .: : .. : .: : .. . :: :. . .:: .. . : . . . NP_000 ELLPKVHIYQKDLFPTETS-NGSPGHLDLVEGSLLQGTEGAIKWNEANRPGKVPFLRVAT 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1470 1480 1490 1500 pF1KB4 ESSQ---SLLLQ------EFNESFPYPDL-GQMPSPSSPTLN--DTFLSK---EFN---- ::: : ::. ... ..: . .: :: . ... ::.:: : : NP_000 ESSAKTPSKLLDPLAWDNHYGTQIPKEEWKSQEKSPEKTAFKKKDTILSLNACESNHAIA 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KB4 --------PLVIVGLSKDG-TDYI--EIIP-----KEEVQSS--EDDYAEIDYVPYDDPY : . : .:.: :. . . : ..:. . ..: :::: :: NP_000 AINEGQNKPEIEVTWAKQGRTERLCSQNPPVLKRHQREITRTTLQSDQEEIDY---DDTI 1640 1650 1660 1670 1680 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KB4 KTDVRTNINSSRDPDNIAAWYLRSNNGNRRNYYIAAEEISWDY----SEFVQRETDIEDS ..... . . : :. . :: . . :.:.::: : ::: : : :. .: NP_000 SVEMKKEDFDIYDEDENQS--PRSFQKKTRHYFIAAVERLWDYGMSSSPHVLRNR--AQS 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KB4 DDIPEDTTYKKVVFRKYLDSTFTKRDPRGEYEEHLGILGPIIRAEVDDVIQVRFKNLASR ..:. .:::::... :..::. ::: .::::.::: :::::.: :.: :.: ::: NP_000 GSVPQ---FKKVVFQEFTDGSFTQPLYRGELNEHLGLLGPYIRAEVEDNIMVTFRNQASR 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KB4 PYSLHAHGLSYEKSSEGKTYEDDSPEWFKEDNAVQPNSSYTYVWHATERSGPESPGSACR :::... .::: ::. . : :.:: . :: :.. .. .: . :. 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NP_000 FLVYSNKCQTPLGMASGHIRDFQITASGQYGQWAPKLARLHYSGSINAWSTKE---PFS- 2040 2050 2060 2070 2080 1960 1970 1980 1990 2000 2010 pF1KB4 KPWIQVDMQKEVIITGIQTQGAKHYLKSCYTTEFYVAYSSNQINWQIFKGNSTRNVMYFN ::.::. .:: ::.::::.. ..: : ..: . :: . .:: ..:::: ..: : NP_000 --WIKVDLLAPMIIHGIKTQGARQKFSSLYISQFIIMYSLDGKKWQTYRGNSTGTLMVFF 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2020 2030 2040 2050 2060 2070 pF1KB4 GNSDASTIKENQFDPPIVARYIRISPTRAYNRPTLRLELQGCEVNGCSTPLGMENGKIEN :: :.: ::.: :.:::.:::::. ::. : :::.::.::..:.:: :::::. : . NP_000 GNVDSSGIKHNIFNPPIIARYIRLHPTHYSIRSTLRMELMGCDLNSCSMPLGMESKAISD 2150 2160 2170 2180 2190 2200 2080 2090 2100 2110 2120 2130 pF1KB4 KQITASSFKKSWWGDYWEPFRARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLEIDLLKIKKITAIITQ ::::::. . .. : : .:::. ::: :::. ..:: :.::..:. : :.:.. :: NP_000 AQITASSYFTNMFAT-WSPSKARLHLQGRSNAWRPQVNNPKEWLQVDFQKTMKVTGVTTQ 2210 2220 2230 2240 2250 2260 2140 2150 2160 2170 2180 2190 pF1KB4 GCKSLSSEMYVKSYTIHYSEQGVEWKPYRLKSSMVDKIFEGNTNTKGHVKNFFNPPIISR : ::: . :::: . : :..: .: . .... : :.:.:: .. : : ..::...: NP_000 GVKSLLTSMYVKEFLISSSQDGHQWTLF-FQNGKV-KVFQGNQDSFTPVVNSLDPPLLTR 2270 2280 2290 2300 2310 2320 2200 2210 2220 pF1KB4 FIRVIPKTWNQSIALRLELFGCDIY ..:. :..: ..::::.:..::. NP_000 YLRIHPQSWVHQIALRMEVLGCEAQDLY 2330 2340 2350 >>NP_001265571 (OMIM: 606018) EGF-like repeat and discoi (470 aa) initn: 963 init1: 420 opt: 924 Z-score: 628.4 bits: 127.9 E(85289): 2.9e-28 Smith-Waterman score: 924; 42.7% identity (68.5% similar) in 337 aa overlap (1897-2221:134-466) 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KB4 GSFKTLEMKASKPGWWLLNTEVGENQRAGMQTPFLIMDRDCRM----PMGLSTGIISDSQ . : .: :.:.. :.:. ::::..: NP_001 IHCQHNINECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQ 110 120 130 140 150 160 1930 1940 1950 1960 1970 pF1KB4 IKASE----FLGY--WEPRLARLNNGGSYNAWSVEKLAAEFASKPWIQVDMQKEVIITGI : :: ..: : : ::::. : :::. ::: ::::...:... .::. NP_001 ITASSTHRALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWT----AAENDRWPWIQINLQRKMRVTGV 170 180 190 200 210 1980 1990 2000 2010 2020 2030 pF1KB4 QTQGAKHYLKSCYTTEFYVAYSSNQINWQIFKGNSTRNVMYFNGNSDASTIKENQFDPPI :::::. . : . .:::.. .: ..: ..: . : : :: : .: :.: ::: NP_001 ITQGAKRIGSPEYIKSYKIAYSNDGKTWAMYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPI 220 230 240 250 260 270 2040 2050 2060 2070 2080 2090 pF1KB4 VARYIRISPTRAYNRPTLRLELQGCEVNGCSTPLGMENGKIENKQITASSFKKSWWGDY- :.:.:. : . :::.:: :::..::: ::::..:.:.. ::::::. .. :. NP_001 KAQYVRLYPQVCRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMF 280 290 300 310 320 330 2100 2110 2120 2130 2140 2150 pF1KB4 -WEPFRARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLEIDLLKIKKITAIITQGCKSLSSEMYVKSYT ::: .:::. ::.:::: . :...:::..::: :.:.::::: :... ..: :: NP_001 TWEPRKARLDKQGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYK 340 350 360 370 380 390 2160 2170 2180 2190 2200 2210 pF1KB4 IHYSEQGVEWKPYRLKSSMVDKIFEGNTNTKGHVKNFFNPPIISRFIRVIPKTWNQSIAL . ::..: .: :. ... ::.:.:: .. : :: ..::: .: ::..: .: :.: NP_001 LAYSNDGEHWTVYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITL 400 410 420 430 440 450 2220 pF1KB4 RLELFGCDIY : ::.:: NP_001 RSELLGCTEEE 460 470 >>NP_005702 (OMIM: 606018) EGF-like repeat and discoidin (480 aa) initn: 963 init1: 420 opt: 924 Z-score: 628.3 bits: 127.9 E(85289): 2.9e-28 Smith-Waterman score: 924; 42.7% identity (68.5% similar) in 337 aa overlap (1897-2221:144-476) 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KB4 GSFKTLEMKASKPGWWLLNTEVGENQRAGMQTPFLIMDRDCRM----PMGLSTGIISDSQ . : .: :.:.. :.:. ::::..: NP_005 IHCQHNINECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQ 120 130 140 150 160 170 1930 1940 1950 1960 1970 pF1KB4 IKASE----FLGY--WEPRLARLNNGGSYNAWSVEKLAAEFASKPWIQVDMQKEVIITGI : :: ..: : : ::::. : :::. ::: ::::...:... .::. NP_005 ITASSTHRALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWT----AAENDRWPWIQINLQRKMRVTGV 180 190 200 210 220 1980 1990 2000 2010 2020 2030 pF1KB4 QTQGAKHYLKSCYTTEFYVAYSSNQINWQIFKGNSTRNVMYFNGNSDASTIKENQFDPPI :::::. . : . .:::.. .: ..: ..: . : : :: : .: :.: ::: NP_005 ITQGAKRIGSPEYIKSYKIAYSNDGKTWAMYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPI 230 240 250 260 270 280 2040 2050 2060 2070 2080 2090 pF1KB4 VARYIRISPTRAYNRPTLRLELQGCEVNGCSTPLGMENGKIENKQITASSFKKSWWGDY- :.:.:. : . :::.:: :::..::: ::::..:.:.. ::::::. .. :. NP_005 KAQYVRLYPQVCRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMF 290 300 310 320 330 340 2100 2110 2120 2130 2140 2150 pF1KB4 -WEPFRARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLEIDLLKIKKITAIITQGCKSLSSEMYVKSYT ::: .:::. ::.:::: . :...:::..::: :.:.::::: :... ..: :: NP_005 TWEPRKARLDKQGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYK 350 360 370 380 390 400 2160 2170 2180 2190 2200 2210 pF1KB4 IHYSEQGVEWKPYRLKSSMVDKIFEGNTNTKGHVKNFFNPPIISRFIRVIPKTWNQSIAL . ::..: .: :. ... ::.:.:: .. : :: ..::: .: ::..: .: :.: NP_005 LAYSNDGEHWTVYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITL 410 420 430 440 450 460 2220 pF1KB4 RLELFGCDIY : ::.:: NP_005 RSELLGCTEEE 470 480 >>NP_000087 (OMIM: 117700,604290) ceruloplasmin precurso (1065 aa) initn: 929 init1: 485 opt: 928 Z-score: 625.9 bits: 128.6 E(85289): 4e-28 Smith-Waterman score: 1377; 34.8% identity (64.4% similar) in 675 aa overlap (61-697:67-731) 40 50 60 70 80 pF1KB4 LRQFYVAAQGISWSYRPEPTNSSLNLSVTSFKKIVYREY-EPYFKKEKPQSTISGLLGPT .:: .: .: . :. . . :.::: NP_000 SDHGEKKLISVDTEHSNIYLQNGPDRIGRLYKKALYLQYTDETFRTTIEKPVWLGFLGPI 40 50 60 70 80 90 90 100 110 120 130 140 pF1KB4 LYAEVGDIIKVHFKNKADKPLSIHPQGIRYSKLSEGASYLDHTFPAEKMDDAVAPGREYT . ::.:: . ::.:: :..: ..: .:: : : ::: : :.: .. :: : ::..:: NP_000 IKAETGDKVYVHLKNLASRPYTFHSHGITYYKEHEGAIYPDNTTDFQRADDKVYPGEQYT 100 110 120 130 140 150 150 160 170 180 190 200 pF1KB4 YEWSISEDSGPTHDDPPCLTHIYYSHENLIEDFNSGLIGPLLICKKGTLTEGGTQKTFDK : .:...: . : :.:.::.:: . .:. :::::::.:::: .: . .: .:. 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