Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4980
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4980, 847 aa
1>>>pF1KB4980 847 - 847 aa - 847 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7198+/-0.00103; mu= 4.6138+/- 0.061
mean_var=174.0875+/-35.339, 0's: 0 Z-trim(109.7): 24 B-trim: 173 in 1/51
Lambda= 0.097205
statistics sampled from 11081 (11098) to 11081 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.698), E-opt: 0.2 (0.341), width: 16
Scan time: 4.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8931.1 STAT6 gene_id:6778|Hs108|chr12 ( 847) 5724 815.7 0
CCDS53804.1 STAT6 gene_id:6778|Hs108|chr12 ( 737) 4983 711.7 1.1e-204
CCDS74067.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 ( 764) 1466 218.5 3.5e-56
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CCDS11424.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 ( 794) 1461 217.8 5.9e-56
CCDS74066.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 ( 763) 761 119.6 2e-26
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CCDS32656.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 ( 770) 603 97.5 9.5e-20
CCDS59288.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 ( 722) 595 96.4 2e-19
CCDS2310.1 STAT4 gene_id:6775|Hs108|chr2 ( 748) 563 91.9 4.5e-18
CCDS42793.1 STAT1 gene_id:6772|Hs108|chr2 ( 712) 550 90.0 1.5e-17
CCDS2309.1 STAT1 gene_id:6772|Hs108|chr2 ( 750) 550 90.1 1.6e-17
CCDS55836.1 STAT2 gene_id:6773|Hs108|chr12 ( 847) 530 87.3 1.2e-16
CCDS8917.1 STAT2 gene_id:6773|Hs108|chr12 ( 851) 530 87.3 1.3e-16
>>CCDS8931.1 STAT6 gene_id:6778|Hs108|chr12 (847 aa)
initn: 5724 init1: 5724 opt: 5724 Z-score: 4348.6 bits: 815.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5724; 100.0% identity (100.0% similar) in 847 aa overlap (1-847:1-847)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSLWGLVSKMPPEKVQRLYVDFPQHLRHLLGDWLESQPWEFLVGSDAFCCNLASALLSDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MSLWGLVSKMPPEKVQRLYVDFPQHLRHLLGDWLESQPWEFLVGSDAFCCNLASALLSDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 VQHLQASVGEQGEGSTILQHISTLESIYQRDPLKLVATFRQILQGEKKAVMEQFRHLPMP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FHWKQEELKFKTGLRRLQHRVGEIHLLREALQKGAEAGQVSLHSLIETPANGTGPSEALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 FHWKQEELKFKTGLRRLQHRVGEIHLLREALQKGAEAGQVSLHSLIETPANGTGPSEALA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 MLLQETTGELEAAKALVLKRIQIWKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MLLQETTGELEAAKALVLKRIQIWKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 EVGAAGGELEPKTRASLTGRLDEVLRTLVTSCFLVEKQPPQVLKTQTKFQAGVRFLLGLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 FLGAPAKPPLVRADMVTEKQARELSVPQGPGAGAESTGEIINNTVPLENSIPGNCCSALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 FLGAPAKPPLVRADMVTEKQARELSVPQGPGAGAESTGEIINNTVPLENSIPGNCCSALF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KNLLLKKIKRCERKGTESVTEEKCAVLFSASFTLGPGKLPIQLQALSLPLVVIVHGNQDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KNLLLKKIKRCERKGTESVTEEKCAVLFSASFTLGPGKLPIQLQALSLPLVVIVHGNQDN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 NAKATILWDNAFSEMDRVPFVVAERVPWEKMCETLNLKFMAEVGTNRGLLPEHFLFLAQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 NAKATILWDNAFSEMDRVPFVVAERVPWEKMCETLNLKFMAEVGTNRGLLPEHFLFLAQK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 IFNDNSLSMEAFQHRSVSWSQFNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDLTKRCLRSYWSDRLIIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 IFNDNSLSMEAFQHRSVSWSQFNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDLTKRCLRSYWSDRLIIG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 FISKQYVTSLLLNEPDGTFLLRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSAKDLSIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 FISKQYVTSLLLNEPDGTFLLRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSAKDLSIR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 SLGDRIRDLAQLKNLYPKKPKDEAFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTVERDQPLPTPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SLGDRIRDLAQLKNLYPKKPKDEAFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTVERDQPLPTPE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 LQMPTMVPSYDLGMAPDSSMSMQLGPDMVPQVYPPHSHSIPPYQGLSPEESVNVLSAFQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LQMPTMVPSYDLGMAPDSSMSMQLGPDMVPQVYPPHSHSIPPYQGLSPEESVNVLSAFQE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 PHLQMPPSLGQMSLPFDQPHPQGLLPCQPQEHAVSSPDPLLCSDVTMVEDSCLSQPVTAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 PHLQMPPSLGQMSLPFDQPHPQGLLPCQPQEHAVSSPDPLLCSDVTMVEDSCLSQPVTAF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 PQGTWIGEDIFPPLLPPTEQDLTKLLLEGQGESGGGSLGAQPLLQPSHYGQSGISMSHMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 PQGTWIGEDIFPPLLPPTEQDLTKLLLEGQGESGGGSLGAQPLLQPSHYGQSGISMSHMD
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 LRANPSW
:::::::
CCDS89 LRANPSW
>>CCDS53804.1 STAT6 gene_id:6778|Hs108|chr12 (737 aa)
initn: 4983 init1: 4983 opt: 4983 Z-score: 3787.9 bits: 711.7 E(32554): 1.1e-204
Smith-Waterman score: 4983; 100.0% identity (100.0% similar) in 737 aa overlap (111-847:1-737)
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 ISTLESIYQRDPLKLVATFRQILQGEKKAVMEQFRHLPMPFHWKQEELKFKTGLRRLQHR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MEQFRHLPMPFHWKQEELKFKTGLRRLQHR
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 VGEIHLLREALQKGAEAGQVSLHSLIETPANGTGPSEALAMLLQETTGELEAAKALVLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VGEIHLLREALQKGAEAGQVSLHSLIETPANGTGPSEALAMLLQETTGELEAAKALVLKR
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 IQIWKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQEVGAAGGELEPKTRASLTGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IQIWKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQEVGAAGGELEPKTRASLTGR
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 LDEVLRTLVTSCFLVEKQPPQVLKTQTKFQAGVRFLLGLRFLGAPAKPPLVRADMVTEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LDEVLRTLVTSCFLVEKQPPQVLKTQTKFQAGVRFLLGLRFLGAPAKPPLVRADMVTEKQ
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 ARELSVPQGPGAGAESTGEIINNTVPLENSIPGNCCSALFKNLLLKKIKRCERKGTESVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ARELSVPQGPGAGAESTGEIINNTVPLENSIPGNCCSALFKNLLLKKIKRCERKGTESVT
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 EEKCAVLFSASFTLGPGKLPIQLQALSLPLVVIVHGNQDNNAKATILWDNAFSEMDRVPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EEKCAVLFSASFTLGPGKLPIQLQALSLPLVVIVHGNQDNNAKATILWDNAFSEMDRVPF
280 290 300 310 320 330
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pF1KB4 VVAERVPWEKMCETLNLKFMAEVGTNRGLLPEHFLFLAQKIFNDNSLSMEAFQHRSVSWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VVAERVPWEKMCETLNLKFMAEVGTNRGLLPEHFLFLAQKIFNDNSLSMEAFQHRSVSWS
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510 520 530 540 550 560
pF1KB4 QFNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDLTKRCLRSYWSDRLIIGFISKQYVTSLLLNEPDGTFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QFNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDLTKRCLRSYWSDRLIIGFISKQYVTSLLLNEPDGTFL
400 410 420 430 440 450
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pF1KB4 LRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSAKDLSIRSLGDRIRDLAQLKNLYPKKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSAKDLSIRSLGDRIRDLAQLKNLYPKKP
460 470 480 490 500 510
630 640 650 660 670 680
pF1KB4 KDEAFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTVERDQPLPTPELQMPTMVPSYDLGMAPDSSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KDEAFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTVERDQPLPTPELQMPTMVPSYDLGMAPDSSM
520 530 540 550 560 570
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pF1KB4 SMQLGPDMVPQVYPPHSHSIPPYQGLSPEESVNVLSAFQEPHLQMPPSLGQMSLPFDQPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SMQLGPDMVPQVYPPHSHSIPPYQGLSPEESVNVLSAFQEPHLQMPPSLGQMSLPFDQPH
580 590 600 610 620 630
750 760 770 780 790 800
pF1KB4 PQGLLPCQPQEHAVSSPDPLLCSDVTMVEDSCLSQPVTAFPQGTWIGEDIFPPLLPPTEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PQGLLPCQPQEHAVSSPDPLLCSDVTMVEDSCLSQPVTAFPQGTWIGEDIFPPLLPPTEQ
640 650 660 670 680 690
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pF1KB4 DLTKLLLEGQGESGGGSLGAQPLLQPSHYGQSGISMSHMDLRANPSW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DLTKLLLEGQGESGGGSLGAQPLLQPSHYGQSGISMSHMDLRANPSW
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>>CCDS74067.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 (764 aa)
initn: 1439 init1: 936 opt: 1466 Z-score: 1122.1 bits: 218.5 E(32554): 3.5e-56
Smith-Waterman score: 1563; 38.8% identity (66.3% similar) in 762 aa overlap (1-720:1-736)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MSLWGLVSKMPPEKVQRLYVDFPQHL----RHLLGDWLESQPWEFLVGSDAFCCNLASAL
:. : .... . .... : . ::. :: :..:.:::::. . .. :. :
CCDS74 MAGWIQAQQLQGDALRQMQVLYGQHFPIEVRHYLAQWIESQPWDAIDLDNPQDRAQATQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB4 LSDTVQHLQASVGEQ-GEGSTILQ----HIST----------LESIYQRDPLKLVATFRQ
: ::.:: .. .: :: . .:. : .: : . ... :.. ::..
CCDS74 LEGLVQELQKKAEHQVGEDGFLLKIKLGHYATQLQCSSPAGILVDAMSQKHLQINQTFEE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KB4 I--LQGEKKAVMEQFRHLPMPFHWK-QEELKFKTGLRRLQHRVGEIHLLRE-ALQKGAEA
. . . . ...... : . :: :.... . .: . . .: :: :::.
CCDS74 LRLVTQDTENELKKLQQTQEYFIIQYQESLRIQAQFAQLAQLSPQERLSRETALQQ----
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 GQVSLHSLIETPANGTGPSEA-LAMLLQETTGELEAAKALVL--KRIQIWKRQQQLAGNG
::::.. .. :. .. :: :.: :. ....: . :: :::.:::::::
CCDS74 KQVSLEAWLQREAQTLQQYRVELAEKHQKTLQLLRKQQTIILDDELIQ-WKRRQQLAGNG
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KB4 APFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQEVGAA---------GGELEPKTRASLTGRLDEVL
.: : :: :: ::.:..: : .:.. : : .: . : ... . ...
CCDS74 GPPEGSLDVLQSWCEKLAEIIWQNRQQIRRAEHLCQQLPIPGPVE-EMLAEVNATITDII
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 RTLVTSCFLVEKQPPQVLKTQTKFQAGVRFLLGLRFLGAPAKPPLVRADMVTEKQARELS
.:::: :..:::::::::::::: : ::.:.: . :.. .:: :.: ...:.::. :
CCDS74 SALVTSTFIIEKQPPQVLKTQTKFAATVRLLVGGK-LNVHMNPPQVKATIISEQQAK--S
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 VPQGPGAGAESTGEIINNTVPLENSIPGNCCSALFKNLLLKKIKRCERKGTESVTEEKCA
. .. .. : .:::.:: .: . :: :.:. ::.::: .:.:.::::::: .
CCDS74 LLKNENTRNECSGEILNNCCVMEYHQATGTLSAHFRNMSLKRIKRADRRGAESVTEEKFT
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 VLFSASFTLGPGKLPIQLQALSLPLVVIVHGNQDNNAKATILWDNAFSEMDRVPFVVAER
::: ..:..: ..: .:...::::.::::::.::.:: ::.::::::.: ::::.: ..
CCDS74 VLFESQFSVGSNELVFQVKTLSLPVVVIVHGSQDHNATATVLWDNAFAEPGRVPFAVPDK
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 VPWEKMCETLNLKFMAEVGTNRGLLPEHFLFLAQKIFNDNSLSMEAFQHRSVSWSQFNKE
: : ..::.::.:: ::: .:::: :...:::::.::..: .: .. ::::::::.:
CCDS74 VLWPQLCEALNMKFKAEVQSNRGLTKENLVFLAQKLFNNSSSHLEDYSGLSVSWSQFNRE
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KB4 ILLGRGFTFWQWFDGVLDLTKRCLRSYWSDRLIIGFISKQYVTSLLLNEPDGTFLLRFSD
: : ..:::::::::... :. . .:.: :.::..:: . .::.:.:::::::::::
CCDS74 NLPGWNYTFWQWFDGVMEVLKKHHKPHWNDGAILGFVNKQQAHDLLINKPDGTFLLRFSD
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KB4 SEIGGITIAHVIRGQDGSPQ--IENIQPFSAKDLSIRSLGDRIRDLAQLKNLYPKKPKDE
::::::::: . ::. . :..::...:.:::::.::. ::. : ..: .::::
CCDS74 SEIGGITIAW----KFDSPERNLWNLKPFTTRDFSIRSLADRLGDLSYLIYVFPDRPKDE
600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KB4 AFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTVERDQPLPTPELQMPTMVPSYDLGMAPDSSMSMQ
.: ..: : ..: ::: ::..: ::. . : : : . . :..
CCDS74 VFSKYYTPV-LAKAVDGYVKPQIKQVV--------PEF----VNASADAGGSSATYMDQA
650 660 670 680 690
690 700 710 720 730
pF1KB4 LGPDMVPQ----VYPPHSHSIPPYQG-LSPEESVNVLSAFQEPHLQMPPSLGQMSLPFDQ
.: . :: .:: . . .: .. .:...: .:
CCDS74 PSPAVCPQAPYNMYPQNPDHVLDQDGEFDLDETMDVARHVEELLRRPMDSLDSRLSPPAG
700 710 720 730 740 750
740 750 760 770 780 790
pF1KB4 PHPQGLLPCQPQEHAVSSPDPLLCSDVTMVEDSCLSQPVTAFPQGTWIGEDIFPPLLPPT
CCDS74 LFTSARGSLS
760
>>CCDS11423.1 STAT5B gene_id:6777|Hs108|chr17 (787 aa)
initn: 1451 init1: 953 opt: 1461 Z-score: 1118.1 bits: 217.8 E(32554): 5.8e-56
Smith-Waterman score: 1566; 39.6% identity (65.1% similar) in 766 aa overlap (22-720:26-771)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MSLWGLVSKMPPEKVQRLYVDFPQHLRHLLGDWLESQPWEFLVGSDAFCCNL-ASA
:: ..:: :..:.::: :. : : :. :.
CCDS11 MAVWIQAQQLQGEALHQMQALYGQHFPIEVRHYLSQWIESQAWDS-VDLDNPQENIKATQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB4 LLSDTVQHLQASVGEQ-GEGSTILQ----HIST-LESIYQRDPLKLVATFRQILQGEKKA
:: ::.:: .. .: :: . .:. : .: :.. :.: :..:: .:.:: .:..
CCDS11 LLEGLVQELQKKAEHQVGEDGFLLKIKLGHYATQLQNTYDRCPMELVRCIRHILYNEQRL
60 70 80 90 100 110
110 120 130
pF1KB4 VMEQ------------------------FRHLPMPFHWKQEELK------------FKTG
: : :..: . . ..::: .. .
CCDS11 VREANNGSSPAGSLADAMSQKHLQINQTFEELRLVTQDTENELKKLQQTQEYFIIQYQES
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180
pF1KB4 LRRLQHRVGEIHLL--REALQK--GAEAGQVSLHSLIETPANGTGPSEA-LAMLLQETTG
:: .: . : . : .: :.. . . ::::.. .. :. .. :: :.:
CCDS11 LR-IQAQFGPLAQLSPQERLSRETALQQKQVSLEAWLQREAQTLQQYRVELAEKHQKTLQ
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 ELEAAKALVLKRIQI-WKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQEVGAA--
:. ....: : :::.:::::::.: : :: :: ::.:..: : .:.. :
CCDS11 LLRKQQTIILDDELIQWKRRQQLAGNGGPPEGSLDVLQSWCEKLAEIIWQNRQQIRRAEH
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290
pF1KB4 -------GGELEPKTRASLTGRLDEVLRTLVTSCFLVEKQPPQVLKTQTKFQAGVRFLLG
: .: . : ... . ... .:::: :..:::::::::::::: : ::.:.:
CCDS11 LCQQLPIPGPVE-EMLAEVNATITDIISALVTSTFIIEKQPPQVLKTQTKFAATVRLLVG
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
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. :.. .:: :.: ...:.::. :. .. .. . .:::.:: .: . ::
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CCDS23 E
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]