Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4982
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4982, 801 aa
1>>>pF1KB4982 801 - 801 aa - 801 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2816+/-0.00113; mu= 7.7930+/- 0.067
mean_var=237.4707+/-48.928, 0's: 0 Z-trim(111.4): 904 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.083228
statistics sampled from 11353 (12342) to 11353 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.709), E-opt: 0.2 (0.379), width: 16
Scan time: 3.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9115.1 PRDM4 gene_id:11108|Hs108|chr12 ( 801) 5478 671.7 1.3e-192
CCDS6206.1 PRDM14 gene_id:63978|Hs108|chr8 ( 571) 576 82.9 1.6e-15
CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 ( 606) 565 81.7 4.2e-15
CCDS12856.1 ZNF600 gene_id:162966|Hs108|chr19 ( 722) 565 81.7 4.7e-15
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 564 81.7 5.6e-15
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 564 81.7 5.6e-15
CCDS12208.1 ZNF558 gene_id:148156|Hs108|chr19 ( 402) 557 80.5 6.1e-15
CCDS12861.1 ZNF677 gene_id:342926|Hs108|chr19 ( 584) 555 80.4 9.3e-15
CCDS54239.1 ZNF714 gene_id:148206|Hs108|chr19 ( 555) 552 80.1 1.2e-14
CCDS12496.1 ZNF790 gene_id:388536|Hs108|chr19 ( 636) 553 80.2 1.2e-14
CCDS33094.1 ZNF468 gene_id:90333|Hs108|chr19 ( 522) 550 79.8 1.3e-14
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 550 79.8 1.4e-14
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 549 79.7 1.6e-14
CCDS46029.1 ZNF486 gene_id:90649|Hs108|chr19 ( 463) 546 79.3 1.7e-14
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 548 79.6 1.7e-14
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 548 79.7 2e-14
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 548 79.7 2.1e-14
CCDS46166.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 661) 546 79.4 2.1e-14
CCDS33092.1 ZNF701 gene_id:55762|Hs108|chr19 ( 465) 543 78.9 2.2e-14
CCDS46165.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 674) 546 79.4 2.2e-14
CCDS54311.1 ZNF701 gene_id:55762|Hs108|chr19 ( 531) 543 79.0 2.4e-14
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 546 79.5 2.4e-14
CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 ( 542) 543 79.0 2.4e-14
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 546 79.6 2.7e-14
CCDS54310.1 ZNF578 gene_id:147660|Hs108|chr19 ( 590) 542 78.9 2.8e-14
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 548 79.9 2.8e-14
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 542 78.9 3e-14
CCDS43933.1 ZNF81 gene_id:347344|Hs108|chrX ( 661) 540 78.7 3.5e-14
CCDS33047.1 ZNF233 gene_id:353355|Hs108|chr19 ( 670) 540 78.7 3.6e-14
CCDS33130.1 ZNF543 gene_id:125919|Hs108|chr19 ( 600) 539 78.5 3.6e-14
CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19 ( 718) 540 78.7 3.7e-14
CCDS33095.1 ZNF320 gene_id:162967|Hs108|chr19 ( 509) 537 78.2 3.8e-14
CCDS74437.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 458) 536 78.0 3.8e-14
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 539 78.6 4e-14
CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 492) 536 78.1 4e-14
CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 ( 903) 541 79.0 4e-14
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 536 78.1 4.2e-14
CCDS12850.2 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 535) 536 78.1 4.3e-14
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 537 78.3 4.3e-14
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 538 78.5 4.4e-14
CCDS32978.1 ZNF430 gene_id:80264|Hs108|chr19 ( 570) 536 78.1 4.4e-14
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 538 78.5 4.5e-14
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 538 78.5 4.6e-14
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 537 78.4 4.9e-14
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 537 78.4 5.2e-14
CCDS62623.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 574) 533 77.8 5.7e-14
CCDS74324.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 586) 533 77.8 5.8e-14
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 535 78.1 5.8e-14
CCDS74323.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 618) 533 77.8 6e-14
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 532 77.7 6.2e-14
>>CCDS9115.1 PRDM4 gene_id:11108|Hs108|chr12 (801 aa)
initn: 5478 init1: 5478 opt: 5478 Z-score: 3571.4 bits: 671.7 E(32554): 1.3e-192
Smith-Waterman score: 5478; 100.0% identity (100.0% similar) in 801 aa overlap (1-801:1-801)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MHHRMNEMNLSPVGMEQLTSSSVSNALPVSGSHLGLAASPTHSAIPAPGLPVAIPNLGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 MHHRMNEMNLSPVGMEQLTSSSVSNALPVSGSHLGLAASPTHSAIPAPGLPVAIPNLGPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LSSLPSALSLMLPMGIGDRGVMCGLPERNYTLPPPPYPHLESSYFRTILPGILSYLADRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 LSSLPSALSLMLPMGIGDRGVMCGLPERNYTLPPPPYPHLESSYFRTILPGILSYLADRP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PPQYIHPNSINVDGNTALSITNNPSALDPYQSNGNVGLEPGIVSIDSRSVNTHGAQSLHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 PPQYIHPNSINVDGNTALSITNNPSALDPYQSNGNVGLEPGIVSIDSRSVNTHGAQSLHP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 SDGHEVALDTAITMENVSRVTSPISTDGMAEELTMDGVAGEHSQIPNGSRSHEPLSVDSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 SDGHEVALDTAITMENVSRVTSPISTDGMAEELTMDGVAGEHSQIPNGSRSHEPLSVDSV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 SNNLAADAVGHGGVIPMHGNGLELPVVMETDHIASRVNGMSDSALSDSIHTVAMSTNSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 SNNLAADAVGHGGVIPMHGNGLELPVVMETDHIASRVNGMSDSALSDSIHTVAMSTNSVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VALSTSHNLASLESVSLHEVGLSLEPVAVSSITQEVAMGTGHVDVSSDSLSFVSPSLQME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 VALSTSHNLASLESVSLHEVGLSLEPVAVSSITQEVAMGTGHVDVSSDSLSFVSPSLQME
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 DSNSNKENMATLFTIWCTLCDRAYPSDCPEHGPVTFVPDTPIESRARLSLPKQLVLRQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 DSNSNKENMATLFTIWCTLCDRAYPSDCPEHGPVTFVPDTPIESRARLSLPKQLVLRQSI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VGAEVGVWTGETIPVRTCFGPLIGQQSHSMEVAEWTDKAVNHIWKIYHNGVLEFCIITTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 VGAEVGVWTGETIPVRTCFGPLIGQQSHSMEVAEWTDKAVNHIWKIYHNGVLEFCIITTD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 ENECNWMMFVRKARNREEQNLVAYPHDGKIFFCTSQDIPPENELLFYYSRDYAQQIGVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 ENECNWMMFVRKARNREEQNLVAYPHDGKIFFCTSQDIPPENELLFYYSRDYAQQIGVPE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HPDVHLCNCGKECNSYTEFKAHLTSHIHNHLPTQGHSGSHGPSHSKERKWKCSMCPQAFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 HPDVHLCNCGKECNSYTEFKAHLTSHIHNHLPTQGHSGSHGPSHSKERKWKCSMCPQAFI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 SPSKLHVHFMGHMGMKPHKCDFCSKAFSDPSNLRTHLKIHTGQKNYRCTLCDKSFTQKAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 SPSKLHVHFMGHMGMKPHKCDFCSKAFSDPSNLRTHLKIHTGQKNYRCTLCDKSFTQKAH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 LESHMVIHTGEKNLKCDYCDKLFMRRQDLKQHVLIHTQERQIKCPKCDKLFLRTNHLKKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 LESHMVIHTGEKNLKCDYCDKLFMRRQDLKQHVLIHTQERQIKCPKCDKLFLRTNHLKKH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 LNSHEGKRDYVCEKCTKAYLTKYHLTRHLKTCKGPTSSSSAPEEEEEDDSEEEDLADSVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 LNSHEGKRDYVCEKCTKAYLTKYHLTRHLKTCKGPTSSSSAPEEEEEDDSEEEDLADSVG
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KB4 TEDCRINSAVYSADESLSAHK
:::::::::::::::::::::
CCDS91 TEDCRINSAVYSADESLSAHK
790 800
>>CCDS6206.1 PRDM14 gene_id:63978|Hs108|chr8 (571 aa)
initn: 444 init1: 266 opt: 576 Z-score: 392.2 bits: 82.9 E(32554): 1.6e-15
Smith-Waterman score: 576; 29.7% identity (60.8% similar) in 347 aa overlap (389-725:230-569)
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 MEDSNSNKENMATLFTIWCTLCDRAYPSDCPEHGPVTFVPDTPIESRARLSLPKQLVLRQ
:. . .:.: .. :.::. : : :
CCDS62 EDLHFVLYGVTPSLEHPASLHHAISGLLVPPDSSGSDSLPQT--LDKDSLQLPEGLCLMQ
200 210 220 230 240 250
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 SIVGA--EVGVWTGETIPVRTCFGPLIGQQSHSMEVAEWTDKAVNHIWKIYHNGVLEFCI
.. : . ::. . : . :::. :. .. :: . :..: .:.:...: : .
CCDS62 TVFGEVPHFGVFCSSFIAKGVRFGPFQGKVVNASEVKTYGDNSV--MWEIFEDGHLSH-F
260 270 280 290 300 310
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 ITTDENECNWMMFVRKARNREEQNLVAYPHDGKIFFCTSQDIPPENELLFYYSRDYAQQI
: . ::: .: :: .:::::: .:.::. . ..: ..::: .:. : . .
CCDS62 IDGKGGTGNWMSYVNCARFPKEQNLVAVQCQGHIFYESCKEIHQNQELLVWYGDCYEKFL
320 330 340 350 360 370
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 GVPEHPDVHLCNCGKECNSYTE-----FKAHLTSHIHNHLPTQGHSGSHGPSHSK-ERKW
.: .... . ::. .. .: .. . ... .. . . .. : .: .::.
CCDS62 DIPV--SLQVTEPGKQPSGPSEESAEGYRCERCGKVFTYKYYRDKHLKYTPCVDKGDRKF
380 390 400 410 420 430
600 610 620 630 640
pF1KB4 KCSMCPQAFISPSKLHVHFMG-HMGMKPHKCDFCSKAFSDPSNLRTHLKIHTGQKNYRCT
::.: ..: . ..:..:.. : .::::. :.: ::. :.: :...:.:.. :.:.
CCDS62 PCSLCKRSFEKRDRLRIHILHVHEKHRPHKCSTCGKCFSQSSSLNKHMRVHSGDRPYQCV
440 450 460 470 480 490
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 LCDKSFTQKAHLESHMVIHTGEKNLKCDYCDKLFMRRQDLKQHVL-IHTQERQIKCPKCD
: : :: .. :..:. :.::: .:: :: : : . .:: : .. .: :
CCDS62 YCTKRFTASSILRTHIRQHSGEKPFKCKYCGKSFASHAAHDSHVRRSHKEDDGCSCSICG
500 510 520 530 540 550
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 KLFLRTNHLKKHLNSHEGKRDYVCEKCTKAYLTKYHLTRHLKTCKGPTSSSSAPEEEEED
:.: . . .:.. ::
CCDS62 KIFSDQETFYSHMKFHEDY
560 570
>>CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 (606 aa)
initn: 548 init1: 548 opt: 565 Z-score: 384.7 bits: 81.7 E(32554): 4.2e-15
Smith-Waterman score: 595; 31.6% identity (54.0% similar) in 376 aa overlap (404-754:172-522)
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 TIWCTLCDRAYPSDCPEHGPVTFVPDTPIESRARLSLPKQ--LVLRQSIVGAEVGVWTGE
:: ::. :. :....: . .: :
CCDS31 LETKTTQDYGREIYMSGSHGFQGGRYRLGISRKNLSMEKEQKLIVQHSYIPVE------E
150 160 170 180 190
440 450 460 470 480
pF1KB4 TIPVRTCFGPLIGQQSHSMEVAEWTDKAVNHIWKIYHNGVLEFCII----TTDENECNWM
..: . .: :.. . : . :. ::. . :.. :: :.
CCDS31 ALPQ---YVGVICQEDLLRDSMEEKYCGCNKCKGIYYWN--SRCVFHKRNQPGENLCQ--
200 210 220 230 240
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 MFVRKARNREEQNLVAYP--HDGKIFF-CTSQDIPPENELLFYYSRDYAQQIGVPEHPDV
. :: ....: .: : :: .. : : .. :. :: : :
CCDS31 CSICKACFSQRSDLYRHPRNHIGKKLYGCDEVD------------GNFHQSSGVHFHQRV
250 260 270 280 290
550 560 570 580
pF1KB4 HL------CN-CGKECNSYTEFKAHLTSHIHNH---------LPTQGHSGSHGPSHSKER
:. :: ::: .. . .. : : ... : .. : : :.
CCDS31 HIGEVPYSCNACGKSFSQISSLHNHQRVHTEEKFYKIECDKDLSRNSLLHIHQRLHIGEK
300 310 320 330 340 350
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 KWKCSMCPQAFISPSKLHVHFMGHMGMKPHKCDFCSKAFSDPSNLRTHLKIHTGQKNYRC
.::..: ..: : :::: : : ::.::: :.:.::. :::: : .:::.:.:.:
CCDS31 PFKCNQCGKSFNRSSVLHVHQRVHTGEKPYKCDECGKGFSQSSNLRIHQLVHTGEKSYKC
360 370 380 390 400 410
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 TLCDKSFTQKAHLESHMVIHTGEKNLKCDYCDKLFMRRQDLKQHVLIHTQERQIKCPKCD
: :.:::...:. :. .::::: ::: : : : . .::. : .:: :. ::.:
CCDS31 EDCGKGFTQRSNLQIHQRVHTGEKPYKCDDCGKDFSHSSDLRIHQRVHTGEKPYTCPECG
420 430 440 450 460 470
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 KLFLRTNHLKKHLNSHEGKRDYVCEKCTKAYLTKYHLTRHLKTCKGPTSSSSAPEEEEED
: : ....:. : : :.. : ::.: :.. . :: : .. :
CCDS31 KGFSKSSKLHTHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSQRSHLLIHQRVHTGEKPYKCHDCGKGFS
480 490 500 510 520 530
770 780 790 800
pF1KB4 DSEEEDLADSVGTEDCRINSAVYSADESLSAHK
CCDS31 HSSNLHIHQRVHTGEKPYQCAKCGKGFSHSSALRIHQRVHAGEKPYKCREYYKGFDHNSH
540 550 560 570 580 590
>>CCDS12856.1 ZNF600 gene_id:162966|Hs108|chr19 (722 aa)
initn: 974 init1: 549 opt: 565 Z-score: 383.8 bits: 81.7 E(32554): 4.7e-15
Smith-Waterman score: 570; 32.3% identity (57.4% similar) in 331 aa overlap (444-755:382-693)
420 430 440 450 460
pF1KB4 LVLRQSIVGAEVGVWTGETIPVRTCFGPLIGQQSHSMEVAE----WTDKAVNHIWKIYHN
:..:.. .: . :... : : .:. .
CCDS12 HTGEKTYKCNECGKTFSHKSSLVCHHRLHGGEKSYKCKVCDKAFAWNSHLVRHT-RIHSG
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500 510
pF1KB4 GVLEFCIITTDENEC------NWMMFVRKARNREEQNLVAYPHDGKIFFCTS----QDIP
: : ::: : ....:. . :: : . :.: : : . :
CCDS12 GKPYKC------NECGKTFGQNSDLLIHKSIHTGEQPY-KYEECEKVFSCGSTLETHKII
420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 PENELLF---YYSRDYAQQIGVPEHPDVHLCNCGKECNSYTEFKAHLTSHIHNHLPTQGH
.: . .. .: . . .: .: . .:: .. : .....:
CCDS12 HTGEKPYKCKVCDKAFACHSYLAKHTRIHSGEKPYKCNECSK-----TFRLRSYL-----
470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
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..:::.:.:.::.:::.:.....: : :::.:: ::. : : : ....:. : ::
CCDS12 RRLHTGEKSYKCTVCDKAFVRNSYLARHTRIHTAEKPYKCNECGKAFNQQSQLSLHHRIH
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. :. :: :::.: : .:::.: : ::. : :. : :.. . :: .: :.: .
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CCDS12 PYKCNECGKAFSKQSTLIHHQAVHGVGKLD
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CCDS12 IHTGEKPYECSDCGKAFNNLSAVKKHLRTHTGEKPYECNHCGKSFTSNSYLSVHKRIHNR
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CCDS12 WI
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CCDS54 KCEECGKAFNRSSNLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHNIIHTGEKSYKCEE
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CCDS54 CGKAFNQSSTLTKHRKIQQGMVAHACNPNTLRGLGEQIARSGVQDQPGQHGKTPSLLKIQ
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CCDS12 SLGFCIYQPEAFSLLEKGKEPWKILRDETRGP---CPDMQSRCQTKKLLPKNGIFEREIA
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