FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4985, 535 aa
1>>>pF1KB4985 535 - 535 aa - 535 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6428+/-0.00122; mu= 16.0558+/- 0.073
mean_var=57.7386+/-11.585, 0's: 0 Z-trim(98.8): 43 B-trim: 33 in 1/47
Lambda= 0.168788
statistics sampled from 5465 (5504) to 5465 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.169), width: 16
Scan time: 2.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8991.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 535) 3368 829.1 0
CCDS55843.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 488) 3082 759.5 0
CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 543) 1012 255.4 1.2e-67
CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 520) 941 238.1 1.9e-62
CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 541) 938 237.4 3.2e-62
CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 503) 937 237.1 3.6e-62
CCDS54367.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 499) 934 236.4 5.9e-62
CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 539) 843 214.3 3e-55
CCDS54366.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 456) 798 203.3 5e-52
CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 545) 795 202.6 9.9e-52
CCDS82990.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 448) 697 178.7 1.3e-44
CCDS82989.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 486) 697 178.7 1.4e-44
CCDS30888.1 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 507) 683 175.3 1.5e-43
CCDS33528.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 548) 682 175.1 1.9e-43
CCDS68181.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 529) 679 174.3 3.1e-43
CCDS58711.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 509) 670 172.1 1.4e-42
CCDS5269.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 556) 653 168.0 2.6e-41
CCDS5523.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 531) 622 160.4 4.7e-39
CCDS32617.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 530) 615 158.7 1.5e-38
CCDS68180.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 475) 594 153.6 4.7e-37
CCDS43522.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 401) 555 144.1 2.9e-34
CCDS42696.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 339) 545 141.7 1.3e-33
CCDS13738.1 CCT8L2 gene_id:150160|Hs108|chr22 ( 557) 524 136.6 7.4e-32
CCDS54105.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 485) 406 107.8 2.9e-23
CCDS34640.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 486) 400 106.4 8e-23
CCDS54106.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 493) 376 100.5 4.7e-21
>>CCDS8991.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 (535 aa)
initn: 3368 init1: 3368 opt: 3368 Z-score: 4428.5 bits: 829.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3368; 100.0% identity (100.0% similar) in 535 aa overlap (1-535:1-535)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASLSLAPVNIFKAGADEERAETARLTSFIGAIAIGDLVKSTLGPKGMDKILLSSGRDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MASLSLAPVNIFKAGADEERAETARLTSFIGAIAIGDLVKSTLGPKGMDKILLSSGRDAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LMVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESLIAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LMVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESLIAKK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 IHPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDHFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 IHPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDHFT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 KLAVEAVLRLKGSGNLEAIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVNQPKRIENAKILIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KLAVEAVLRLKGSGNLEAIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVNQPKRIENAKILIA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 NTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQLIYNYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 NTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQLIYNYP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 EQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIGEDKLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 EQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIGEDKLI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 HFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSEMLMAHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 HFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSEMLMAHA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VTQLANRTPGKEAVAMESYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQLRAAHSEGNTTAGLDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 VTQLANRTPGKEAVAMESYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQLRAAHSEGNTTAGLDM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB4 REGTIGDMAILGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHPC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 REGTIGDMAILGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHPC
490 500 510 520 530
>>CCDS55843.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 (488 aa)
initn: 3082 init1: 3082 opt: 3082 Z-score: 4052.8 bits: 759.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3082; 100.0% identity (100.0% similar) in 488 aa overlap (48-535:1-488)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 EERAETARLTSFIGAIAIGDLVKSTLGPKGMDKILLSSGRDASLMVTNDGATILKNIGVD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MDKILLSSGRDASLMVTNDGATILKNIGVD
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 NPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESLIAKKIHPQTIIAGWREATKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESLIAKKIHPQTIIAGWREATKAA
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 REALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDHFTKLAVEAVLRLKGSGNLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 REALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDHFTKLAVEAVLRLKGSGNLE
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 AIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVNQPKRIENAKILIANTGMDTDKIKIFGSRVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVNQPKRIENAKILIANTGMDTDKIKIFGSRVR
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 VDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQLIYNYPEQLFGAAGVMAIEHADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQLIYNYPEQLFGAAGVMAIEHADF
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 AGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIGEDKLIHFSGVALGEACTIVLRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIGEDKLIHFSGVALGEACTIVLRG
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 ATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSEMLMAHAVTQLANRTPGKEAVAME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSEMLMAHAVTQLANRTPGKEAVAME
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 SYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQLRAAHSEGNTTAGLDMREGTIGDMAILGITESF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQLRAAHSEGNTTAGLDMREGTIGDMAILGITESF
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530
pF1KB4 QVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHPC
460 470 480
>>CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 (543 aa)
initn: 897 init1: 455 opt: 1012 Z-score: 1327.8 bits: 255.4 E(32554): 1.2e-67
Smith-Waterman score: 1012; 35.8% identity (67.0% similar) in 528 aa overlap (8-529:5-527)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MASLSLAPVNIFKAGADEERAETARLTSFIGAI-AIGDLVKSTLGPKGMDKILLSSGRDA
:: ..: :.: .. .:.: :.: .:.. :..::::.:::: :. .::
CCDS46 MMPTPVILLKEGTDSSQG-IPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDK-LIVDGRGK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 SLMVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESLIAK
. ..:::::::: . : .::::.:::... :: ::::::::::.::::.:.... . .
CCDS46 AT-ISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 KIHPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVD-HGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDH
.::: :: ..: ::. : . . :: . .:.:. :. : . : :.:::::....:
CCDS46 GLHPQIIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 FTKLAVEAVLRLKGSGNLEAIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVN----QPKRIEN
:.:..:.::. : .:. : : : ::.: :: : : . : .. :::. .:
CCDS46 FAKMVVDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 AKILIANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQ
:: . :. .. : . ....:: .. : :: . . .:.:.: . : . ...
CCDS46 PKIALLNVELEL-KAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 LIYNYPEQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMI
: . : :. .. .. ..: .. :: : .. . :: :...::..:
CCDS46 PIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 GEDKLIHFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSE
: .. :.: ...::..:::...:...:.:::::::. .. ...:.. .: ::: :
CCDS46 GGERYNFFTGCPKAKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 MLMAHAVTQLANRTPGKEAVAMESYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQLRAAHSEGNT
: ... . . . :::. . . .:::::...: . ::::.:..... .::: :..:.:
CCDS46 MELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 TAGLDMREGTIGDMAILGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHP
:.:. . :.: . : .:. ..: .:.::: .:. ::. :: ::. :
CCDS46 WYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKN-PRSTVDAPTA
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 C
CCDS46 AGRGRGRGRPH
540
>>CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (520 aa)
initn: 689 init1: 299 opt: 941 Z-score: 1234.7 bits: 238.1 E(32554): 1.9e-62
Smith-Waterman score: 941; 34.3% identity (69.6% similar) in 510 aa overlap (22-522:10-514)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASLSLAPVNIFKAGADEERAETARLTSFIGAIAIGDLVKSTLGPKGMDKILLSSGRDAS
: .. ...: :... ....:::.:.::.... .:..
CCDS82 MNSSLGPTIEKLSVSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVD--KDGD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LMVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESLIAKK
. :::::::::. . ::. ::..:..:. ::::.:::::.:.:::. ::.:::.:. .
CCDS82 VTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 IHPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDHFT
::: : :...:...: : : .. : ..: . :.. : :::.::... . ...
CCDS82 IHPIRIADGYEQAARVAIEHL-DKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMA
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB4 KLAVEAVLRL----KGSGNLEAIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVNQ-PKRIENA
..::.::: . . . ..: :.. :.:: : :. : .: ..:: .. : ::..:.:
CCDS82 EIAVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 KILIANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQL
:: : . .. : : .. : :. ... ::::..: ...: . : : : .
CCDS82 KIAILTCPFEPPKPKT-KHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 IYNYPEQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIG
. . ..:. .. :.. . .: .:..:::.:. :.. ::: :..:. .:
CCDS82 FDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEISFG
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 --EDKLIHFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCS
.::.. . ..: :: .::....:..::.:::::::::. . ..:.:.::::: .
CCDS82 TTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAA
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 EMLMAHAVTQLANRTPGKEAVAMESYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQLRAAH-SEG
:. : ::.: :.. : : ::...: ::...: ...:.:.. . ....:: . .:
CCDS82 EISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVKEM
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 NTTAGLD-MREGTIGDMAILGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPD
: . :.: ...:: .:: . :.. :.: . :.. ...::..:.: :
CCDS82 NPALGIDCLHKGT-NDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 HHPC
>>CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (541 aa)
initn: 689 init1: 299 opt: 938 Z-score: 1230.4 bits: 237.4 E(32554): 3.2e-62
Smith-Waterman score: 938; 34.5% identity (69.9% similar) in 505 aa overlap (27-522:36-535)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MASLSLAPVNIFKAGADEERAETARLTSFIGAIAIGDLVKSTLGPKGMDKILLSSG
. ...: :... ....:::.:.::....
CCDS38 TLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVD--
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 RDASLMVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESL
.:... :::::::::. . ::. ::..:..:. ::::.:::::.:.:::. ::.:::.:
CCDS38 KDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 IAKKIHPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHK
. . ::: : :...:...: : : .. : ..: . :.. : :::.::... .
CCDS38 LDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHL-DKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 DHFTKLAVEAVLRL----KGSGNLEAIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVNQ-PKR
.....::.::: . . . ..: :.. :.:: : :. : .: ..:: .. : ::.
CCDS38 RQMAEIAVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 IENAKILIANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFI
.:.::: : . .. : : .. : :. ... ::::..: ...: . : : :
CCDS38 VEDAKIAILTCPFEPPKPKT-KHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 NRQLIYNYPEQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEE
. . . ..:. .. :.. . .: .:..:::.:. :.. ::: :..:
CCDS38 CQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KB4 VMIG--EDKLIHFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYG
. .: .::.. . ..: :: .::....:..::.:::::::::. . ..:.:.:::
CCDS38 ISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYG
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 GGCSEMLMAHAVTQLANRTPGKEAVAMESYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQLRAAH
:: .:. : ::.: :.. : : ::...: ::...: ...:.:.. . ....:: .
CCDS38 GGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQ
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 -SEGNTTAGLD-MREGTIGDMAILGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRK
.: : . :.: ...:: .:: . :.. :.: . :.. ...::..:.: :
CCDS38 VKEMNPALGIDCLHKGT-NDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESE
490 500 510 520 530 540
530
pF1KB4 RVPDHHPC
CCDS38 E
>>CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (503 aa)
initn: 689 init1: 299 opt: 937 Z-score: 1229.7 bits: 237.1 E(32554): 3.6e-62
Smith-Waterman score: 937; 34.7% identity (69.9% similar) in 502 aa overlap (30-522:1-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASLSLAPVNIFKAGADEERAETARLTSFIGAIAIGDLVKSTLGPKGMDKILLSSGRDAS
..: :... ....:::.:.::.... .:..
CCDS77 MAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVD--KDGD
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LMVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESLIAKK
. :::::::::. . ::. ::..:..:. ::::.:::::.:.:::. ::.:::.:. .
CCDS77 VTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRG
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 IHPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDHFT
::: : :...:...: : : .. : ..: . :.. : :::.::... . ...
CCDS77 IHPIRIADGYEQAARVAIEHL-DKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMA
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230
pF1KB4 KLAVEAVLRL----KGSGNLEAIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVNQ-PKRIENA
..::.::: . . . ..: :.. :.:: : :. : .: ..:: .. : ::..:.:
CCDS77 EIAVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDA
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 KILIANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQL
:: : . .. : : .. : :. ... ::::..: ...: . : : : .
CCDS77 KIAILTCPFEPPKPKT-KHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWG
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 IYNYPEQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIG
. . ..:. .. :.. . .: .:..:::.:. :.. ::: :..:. .:
CCDS77 FDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEISFG
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 --EDKLIHFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCS
.::.. . ..: :: .::....:..::.:::::::::. . ..:.:.::::: .
CCDS77 TTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAA
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 EMLMAHAVTQLANRTPGKEAVAMESYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQLRAAH-SEG
:. : ::.: :.. : : ::...: ::...: ...:.:.. . ....:: . .:
CCDS77 EISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVKEM
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 NTTAGLD-MREGTIGDMAILGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPD
: . :.: ...:: .:: . :.. :.: . :.. ...::..:.: :
CCDS77 NPALGIDCLHKGT-NDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 HHPC
>>CCDS54367.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 (499 aa)
initn: 846 init1: 455 opt: 934 Z-score: 1225.8 bits: 236.4 E(32554): 5.9e-62
Smith-Waterman score: 934; 35.3% identity (66.7% similar) in 487 aa overlap (48-529:1-483)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 EERAETARLTSFIGAIAIGDLVKSTLGPKGMDKILLSSGRDASLMVTNDGATILKNIGVD
:::.... :: . ..:::::::: . :
CCDS54 MDKLIVD-GRGKAT-ISNDGATILKLLDVV
10 20
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 NPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESLIAKKIHPQTIIAGWREATKAA
.::::.:::... :: ::::::::::.::::.:.... . . .::: :: ..: ::. :
CCDS54 HPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATQLA
30 40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 REALLSSAVD-HGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDHFTKLAVEAVLRLKGSGNL
. . :: . .:.:. :. : . : :.:::::....: :.:..:.::. : .:
CCDS54 VNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDDLLQL
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 EAIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVN----QPKRIENAKILIANTGMDTDKIKIF
. : : : ::.: :: : : . : .. :::. .: :: . :. .. : .
CCDS54 KMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIALLNVELEL-KAEKD
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 GSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQLIYNYPEQLFGAAGVMAI
....:: .. : :: . . .:.:.: . : . ... : . : :. ..
CCDS54 NAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCA
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 EHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIGEDKLIHFSGVALGEACT
.. ..: .. :: : .. . :: :...::..:: .. :.: ...::
CCDS54 GRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCT
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 IVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSEMLMAHAVTQLANRTPGKE
..:::...:...:.:::::::. .. ...:.. .: ::: :: ... . . . :::.
CCDS54 FILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQ
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 AVAMESYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQLRAAHSEGNTTAGLDMREGTIGDMAILG
. . .:::::...: . ::::.:..... .::: :..:.: :.:. . :.:
CCDS54 QLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGTWYGVDINNEDIADNFEAF
390 400 410 420 430 440
500 510 520 530
pF1KB4 ITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHPC
. : .:. ..: .:.::: .:. ::. :: ::. :
CCDS54 VWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKN-PRSTVDAPTAAGRGRGRGRPH
450 460 470 480 490
>>CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 (539 aa)
initn: 738 init1: 345 opt: 843 Z-score: 1105.4 bits: 214.3 E(32554): 3e-55
Smith-Waterman score: 902; 32.2% identity (67.4% similar) in 522 aa overlap (14-521:23-536)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MASLSLAPVNIFKAGADEERAETARLTSFIGAIAIGDLVKSTLGPKGMDKI
: :... :.... .: :..: ....::::::::.
CCDS33 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 LLSSGRDASLMVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLR
. .. :.. .:::::::::.. : .:::..::..:..:: :.:::::::...:. ::
CCDS33 IQDGKGDVT--ITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLD
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB4 EAESLIAKKIHPQTIIAGWREATKAAREAL--LSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSS
.:. : ::: : ....: . . : : .: :. :: :. :.: : :.:.:
CCDS33 SCTKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVEL-SD----RETLLNSATTSLNS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 KLLTHHKDHFTKLAVEAVLRL-----KGSGNLEAIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKI
:....... .. ..:.::... : .:. :.:.:::::.. : : ::..: .:.
CCDS33 KVVSQYSSLLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 GVNQPKRIENAKILIANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILK
. . :.:.::: . . ... : . ... :.. :.. .. . :. . . :..: :
CCDS33 SNSGITRVEKAKIGLIQFCLSAPKTDM-DNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB4 HGINCF-----INRQLIYNYPEQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPE
: : . : :. . . .... .:.:. . .: . . : . .. .:.
CCDS33 TGCNVLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFT
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 LVKLGSCKLIEEVMI-GEDKLIHFSGVAL-GEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVL
::: .: ::: . : ::....: : :.. :::.::... ...:::::.::::::.
CCDS33 ADMLGSAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVI
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 AQTVKDSRTVYGGGCSEMLMAHAVTQLANRTPGKEAVAMESYAKALRMLPTIIADNAGYD
:: . ::: :. .: .:. . : :. ....: :....:. .:.::: .
CCDS33 RCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLN
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 SADLVAQLRAAHSEGNTTAGLDMREGTIGDMAILGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRV
. :..:: :..:. :::...:.: :... ... . :. ..: :.:... ::..
CCDS33 PISTVTELRNRHAQGEKTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKI
480 490 500 510 520 530
520 530
pF1KB4 DNIIKAAPRKRVPDHHPC
:...
CCDS33 DDVVNTR
>>CCDS54366.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 (456 aa)
initn: 725 init1: 455 opt: 798 Z-score: 1047.5 bits: 203.3 E(32554): 5e-52
Smith-Waterman score: 798; 33.6% identity (65.5% similar) in 440 aa overlap (95-529:3-440)
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 NDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESLIAKKIHPQ
:::::::::.::::.:.... . . .:::
CCDS54 MMVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQ
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 TIIAGWREATKAAREALLSSAVD-HGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDHFTKLA
:: ..: ::. : . . :: . .:.:. :. : . : :.:::::....: :.:..
CCDS54 IIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMV
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230
pF1KB4 VEAVLRLKGSGNLEAIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVN----QPKRIENAKILI
:.::. : .:. : : : ::.: :: : : . : .. :::. .: :: .
CCDS54 VDAVMMLDDLLQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIAL
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 ANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQLIYNY
:. .. : . ....:: .. : :: . . .:.:.: . : . ... : .
CCDS54 LNVELEL-KAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPIGDV
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 PEQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIGEDKL
: :. .. .. ..: .. :: : .. . :: :...::..:: ..
CCDS54 ATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIGGERY
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 IHFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSEMLMAH
:.: ...::..:::...:...:.:::::::. .. ...:.. .: ::: :: ...
CCDS54 NFFTGCPKAKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSK
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 AVTQLANRTPGKEAVAMESYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQLRAAHSEGNTTAGLD
. . . :::. . . .:::::...: . ::::.:..... .::: :..:.: :.:
CCDS54 YLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGTWYGVD
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 MREGTIGDMAILGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHPC
. . :.: . : .:. ..: .:.::: .:. ::. :: ::. :
CCDS54 INNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKN-PRSTVDAPTAAGRGR
400 410 420 430 440 450
CCDS54 GRGRPH
>>CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 (545 aa)
initn: 674 init1: 273 opt: 795 Z-score: 1042.2 bits: 202.6 E(32554): 9.9e-52
Smith-Waterman score: 795; 30.2% identity (67.4% similar) in 536 aa overlap (8-527:6-529)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASLSLAPVNIFKAGADEERAETARLTSFIGAIAIGDLVKSTLGPKGMDKILLSSGRDAS
:: ... .. .: .. .. .. .: .:.:.... ::::.: :.::. ..
CCDS11 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPM--GG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LMVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESLIAKK
...:::: .::..: :..:::: ....::.::.::::::::: .::.:.: :: .. ..
CCDS11 IVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB4 IHPQTIIAGWREATKAAREAL--LSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDH
.:: ..:...:.: .: .: :: ..... ..:: ......: ... ..
CCDS11 MHPTVVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDM-----MLNIINSSITTKAISRWSSL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 FTKLAVEAV--LRLKGSGNLEAIHI-----IKKL-GGSLADSYLDEGFLLDKKIGVNQPK
..:..:: .... .: : : : ..:. :: . :: . .: ...: . . .
CCDS11 ACNIALDAVKMVQFEENGRKE-IDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB4 R-IENAKILIANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINC
: :.: .:.. ..... : . . ... ..: . :.: ... : :.. .
CCDS11 RYIKNPRIVLLDSSLEYKKGES-QTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDV
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 FINRQLIYNYPEQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVK---LGS-
:... : . .. . :.. ::... . .:.: . :..:.: .:: .. .:.
CCDS11 VITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVS---RPEELREDDVGTG
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 CKLIEEVMIGEDKLIHFSGVALGEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSR
:.: ::.. . .. .::::.::::...::.:.::.:.::. : ... : .
CCDS11 AGLLEIKKIGDEYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQ
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 TVYGGGCSEMLMAHAVTQLANRTPGKEAVAMESYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQL
: ::: ::: .:::.:. .. : : ... :.::...: . .: : .. :...:
CCDS11 LVPGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSL
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 RAAHSEGNT-TAGLDMREGTIGDMAILGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAA
:: :.. : : :.. . ::. :: ::: : . :: :. .:.:.: ..::.:.:...
CCDS11 RAKHTQENCETWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGH
470 480 490 500 510 520
530
pF1KB4 PRKRVPDHHPC
.:
CCDS11 KKKGDDQSRQGGAPDAGQE
530 540
535 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 15:40:57 2016 done: Thu Nov 3 15:40:58 2016
Total Scan time: 2.840 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]