Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5005
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5005, 418 aa
1>>>pF1KB5005 418 - 418 aa - 418 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6832+/-0.000962; mu= 15.3126+/- 0.058
mean_var=72.9306+/-14.601, 0's: 0 Z-trim(105.1): 50 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.150182
statistics sampled from 8194 (8243) to 8194 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 2.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 2692 592.7 2.1e-169
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 628 145.5 7.9e-35
CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 612 142.1 9.2e-34
CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 ( 376) 610 141.6 1.2e-33
CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 380) 609 141.4 1.4e-33
CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 376) 608 141.2 1.6e-33
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 565 131.9 1.1e-30
CCDS32839.1 SERPINB5 gene_id:5268|Hs108|chr18 ( 375) 559 130.6 2.5e-30
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 556 129.9 4.2e-30
CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 ( 379) 536 125.6 8e-29
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 532 124.7 1.6e-28
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 ( 397) 525 123.2 4.4e-28
CCDS11989.1 SERPINB2 gene_id:5055|Hs108|chr18 ( 415) 521 122.4 8.3e-28
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 508 119.5 5.7e-27
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 508 119.5 5.8e-27
CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 ( 423) 492 116.1 6.5e-26
CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 435) 488 115.2 1.2e-25
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 469 111.1 1.9e-24
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 397) 466 110.4 3.1e-24
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 409) 466 110.4 3.2e-24
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 398) 465 110.2 3.6e-24
CCDS11984.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 405) 456 108.3 1.4e-23
CCDS77194.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 425) 456 108.3 1.5e-23
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 451 107.2 3.1e-23
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 449 106.7 3.9e-23
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 ( 390) 447 106.3 5.3e-23
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 ( 499) 443 105.5 1.2e-22
CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 363) 440 104.8 1.4e-22
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 437 104.2 2.6e-22
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 436 103.9 2.8e-22
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 434 103.5 3.8e-22
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 428 102.2 9.9e-22
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 423 101.1 2e-21
CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX ( 415) 419 100.3 3.7e-21
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 ( 464) 410 98.3 1.6e-20
CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 491) 401 96.4 6.4e-20
CCDS11988.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 380) 383 92.4 7.7e-19
CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 ( 422) 382 92.2 9.8e-19
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 375 90.6 1.7e-18
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 427) 364 88.4 1.5e-17
CCDS3203.1 SERPINI1 gene_id:5274|Hs108|chr3 ( 410) 355 86.4 5.5e-17
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 286) 345 84.1 1.8e-16
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 192) 326 79.9 2.2e-15
CCDS77196.1 SERPINB11 gene_id:89778|Hs108|chr18 ( 305) 328 80.5 2.5e-15
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 306 75.7 7.3e-14
CCDS53870.1 SERPINE3 gene_id:647174|Hs108|chr13 ( 424) 286 71.4 1.8e-12
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 282 70.6 3.8e-12
CCDS1585.1 AGT gene_id:183|Hs108|chr1 ( 485) 273 68.7 1.4e-11
>>CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 (418 aa)
initn: 2692 init1: 2692 opt: 2692 Z-score: 3154.9 bits: 592.7 E(32554): 2.1e-169
Smith-Waterman score: 2692; 100.0% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRSLLLLSAFCLLEAALAAEVKKPAAAAAPGTAEKLSPKAATLAERSAGLAFSLYQAMAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MRSLLLLSAFCLLEAALAAEVKKPAAAAAPGTAEKLSPKAATLAERSAGLAFSLYQAMAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DQAVENILVSPVVVASSLGLVSLGGKATTASQAKAVLSAEQLRDEEVHAGLGELLRSLSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DQAVENILVSPVVVASSLGLVSLGGKATTASQAKAVLSAEQLRDEEVHAGLGELLRSLSN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 STARNVTWKLGSRLYGPSSVSFADDFVRSSKQHYNCEHSKINFRDKRSALQSINEWAAQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 STARNVTWKLGSRLYGPSSVSFADDFVRSSKQHYNCEHSKINFRDKRSALQSINEWAAQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 TDGKLPEVTKDVERTDGALLVNAMFFKPHWDEKFHHKMVDNRGFMVTRSYTVGVMMMHRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TDGKLPEVTKDVERTDGALLVNAMFFKPHWDEKFHHKMVDNRGFMVTRSYTVGVMMMHRT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GLYNYYDDEKEKLQIVEMPLAHKLSSLIILMPHHVEPLERLEKLLTKEQLKIWMGKMQKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GLYNYYDDEKEKLQIVEMPLAHKLSSLIILMPHHVEPLERLEKLLTKEQLKIWMGKMQKK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 AVAISLPKGVVEVTHDLQKHLAGLGLTEAIDKNKADLSRMSGKKDLYLASVFHATAFELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AVAISLPKGVVEVTHDLQKHLAGLGLTEAIDKNKADLSRMSGKKDLYLASVFHATAFELD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB5 TDGNPFDQDIYGREELRSPKLFYADHPFIFLVRDTQSGSLLFIGRLVRPKGDKMRDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TDGNPFDQDIYGREELRSPKLFYADHPFIFLVRDTQSGSLLFIGRLVRPKGDKMRDEL
370 380 390 400 410
>>CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 (374 aa)
initn: 388 init1: 119 opt: 628 Z-score: 738.7 bits: 145.5 E(32554): 7.9e-35
Smith-Waterman score: 628; 31.3% identity (63.4% similar) in 377 aa overlap (43-409:4-374)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 LEAALAAEVKKPAAAAAPGTAEKLSPKAATLAERSAGLAFSLYQAMAKDQAVENILVSPV
: : .. .:.::.. ..... .:.. ::.
CCDS11 MDDLCEANGTFAISLFKILGEEDNSRNVFFSPM
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 VVASSLGLVSLGGKATTASQAKAVLSAEQLRDEEVHAGLGELLRSLSNSTARNVTWKLGS
..:.:..: .:.:..::.: . .: .: ..: :. :: : : :. . . ..
CCDS11 SISSALAMVFMGAKGSTAAQMSQALCL--YKDGDIHRGFQSLL-SEVNRTGTQYLLRTAN
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 RLYGPSSVSFADDFVRSSKQHYNCEHSKINF-RDKRSALQSINEWAAQTTDGKLPEVTK-
::.: .. .: :: . .. :. : ...: .: . . ::.:.:. :.::. ::
CCDS11 RLFGEKTCDFLPDFKEYCQKFYQAELEELSFAEDTEECRKHINDWVAEKTEGKISEVLDA
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240
pF1KB5 -DVERTDGALLVNAMFFKPHWDEKFHHKMVDNRGFMV-TRSYTVGVMMMHRTGLYNY-YD
:. .::::..:: .:.:.: .:.. ::.. : :.:: . . ... :
CCDS11 GTVDPLTKLVLVNAIYFKGKWNEQFDRKYT--RGMLFKTNEEKKTVQMMFKEAKFKMGYA
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 DEKEKLQIVEMPLAHKLSSLIILMPHHVEPLERLEKLLTKEQLKIWMG--KMQKKAVAIS
:: . :..:.: ... :..::.: : .:: :: :..: : . :. :. : .
CCDS11 DEVHT-QVLELPYVEEELSMVILLPDDNTDLAVVEKALTYEKFKAWTNSEKLTKSKVQVF
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LPKGVVEVTHDLQKHLAGLGLTEAIDKNKADLSRMSGKKDLYLASVFHATAFELDTDGNP
::. .: ..::. : ::. .:.:. :::.: :: .:.. :..: : :.. .:.
CCDS11 LPRLKLEESYDLEPFLRRLGMIDAFDEAKADFSGMSTEKNVPLSKVAHKCFVEVNEEGTE
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410
pF1KB5 FDQDIYGREELRSPKL---FYADHPFIFLVRDTQSGSLLFIGRLVRPKGDKMRDEL
.. : .. : :::::.:..: ... .:: ::. :
CCDS11 AAAATAVVRNSRCSRMEPRFCADHPFLFFIRHHKTNCILFCGRFSSP
330 340 350 360 370
>>CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 (395 aa)
initn: 381 init1: 167 opt: 612 Z-score: 719.6 bits: 142.1 E(32554): 9.2e-34
Smith-Waterman score: 612; 29.7% identity (66.1% similar) in 387 aa overlap (35-409:12-395)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 LLLSAFCLLEAALAAEVKKPAAAAAPGTAEKLSPKAA---TLAERSAGLAFSLYQAMAKD
::. :.: .::: .. .:..: ....::
CCDS75 MSSRQRGNFNYKLAFKSAIMDVLAEANGTFALNLLKTLGKD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QAVENILVSPVVVASSLGLVSLGGKATTASQAKAVLSAEQLRDE-EVHAGLGELLRSLSN
.. .:.. ::. .. .:..: .:.:..::.: .:: .. ..: :. :: . :
CCDS75 NS-KNVFFSPMSMSCALAMVYMGAKGNTAAQMAQILSFNKSGGGGDIHQGFQSLLTEV-N
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB5 STARNVTWKLGSRLYGPSSVSFADDFVRSSKQHYNCEHSKINFRDK-RSALQSINEWAAQ
.:. . ....::.: .: .: ..: : .. :. : ...: . ... . :: :.:.
CCDS75 KTGTQYLLRMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQAEMEELDFISAVEKSRKHINTWVAE
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 TTDGKLPEVTK--DVERTDGALLVNAMFFKPHWDEKFHHKMVDNRGFMVTRSYTVGVMMM
:.::. :. . .:. .::::..:. .:::.: .. ...: : :... :.::
CCDS75 KTEGKIAELLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDEQFDKENTEERLFKVSKNEEKPVQMM
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 HRTGLYNYYDDEKEKLQIVEMPLAHKLSSLIILMPHHVEPLERLEKLLTKEQLKIW--MG
. . .. . ::. .: . : ..::..: .. :. .:: :: :.. : .
CCDS75 FKQSTFKKTYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDETTDLRTVEKELTYEKFVEWTRLD
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 KMQKKAVAISLPKGVVEVTHDLQKHLAGLGLTEAIDKNKADLSRMSGKKDLYLASVFHAT
:... : .:::. .: ..:... : .::.:.:.. .:::.: :: . :: :..: : .
CCDS75 MMDEEEVEVSLPRFKLEESYDMESVLRNLGMTDAFELGKADFSGMS-QTDLSLSKVVHKS
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 AFELDTDGNPFDQDIYGREELRSPKL---FYADHPFIFLVRDTQSGSLLFIGRLVRPKGD
:.. .:. . .: .. : :::::.:... ......:: ::. :
CCDS75 FVEVNEEGTEAAAATAAIMMMRCARFVPRFCADHPFLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 KMRDEL
>>CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 (376 aa)
initn: 498 init1: 178 opt: 610 Z-score: 717.6 bits: 141.6 E(32554): 1.2e-33
Smith-Waterman score: 610; 29.7% identity (63.9% similar) in 377 aa overlap (42-409:3-376)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 LLEAALAAEVKKPAAAAAPGTAEKLSPKAATLAERSAGLAFSLYQAMAKDQAVENILVSP
::.. :. .:. : . . .:. .:.. ::
CCDS44 METLSNASGTFAIRLLKILCQDNPSHNVFCSP
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 VVVASSLGLVSLGGKATTASQAKAVLSAEQLRDEEVHAGLGELLRSLSNSTARNVTWKLG
: ..:.:..: ::.:..::.: .:: . .:..: .. :: . :... . . .
CCDS44 VSISSALAMVLLGAKGNTATQMAQALSLNT--EEDIHRAFQSLLTEV-NKAGTQYLLRTA
40 50 60 70 80
140 150 160 170 180
pF1KB5 SRLYGPSSVSFADDFVRSSKQHYNCEHSKINF-RDKRSALQSINEWAAQTTDGKLPEVT-
.::.: .. .: . : .: : :. : ....: : . . . :: :... :.::. :.
CCDS44 NRLFGEKTCQFLSTFKESCLQFYHAELKELSFIRAAEESRKHINTWVSKKTEGKIEELLP
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 -KDVERTDGALLVNAMFFKPHWDEKFHHKMVDNRGFMVTRSYTVGVMMMHRTGLYNYYDD
.... .::::..:: .:.: : . .. . : ... :.::.. . ..
CCDS44 GSSIDAETRLVLVNAIYFKGKWNEPFDETYTREMPFKINQEEQRPVQMMYQEATFKLAHV
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 EKEKLQIVEMPLAHKLSSLIILMPHHVEPLERLEKLLTKEQLKIWMGK--MQKKAVAISL
. . :..:.: :.: ::..:.: : .:: :: :.: : :.. : . :
CCDS44 GEVRAQLLELPYARKELSLLVLLPDDGVELSTVEKSLTFEKLTAWTKPDCMKSTEVEVLL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PKGVVEVTHDLQKHLAGLGLTEAIDKNKADLSRMSGKKDLYLASVFHATAFELDTDGNPF
:: .. .:... : ::...:....::::: ::...:: :.. : . :.. .:.
CCDS44 PKFKLQEDYDMESVLRHLGIVDAFQQGKADLSAMSAERDLCLSKFVHKSFVEVNEEGTEA
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410
pF1KB5 DQD----IYGREELRSPKLFYADHPFIFLVRDTQSGSLLFIGRLVRPKGDKMRDEL
. .. ..: : :::::.:..: ....:.:: ::. :
CCDS44 AAASSCFVVAECCMESGPRFCADHPFLFFIRHNRANSILFCGRFSSP
330 340 350 360 370
>>CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 (380 aa)
initn: 381 init1: 167 opt: 609 Z-score: 716.4 bits: 141.4 E(32554): 1.4e-33
Smith-Waterman score: 609; 29.2% identity (65.8% similar) in 383 aa overlap (36-409:1-380)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 LLSAFCLLEAALAAEVKKPAAAAAPGTAEKLSPKAATLAERSAGLAFSLYQAMAKDQAVE
.: .::: .. .:..: ....::.. .
CCDS75 MSAIMDVLAEANGTFALNLLKTLGKDNS-K
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NILVSPVVVASSLGLVSLGGKATTASQAKAVLSAEQLRDE-EVHAGLGELLRSLSNSTAR
:.. ::. .. .:..: .:.:..::.: .:: .. ..: :. :: . :.:.
CCDS75 NVFFSPMSMSCALAMVYMGAKGNTAAQMAQILSFNKSGGGGDIHQGFQSLLTEV-NKTGT
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NVTWKLGSRLYGPSSVSFADDFVRSSKQHYNCEHSKINFRDK-RSALQSINEWAAQTTDG
. ....::.: .: .: ..: : .. :. : ...: . ... . :: :.:. :.:
CCDS75 QYLLRMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQAEMEELDFISAVEKSRKHINTWVAEKTEG
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KLPEVTK--DVERTDGALLVNAMFFKPHWDEKFHHKMVDNRGFMVTRSYTVGVMMMHRTG
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CCDS75 KIAELLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDEQFDKENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]