FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5010, 619 aa 1>>>pF1KB5010 619 - 619 aa - 619 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8405+/-0.000445; mu= 15.3476+/- 0.028 mean_var=267.0944+/-54.813, 0's: 0 Z-trim(119.4): 2006 B-trim: 198 in 2/53 Lambda= 0.078477 statistics sampled from 31125 (33427) to 31125 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.392), width: 16 Scan time: 10.520 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001166139 (OMIM: 617103) zinc finger protein 66 ( 619) 4438 516.5 1.1e-145 NP_078982 (OMIM: 617103) zinc finger protein 668 i ( 619) 4438 516.5 1.1e-145 NP_001166141 (OMIM: 617103) zinc finger protein 66 ( 619) 4438 516.5 1.1e-145 NP_001166140 (OMIM: 617103) zinc finger protein 66 ( 642) 4438 516.5 1.1e-145 NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1325 164.0 1.4e-39 XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1325 164.0 1.4e-39 XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1325 164.0 1.4e-39 XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1325 164.1 1.4e-39 NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1325 164.1 1.4e-39 XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1325 164.1 1.4e-39 XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1325 164.1 1.4e-39 NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1325 164.1 1.4e-39 XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1325 164.1 1.4e-39 NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1325 164.1 1.4e-39 XP_016882717 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 1311 162.5 4.2e-39 XP_016882719 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 1311 162.5 4.2e-39 XP_016882718 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 1311 162.5 4.2e-39 XP_016882710 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 XP_016882713 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 XP_011525569 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 XP_016882714 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 XP_016882712 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 XP_016882707 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 XP_016882706 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 XP_016882716 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 NP_003416 (OMIM: 194554) zinc finger protein 45 [H ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 XP_016882709 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 XP_016882708 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 XP_011525575 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 XP_011525573 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 XP_016882711 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 XP_016882715 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 XP_011525571 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39 XP_005272399 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 542) 1304 161.6 6.6e-39 NP_066358 (OMIM: 194556) zinc finger protein 14 [H ( 642) 1304 161.7 7.3e-39 XP_011515600 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1304 161.7 7.5e-39 XP_005272398 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1304 161.7 7.5e-39 NP_008889 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 [H ( 682) 1304 161.7 7.5e-39 NP_001025147 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 ( 682) 1304 161.7 7.5e-39 NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 1297 160.9 1.2e-38 XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1279 158.7 4.6e-38 XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1279 158.7 4.6e-38 NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1279 158.7 4.6e-38 XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1279 158.7 4.6e-38 XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1279 158.9 5.2e-38 XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1279 158.9 5.3e-38 NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 1279 158.9 5.3e-38 XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1279 158.9 5.3e-38 XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1279 158.9 5.3e-38 XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1279 158.9 5.4e-38 >>NP_001166139 (OMIM: 617103) zinc finger protein 668 is (619 aa) initn: 4438 init1: 4438 opt: 4438 Z-score: 2736.5 bits: 516.5 E(85289): 1.1e-145 Smith-Waterman score: 4438; 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