Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5026
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5026, 448 aa
1>>>pF1KB5026 448 - 448 aa - 448 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6708+/-0.00136; mu= 5.6779+/- 0.078
mean_var=229.7659+/-52.864, 0's: 0 Z-trim(106.8): 657 B-trim: 365 in 2/46
Lambda= 0.084612
statistics sampled from 8436 (9211) to 8436 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 3.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10224.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 ( 448) 3000 380.1 2.5e-105
CCDS55970.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 ( 412) 2691 342.3 5.4e-94
CCDS42051.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 ( 438) 2293 293.8 2.4e-79
CCDS10216.1 MAP2K1 gene_id:5604|Hs108|chr15 ( 393) 808 112.4 8.2e-25
CCDS11686.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 ( 334) 783 109.3 6.1e-24
CCDS12120.1 MAP2K2 gene_id:5605|Hs108|chr19 ( 400) 781 109.1 8.2e-24
CCDS82194.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 ( 278) 764 106.9 2.7e-23
CCDS11218.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17 ( 318) 638 91.6 1.3e-18
CCDS11217.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17 ( 347) 638 91.6 1.3e-18
CCDS42491.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19 ( 419) 618 89.3 8.2e-18
CCDS74277.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19 ( 435) 618 89.3 8.4e-18
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 426) 575 84.0 3.2e-16
CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 416) 573 83.8 3.7e-16
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 568 83.2 5.8e-16
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 568 83.2 5.9e-16
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 566 83.0 7.7e-16
CCDS74278.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19 ( 426) 560 82.2 1.1e-15
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 560 82.3 1.2e-15
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 558 82.0 1.5e-15
CCDS11162.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17 ( 399) 553 81.3 1.9e-15
CCDS62095.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17 ( 410) 553 81.3 2e-15
CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 873) 504 75.7 2e-13
CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 894) 504 75.7 2.1e-13
CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 545) 490 73.8 4.9e-13
CCDS81582.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 812) 484 73.2 1.1e-12
CCDS8082.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 820) 484 73.2 1.1e-12
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 485 73.5 1.1e-12
CCDS44687.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 553) 473 71.7 2.1e-12
CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3 ( 524) 465 70.7 4e-12
CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20 ( 719) 462 70.5 6.3e-12
CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 544) 458 69.9 7.4e-12
CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 559) 458 69.9 7.5e-12
CCDS48152.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 565) 458 69.9 7.6e-12
CCDS48151.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 580) 458 69.9 7.7e-12
CCDS42564.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 821) 457 70.0 1e-11
CCDS59385.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 833) 457 70.0 1.1e-11
CCDS48168.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 339) 438 67.2 2.9e-11
CCDS63200.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 349) 438 67.2 3e-11
CCDS76334.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1204) 445 68.7 3.7e-11
CCDS63199.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 332) 435 66.8 3.7e-11
CCDS7553.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1235) 445 68.7 3.8e-11
CCDS56024.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 ( 853) 442 68.1 3.8e-11
CCDS32601.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 (1001) 442 68.2 4.2e-11
CCDS9188.1 TAOK3 gene_id:51347|Hs108|chr12 ( 898) 438 67.7 5.5e-11
CCDS10662.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1049) 434 67.3 8.6e-11
CCDS58448.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1122) 434 67.3 9e-11
CCDS10663.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1235) 434 67.4 9.6e-11
>>CCDS10224.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 (448 aa)
initn: 3000 init1: 3000 opt: 3000 Z-score: 2004.4 bits: 380.1 E(32554): 2.5e-105
Smith-Waterman score: 3000; 100.0% identity (100.0% similar) in 448 aa overlap (1-448:1-448)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLWLALGPFPAMENQVLVIRIKIPNSGAVDWTVHSGPQLLFRDVLDVIGQVLPEATTTAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MLWLALGPFPAMENQVLVIRIKIPNSGAVDWTVHSGPQLLFRDVLDVIGQVLPEATTTAF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 EYEDEDGDRITVRSDEEMKAMLSYYYSTVMEQQVNGQLIEPLQIFPRACKPPGERNIHGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EYEDEDGDRITVRSDEEMKAMLSYYYSTVMEQQVNGQLIEPLQIFPRACKPPGERNIHGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHGNGGTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHGNGGTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 YKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVENRISIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVENRISIC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TEFMDGGSLDVYRKMPEHVLGRIAVAVVKGLTYLWSLKILHRDVKPSNMLVNTRGQVKLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TEFMDGGSLDVYRKMPEHVLGRIAVAVVKGLTYLWSLKILHRDVKPSNMLVNTRGQVKLC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DFGVSTQLVNSIAKTYVGTNAYMAPERISGEQYGIHSDVWSLGISFMELALGRFPYPQIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DFGVSTQLVNSIAKTYVGTNAYMAPERISGEQYGIHSDVWSLGISFMELALGRFPYPQIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 KNQGSLMPLQLLQCIVDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KNQGSLMPLQLLQCIVDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIV
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB5 QFNDGNAAVVSMWVCRALEERRSQQGPP
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QFNDGNAAVVSMWVCRALEERRSQQGPP
430 440
>>CCDS55970.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 (412 aa)
initn: 2691 init1: 2691 opt: 2691 Z-score: 1800.9 bits: 342.3 E(32554): 5.4e-94
Smith-Waterman score: 2691; 100.0% identity (100.0% similar) in 403 aa overlap (46-448:10-412)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 VLVIRIKIPNSGAVDWTVHSGPQLLFRDVLDVIGQVLPEATTTAFEYEDEDGDRITVRSD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MMEGHFPQSDVIGQVLPEATTTAFEYEDEDGDRITVRSD
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 EEMKAMLSYYYSTVMEQQVNGQLIEPLQIFPRACKPPGERNIHGLKVNTRAGPSQHSSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EEMKAMLSYYYSTVMEQQVNGQLIEPLQIFPRACKPPGERNIHGLKVNTRAGPSQHSSPA
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 VSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHGNGGTVYKAYHVPSGKILAVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHGNGGTVYKAYHVPSGKILAVK
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 VILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVENRISICTEFMDGGSLDVYRKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVENRISICTEFMDGGSLDVYRKM
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 PEHVLGRIAVAVVKGLTYLWSLKILHRDVKPSNMLVNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSIAKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PEHVLGRIAVAVVKGLTYLWSLKILHRDVKPSNMLVNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSIAKT
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 YVGTNAYMAPERISGEQYGIHSDVWSLGISFMELALGRFPYPQIQKNQGSLMPLQLLQCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YVGTNAYMAPERISGEQYGIHSDVWSLGISFMELALGRFPYPQIQKNQGSLMPLQLLQCI
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 VDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIVQFNDGNAAVVSMWVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIVQFNDGNAAVVSMWVC
340 350 360 370 380 390
440
pF1KB5 RALEERRSQQGPP
:::::::::::::
CCDS55 RALEERRSQQGPP
400 410
>>CCDS42051.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 (438 aa)
initn: 2293 init1: 2293 opt: 2293 Z-score: 1538.0 bits: 293.8 E(32554): 2.4e-79
Smith-Waterman score: 2897; 97.8% identity (97.8% similar) in 448 aa overlap (1-448:1-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLWLALGPFPAMENQVLVIRIKIPNSGAVDWTVHSGPQLLFRDVLDVIGQVLPEATTTAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MLWLALGPFPAMENQVLVIRIKIPNSGAVDWTVHSGPQLLFRDVLDVIGQVLPEATTTAF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 EYEDEDGDRITVRSDEEMKAMLSYYYSTVMEQQVNGQLIEPLQIFPRACKPPGERNIHGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EYEDEDGDRITVRSDEEMKAMLSYYYSTVMEQQVNGQLIEPLQIFPRACKPPGERNIHGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHGNGGTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHGNGGTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 YKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVENRISIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVENRISIC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TEFMDGGSLDVYRKMPEHVLGRIAVAVVKGLTYLWSLKILHRDVKPSNMLVNTRGQVKLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TEFMDGGSLDVYRKMPEHVLGRIAVAVVKGLTYLWSLKILHRDVKPSNMLVNTRGQVKLC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DFGVSTQLVNSIAKTYVGTNAYMAPERISGEQYGIHSDVWSLGISFMELALGRFPYPQIQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS42 DFGVSTQLVNSIAKTYVGTNAYMAPERISGEQYGIHSDVWSLGISFME----------IQ
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 KNQGSLMPLQLLQCIVDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KNQGSLMPLQLLQCIVDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIV
360 370 380 390 400 410
430 440
pF1KB5 QFNDGNAAVVSMWVCRALEERRSQQGPP
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QFNDGNAAVVSMWVCRALEERRSQQGPP
420 430
>>CCDS10216.1 MAP2K1 gene_id:5604|Hs108|chr15 (393 aa)
initn: 917 init1: 400 opt: 808 Z-score: 558.9 bits: 112.4 E(32554): 8.2e-25
Smith-Waterman score: 885; 42.6% identity (69.7% similar) in 333 aa overlap (146-438:48-379)
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 NIHGLKVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHG
:. : : . :.....:.. . :: :
CCDS10 SAVNGTSSAETNLEALQKKLEELELDEQQRKRLEAFLTQKQKVGELKDDDFEKISELGAG
20 30 40 50 60 70
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 NGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVEN
:::.:.:. : ::: ..: :.: :.: ...::. ::..:..:.: ::.::::::. ..
CCDS10 NGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDG
80 90 100 110 120 130
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 RISICTEFMDGGSLD-VYRK---MPEHVLGRIAVAVVKGLTYLW-SLKILHRDVKPSNML
.:::: : ::::::: : .: .::..::....::.:::::: . ::.::::::::.:
CCDS10 EISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNIL
140 150 160 170 180 190
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 VNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSIAKTYVGTNAYMAPERISGEQYGIHSDVWSLGISFMELA
::.::..:::::::: ::..:.:...::: .::.:::..: .:...::.::.:.:..:.:
CCDS10 VNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVEMA
200 210 220 230 240 250
360 370
pF1KB5 LGRFPYPQIQKNQGSLM---------------------PL--------------QLLQCI
.::.: : . .. :: :: .::. :
CCDS10 VGRYPIPPPDAKELELMFGCQVEGDAAETPPRPRTPGRPLSSYGMDSRPPMAIFELLDYI
260 270 280 290 300 310
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 VDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIVQFNDGNAAVVSMWVC
:.: : :: : :: : :...:. :.: :: ..:: : :: . .:.. . . :.:
CCDS10 VNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADLKQLMVHAFI-KRSDAEEVDFAGWLC
320 330 340 350 360 370
440
pF1KB5 RALEERRSQQGPP
..
CCDS10 STIGLNQPSTPTHAAGV
380 390
>>CCDS11686.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 (334 aa)
initn: 765 init1: 195 opt: 783 Z-score: 543.2 bits: 109.3 E(32554): 6.1e-24
Smith-Waterman score: 783; 41.6% identity (67.7% similar) in 334 aa overlap (113-431:6-326)
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 SYYYSTVMEQQVNGQLIEPLQIFPRACKPPGERNIHGLKVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPS
:.. :::. .: .: .:.. :
CCDS11 MSQSKGKKRNPGLKIPKEA----FEQPQTSSTPPR
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 NSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHGNGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDIT
. .:. . . : ... .:.. ::.: :.: : :::::.:.::: : ..
CCDS11 DLDSKACISIGN--QNFEVKADDLEPIMELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRATVN
40 50 60 70 80
210 220 230 240 250
pF1KB5 LELQKQIMSELEI-LYKCDSSYIIGFYGAFFVENRISICTEFMDGGSLDVYRK-------
. ::... .:.: . : . . ::::.: :. . :: :.:: ::: . :
CCDS11 SQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALFREGDVWICMELMDT-SLDKFYKQVIDKGQ
90 100 110 120 130 140
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 -MPEHVLGRIAVAVVKGLTYLWS-LKILHRDVKPSNMLVNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSI
.:: .::.:::..::.: .: : :...::::::::.:.:. ::::.::::.: ::.:.
CCDS11 TIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDSV
150 160 170 180 190 200
320 330 340 350 360
pF1KB5 AKTY-VGTNAYMAPERISGEQ----YGIHSDVWSLGISFMELALGRFPYPQIQKNQGSLM
::: .: . :::::::. : :...::.:::::...:::. :::: . :.
CCDS11 AKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRFPYD----SWGT--
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pF1KB5 PLQLLQCIVDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIVQFNDGNA
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CCDS11 PFQQLKQVVEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKGT
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430 440
pF1KB5 AVVSMWVCRALEERRSQQGPP
:.:
CCDS11 DVASFVKLILGD
330
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CCDS12 PSPTSEGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQKAKVGELKDDDFERISELGAG
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pF1KB5 NGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVEN
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CCDS12 NGGVVTKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDG
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CCDS12 EISICMEHMDGGSLDQVLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRGLAYLREKHQIMHRDVKPSNIL
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pF1KB5 VNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSIAKTYVGTNAYMAPERISGEQYGIHSDVWSLGISFMELA
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CCDS12 VNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMAPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVELA
210 220 230 240 250 260
360 370
pF1KB5 LGRFPYPQ--------------IQKNQG---SLMP----------------------LQL
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CCDS12 VGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRPPGRPVSGHGMDSRPAMAIFEL
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:. ::.: : :: : :. : .:...:. :.: :: . : .: :: . .. . . .
CCDS12 LDYIVNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADLKMLTNHTFI-KRSEVEEVDFA
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440
pF1KB5 MWVCRALEERRSQQGPP
:.:..:
CCDS12 GWLCKTLRLNQPGTPTRTAV
390 400
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CCDS82 NSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALFREGDVWICMELMDT-SLDKFYKQVIDKG
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CCDS82 QTIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDS
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pF1KB5 IAKTY-VGTNAYMAPERISGEQ----YGIHSDVWSLGISFMELALGRFPYPQIQKNQGSL
.::: .: . :::::::. : :...::.:::::...:::. :::: . :.
CCDS82 VAKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRFPYD----SWGT-
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pF1KB5 MPLQLLQCIVDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIVQFNDGN
:.: :. .:.: :: ::. .:: :: : .::..:. ::::. ::: :::.. .. .
CCDS82 -PFQQLKQVVEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKG
210 220 230 240 250 260
430 440
pF1KB5 AAVVSMWVCRALEERRSQQGPP
. :.:
CCDS82 TDVASFVKLILGD
270
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CCDS11 MSKPPAPNPTPPRNLD-SRTFITIGDRNFEV
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pF1KB5 NEQDIRYRDTLGHGNGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEI-LYKCD
. .:. . ::.: :.: :. :. :: :.::: : .. . ::... .:.: . :
CCDS11 EADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVD
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pF1KB5 SSYIIGFYGAFFVENRISICTEFMDGGSLD-VYRK-------MPEHVLGRIAVAVVKGLT
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CCDS11 CFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDT-SLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALE
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CCDS11 HLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINP
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pF1KB5 EQ----YGIHSDVWSLGISFMELALGRFPYPQIQKNQGSLMPLQLLQCIVDEDSPVLPVG
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CCDS11 ELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPY----ESWGT--PFQQLKQVVEEPSPQLPAD
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pF1KB5 EFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIVQFNDGNAAVVSMWVCRALEERRSQQG
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CCDS11 RFSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS
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pF1KB5 PP
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pF1KB5 EEMKAMLSYYYSTVMEQQVNGQLIEPLQIFPRACKP---PGERNIHGLKVNTRAGPSQHS
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CCDS11 MESPASSQPASMPQSKGKSKRKKDLRI--SCMS
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CCDS11 KPPAPNPTPPRNLD-SRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIM
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CCDS11 AVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDT-SLDK
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pF1KB5 VYRK-------MPEHVLGRIAVAVVKGLTYLWS-LKILHRDVKPSNMLVNTRGQVKLCDF
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CCDS11 FYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDF
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CCDS11 GISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPY-
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CCDS11 ---ESWGT--PFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHP
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pF1KB5 FIVQFNDGNAAVVSMWVCRALEERRSQQGPP
:
CCDS11 FFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS
330 340
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CCDS42 LDISPQRPRPTLQLPLANDGGSRSPSSESSPQHPTPPARPRHMLGL-------PSTLFTP
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CCDS42 RSMESIEIDQKLQEIMKQTGYLTIGGQRYQAEINDLENLGEMGSGTCGQVWKMRFRKTGH
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CCDS42 VIAVKQMRRSGNKEENKRILMDLDVVLKSHDCPYIVQCFGTFITNTDVFIAMELMGTCAE
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CCDS42 KLKKRMQGPIPERILGKMTVAIVKALYYLKEKHGVIHRDVKPSNILLDERGQIKLCDFGI
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CCDS42 SGRLVDSKAKTRSAGCAAYMAPERIDPPDPTKPDYDIRADVWSLGISLVELATGQFPYKN
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CCDS42 SFIKRYETLEVDVAS-WFKDVMAKTESPRTSGVLSQPHLPFFR
380 390 400 410
448 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 15:47:11 2016 done: Thu Nov 3 15:47:11 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]