FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5080, 725 aa 1>>>pF1KB5080 725 - 725 aa - 725 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6336+/-0.000995; mu= 17.3153+/- 0.060 mean_var=65.9434+/-13.790, 0's: 0 Z-trim(103.8): 24 B-trim: 346 in 2/48 Lambda= 0.157939 statistics sampled from 7546 (7563) to 7546 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16 Scan time: 3.340 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3241.1 MCCC1 gene_id:56922|Hs108|chr3 ( 725) 4715 1083.9 0 CCDS45065.1 PCCA gene_id:5095|Hs108|chr13 ( 702) 1603 374.8 2.5e-103 CCDS9496.2 PCCA gene_id:5095|Hs108|chr13 ( 728) 1592 372.3 1.5e-102 CCDS53878.1 PCCA gene_id:5095|Hs108|chr13 ( 681) 1472 344.9 2.3e-94 CCDS8152.1 PC gene_id:5091|Hs108|chr11 (1178) 1299 305.6 2.8e-82 CCDS31898.1 ACACB gene_id:32|Hs108|chr12 (2458) 541 133.0 5.3e-30 CCDS42303.1 ACACA gene_id:31|Hs108|chr17 (2268) 534 131.4 1.5e-29 CCDS11318.1 ACACA gene_id:31|Hs108|chr17 (2288) 534 131.4 1.5e-29 CCDS11317.1 ACACA gene_id:31|Hs108|chr17 (2346) 534 131.4 1.5e-29 CCDS42302.1 ACACA gene_id:31|Hs108|chr17 (2383) 534 131.4 1.6e-29 >>CCDS3241.1 MCCC1 gene_id:56922|Hs108|chr3 (725 aa) initn: 4715 init1: 4715 opt: 4715 Z-score: 5800.6 bits: 1083.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4715; 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CCDS45 TRAQAVHPGYGFLSENKEFARCLAAEDVVFIGPDTHAIQAMGDKIESKLLAKKAEVNTIP 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 GYHGEDQSDQCLKEHARRIGYPVMIKAVRGGGGKGMRIVRSEQEFQEQLESAWREAKKSF :. : .. . . ::.::::::::: :::::::::. ...: .. .. . .:: .:: CCDS45 GFDGVVKDAEEAVRIAREIGYPVMIKASAGGGGKGMRIAWDDEETRDGFRLSSQEAASSF 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 NDDAMLIEKFVDTPRHVEVQVFGDHHGNAVYLFERDCSVQRRHQKIIEEAPAPGIKSEVR .:: .:::::.:.:::.:.::.::.::::..: ::.::.:::.::..::::. . .:.: CCDS45 GDDRLLIEKFIDNPRHIEIQVLGDKHGNALWLNERECSIQRRNQKVVEEAPSIFLDAETR 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 KKLGEAAVRAAKAVNYVGAGTVEFIMDSKHNFCFMEMNTRLQVEHPVTEMITGTDLVEWQ . .:: :: :.::.: .::::::..:::.:: :.:::::::::::::: ::: :::. . CCDS45 RAMGEQAVALARAVKYSSAGTVEFLVDSKKNFYFLEMNTRLQVEHPVTECITGLDLVQEM 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 LRIAAGEKIPLSQEEITLQGHAFEARIYAEDPSNNF-MPVAGPLVHLSTPRADPSTRIET .:.: : . .: .: ..: : : :.::::: ..: .: : : . . : :..:... CCDS45 IRVAKGYPLRHKQADIRINGWAVECRVYAEDPYKSFGLPSIGRLSQYQEPLHLPGVRVDS 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 GVRQGDEVSVHYDPMIAKLVVWAADRQAALTKLRYSLRQYNIVGLPTNIDFLLNLSGHPE :.. :...:..:::::.::.....:: :: .. .: .: : :. :: .: .. . . CCDS45 GIQPGSDISIYYDPMISKLITYGSDRTEALKRMADALDNYVIRGVTHNIALLREVIINSR 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 FEAGNVHTDFI----PQHHKQLLLSRKAAAKESLCQAALGLILKEKAMTDTFTLQAHDQF : :.. : :. :. : .:.. . :..: : .:.. .: :.:. .: CCDS45 FVKGDISTKFLSDVYPDGFKGHMLTK--SEKNQLLAIASSLFV-------AFQLRAQ-HF 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 SPFSSSSGRRLNIS-YTRNMTLKDGKNNVAIAVTYNHDGSYSMQIEDKTFQVLG--NLYS . : . .:. . .. :.: .: .:. :. . .:.... . ..: . :: : CCDS45 QENSRMPVIKPDIANWELSVKLHD---KVHTVVASNNGSVFSVEVDGSKLNVTSTWNLAS 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 pF1KB5 EGDCTYLKCSVNGVASKAKLIILEN----TIYLFSKEGSIEI----DIPVPKYLSSVSSQ :. ::.:. .. . : .: ... ...: . :.. .. CCDS45 P----LLSVSVDGTQRTVQCLSREAGGNMSIQFLGTVYKVNILTRLAAELNKFMLEKVTE 580 590 600 610 620 630 650 660 670 680 690 700 pF1KB5 ETQGGPLAPMTGTIEKVFVKAGDKVKAGDSLMVMIAMKMEHTIKSPKDGTVKKVFYREGA .:.. .:: :.. : :: :: : :. . :. ::::.... . : ::::.: . : CCDS45 DTSSVLRSPMPGVVVAVSVKPGDAVAEGQEICVIEAMKMQNSMTAGKTGTVKSVHCQAGD 640 650 660 670 680 690 710 720 pF1KB5 QANRHTPLVEFEEEESDKRESE ... :::.: CCDS45 TVGEGDLLVELE 700 >>CCDS9496.2 PCCA gene_id:5095|Hs108|chr13 (728 aa) initn: 1631 init1: 1262 opt: 1592 Z-score: 1954.8 bits: 372.3 E(32554): 1.5e-102 Smith-Waterman score: 1593; 40.3% identity (69.2% similar) in 685 aa overlap (47-715:61-728) 20 30 40 50 60 70 pF1KB5 NRWHRLPSLLLPPRTWVWRQRTMKYTTATGRNITKVLIANRGEIACRVMRTAKKLGVQTV ... :.:.::::::::::.:: ::.:..:: CCDS94 LRTLKHVLYYSRQCLMVSRNLGSVGYDPNEKTFDKILVANRGEIACRVIRTCKKMGIKTV 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 pF1KB5 AVYSEADRNSMHVDMADEAYSIGPAPSQQSYLSMEKIIQVAKTSAAQAIHPGCGFLSENM :..:..: .:.:: ::::: .::::...:::.:. :... : . :::.::: :::::: CCDS94 AIHSDVDASSVHVKMADEAVCVGPAPTSKSYLNMDAIMEAIKKTRAQAVHPGYGFLSENK 100 110 120 130 140 150 140 150 160 170 180 190 pF1KB5 EFAELCKQEGIIFIGPPPSAIRDMGIKSTSKSIMAAAGVPVVEGYHGEDQSDQCLKEHAR :::. : ..:::: ::. :: : :: . : : .. :. : .. . . :: CCDS94 EFARCLAAEDVVFIGPDTHAIQAMGDKIESKLLAKKAEVNTIPGFDGVVKDAEEAVRIAR 160 170 180 190 200 210 200 210 220 230 240 250 pF1KB5 RIGYPVMIKAVRGGGGKGMRIVRSEQEFQEQLESAWREAKKSFNDDAMLIEKFVDTPRHV .::::::::: :::::::::. ...: .. .. . .:: .::.:: .:::::.:.:::. CCDS94 EIGYPVMIKASAGGGGKGMRIAWDDEETRDGFRLSSQEAASSFGDDRLLIEKFIDNPRHI 220 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 EVQVFGDHHGNAVYLFERDCSVQRRHQKIIEEAPAPGIKSEVRKKLGEAAVRAAKAVNYV :.::.::.::::..: ::.::.:::.::..::::. . .:.:. .:: :: :.::.: CCDS94 EIQVLGDKHGNALWLNERECSIQRRNQKVVEEAPSIFLDAETRRAMGEQAVALARAVKYS 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 GAGTVEFIMDSKHNFCFMEMNTRLQVEHPVTEMITGTDLVEWQLRIAAGEKIPLSQEEIT .::::::..:::.:: :.:::::::::::::: ::: :::. ..:.: : . .: .: CCDS94 SAGTVEFLVDSKKNFYFLEMNTRLQVEHPVTECITGLDLVQEMIRVAKGYPLRHKQADIR 340 350 360 370 380 390 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 LQGHAFEARIYAEDPSNNF-MPVAGPLVHLSTPRADPSTRIETGVRQGDEVSVHYDPMIA ..: : : :.::::: ..: .: : : . . : :..:...:.. :...:..:::::. CCDS94 INGWAVECRVYAEDPYKSFGLPSIGRLSQYQEPLHLPGVRVDSGIQPGSDISIYYDPMIS 400 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 KLVVWAADRQAALTKLRYSLRQYNIVGLPTNIDFLLNLSGHPEFEAGNVHTDFI----PQ ::.....:: :: .. .: .: : :. :: .: .. . .: :.. : :. :. CCDS94 KLITYGSDRTEALKRMADALDNYVIRGVTHNIALLREVIINSRFVKGDISTKFLSDVYPD 460 470 480 490 500 510 500 510 520 530 540 550 pF1KB5 HHKQLLLSRKAAAKESLCQAALGLILKEKAMTDTFTLQAHDQFSPFSSSSGRRLNIS-YT : .:.. . :..: : .:.. .: :.:. .:. : . .:. . CCDS94 GFKGHMLTK--SEKNQLLAIASSLFV-------AFQLRAQ-HFQENSRMPVIKPDIANWE 520 530 540 550 560 560 570 580 590 600 pF1KB5 RNMTLKDGKNNVAIAVTYNHDGSYSMQIEDKTFQVLG--NLYSEGDCTYLKCSVNGVASK .. :.: .: .:. :. . .:.... . ..: . :: : :. ::.:. CCDS94 LSVKLHD---KVHTVVASNNGSVFSVEVDGSKLNVTSTWNLASP----LLSVSVDGTQRT 570 580 590 600 610 610 620 630 640 650 660 pF1KB5 AKLIILEN----TIYLFSKEGSIEI----DIPVPKYLSSVSSQETQGGPLAPMTGTIEKV .. . : .: ... ...: . :.. ...:.. .:: :.. : CCDS94 VQCLSREAGGNMSIQFLGTVYKVNILTRLAAELNKFMLEKVTEDTSSVLRSPMPGVVVAV 620 630 640 650 660 670 670 680 690 700 710 720 pF1KB5 FVKAGDKVKAGDSLMVMIAMKMEHTIKSPKDGTVKKVFYREGAQANRHTPLVEFEEEESD :: :: : :. . :. ::::.... . : ::::.: . : ... :::.: CCDS94 SVKPGDAVAEGQEICVIEAMKMQNSMTAGKTGTVKSVHCQAGDTVGEGDLLVELE 680 690 700 710 720 pF1KB5 KRESE >>CCDS53878.1 PCCA gene_id:5095|Hs108|chr13 (681 aa) initn: 1567 init1: 1262 opt: 1472 Z-score: 1807.5 bits: 344.9 E(32554): 2.3e-94 Smith-Waterman score: 1525; 40.8% identity (69.4% similar) in 644 aa overlap (47-675:61-678) 20 30 40 50 60 70 pF1KB5 NRWHRLPSLLLPPRTWVWRQRTMKYTTATGRNITKVLIANRGEIACRVMRTAKKLGVQTV ... :.:.::::::::::.:: ::.:..:: CCDS53 LRTLKHVLYYSRQCLMVSRNLGSVGYDPNEKTFDKILVANRGEIACRVIRTCKKMGIKTV 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 pF1KB5 AVYSEADRNSMHVDMADEAYSIGPAPSQQSYLSMEKIIQVAKTSAAQAIHPGCGFLSENM :..:..: .:.:: ::::: .::::...:::.:. :... : . :::.::: :::::: CCDS53 AIHSDVDASSVHVKMADEAVCVGPAPTSKSYLNMDAIMEAIKKTRAQAVHPGYGFLSENK 100 110 120 130 140 150 140 150 160 170 180 190 pF1KB5 EFAELCKQEGIIFIGPPPSAIRDMGIKSTSKSIMAAAGVPVVEGYHGEDQSDQCLKEHAR :::. : ..:::: ::. :: : :: . : : .. :. : .. . . :: CCDS53 EFARCLAAEDVVFIGPDTHAIQAMGDKIESKLLAKKAEVNTIPGFDGVVKDAEEAVRIAR 160 170 180 190 200 210 200 210 220 230 240 250 pF1KB5 RIGYPVMIKAVRGGGGKGMRIVRSEQEFQEQLESAWREAKKSFNDDAMLIEKFVDTPRHV .::::::::: :::::::::. ...: .. .. . .:: .::.:: .:::::.:.:::. CCDS53 EIGYPVMIKASAGGGGKGMRIAWDDEETRDGFRLSSQEAASSFGDDRLLIEKFIDNPRHI 220 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 EVQVFGDHHGNAVYLFERDCSVQRRHQKIIEEAPAPGIKSEVRKKLGEAAVRAAKAVNYV :.::.::.::::..: ::.::.:::.::..::::. . .:.:. .:: :: :.::.: CCDS53 EIQVLGDKHGNALWLNERECSIQRRNQKVVEEAPSIFLDAETRRAMGEQAVALARAVKYS 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 GAGTVEFIMDSKHNFCFMEMNTRLQVEHPVTEMITGTDLVEWQLRIAAGEKIPLSQEEIT .::::::..:::.:: :.:::::::::::::: ::: :::. ..:.: : . .: .: CCDS53 SAGTVEFLVDSKKNFYFLEMNTRLQVEHPVTECITGLDLVQEMIRVAKGYPLRHKQADIR 340 350 360 370 380 390 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 LQGHAFEARIYAEDPSNNF-MPVAGPLVHLSTPRADPSTRIETGVRQGDEVSVHYDPMIA ..: : : :.::::: ..: .: : : . . : :..:...:.. :...:..:::::. CCDS53 INGWAVECRVYAEDPYKSFGLPSIGRLSQYQEPLHLPGVRVDSGIQPGSDISIYYDPMIS 400 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 KLVVWAADRQAALTKLRYSLRQYNIVGLPTNIDFLLNLSGHPEFEAGNVHTDFI----PQ ::.....:: :: .. .: .: : :. :: .: .. . .: :.. : :. :. CCDS53 KLITYGSDRTEALKRMADALDNYVIRGVTHNIALLREVIINSRFVKGDISTKFLSDVYPD 460 470 480 490 500 510 500 510 520 530 540 550 pF1KB5 HHKQLLLSRKAAAKESLCQAALGLILKEKAMTDTFTLQAHDQFSPFSSSSGRRLNIS-YT : .:.. . :..: : .:.. .: :.:. .:. : . .:. . CCDS53 GFKGHMLTK--SEKNQLLAIASSLFV-------AFQLRAQ-HFQENSRMPVIKPDIANWE 520 530 540 550 560 560 570 580 590 600 pF1KB5 RNMTLKDGKNNVAIAVTYNHDGSYSMQIEDKTFQVLG--NLYSEGDCTYLKCSVNGVASK .. :.: .: .:. :. . .:.... . ..: . :: : :. ::.:. CCDS53 LSVKLHD---KVHTVVASNNGSVFSVEVDGSKLNVTSTWNLASP----LLSVSVDGT--- 570 580 590 600 610 610 620 630 640 650 660 pF1KB5 AKLIILENTIYLFSKE--GSIEID-----IPVPKYLSSVSSQETQGGPLAPMTGTIEKVF . :. .:.: :.. :. . . . . ... :.. : :::...: CCDS53 ------QRTVQCLSREAGGNMSIQFLGTVVAEGQEICVIEAMKMQNSMTAGKTGTVKSVH 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB5 VKAGDKVKAGDSLMVMIAMKMEHTIKSPKDGTVKKVFYREGAQANRHTPLVEFEEEESDK .::: : :: :. CCDS53 CQAGDTVGEGDLLVELE 670 680 >>CCDS8152.1 PC gene_id:5091|Hs108|chr11 (1178 aa) initn: 1405 init1: 875 opt: 1299 Z-score: 1590.6 bits: 305.6 E(32554): 2.8e-82 Smith-Waterman score: 1299; 39.9% identity (68.2% similar) in 544 aa overlap (47-584:35-571) 20 30 40 50 60 70 pF1KB5 NRWHRLPSLLLPPRTWVWRQRTMKYTTATGRNITKVLIANRGEIACRVMRTAKKLGVQTV . : ::..::::::: ::.:. .::..:: CCDS81 RTVHGGLRLLGIRRTSTAPAASPNVRRLEYKPIKKVMVANRGEIAIRVFRACTELGIRTV 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KB5 AVYSEADRNSMHVDMADEAYSIGP--APSQQSYLSMEKIIQVAKTSAAQAIHPGCGFLSE :.::: : ..:: . ::::: :: :: : .:: . ::.::: . ..:.::: ::::: CCDS81 AIYSEQDTGQMHRQKADEAYLIGRGLAPVQ-AYLHIPDIIKVAKENNVDAVHPGYGFLSE 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 pF1KB5 NMEFAELCKQEGIIFIGPPPSAIRDMGIKSTSKSIMAAAGVPVVEGYHGEDQSDQCLKEH .::. :.. :. :::: : ..: :: : ...: ::::::: : . : . .: CCDS81 RADFAQACQDAGVRFIGPSPEVVRKMGDKVEARAIAIAAGVPVVPGTDAPITSLHEAHEF 130 140 150 160 170 180 200 210 220 230 240 250 pF1KB5 ARRIGYPVMIKAVRGGGGKGMRIVRSEQEFQEQLESAWREAKKSFNDDAMLIEKFVDTPR . :.:...::. ::::.:::.:.: .:..:. :. :: .:.. :...:::.. :: CCDS81 SNTYGFPIIFKAAYGGGGRGMRVVHSYEELEENYTRAYSEALAAFGNGALFVEKFIEKPR 190 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 HVEVQVFGDHHGNAVYLFERDCSVQRRHQKIIEEAPAPGIKSEVRKKLGEAAVRAAKAVN :.:::..::..:: ..:.:::::.::::::..: ::: . ..: .: .:. :: :. CCDS81 HIEVQILGDQYGNILHLYERDCSIQRRHQKVVEIAPAAHLDPQLRTRLTSDSVKLAKQVG 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 YVGAGTVEFIMDSKHNFCFMEMNTRLQVEHPVTEMITGTDLVEWQLRIAAGEKIP---LS : .::::::..: . . :.:.:.:::::: ::: :: .:::. :...: :...: : CCDS81 YENAGTVEFLVDRHGKHYFIEVNSRLQVEHTVTEEITDVDLVHAQIHVAEGRSLPDLGLR 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 QEEITLQGHAFEARIYAEDPSNNFMPVAGPLVHLSTPRADPSTRIETG-VRQGDEVSVHY ::.: ..: :.. :. .:::. .:.: .: ... . :.... . :: .: :: CCDS81 QENIRINGCAIQCRVTTEDPARSFQPDTGR-IEVFRSGEGMGIRLDNASAFQGAVISPHY 370 380 390 400 410 420 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 DPMIAKLVVWAADRQAALTKLRYSLRQYNIVGLPTNIDFLLNLSGHPEFEAGNVHTDFIP : ...:... . :. .: ::. .: .. . :. ::: :: :. .. .: ::.: :.:: CCDS81 DSLLVKVIAHGKDHPTAATKMSRALAEFRVRGVKTNIAFLQNVLNNQQFLAGTVDTQFID 430 440 450 460 470 480 500 510 520 530 540 550 pF1KB5 QHHKQLLLSRKAAAKESLCQAALGLILKEKAMTDTFTLQAHDQFSPFSSSSGRRLNISYT .. .:. : : . . :: .. . : . . . .: . . CCDS81 EN-PELFQLRPAQNRAQKLLHYLGHVMVNGPTTPIPVKASPSPTDPVVPAVPIGPPPAGF 490 500 510 520 530 540 560 570 580 590 600 610 pF1KB5 RNMTLKDGKNNVAIAVTYNHDGSYSMQIEDKTFQVLGNLYSEGDCTYLKCSVNGVASKAK :.. :..: .. : :: :: : . . : ::. CCDS81 RDILLREGPEGFARAVR-NHPG---LLLMDTTFRDAHQSLLATRVRTHDLKKIAPYVAHN 550 560 570 580 590 620 630 640 650 660 670 pF1KB5 LIILENTIYLFSKEGSIEIDIPVPKYLSSVSSQETQGGPLAPMTGTIEKVFVKAGDKVKA CCDS81 FSKLFSMENWGGATFDVAMRFLYECPWRRLQELRELIPNIPFQMLLRGANAVGYTNYPDN 600 610 620 630 640 650 >>CCDS31898.1 ACACB gene_id:32|Hs108|chr12 (2458 aa) initn: 779 init1: 403 opt: 541 Z-score: 652.1 bits: 133.0 E(32554): 5.3e-30 Smith-Waterman score: 834; 28.0% identity (56.9% similar) in 742 aa overlap (47-721:258-968) 20 30 40 50 60 70 pF1KB5 NRWHRLPSLLLPPRTWVWRQRTMKYTTATGRNITKVLIANRGEIACRVMRTAKKLG---- : : :::::: : : . ::. .. . CCDS31 KRGREHKKLDLHRDFTVASPAEFVTRFGGDRVIEKVLIANNGIAAVKCMRSIRRWAYEMF 230 240 250 260 270 280 80 90 100 110 120 pF1KB5 -----VQTVAVYSEAD--RNSMHVDMADEAYSIGPAPSQQSYLSMEKIIQVAKTSAAQAI .. :.. . : :. .. :::. . .:....: ..: :...:: .::. CCDS31 RNERAIRFVVMVTPEDLKANAEYIKMADHYVPVPGGPNNNNYANVELIVDIAKRIPVQAV 290 300 310 320 330 340 130 140 150 160 170 pF1KB5 HPGCGFLSENMEFAELCKQEGIIFIGPPPSAIRDMGIKSTSKSIMAAAGVPVV------- : : ::: .. :: ..:. :.::: :. .: : .: . . ::.. CCDS31 WAGWGHASENPKLPELLCKNGVAFLGPPSEAMWALGDKIASTVVAQTLQVPTLPWSGSGL 350 360 370 380 390 400 180 190 200 210 pF1KB5 -------EGYHG------EDQSDQ-CLK------EHARRIGYPVMIKAVRGGGGKGMRIV . .: :: :. :.: : :.:::.:.:::: .::::::.: . CCDS31 TVEWTEDDLQQGKRISVPEDVYDKGCVKDVDEGLEAAERIGFPLMIKASEGGGGKGIRKA 410 420 430 440 450 460 220 230 240 250 260 270 pF1KB5 RSEQEFQEQLESAWREAKKSFNDDAMLIEKFVDTPRHVEVQVFGDHHGNAVYLFERDCSV .: ..: .:.... . . ... :... ::.:::...:..:::: :: ::::. CCDS31 ESAEDFP----ILFRQVQSEIPGSPIFLMKLAQHARHLEVQILADQYGNAVSLFGRDCSI 470 480 490 500 510 520 280 290 300 310 320 330 pF1KB5 QRRHQKIIEEAPAPGIKSEVRKKLGEAAVRAAKAVNYVGAGTVEFIMDSKHNFCFMEMNT :::::::.::::: . . . . :.: ::.:.::.:::::..... .: :.:.: CCDS31 QRRHQKIVEEAPATIAPLAIFEFMEQCAIRLAKTVGYVSAGTVEYLYSQDGSFHFLELNP 530 540 550 560 570 580 340 350 360 370 pF1KB5 RLQVEHPVTEMITGTDLVEWQLRIAAGEKIPLSQ-EEITL-------------------- ::::::: ::::. ..: ::.:: : .:: . ..: : CCDS31 RLQVEHPCTEMIADVNLPAAQLQIAMG--VPLHRLKDIRLLYGESPWGVTPISFETPSNP 590 600 610 620 630 640 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 ---QGHAFEARIYAEDPSNNFMPVAGPLVHLSTPRADPSTRIETGVRQGDEVSVHYDPMI .::.. ::: .:.:...: : .: . .:. :.. .. .: . : .. CCDS31 PLARGHVIAARITSENPDEGFKPSSGTVQELNF-RSSKNVWGYFSVAATGGLHEFADSQF 650 660 670 680 690 700 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 AKLVVWAADRQAALTKLRYSLRQYNIVG-LPTNIDFLLNLSGHPEFEAGNVHTDFIPQHH .. :. .:. :.... .:.. .: : . :....:.:: :. ... : .. CCDS31 GHCFSWGENREEAISNMVVALKELSIRGDFRTTVEYLINLLETESFQNNDIDTGWL---- 710 720 730 740 750 500 510 520 530 540 550 pF1KB5 KQLLLSRKAAAKESLCQAALGLILKEKAMTDTFTLQAHDQFSPFSSSSGRRLNISYTRNM . :...:. :.. . ::.. ..:.. .: : :. : . :. CCDS31 -DYLIAEKVQAEKP--DIMLGVVCGALNVADAMFRTCMTDFL-HSLERGQVLPADSLLNL 760 770 780 790 800 810 560 570 580 590 600 610 pF1KB5 TLKDGKNNVAIAVTYNHDGSYSMQIEDKTFQVLGNLYSEGDCTYLKCSVNGVASKAKLII : . . :. .: ... ... .. : .: : ... ... . . . :. CCDS31 --------VDVELIYG-GVKYILKVARQSLTMF-VLIMNG-C-HIEIDAHRLNDGGLLLS 820 830 840 850 860 620 630 640 650 660 pF1KB5 LE-NTIYLFSKEGSIEIDIPVPKYLSSVSSQETQGGPL---APMTGTIEKVFVKAGDKVK . :. . :: :.: ... : .. : .: .: . . :. : .:. CCDS31 YNGNSYTTYMKE---EVDSYRITIGNKTCVFEKENDPTVLRSPSAGKLTQYTVEDGGHVE 870 880 890 900 910 670 680 690 700 710 720 pF1KB5 AGDSLMVMIAMKMEHTIKSPKDGTVKKVFYREGAQANRHTPLVEFEEEESDKRESE ::.: : .::: :.. . : :: . : :: . ....: .. .: CCDS31 AGSSYAEMEVMKMIMTLNVQERGRVKYI-KRPGAVLEAGCVVARLELDDPSKVHPAEPFT 920 930 940 950 960 970 CCDS31 GELPAQQTLPILGEKLHQVFHSVLENLTNVMSGFCLPEPVFSIKLKEWVQKLMMTLRHPS 980 990 1000 1010 1020 1030 >>CCDS42303.1 ACACA gene_id:31|Hs108|chr17 (2268 aa) initn: 759 init1: 406 opt: 534 Z-score: 644.0 bits: 131.4 E(32554): 1.5e-29 Smith-Waterman score: 819; 27.7% identity (58.0% similar) in 758 aa overlap (40-721:29-747) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 LLVAAERNRWHRLPSLLLPPRTWVWRQRTMKYTTATGRN--ITKVLIANRGEIACRVMRT ...: : : : :::::: : : . ::. CCDS42 MSGLHLVKQGRDRKKIDSQRDFTVASPAEFVTRFGGNKVIEKVLIANNGIAAVKCMRS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB5 AKKLG---------VQTVAVYSEAD--RNSMHVDMADEAYSIGPAPSQQSYLSMEKIIQV .. . .. :.. . : :. .. :::. . .:....: ..: :... CCDS42 IRRWSYEMFRNERAIRFVVMVTPEDLKANAEYIKMADHYVPVPGGPNNNNYANVELILDI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 AKTSAAQAIHPGCGFLSENMEFAELCKQEGIIFIGPPPSAIRDMGIKSTSKSIMAAAGVP :: .::. : : ::: .. :: ..:: :.::: .:. .: : .:. . .::.: CCDS42 AKRIPVQAVWAGWGHASENPKLPELLLKNGIAFMGPPSQAMWALGDKIASSIVAQTAGIP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KB5 VVE----GYHGEDQSD----------QCLKEH------------ARRIGYPVMIKAVRGG .. : . . : . : : :. :...:::::::: .:: CCDS42 TLPWSGSGLRVDWQENDFSKRILNVPQELYEKGYVKDVDDGLQAAEEVGYPVMIKASEGG 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KB5 GGKGMRIVRSEQEFQEQLESAWREAKKSFNDDAMLIEKFVDTPRHVEVQVFGDHHGNAVY ::::.: : . ..: . .:... . ... ... ::.:::...:..:::. CCDS42 GGKGIRKVNNADDFP----NLFRQVQAEVPGSPIFVMRLAKQSRHLEVQILADQYGNAIS 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB5 LFERDCSVQRRHQKIIEEAPAPGIKSEVRKKLGEAAVRAAKAVNYVGAGTVEFIMDSKHN :: :::::::::::::::::: : ... . ::. :: :.::.:::::..... . CCDS42 LFGRDCSVQRRHQKIIEEAPATIATPAVFEHMEQCAVKLAKMVGYVSAGTVEYLYSQDGS 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 pF1KB5 FCFMEMNTRLQVEHPVTEMITGTDLVEWQLRIAAGEKIPLSQ-EEITL------------ : :.:.: ::::::: :::.. ..: ::.:: : ::: . ..: . CCDS42 FYFLELNPRLQVEHPCTEMVADVNLPAAQLQIAMG--IPLYRIKDIRMMYGVSPWGDSPI 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 pF1KB5 -----------QGHAFEARIYAEDPSNNFMPVAGPLVHLSTPRADPSTRIETGVRQGDEV .::.. ::: .:.:...: : .: . .:. :.. .. .: . . CCDS42 DFEDSAHVPCPRGHVIAARITSENPDEGFKPSSGTVQELNF-RSNKNVWGYFSVAAAGGL 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 SVHYDPMIAKLVVWAADRQAALTKLRYSLRQYNIVG-LPTNIDFLLNLSGHPEFEAGNVH : .... :. .:. :.... .:.. .: : . :....:..: :. . . CCDS42 HEFADSQFGHCFSWGENREEAISNMVVALKELSIRGDFRTTVEYLIKLLETESFQMNRID 480 490 500 510 520 530 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 TDFIPQHHKQLLLSRKAAAKESLCQAALGLILKEKAMTDTFTLQAHDQFSPFSSSSGRRL : .. . :...:. :.. .. ::.. ..: .. ... : : : .: CCDS42 TGWLDR-----LIAEKVQAERP--DTMLGVVCGALHVAD---VSLRNSVSNFLHSL-ERG 540 550 560 570 580 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 NISYTRNMTLKDGKNNVAIAVTYNHDG-SYSMQIEDKT---FQVLGNLYSEGDCTYLKCS .. .... :.: . . : .: .: ... .. . :. : :.: .. . CCDS42 QVLPAHTLL-----NTVDVELIY--EGVKYVLKVTRQSPNSYVVIMN----GSC--VEVD 590 600 610 620 610 620 630 640 650 pF1KB5 VNGVASKAKLIILENTIYL-FSKEGSIEIDIPVPKYLSSVSSQ----ETQGGPL---APM :. ... . :. ... : . :: :.: .: ..... : .. : .: CCDS42 VHRLSDGGLLLSYDGSSYTTYMKE---EVD----RYRITIGNKTCVFEKENDPSVMRSPS 630 640 650 660 670 680 660 670 680 690 700 710 pF1KB5 TGTIEKVFVKAGDKVKAGDSLMVMIAMKMEHTIKSPKDGTVKKVFYREGAQANRHTPLVE .: . . .:. : .: ::. . .::: :. . ..: .. : : :: . :.. CCDS42 AGKLIQYIVEDGGHVFAGQCYAEIEVMKMVMTLTAVESGCIHYV-KRPGAALDPGCVLAK 690 700 710 720 730 720 pF1KB5 FEEEESDKRESE .. .. .: CCDS42 MQLDNPSKVQQAELHTGSLPRIQSTALRGEKLHRVFHYVLDNLVNVMNGYCLPDPFFSSK 740 750 760 770 780 790 >>CCDS11318.1 ACACA gene_id:31|Hs108|chr17 (2288 aa) initn: 759 init1: 406 opt: 534 Z-score: 644.0 bits: 131.4 E(32554): 1.5e-29 Smith-Waterman score: 819; 27.7% identity (58.0% similar) in 758 aa overlap (40-721:49-767) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 LLVAAERNRWHRLPSLLLPPRTWVWRQRTMKYTTATGRN--ITKVLIANRGEIACRVMRT ...: : : : :::::: : : . ::. CCDS11 SSMSGLHLVKQGRDRKKIDSQRDFTVASPAEFVTRFGGNKVIEKVLIANNGIAAVKCMRS 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 pF1KB5 AKKLG---------VQTVAVYSEAD--RNSMHVDMADEAYSIGPAPSQQSYLSMEKIIQV .. . .. :.. . : :. .. :::. . .:....: ..: :... CCDS11 IRRWSYEMFRNERAIRFVVMVTPEDLKANAEYIKMADHYVPVPGGPNNNNYANVELILDI 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 AKTSAAQAIHPGCGFLSENMEFAELCKQEGIIFIGPPPSAIRDMGIKSTSKSIMAAAGVP :: .::. : : ::: .. :: ..:: :.::: .:. .: : .:. . .::.: CCDS11 AKRIPVQAVWAGWGHASENPKLPELLLKNGIAFMGPPSQAMWALGDKIASSIVAQTAGIP 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 pF1KB5 VVE----GYHGEDQSD----------QCLKEH------------ARRIGYPVMIKAVRGG .. : . . : . : : :. :...:::::::: .:: CCDS11 TLPWSGSGLRVDWQENDFSKRILNVPQELYEKGYVKDVDDGLQAAEEVGYPVMIKASEGG 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KB5 GGKGMRIVRSEQEFQEQLESAWREAKKSFNDDAMLIEKFVDTPRHVEVQVFGDHHGNAVY ::::.: : . ..: . .:... . ... ... ::.:::...:..:::. CCDS11 GGKGIRKVNNADDFP----NLFRQVQAEVPGSPIFVMRLAKQSRHLEVQILADQYGNAIS 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 pF1KB5 LFERDCSVQRRHQKIIEEAPAPGIKSEVRKKLGEAAVRAAKAVNYVGAGTVEFIMDSKHN :: :::::::::::::::::: : ... . ::. :: :.::.:::::..... . CCDS11 LFGRDCSVQRRHQKIIEEAPATIATPAVFEHMEQCAVKLAKMVGYVSAGTVEYLYSQDGS 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 pF1KB5 FCFMEMNTRLQVEHPVTEMITGTDLVEWQLRIAAGEKIPLSQ-EEITL------------ : :.:.: ::::::: :::.. ..: ::.:: : ::: . ..: . CCDS11 FYFLELNPRLQVEHPCTEMVADVNLPAAQLQIAMG--IPLYRIKDIRMMYGVSPWGDSPI 380 390 400 410 420 430 380 390 400 410 420 pF1KB5 -----------QGHAFEARIYAEDPSNNFMPVAGPLVHLSTPRADPSTRIETGVRQGDEV .::.. ::: .:.:...: : .: . .:. :.. .. .: . . CCDS11 DFEDSAHVPCPRGHVIAARITSENPDEGFKPSSGTVQELNF-RSNKNVWGYFSVAAAGGL 440 450 460 470 480 490 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 SVHYDPMIAKLVVWAADRQAALTKLRYSLRQYNIVG-LPTNIDFLLNLSGHPEFEAGNVH : .... :. .:. :.... .:.. .: : . :....:..: :. . . 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CCDS42 AGKLIQYIVEDGGHVFAGQCYAEIEVMKMVMTLTAVESGCIHYV-KRPGAALDPGCVLAK 800 810 820 830 840 850 720 pF1KB5 FEEEESDKRESE .. .. .: CCDS42 MQLDNPSKVQQAELHTGSLPRIQSTALRGEKLHRVFHYVLDNLVNVMNGYCLPDPFFSSK 860 870 880 890 900 910 725 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 22:11:24 2016 done: Sat Nov 5 22:11:24 2016 Total Scan time: 3.340 Total Display time: 0.220 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]