Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5089
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5089, 1234 aa
1>>>pF1KB5089 1234 - 1234 aa - 1234 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8302+/-0.00106; mu= 3.7483+/- 0.064
mean_var=237.6333+/-49.278, 0's: 0 Z-trim(112.3): 39 B-trim: 236 in 2/50
Lambda= 0.083199
statistics sampled from 13021 (13057) to 13021 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.718), E-opt: 0.2 (0.401), width: 16
Scan time: 5.190
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8064.1 PLCB3 gene_id:5331|Hs108|chr11 (1234) 8135 990.3 0
CCDS53654.1 PLCB3 gene_id:5331|Hs108|chr11 (1167) 7473 910.8 0
CCDS13103.1 PLCB1 gene_id:23236|Hs108|chr20 (1173) 2218 280.1 2.3e-74
CCDS13102.1 PLCB1 gene_id:23236|Hs108|chr20 (1216) 2218 280.1 2.4e-74
CCDS61591.1 PLCB2 gene_id:5330|Hs108|chr15 (1170) 1846 235.4 6.4e-61
CCDS61592.1 PLCB2 gene_id:5330|Hs108|chr15 (1181) 1846 235.4 6.5e-61
CCDS42020.1 PLCB2 gene_id:5330|Hs108|chr15 (1185) 1846 235.4 6.5e-61
CCDS54447.1 PLCB4 gene_id:5332|Hs108|chr20 (1187) 1606 206.6 3.1e-52
CCDS13105.1 PLCB4 gene_id:5332|Hs108|chr20 (1175) 1303 170.2 2.7e-41
CCDS13104.1 PLCB4 gene_id:5332|Hs108|chr20 (1194) 1302 170.1 3e-41
CCDS73704.1 PLCB2 gene_id:5330|Hs108|chr15 ( 199) 629 88.9 1.4e-17
CCDS2326.2 PLCL1 gene_id:5334|Hs108|chr2 (1095) 633 89.8 4.1e-17
CCDS46516.1 PLCD4 gene_id:84812|Hs108|chr2 ( 762) 584 83.8 1.8e-15
CCDS13313.1 PLCG1 gene_id:5335|Hs108|chr20 (1291) 583 83.8 3e-15
CCDS33713.1 PLCL2 gene_id:23228|Hs108|chr3 (1001) 579 83.3 3.4e-15
CCDS74911.1 PLCL2 gene_id:23228|Hs108|chr3 (1127) 579 83.3 3.8e-15
CCDS13314.1 PLCG1 gene_id:5335|Hs108|chr20 (1290) 577 83.1 5e-15
CCDS59959.1 PLCH2 gene_id:9651|Hs108|chr1 (1416) 561 81.2 2e-14
CCDS74077.1 PLCD3 gene_id:113026|Hs108|chr17 ( 789) 542 78.8 6.1e-14
CCDS42204.1 PLCG2 gene_id:5336|Hs108|chr16 (1265) 546 79.4 6.4e-14
CCDS2671.1 PLCD1 gene_id:5333|Hs108|chr3 ( 756) 539 78.4 7.6e-14
CCDS46793.1 PLCD1 gene_id:5333|Hs108|chr3 ( 777) 539 78.4 7.7e-14
CCDS81671.1 PLCZ1 gene_id:89869|Hs108|chr12 ( 415) 529 77.1 1.1e-13
CCDS8680.1 PLCZ1 gene_id:89869|Hs108|chr12 ( 608) 529 77.2 1.5e-13
CCDS46940.1 PLCH1 gene_id:23007|Hs108|chr3 (1002) 508 74.8 1.3e-12
CCDS46939.1 PLCH1 gene_id:23007|Hs108|chr3 (1693) 508 74.9 1.9e-12
CCDS33881.1 PLCH1 gene_id:23007|Hs108|chr3 (1655) 505 74.5 2.4e-12
CCDS53555.1 PLCE1 gene_id:51196|Hs108|chr10 (1994) 494 73.3 7.1e-12
CCDS41552.1 PLCE1 gene_id:51196|Hs108|chr10 (2302) 494 73.3 8e-12
>>CCDS8064.1 PLCB3 gene_id:5331|Hs108|chr11 (1234 aa)
initn: 8135 init1: 8135 opt: 8135 Z-score: 5286.5 bits: 990.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8135; 100.0% identity (100.0% similar) in 1234 aa overlap (1-1234:1-1234)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAGAQPGVHALQLEPPTVVETLRRGSKFIKWDEETSSRNLVTLRVDPNGFFLYWTGPNME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 MAGAQPGVHALQLEPPTVVETLRRGSKFIKWDEETSSRNLVTLRVDPNGFFLYWTGPNME
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VDTLDISSIRDTRTGRYARLPKDPKIREVLGFGGPDARLEEKLMTVVSGPDPVNTVFLNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 VDTLDISSIRDTRTGRYARLPKDPKIREVLGFGGPDARLEEKLMTVVSGPDPVNTVFLNF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 MAVQDDTAKVWSEELFKLAMNILAQNASRNTFLRKAYTKLKLQVNQDGRIPVKNILKMFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 MAVQDDTAKVWSEELFKLAMNILAQNASRNTFLRKAYTKLKLQVNQDGRIPVKNILKMFS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 ADKKRVETALESCGLKFNRSESIRPDEFSLEIFERFLNKLCLRPDIDKILLEIGAKGKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 ADKKRVETALESCGLKFNRSESIRPDEFSLEIFERFLNKLCLRPDIDKILLEIGAKGKPY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LTLEQLMDFINQKQRDPRLNEVLYPPLRPSQARLLIEKYEPNQQFLERDQMSMEGFSRYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LTLEQLMDFINQKQRDPRLNEVLYPPLRPSQARLLIEKYEPNQQFLERDQMSMEGFSRYL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GGEENGILPLEALDLSTDMTQPLSAYFINSSHNTYLTAGQLAGTSSVEMYRQALLWGCRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 GGEENGILPLEALDLSTDMTQPLSAYFINSSHNTYLTAGQLAGTSSVEMYRQALLWGCRC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VELDVWKGRPPEEEPFITHGFTMTTEVPLRDVLEAIAETAFKTSPYPVILSFENHVDSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 VELDVWKGRPPEEEPFITHGFTMTTEVPLRDVLEAIAETAFKTSPYPVILSFENHVDSAK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 QQAKMAEYCRSIFGDALLIEPLDKYPLAPGVPLPSPQDLMGRILVKNKKRHRPSAGGPDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 AGRKRPLEQSNSALSESSAATEPSSPQLGSPSSDSCPGLSNGEEVGLEKPSLEPQKSLGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 AGRKRPLEQSNSALSESSAATEPSSPQLGSPSSDSCPGLSNGEEVGLEKPSLEPQKSLGD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 EGLNRGPYVLGPADREDEEEDEEEEEQTDPKKPTTDEGTASSEVNATEEMSTLVNYIEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 EGLNRGPYVLGPADREDEEEDEEEEEQTDPKKPTTDEGTASSEVNATEEMSTLVNYIEPV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 KFKSFEAARKRNKCFEMSSFVETKAMEQLTKSPMEFVEYNKQQLSRIYPKGTRVDSSNYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 KFKSFEAARKRNKCFEMSSFVETKAMEQLTKSPMEFVEYNKQQLSRIYPKGTRVDSSNYM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 PQLFWNVGCQLVALNFQTLDVAMQLNAGVFEYNGRSGYLLKPEFMRRPDKSFDPFTEVIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 PQLFWNVGCQLVALNFQTLDVAMQLNAGVFEYNGRSGYLLKPEFMRRPDKSFDPFTEVIV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 DGIVANALRVKVISGQFLSDRKVGIYVEVDMFGLPVDTRRKYRTRTSQGNSFNPVWDEEP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 FDFPKVVLPTLASLRIAAFEEGGKFVGHRILPVSAIRSGYHYVCLRNEANQPLCLPALLI
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850 860 870 880 890 900
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 YTEASDYIPDDHQDYAEALINPIKHVSLMDQRARQLAALIGESEAQAGQETCQDTQSQQL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 GSQPSSNPTPSPLDASPRRPPGPTTSPASTSLSSPGQRDDLIASILSEVAPTPLDELRGH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB5 KALVKLRSRQERDLRELRKKHQRKAVTLTRRLLDGLAQAQAEGRCRLRPGALGGAADVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 KALVKLRSRQERDLRELRKKHQRKAVTLTRRLLDGLAQAQAEGRCRLRPGALGGAADVED
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB5 TKEGEDEAKRYQEFQNRQVQSLLELREAQVDAEAQRRLEHLRQALQRLREVVLDANTTQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 TKEGEDEAKRYQEFQNRQVQSLLELREAQVDAEAQRRLEHLRQALQRLREVVLDANTTQF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB5 KRLKEMNEREKKELQKILDRKRHNSISEAKMRDKHKKEAELTEINRRHITESVNSIRRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 KRLKEMNEREKKELQKILDRKRHNSISEAKMRDKHKKEAELTEINRRHITESVNSIRRLE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB5 EAQKQRHDRLVAGQQQVLQQLAEEEPKLLAQLAQECQEQRARLPQEIRRSLLGEMPEGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 EAQKQRHDRLVAGQQQVLQQLAEEEPKLLAQLAQECQEQRARLPQEIRRSLLGEMPEGLG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230
pF1KB5 DGPLVACASNGHAPGSSGHLSGADSESQEENTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 DGPLVACASNGHAPGSSGHLSGADSESQEENTQL
1210 1220 1230
>>CCDS53654.1 PLCB3 gene_id:5331|Hs108|chr11 (1167 aa)
initn: 7465 init1: 7465 opt: 7473 Z-score: 4857.4 bits: 910.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7540; 94.6% identity (94.6% similar) in 1234 aa overlap (1-1234:1-1167)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAGAQPGVHALQLEPPTVVETLRRGSKFIKWDEETSSRNLVTLRVDPNGFFLYWTGPNME
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAGAQPGVHALQLEPPTVVETLRRGSKFIKWDEE--------------------------
10 20 30
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pF1KB5 VDTLDISSIRDTRTGRYARLPKDPKIREVLGFGGPDARLEEKLMTVVSGPDPVNTVFLNF
:::::::::::::::::::
CCDS53 -----------------------------------------KLMTVVSGPDPVNTVFLNF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAVQDDTAKVWSEELFKLAMNILAQNASRNTFLRKAYTKLKLQVNQDGRIPVKNILKMFS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LTLEQLMDFINQKQRDPRLNEVLYPPLRPSQARLLIEKYEPNQQFLERDQMSMEGFSRYL
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GGEENGILPLEALDLSTDMTQPLSAYFINSSHNTYLTAGQLAGTSSVEMYRQALLWGCRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GGEENGILPLEALDLSTDMTQPLSAYFINSSHNTYLTAGQLAGTSSVEMYRQALLWGCRC
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370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VELDVWKGRPPEEEPFITHGFTMTTEVPLRDVLEAIAETAFKTSPYPVILSFENHVDSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VELDVWKGRPPEEEPFITHGFTMTTEVPLRDVLEAIAETAFKTSPYPVILSFENHVDSAK
300 310 320 330 340 350
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pF1KB5 QQAKMAEYCRSIFGDALLIEPLDKYPLAPGVPLPSPQDLMGRILVKNKKRHRPSAGGPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QQAKMAEYCRSIFGDALLIEPLDKYPLAPGVPLPSPQDLMGRILVKNKKRHRPSAGGPDS
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pF1KB5 AGRKRPLEQSNSALSESSAATEPSSPQLGSPSSDSCPGLSNGEEVGLEKPSLEPQKSLGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AGRKRPLEQSNSALSESSAATEPSSPQLGSPSSDSCPGLSNGEEVGLEKPSLEPQKSLGD
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pF1KB5 EGLNRGPYVLGPADREDEEEDEEEEEQTDPKKPTTDEGTASSEVNATEEMSTLVNYIEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EGLNRGPYVLGPADREDEEEDEEEEEQTDPKKPTTDEGTASSEVNATEEMSTLVNYIEPV
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pF1KB5 KFKSFEAARKRNKCFEMSSFVETKAMEQLTKSPMEFVEYNKQQLSRIYPKGTRVDSSNYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KFKSFEAARKRNKCFEMSSFVETKAMEQLTKSPMEFVEYNKQQLSRIYPKGTRVDSSNYM
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pF1KB5 PQLFWNVGCQLVALNFQTLDVAMQLNAGVFEYNGRSGYLLKPEFMRRPDKSFDPFTEVIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PQLFWNVGCQLVALNFQTLDVAMQLNAGVFEYNGRSGYLLKPEFMRRPDKSFDPFTEVIV
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pF1KB5 DGIVANALRVKVISGQFLSDRKVGIYVEVDMFGLPVDTRRKYRTRTSQGNSFNPVWDEEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DGIVANALRVKVISGQFLSDRKVGIYVEVDMFGLPVDTRRKYRTRTSQGNSFNPVWDEEP
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790 800 810 820 830 840
pF1KB5 FDFPKVVLPTLASLRIAAFEEGGKFVGHRILPVSAIRSGYHYVCLRNEANQPLCLPALLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FDFPKVVLPTLASLRIAAFEEGGKFVGHRILPVSAIRSGYHYVCLRNEANQPLCLPALLI
720 730 740 750 760 770
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 YTEASDYIPDDHQDYAEALINPIKHVSLMDQRARQLAALIGESEAQAGQETCQDTQSQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YTEASDYIPDDHQDYAEALINPIKHVSLMDQRARQLAALIGESEAQAGQETCQDTQSQQL
780 790 800 810 820 830
910 920 930 940 950 960
pF1KB5 GSQPSSNPTPSPLDASPRRPPGPTTSPASTSLSSPGQRDDLIASILSEVAPTPLDELRGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GSQPSSNPTPSPLDASPRRPPGPTTSPASTSLSSPGQRDDLIASILSEVAPTPLDELRGH
840 850 860 870 880 890
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB5 KALVKLRSRQERDLRELRKKHQRKAVTLTRRLLDGLAQAQAEGRCRLRPGALGGAADVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KALVKLRSRQERDLRELRKKHQRKAVTLTRRLLDGLAQAQAEGRCRLRPGALGGAADVED
900 910 920 930 940 950
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB5 TKEGEDEAKRYQEFQNRQVQSLLELREAQVDAEAQRRLEHLRQALQRLREVVLDANTTQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TKEGEDEAKRYQEFQNRQVQSLLELREAQVDAEAQRRLEHLRQALQRLREVVLDANTTQF
960 970 980 990 1000 1010
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB5 KRLKEMNEREKKELQKILDRKRHNSISEAKMRDKHKKEAELTEINRRHITESVNSIRRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KRLKEMNEREKKELQKILDRKRHNSISEAKMRDKHKKEAELTEINRRHITESVNSIRRLE
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB5 EAQKQRHDRLVAGQQQVLQQLAEEEPKLLAQLAQECQEQRARLPQEIRRSLLGEMPEGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EAQKQRHDRLVAGQQQVLQQLAEEEPKLLAQLAQECQEQRARLPQEIRRSLLGEMPEGLG
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1210 1220 1230
pF1KB5 DGPLVACASNGHAPGSSGHLSGADSESQEENTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DGPLVACASNGHAPGSSGHLSGADSESQEENTQL
1140 1150 1160
>>CCDS13103.1 PLCB1 gene_id:23236|Hs108|chr20 (1173 aa)
initn: 3280 init1: 1765 opt: 2218 Z-score: 1448.4 bits: 280.1 E(32554): 2.3e-74
Smith-Waterman score: 4304; 54.8% identity (78.5% similar) in 1212 aa overlap (1-1184:1-1161)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAGAQPGVHALQLEPPTVVETLRRGSKFIKWDEETSSRNLVTLRVDPNGFFLYWTGPNME
:::::::::::::.: : ..:..:.::.:::.... . . ::.::.:::.::: : :
CCDS13 MAGAQPGVHALQLKPVCVSDSLKKGTKFVKWDDDSTIVTPIILRTDPQGFFFYWTDQNKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VDTLDISSIRDTRTGRYARLPKDPKIREVLGFGGPDARLEEKLMTVVSGPDPVNTVFLNF
.. ::.: ..:.: ::.:. :::::.::.: :. .:::....::: ::: :: ::.
CCDS13 TELLDLSLVKDARCGRHAKAPKDPKLRELLDVGNI-GRLEQRMITVVYGPDLVNISHLNL
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CCDS42 RLKREINNSHIQEVVQVIKQMTENLERHQEKLEEKQAACLEQIREMEKQFQKEALAEYEA
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CCDS42 RMKGLEAEVKESVRACLRTCFPSEAKDKPERACECPPELCEQDPLIAKADAQESRL
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