FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5089, 1234 aa 1>>>pF1KB5089 1234 - 1234 aa - 1234 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4333+/-0.000412; mu= 5.8897+/- 0.026 mean_var=249.9663+/-49.867, 0's: 0 Z-trim(120.2): 139 B-trim: 0 in 0/57 Lambda= 0.081121 statistics sampled from 34999 (35140) to 34999 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.726), E-opt: 0.2 (0.412), width: 16 Scan time: 18.760 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000923 (OMIM: 600230) 1-phosphatidylinositol 4, (1234) 8135 966.2 0 NP_001303243 (OMIM: 600230) 1-phosphatidylinositol (1234) 8135 966.2 0 XP_011543403 (OMIM: 600230) PREDICTED: 1-phosphati (1154) 7505 892.4 0 NP_001171812 (OMIM: 600230) 1-phosphatidylinositol (1167) 7473 888.7 0 XP_016873414 (OMIM: 600230) PREDICTED: 1-phosphati ( 703) 4511 541.8 5.7e-153 XP_016883241 (OMIM: 607120,613722) 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. . ::.::.:::.::: : : XP_016 MAGAQPGVHALQLKPVCVSDSLKKGTKFVKWDDDSTIVTPIILRTDPQGFFFYWTDQNKE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 VDTLDISSIRDTRTGRYARLPKDPKIREVLGFGGPDARLEEKLMTVVSGPDPVNTVFLNF .. ::.: ..:.: ::.:. :::::.::.: :. .:::....::: ::: :: ::. 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XP_011 -SGKKKLSEQASNTYSDSSSMFEPSSP--GA----------------------------- 480 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 DEGLNRGPYVLGPADREDEEEDEEEEEQTDPKKPTTDEGTASSEVNATEEMSTLVNYIEP : :: :....:... : :: . :::::.::. ::::::.:::::.: XP_011 -----------GEADTESDDDDDDD----DCKKSSMDEGTAGSEAMATEEMSNLVNYIQP 510 520 530 540 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 VKFKSFEAARKRNKCFEMSSFVETKAMEQLTKSPMEFVEYNKQQLSRIYPKGTRVDSSNY :::.::: ..:::: ::::::::::..:::::::.:::::::.::::::::::::::::: XP_011 VKFESFEISKKRNKSFEMSSFVETKGLEQLTKSPVEFVEYNKMQLSRIYPKGTRVDSSNY 550 560 570 580 590 600 660 670 680 690 700 710 pF1KB5 MPQLFWNVGCQLVALNFQTLDVAMQLNAGVFEYNGRSGYLLKPEFMRRPDKSFDPFTEVI :::::::.:::.:::::::.:.:::.: :..::::.::: ::::::::::: :::::: : XP_011 MPQLFWNAGCQMVALNFQTMDLAMQINMGMYEYNGKSGYRLKPEFMRRPDKHFDPFTEGI 610 620 630 640 650 660 720 730 740 750 760 770 pF1KB5 VDGIVANALRVKVISGQFLSDRKVGIYVEVDMFGLPVDTRRK-YRTRTSQGNSFNPVWDE :::::::.: ::.::::::::.::: :::::::::::::::: ..:.:::::. ::::.: XP_011 VDGIVANTLSVKIISGQFLSDKKVGTYVEVDMFGLPVDTRRKAFKTKTSQGNAVNPVWEE 670 680 690 700 710 720 780 790 800 810 820 830 pF1KB5 EPFDFPKVVLPTLASLRIAAFEEGGKFVGHRILPVSAIRSGYHYVCLRNEANQPLCLPAL ::. : :::::::: ::::..::::::.:::::::.::: ::::.::::: :::: :::. 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XP_011 QMEEEKTEMIRSYIQEVVQYIKRLEEAQSKRQEKLVEKHKEIRQQILDEKPKIQTVNSVM 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KB5 CQEQRARLPQEIRRSLLGEMPEGLGDGPLVACASNGHAPGSSGHLSGADSESQEENTQL XP_011 RWLP 1150 >>NP_877398 (OMIM: 607120,613722) 1-phosphatidylinositol (1173 aa) initn: 3280 init1: 1765 opt: 2218 Z-score: 1413.9 bits: 273.7 E(85289): 5.1e-72 Smith-Waterman score: 4304; 54.8% identity (78.5% similar) in 1212 aa overlap (1-1184:1-1161) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MAGAQPGVHALQLEPPTVVETLRRGSKFIKWDEETSSRNLVTLRVDPNGFFLYWTGPNME :::::::::::::.: : ..:..:.::.:::.... . . ::.::.:::.::: : : NP_877 MAGAQPGVHALQLKPVCVSDSLKKGTKFVKWDDDSTIVTPIILRTDPQGFFFYWTDQNKE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 VDTLDISSIRDTRTGRYARLPKDPKIREVLGFGGPDARLEEKLMTVVSGPDPVNTVFLNF .. ::.: ..:.: ::.:. :::::.::.: :. .:::....::: ::: :: ::. NP_877 TELLDLSLVKDARCGRHAKAPKDPKLRELLDVGNI-GRLEQRMITVVYGPDLVNISHLNL 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 MAVQDDTAKVWSEELFKLAMNILAQNASRNTFLRKAYTKLKLQVNQDGRIPVKNILKMFS .: :...:: :..:.:.:: :.:::: ::..::.::::::::::. .::::.::: ..:: NP_877 VAFQEEVAKEWTNEVFSLATNLLAQNMSRDAFLEKAYTKLKLQVTPEGRIPLKNIYRLFS 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 ADKKRVETALESCGLKFNRSESIRPDEFSLEIFERFLNKLCLRPDIDKILLEIGAKGKPY ::.::::::::.:.: .:..:: ..:. :... :::.:: ::.::.:. :.:::.::: NP_877 ADRKRVETALEACSLPSSRNDSIPQEDFTPEVYRVFLNNLCPRPEIDNIFSEFGAKSKPY 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 LTLEQLMDFINQKQRDPRLNEVLYPPLRPSQARLLIEKYEPNQQFLERDQMSMEGFSRYL ::..:.::::: :::::::::.:::::. :...::::::::... .. :.:..:: ::: NP_877 LTVDQMMDFINLKQRDPRLNEILYPPLKQEQVQVLIEKYEPNNSLARKGQISVDGFMRYL 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 GGEENGILPLEALDLSTDMTQPLSAYFINSSHNTYLTAGQLAGTSSVEMYRQALLWGCRC .:::::.. : :::. ::.:::: ::::::::::::::::::.::::::::.:: :::: NP_877 SGEENGVVSPEKLDLNEDMSQPLSHYFINSSHNTYLTAGQLAGNSSVEMYRQVLLSGCRC 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 VELDVWKGRPPEEEPFITHGFTMTTEVPLRDVLEAIAETAFKTSPYPVILSFENHVDSAK :::: :::: :::: ::::::::::. ...:.::::: ::::::.:..::::::::: : NP_877 VELDCWKGRTAEEEPVITHGFTMTTEISFKEVIEAIAECAFKTSPFPILLSFENHVDSPK 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 pF1KB5 QQAKMAEYCRSIFGDALLIEPLDKYPLAPGVPLPSPQDLMGRILVKNKKR-HRPSAGGPD :::::::::: :::::::.:::.:::: :::::::.::: .:::::::. :. : : NP_877 QQAKMAEYCRLIFGDALLMEPLEKYPLESGVPLPSPMDLMYKILVKNKKKSHKSSEG--- 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 SAGRKRPLEQSNSALSESSAATEPSSPQLGSPSSDSCPGLSNGEEVGLEKPSLEPQKSLG .:.:. ::.... :.::. ::::: :. 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NP_877 IEELKQQKSFVKLQKKHYKEMKDLVKRHHKKTTDLIKEHTTKYNEIQNDYLRRRAALEKS 910 920 930 940 950 960 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB5 AQAEGRCRLRPGALG-GAADVEDTKEGEDE--AKRYQEFQNRQVQSLLELREAQVDAEAQ :. ... . .:.. :.. .:. . : ... .....: :.::.::. : .: NP_877 AKKDSKKKSEPSSPDHGSSTIEQDLAALDAEMTQKLIDLKDKQQQQLLNLRQEQYYSEKY 970 980 990 1000 1010 1020 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB5 RRLEHLRQALQRLREVVLDANTTQFKRLKEMNEREKKELQKILDRKRHNSISEAKMRDKH .. ::.. .:.: .:. . ...:.:.:::. :.:::::.: .:.::...:.::: .:: NP_877 QKREHIKLLIQKLTDVAEECQNNQLKKLKEICEKEKKELKKKMDKKRQEKITEAKSKDKS 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB5 KKEAELTEINRRHITESVNSIRRLEEAQKQRHDRLVAGQQQVLQQLAEEEPKLLAQ---L . : : ::. : .: : :. :.::::::..:...:: .... ::. .:.:: .. : NP_877 QMEEEKTEMIRSYIQEVVQYIKRLEEAQSKRQEKLVEKHKEIRQQILDEKPKGEGSSSFL 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KB5 AQECQEQRARLPQEIRRSLLGEMPEGLGDGPLVACASNGHAPGSSGHLSGADSESQEENT .. :.:. . : NP_877 SETCHEDPSVSPNFTPPNPQALKW 1150 1160 1170 >>NP_056007 (OMIM: 607120,613722) 1-phosphatidylinositol (1216 aa) initn: 3337 init1: 1765 opt: 2218 Z-score: 1413.7 bits: 273.7 E(85289): 5.3e-72 Smith-Waterman score: 4381; 54.0% identity (77.7% similar) in 1268 aa overlap (1-1234:1-1216) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MAGAQPGVHALQLEPPTVVETLRRGSKFIKWDEETSSRNLVTLRVDPNGFFLYWTGPNME :::::::::::::.: : ..:..:.::.:::.... . . ::.::.:::.::: : : NP_056 MAGAQPGVHALQLKPVCVSDSLKKGTKFVKWDDDSTIVTPIILRTDPQGFFFYWTDQNKE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 VDTLDISSIRDTRTGRYARLPKDPKIREVLGFGGPDARLEEKLMTVVSGPDPVNTVFLNF .. ::.: ..:.: ::.:. :::::.::.: :. .:::....::: ::: :: ::. NP_056 TELLDLSLVKDARCGRHAKAPKDPKLRELLDVGNI-GRLEQRMITVVYGPDLVNISHLNL 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 MAVQDDTAKVWSEELFKLAMNILAQNASRNTFLRKAYTKLKLQVNQDGRIPVKNILKMFS .: :...:: :..:.:.:: :.:::: ::..::.::::::::::. .::::.::: ..:: NP_056 VAFQEEVAKEWTNEVFSLATNLLAQNMSRDAFLEKAYTKLKLQVTPEGRIPLKNIYRLFS 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 ADKKRVETALESCGLKFNRSESIRPDEFSLEIFERFLNKLCLRPDIDKILLEIGAKGKPY ::.::::::::.:.: .:..:: ..:. :... :::.:: ::.::.:. :.:::.::: NP_056 ADRKRVETALEACSLPSSRNDSIPQEDFTPEVYRVFLNNLCPRPEIDNIFSEFGAKSKPY 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 LTLEQLMDFINQKQRDPRLNEVLYPPLRPSQARLLIEKYEPNQQFLERDQMSMEGFSRYL ::..:.::::: :::::::::.:::::. :...::::::::... .. :.:..:: ::: NP_056 LTVDQMMDFINLKQRDPRLNEILYPPLKQEQVQVLIEKYEPNNSLARKGQISVDGFMRYL 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 GGEENGILPLEALDLSTDMTQPLSAYFINSSHNTYLTAGQLAGTSSVEMYRQALLWGCRC .:::::.. : :::. ::.:::: ::::::::::::::::::.::::::::.:: :::: NP_056 SGEENGVVSPEKLDLNEDMSQPLSHYFINSSHNTYLTAGQLAGNSSVEMYRQVLLSGCRC 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 VELDVWKGRPPEEEPFITHGFTMTTEVPLRDVLEAIAETAFKTSPYPVILSFENHVDSAK :::: :::: :::: ::::::::::. ...:.::::: ::::::.:..::::::::: : NP_056 VELDCWKGRTAEEEPVITHGFTMTTEISFKEVIEAIAECAFKTSPFPILLSFENHVDSPK 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 pF1KB5 QQAKMAEYCRSIFGDALLIEPLDKYPLAPGVPLPSPQDLMGRILVKNKKR-HRPSAGGPD :::::::::: :::::::.:::.:::: :::::::.::: .:::::::. :. : : NP_056 QQAKMAEYCRLIFGDALLMEPLEKYPLESGVPLPSPMDLMYKILVKNKKKSHKSSEG--- 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 SAGRKRPLEQSNSALSESSAATEPSSPQLGSPSSDSCPGLSNGEEVGLEKPSLEPQKSLG .:.:. ::.... :.::. ::::: :. NP_056 -SGKKKLSEQASNTYSDSSSMFEPSSP--GA----------------------------- 480 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 DEGLNRGPYVLGPADREDEEEDEEEEEQTDPKKPTTDEGTASSEVNATEEMSTLVNYIEP : :: :....:... : :: . :::::.::. ::::::.:::::.: NP_056 -----------GEADTESDDDDDDD----DCKKSSMDEGTAGSEAMATEEMSNLVNYIQP 510 520 530 540 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 VKFKSFEAARKRNKCFEMSSFVETKAMEQLTKSPMEFVEYNKQQLSRIYPKGTRVDSSNY :::.::: ..:::: ::::::::::..:::::::.:::::::.::::::::::::::::: NP_056 VKFESFEISKKRNKSFEMSSFVETKGLEQLTKSPVEFVEYNKMQLSRIYPKGTRVDSSNY 550 560 570 580 590 600 660 670 680 690 700 710 pF1KB5 MPQLFWNVGCQLVALNFQTLDVAMQLNAGVFEYNGRSGYLLKPEFMRRPDKSFDPFTEVI :::::::.:::.:::::::.:.:::.: :..::::.::: ::::::::::: :::::: : NP_056 MPQLFWNAGCQMVALNFQTMDLAMQINMGMYEYNGKSGYRLKPEFMRRPDKHFDPFTEGI 610 620 630 640 650 660 720 730 740 750 760 770 pF1KB5 VDGIVANALRVKVISGQFLSDRKVGIYVEVDMFGLPVDTRRK-YRTRTSQGNSFNPVWDE :::::::.: ::.::::::::.::: :::::::::::::::: ..:.:::::. ::::.: NP_056 VDGIVANTLSVKIISGQFLSDKKVGTYVEVDMFGLPVDTRRKAFKTKTSQGNAVNPVWEE 670 680 690 700 710 720 780 790 800 810 820 830 pF1KB5 EPFDFPKVVLPTLASLRIAAFEEGGKFVGHRILPVSAIRSGYHYVCLRNEANQPLCLPAL ::. : :::::::: ::::..::::::.:::::::.::: ::::.::::: :::: :::. NP_056 EPIVFKKVVLPTLACLRIAVYEEGGKFIGHRILPVQAIRPGYHYICLRNERNQPLTLPAV 730 740 750 760 770 780 840 850 860 870 880 890 pF1KB5 LIYTEASDYIPDDHQDYAEALINPIKHVSLMDQRARQLAALIGESEAQAGQETCQDTQSQ ..: :..::.:: . : ::: :::..:.::.:::.::::: :.: .. .:. . NP_056 FVYIEVKDYVPDTYADVIEALSNPIRYVNLMEQRAKQLAALTLEDEEEVKKEADPGETPS 790 800 810 820 830 840 900 910 920 930 940 950 pF1KB5 QLGSQPSSNPTPSPLDASPRRPPGPTTS-----PASTSLSSPGQRDDLIASILSEVAPTP . :. ..:. . .. . : : .. :: :...:.. .::: :.:.:: NP_056 EAPSEARTTPAENGVNHTTTLTPKPPSQALHSQPAPGSVKAPAKTEDLIQSVLTEVEAQT 850 860 870 880 890 900 960 970 980 990 pF1KB5 LDELRGHKALVKLRSRQERDLRELRKKHQRKAVTLT---------------RRLLDGLAQ ..::. .:..:::.... .....: :.:..:.. : :: . 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