Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5098
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5098, 1158 aa
1>>>pF1KB5098 1158 - 1158 aa - 1158 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.3597+/-0.00116; mu= -13.6609+/- 0.071
mean_var=478.3575+/-96.294, 0's: 0 Z-trim(115.8): 83 B-trim: 179 in 1/51
Lambda= 0.058641
statistics sampled from 16344 (16425) to 16344 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.773), E-opt: 0.2 (0.505), width: 16
Scan time: 6.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5476.1 AEBP1 gene_id:165|Hs108|chr7 (1158) 8016 693.5 7.4e-199
CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10 ( 756) 1784 166.2 2.7e-40
CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20 ( 734) 1541 145.6 4.1e-34
CCDS7486.1 CPN1 gene_id:1369|Hs108|chr10 ( 458) 685 73.0 1.8e-12
CCDS43212.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 515) 675 72.2 3.6e-12
CCDS3404.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 641) 675 72.3 4.2e-12
CCDS33953.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 652) 675 72.3 4.3e-12
>>CCDS5476.1 AEBP1 gene_id:165|Hs108|chr7 (1158 aa)
initn: 8016 init1: 8016 opt: 8016 Z-score: 3683.6 bits: 693.5 E(32554): 7.4e-199
Smith-Waterman score: 8016; 99.8% identity (99.9% similar) in 1158 aa overlap (1-1158:1-1158)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAAVRGAPLLSCLLALLALCPGGRPQTVLTDDEIEEFLEGFLSELEPEPREDDVEAPPPP
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CCDS54 MAAVRGAPLLSCLLALLALCPGGRPQTVLTDDEIEEFLEGFLSELEPEPREDDVEAPPPP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 EPTPRVRKAQAGGKPGKRPGTAAEVPPEKTKDKGKKGKKDKGPKVPKESLEGSPRPPKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EPTPRVRKAQAGGKPGKRPGTAAEVPPEKTKDKGKKGKKDKGPKVPKESLEGSPRPPKKG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KEKPPKATKKPKEKPPKATKKPKEKPPKATKKPKEKPPKATKKPPSGKRPPILAPSETLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KEKPPKATKKPKEKPPKATKKPKEKPPKATKKPKEKPPKATKKPPSGKRPPILAPSETLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 WPLPPPPSPGPEELPQEGGAPLSNNWQNPGEETHVEAREHQPEPEEETEQPTLDYNDQIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WPLPPPPSPGPEELPQEGGAPLSNNWQNPGEETHVEAREHQPEPEEETEQPTLDYNDQIE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 REDYEDFEYIRRQKQPRPPPSRRRRPERVWPEPPEEKAPAPAPEERIEPPVKPLLPPLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 REDYEDFEYIRRQKQPRPPPSRRRRPERVWPEPPEEKAPAPAPEERIEPPVKPLLPPLPP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DYGDGYVIPNYDDMDYYFGPPPPQKPDAERQTDEEKEELKKPKKEDSSPKEETDKWAVEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DYGDGYVIPNYDDMDYYFGPPPPQKPDAERQTDEEKEELKKPKKEDSSPKEETDKWAVEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GKDHKEPRKGEELEEEWTPTEKVKCPPIGMESHRIEDNQIRASSMLRHGLGAQRGRLNMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GKDHKEPRKGEELEEEWTPTEKVKCPPIGMESHRIEDNQIRASSMLRHGLGAQRGRLNMQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 TGATEDDYYDGAWCAEDDARTQWIEVDTRRTTRFTGVITQGRDSSIHDDFVTTFFVGFSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TGATEDDYYDGAWCAEDDARTQWIEVDTRRTTRFTGVITQGRDSSIHDDFVTTFFVGFSN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 DSQTWVMYTNGYEEMTFHGNVDKDTPVLSELPEPVVARFIRIYPLTWNGSLCMRLEVLGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DSQTWVMYTNGYEEMTFHGNVDKDTPVLSELPEPVVARFIRIYPLTWNGSLCMRLEVLGC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SVAPVYSYYAQNEVVATDDLDFRHHSYKDMRQLMKVVNEECPTITRTYSLGKSSRGLKIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVAPVYSYYAQNEVVATDDLDFRHHSYKDMRQLMKVVNEECPTITRTYSLGKSSRGLKIY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 AMEISDNPGEHELGEPEFRYTAGIHGNEVLGRELLLLLMQYLCREYRDGNPRVRSLVQDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AMEISDNPGEHELGEPEFRYTAGIHGNEVLGRELLLLLMQYLCREYRDGNPRVRSLVQDT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 RIHLVPSLNPDGYEVAAQMGSEFGNWALGLWTEEGFDIFEDFPDLNSVLWGAEERKWVPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RIHLVPSLNPDGYEVAAQMGSEFGNWALGLWTEEGFDIFEDFPDLNSVLWGAEERKWVPY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 RVPNNNLPIPERYLSPDATVSTEVRAIIAWMEKNPFVLGANLNGGERLVSYPYDMARTPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RVPNNNLPIPERYLSPDATVSTEVRAIIAWMEKNPFVLGANLNGGERLVSYPYDMARTPT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 QEQLLAAAMAAARGEDEDEVSEAQETPDHAIFRWLAISFASAHLTLTEPYRGGCQAQDYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QEQLLAAAMAAARGEDEDEVSEAQETPDHAIFRWLAISFASAHLTLTEPYRGGCQAQDYT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 GGMGIVNGAKWNPRTGTINDFSYLHTNCLELSFYLGCDKFPHESELPREWENNKEALLTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GGMGIVNGAKWNPRTGTINDFSYLHTNCLELSFYLGCDKFPHESELPREWENNKEALLTF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB5 MEQVHRGIKGVVTDEQGIPIANATISVSGINHGVKTASGGDYWRILNPGEYRVTAHAEGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MEQVHRGIKGVVTDEQGIPIANATISVSGINHGVKTASGGDYWRILNPGEYRVTAHAEGY
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB5 TPSAKTCNVDYDIGATQCNFILARSNWKRIREIMAMNGNRPIPHIDPSRPMTPQQRRLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TPSAKTCNVDYDIGATQCNFILARSNWKRIREIMAMNGNRPIPHIDPSRPMTPQQRRLQQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB5 RRLQHRLRLRAQMRLRRLNATTTLGPHTVPPTLPPAPATTLSTTIEPWGLIPPTTAGWGE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS54 RRLQHRLRLRAQMRLRRLNATTTLGPHTVPPTLPPAPATTLSTTIEPWGLIPPTTAGWEE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB5 SETETYTEVVTEFGTEVEPEFGTKVEPEFETQLEPEFETQLEPEFEEEEEEEEEEEIATG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS54 SETETYTEVVTEFGTEVEPEFGTKVEPEFETQLEPEFETQLEPEFEEEEEEEKEEEIATG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150
pF1KB5 QAFPFTTVETYTVNFGDF
::::::::::::::::::
CCDS54 QAFPFTTVETYTVNFGDF
1150
>>CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10 (756 aa)
initn: 1750 init1: 1091 opt: 1784 Z-score: 836.8 bits: 166.2 E(32554): 2.7e-40
Smith-Waterman score: 2638; 52.4% identity (73.8% similar) in 763 aa overlap (267-1022:38-753)
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DQIEREDYEDFEYIRRQKQPRPPPSRRRRPERVWPEPPEEKAPAPAPEERIEPPVKPLLP
...: . : : :: .. . :
CCDS76 TPALALVLLAVTLAGVGAQGAALEDPDYYGQEIWSREPYYARP--------EPELETFSP
10 20 30 40 50
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 PLPPDYGDGYVIPNYDDMDYYFGPPPPQKPDAERQTDEEKEELKKPKKEDSSPKEETD-K
::: : : .. . ::.: ... . : : ::.: :.:. :
CCDS76 PLPA--GPG------EEWERR-----PQEPRPPKRATKPK---KAPKREKSAPEPPPPGK
60 70 80 90 100
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 WAVEKGKDHKEPRKGEELEEEW-TPTEKVK--CPPIGMESHRIEDNQIRASSMLRHGLGA
. .: : .:. . .. . : :. :::.:.:. .: : :..::.. :.::::
CCDS76 HSNKKVMRTKSSEKAANDDHSVRVAREDVRESCPPLGLETLKITDFQLHASTVKRYGLGA
110 120 130 140 150 160
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 QRGRLNMQTGATEDDYYDGAWCAEDDARTQWIEVDTRRTTRFTGVITQGRDSSIHDDFVT
.:::::.:.: .:.:.::::::: . ::::::.:: :::::::::::.: .:.::
CCDS76 HRGRLNIQAGINENDFYDGAWCAGRNDLQQWIEVDARRLTRFTGVITQGRNSLWLSDWVT
170 180 190 200 210 220
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 TFFVGFSNDSQTWVMYTNGYEEMTFHGNVDKDTPVLSELPEPVVARFIRIYPLTW--NGS
.. : ::::.::: :: .: :.:: .:. :::.::: :.:::.::: : .: :::
CCDS76 SYKVMVSNDSHTWVTVKNGSGDMIFEGNSEKEIPVLNELPVPMVARYIRINPQSWFDNGS
230 240 250 260 270 280
540 550 560 570 580
pF1KB5 LCMRLEVLGCSVA-PVYSYYAQNEVVATDDLDFRHHSYKDMRQLMKVVNEECPTITRTYS
.:::.:.::: . : :. .::...::::::.::.::.:::::::::: ::.::: :.
CCDS76 ICMRMEILGCPLPDPNNYYHRRNEMTTTDDLDFKHHNYKEMRQLMKVVNEMCPNITRIYN
290 300 310 320 330 340
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 LGKSSRGLKIYAMEISDNPGEHELGEPEFRYTAGIHGNEVLGRELLLLLMQYLCREYRDG
.::: .:::.::.::::.:::::.:::::.: :: ::::::::::::::.:..:.::
CCDS76 IGKSHQGLKLYAVEISDHPGEHEVGEPEFHYIAGAHGNEVLGRELLLLLVQFVCQEYLAR
350 360 370 380 390 400
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 NPRVRSLVQDTRIHLVPSLNPDGYEVAAQMGSEFGNWALGLWTEEGFDIFEDFPDLNSVL
: :. ::..::::..::::::::: : . :::.:.:.:: ::..:.:: ..:::::..:
CCDS76 NARIVHLVEETRIHVLPSLNPDGYEKAYEGGSELGGWSLGRWTHDGIDINNNFPDLNTLL
410 420 430 440 450 460
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 WGAEERKWVPYRVPNNNLPIPERYLSPDATVSTEVRAIIAWMEKNPFVLGANLNGGERLV
: ::.:. :: .:::. . ::: .:: .:::..:.::.:::::: :::::.::.::: .:
CCDS76 WEAEDRQNVPRKVPNHYIAIPEWFLSENATVAAETRAVIAWMEKIPFVLGGNLQGGELVV
470 480 490 500 510 520
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 SYPYDMARTPTQEQLLAAAMAAARGEDEDEVSEAQETPDHAIFRWLAISFASAHLTLTEP
.::::..:.: . : : ::: .::::: :.::.: .:.
CCDS76 AYPYDLVRSPWKTQ------------------EHTPTPDDHVFRWLAYSYASTHRLMTDA
530 540 550 560
830 840 850 860 870 880
pF1KB5 YRGGCQAQDYTGGMGIVNGAKWNPRTGTINDFSYLHTNCLELSFYLGCDKFPHESELPRE
: :...:. : ::::.:. .:..::::::::::.:::.:.::::.::::.::.:
CCDS76 RRRVCHTEDFQKEEGTVNGASWHTVAGSLNDFSYLHTNCFELSIYVGCDKYPHESQLPEE
570 580 590 600 610 620
890 900 910 920 930 940
pF1KB5 WENNKEALLTFMEQVHRGIKGVVTDEQGIPIANATISVSGINHGVKTASGGDYWRILNPG
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CCDS76 WENNRESLIVFMEQVHRGIKGLVRDSHGKGIPNAIISVEGINHDIRTANDGDYWRLLNPG
630 640 650 660 670 680
950 960 970 980 990 1000
pF1KB5 EYRVTAHAEGYTPSAKTCNVDYDIGATQCNFILARSNWKRIREIMAMNGNRPIPHIDPSR
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CCDS76 EYVVTAKAEGFTASTKNCMVGYDMGATRCDFTLSKTNMARIREIMEKFGKQPV-----SL
690 700 710 720 730 740
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB5 PMTPQQRRLQQRRLQHRLRLRAQMRLRRLNATTTLGPHTVPPTLPPAPATTLSTTIEPWG
: . : :.::
CCDS76 PARRLKLRGQKRRQRG
750
>>CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20 (734 aa)
initn: 2227 init1: 991 opt: 1541 Z-score: 725.8 bits: 145.6 E(32554): 4.1e-34
Smith-Waterman score: 2243; 51.4% identity (75.1% similar) in 654 aa overlap (379-1024:107-732)
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 PKEETDKWAVEKGKDHKEPRKGEELEEEWTPTEKVK--CPPIGMESHRIEDNQIRASSML
:.:: . :::.:.:: :. :....:::
CCDS13 KKRKKLTLTRPTPLVTAGPLVTPTPAGTLDPAEKQETGCPPLGLESLRVSDSRLEASSSQ
80 90 100 110 120 130
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 RHGLGAQRGRLNMQTGATEDDYYDGAWCAEDDARTQWIEVDTRRTTRFTGVITQGRDSSI
::: .:::::.:.: . : ::::::::.. :..::. . :::.:::::::.:
CCDS13 SFGLGPHRGRLNIQSGLEDGDLYDGAWCAEEQDADPWFQVDAGHPTRFSGVITQGRNSVW
140 150 160 170 180 190
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 HDDFVTTFFVGFSNDSQTWVMYTNGYEEM--TFHGNVDKDTPVLSELPEPVVARFIRIYP
. :.::.. : :::::.:: : : .: .: : .::::. :::: ::::::. :
CCDS13 RYDWVTSYKVQFSNDSRTWWGSRNHSSGMDAVFPANSDPETPVLNLLPEPQVARFIRLLP
200 210 220 230 240 250
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 LTW--NGSLCMRLEVLGCSVAPVYSYYAQNEVVATDD-LDFRHHSYKDMRQLMKVVNEEC
:: .:. :.: :.:.: :. . . . . ...: :::.::.:: ::.::: :.:.:
CCDS13 QTWLQGGAPCLRAEILACPVSDPNDLFLEAPASGSSDPLDFQHHNYKAMRKLMKQVQEQC
260 270 280 290 300 310
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 PTITRTYSLGKSSRGLKIYAMEISDNPGEHELGEPEFRYTAGIHGNEVLGRELLLLLMQY
:.::: ::.::: .:::.:.::.::.:::::::::: ::.::.::::.:::::::::::.
CCDS13 PNITRIYSIGKSYQGLKLYVMEMSDKPGEHELGEPEVRYVAGMHGNEALGRELLLLLMQF
320 330 340 350 360 370
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 LCREYRDGNPRVRSLVQDTRIHLVPSLNPDGYEVAAQMGSEFGNWALGLWTEEGFDIFED
::.:. ::::: :... ::::.::.::::::.: . :::. .:: : :.....:. ..
CCDS13 LCHEFLRGNPRVTRLLSEMRIHLLPSMNPDGYEIAYHRGSELVGWAEGRWNNQSIDLNHN
380 390 400 410 420 430
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 FPDLNSVLWGAEERKWVPYRVPNNNLPIPERYLSPDATVSTEVRAIIAWMEKNPFVLGAN
: :::. :: :.. ::. :::..::.: : :.:::. :.::.: ::.. ::::.::
CCDS13 FADLNTPLWEAQDDGKVPHIVPNHHLPLPTYYTLPNATVAPETRAVIKWMKRIPFVLSAN
440 450 460 470 480 490
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 LNGGERLVSYPYDMARTPTQEQLLAAAMAAARGEDEDEVSEAQETPDHAIFRWLAISFAS
:.::: .::::.::.::: ::: : ::: :.::::. .:.
CCDS13 LHGGELVVSYPFDMTRTPW----------AAR--------ELTPTPDDAVFRWLSTVYAG
500 510 520 530
830 840 850 860 870 880
pF1KB5 AHLTLTEPYRGGCQAQDYTGGMGIVNGAKWNPRTGTINDFSYLHTNCLELSFYLGCDKFP
..:.. . : :..::.. .:.::: :. :..::::::::::.:.. :.:::::
CCDS13 SNLAMQDTSRRPCHSQDFSVHGNIINGADWHTVPGSMNDFSYLHTNCFEVTVELSCDKFP
540 550 560 570 580 590
890 900 910 920 930 940
pF1KB5 HESELPREWENNKEALLTFMEQVHRGIKGVVTDEQG-IPIANATISVSGINHGVKTASGG
::.:::.::::::.::::..:::. :: ::: :.. . ::.:.:.:.:::: : :: ::
CCDS13 HENELPQEWENNKDALLTYLEQVRMGIAGVVRDKDTELGIADAVIAVDGINHDVTTAWGG
600 610 620 630 640 650
950 960 970 980 990 1000
pF1KB5 DYWRILNPGEYRVTAHAEGYTPSAKTCNVDYDIGATQCNFILARSNWKRIREIMAMNGNR
::::.:.::.: ::: :::: ...: : .. : :::.:... .:.::..: ...
CCDS13 DYWRLLTPGDYMVTASAEGYHSVTRNCRVTFEEGPFPCNFVLTKTPKQRLRELLAAGAKV
660 670 680 690 700 710
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB5 PIPHIDPSRPMTPQQRRLQQRRLQHRLRLRAQMRLRRLNATTTLGPHTVPPTLPPAPATT
: : . .:::.. : :
CCDS13 P-PDL---------RRRLERLRGQKD
720 730
>>CCDS7486.1 CPN1 gene_id:1369|Hs108|chr10 (458 aa)
initn: 1160 init1: 540 opt: 685 Z-score: 337.3 bits: 73.0 E(32554): 1.8e-12
Smith-Waterman score: 1183; 43.3% identity (67.4% similar) in 478 aa overlap (562-1038:23-453)
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 CMRLEVLGCSVAPVYSYYAQNEVVATDDLDFRHHSYKDM-RQLMKVVNEECPTITRTYSL
:::: : :. : :.:: :: :: :::.::.
CCDS74 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNE-CPGITRVYSI
10 20 30 40 50
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 GKSSRGLKIYAMEISDNPGEHELGEPEFRYTAGIHGNEVLGRELLLLLMQYLCREYRDGN
:.: .: ..:..:.::.:: :: ::: .:....::::.:::::.: : ..::.:.:. :
CCDS74 GRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNRN
60 70 80 90 100 110
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 PRVRSLVQDTRIHLVPSLNPDGYEVAAQMGSEFGNWALGLWTEEGFDIFEDFPDLNSVLW
:. .:.::::::..::.::::::::: .: . .. .: . .: :. ..:::::. ..
CCDS74 QRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNTYIY
120 130 140 150 160 170
720 730 740 750 760 770
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]