FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5107, 735 aa 1>>>pF1KB5107 735 - 735 aa - 735 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4571+/-0.000634; mu= 11.0864+/- 0.038 mean_var=563.1413+/-125.370, 0's: 0 Z-trim(114.2): 2224 B-trim: 0 in 0/56 Lambda= 0.054046 statistics sampled from 21192 (23973) to 21192 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16 Scan time: 12.450 The best scores are: opt bits E(85289) NP_002944 (OMIM: 601684) ribosomal protein S6 kina ( 735) 4900 399.1 3.4e-110 NP_001006666 (OMIM: 601684) ribosomal protein S6 k ( 744) 4679 381.8 5.3e-105 NP_001317370 (OMIM: 601684) ribosomal protein S6 k ( 719) 4664 380.6 1.2e-104 NP_004577 (OMIM: 300075,300844,303600) ribosomal p ( 740) 3967 326.3 2.7e-88 XP_005274630 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 739) 3948 324.8 7.6e-88 XP_016885203 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 712) 3906 321.5 7.2e-87 XP_016885205 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 712) 3906 321.5 7.2e-87 XP_016885202 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 712) 3906 321.5 7.2e-87 XP_016885206 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 712) 3906 321.5 7.2e-87 XP_016885204 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 712) 3906 321.5 7.2e-87 XP_011543865 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 712) 3906 321.5 7.2e-87 NP_001006933 (OMIM: 601685) ribosomal protein S6 k ( 741) 3903 321.3 8.6e-87 XP_016885207 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 711) 3890 320.3 1.7e-86 XP_006724570 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 711) 3887 320.1 2e-86 XP_016885208 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 711) 3887 320.1 2e-86 XP_011543860 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 718) 3884 319.8 2.4e-86 XP_011543862 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 718) 3884 319.8 2.4e-86 XP_011543859 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 718) 3884 319.8 2.4e-86 XP_011543861 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 718) 3884 319.8 2.4e-86 XP_011543863 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 718) 3884 319.8 2.4e-86 XP_011543858 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 745) 3872 318.9 4.6e-86 XP_011543857 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 746) 3872 318.9 4.6e-86 XP_005274634 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 710) 3871 318.8 4.8e-86 XP_011543864 (OMIM: 300075,300844,303600) PREDICTE ( 717) 3868 318.6 5.6e-86 NP_066958 (OMIM: 601685) ribosomal protein S6 kina ( 733) 3860 318.0 8.8e-86 NP_001305865 (OMIM: 601685) ribosomal protein S6 k ( 758) 3857 317.8 1e-85 XP_006715612 (OMIM: 601685) PREDICTED: ribosomal p ( 761) 3857 317.8 1e-85 XP_011529219 (OMIM: 300303) PREDICTED: ribosomal p ( 745) 3603 298.0 9.5e-80 NP_001317441 (OMIM: 300303) ribosomal protein S6 k ( 745) 3603 298.0 9.5e-80 NP_055311 (OMIM: 300303) ribosomal protein S6 kina ( 745) 3603 298.0 9.5e-80 XP_016884913 (OMIM: 300303) PREDICTED: ribosomal p ( 762) 3603 298.0 9.6e-80 XP_016884914 (OMIM: 300303) PREDICTED: ribosomal p ( 762) 3603 298.0 9.6e-80 XP_016884912 (OMIM: 300303) PREDICTED: ribosomal p ( 762) 3603 298.0 9.6e-80 NP_001305867 (OMIM: 601685) ribosomal protein S6 k ( 644) 3576 295.7 3.9e-79 NP_001305866 (OMIM: 601685) ribosomal protein S6 k ( 635) 3466 287.1 1.5e-76 XP_011529221 (OMIM: 300303) PREDICTED: ribosomal p ( 642) 3300 274.2 1.2e-72 XP_011529222 (OMIM: 300303) PREDICTED: ribosomal p ( 624) 3197 266.1 3e-70 XP_016884915 (OMIM: 300303) PREDICTED: ribosomal p ( 506) 2482 210.2 1.7e-53 NP_001258972 (OMIM: 608938) ribosomal protein S6 k ( 451) 1257 114.6 9e-25 NP_001258989 (OMIM: 608938) ribosomal protein S6 k ( 502) 1257 114.7 9.4e-25 NP_003152 (OMIM: 608938) ribosomal protein S6 kina ( 525) 1257 114.7 9.6e-25 NP_001258973 (OMIM: 608938) ribosomal protein S6 k ( 472) 1255 114.5 1e-24 NP_003943 (OMIM: 608939) ribosomal protein S6 kina ( 482) 1235 112.9 3e-24 XP_011523403 (OMIM: 608938) PREDICTED: ribosomal p ( 489) 1153 106.6 2.6e-22 XP_016880418 (OMIM: 608938) PREDICTED: ribosomal p ( 436) 1151 106.3 2.7e-22 XP_011523404 (OMIM: 608938) PREDICTED: ribosomal p ( 391) 1150 106.1 2.8e-22 NP_872198 (OMIM: 603607) ribosomal protein S6 kina ( 549) 1145 106.0 4.1e-22 NP_001309158 (OMIM: 603607) ribosomal protein S6 k ( 795) 1145 106.4 4.8e-22 NP_004746 (OMIM: 603607) ribosomal protein S6 kina ( 802) 1145 106.4 4.8e-22 NP_001287731 (OMIM: 603606) ribosomal protein S6 k ( 765) 1093 102.3 7.9e-21 >>NP_002944 (OMIM: 601684) ribosomal protein S6 kinase a (735 aa) initn: 4900 init1: 4900 opt: 4900 Z-score: 2099.3 bits: 399.1 E(85289): 3.4e-110 Smith-Waterman score: 4900; 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99.9% identity (99.9% similar) in 702 aa overlap (34-735:18-719) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 AQLKEPWPLMELVPLDPENGQTSGEEAGLQPSKDEGVLKEISITHHVKAGSEKADPSHFE : :::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MQTPADFPRVERDLVPCPRKDEGVLKEISITHHVKAGSEKADPSHFE 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 LLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVNHPF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMERDILADVNHPF 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 VVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHSLGI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 VVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALGLDHLHSLGI 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 IYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHSHSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 IYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRQGHSHSA 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 DWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKETMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLLRALFKRNPAN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 DWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKETMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLLRALFKRNPAN 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 RLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTEFTSRTPKDS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 RLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDTEFTSRTPKDS 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 PGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQAPLHSVVQQLHGKNLVFSDGYVVKET :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 PGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQAPLHSVVQQLHGKNLVFSDGYVVKET 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 IGVGSYSECKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYDDGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 IGVGSYSECKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYDDGK 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 HVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGVVHRDLKPSNILY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 HVYLVTELMRGGELLDKILRQKFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGVVHRDLKPSNILY 470 480 490 500 510 520 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 VDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEGCDIWSLGIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 VDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEGCDIWSLGIL 530 540 550 560 570 580 610 620 630 640 650 660 pF1KB5 LYTMLAGYTPFANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLVSKMLHVDPHQR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LYTMLAGYTPFANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLVSKMLHVDPHQR 590 600 610 620 630 640 670 680 690 700 710 720 pF1KB5 LTAKQVLQHPWVTQKDKLPQSQLSHQDLQLVKGAMAATYSALNSSKPTPQLKPIESSILA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LTAKQVLQHPWVTQKDKLPQSQLSHQDLQLVKGAMAATYSALNSSKPTPQLKPIESSILA 650 660 670 680 690 700 730 pF1KB5 QRRVRKLPSTTL :::::::::::: NP_001 QRRVRKLPSTTL 710 >>NP_004577 (OMIM: 300075,300844,303600) ribosomal prote (740 aa) initn: 3939 init1: 2066 opt: 3967 Z-score: 1706.1 bits: 326.3 E(85289): 2.7e-88 Smith-Waterman score: 3967; 80.5% identity (91.1% similar) in 744 aa overlap (1-735:1-740) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MPLAQLKEPWPLMEL-VPLDP-ENGQT-----SGEEAGLQPSKDEGVLKEISITHHVKAG :::::: .:: : . : : :::: ::: ..:. .: .:::.:::::: : NP_004 MPLAQLADPWQKMAVESPSDSAENGQQIMDEPMGEEE-INPQTEEVSIKEIAITHHVKEG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 SEKADPSHFELLKVLGQGSFGKVFLVRKVTRPDSGHLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMER ::::::.::::::::::::::::::.:.. :. .:::::::::::::::::::::::: NP_004 HEKADPSQFELLKVLGQGSFGKVFLVKKISGSDARQLYAMKVLKKATLKVRDRVRTKMER 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 DILADVNHPFVVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELAL :::..:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 DILVEVNHPFIVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELAL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 GLDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEAIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEV .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: NP_004 ALDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKESIDHEKKAYSFCGTVEYMAPEV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 VNRQGHSHSADWWSYGVLMFEMLTGSLPFQGKDRKETMTLILKAKLGMPQFLSTEAQSLL :::.::..::::::.::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::: :::::: NP_004 VNRRGHTQSADWWSFGVLMFEMLTGTLPFQGKDRKETMTMILKAKLGMPQFLSPEAQSLL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 RALFKRNPANRLGSGPDGAEEIKRHVFYSTIDWNKLYRREIKPPFKPAVAQPDDTFYFDT : :::::::::::.::::.:::::: :.:::::::::::::.::::::...:.:::::: NP_004 RMLFKRNPANRLGAGPDGVEEIKRHSFFSTIDWNKLYRREIHPPFKPATGRPEDTFYFDP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 EFTSRTPKDSPGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQAPLHSVVQQLHGKNLV :::..::::::::::::.:::::::::::: . :: . . .::.::::: ... 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