Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5139
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5139, 567 aa
1>>>pF1KB5139 567 - 567 aa - 567 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0151+/-0.00101; mu= 6.2920+/- 0.061
mean_var=343.5077+/-68.910, 0's: 0 Z-trim(116.4): 918 B-trim: 11 in 1/53
Lambda= 0.069200
statistics sampled from 16032 (17009) to 16032 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.792), E-opt: 0.2 (0.522), width: 16
Scan time: 3.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43677.1 REPIN1 gene_id:29803|Hs108|chr7 ( 567) 4196 432.6 6.1e-121
CCDS47745.1 REPIN1 gene_id:29803|Hs108|chr7 ( 624) 4196 432.7 6.5e-121
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 1179 131.7 3.7e-30
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1175 131.2 4.3e-30
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1175 131.2 4.5e-30
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1172 130.9 5.6e-30
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1171 131.0 7.3e-30
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1171 131.0 7.4e-30
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1162 129.9 1.1e-29
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1158 129.7 1.8e-29
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1155 129.2 1.8e-29
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1155 129.2 1.9e-29
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1147 128.3 2.8e-29
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1147 128.3 2.9e-29
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1148 128.6 3.3e-29
CCDS46100.1 ZNF225 gene_id:7768|Hs108|chr19 ( 706) 1141 127.8 4.5e-29
CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 1131 127.0 1.1e-28
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1124 126.0 1.4e-28
CCDS12977.1 ZNF497 gene_id:162968|Hs108|chr19 ( 498) 1117 125.2 1.9e-28
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1119 125.6 2.1e-28
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1116 125.4 2.9e-28
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 1112 124.8 3.1e-28
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1110 124.8 4.3e-28
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1110 124.8 4.3e-28
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1107 124.3 4.4e-28
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1107 124.3 4.5e-28
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19 ( 537) 1105 124.0 4.6e-28
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 1096 123.3 1.1e-27
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 1096 123.3 1.1e-27
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1090 122.6 1.4e-27
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1090 122.6 1.5e-27
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1088 122.4 1.6e-27
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 1084 122.1 2.6e-27
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 1084 122.2 2.6e-27
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1087 122.6 2.6e-27
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1087 122.7 2.6e-27
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1080 121.6 2.7e-27
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1080 121.6 2.7e-27
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1080 121.6 2.8e-27
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1080 121.6 2.8e-27
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1080 121.6 2.9e-27
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 1079 121.5 3.1e-27
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 1079 121.5 3.1e-27
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1081 121.8 3.1e-27
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1079 121.5 3.1e-27
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1081 121.8 3.1e-27
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1081 121.8 3.2e-27
CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 1078 121.6 3.9e-27
CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 590) 1070 120.6 5.5e-27
CCDS32330.1 ZNF774 gene_id:342132|Hs108|chr15 ( 483) 1068 120.3 5.6e-27
>>CCDS43677.1 REPIN1 gene_id:29803|Hs108|chr7 (567 aa)
initn: 4196 init1: 4196 opt: 4196 Z-score: 2284.8 bits: 432.6 E(32554): 6.1e-121
Smith-Waterman score: 4196; 100.0% identity (100.0% similar) in 567 aa overlap (1-567:1-567)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLERRCRGPLAMGLAQPRLLSGPSQESPQTLGKESRGLRQQGTSVAQSGAQAPGRAHRCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MLERRCRGPLAMGLAQPRLLSGPSQESPQTLGKESRGLRQQGTSVAQSGAQAPGRAHRCA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 HCRRHFPGWVALWLHTRRCQARLPLPCPECGRRFRHAPFLALHRQVHAAATPDLGFACHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HCRRHFPGWVALWLHTRRCQARLPLPCPECGRRFRHAPFLALHRQVHAAATPDLGFACHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 CGQSFRGWVALVLHLRAHSAAKRPIACPKCERRFWRRKQLRAHLRRCHPPAPEARPFICG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CGQSFRGWVALVLHLRAHSAAKRPIACPKCERRFWRRKQLRAHLRRCHPPAPEARPFICG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NCGRSFAQWDQLVAHKRVHVAEALEEAAAKALGPRPRGRPAVTAPRPGGDAVDRPFQCAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NCGRSFAQWDQLVAHKRVHVAEALEEAAAKALGPRPRGRPAVTAPRPGGDAVDRPFQCAC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 CGKRFRHKPNLIAHRRVHTGERPHQCPECGKRFTNKPYLTSHRRIHTGEKPYPCKECGRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CGKRFRHKPNLIAHRRVHTGERPHQCPECGKRFTNKPYLTSHRRIHTGEKPYPCKECGRR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 FRHKPNLLSHSKIHKRSEGSAQAAPGPGSPQLPAGPQESAAEPTPAVPLKPAQEPPPGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FRHKPNLLSHSKIHKRSEGSAQAAPGPGSPQLPAGPQESAAEPTPAVPLKPAQEPPPGAP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 PEHPQDPIEAPPSLYSCDDCGRSFRLERFLRAHQRQHTGERPFTCAECGKNFGKKTHLVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PEHPQDPIEAPPSLYSCDDCGRSFRLERFLRAHQRQHTGERPFTCAECGKNFGKKTHLVA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 HSRVHSGERPFACEECGRRFSQGSHLAAHRRDHAPDRPFVCPDCGKAFRHKPYLAAHRRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HSRVHSGERPFACEECGRRFSQGSHLAAHRRDHAPDRPFVCPDCGKAFRHKPYLAAHRRI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 HTGEKPYVCPDCGKAFSQKSNLVSHRRIHTGERPYACPDCDRSFSQKSNLITHRKSHIRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HTGEKPYVCPDCGKAFSQKSNLVSHRRIHTGERPYACPDCDRSFSQKSNLITHRKSHIRD
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KB5 GAFCCAICGQTFDDEERLLAHQKKHDV
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GAFCCAICGQTFDDEERLLAHQKKHDV
550 560
>>CCDS47745.1 REPIN1 gene_id:29803|Hs108|chr7 (624 aa)
initn: 4196 init1: 4196 opt: 4196 Z-score: 2284.3 bits: 432.7 E(32554): 6.5e-121
Smith-Waterman score: 4196; 100.0% identity (100.0% similar) in 567 aa overlap (1-567:58-624)
10 20 30
pF1KB5 MLERRCRGPLAMGLAQPRLLSGPSQESPQT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SRGSIPRNIPKRSWKKPHPQLCSLQAEEEPMLERRCRGPLAMGLAQPRLLSGPSQESPQT
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 LGKESRGLRQQGTSVAQSGAQAPGRAHRCAHCRRHFPGWVALWLHTRRCQARLPLPCPEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LGKESRGLRQQGTSVAQSGAQAPGRAHRCAHCRRHFPGWVALWLHTRRCQARLPLPCPEC
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 GRRFRHAPFLALHRQVHAAATPDLGFACHLCGQSFRGWVALVLHLRAHSAAKRPIACPKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GRRFRHAPFLALHRQVHAAATPDLGFACHLCGQSFRGWVALVLHLRAHSAAKRPIACPKC
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 ERRFWRRKQLRAHLRRCHPPAPEARPFICGNCGRSFAQWDQLVAHKRVHVAEALEEAAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ERRFWRRKQLRAHLRRCHPPAPEARPFICGNCGRSFAQWDQLVAHKRVHVAEALEEAAAK
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 ALGPRPRGRPAVTAPRPGGDAVDRPFQCACCGKRFRHKPNLIAHRRVHTGERPHQCPECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ALGPRPRGRPAVTAPRPGGDAVDRPFQCACCGKRFRHKPNLIAHRRVHTGERPHQCPECG
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 KRFTNKPYLTSHRRIHTGEKPYPCKECGRRFRHKPNLLSHSKIHKRSEGSAQAAPGPGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KRFTNKPYLTSHRRIHTGEKPYPCKECGRRFRHKPNLLSHSKIHKRSEGSAQAAPGPGSP
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 QLPAGPQESAAEPTPAVPLKPAQEPPPGAPPEHPQDPIEAPPSLYSCDDCGRSFRLERFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QLPAGPQESAAEPTPAVPLKPAQEPPPGAPPEHPQDPIEAPPSLYSCDDCGRSFRLERFL
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 RAHQRQHTGERPFTCAECGKNFGKKTHLVAHSRVHSGERPFACEECGRRFSQGSHLAAHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RAHQRQHTGERPFTCAECGKNFGKKTHLVAHSRVHSGERPFACEECGRRFSQGSHLAAHR
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 RDHAPDRPFVCPDCGKAFRHKPYLAAHRRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSNLVSHRRIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RDHAPDRPFVCPDCGKAFRHKPYLAAHRRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSNLVSHRRIHT
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550 560
pF1KB5 GERPYACPDCDRSFSQKSNLITHRKSHIRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAHQKKHDV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GERPYACPDCDRSFSQKSNLITHRKSHIRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAHQKKHDV
570 580 590 600 610 620
>>CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 (855 aa)
initn: 6293 init1: 733 opt: 1179 Z-score: 655.0 bits: 131.7 E(32554): 3.7e-30
Smith-Waterman score: 1332; 36.6% identity (62.5% similar) in 538 aa overlap (55-565:294-822)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 QESPQTLGKESRGLRQQGTSVAQSGAQAPGRAHRCAHCRRHFPGWVALWLHTRRCQARLP
. :.:..: . : .:.. : : .. :
CCDS46 HTEKKHECGECGKSFSKYVSFSNHQRVHTEKKHECGECGKSFSKYVSFSNHQRVHTGKRP
270 280 290 300 310 320
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 LPCPECGRRFRHAPFLALHRQVHAAATPDLGFACHLCGQSFRGWVALVLHLRAHSAAKRP
: :::. : . .. :..:: : . : ::.:: .:.. : :.:.. :::
CCDS46 YECGECGKSFSKYASFSNHQRVH---TEKKHYECGECGKSFSKYVSFSNHQRVHTG-KRP
330 340 350 360 370
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 IACPKCERRFWRRKQLRAHLRRCHPPAPEARPFICGNCGRSFAQWDQLVAHKRVHVAEAL
: .: . : . .. : .: : . . . ::.::.::.: ..:. :.: :..:
CCDS46 YECGECGKSFSKYASFSNH-QRVHT---DKKHYECGECGKSFSQKSSLIQHQRFHTGEKP
380 390 400 410 420 430
210 220 230
pF1KB5 E--EAAAKALGPRP--RGRPAVTA-PRP--GGDAV------------------DRPFQCA
: .:... . :.. : : :: :. : .::.::.
CCDS46 YGCEECGKSFSSEGHLRSHQRVHAGERPFKCGECVKSFSHKRSLVHHQRVHSGERPYQCG
440 450 460 470 480 490
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 CCGKRFRHKPNLIAHRRVHTGERPHQCPECGKRFTNKPYLTSHRRIHTGEKPYPCKECGR
::: : .: ::. :.::::: ::..: :::: :..: .: .:..::::.. : : :::.
CCDS46 ECGKSFSQKGNLVLHQRVHTGARPYECGECGKSFSSKGHLRNHQQIHTGDRLYECGECGK
500 510 520 530 540 550
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 RFRHKPNLLSHSKIH--KRSEGSAQAAPGPGSPQLPAGPQESAAEPTPAVPLKPAQEPPP
: :: .:. :...: .:: : .. . . .: . :. . : . ..
CCDS46 SFSHKGTLILHQRVHPRERSYGCGECGKSFSSIGHLRSHQRVHTGERPYECGECGKSFSH
560 570 580 590 600 610
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 GAPPEHPQDPIEAPPSLYSCDDCGRSFRLERFLRAHQRQHTGERPFTCAECGKNFGKKTH
: : ... :.: :::.:: . :: ::: :: :::: :.:::: :..: .
CCDS46 KRSLVHHQR-MHTGERPYKCGDCGKSFNEKGHLRNHQRVHTTERPFKCGECGKCFSHKGN
620 630 640 650 660 670
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LVAHSRVHSGERPFACEECGRRFSQGSHLAAHRRDHAPDRPFVCPDCGKAFRHKPYLAAH
:. :.. :.::::..:.:::. :.. ::: .:.: : ..:..: : : ::.: : ::
CCDS46 LILHQHGHTGERPYVCRECGKLFKKKSHLLVHQRIHNGEKPYACEACQKFFRNKYQLIAH
680 690 700 710 720 730
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 RRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSNLVSHRRIHTGERPYACPDCDRSFSQKSNLITHRKSH
.:.::::.:: : ::::.:...:.. :.::::::.:: : .: .::...:.. :.. :
CCDS46 QRVHTGERPYECNDCGKSFTHSSTFCVHKRIHTGEKPYECSECGKSFAESSSFTKHKRVH
740 750 760 770 780 790
540 550 560
pF1KB5 IRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAHQKKHDV
. . :. ::..: . : :.. :
CCDS46 TGEKPYECSECGKSFAESSSLTKHKRVHTGEKPYKCEKCGKLFNKKSHLLVHQSSHWRKA
800 810 820 830 840 850
>>CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 (714 aa)
initn: 6304 init1: 743 opt: 1175 Z-score: 653.7 bits: 131.2 E(32554): 4.3e-30
Smith-Waterman score: 1278; 35.5% identity (62.6% similar) in 516 aa overlap (55-565:185-685)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 QESPQTLGKESRGLRQQGTSVAQSGAQAPGRAHRCAHCRRHFPGWVALWLHTRRCQARLP
: :.:. : . : .: .: . ..
CCDS12 GEKLYECSQCGKGFSYNSDLSIHEKIHTGERHHECTDCGKAFTQKSTLKMHQKIHTGERS
160 170 180 190 200 210
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 LPCPECGRRFRHAPFLALHRQVHAAATPDLGFACHLCGQSFRGWVALVLHLRAHSAAKRP
: :::. : . : ::..:.. : . : ::.:: . : .: :.:. .: :
CCDS12 YICIECGQAFIQKTHLIAHRRIHTGEKP---YECSNCGKSFISKSQLQVHQRVHTRVK-P
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CCDS59 -------TGEKPYNCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYH-------------CKECG
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