Result of FASTA (omim) for
pF1KB5139
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5139, 567 aa
1>>>pF1KB5139 567 - 567 aa - 567 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0023+/-0.000423; mu= 0.8156+/- 0.027
mean_var=404.2775+/-81.434, 0's: 0 Z-trim(123.8): 1913 B-trim: 0 in 0/60
Lambda= 0.063787
statistics sampled from 42195 (44320) to 42195 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.79), E-opt: 0.2 (0.52), width: 16
Scan time: 12.750
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1155 120.6 1.9e-26
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NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
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NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
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NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
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NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 1148 120.1 3.3e-26
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XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 1087 114.5 1.8e-24
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 1087 114.5 1.8e-24
NP_001166303 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 568) 1080 113.5 1.8e-24
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 1087 114.6 1.8e-24
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 1087 114.6 1.8e-24
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 1087 114.6 1.8e-24
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 1087 114.6 1.9e-24
NP_443092 (OMIM: 612429) zinc finger protein 300 i ( 604) 1080 113.6 1.9e-24
XP_011536004 (OMIM: 612429) PREDICTED: zinc finger ( 609) 1080 113.6 1.9e-24
NP_001166302 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 620) 1080 113.6 1.9e-24
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1081 113.8 2e-24
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1081 113.8 2e-24
NP_003399 (OMIM: 602951) zinc finger protein 37 ho ( 630) 1079 113.5 2.1e-24
NP_001269447 (OMIM: 602951) zinc finger protein 37 ( 631) 1079 113.5 2.1e-24
NP_001269444 (OMIM: 602951) zinc finger protein 37 ( 645) 1079 113.5 2.1e-24
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1081 113.8 2.1e-24
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1081 113.8 2.1e-24
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1081 113.8 2.1e-24
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1081 113.8 2.1e-24
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1081 113.8 2.1e-24
>>NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (782 aa)
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pF1KB5 QESPQTLGKESRGLRQQGTSVAQSGAQAPGRAHRCAHCRRHFPGWVALWLHTRRCQARLP
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..: . : :::: ::::.:. : ::::.:. .. : :: :.:.::.:. :..::. ::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]